BIOKIMIA

ASAM NUKLEAT
OLEH MEGAWATI

UNIVERSITAS SEMBILANBELAS NOVEMBER KOLAKA

2020 http://www.free-powerpoint-templates-design.com
KONTEN
1. KOMPONEN ASAM NUKLEAT
2. NUKLEOTIDA, NUKLEOSIDA
3. DNA dan RNA
4. STRUKTUR DAN FUNGSI
5. REPLIKASI, TRANSKRIPSI & TRANSLASI

1/15/2021 MEGAWATI_USN 2
PENGANTAR

 Setiap sel makhluk hidup

mempunyai nucleus (inti sel)
dimana didalamnya terdapat
nucleoplasma
 Nucleus berperan dalam:
1. Menyimpan informasi genetik
2. Duplikasi DNA
3. Transkripsi  dalam sintesis
protein

 Dalam nucleoplasma terdapat chromosomes (chromatin pada saat pembelahan

sel) yang strukturnya sebagian besar terdiri dari DNA dan protein
 Dalam nucleus juga terdapat nucleoli (anak inti) yang aktif dalam sintesis
protein. Nucleoli dalam suatu sel dapat berjumlah satu atau lebih.
1/15/2021 MEGAWATI_USN 3
 KOMPONEN ASAM NUKLEAT
Sugar-phosphate backbone
5 end Nitrogenous bases

 adalah makromolekul Pyrimidines

5C
yang tersusun atas rantai
3C
nukleotida yang Nucleoside
mengandung informasi Nitrogenous
base Cytosine (C) Thymine (T, in DNA) Uracil (U, in RNA)
genetik.
Purines
 Asam nukleat yang 5C

paling umum adalah 1C

Phosphate
 Asam deoksiribonukleat 5C
group
3C
Sugar
(pentose)
(DNA) Adenine (A) Guanine (G)
3C (b) Nucleotide
 Asam ribonukleat (RNA
Sugars
3 end
 Asam nukleat dinamai
(a) Polynucleotide, or nucleic acid
demikian karena
keberadaan umumnya di
dalam inti (nukleus) sel
Deoxyribose (in DNA) Ribose (in RNA)
Nukleotida
 Protein yang bergabung dengan asam nukleat .
 Nukleotida dalam sitoplasma dan dalam inti adalah sama
tetapi jenis asam nukleatnya berbeda.

 Nukleotida tersusun atas :

1 Basa DNA
1 Gula Komponen yang essential
1 Fosfat RNA
 Gula → Ribosa & Deoksiribosa
 Basa → Adenin, Guanin, Timin, Sitosin

 Polinukleotida
adalah→ Ikatan antara 2 nukleotida dari 2 gugus fosfat
yang terikat pada 2 pentosa → ikatan Fosfodiester
 Tiap struktur DNA / RNA merupakan suatu polinukleotida
yang ujung-ujungnya C3 & C5
NUKLEOSIDA
Merupakan KOMBINASI BASA NITROGEN DAN GULA

TURUNAN KOMBINASI DGN RIBOSA KOMBINASI DGN DEOKSI

RIBOSA
PURINE
ADENIN ADENOSIN DEOKSI ADENOSIN
GUANIN GUANOSINE DEOKSI GUANOSIN

PIRIMIDIN
TIMIN TIMIDIN DEOKSI TIMIDIN
CYTOSIN CYTODIN DEOKSI CYTODIN
URASIL URIDINE DEOKSI URIDINE

1/15/2021 MEGAWATI_USN 6
Nukleotida dan Nukleosida
No Nukleotida Nukleosida
1 Adenosin monofosfat Adenosin
2 Guanosin monofosfat Guanosin
3 Timidin monofosfat Timidin
4 Sitidin monofosfat Sitosin
5 Uridin monofosfat Uridin
 Ribonukleotida
Ribonukleic Acid (RNA)

1/15/2021 MEGAWATI_USN 8
 Deoksiribonukleotida
deoksiribosanukleic acid (DNA)

1/15/2021 MEGAWATI_USN 9
 DNA (Asam Deoksiribonukleat)
 2 rantai DNA yang membentuk helix saling  FUNGSI DNA
berikatan antara hidrogen dengan basa
nitrogen dari utas DNA yang berhadapan  Membawa informasi genetik
 Backbone fosfat terletak dibagian luar helix  Mengontrol aktivitas hidup secara
 Basa nitrogen menghadap ke dalam langsung dan tidak langsung
 Ke-2 utas DNA berlawanan arah  Menyintesis RNA
5’→3’ \ A-T
 Berperan dalam proses sintesis
3’→5’ / G-C
protein
 Ke-2 rantai double helix DNA
→komplementer
 Informasi yang disandikan DNA
menentukan sifat dan organisme
DNA
 DNA : persenyawaan kimia yang membawa informasi
genetik dari suatu generasi ke generasi berikutnya.
 Struktur kimia DNA terdiri atas tiga komponen dasar:
yaitu :
a. gugus gula
(deoksiribosa)
b. asam fosfat
c. basa nitrogen  terdiri dari 2 jenis: purin
(adenin & guanin), pirimidin (sitosin & timin)
Model Molekul DNA
1. Berdasarkan gagasan W.T MODEL MOLEKUL DNA Watson dan Crick
Atsbury (1940)
DNA memiliki struktur 3 dimensi 1. Deretan Polinukleotida DNA mempunyai bentuk sebagai
berdasarkan hasil kristalografi sinar X. DNA spiral teratur
sangat padat maka nukleotida yang 2. Spiral mempunyai diameter kira-kira 20 Å dan lebar spiral
menyusun poli nukleotida berbentuk pipih tetap
yang masing-masing tegak lurus terhadap 3. Spiral mempunyai satu putaran lengkap (10 X putaran )
sumbu memanjang dan tiap-tiap nukleotida jarak antara nukleotida 3.4 Å. Jadi 1 putaran lengkap 34
mempunyai jarak 3.4 Å Å.
4. Molekul DNA sangat padat , maka spiralnya Duplex.
2. Wilkins
5. Molekul DNA berbentuk 2 pita spiral yang saling berpilin
Melanjutkan penelitian W.T Atsbury dan (Double Helix) bagian luar deretan gula fosfat (tulang
diperoleh serabut- serabut DNA yang punggung double helix/ backbone fosfat berada dibagian
kemudian oleh Rosalind franklin berhasil luar)
membuat foto melalui difraksi sinar X dan
molekul DNA mempunyai struktur spiral. 6. Pada bagian dalam terdapat basa purin dan pirimidin
7. 2 Polinukleotida yang berhadapan dihubungkan oleh H+
 Model Double Helix (Watson & Crick)
 2 jenis struktur DNA : Struktur a dan b
 Setiap molekul tersusun oleh 2 rantai
polinukleotida
 Ke 2 rantai nukleotida bersifat komplementer &
antipararel
 Komplementer : Basa purin - Basa pirimidin
A T
G C

 Antipararel : 5! P 3! OH

3! OH 5! P

 Ke 2 rantai polinukleotida berputar membentuk

pilinan mengelilingi satu sumbu perputaran
kearah kanan
 Ikatan Hidrogen : antara pasangan basa
 Ikatan fosfodiester : antara 2 nukleotida
 Gugus fosfat : Hidrofilik
Gugus basa-basa : Hidrofobik
STRUKTUR DNA
RNA (Asam Ribonukleat)
 Berbeda dengan DNA, RNA
merupakan rantai tunggal
polinukleotida.
 Tiap ribonukleotida terdiri dari 3
gugus molekul, yaitu gula 5
karbon (ribosa), basa nitrogen,
yang terdiri dari basa purin
yaitu adenine dan guanin yang
sama dengan DNA sedangkan
pirimidin berbeda, yaitu sitosin
dan urasil, dan gugus fosfat.

1/15/2021 MEGAWATI_USN 15
RNA

RNA terdiri dari tiga tipe, yaitu:

a) RNA duta (RNAd) atau messenger RNA
(mRNA).Terdapat di dalam inti sel (nukleus).
Berfungsi untuk membawa pesan atau kode
genetik (kodon) dari kromosom yang ada di inti ke
sitoplasma.
b) RNA pemindah (RNAp) atau transfer RNA
(tRNA). Terdapat di dalam sitoplasma. RNA p
berfungsi untuk mengikat asam amino yang
terdapat di dalam sitoplasma, kemudian
membawanya ke ribosom
c) RNA ribosom (RNAr) atau ribosome RNA
(rRNA). Terdapat di dalam ribosom. Berfungsi
untuk mensintesis protein dengan menggunakan
basa asam amino, yang menghasilkan polipeptida.
Struktur RNA transfer (Campbell, 2002)
Perbedaan DNA dan RNA
Perbedaan DNA RNA

Gula Deoksiribosa Ribosa

Basa Cytosine (C) Cytosine (C)

pirimidin Thymine (T) Urasil (U)
Basa Purin Adenine (A) Adenine (A)
Guanine (G) Guanine (G)
Bentuk Rantai ganda Rantai
(double tunggal,
helix), rantai pendek, tidak
panjang, terpilin
terpilin
Letak Nukleus, Nukleus,
kloroplast, sitoplasma,
dan kloroplas, dan
mitokondria mitokondria
 Figure 5.25-3
DNA

1 Synthesis of
mRNA
TRANSFER mRNA

GENETIK NUCLEUS
CYTOPLASM

REPLIKASI 2 Movement of
mRNA

TRANSKRIPSI mRNA into

cytoplasm
Ribosome

TRANSLASI 3 Synthesis
of protein

Amino
Polypeptide acids
1/15/2021 MEGAWATI_USN 18
 Tranfer Genetik/Ekpresi Gen
 kode genetik adalah
suatu cara untuk
menentukan jumlah serta
urutan nukleotida yang
berperan dalam
menentukan posisi yang
tepat dari tiap asam
amino dalam rantai
peptida yang bertambah
panjang
 Ekspresi gen merupakan proses
penterjemaahan informasi yang dikode di
dalam gen menjadi urutan asam amino
selama sintesis protein.
 Dalam ilmu Biologi dikenal istilah Dogma
sentral yang menjelaskan mengenai
proses perubahan gen dari DNA menjadi
RNA, dan RNA menjadi protein.
 Dogma ini menjelaskan bagaimana
proses pembacaan materi genetik
menjadi protein yang berperan di setiap
tahap metabolisme di dalam tubuh suatu
organisme

1/15/2021 MEGAWATI_USN 19
 KODE GENETIK
 Kodon merupakan kombinasi dari tiga nukleotida
yang berurutan dalam untai DNA atau RNA. Semua
asam nukleat, DNA dan RNA, memiliki nukleotida
diurutkan sebagai satu set kodon
 Setiap asam amino (20 amino acids) diwakili oleh tiga
basa yang disebut dengan kodon
 Setiap kodon mengkodekan satu jenis asam amino
 Setiap nukleotida terdiri dari basa nitrogen, salah satu
A, C, T / U, atau G.
 Oleh karena itu, tiga nukleotida berurutan memiliki
urutan basa nitrogen, yang pada akhirnya
menentukan asam amino yang kompatibel dalam
sintesis protein.

MEGAWATI_USN 20
  Penerjemahan mRNA menjadi protein dilakukan
pada ruas penyandi yang diapit oleh kodon awal
(AUG) dan kodon akhir (UAA, UAG atau UGA), ruas
ini disebut gen.
 Kodon pada molekul mRNA dapat menyandi asam-
asam amino dengan bantuan interpretasi kodon oleh
tRNA. Setiap tRNA membawa satu jenis asam amino
sesuai dengan tiga urutan nukleotida atau triplet
yang disebut dengan antikodon yang berada pada
simpul antikodon tRNA.
 Antikodon mengikatkan diri secara komplementer
pada kodon di mRNA, sehingga asam amino yang
dibawa oleh tRNA sesuai dengan kodon yang ada
pada mRNA.
 pesan genetik ditransalsi kodon demi kodon dengan
cara tRNA membawa asam-asam amino sesuai
antikodon yang komplementer dengan kodon dan
ribosom menyambungkan asam-asam amino
tersebut menjadi suatu rantai polipeptida.
 Ribosom menambahkan tiap asam amino yang
dibawa oleh tRNA ke ujung rantai polipeptida yang
sedang tumbuh
1/15/2021 MEGAWATI_USN 21
TAHAPAN UTAMA DALAM TRANSFER GENITIK
1. REPLIKASI DNA
ADALAH PROSES PEMBENTUKAN KOPI DNA, DIMANA PITA DOUBLE HELIX DARI DNA
SALING MEMISAH, DENGAN BANTUAN ENZIM DNA POLIMERASE, AKAN TERBENTUK DUA
MOLEKUL DNA.

2. TRANSKRIPSI
ADALAH PROSES MEMPRODUKSI RNA OLEH DNA. BAGIAN SIGMEN PITA DOUBLE
HELIX DARI DNA MEMISAH. RIBONUKLEOTID COMPLEMEN, MENYUSUN DIRI PADA BAGIAN
ATAS DNA TEMPLETE, YANG MEMISAHKAN DIRI. RNA TERBENTUK..

3. TRANSLASI
ADALAH PROSES SINTESIS PROTEIN OLEH RNA. TIAP mRNA MEMPUNYAI TIGA SEGMEN
SENYAWA BASA, YANG DIKENAL SEBAGAI KODON. MASING- MASING KODON AKAN
DIMASUKI OLEH ANTIKODON DARI tRNA YANG MEMBAWA ASAM AMINO, UNTUK
DISINTESIS PROTEIN
1/15/2021 MEGAWATI_USN 22
 ANTIKODON
ADALAH SUSUNAN SENYAWA BASA (KODE ASAM AMINO) YANG DIBAWA OLEH tRNA .

HUBUNGAN ANTARA SENYAWA BASA YANG TERDAPAT PADA DNA, mRNA , dan t RNA
ADALAH SEBAGAI BERIKUT :
DNA mRNA tRNA
Adenin (A) Urancil (U) Adenin (A)
Cytocin (C) Guanin (G) Cytosin(C)
Guanin (G) Cytocin (C) Guanin (G)
Thymin ( T) Adenin (A) Uracyl (U)
Dogma Sentral Biologi Molekuler
Replikasi
Duplikasi DNA

Transkripsi
Sintesis RNA
Inti Sel

Membran inti sel

Sitoplasma
Translasi
Sintesis Protein
Ribosom

1/15/2021 MEGAWATI_USN 24 24
Protein
Figure 5.UN02
Figure 5.UN02a
Figure 5.UN02b
Figure 5. UN07
Figure 5. UN08
Figure 5. UN09
Figure 5. UN12
Figure 5. UN13
 GENUS
• Cyprinus (ikan Mas)

1/15/2021 MEGAWATI_USN 33