STRUKTUR-FUNGSI

ASAM NUKLEAT
Oleh : Dr. I Nengah Wirajana, S.Si, M.Si.
Email : biokimia2020unud@gmail.com

MK. Struktur dan Fungsi Biomolekul dan Enzim

Prodi Kimia FMIPA
Universitas Udayana
2023
 CAPAIAN PEMBELAJARAN
(KOMPETENSI YANG DICAPAI)
Capaian Pembelajaran Lulusan (CPL) Prodi Kimia yang menjadi
tanggung jawab Mata Kuliah (MK) ini :
▪ menunjukkan sikap bertanggungjawab atas pekerjaan di bidang
keahliannya secara mandiri (CP Sikap)

*
▪ menguasai konsep teoretis struktur, sifat, dan perubahannya baik

INW Biokim AsNu

pada energi maupun kinetiknya, identifikasi, pemisahan,
karakterisasi, transformasi, sintesis bahan kimia mikromolekul dan
terapannya (CP Pengetahuan)
▪ menerapkan pemikiran logis, kritis, sistematis, dan inovatif dalam
konteks pengembangan atau implementasi ilmu pengetahuan
dan/atau teknologi sesuai dengan bidang keahliannya (CP
Ketrampilan Umum)

Capaian Pembelajaran Mata Kuliah ini (CPMK) :

Menguasai konsep tentang struktur dan sifat biomolekul (asam
amino, protein, asam nukleat DNA & RNA, karbohidrat, dan lipida);
dan kinetika enzim .

Capaian Pembelajaran (CP) Pokok Bahasan ini :

2
Mampu memahami struktur & fungsi Asam
Nukleat (DNA & RNA)
OUT LINE
🞆 Pendahuluan: aliran

*
informasi genetika

INW Biokim AsNu

🞆 Struktur-Sifat-Fungsi DNA

🞆 Struktur-Sifat-Fungsi RNA

3
PENDAHULUAN: ALIRAN INFORMASI
GENETIKA

🞆 Gen

*
INW Biokim AsNu
⚫Unit fundamental informasi dalam sistem kehidupan
adalah gen.

⚫Gen secara biokimia didefinisikan sebagai

segmen DNA (atau dalam sedikit kasus
berupa RNA) yang mengkode informasi
yang diperlukan untuk menghasilkan suatu
produk biologi fungsional (produk final
biasanya suatu protein).
4
PENDAHULUAN: ALIRAN INFORMASI GENETIKA

🞆 Gen
⚫Dogma sentral menunjukkan aliran umum
informasi melalui replikasi, transkripsi, dan
translasi.

*
(Kata “dogma” di sini adalah istilah yang kurang tepat.

INW Biokim AsNu

🞆
Diperkenalkan pertama oleh Francis Crick pada saat ketika
sedikit bukti mendukung ide ini, dogma telah menjadi suatu
prinsip yang berkedudukan kuat.)

DNA

Perkecualian :
virus tertentu
mempunyai enzim
reverse transkriptase

RNA
5
PENDAHULUAN: ALIRAN INFORMASI GENETIKA

🞆 Kromosom
🞆 Kromosom tdd : protein dan molekul-molekul asam
nukleat tempat menyimpan informasi genetik

*
organisme merupakan molekul terbesar dalam sel

INW Biokim AsNu

dan mungkin mengandung ribuan gen begitu juga
DNA intergenik.
🞆 Kromosom bakteri – Hampir semua DNA
kususnya prokariot seperti E. coli terkandung
dalam ukuran tunggal besar/panjang yg
terkompleks dg protein dan berada bebas dalam
sitosol, juga ada berupa molekul DNA sirkuler
superkoil yg jumlahnya sedikit (plasmid).
6
 DNA MOLECULES ARE MUCH LONGER THAN THE
CELLULAR PACKAGES THAT CONTAIN THEM

🞆 DNA > panjang daripada sel (lihat tabel dan gambar)

🞆 Sel bakteri yang sedang lisis, perhatikan DNA kromosom yang

keluar dari sel

🞆 ATTGCC = 6 bp atau pb
(pasang basa)
PENDAHULUAN: ALIRAN INFORMASI GENETIKA

Kromosom
🞆 Kromosom eukariot – Genome sel-sel eukariot
terbagi dalam beberapa atau banyak kromosom,

*
masing-masing mengandung molekul DNA linier,

INW Biokim AsNu

tunggal amat besar.
🞆 Molekul DNA ini biasanya memiliki panjang
bervariasi 107 - 109 bp.
🞆 Jumlah kromosom eukariotik antara 1 (pd semut
Australi) sampai 190 (dalam spesies kupu-kupu).
🞆 Pada sel yg tidak dalam keadaan membelah,
kromosom tersegresi dalam nukleus sebagai serat
yg kompak antara kompleks DNA–protein yg
disebut kromatin. 8
* INW Biokim AsNu
10
* INW Biokim AsNu
11
STRUKTUR-SIFAT-FUNGSI DNA
🞆 DNA (DeoxyriboNucleic Acid) is called the
genetic material because it contains the genetic
information for every cell and tissue in an

*
INW Biokim AsNu
organism.
🞆 DNA is a component of the chromosomes
(proteins are the other component).
🞆 DNA is one of two types of nucleic acid.
Ribonucleic acid (RNA) is the other.
🞆 DNA is a polymer of deoxyribonucleotides
linked through phosphodiester bonds

12
* INW Biokim AsNu
13
🞆 Deoxyribonucleotides Acid
(DNA) contain three components :
⚫a phosphate group,
⚫a modified sugar called deoxyribose, and

*
⚫a nitrogenous base (adenine, guanine,

INW Biokim AsNu

cytosine, or thymine). Adenine and guanine
are called purine bases, whereas cytosine and
thymine are called pyrimidine bases.

14
🞆 Deoxyribose (more accuratey named 2-
deoxyribose) is a five carbon sugar contained in
deoxyribonucleosides.
🞆 Deoxyribose differs from ribose in lacking a

*
hydroxyl at position 2.

INW Biokim AsNu

🞆 Deoxyribonucleotides are the monomeric units
(building blocks) of DNA.

15
🞆 Adenine is a purine base found in DNA and
RNA. In nucleosides and nucleotides, adenine is
linked to the sugar moiety via a covalent bond
between nitrogen #9 of adenine and carbon #1 of
the sugar.

*
INW Biokim AsNu
🞆 The ribonucleoside containing adenine is called
adenosine. The deoxyribonucleoside containing
adenine is called deoxyadenosine.

16
🞆 Guanine is a purine base found in DNA and
RNA. In nucleosides and nucleotides, guanine
is linked to the sugar moiety via a covalent bond
between nitrogen #9 of guanine and carbon #1 of
the sugar.

*
INW Biokim AsNu
🞆 The ribonucleoside containing guanine is called
guanosine. The deoxyribonucleoside containing
guanine is called deoxyguanosine.

17
🞆 Cytosine is a pyrimidine base found in DNA
and RNA. In nucleosides and nucleotides,
cytosine is linked to the sugar moiety via a
covalent bond between nitrogen #1 of cytosine

*
and carbon #1 of the sugar.

INW Biokim AsNu

🞆 The ribonucleoside containing cytosine is called
cytidine. The deoxyribonucleoside containing
cytosine is called deoxycytidine.

18
🞆 Thymine is a pyrimidine base found almost
exclusively in DNA. In nucleosides and
nucleotides, thymine is linked to the sugar

*
moiety via a covalent bond between nitrogen #1

INW Biokim AsNu

in thymine and carbon #1 of the sugar. The
deoxyribonucleoside containing thymine is
called thymidine.

19
🞆 In cells, DNA consists of two strands wound
around each other in a double-helical structure
such that the phosphate-deoxyribose backbone is
on the outside and the bases are on the inside.

*
(see next Figure).

INW Biokim AsNu

🞆 The polarity of the two strands in a DNA
molecule is opposite; that is, the 5' end of one
strand matches up to the 3' end of the other
strand.
🞆 Thus, the strands are said to be "antiparallel.“
🞆 5’ 3’

🞆 3’ 5’ 20
COMPARISON OF THE TWO MAJOR FORMS
OF DNA

*
INW Biokim AsNu
21

Konformasi B Konformasi A
Fundamental
elements of
structure in the
DNA double helix.

*
???

INW Biokim AsNu

Mengapa dapat
disimpulkan
bahwa basa G
selalu
berpasangan
dengan C dan
basa T dengan A ?
🞆 Alasan struktur?
🞆 Alasan hasil
22
eksperimen?
DATA PENELITIAN MEMBUKTIKAN
KOMPOSISI BASA DALAM DNA !
 STRUKTUR-SIFAT-FUNGSI RNA
🞆 RNA (RiboNucleic
Acid), like DNA, is a
polymer composed of
nucleoside
monophosphates.

*
INW Biokim AsNu
🞆 RNA contain the
sugar ribose instead
of 2-deoxyribose, as
is found in DNA.

24
Chemical structures of ribonucleic acid (RNA) and
deoxyribonucleic acid (DNA).

*
INW Biokim AsNu
25
 * INW Biokim AsNu
26
Struktur RNA
RNA
🞆 The bases in RNA are adenine (A), guanine (G),
cytosine (C), and uracil (U). These are the same bases as
DNA except that the base uracil is used in place of
thymine (T).

*
INW Biokim AsNu
🞆 Instead, RNA exists as a single-stranded entity, though
extensive regions of many RNAs may form double helices
within themselves by the base pairing rules.

27
messenger RNA (mRNA), transfer RNA (tRNA),
and ribosomal RNA (rRNA):
⚫The three predominant forms of RNA are all
involved in translating the genetic information in
the sequence of bases in DNA to a sequence of

*
amino acids in proteins.

INW Biokim AsNu

28
ALIRAN INFORMASI GENETIK: DNA
🡪 RNA 🡪 PROTEIN

*
INW Biokim AsNu
29
🞆 mRNA is made directly from DNA, so mRNA
carries the genetic information in the DNA
sequence from the cell nucleus to the ribosomes
where proteins are made.
🞆 Information is organized in DNA (and mRNA) in

*
a sequence of three nucleotides called a codon.

INW Biokim AsNu

🞆 One codon specifies the incorporation of a specific
amino acid into a protein.

30
The genetic code
(as written in

*
mRNA).

INW Biokim AsNu

61 codons
specify 20
amino acids
3 stop codons
1 start codon

31
 bertugas membaca kodon
tRNA yang ada pada mRNA

🞆 In the universal genetic code, 61 codons specify

20 amino acids.

*
INW Biokim AsNu
🞆 There are not 61 different tRNAs molecules,
however, because some tRNAs can recognize
more that one codon (especially when the
difference is in the Wobble position).

🞆 Diskusi: berapakah jumlah jenis tRNA

pembawa asam amino? Apakah jumlahnya
sesuai jumlah kodon atau jumlah asam 32
amino?
Struktur
umum tRNA
seperti “daun
semanggi”
(cloverleaf-

*
like structure

INW Biokim AsNu

of a tRNA)
saat tanpa
mengikat
asam amino:

33
Strutur tersiaer tRNA yang sebenarnya ditentukan
dengan metode difraksi sinar-x (x-ray diffraction)
🡪 seperti Huruf “L” terbalik.

*
INW Biokim AsNu
34
Formation of aminoacyl tRNAs by aminoacyl tRNA
synthetase

*
INW Biokim AsNu
35
DISKUSI:
🞆 tRNA membawa asam amino dari
sitoplasma ke ribosom sesuai asam amino

*
apa yang diperlukan dalam proses translasi

INW Biokim AsNu

(biosintesis protein).
A. BAGAIMANA CARA tRNA melakukan
fungsi ini?
B. MENGAPA tRNA dapat membawa asam
amino yang dibutuhkan? BAGAIMANA
proses ini dapat berlangsung?

36
Fungsi mRNA membawa kodon, dan tRNA membaca kodon, rRNA
penyusun ribosom tempat terjadinya biosintesis protein, dengan
jelas ditunjukkan pada proses translasi

*
INW Biokim AsNu
37
RIBOSOM
🞆 The ribosome is the structure on which
translation occurs.

*
INW Biokim AsNu
🞆 Next Figure shows that the prokaryotic
ribosome consists of two large subunits.
🞆 Each subunit, in turn, consists of multiple
proteins and RNA. The 70S, 50S, and 30S
designations refer to centrifugation
sedimentation coefficients, which reflect the size
of each entity, but are not strictly additive.

38
RIBOSOMAL RNA
🞆 rRNA is a type of
RNArRNA is a type of

*
RNA that is a

INW Biokim AsNu

component of
ribosomesrRNA is a
type of RNA that is a
component of ribosomes
and plays a role in the
process of
translationrRNA is a
type of RNA that is a
component of ribosomes 39
and plays a role in the
process of translation
RIBOSOM
Figure : Components of a 70S prokaryotic ribosome.

*
INW Biokim AsNu
40
 TUGAS
1. JELASKAN PERBEDAAN & PERSAMAAN DNA DAN RNA

A. Dalam hal STRUKTURNYA

*
B. Dalam hal FUNGSINYA

INW Biokim AsNu

C. Tulis urutan basa nukleotida DNA dengan Panjang 20 bp
dan RNA 20 bp

2. Jelaskan Percobaan yang membuktikan asam nukleat

sebagai materi genetik

3. Jelaskan Perbedaan dan persamaan material genetik yang

terkandung dalam, virus, bakteri prokariot, sel tumbuhan,
dan sel hewan!
41
TERIMA KASIH
Email tugas ke:
biokimia2020unud@gmail.com