NUKLEOTIDA & ASAM NUKLEAT

Dewi Riskha N.M.Si

Pokok bahasan
Nukleotida
 Prekursor untuk asam nukleat, RNA dan DNA
 Perbedaan Nukleotida & Nukleosida:
Nukleosida tdk punya gugus fosfatshg penulisannya tergantung
jmlah fosfat yg dimiliki
 Nukleosida monofosfat
 Nukleosida difosfat
 Nukleosida trifosfat
Asam Nukleat
 Asam nukleatpolinukleotida yg terdiri dari unit-unit
mononukleotida, jika unit–unit pembangunnya
dioksinukleotida maka asam nukleat itu disebut
dioksiribonukleotida asam ribonukleat (RNA)
 Polimerpolinukleotida
 Monomer : nukleotida
 Struktur terdiri dari :
 Basa

 Gula 5 carbon

 Phosphat
 Deoksiribonukleotida
 Deoksiribonukleotida ditulis dg tambahan “d” yg
menunjukkan adanya gugus hidroksil pd atom C
no 2.
 Terdiri dari 2 golongan
a. Ribonukleotida
b. deoksiribonukleotida
Peranan Nukleotida

1. Prekursor asam nukleat (materi genetik dan

enzim non protein)
2. Pembawa metabolit aktif untuk biosintesis
(misal:CDP, UDP)
3. Regulator metabolik dan molekul sinyal (misal:
cAMP, cGMP, ppGpp)
4. Energy dalam metabolisme (ATP dan GTP)
5. Bagian struktural dari koenzim (NAD, CoA)
Struktur Nukleotida
Macam Basa N dalam nukleotida
Struktur Asam Nukleat
Replikasi DNA
 Tahap replikasi DNA:
1. Inisiasi

2. Elongasi

3. Terminasi
 DNA template: leading and lagging strand

 Primer yg mengawali polimerisasi DNA

 Arah replikasi selalu dari 5’3’

DNA polimerasedisebut sebagai primer (menempel
pada strand RNA/DNA)enzim primase dan hanya dapat
menambahkan nukleotida ke ujung 3 ‘ hydroxyl dan
menjadi polynukleotida
Penamaan Nukleotida:

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

Struktur Primer
DNA dan RNA
A, G, T, C  DNA
A, G, U, C  RNA
“ Two strands” harus saling komplementer satu sama lain

Pasangan Basa A-T

dan G-C yang
Berikatan
Hidrogen
• A-T memiliki 2
ikt. Hidrogen
• G-C memiliki 3
Ikt. Hidrogen

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

RNA
 mRNA (messenger RNA)
 Membawa informasi genetik dari DNA ke ribosom untuk
sintesis protein

 rRNA (ribosomal RNA)

 Penyusun 65 % ribosom, sisanya protein
 Mengenali mRNA

 tRNA (transfer RNA)

 Menterjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi
asam amino tertentu
RNA
ASAM NUKLEAT VS PROTEIN

 ALIRAN INFORMASI GENETIK

 DNAmenyimpan dan mentransmisi
informasi genetik
 RNAberperan dalam ekspresi informasi
genetik
 PROTEINhasil dari ekspresi informasi
genetik
 Memiliki fungsi tertentu
Metabolisme Asam Nukleat
1. Anabolisme Asam Nukleat
 Biosintesis Purin

 Biosintesis Pirimidin

2. Katabolisme Asam Nukleat

 Degradasi Purin

 Degradasi Pirimidin
Jalur metabolisme asam nukleat,
dibagi menjadi 2:
1. Jalur De novo: sintesis nukleotida dimulai dengan
prekursor metaboliknya: asam amino, ribosa-5-
fosfat, CO2, dan unit satu karbon. 
2. Jalur Salvage
Katabolisme As. Nukleatnukleotida

 Asam-asam nukleat terdapat pada jaringan tubuh

sebagai nukleoprotein
 Nukleoprotein dlm pencernaan akan dipecah jd
molekul yg lebih kecilasam nukleat +protein
 As. Nukleat tersusun ats monomer’’ yg berupa
nukleotidashg dipecah menghasilkan nukleotida
 Hampir semua organisme mampu
mensintesis nukleotida dr prekursor yg lebih
sederhana  jalur de novo untuk nukleotida
 mirip utk setiap organisme

 Nukleotida juga dapat disintesis dari hasil

pemecahan nukleotida yang telah ada 
salvage pathway (recycle) yaitu dari
degradasi pirimidin dan purin  dari sel yang
mati (regenerasi) atau dari makanan
Degradasi nukleotida
 Di dalam usus halus tjd pemutusan ikatan fosfodiester
oleh endonuklease (pankreas)  oligonukleotida
 Dipecah lebih lanjut dg fosfodiesterase (ensim
exonuclease non spesifik)  monofosfat
 Dipecah lbh lanjut fosfomonoesterase dikenal sebagai
nukleotidase  menghasilkan nukleosida and
orthophosphate.
 Nucleosida phosphorylase menghasilkan basa dan
and ribose-1-phosphate.