Nama : Rutmaida Boru Hombing

NMP : 1914111012
Program Studi : Budidaya Perairan
Mata Kuliah : Bioteknlogi Akualutur
Tugas Resume

Penerapan RNA Interference (RNAi) terhadap Infeksi Virus pada Udang:

Sebuah Tinjauan
César Marcial Escobedo-Bonilla
Budidaya udang telah lama dilakukan di Asia dan Amerika untuk menyediakan makanan
berkualitas tinggi kepada masyarakat. Budidaya modern menggunakan teknik-teknik canggih
untuk meningkatkan produksi udang tetapi juga telah meningkatkan terjadinya penyakit menular.
Penyakit adalah perangkap utama untuk pengembangan dan keberlanjutan budidaya udang di
seluruh dunia. Dalam dekade terakhir beberapa metode dan strategi telah dikembangkan dan
dievaluasi di bawah kondisi eksperimental untuk mengekang dampak negatif dari infeksi virus.
Di antaranya, interferensi RNA adalah alat terbaru melawan penyakit virus pada udang dan
dianggap sebagai bioteknologi yang menjanjikan untuk meningkatkan produksi udang.

Penyakit Menular

Penyakit menular saat ini merupakan ancaman terbesar bagi produksi udang budidaya karena
menyebabkan gejala klinis yang parah dan kematian yang tinggi. Virus adalah patogen yang
paling merusak yang mempengaruhi udang budidaya. Beberapa virus dianggap sebagai ancaman
bagi pengembangan budidaya udang karena jangkauan inang yang luas, patogenisitas dan
distribusinya. Virus yang menyebabkan epizootik parah dan kematian tinggi pada larva,
postlarva, dan stadium juvenil udang termasuk baculovirus (monodon baculovirus [MBV],
baculovirus penaei [BP], baculoviral midgut gland necrosis virus [BMNV]), virus parvolike
(infeksi hipodermal dan hematopoietik). virus nekrosis [IHHNV], hepatopancreatic parvovirus
[HPV]), dicistrovirus (virus sindrom Taura [TSV]), ronivirus (virus kepala kuning [YHV]), dan
nimavirus (virus sindrom titik putih).

Interferensi RNA (RNAi)

RNAi dimulai dengan adanya molekul RNA seperti RNA untai ganda. Setelah masuk, enzim
yang disebut Dicer (endonuklease tipe III) memotong dsRNA panjang menjadi RNA
pengganggu pendek untai ganda (siRNA). Molekul siRNA diambil oleh RNA-inducing
silencing complex (RISC) yang terdiri dari berbagai protein yang membuka siRNA menjadi
molekul beruntai tunggal. Untai antisense tetap melekat pada RISC dan digabungkan dengan
mRNA target homolognya untuk menginduksi pembelahan endonukleolitik. Molekul dsRNA
yang panjang memungkinkan untuk menghasilkan berbagai molekul siRNA yang menargetkan
mRNA tunggal sehingga meningkatkan pembungkaman gen yang efektif.
Evaluasi RNAi untuk mengendalikan infeksi virus pada udang

Beberapa penelitian dengan RNAi telah dilakukan untuk melawan penyakit virus pada udang. Ini
telah menunjukkan adanya dua jalur kekebalan antivirus pada udang: urutan-independen
(bawaan) dan urutan-spesifik (RNAi-mediated). Baru-baru ini ditunjukkan bahwa molekul
dsRNA yang tidak bergantung pada urutan panjang mengaktifkan ekspresi mRNA dari molekul
RNAi Lv Sid-1 dan Lv Ago-2 seperti molekul dsRNA spesifik urutan.

Imunitas antivirus bawaan: Udang yang diobati dengan dsRNA yang tidak terkait secara
tajam mengurangi kematian (50-75%) dibandingkan dengan kontrol yang tidak diobati . Hasil ini
menunjukkan bahwa udang memiliki kekebalan antivirus bawaan.

Imunitas antivirus RNAi spesifik: DsRNA urutan-spesifik telah digunakan untuk menghambat
replikasi virus pada udang terhadap TSV, IHHNV, YHV dan WSSV. Studi yang dilakukan
dengan dsRNA terhadap protease diduga dari TSV menunjukkan bahwa dsRNA spesifik urutan
sangat menghambat replikasi TSV (11% kematian) pada udang yang terinfeksiper os , sedangkan
kontrol menunjukkan kematian 100% pada 5 dpi.

Imunitas antivirus RNAi spesifik oleh siRNA: Bekerja menggunakan siRNA untuk memicu
respons antivirus RNAi telah menunjukkan hasil yang kontroversial. Injeksi siRNA (19 bp)
terhadap vp19 tidak melindungi udang terhadap tantangan WSSV. Studi lain menggunakan
siRNA pendek (21bp) terhadap WSSV vp28 atau vp15 dan mereka menginduksi pengurangan
udang yang signifikan.

Pembungkaman RNA gen endogen udang yang terlibat dalam infeksi virus RNAi juga telah
digunakan untuk menentukan fungsi berbagai gen dari udang yang terlibat dalam infeksi virus.
Hal ini dilakukan dengan membungkam gen yang mengkode protein atau enzim tertentu. Pada
udang, sejumlah protein yang terlibat dalam kekebalan antivirus telah dipelajari oleh
pembungkaman RNAi, termasuk: reseptor seperti tol, protein mirip rab7 yang terlibat dalam
masuknya virus, protein caspase-3, terlibat dalam apoptosis dan sistem proPO.

Kemajuan dalam pengiriman besar molekul RNAi: RNAi adalah alat yang menjanjikan
terhadap penyakit menular dalam pengobatan manusia, kedokteran hewan dan kesehatan hewan
akuatik. Pada cacing nematoda dan udang percobaan efikasi molekul RNAi telah dilakukan
melalui injeksi. Metode pemberian ini tidak cocok untuk pengiriman besar-besaran dan/atau
distribusi molekul RNAi secara terus-menerus ke populasi besar hewan seperti yang ada di
pembenihan udang atau kolam pembesaran.

Penerapan RNAi untuk mengendalikan penyakit virus udang di lapangan merupakan strategi
yang menjanjikan. Produksi RNAi skala besar melalui sel bakteri adalah metode yang murah dan
menarik. Strategi ini digabungkan dengan pengiriman besar molekul RNAi melalui pakan baik
menggunakan sel bakteri yang tidak aktif yang mengekspresikan RNAi, atau melalui
makromolekul yang merangkum atau mengikat RNAi merupakan metode yang mudah dan
efektif untuk mendistribusikan RNAi di fasilitas budidaya udang seperti pembenihan atau kolam
pembesaran. Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk mengatasi masalah yang berkaitan dengan
keamanan lingkungan dan keamanan pangan udang yang diberi RNAi.