Wilayah fauna Indonesia Timur berbatasan dengan Wilayah Fauna Indonesia Tengah dan
dibatasi oleh garis khayal yaitu Garis Webber, dan termasuk dalam kelompok fauna
dunia zona Australis.
Beberapa jenis fauna yang hidup di wilayah Fauna Indonesia Timur antara lain :
1. Mamalia, terdiri atas kangguru, walaby, beruang, nokdiak (landak Irian), oposum
layang (pemanjat berkantung), kuskus, kangguru pohon dan kelelawar.
4. Burung, terdiri atas nuri, raja udang, cendrawasih, kasuari dan namudur