Machine Translated by Google

Peraturan Gen 17
Ekspresi pada Prokariota
GARIS BESAR BAB

ÿ Strategi untuk Mengatur Gen di

Prokariota
ÿ Gen Konstitutif, Inducible, dan Repressible
Ekspresi
ÿ Kontrol Positif dan Negatif terhadap Ekspresi Gen
ÿ Operon: Unit Ekspresi Gen yang
Diatur Secara Koordinasi
ÿ Operon Laktosa di E. coli: Induksi dan
Represi Katabolit
ÿ Operon Triptofan di E. coli: Represi dan
Atenuasi
ÿ Kontrol Ekspresi Gen Pascatranskripsional

D'Hérelle menjadi terobsesi dengan keyakinannya bahwa penyakit manusia

yang disebabkan oleh bakteri dapat diobati, bahkan mungkin diberantas, dengan terapi
ÿ Impian D'Hérelle
Pada tahun 1910, ahli mikrobiologi Perancis-Kanada Felix d'Hérelle berada di Meksiko bakteriofag. Sayangnya, segera terbukti bahwa bentuk terapi bakteriofag yang sederhana
menyelidiki penyakit bakteri yang membunuh seluruh populasi belalang. Belalang ini tidak efektif dalam mengobati infeksi bakteri karena, terlalu sering, bakteri tersebut
yang terinfeksi mengalami diare parah, mengeluarkan suspensi basil yang hampir murni bermutasi menjadi bentuk yang resisten terhadap fag. Namun demikian, karya d'Hérelle
sebelum mati. Ketika dia mempelajari bakteri dalam kotoran belalang, d'Hérelle membuka jalan bagi penelitian yang pada akhirnya akan menghasilkan bidang baru—
mengamati bintik-bintik bening berbentuk lingkaran pada kultur bakteri yang ditumbuhkan genetika mikroba—dan menghasilkan wawasan tentang mekanisme pengaturan
pada agar-agar. Namun, ketika dia memeriksa material di titik bening itu secara ekspresi gen.
mikroskopis, dia tidak melihat apa pun. Pada tahun 1915, d'Hérelle kembali ke Institut
Pasteur di Paris, di mana ia mempelajari epidemi disentri bakterial yang menyebar melalui
unit tentara yang ditempatkan di Prancis. Dia sekali lagi mengamati titik-titik jelas di halaman
rumput yang berisi bakteri. Selain itu, ia menunjukkan bahwa apa pun yang membunuh
Shigella—bakteri penyebab disentri pada manusia—dapat melewati filter porselen yang
menahan semua bakteri yang diketahui. Pada tahun 1917, d'Hérelle mempublikasikan
hasilnya dan menamai agen bakteriosidal submikroskopik itu bakteriofag (dari bahasa
Yunani untuk “melahap bakteri”).

D'Hérelle terus mempelajari agen submikroskopik yang membunuh Shigella. Dia

memberikan penjelasan berikut tentang salah satu eksperimennya: “. . . . dalam sekejap
saya sudah mengerti: yang menyebabkan flek bening saya sebenarnya adalah mikroba
yang tidak terlihat, virus yang dapat disaring, tetapi virus yang bersifat parasit pada bakteri. . . .
Jika benar demikian, kemungkinan besar hal yang sama juga terjadi pada malam hari pada
orang sakit yang kemarin dalam kondisi serius. Di ususnya, seperti di tabung reaksi saya,
oC
e
ontN
iti/lIe.R P
F

basil disentri akan larut karena pengaruh parasitnya. Dia sekarang harus disembuhkan.
Saya berlari ke rumah sakit.
Faktanya, pada malam hari, kondisinya telah membaik dan masa pemulihan pun
dimulai” (d'Hérelle, F. 1949. The Bacteriophage. Science News 14:44–59).
Mikrograf elektron berwarna dari bakteriofag lambda.

459
Machine Translated by Google
460 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

Strategi Pengaturan Gen pada Prokariota

Prokariota telah mengembangkan mekanisme yang menghidupkan Mikroorganisme menunjukkan kemampuan luar biasa untuk beradaptasi dengan
beragam kondisi lingkungan. Kemampuan beradaptasi ini sebagian bergantung
dan mematikan gen sebagai respons terhadap sinyal lingkungan,
pada kemampuan mereka untuk menghidupkan dan mematikan ekspresi
serta mekanisme yang mengekspresikan gen dalam rangkaian temporal rangkaian gen tertentu sebagai respons terhadap perubahan lingkungan. Ekspresi
gen tertentu diaktifkan ketika produk dari gen tersebut dibutuhkan untuk
yang telah terprogram.
pertumbuhan. Ekspresi mereka dimatikan ketika produk gen tidak lagi diperlukan.
Sintesis transkrip gen dan produk translasi memerlukan pengeluaran energi yang cukup besar. Dengan
mematikan ekspresi gen ketika produknya tidak diperlukan, organisme dapat menghemat energi dan
memanfaatkan energi yang dilestarikan untuk mensintesis produk yang memaksimalkan laju
pertumbuhan. Lalu, bagaimana mekanisme mikroorganisme mengatur ekspresi gen sebagai respons
terhadap perubahan lingkungan?
Ekspresi gen pada prokariota diatur pada beberapa tingkatan yang berbeda: transkripsi, pemrosesan
mRNA, pergantian mRNA, translasi, dan pasca translasi (ÿ Gambar 17.1).
Namun, mekanisme pengaturan dengan efek terbesar pada fenotipe bekerja pada tingkat transkripsi.

Berdasarkan apa yang diketahui tentang regulasi transkripsi, berbagai peraturannya

mekanisme sejarah tampaknya masuk ke dalam dua kategori umum:

1. Mekanisme yang melibatkan pengaktifan dan penghentian ekspresi gen secara cepat sebagai respons
terhadap perubahan lingkungan. Mekanisme pengaturan jenis ini penting dalam mikro organisme
karena seringnya organisme ini terpapar perubahan lingkungan yang tiba-tiba. Mereka memberi
mikroorganisme “plastisitas” yang cukup besar, suatu kemampuan untuk menyesuaikan proses
metabolisme mereka dengan cepat untuk mencapai pertumbuhan dan reproduksi maksimal dalam
berbagai kondisi lingkungan.
2. Mekanisme yang disebut sebagai sirkuit terprogram atau rangkaian ekspresi gen. Dalam kasus ini,
beberapa peristiwa memicu ekspresi satu set gen. Produk dari satu atau lebih gen ini berfungsi
dengan mematikan transkripsi set gen pertama atau mengaktifkan transkripsi set gen kedua.
Kemudian, satu atau lebih produk dari himpunan kedua bertindak dengan menyalakan himpunan
ketiga, dan seterusnya. Dalam kasus ini, ekspresi gen yang berurutan telah diprogram secara
genetik, dan gen biasanya tidak dapat diaktifkan secara tidak berurutan. Urutan ekspresi gen yang
telah diprogram sebelumnya telah didokumentasikan dengan baik pada prokariota dan virus yang
menyerangnya. Misalnya, ketika bakteriofag litik menginfeksi bakteri, gen virus diekspresikan dalam
urutan yang telah ditentukan, dan urutan ini berkorelasi langsung dengan urutan temporal keterlibatan
produk gen dalam reproduksi dan morfogenesis virus. Dalam sebagian besar contoh ekspresi gen
terprogram yang diketahui, sirkuitnya bersifat siklus. Misalnya, selama infeksi virus, beberapa
peristiwa yang terkait dengan pengemasan DNA atau RNA virus dalam selubung protein mengatur
ulang program genetik sehingga urutan ekspresi gen yang tepat terjadi lagi ketika virus keturunan
menginfeksi sel inang baru.

POIN PENTING Meskipun ekspresi gen dapat diatur pada banyak tingkatan, regulasi transkripsional dapat diatur
terpenting.

Tingkat di mana ekspresi gen diatur pada prokariota

1 2 3 4 5
Transkripsi Pemrosesan RNA Stabilitas RNA Terjemahan Pasca terjemahan
Fungsi
dilakukan
oleh protein

DNA Transkrip RNA mRNA Protein

ÿ GAMBAR 17.1 Jalur ekspresi gen yang disingkat, menunjukkan lima tingkat regulasi penting pada prokariota.
Machine Translated by Google
Ekspresi Gen yang Konstitutif, Dapat Diinduksi, dan Dapat Ditekan 461

Ekspresi Gen yang Konstitutif, Dapat Diinduksi, dan Dapat Ditekan

Produk gen tertentu—seperti molekul tRNA, molekul rRNA, Gen yang menentukan komponen seluler yang menjalankan
protein ribosom, subunit RNA polimerase, dan enzim yang
mengkatalisis proses metabolisme yang sering disebut
fungsi pemeliharaan—misalnya, RNA ribosom dan protein
sebagai fungsi “pemeliharaan” seluler—merupakan yang terlibat dalam sintesis protein—diekspresikan secara
komponen penting dari hampir semua sel hidup. Gen yang
konstitutif. Gen lain sering kali hanya diekspresikan ketika
menentukan produk jenis ini terus-menerus diekspresikan
di sebagian besar sel. Gen-gen tersebut dikatakan produknya diperlukan untuk pertumbuhan.
diekspresikan secara konstitutif dan disebut sebagai gen
konstitutif.
Produk gen lain diperlukan untuk pertumbuhan sel hanya dalam kondisi mental
lingkungan tertentu. Sintesis konstitutif dari produk-produk gen tersebut akan sia-sia, karena
menggunakan energi yang seharusnya dapat dimanfaatkan untuk pertumbuhan yang lebih
cepat. Evolusi mekanisme regulasi yang menyediakan sintesis produk gen hanya ketika dan
di mana produk tersebut dibutuhkan jelas akan memberikan organisme
yang memiliki mekanisme regulasi ini keunggulan selektif dibandingkan
Induksi sintesis enzim
organisme yang tidak memiliki mekanisme regulasi tersebut. Hal ini jelas
menjelaskan mengapa organisme yang ada saat ini, termasuk bakteri dan
virus, menunjukkan mekanisme yang sangat efisien dalam mengendalikan ekspresi gen.
Escherichia coli dan sebagian besar bakteri lainnya mampu tumbuh
Aktivitas
menggunakan salah satu dari beberapa karbohidrat—misalnya glukosa, enzim
sukrosa, galaktosa, arabinosa, dan laktosa—sebagai sumber energi. terlibat Laktosa
Jika glukosa ada di lingkungan, glukosa akan dimetabolisme secara dalam laktosa ditambahkan

istimewa oleh sel E. coli . Namun, tanpa glukosa, sel E. coli dapat tumbuh pemanfaatan
dengan baik pada karbohidrat lain. Sel yang tumbuh dalam medium yang
mengandung gula laktosa, misalnya, sebagai satu-satunya sumber karbon
mensintesis dua enzim, ÿ-galaktosidase dan ÿ-galaktosida permease,
0 5 10 15 20 25
yang secara unik diperlukan untuk katabolisme laktosa. ÿ-Galaktosida
permease memompa laktosa ke dalam sel, di mana ÿ-galaktosidase Menit
memecahnya menjadi glukosa dan galaktosa. (A)
Tak satu pun dari enzim ini yang berguna bagi sel E. coli jika tidak tersedia
laktosa. Sintesis kedua enzim ini memerlukan energi yang cukup besar
(dalam bentuk ATP dan GTP; lihat Bab 11 dan 12). Dengan demikian, sel- Represi sintesis enzim
sel E. coli telah mengembangkan mekanisme pengaturan dimana sintesis
triptofan
enzim-enzim katabolisme laktosa ini diaktifkan ketika ada laktosa dan ditambahkan

dimatikan ketika tidak ada laktosa.

Di lingkungan alami (saluran usus dan saluran pembuangan), sel E.
coli mungkin relatif jarang mengalami kekurangan glukosa dan
keberadaan lak tosa. Oleh karena itu, gen E. coli yang mengkode enzim Aktivitas dari
yang terlibat dalam pemanfaatan laktosa mungkin sering kali dimatikan. triptofan
Jika sel yang tumbuh pada karbohidrat selain laktosa dipindahkan ke enzim
media yang mengandung laktosa sebagai satu-satunya sumber karbon, biosintetik
sel tersebut dengan cepat mulai mensintesis enzim yang diperlukan
untuk pemanfaatan laktosa (ÿGambar 17.2a). Proses menghidupkan
ekspresi gen sebagai respons terhadap suatu zat di lingkungan disebut
induksi. Gen yang ekspresinya diatur dengan cara ini disebut gen yang 0 5 10 15 20 25
dapat diinduksi; produknya, jika berupa enzim, disebut enzim yang dapat diinduksi.
Menit
Enzim yang terlibat dalam jalur katabolik (degradatif) ,
seperti pemanfaatan laktosa, galaktosa, atau arabinosa, secara (B)
karakteristik dapat diinduksi. Seperti yang akan kita bahas nanti di bab ini,
ÿ GAMBAR 17.2 (a) Induksi sintesis enzim yang
induksi terjadi pada tingkat transkripsi. Induksi mengubah laju sintesis
diperlukan untuk pemanfaatan laktosa sebagai sumber
enzim, bukan aktivitas molekul enzim yang ada. Induksi tidak sama dengan aktivasi enzim,
energi dan (b) represi sintesis enzim yang diperlukan
yang terjadi ketika pengikatan molekul kecil ke suatu enzim meningkatkan aktivitas enzim, untuk biosintesis triptofan, keduanya pada E. coli.
namun tidak mempengaruhi laju sintesisnya. Perhatikan bahwa rendahnya tingkat sintesis enzim
Bakteri dapat mensintesis sebagian besar molekul organik yang dibutuhkan untuk terjadi baik metabolitnya ada atau tidak ada.
pertumbuhan, seperti asam amino, purin, pirimidin, dan vitamin. Misalnya saja genom E.coli
Machine Translated by Google
462 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

mengandung lima gen yang mengkode enzim yang mengkatalisis langkah-langkah dalam
biosintesis triptofan. Kelima gen ini harus diekspresikan dalam sel E. coli yang tumbuh di
lingkungan tanpa triptofan agar dapat menyediakan asam amino dalam jumlah yang cukup
untuk sintesis protein yang berkelanjutan.
Ketika sel E. coli berada di lingkungan yang mengandung cukup triptofan untuk mendukung
pertumbuhan optimal, sintesis enzim biosintetik triptofan yang berkelanjutan akan membuang-
buang energi. Dengan demikian, mekanisme pengaturan telah berkembang pada E. coli yang
mematikan sintesis enzim biosintetik triptofan ketika triptofan eksternal tersedia (ÿGambar
17.2b). Gen yang ekspresinya dimatikan dengan cara ini dikatakan “ditekan”; prosesnya
disebut represi. Ketika ekspresi gen ini diaktifkan, dikatakan “derepresi”; respons seperti itu
disebut derepresi.
Enzim yang merupakan komponen jalur anabolik (biosintetik) sering kali dapat direpresi.
Represi, seperti induksi, terjadi pada tingkat transkripsi. Represi tidak sama dengan
penghambatan umpan balik, yang terjadi ketika produk dari jalur biosintesis berikatan dan
menghambat aktivitas enzim pertama dalam jalur tersebut, namun tidak mempengaruhi sintesis
enzim.

POIN PENTING Pada prokariota, gen yang menentukan fungsi rumah tangga seperti rRNA, tRNA, dan protein ribosom
diekspresikan secara konstitutif. Gen-gen lain biasanya diekspresikan hanya ketika produknya
dibutuhkan.

Gen yang mengkode enzim yang terlibat dalam jalur katabolik sering kali diekspresikan
hanya dengan adanya substrat enzim; ekspresi mereka dapat diinduksi.
Gen yang mengkode enzim yang terlibat dalam jalur anabolik biasanya dimatikan dengan adanya
produk akhir dari jalur tersebut; ekspresi mereka dapat ditekan.

Kontrol Positif dan Negatif terhadap Ekspresi Gen

Dalam beberapa kasus, produk dari gen pengatur Regulasi ekspresi gen—induksi, atau menghidupkan gen, dan represi,
atau mematikan gen—dapat dicapai melalui mekanisme kontrol positif dan
diperlukan untuk memulai ekspresi satu atau lebih gen. mekanisme kontrol negatif.
Dalam kasus lain, produk gen pengatur diperlukan untuk Kedua mekanisme tersebut melibatkan partisipasi gen pengatur —gen
yang mengkode produk yang mengatur ekspresi gen lain. Dalam
mematikan ekspresi gen tersebut
mekanisme kontrol positif, produk dari gen pengatur diperlukan untuk
atau lebih gen. menghidupkan ekspresi satu atau lebih gen struktural (gen yang
menentukan urutan asam amino dari enzim atau protein struktural), sedangkan dalam
mekanisme kontrol negatif, produk dari regulator gen diperlukan untuk mematikan ekspresi
gen struktural. Regulasi positif dan negatif diilustrasikan untuk sistem yang dapat diinduksi dan
direpresi pada ÿGambar 17.3.
Ingatlah bahwa suatu gen diekspresikan ketika RNA polimerase berikatan dengan
promotornya dan mensintesis transkrip RNA yang berisi wilayah pengkodean gen tersebut (Bab 11).
Produk dari gen pengatur bekerja dengan mengikat situs yang disebut situs pengikatan protein
pengatur (RPBS) yang berdekatan dengan promotor gen struktural. Ketika produk gen pengatur
terikat pada RPBS, transkripsi gen struktural diaktifkan dalam sistem kontrol positif (Gambar
17.3, kanan) atau dimatikan dalam sistem kontrol negatif (Gambar 17.3, kiri). Produk gen
pengatur disebut aktivator—karena mengaktifkan ekspresi gen—dalam sistem kontrol positif,
dan represor—karena menekan ekspresi gen—dalam sistem kontrol negatif.

Dapat atau tidaknya suatu protein pengatur berikatan dengan RPBS bergantung pada ada
tidaknya molekul efektor di dalam sel. Efektor biasanya berupa molekul kecil seperti asam
amino, gula, dan metabolit serupa. Molekul efektor yang terlibat dalam induksi ekspresi gen
disebut induser; mereka yang terlibat dalam represi ekspresi gen disebut co-represor.
Machine Translated by Google

Sistem yang Kontrol negatif Kontrol positif

dapat diinduksi

Pengikatan protein Protein pengatur

pengatur Situs Situs
Gen pengatur Gen promotor struktural Gen pengatur pengikatan struktural Gen promotor

Melompat

represor
RNA polimerase tidak dapat
berikatan dengan promotor tanpa
memblokir transkripsi.
aktivator pada tempat pengikatan protein pengatur.

Penekan RNA polimerase Aktivator tidak aktif

Penambahan induser Penambahan induser

( ) ( )

Pengikatan protein Pengikatan protein

pengatur Struktural pengatur Situs
Gen pengatur Gen situs promotor Gen pengatur struktural Gen promotor

Transkripsi Transkripsi

Kompleks represor/induser tidak

Kompleks aktivator/induser aktif
dapat berikatan dengan tempat pengikatan protein regulator.
berikatan dengan tempat pengikatan protein pengatur.

(A)

Sistem yang Kontrol negatif Kontrol positif

dapat direpresi

Pengikatan protein Pengikatan protein

pengatur Gen pengatur Situs
Gen pengatur Situs promotor struktural Gen pengatur struktural Gen promotor

Transkripsi Transkripsi

Aktivator
Penekan telanjang tidak dapat berikatan
bebas aktif berikatan dengan tempat pengikatan protein pengatur.
dengan tempat pengikatan protein pengatur.

Penambahan co-represor Penambahan co-represor

( ) ( )

Pengikatan protein Pengikatan protein

pengatur Gen situs pengatur Struktural
Gen pengatur Promotor struktural Gen pengatur Situs gen promotor

Memblokir transkripsi
RNA polimerase tidak dapat
berikatan dengan promotor tanpa
RNA polimerase
aktivator pada tempat pengikatan protein pengatur.

Kompleks represor/ko-represor berikatan Kompleks aktivator/ko-represor yang

dengan tempat pengikatan protein pengatur. tidak aktif tidak dapat berikatan dengan tempat pengikatan protein pengatur.

(B)

ÿ GAMBAR 17.3 Kontrol negatif dan positif terhadap ekspresi gen yang dapat diinduksi (a) dan yang dapat ditekan (b). Produk gen pengatur diperlukan untuk
mengaktifkan ekspresi gen pada sistem kontrol positif dan mematikan ekspresi gen pada sistem kontrol negatif.
Machine Translated by Google
464 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

Molekul efektor (induser dan ko-represor) berikatan dengan produk gen pengatur (aktivator
dan represor) dan menyebabkan perubahan struktur tiga dimensi protein tersebut. Perubahan
konformasi struktur protein akibat pengikatan molekul kecil disebut transisi alosterik.
Perubahan konformasi pada protein sering kali mengakibatkan perubahan aktivitasnya. Dalam
kasus aktivator dan represor, transisi alosterik yang disebabkan oleh pengikatan molekul efektor
biasanya mengubah kemampuannya untuk berikatan dengan situs pengikatan protein pengatur
yang berdekatan dengan promotor gen struktural yang mereka kendalikan.

Dalam mekanisme kontrol negatif yang dapat diinduksi (Gambar 17.3a, kiri), represor
bebas berikatan dengan RPBS dan mencegah transkripsi gen struktural jika tidak ada
penginduksi. Ketika terdapat induser, ia terikat oleh represor, dan kompleks represor/induser
tidak dapat berikatan dengan RPBS . Tanpa adanya represor yang terikat pada RPBS, RNA
polimerase berikatan dengan promotor dan mentranskripsikan gen struktural.
Dalam mekanisme kontrol positif yang dapat diinduksi (Gambar 17.3a, kanan), aktivator tidak
dapat berikatan dengan RPBS kecuali terdapat penginduksi, dan RNA polimerase tidak dapat
mentranskripsi gen struktural kecuali kompleks aktivator/induser terikat pada RPBS. Dengan
demikian, transkripsi gen struktural diaktifkan hanya dengan adanya induser.
Dalam mekanisme regulasi yang negatif dan dapat ditekan (Gambar 17.3b, kiri), transkripsi
gen struktural terjadi tanpa adanya ko-represor, namun tidak dengan kehadirannya. Ketika
kompleks represor/ko-represor terikat pada RPBS, hal ini mencegah RNA polimerase menyalin
gen struktural. Jika tidak ada co-repressor, maka free repressor tidak dapat berikatan dengan
RPBS; dengan demikian, RNA polimerase dapat berikatan dengan promotor dan
mentranskripsikan gen struktural. Dalam mekanisme kontrol yang positif dan dapat ditekan
(Gambar 17.3b, kanan), produk dari gen pengatur, yaitu aktivator, harus terikat pada RPBS
agar RNA polimerase dapat berikatan dengan promotor dan mentranskripsikan gen struktural.
Ketika ada ko-represor, ia membentuk kompleks dengan protein aktivator, dan kompleks
aktivator/ko-represor ini tidak dapat berikatan dengan RPBS ; akibatnya, RNA polimerase tidak
dapat berikatan dengan promotor dan mentranskripsikan gen struktural.
Untuk memahami rincian keempat mekanisme regulasi ini, fokuslah pada perbedaan utama
di antara keempat mekanisme tersebut. (1) Produk gen pengatur, yaitu aktivator, berperan serta
dalam menghidupkan ekspresi gen pada mekanisme kontrol positif, sedangkan produk gen
pengatur, yaitu represor, terlibat dalam mematikan ekspresi gen pada mekanisme kontrol
negatif. (2) Dengan mekanisme kontrol positif dan negatif, apakah ekspresi gen dapat diinduksi
atau ditekan tergantung pada apakah protein pengatur bebas atau kompleks protein/molekul
efektor berikatan dengan situs pengikatan protein pengatur (RPBS) .

POIN PENTING Ekspresi gen dikendalikan oleh mekanisme regulasi positif dan negatif.
Dalam mekanisme kontrol positif, produk dari gen pengatur, suatu aktivator, diperlukan untuk menghidupkan
ekspresi gen struktural.

Dalam mekanisme kontrol negatif, produk dari gen pengatur, suatu represor, diperlukan untuk mematikan
ekspresi gen struktural.

Aktivator dan represor mengatur ekspresi gen dengan mengikat situs yang berdekatan dengan promotor gen
struktural.

Dapat atau tidaknya protein pengatur berikatan pada tempat pengikatannya bergantung pada ada tidaknya
molekul efektor kecil yang membentuk kompleks dengan protein pengatur.

Molekul efektor disebut induser dalam sistem yang dapat diinduksi dan ko-represor dalam sistem yang
dapat ditekan.

Operon: Unit Ekspresi Gen yang Diatur Secara Koordinasi

Pada prokariota, gen dengan fungsi terkait sering kali Model operon, suatu mekanisme kontrol negatif, dikembangkan pada
tahun 1961 oleh François Jacob dan Jacques Monod untuk menjelaskan
terdapat dalam unit genetik yang diatur secara terkoordinasi regulasi gen yang diperlukan untuk pemanfaatan laktosa pada E. coli. Kami
yang disebut operon. membahas beberapa hasil eksperimen yang mengarah pada pengembangan ini
Machine Translated by Google
Operon: Unit Ekspresi Gen yang Diatur Secara Koordinasi 465

Operon: komponen Operon: represi

)R(
RNA RNA
Operon
polimerase polimerase

PR R PO SG1 SG2 SG3

Gen struktural
rotokmuotnrP
u

nePp
g(

rutagnneeG
p

rotokmuotnrP
u

nore)pPo(

rota)rIeApHO(
rutag)R

SG1 SG2 SG3

Ribosom
menerjemahkan mRNA
Transkripsi

Terjemahan Penekan
(tidak aktif, tidak dapat mengikat ke operator)

Penekan Molekul efektor

(induser atau ko-represor)
mRNA
(A)

Operon: induksi

RNA polimerase
(transkripsi diblokir)

PR R SG1 SG2 SG3

Polipeptida I Polipeptida 2 Polipeptida 3

P
Penekan Co-represor ditambahkan
terikat pada

Penekan operator
(aktif, terikat ke operator)
Induser menambahkan
RNA polimerase
(transkripsi diblokir)

PR R SG1 SG2 SG3

RNA RNA
polimerase polimerase
P
PR R PO SG1 SG2 SG3 Kompleks represor/ko-represor
terikat pada
operator
Penekan/
kompleks ko-represor
(aktif, berikatan dengan operator)
(C)
Ribosom
menerjemahkan mRNA
ÿ GAMBAR 17.4 Regulasi ekspresi gen melalui mekanisme operon.
(a) Komponen operon: satu atau lebih gen struktural (tiga, SG1, SG2,
dan SG3, ditampilkan) dan urutan operator (O) dan promotor (P)
Kompleks represor/induser yang bersebelahan. Satu operator dan satu promotor ditampilkan;
(tidak aktif, tidak dapat mengikat ke operator)
namun, beberapa operon memiliki banyak operator dan promotor.
Transkripsi gen pengatur (R) diprakarsai oleh RNA polimerase, yang
mRNA berikatan dengan promotornya (PR). Ketika represor terikat pada
operator, ia secara sterik mencegah RNA polimerase memulai transkripsi gen struk
Perbedaan antara operon yang dapat diinduksi (b) dan operon yang dapat
direpresi (c) adalah bahwa represor bebas berikatan dengan operator operon
yang dapat diinduksi, sedangkan kompleks molekul represor/efektor berikatan
dengan operator operon yang dapat direpresi. . Jadi, operon yang dapat
diinduksi dimatikan jika tidak ada molekul efektor (induser), dan operon yang
dapat ditekan diaktifkan jika tidak ada molekul efektor.
Polipeptida I Polipeptida 2 Polipeptida 3 molekul (ko-represor).
(B)
Machine Translated by Google
466 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

model dalam A Milestone in Genetics: Jacob, Monod, dan Operon Model di situs Stu dent
Companion. Jacob dan Monod mengusulkan bahwa transkripsi sekumpulan gen struktural yang
berdekatan diatur oleh dua elemen pengendali (ÿ Gambar 17.4a).
Salah satu elemen, gen represor, mengkodekan represor, yang (dalam kondisi sesuai) berikatan
dengan elemen kedua, operator . Operator selalu berdekatan dengan gen struktural yang
ekspresinya diatur. Beberapa operon—termasuk operon laktosa yang dibahas pada bagian
selanjutnya—mengandung banyak operator; namun, untuk saat ini, kami hanya akan
mempertimbangkan satu operator untuk menjaga mekanismenya sesederhana mungkin.

Transkripsi dimulai pada promotor yang terletak tepat di hulu (5ÿ) dari daerah pengkodean
gen struktural. Ketika represor terikat pada operator, ia secara sterik mencegah RNA polimerase
menyalin gen struktural dalam operon. Wilayah operator berbatasan dengan wilayah promotor;
terkadang operator dan promotor bahkan tumpang tindih, berbagi urutan DNA yang pendek.
Wilayah operator sering kali terletak di antara promotor dan gen struktural yang diaturnya. Unit
lengkap yang bersebelahan, termasuk gen struktural, operator, dan promotor, disebut operon
( Gambar 17.4a).
Apakah represor akan berikatan dengan operator dan mematikan transkripsi gen struktural
dalam suatu operon ditentukan oleh ada atau tidaknya molekul efektor seperti yang dibahas pada
bagian sebelumnya. Operon yang dapat diinduksi dan operon yang dapat ditekan dapat dibedakan
satu sama lain dengan menentukan apakah represor telanjang atau kompleks molekul represor/
efektor berikatan dengan operator.

1. Dalam kasus operon yang dapat diinduksi, represor bebas berikatan dengan operator, memutar
transkripsi nonaktif (ÿ Gambar 17.4b).
2. Dalam kasus operon yang dapat ditindas, situasinya sebaliknya. Penekan bebas tidak dapat
mengikat operator. Hanya kompleks molekul represor/efektor (ko-represor) yang aktif berikatan
dengan operator (ÿ Gambar 17.4c).

Kecuali perbedaan dalam perilaku pengikatan operator dari represor bebas dan kompleks molekul
represor/efektor, operon yang dapat diinduksi dan yang dapat ditekan adalah identik.
Transkrip mRNA tunggal membawa informasi pengkodean seluruh operon.
Jadi, mRNA operon yang terdiri dari lebih dari satu gen struktural bersifat multigenik. Misalnya,
mRNA operon triptofan dari E. coli berisi urutan pengkodean lima gen berbeda. Karena mereka
ditranskripsikan bersama, semua gen struktural dalam sebuah operon diekspresikan secara
terkoordinasi.
Meskipun jumlah molar produk gen yang berbeda tidak harus sama (karena efisiensi inisiasi
translasi yang berbeda), jumlah relatif dari polipeptida berbeda yang ditentukan oleh gen dalam
suatu operon biasanya tetap sama, terlepas dari keadaan induksi atau represi. Dalam beberapa
kasus, perbedaan penggunaan sinyal penghentian transkripsi dapat mengubah jumlah produk gen
yang disintesis.

POIN PENTING Pada bakteri, gen dengan fungsi terkait sering kali terdapat dalam unit terkoordinasi yang disebut
operon.
Setiap operon berisi sekumpulan gen struktural yang berdekatan, promotor (tempat pengikatan
RNA polimerase), dan operator (tempat pengikatan protein pengatur yang disebut represor).

Ketika represor terikat pada operator, RNA polimerase tidak dapat mentranskripsikan gen struktural
dalam operon. Ketika operator bebas dari represor, RNA polimerase dapat mentranskripsi operon.

Operon Laktosa di E. coli: Induksi

dan Represi Katabolit
Gen struktural pada operon lac ditranskripsi
hanya jika ada laktosa dan tidak ada glukosa.
Jacob dan Monod mengusulkan model operon berdasarkan studi mereka
terhadap operon laktosa (lac) pada E. coli (lihat Tonggak Sejarah dalam
Genetika: Jacob, Monod, dan Model Operon di situs Student Compan ion).
Operon lac berisi promotor (P), tiga operator
Machine Translated by Google

Operon laktosa di E. coli: induksi dan represi katabolit 467

E.coli lak argD

proses murni perahu
kromosom

Pengatur
gen Operon

saya gen gen Z gen Y Sebuah gen

PI O3 PO1 O2

1040 70 3510 780 825

70 22 22 22

penekan lac ß-galaktosidase ß-galaktosida ß-galaktosida

meresap transasetilase

ÿ GAMBAR 17.5 Operon lac E. coli. Operon lac terdiri dari tiga gen struktural, Z, Y, dan A, ditambah
promotor (P) dan tiga operator (O1, O2, dan O3). Gen pengatur (I) berdekatan dengan operon dalam
kasus lac dan memiliki promotornya sendiri (PI). Angka-angka di bawah berbagai elemen genetik
menunjukkan ukurannya dalam pasangan nukleotida.

(O1, O2, dan O3), dan tiga gen struktural, lacZ, lacY, dan lacA, masing-masing mengkode
enzim ÿ-galaktosidase, ÿ-galaktosida permease, dan ÿ-galaktosida transasetilase (ÿ
Gambar 17.5). ÿ-galaktosida permease “memompa” laktosa ke dalam sel, di mana ÿ-
galaktosidase memecahnya menjadi glukosa dan galaktosa (ÿ Gambar 17.6). Peran
biologis transasetilase tidak diketahui.
Dalam model Jacob dan Monod, operon lac berisi satu operator (sekarang disebut
O1). Namun, dua operator tambahan (O2 dan O3) kemudian ditemukan. Awalnya, O2 dan
O3 dianggap memainkan peran yang sangat kecil. Kemudian, Benno Müller-Hill dan rekan
kerjanya menunjukkan bahwa penghapusan kedua operator “minor” tersebut mempunyai
pengaruh yang besar pada tingkat transkripsi operon. Penelitian yang lebih baru
menunjukkan bahwa represi yang efisien terhadap operon lac memerlukan operator besar
(O1) dan setidaknya satu operator minor (O2 atau O3) dan represi maksimum memerlukan
ketiga operator tersebut. Namun demikian, pertama-tama kita akan membahas model lac Jacob dan Monod
operon, yang hanya melibatkan satu operator, sekarang disebut O1. Kemudian, kami akan
memperluas model dan memeriksa fungsi ketiga operator di bagian berjudul Interaksi
Protein-DNA yang Mengontrol Transkripsi lac Operon .

OH
H

HAI OH H

H
(1) Formasi CH2 HAI H H
OH
HAI
dari lac
HAI HAI
penginduksi HAI
CH2
H
OH
H
OH H
CH2 HAI H H

OH
HAI HAI
HAI OH H H Alolaktosa
H H
+ H2O
OH
H H OH ß-galaktosidase
H
HH CH2 HAI H
HAI CH2 HAI H

OH HAI
OH HAI
OH
H
H CH2 HAI H HAI
H H
+
Laktosa OH OH
H
H
(2) Katabolisme HAI
HH
H

dari laktosa
H.OH H OH

Glukosa Galaktosa

ÿ GAMBAR 17.6 Dua reaksi fisiologis penting yang dikatalisis oleh ÿ-galaktosidase: (1) konversi laktosa
menjadi alolaktosa penginduksi operon lac dan (2) pembelahan laktosa untuk menghasilkan monosakarida
glukosa dan galaktosa.
Machine Translated by Google
468 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota
TABEL 17.1
Efek Fenotipik Mutasi pada Gen Represor (I) dan Wilayah Operator (O) lac Operon
Aktivitas ÿ-Galaktosidasea
Dengan
Genotip Laktosa
saya +P+O+Z+Y+ 100 unit
Saya +P+O+Z+Y+/ Fÿ Saya +P+O+ ZÿYÿ 100 unit
Saya +P+O+Z+Y+/ Fÿ Saya +P+O+Z+Y+ 200 unit
Saya ÿP+O+Z+Y+ 100 unit
Saya +P+O+Z+Y+/ Fÿ Saya ÿP+O+Z+Y+ 200 unit
saya +P+ Oc Z+Y+ 100 unit
Saya +P+ Oc Z+Yÿ/ Fÿ Saya +P+O+ZÿY+ 100 unit
a Tingkat aktivitas bakteri tipe liar telah ditetapkan sebesar 100 unit untuk ÿ-galaktosidase (produk dari gen Z) dan ÿ-galaktosida permease (produk dari gen Y).
Gen A dan produknya ÿ-galaktosida transasetilase tidak ditampilkan demi singkatnya.
Selesaikan!
Mutasi Konstitutif
di E.coli lac Operon
Anda telah mengisolasi dua mutan E. coli K12 yang
mensintesis ÿ-galaktosidase, ÿ-galaktosida permease,
dan ÿ-galaktosida transasetilase secara konstitutif,
yaitu apakah terdapat laktosa dalam medium atau
tidak. Anda selanjutnya memperkenalkan Fÿ yang
membawa salinan tipe liar dari gen lacI, promotor
lac, dan tiga operator lac tetapi berisi penghapusan
segmen distal lacZ dan semua lacY dan lacA, ke
dalam masing-masing mutan konstitutif Anda. .
Diploid parsial yang dihasilkan mengandung mutan
konstitutif 1 terus mensintesis tiga enzim katabolik
laktosa secara konstitutif, sedangkan diploid parsial
yang mengandung mutan konstitutif 2 menunjukkan
sintesis ketiga enzim yang dapat diinduksi. Jelaskan
perbedaan antara mutan 1 dan 2.
ÿ Untuk melihat solusi masalah ini, kunjungi situs
Pendamping Siswa.
Aktivitas Permease ÿ-Galaktosidaa
Tanpa Dengan Tanpa
Laktosa Laktosa Laktosa Deduksi
1 unit 100 unit 1 unit Tipe liar dapat diinduksi
1 unit 100 unit 1 unit Z+ dominan terhadap Zÿ
Y+ dominan terhadap Yÿ
2 unit 200 unit 2 unit Aktivitas tergantung pada dosis gen
100 unit 100 unit 100 unit lacIÿ mutan bersifat konstitutif
2 unit 200 unit 2 unit I+ dominan terhadap I -
100 unit 100 unit 100 unit mutan lacOc bersifat konstitutif
100 unit 100 unit 1 unit Oc dan O+ adalah regulator yang bertindak cis
INDUKSI
Operon lac adalah operon terinduksi yang dikontrol secara negatif ; gen lacZ , lacY, dan
lacA hanya diekspresikan dengan adanya laktosa. Gen pengatur lac , diberi nama I
gen, mengkodekan represor yang panjangnya 360 asam amino. Namun, bentuk aktif dari
represor lac adalah tetramer yang mengandung empat salinan produk gen I. Dengan tidak
adanya induser, represor berikatan dengan operator lac , yang pada gilirannya mencegah
RNA polimerase mengkatalisis transkripsi ketiga gen struktural (lihat Gambar 17.4b).
(Catatan: hanya operator asli (O1) yang ditemukan oleh Jacob dan Monod yang ditunjukkan
pada Gambar 17.4, 17.7, dan 17.8.) Beberapa molekul produk gen lacZ, lacY, dan lacA
disintesis dalam keadaan tidak terinduksi, menghasilkan tingkat aktivitas enzim latar
belakang yang rendah. Aktivitas latar belakang ini penting untuk induksi operon lac karena
penginduksi operon, alolaktosa, berasal dari laktosa dalam reaksi yang dikatalisis oleh ÿ-
galaktosidase (Gambar 17.6). Setelah terbentuk, alolaktosa berikatan dengan represor,
menyebabkan pelepasan represor dari operator. Dengan cara ini, alolaktosa menginduksi
transkripsi gen struktural lacZ, lacY, dan lacA (lihat Gambar 17.4b).
Gen lacI , operator lac O1, dan promotor lac semuanya awalnya diidentifikasi secara
genetis melalui isolasi strain mutan yang menunjukkan perubahan ekspresi gen lac operon.
Mutasi pada gen I dan operator sering kali mengakibatkan sintesis konstitutif produk gen
lac . Mutasi ini diberi nama Iÿ dan Oc ,
masing-masing. Mutasi konstitutif Iÿ dan Oc dapat dibedakan tidak hanya berdasarkan
posisi peta tetapi juga berdasarkan perilakunya pada diploid parsial yang lokasinya berada
pada konfigurasi cis dan trans relatif terhadap mutasi pada gen struktural lac (Tabel 17.1).
Ingatlah bahwa diploid parsial dapat dibuat dengan menggunakan faktor kesuburan (F)
yang membawa gen kromosom—faktor Fÿ (Bab 8). Faktor Fÿ yang membawa operon lac
telah digunakan untuk mempelajari interaksi antara berbagai komponen operon.
Seperti sel tipe liar monoploid (I+P+O+Z+Y+A+) , diploid parsial (juga disebut
“merozigot”) dari genotipe Fÿ I+P+O+Z+A+/ I+P+O+Z ÿYÿAÿ atau genotipe Fÿ
I+P+O+ZÿYÿAÿ/I+P+O+Z+Y+A+ diinduksi untuk pemanfaatan laktosa sebagai sumber
karbon. Alel tipe liar (Z+, Y+, dan A+) dari tiga gen struktural dominan terhadap alel
mutannya (Zÿ, Yÿ, dan Aÿ). Dominasi ini diperkirakan terjadi karena alel tipe liar
menghasilkan enzim fungsional, sedangkan alel mutan tidak menghasilkan enzim atau
enzim cacat (tidak aktif). Diploid parsial genotipe I+P+O+Z+Y+A+/IÿP+O+Z+Y+A+ (I+/Iÿ)
juga diinduksi untuk sintesis tiga enzim yang ditentukan oleh operon lac . Dengan demikian,
I+ dominan terhadap Iÿ seperti yang diharapkan, karena I+ mengkode molekul penekan
fungsional dan alel Iÿ nya menentukan penekan yang tidak aktif. Dominasi I+ atas Iÿ juga
menunjukkan bahwa represornya dapat berdifusi, karena
Machine Translated by Google

Operon laktosa pada E. coli: induksi dan represi katabolit 469

Dominasi lacI+ atas lacI –

represor yang dihasilkan oleh alel lacI+ pada satu kromosom dapat mematikan gen
struktural lac pada kedua operon di dalam sel (ÿ Gambar 17.7a). SAYA + P+ HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+

Seperti sel tipe liar, diploid parsial genotipe Fÿ I+P+O+Z+Y+A+/ IÿP+O+ZÿYÿAÿ Kromosom
atau genotipe Fÿ I+P+O+ZÿYÿ Aÿ/IÿP+O+Z+Y+A+ diinduksi untuk ÿ-galaktosidase, Gen dimatikan
ÿ-galaktosida permease, dan ÿ-galaktosida transasetilase. Indusibilitas genotipe ini
menunjukkan bahwa represor lac ( produk gen I+) mengontrol ekspresi gen Penekan aktif Represor bersifat difusibel
produk gen.
struktural yang terletak di cis (ÿGambar 17.7b) atau trans (ÿGambar 17.7c) ke Penekan
lacI+ tidak aktif
alel. Gen dimatikan
Mutasi konstitutif operator (Oc ) hanya berlaku pada cis; yaitu, Ok F' plasmid
mutasi hanya mempengaruhi ekspresi gen struktural yang terletak pada kromosom
– P+ SAYA HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+

yang sama. Sifat mutasi O yang bertindak cis adalah logis mengingat fungsi
operatornya. HAI mutasi seharusnya tidak terjadi pada trans Sintesis produk gen lac operon dapat diinduksi karena
represor tipe liar (lacI +) berikatan dengan operator lac
jika operator merupakan tempat pengikatan bagi penekan; dengan demikian, pada kedua kromosom
operator tidak mengkodekan produk apa pun, yang dapat difusikan atau lainnya.
(A)
Gen pengatur harus bertindak dalam trans hanya jika gen tersebut menentukan
produk yang dapat difusi. Oleh karena itu, diploid parsial genotipe Fÿ I+P+Oc
dominasi cis dari lacI+: I+ terletak cis pada Z+, Y+, dan A+
ZÿYÿAÿ/ I+P+O+Z+Y+A+ dapat diinduksi untuk tiga enzim yang ditentukan oleh
saya– P+ HAI+ Z– A-
gen struktural operon lac (Tabel 17.2 , ÿ Gambar 17.8a), sedangkan diploid parsial genotipe Fÿ kamu–

I+P+Oc Z+Y+A+/ I+P+O+ZÿYÿAÿ mensintesis enzim-enzim ini secara konstitutif Kromosom

(Tabel 17.2, ÿ Gambar 17.8b). Setelah Anda yakin bahwa Anda memahami Gen dimatikan
bagaimana komponen operon berinteraksi untuk mengatur transkripsi gen struktural Penekan
tidak aktif
lac , cobalah Selesaikan: Mutasi Konstitutif pada Operon E. coli lac dan lihat juga
Keterampilan Pemecahan Masalah: Menguji Pemahaman Anda tentang lac
Penekan aktif
Operon . Gen dimatikan
Beberapa mutasi gen I , yang disebut Iÿd , dominan
terhadap alel tipe liar (I+). Dominasi ini diakibatkan oleh ketidakmampuan F' plasmid

heteromultimer (protein yang terdiri dari dua atau lebih bentuk polipeptida yang saya+ P+ HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+

berbeda; ingat bahwa represor lac berfungsi sebagai tetramer) yang mengandung Sintesis produk gen lac operon yang dapat diinduksi
polipeptida tipe liar dan polipeptida mutan untuk berikatan dengan operator. Mutasi
(B)
gen I lainnya , yang disebut Is (s untuk superrepresi), menyebabkan lac
operon menjadi tidak dapat diinduksi. Pada strain yang membawa mutasi Is ini , lac
dominasi trans dari lacI+: I+ terletak trans ke Z+, Y+, dan A+
gen struktural biasanya dapat diinduksi sampai tingkat tertentu dengan konsentrasi
saya– P+ HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+

induser yang tinggi, namun gen tersebut tidak dapat diinduksi pada konsentrasi induser
Kromosom
normal. Ketika dipelajari secara in vitro, polipeptida Is mutan membentuk tetramer yang
berikatan dengan DNA operator lac . Namun, mereka tidak mengikat induser atau Gen dimatikan
menunjukkan afinitas yang rendah terhadap induser. Dengan demikian, mutasi Is Penekan
mengubah tempat pengikatan induser pada represor lac . tidak aktif

Mutasi promotor tidak mengubah induksibilitas operasi lac . Sebaliknya,

Penekan aktif
mereka memodifikasi tingkat ekspresi gen dalam keadaan terinduksi dan tidak
Gen dimatikan
terinduksi dengan mengubah frekuensi inisiasi transkripsi lac operon—yaitu,
efisiensi pengikatan RNA polimerase. F' plasmid
Promotor lac sebenarnya mengandung dua komponen terpisah: (1) situs SAYA + P+ HAI+ Z– kamu– A-
pengikatan RNA polimerase dan (2) situs pengikatan untuk protein lain yang
Sintesis produk gen lac operon yang dapat diinduksi
disebut protein aktivator katabolit (disingkat CAP) yang mencegah lac
operon tidak diinduksi dengan adanya glukosa. Sirkuit kontrol kedua ini, yang (C)

akan kita bahas selanjutnya, menjamin penggunaan glukosa sebagai sumber energi ÿ GAMBAR 17.7 Studi diploid parsial E. coli menunjukkan
ketika glukosa tersedia. bahwa gen lacI+ dominan terhadap lacIÿ
alel (a) dan mengontrol operator lac yang berada di keduanya
cis (b) atau trans (c) ke dirinya sendiri. Efek ini menunjukkan
REPRESI KATABOLIT
bahwa produk gen lacI dapat berdifusi. Meskipun bentuk
Kehadiran glukosa telah lama diketahui dapat mencegah induksi operasi lac , serta operon fungsional dari represor lac adalah tetramer, dua molekul di
lain yang mengendalikan enzim yang terlibat dalam katabolisme karbohidrat. belakang tetramer tidak ditampilkan demi kesederhanaan.

Fenomena ini, yang disebut represi katabolit (atau efek glukosa), memastikan bahwa glukosa
dimetabolisme saat ada, dibandingkan sumber energi lain yang kurang efisien.
Represi katabolit terhadap operon lac dan beberapa operon lainnya dimediasi oleh protein
pengatur yang disebut CAP (untuk protein aktivator katabolit) dan molekul efektor kecil
yang disebut AMP siklik (adenosin-3ÿ, 5ÿ-monofosfat; disingkat cAMP)
Machine Translated by Google
470 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

TABEL 17.2
Gen Penekan lac (I) Bertindak Baik Cis maupun Trans; Operator lac hanya bertindak dalam Konfigurasi Cis

Aktivitas ÿ-Galaktosidasea Aktivitas Permease ÿ-Galaktosidaa

Dengan Tanpa Dengan Tanpa

Genotip Laktosa Laktosa Laktosa Laktosa Deduksi

saya +P+O+Z+Y+ 100 unit 1 unit 100 unit 1 unit Tipe liar dapat diinduksi
Saya +P+O+ Z+Y+/Fÿ Saya ÿP+O+ ZÿYÿ 100 unit 1 unit 100 unit 1 unit
Saya ÿP+O+Z+Y+/Fÿ Saya+P+O+ ZÿYÿ 100 unit 1 unit 100 unit 1 unit SAYA
+ bertindak baik cis dan trans

Saya +P+O+Z+Y+/Fÿ Saya +P+ Oc ZÿYÿ 100 unit 1 unit 100 unit 1 unit O+ hanya bekerja pada cis
Saya +P+O+ ZÿYÿ /Fÿ Saya +P+Oc Z+Y+ 100 unit 100 unit 100 unit 100 unit Oc hanya bertindak di cis

a Tingkat aktivitas bakteri tipe liar telah ditetapkan sebesar 100 unit untuk ÿ-galaktosidase (produk dari gen Z) dan ÿ-galaktosida permease (produk dari gen Y).
Gen A dan produknya ÿ-galaktosida transasetilase tidak ditampilkan demi singkatnya.

Sintesis produk gen lac operon yang dapat diinduksi dalam

F' I+ P+ Oc Z – Y – A–/I+ P+ O+ Z+ Y+ A+ bakteri

SAYA + P+ HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+

Kromosom

Represor memblokir transkripsi

Penekan
aktif Produk mutan yang tidak berfungsi
Terjemahan
RNA
polimerase Transkripsi

F' plasmid
SAYA + P+ ok Z– kamu – A-

Represor tidak dapat mengikat Oc

Induser tidak ada; tidak ada produk gen lac operon fungsional yang disintesis Sintesis konstitutif produk gen lac operon dalam
F' I+ P+ Oc Z+ Y+ A+/I+ P+ O+ Z – Y – A – bakteri

SAYA + P+ HAI+ Z+ Y+ SEBUAH+ SAYA + P+ HAI+ Z– kamu – A-

Kromosom Kromosom

Represor memblokir transkripsi

Tidak dapat mengikat

kepada operator

ÿ-galakto sisi ÿ-galakto trans

Penekan
Penekan/ sidase ÿ-galakto sisi ÿ-galakto trans
penginduksi aktif sidase
Alolaktosa meresap
kompleks asetilase sisi ÿ-galakto
meresap
asetilase sisi ÿ-galakto
Produk mutan yang tidak berfungsi
Terjemahan
RNA Terjemahan
polimerase Transkripsi
Transkripsi

F' plasmid F' plasmid

SAYA + P+ ok Z– Y – SEBUAH – SAYA + P+ ok Z+ Y+ SEBUAH+

Represor tidak dapat mengikat Oc Represor tidak dapat mengikat Oc

Hadirnya penginduksi; produk gen lac operon fungsional disintesis Induser tidak ada; produk gen lac operon fungsional disintesis

(A) (B)

ÿ GAMBAR 17.8 Studi diploid parsial E. coli menunjukkan bahwa operator hanya bertindak dalam konfigurasi cis. Sintesis ÿ-galaktosidase
fungsional, ÿ-galaktosida permease, dan ÿ-galaktosida transasetilase (a) dapat diinduksi dalam diploid parsial genotipe Fÿ I +P+Oc ZÿYÿAÿ/ I
+ P+O+Z +Y+A+ dan (b) konstitutif dalam diploid parsial genotipe Fÿ I +P+Oc Z+Y+A+/I +P+O+ZÿYÿAÿ. Hasil ini menunjukkan bahwa
operator (O) bertindak cis; artinya, ia hanya mengatur gen struktural yang terletak pada kromosom yang sama.
Machine Translated by Google
Operon laktosa pada E. coli: induksi dan represi katabolit 471

MASALAH ÿ KETERAMPILAN PEMECAHAN

Menguji Pemahaman Anda tentang lac Operon

MASALAH
dan trans (pada kromosom yang berbeda) ke sana. Unsur regulasi jenis ini
Tabel berikut memberikan aktivitas relatif enzim ÿ-galaktosidase dan ÿ-galaktosida dikatakan cis- dan trans-acting.
permease dalam sel dengan genotipe berbeda di lokus lac pada E. coli. Tingkat 6. Operator tipe liar (O+) berisi urutan nukleotida yang berfungsi sebagai tempat

aktivitas yang diinduksi dari masing-masing enzim dalam sel E. coli tipe liar yang tidak
membawa Fÿ ditetapkan secara sewenang-wenang pada 100 unit, dan semua tingkat
enzim lainnya diukur relatif terhadap tingkat yang diamati dalam sel tipe liar ini.
Berdasarkan data yang diberikan pada tabel untuk genotipe 1 sampai 4, isikan tingkat
aktivitas yang diharapkan untuk genotipe 5 pada tempat (tanda kurung) yang tersedia.
7. Jumlah sintesis ÿ-galaktosidase dan ÿ-galaktosida permease dalam sel bergantung
-Galaktosida
-Galaktosidase meresap
pengikatan represor lac. Mutan konstitutif operator (Oc ) mengandung operator
dengan urutan nukleotida yang berubah (seringkali berupa penghapusan)
sehingga penekan lac tidak lagi berikatan atau berikatan secara tidak efisien.
Dengan demikian, tingkat sintesis enzim konstitutif akan bergantung pada apakah
represor berikatan lemah dengan operator mutan atau tidak sama sekali. Karena
operator lacO+ dan lacOc hanya mengatur ekspresi lac
gen pada kromosom yang sama, mereka disebut regulator akting cis.
pada jumlah salinan fungsional lacZ+
dan gen lacY+ di dalam sel.

Genotip ÿinduser +induser ÿinduser + induser ANALISIS DAN SOLUSI

1. Saya +O+Z+Y+ 0,2 100 0,2 100 1. Data yang diberikan untuk genotipe 1 (I +O+Z+Y+ = tipe liar) menunjukkan bahwa
2. Saya – O+Z+Y+ 100 100 100 100 sel-sel ini mensintesis 0,2 unit setiap enzim tanpa laktosa dan 100 unit dengan
3. Saya +Oc Z+Y+ 75 100 75 100 adanya laktosa.
4. Saya – O+Z+Y – / Fÿ Saya – O+Z+Y+ 200 200 100 100 2. Data untuk genotipe 2 (I ÿO+Z+Y+ = mutan represor-konstitutif) menunjukkan
bahwa tanpa adanya represor fungsional, sel mensintesis 100 unit setiap enzim
5. Saya – Oc Z – Y+ / Fÿ I +O+Z+Y+ ( ) ( ) ( ) ( )
baik ada atau tidak ada laktosa.
3. Mutan konstitutif operator (genotipe 3, I +Oc Z+Y+) dalam pertanyaan ini
FAKTA DAN KONSEP menghasilkan 75 unit setiap enzim tanpa laktosa dan 100 unit dengan adanya
laktosa. Meskipun sintesis enzim bersifat konstitutif, terdapat ikatan antara
1. Gen lacZ dan lacY masing-masing mengkode enzim ÿ-galaktosidase dan ÿ-
represor lac dengan operator lac jika tidak ada laktosa. Jika terdapat laktosa,
galaktosida permease. ÿ-galaktosida permease mengangkut laktosa ke dalam
pengikatan tersebut tidak lagi terjadi, dan sintesis enzim lak meningkat hingga
sel di mana ÿ-galaktosidase memecahnya menjadi glukosa dan galaktosa. Alel
tingkat yang diinduksi sepenuhnya (100 unit).
lacZ+ dan lacY+ dari gen-gen ini mengkode enzim fungsional, sedangkan alel
lacZÿ dan lacYÿ mengkode produk gen non-fungsional.
4. Data yang disajikan untuk genotipe 4 (diploid parsial I ÿO+Z+Yÿ/ Fÿ I ÿO+Z+Y+)
menunjukkan pengaruh dosis gen. Sel menghasilkan enzim dua kali lebih banyak
2. Pada sel E. coli tipe liar, gen lacZ+ dan lacY+ ditranskripsi hanya dengan adanya
ketika ada dua salinan gen tipe liar dibandingkan ketika hanya ada satu.
laktosa. Transkripsinya ditekan (dimatikan) dengan tidak adanya laktosa ketika ÿ-
galaktosidase dan ÿ-galaktosida per mease tidak memiliki apa pun untuk
5. Genotipe 5 (I ÿOc ZÿY+/Fÿ I +O+Z+Y+) adalah diploid parsial dengan dua salinan
dikatabolisme atau diangkut. Transkripsinya diinduksi ketika laktosa ditambahkan
operon lac. Ia memiliki dua salinan Y+ tetapi hanya satu salinan Z+. Ia memiliki I
ke media tempat sel berada
+ alel pada Fÿ, sehingga represor fungsional akan
tumbuh (lihat Gambar 17.4b). ada di dalam sel. Transkripsi gen kromosom akan dikendalikan
3. Mutan konstitutif E. coli mensintesis ÿ-galaktosidase dan ÿ-galaktosida permease oleh Oc
, sedangkan transkripsi gen pada Fÿ akan dikontrol oleh
secara terus menerus baik ada laktosa atau tidak.
HAI+. Semua ÿ-galaktosidase akan diproduksi oleh alel Z+ pada Fÿ; ada mutasi
Mutasi konstitutif ini ada dua jenis dan dipetakan pada dua lokasi berbeda di
Zÿ pada kromosom. Fÿ mengandung operon lac tipe liar, sehingga 0,2 unit ÿ-
dalam dan dekat operon lac pada kromosom E. coli. Beberapa mutasi konstitutif—
galaktosidase akan disintesis tanpa adanya laktosa, dan 100 unit akan disintesis
mutasi lacIÿ—terpetakan pada gen yang mengkode penekan lac; yang lainnya—
dengan adanya laktosa. Dalam kasus permease ÿ-galaktosida, kontribusi kedua
mutasi lacOc—dipetakan di wilayah operator—tempat di mana penekan lac
salinan gen Y+ harus dipertimbangkan dan digabungkan untuk menghitung jumlah
berikatan.
total enzim per sel. Dengan tidak adanya laktosa, 75 unit akan diproduksi dari
4. Penekan lac ( produk gen lacI+) berikatan dengan operator lac (O) dan mencegah
salinan kromosom gen Y+ dan 0,2 unit dari salinan pada Fÿ, dengan total 75,2
RNA polimerase berikatan dengan promotor lac dan menyalin gen-gen dalam
unit. Dengan adanya laktosa, 100 unit akan dibuat dari setiap salinan gen Y+ ,
operon lac (lihat Gambar 17.4). Alel mutan lacIÿ mengkodekan represor tidak aktif
sehingga totalnya menjadi 200 unit.
yang tidak dapat berikatan dengan operator lac.
Alel lacI+ dominan terhadap lacIÿ.
5. Penekan lac adalah protein yang dapat berdifusi; dengan demikian, lacI+ mengatur
ekspresi gen operon lac yang terletak di kedua cis (pada kromosom yang sama) Untuk diskusi lebih lanjut kunjungi situs Pendamping Mahasiswa.
Machine Translated by Google

472 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

NH 2 (ÿ Gambar 17.9). Karena CAP mengikat cAMP ketika mono

NH 2

N N nukleotida ini terdapat pada konsentrasi yang cukup, kadang-

N N
H H kadang disebut protein reseptor AMP siklik.
H N
N H N
N Promotor lac mengandung dua situs pengikatan terpisah,
satu untuk RNA polimerase dan satu lagi untuk kompleks
HAI HAI Adenilsiklase 5'
=

HAI
=

– CH2
CAP/cAMP (Gambar 17.10). Kompleks CAP/cAMP harus
HAI
O – P – O – P – O – P – O –CH 2
terdapat pada tempat pengikatannya pada promotor lac agar
–
–

HAI HAI
–– –

OO O = operon dapat diinduksi secara normal. Kompleks CAP/cAMP

H H P H H
HAI

H 3' dengan demikian memberikan kontrol positif terhadap

OH transkripsi operon lac . Ini mempunyai efek yang berlawanan
OH OH OH HAI

dengan efek pengikatan represor pada operator. Meskipun

ATP AMP siklik mekanisme pasti bagaimana CAP/cAMP menstimulasi
pengikatan RNA polimerase ke promotor masih belum pasti,
ÿ GAMBAR 17.9 Sintesis AMP siklik (cAMP) yang dikatalisis adenilsiklase dari ATP.
kontrol positifnya terhadap transkripsi lac operon ditentukan
dengan kuat oleh hasil percobaan in vivo dan in vitro . CAP
berfungsi sebagai dimer; jadi, seperti represor lac , status fungsionalnya multim
Hanya kompleks CAP/cAMP yang berikatan dengan promotor lac ; jika tidak ada
cAMP, CAP tidak mengikat. Dengan demikian, cAMP bertindak sebagai molekul
efektor, menentukan efek CAP pada transkripsi lac operon. Konsentrasi cAMP
intraseluler sensitif terhadap ada tidaknya glukosa. Konsentrasi glukosa yang tinggi
menyebabkan penurunan tajam konsentrasi cAMP intraseluler. Glukosa mencegah
aktivasi adenilsiklase, enzim yang mengkatalisis pembentukan cAMP dari ATP. Dengan
demikian, kehadiran glukosa menyebabkan penurunan konsentrasi cAMP intraseluler.
Dengan adanya konsentrasi cAMP yang rendah, CAP tidak dapat berikatan dengan
promotor operon lac . Sebaliknya, RNA polimerase tidak dapat berikatan secara efisien
dengan promotor lac jika tidak ada ikatan CAP/cAMP. Jadi, dengan adanya glukosa,
transkripsi operon lac tidak pernah melebihi 2 persen dari kecepatan induksi yang
diamati tanpa adanya glukosa. Dengan mekanisme serupa, CAP dan cAMP menjaga
operon arabinosa (ara) dan galaktosa (gal) E. coli agar tidak diinduksi dengan adanya glukosa.

PROTEINÿINTERAKSI DNA YANG MENGONTROL

TRANSKRIPSI lac OPERON
Urutan pasangan nukleotida daerah pengatur operon lac ditunjukkan pada Gambar
17.10. Studi perbandingan urutan nukleotida tipe mutan dan liar

Promotor

Operator3 CAP/cAMP RNA polimerase Operator1 Operator 2

saya gen
situs pengikatan situs pengikatan
gen Z

mRNA
iulaleM

umetreB
umetreBf
reS

itnehreB
mel

gnabret

nlG

5' GGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATG 3'

3' CCTTTCGCCCGTCACTCGCGTTGCGTTAATTACACTCAATCGAGTGAGTAATCCGTGGGGTCCGAAATGTGAAATACGAAGGCCGAGCATACAACACACCTTAACACTCGCCTATTGTTAAAGTGTGTCCTTTGTCGATACTGGTAC 5'

ÿ100 ÿ90 ÿ80 ÿ70 ÿ50 ÿ40 ÿ30 ÿ20 ÿ10 +1 +10 +20 +30 +40

ÿ GAMBAR 17.10 Organisasi wilayah promotor-operator lac operon. Promotor terdiri dari dua komponen: (1)
situs yang mengikat kompleks CAP/cAMP dan (2) situs pengikatan RNA polimerase. Segmen gen struktural
lacI (represor) dan lacZ (ÿ-galaktosidase) yang berdekatan serta operator lac O1 dan O3 juga ditampilkan. Operator O2
terletak di hilir (berpusat pada posisi +412) pada gen lacZ. Garis horizontal berlabel mRNA menunjukkan posisi
dimulainya transkripsi operon (ujung 5ÿ lac mRNA). Angka di bawah menunjukkan jarak pasangan nukleotida
dari tempat inisiasi transkrip (posisi +1). Titik di antara dua untaian nukleotida menunjukkan pusat simetri
palindrom tidak sempurna.
Machine Translated by Google
Operon laktosa pada E. coli: induksi dan represi katabolit 473

promotor dan operator, selain CAP / Pembengkokan DNA oleh CAP/cAMP Struktur kompleks CAP/cAMP/DNA
studi cAMP, RNA polimerase, dan pengikatan represor serta data Bengkok

DNA
kristalografi sinar-X, telah memberikan informasi penting tentang
interaksi protein-asam nukleat spesifik urutan yang mengatur

z.ste
isnr,e
santa ilrn
vkie
a etU
aA A
S
Y
pJ
transkripsi operon lac .
Salah satu interaksi utama melibatkan pengikatan RNA TOPI
polimerase ke tempat pengikatannya pada promotor lac (lihat Bab 11). 5'
3'
Interaksi penting lainnya adalah pengikatan CAP/cAMP ke tempat
pengikatannya pada promotor lac (dibahas pada bagian
kamp
sebelumnya). Yang ketiga adalah pengikatan represor lac ke
(B)
operator lac . (A)

Pertama mari kita periksa pengikatan CAP/cAMP ke situs ÿ GAMBAR 17.11 Interaksi CAP/cAMP dengan situs
pengikatannya di promotor lac . CAP/cAMP mengontrol represi
pengikatannya pada promotor lac. (a) Ketika CAP/cAMP,
katabolit; pengikatan CAP/cAMP ke promotor diperlukan untuk induksi operon lac yang suatu regulator positif, berikatan dengan promotor lac,
efisien . Bagaimana pengikatan CAP/cAMP merangsang transkripsi gen struktural lac ? RNA ia menghasilkan lengkungan lebih dari 90° pada DNA. (b)
polimerase tidak dapat berikatan secara efisien ke tempat pengikatannya di promotor lac Struktur kompleks yang dibentuk oleh CAP/cAMP dan
kecuali CAP/cAMP sudah terikat. Ketika CAP/cAMP berikatan dengan DNA, ia membengkokkan molekul DNA sintetik 30-bp yang mengandung situs
DNA (ÿ Gambar 17.11a). Studi sinar-X menunjukkan bahwa DNA bengkok saat terbungkus pengikatan CAP/cAMP berdasarkan studi sinar-X.
pada permukaan kompleks CAP/cAMP (ÿ Gambar 17.11b). Ingatlah bahwa situs pengikatan
CAP/cAMP dan RNA polimerase berdekatan satu sama lain dalam promotor lac (lihat Gambar
17.10). Agaknya, pembengkokan DNA oleh CAP/cAMP mendorong situs yang lebih terbuka
untuk RNA polimerase dan dengan demikian meningkatkan pengikatan dan transkripsi gen
struktural. Namun, terdapat juga bukti adanya kontak antara RNA polimerase dan CAP/cAMP,
sehingga gambaran lengkapnya mungkin lebih kompleks daripada sekadar pembengkokan
DNA.
Selanjutnya, mari kita periksa pengikatan represor lac ke operator lac , yang mencegah
RNA polimerase menyalin gen struktural dalam operon. Ingatlah bahwa operon lac dikendalikan
oleh tiga operator: operator primer—O1—dan dua operator sekunder—O2 dan O3 (lihat Gambar
17.5 dan 17.10). O1 adalah operator asli yang diidentifikasi oleh Jacob dan Monod; itu terletak
di antara promotor dan Z
gen. O2 terletak di hilir O1 dalam gen Z , dan O3 terletak di hulu promotor. Represi maksimum
membutuhkan ketiga operator; namun, represi kuat terjadi selama O1 dan O2 atau O3 masih
ada. Mengapa diperlukan dua operator untuk melakukan represi yang efisien? Untuk menjawab
pertanyaan ini, kita perlu melihat pengikatan represor ke operator secara spesifik urutan.

Bentuk aktif dari represor lac adalah tetramer yang mengandung empat salinan produk
gen lacI . Studi sinar-X terhadap struktur yang dibentuk oleh represor lac dan situs pengikatan
sintetik 21-bp menunjukkan bahwa setiap represor tetramerik mengikat dua rangkaian operator
secara bersamaan (ÿ Gambar 17.12a). Akibatnya, tetramer terdiri

Struktur represor lac/O1–O3

kompleks DNA operator/CAP/cAMP

Pengikatan represor lac ke dua represor sintetis

DNA operator

ÿ GAMBAR 17.12 Interaksi represor lac dengan situs

pengikatannya pada operator lac. (a) Pengikatan
9.G
6iaa2
7 S
2
1
6

7G
P
S2
1
kU
P
L
d

:5
1

uitM
U
A
P
p
d
L

1.iaec1
2
ee
uitM
A
P
p
d
L

6m
n
nkin

.s4

oe
a
rtoe
a

:en5
eniv.w

ra2,b,1

irtn

nn4m
cnna

cnna
nallne,ysehziskw

shzisvkw

lya2csb,1
.ainsaavtilsyrss

–74

r,ye
ilslne

re
,ain–a7v,4
santa

represor lac tetramerik ke dua DNA 21-bp yang

mengandung rangkaian pengenalan represor. (b)
Struktur montase loop 93-bp terbentuk ketika represor
tetramerik terikat pada lac
operator O1 dan O3. CAP/cAMP (biru) ditampilkan
di dalam loop yang terkait dengan situs pengikatannya
(A) (B) di promotor lac.
Machine Translated by Google
474 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

dari dua dimer, masing-masing dengan situs pengikatan spesifik urutan. Salah satu dimer berikatan
dengan O1, dan yang lainnya berikatan dengan O2 atau O3. Dengan melakukan hal ini, represor
membengkokkan DNA sehingga membentuk jepit rambut (O1 dan O2) atau lingkaran (O1 dan
O3). Struktur kompleks represor O1–O3 yang diusulkan ditunjukkan pada Gambar 17.12b.
Perhatikan keberadaan CAP/cAMP dalam loop DNA yang terbentuk ketika represor lac terikat pada kedua O1
dan O3 (Gambar 17.12b).
Diketahui bahwa loop DNA serupa dibentuk oleh pengikatan aktivator protein dan
penekan operon lain pada E. coli dan bakteri lain. Protein pengatur memiliki kemampuan
untuk berikatan dengan DNA dalam urutan tertentu, mengubah struktur DNA, dan
merangsang atau menekan transkripsi gen struktural di sekitarnya.
Pemahaman lengkap tentang regulasi ekspresi gen memerlukan pengetahuan rinci tentang
interaksi penting ini.

POIN-POIN PENTING Operon E. coli lac adalah sistem yang dapat diinduksi secara negatif dan dapat ditekan oleh katabolit; tiga
gen struktural dalam operon lac ditranskripsi pada tingkat tinggi hanya dengan adanya laktosa dan tidak
adanya glukosa.

Dengan tidak adanya laktosa, represor lac berikatan dengan operator lac dan mencegah RNA
polimerase memulai transkripsi operon.

Represi katabolit menjaga agar operon seperti enzim penyandi lac yang terlibat dalam katabolisme
karbohidrat tidak diinduksi dengan adanya glukosa, sumber energi pilihan.

Pengikatan kompleks CAP/ cAMP ke tempat pengikatannya di promotor lac membengkokkan DNA dan
membuatnya lebih mudah diakses oleh RNA polimerase.

Represor lac mengikat dua operator — O1 dan O2 atau O1 dan O3—secara bersamaan dan
membengkokkan DNA menjadi jepit rambut atau lingkaran.

Operon Triptofan di E. coli: Represi dan Atenuasi

Gen struktural dalam operon triptofan ditranskripsi
hanya jika triptofan tidak ada atau terdapat dalam
konsentrasi rendah. Ekspresi gen dalam operon trp
diatur oleh represi inisiasi transkripsi dan dengan
pelemahan (penghentian dini) transkripsi ketika
triptofan lazim di lingkungan.
mekanisme regulasi ini dalam dua bagian berikut.
Operon trp dari E. coli mengontrol sintesis enzim yang
mengkatalisis biosintesis asam amino triptofan. Fungsi dari
lima gen struktural dan urutan pengaturan yang berdekatan
dari operon trp telah dianalisis secara rinci oleh Charles
Yanofsky dan rekannya. Lima gen struktural mengkode enzim
yang mengubah asam choris mic menjadi triptofan. Ekspresi
operasi trp diatur pada dua tingkat: represi, yang mengontrol
inisiasi transkripsi, dan atenuasi, yang mengatur frekuensi
penghentian transkrip prematur. Kami akan membahas

REPRESI
Operon trp dari E. coli adalah operon negatif yang dapat ditekan. Organisasi trp
operon dan jalur biosintesis triptofan ditunjukkan pada Gambar 17.13. Gen trpR , yang
mengkode represor trp , tidak terkait erat dengan operon trp . Wilayah operator (O) dari
operon trp terletak di wilayah promotor utama (P1) .
Ada juga promotor lemah (P2) di ujung operator-distal gen trpD . P2 _
promotor meningkatkan tingkat dasar transkripsi gen trpC, trpB, dan trpA .
Dua urutan terminasi transkripsi (t dan tÿ) terletak di hilir dari trpA.
Wilayah trpL menentukan urutan pemimpin mRNA sepanjang 162 nukleotida.
Regulasi transkripsi operon trp digambarkan pada Gambar 17.4c.
Dengan tidak adanya triptofan (ko-represor), RNA polimerase berikatan dengan
Machine Translated by Google
Operon Triptofan di E. coli: Represi dan Atenuasi 475

ilvC
memberikan

trpR

operonnya lac operon

trp operon

LEDCBA

P1

HAI
trpL trpE trpD trpC trpB trpA T T'
Hai

40 162 1560 1590 1353 1191 804 36 ô250

2 6 14 2
A hal2

ÿ Indole ÿ ÿ

polipeptida polipeptida gliserolfosfat polipeptida polipeptida

sintetase

Antranilat triptofan
sintetase sintetase
(ÿ2 2) (ÿ2ÿ2)

paduan suara Antranilik

PRA CDRP Dalam GP triptofan
asam asam

ÿ GAMBAR 17.13 Organisasi operon trp (triptofan) pada E. coli. Operon trp berisi lima gen struktural yang mengkode
enzim yang terlibat dalam biosintesis triptofan, seperti yang ditunjukkan di bagian bawah, dan wilayah pengatur trpL.
Panjang setiap gen atau wilayah diberikan dalam pasangan nukleotida; jarak antargenik ditunjukkan di bawah urutan
gen. Kunci: PRA, fosforibosil antranilat; CDRP, karboksifenilamino-deoksiribulosa fosfat; dan InGP, indole-gliserol fosfat.

wilayah promotor dan mentranskripsikan gen struktural operon. Dengan adanya

triptofan, kompleks ko-represor/represor berikatan dengan wilayah operator dan
mencegah RNA polimerase memulai transkripsi gen dalam operon.

Laju transkripsi operon trp dalam keadaan tertekan (tidak adanya triptofan) adalah
70 kali lipat laju transkripsi yang terjadi pada keadaan tertekan (adanya triptofan).
Pada mutan trpR , yang tidak memiliki represor fungsional, laju sintesis enzim biosintetik
triptofan masih berkurang sekitar sepuluh kali lipat dengan penambahan triptofan ke
dalam medium. Pengurangan tambahan dalam ekspresi operon trp ini disebabkan oleh
atenuasi, yang akan dibahas selanjutnya.

ATENUASI
Penghapusan yang menghilangkan sebagian wilayah trpL (Gambar 17.13) menghasilkan
peningkatan laju ekspresi operon trp . Namun, penghapusan ini tidak berpengaruh
pada represibilitas operon trp ; artinya, represi dan derepresi terjadi seperti pada trpL+
strain. Hasil ini menunjukkan bahwa sintesis enzim biosintetik triptofan diatur pada
tingkat kedua melalui mekanisme yang tidak bergantung pada represi/dere presi dan
memerlukan rangkaian nukleotida yang ada di wilayah trpL pada operon trp .
Machine Translated by Google

476 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

Komponen regulasi wilayah trpL

Peptida pemimpin
71 110 141 gen trpE
1 26 162
Bertemu–Lys-Ala-Ile-Phe-Val-Leu-Lys-Gly-Trp-Trp-Arg-Thr-Ser Wilayah 2 Wilayah 3 Wilayah 4
5' pppAAGUUCACGUAAAAAGGGUAUCGACAAUGAAAGCAAUUUUCGUACUGAAAGGUUGGUGGCGCACUUCCUGAAACGGGGCAGUAUUCACCAUGCGUAAAGCAAUCAGAUACCCAGCCCGCCUAAUGAGCGGGCUUUUUUUU GAACAAAAUUAGAGAAUAACAAUGCAAACACAAAAACC… 3'
53 Wilayah 1
Pemimpin
Pemimpin Urutan atenuasi trpE
kodon Trp
peptida peptida Pemrakarsa
pemrakarsa
penghentian kodon
kodon kodon

(A)

Struktur sekunder alternatif yang dibentuk oleh transkrip trpL

Alternatif 1: Wilayah 1 dan 2 Alternatif 2: Wilayah 2 dan 3

pasangan basa dan wilayah berpasangan basa
3 dan 4 berpasangan basa

5'
54

trp
kodon

5'
1 2 140 54
2 3

3'
1
Berhenti 4
kodon 3
4
Berhenti
kodon

Transkripsi – penghentian Transkripsi – penghentian

jepit rambut jepit rambut TIDAK bisa terbentuk.
(B)

ÿ GAMBAR 17.14 Urutan di wilayah pemimpin trp mRNA yang bertanggung jawab atas atenuasi. (a) Urutan trpL,
menyoroti urutan yang mengkode peptida pemimpin, dua kodon triptofan tandem yang bertanggung jawab untuk
mengontrol atenuasi oleh triptofan, dan empat wilayah (diarsir) yang membentuk struktur batang-dan-lingkaran atau jepit
rambut yang ditunjukkan pada ( B). (b) Struktur sekunder alternatif yang dibentuk oleh trpL mRNA—antara (1) wilayah
1 akan berpasangan dengan wilayah 2 dan wilayah 3 dengan wilayah 4, membentuk jepit rambut transkripsi-terminasi,
atau (2) wilayah 2 akan berpasangan dengan wilayah 3, mencegah wilayah 3 berpasangan dengan wilayah 4.
Konsentrasi triptofan dalam sel menentukan struktur mana yang akan terbentuk selama transkripsi operon trp.

Regulasi tingkat kedua dari operon trp ini disebut atenuasi, dan urutan dalam trpL yang
mengontrol fenomena ini disebut attenuator.
(ÿ Gambar 17.14a). Atenuasi terjadi melalui kontrol penghentian transkripsi pada lokasi
dekat akhir rangkaian pemimpin mRNA. Penghentian transkripsi operon trp secara
“prematur” ini hanya terjadi jika terdapat tRNATrp yang bermuatan triptofan. Ketika
penghentian atau pelemahan dini ini terjadi, transkrip trp terpotong (140 nukleotida) dihasilkan.

Wilayah attenuator mempunyai urutan pasangan nukleotida yang pada dasarnya identik
dengan sinyal transkripsi-terminasi yang ditemukan di ujung sebagian besar operon bakteri.
Sinyal terminasi ini mengandung palindrom kaya G:C diikuti oleh beberapa pasangan basa
A:T. Transkripsi sinyal terminasi ini menghasilkan RNA baru dengan potensi membentuk
struktur jepit rambut berikatan hidrogen diikuti oleh beberapa urasil.
Machine Translated by Google
Operon Triptofan di E. coli: Represi dan Atenuasi 477

Ketika transkrip yang baru lahir membentuk struktur jepit rambut ini, hal itu menyebabkan perubahan
konformasi pada RNA polimerase terkait, yang mengakibatkan penghentian transkripsi di wilayah ikatan Selesaikan!
hidrogen (A:U)n yang lebih lemah pada pasangan basa DNA-RNA .

Regulasi Histidin
Oleh karena itu, urutan nukleotida attenuator menjelaskan kemampuannya untuk menghentikan
transkripsi operon trp sebelum waktunya. Namun bagaimana hal ini dapat diatur oleh ada atau tidaknya
Operon Salmonella
triptofan? typhimurium
Pertama, ingat bahwa transkripsi dan terjemahan digabungkan dalam prokariota; artinya, ribosom Asam amino histidin disintesis dari 5-fosforibosil 1-
mulai menerjemahkan mRNA saat mereka masih disintesis. Dengan demikian, peristiwa yang terjadi pirofosfat dan ATP melalui serangkaian 10 reaksi
selama penerjemahan juga dapat mempengaruhi transkripsi. yang dikatalisis oleh enzim yang dikodekan oleh
Kedua, perhatikan bahwa rangkaian pemimpin sepanjang 162 nukleotida dari operon trp mRNA delapan gen yang berdekatan dalam operon histidin
berisi rangkaian yang dapat berpasangan basa untuk membentuk struktur batang-dan-lingkaran atau Salmonella typhimurium. Operonnya ditranskripsi
jepit rambut bergantian (ÿ Gambar 17.14b). Empat wilayah pemimpin yang dapat berpasangan basa sebagai unit yang menghasilkan mRNA multigenik.

untuk membentuk struktur ini adalah (1) nukleotida 60–68, (2) nukleotida 75–83, (3) nukleotida 110– Operon diekspresikan pada tingkat tinggi ketika
konsentrasi histidin rendah, namun pada tingkat
121, dan (4) nukleotida 126–134. Panjang sebenarnya dari wilayah yang terlibat dalam pasangan basa
rendah ketika kadar histidin tinggi. Urutan nukleotida
bervariasi tergantung pada wilayah mana yang berpasangan. Urutan nukleotida dari keempat wilayah
dari untai nontemplate dari wilayah pemimpin 5ÿ
ini sedemikian rupa sehingga wilayah 1 dapat berpasangan dengan wilayah 2, wilayah 2 dapat yang tidak diterjemahkan dari operonnya ditunjukkan
berpasangan dengan wilayah 3, dan wilayah 3 dapat berpasangan dengan wilayah 4. Wilayah 2 dapat dalam urutan berikut, bersama dengan urutan asam
berpasangan dengan wilayah 1 atau wilayah 3, namun, tentu saja, ia hanya dapat dipasangkan amino yang diprediksi (menggunakan kode satu
dengan salah satu wilayah ini pada waktu tertentu. Dengan demikian, ada dua kemungkinan struktur huruf) dari peptida pemimpin yang ditentukan oleh
sekunder untuk rangkaian pemimpin trp : (1) wilayah 1 berpasangan dengan wilayah 2 dan wilayah 3 ORF kecil dan lima asam amino pertama dari hisG
berpasangan dengan wilayah 4 atau (2) wilayah 2 berpasangan dengan wilayah 3, sehingga wilayah 1
dan 4 tidak berpasangan. Pemasangan wilayah 3 dan 4 menghasilkan jepit rambut transkripsi-terminasi
yang disebutkan sebelumnya. Jika wilayah 3 berpasangan dengan wilayah 2, wilayah tersebut tidak produk. Selain itu, enam daerah yang mampu
membentuk struktur batang-dan-lingkaran (jepit
dapat berpasangan dengan wilayah 4, dan jepit rambut transkripsi-terminasi tidak dapat terbentuk.
rambut) berpasangan basa disebut 1–6.
Seperti yang mungkin sudah Anda duga sekarang, ada atau tidaknya triptofan menentukan struktur alternatif mana yang akan terbentuk.
Ketiga, perhatikan bahwa rangkaian pemimpin berisi kodon inisiasi translasi AUG, diikuti oleh 13
ATCAAATGAATAAGCATTCATCGGAATTTTTATGACACGCGTTCAA
kodon untuk asam amino, diikuti oleh kodon translasi-terminasi UGA (Gambar 17.14a). Selain itu, +1 M TRVQ
rangkaian pemimpin trp berisi situs pengikatan ribosom yang efisien yang terletak pada posisi yang 1 2

sesuai untuk inisiasi penerjemahan pada kodon inisiasi pemimpin AUG. Semua bukti yang tersedia TTTAAACACCACCATCAT CACCATCATCCTGAC TAGCTTTCAGG
menunjukkan bahwa “peptida pemimpin” 14-asam amino disintesis seperti yang digambarkan pada FK HHHH HHH PD Ketentuan.

Gambar 17.14a.
CGATGTGTGCTGGAAGACATTCAGATCTTCCAGCGGCGCATGAAC

Jepit rambut transkripsi-penghentian operon trp normal ditunjukkan pada ÿ Gambar 17.15a, dan 3 4
5 6
mekanisme pelemahan transkripsi operon trp yang diusulkan digambarkan dalam ÿ Gambar 17.15b
GCATGAGAAAAGCCCCCGGAAGATCATCTTCCGGGGGCTTTTTTTT
dan c. Peptida pemimpin mengandung dua residu triptofan yang berdekatan.
Kedua kodon Trp diposisikan sedemikian rupa sehingga dalam konsentrasi triptofan yang rendah (dan
dengan demikian konsentrasi Trp-tRNATrp yang rendah), ribosom akan berhenti sebelum bertemu TGGCGCGCGATACAGACCGGTTCAGACAGGATAAAGAGGAACGC
dengan struktur pasangan basa yang dibentuk oleh daerah pemimpin 2 dan 3 (Gambar 17.15b).
Karena pemasangan daerah 2 dan 3 menghalangi pembentukan jepit rambut transkripsi-terminasi oleh
pasangan basa daerah 3 dan 4, transkripsi akan terus melewati attenuator ke dalam gen trpE tanpa AGAATGTTAGACAACACC
MLDNT
adanya triptofan. miliknyaG

Dengan adanya triptofan yang cukup, ribosom dapat menerjemahkan melewati kodon Trp ke
kodon terminasi peptida pemimpin. Dalam prosesnya, hal ini akan mengganggu pasangan basa antara Berdasarkan informasi di atas, usulkan suatu
wilayah pemimpin 2 dan 3. Gangguan ini membuat wilayah 3 bebas berpasangan dengan wilayah 4, mekanisme yang dapat mengatur ekspresi operonnya.

sehingga membentuk jepit rambut transkripsi-terminasi (Gambar 17.15c).

Jadi, dengan adanya triptofan yang cukup, transkripsi sering kali (sekitar 90 persen) berakhir di ÿ Untuk melihat solusi masalah ini, kunjungi situs
attenuator, sehingga mengurangi jumlah mRNA untuk gen struktural trp . Pendamping Siswa.

Transkripsi operon trp dapat diatur dalam rentang hampir 700 kali lipat dengan efek gabungan dari
represi (hingga 70 kali lipat) dan atenuasi (hingga 10 kali lipat).

Regulasi transkripsi dengan atenuasi tidak hanya terjadi pada operon trp . Lima operon lainnya
(thr, ilv, leu, phe, dan his) diketahui diatur oleh atenuasi. Operonnya , yang selama bertahun-tahun
dianggap dapat direpresi, kini diyakini diatur seluruhnya melalui pelemahan . Meskipun detail kecil
bervariasi dari satu operon ke operon lainnya, fitur utama atenuasi adalah sama untuk keenam operon.
Coba Selesaikan: Regulasi
Machine Translated by Google
478 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

G kamu
AA 100
DNA C A
GCCGCCAGTTCCGCTGGCGGCATTTT
............ ...... .. ... .. .. ......... ... ...............
.. ... .. ... .. ... .. G G
CGGCGGTCAAGGCGACCGCCGTAAAA kamu
C
A
A
Transkripsi 90 C
A
C
kamu

mRNA GCCGCCAGUUCCGCUGCGGGCA UUUU A C

C A
UU G

..
100 _
A

..
kamu

60 70 80
Transkripsi–

..
G CAUUUU

...
Usulan C G GGUGGCGCACUUCCUGAAACGGGCAGUG Terminator UA

...
C

...
transkripsi – C G ... Lys Gly Trp Trp Arg Thr Ser BERHENTI jepit rambut

terminasi G C
C
C telah terbentuk
...

Peptida pemimpin

..
struktur C G A UUUUUUU
...

kamu

jepit rambut C G G C
...

C G 140
A
..

kamu

G C C G
...

kamu G C G 130
Pergerakan ribosom ke kodon G C
universitas
C peptida pemimpin UGA "STOP" C G
A
ketika ada Trp-tRNA C G

... ... ... ... ... ... ...

(a) Struktur urutan transkripsi-terminasi operon trp t dan pembentukan UU
jepit rambut transkripsi-terminasi. AA

(c) Dengan adanya triptofan yang cukup, translasi berlanjut melewati kodon
G kamu
AA 100
C A Trp ke kodon terminasi dan mengganggu pasangan basa antara
G G
wilayah pemimpin 2 dan 3. Proses ini membuat wilayah 3 bebas
kamu
C
A berpasangan dengan wilayah 4 untuk membentuk jepit rambut
A
90 C transkripsi-terminasi , yang menghentikan transkripsi pada urutan attenuator.
A
C
kamu

A C
C A
UU A G
.. ..

A
..

kamu

A 110
..

kamu Jepit rambut

G C terminator
...

universitas

80 transkripsi tidak dapat terbentuk

G C
...

AA kamu UUUUUUU
C G C
...

G C G 140
...

G C G
...

50 60 70
G C G 130
...

AAAGGUUGGUGGCGCACUUCCUGAAA C G C
...

Lys Gly Trp Trp

C G
A
C
Peptida
kamu UG
pemimpin
AA

Posisi di mana ribosom akan berhenti tanpa

Trp-tRNA yang cukup untuk merespons dua
ÿ GAMBAR 17.15 Pengendalian operon trp dengan atenuasi. (a) Sinyal transkripsi-
kodon UGG Trp (b)
terminasi pada E. coli mengandung wilayah simetri angka dua (panah) yang menghasilkan
Dengan tingkat triptofan yang rendah, translasi rangkaian pemimpin
rangkaian mRNA yang dapat membentuk struktur jepit rambut. (b) Dalam triptofan
terhenti di salah satu kodon Trp. Penghentian ini memungkinkan wilayah pemimpin
2 dan 3 untuk berpasangan, yang mencegah wilayah 3 berpasangan dengan konsentrasi rendah, transkripsi berlangsung melewati urutan attenuator melalui
wilayah 4 untuk membentuk jepit rambut transkripsi-terminasi. Dengan seluruh operon trp. (c) Dengan adanya triptofan yang cukup, transkripsi sering kali
demikian, transkripsi berlangsung melalui seluruh operon trp. berakhir pada urutan atenuasi.

dari Histidine Operon of Salmonella typhimurium untuk menguji pemahaman Anda

tentang atenuasi. Selain itu, bacalah Fokus pada Lysine Riboswitch di situs Student
Companion untuk informasi mengenai mekanisme regulasi terkait.

POIN-POIN PENTING Operon E. coli trp adalah sistem yang dapat ditekan secara negatif; transkripsi lima gen struktural dalam
operon trp ditekan dengan adanya konsentrasi triptofan yang signifikan.

Operon seperti trp yang mengkode enzim yang terlibat dalam jalur biosintetik asam amino sering kali
dikendalikan oleh mekanisme pengaturan kedua yang disebut atenuasi.

Atenuasi terjadi melalui penghentian dini transkripsi pada suatu lokasi di urutan pemimpin mRNA (urutan
5ÿ ke daerah pengkode) ketika triptofan lazim di lingkungan tempat bakteri tumbuh.
Machine Translated by Google
Regulasi Ekspresi Gen Pascatranskripsi pada Prokariota 479

Regulasi Ekspresi Gen Pascatranskripsi pada Prokariota

KONTROL TERJEMAHAN Ekspresi gen disempurnakan dengan memodulasi
EKSPRESI GEN intensitas sintesis polipeptida, dan aktivitas
Meskipun ekspresi gen pada prokariota diatur terutama pada tingkat enzimatik gelombang polipep dapat dihentikan
transkripsi, penyesuaian sering kali terjadi pada tingkat translasi. Pada
prokariota, molekul mRNA seringkali bersifat multigenik, membawa oleh produk akhir dari jalur metabolisme yang diaturnya.
urutan pengkodean beberapa gen. Misalnya, mRNA operon E. coli lac
mengandung urutan nukleotida yang mengkode ÿ-galaktosidase, ÿ-galaktosida permease,
dan ÿ-galaktosida transasetilase. Jadi, ketiga gen yang mengkode protein ini harus dihidupkan
dan dimatikan bersama-sama pada tingkat transkripsi karena gen-gen tersebut ditranskripsikan
bersama. Meskipun demikian, ketiga produk gen tersebut tidak disintesis dalam jumlah yang
sama. Sel E. coli yang tumbuh pada media kaya dengan laktosa sebagai satu-satunya sumber
karbon mengandung sekitar 3000 molekul ÿ-galaktosidase, 1500 molekul ÿ-galaktosida
permease, dan 600 molekul ÿ-galaktosida transasetilase. Jelasnya, jumlah protein yang
berbeda per sel harus dikontrol secara pascatranskripsi.

Ingatlah bahwa transkripsi, translasi, dan degradasi mRNA digabungkan dalam

prokariota; molekul mRNA biasanya terlibat dalam ketiga proses pada waktu tertentu. Dengan
demikian, produk gen dapat diproduksi dalam jumlah berbeda dari transkrip yang sama
melalui beberapa mekanisme.

1. Efisiensi inisiasi translasi yang tidak seimbang diketahui terjadi pada kodon awal ATG dari
gen yang berbeda.
2. Perubahan efisiensi pergerakan ribosom melalui daerah intergenik pada transkrip cukup
umum terjadi. Penurunan laju translasi sering kali diakibatkan oleh jepit rambut atau
bentuk struktur sekunder lainnya yang menghambat migrasi ribosom di sepanjang molekul
mRNA.

3. Perbedaan tingkat degradasi daerah tertentu dari molekul mRNA juga terjadi.

MEKANISME PERATURAN PASCA TRANSLASI

Sebelumnya dalam bab ini, kita telah membahas mekanisme dimana transkripsi
gen bakteri yang mengkode enzim dalam jalur biosintetik ditekan ketika produk
dari jalur tersebut terdapat dalam media di mana sel tumbuh. Penyesuaian Substrat

regulasi metabolisme yang kedua dan lebih cepat sering kali terjadi pada
tingkat aktivitas enzim. Adanya konsentrasi produk akhir jalur biosintetik yang
cukup sering mengakibatkan penghambatan enzim pertama pada jalur tersebut Substrat
Intermediat Produk akhir
situs pengikatan
(ÿ Gambar 17.16). Fenomena ini disebut penghambatan umpan balik atau
penghambatan produk akhir. Penghambatan umpan balik menghasilkan
penghentian sintesis produk akhir yang hampir seketika ketika ditambahkan ke
media.
Enzim
Jalur biosintetik triptofan pada E. coli memberikan ilustrasi yang baik Produk akhir
tentang penghambatan umpan balik. Produk akhir—triptofan—diikat oleh enzim situs pengikatan
Substrat tidak
pertama pada jalur tersebut—anthranilate synthetase (lihat Gambar 17.13)— terikat pada diubah
dan menghentikan aktivitasnya sepenuhnya, sehingga segera menghentikan tempat

sintesis triptofan. pengikatan substrat

Enzim yang sensitif terhadap penghambatan umpan balik mengandung Enzim setelahnya
situs (atau situs) pengikatan produk akhir selain situs (atau situs) pengikatan transisi alosterik dalam Produk akhir
konformasi terikat di efektor
substrat. Dalam kasus enzim multimerik, produk akhir atau situs pengikatan
tempat pengikatan molekul
pengatur sering kali berada pada subunit (polipeptida) yang berbeda dari situs substrat.
Setelah mengikat produk akhir, enzim tersebut mengalami transisi alosterik ÿ GAMBAR 17.16 Penghambatan umpan balik aktivitas produk gen.
yang mengurangi afinitasnya terhadap substrat. Protein yang mengalami Produk akhir dari jalur biosintetik sering kali mengikat dan
perubahan konformasi disebut sebagai protein alosterik. Banyak, mungkin menghentikan aktivitas enzim pertama dalam jalur tersebut,
sebagian besar, enzim mengalami beberapa jenis transisi alosterik. sehingga dengan cepat menghalangi sintesis produk akhir.
Machine Translated by Google
480 Bab 17 Regulasi Ekspresi Gen pada Prokariota

Transisi alosterik juga tampaknya bertanggung jawab atas aktivasi enzim, yang sering terjadi ketika
suatu enzim mengikat satu atau lebih substratnya atau beberapa molekul kecil lainnya.
Beberapa enzim menunjukkan spektrum aktivasi dan penghambatan yang luas oleh banyak molekul
efektor yang berbeda. Contohnya adalah enzim glutamin sintetase, yang mengkatalisis langkah terakhir
dalam biosintesis asam amino glutamin. Glutamin sintetase adalah enzim multimerik kompleks pada
prokariota dan eukariota. Sintetase glutamin dari E. coli telah terbukti merespons, baik melalui aktivasi
atau penghambatan, terhadap 16 metabolit berbeda, mungkin melalui transisi alosterik.

POIN PENTING Penghambatan umpan balik terjadi ketika produk jalur biosintetik menghambat aktivitas
enzim pertama di jalur tersebut, dengan cepat menghentikan biosintesis produk.
Aktivasi enzim terjadi ketika substrat atau molekul efektor lainnya meningkatkan aktivitas enzim,
meningkatkan laju sintesis produk jalur biosintetik.

Penyesuaian regulasi sering kali terjadi pada tingkat translasi melalui modulasi laju inisiasi rantai
polipeptida atau pemanjangan rantai.

Latihan Dasar
Ilustrasikan Analisis Genetik Dasar

1. Bagaimana mekanisme regulasi positif dan negatif dapat dibedakan?
Jawaban: Mutasi pada gen pengatur yang menghasilkan produk nonfungsional
akan mempunyai dampak yang sangat berbeda pada sistem kendali
positif dan negatif. Pada rangkaian kontrol positif, mutasi tersebut akan
membuat ekspresi gen yang diatur tidak dapat dihidupkan, sedangkan
pada rangkaian kontrol negatif, mutasi ini akan membuat ekspresi gen
yang diatur tidak dapat dimatikan.
2. Bagaimana cara membedakan operon yang dapat diinduksi dan yang
dapat ditekan?
Jawaban: Jika tidak ada molekul efektor, maka operasi induksi akan
dimatikan, sedangkan operon yang dapat ditekan akan diaktifkan.
3. Bagaimana unsur regulasi cis dan trans-acting dapat dibedakan?
terjadi pelemahan. Wilayah pemimpin mRNA mempunyai urutan yang
dapat berpasangan basa untuk membentuk struktur jepit rambut
alternatif, salah satunya adalah sinyal transkripsi-terminasi yang khas.
Terbentuknya jepit rambut atau tidak bergantung pada translasi peptida
pemimpin yang mengandung dua residu triptofan. Ketika kadar triptofan
rendah, translasi berhenti pada kodon Trp, yang mencegah
pembentukan jepit rambut transkripsi-terminasi (lihat Gambar 17.15b).
Ketika triptofan mencukupi, translasi dilanjutkan melewati kodon Trp
ke kodon translasi-terminasi, sehingga mengganggu hairpin pertama.
Hal ini, pada gilirannya, memungkinkan terbentuknya jepit rambut
transkripsi-terminasi dan atenuasi (penghentian transkripsi pada
attenuator) terjadi (lihat Gambar 17.15c). Atenuasi menurunkan sintesis
enzim biosintetik triptofan sepuluh kali lipat. Atenuasi dimungkinkan
pada prokariota karena transkripsi dan translasi digabungkan, sehingga
peristiwa yang terjadi selama translasi dapat mempengaruhi transkripsi.

Jawaban: Mereka dapat dibedakan dengan membuat dip loid parsial yang
elemen pengaturnya ditempatkan (1) cis
ke gen yang diatur dan (2) trans ke gen yang diatur.
Unsur yang berperan cis hanya akan mempengaruhi ekspresi gen bila
ada dalam konfigurasi cis , sedangkan unsur yang bertransaksi akan
memberikan pengaruhnya pada konfigurasi cis atau trans (bandingkan
Gambar 17.7 dan 17.8).
4. Apa yang dimaksud dengan atenuasi dan bagaimana cara kerjanya?
Jawaban: Atenuasi adalah mekanisme pengaturan ekspresi gen melalui
penghentian dini transkripsi pada wilayah pemimpin transkrip. Dalam
kasus operon triptofan (trp) E. coli, misalnya, ada tidaknya produk akhir,
triptofan, menentukan apakah
5. Ketika histidin ditambahkan ke media di mana E. coli
sel-sel tumbuh, sintesisnya berhenti dengan sangat cepat, lama
sebelum sintesis enzim biosintetik histidin berhenti. Bagaimana hal ini
dapat dijelaskan?
Jawaban: Selain mematikan sintesis enzim biosintetik histidin, histidin juga
menghambat aktivitas enzim pertama —Nÿ-5ÿ-fosforibosil-ATP
transferase—dalam jalur biosintetik histidin melalui proses yang disebut
penghambatan umpan balik. Enzim tersebut mengandung tempat
pengikatan histidin, dan ketika ia mengikat histidin, enzim tersebut
mengalami perubahan konformasi yang menghambat aktivitasnya (lihat
Gambar 17.16). Dengan demikian, penghambatan umpan balik
menghasilkan penghentian sintesis histidin hampir seketika.