Klasifikasi Virus

Jenis asam nukleat

Ukuran & morfologi virus
Kepekaan thd zat kimia & keadaan fisik

Dr. Suwarno MSi., drh.

Departemen Mikrobiologi
Fakultas Kedokteran Hewan Unair 1
 Asam nukleat virus
 Fungsi mengatur informasi genetik u/ replikasi virus
 Unit dasar berupa nukleotida
– Nitrogen basa
– Gula dari 5 atom C (pentosa)
– Molekul asam fosfat

Nukleotida DNA : 4 macam N basa

– Inti purin  adenin (A)
 guanin (G)
– Inti pirimidin  timin (T)
 cytosin (C)
 Nukleotida RNA : 4 macam N basa
– Inti purin  adenin (A)
 guanin (G)
– Inti pirimidin  cytosin (C)
 urasil (U)
Pentosa pada  DNA : deoksiribosa
 RNA : ribosa
Protein virus
Fungsi : - Melindungi genom virus thd daya
kerja nuklease
- Berperan thd perlekatan virus pd
sel host
- Menentukan simetri struktur virus
- Menentukan sifat antigenik virus
 Lipid virus
 Terdapat pd amplop
 Virus beramplop peka thd pelarut lemak : eter,
kloroform, sodium deoksikholat, fosfolipase
 Dpt digunakan u/ klasifikasi virus
 Virus yg kehilangan lipid akan kehilangan
infektivitas

Karbohidrat virus
 Terdapat pd amplop
 Terikat bersama protein  glikoprotein
 KLASIFIKASI VIRUS
JENIS ASAM NUKLEAT
DNA atau RNA
Dibedakan dengan pemberian :
 5-iodo-2 deoksiuridin (IUDR)
 5-fluoro-2 deoksiuridin (FUDR)
 5-bromo-2 deoksiuridin (BUDR)
 Virus DNA dihambat, Virus RNA tidak
dihambat
JENIS UNTAIAN
 Dengan Mikroskop Fluorescence
 Virus ss + acridin orange  merah
 Virus ds + acridin orange  kuning
kehijauan
 ASAM NUKLEAT VIRUS
 Semua genom virus adalah haploid
(mengandung hanya 1 cetakan dari
tiap gen), kecuali genom retrovirus
diploid
 DNA atau RNA

 Single stranded (ss) atau double

stranded (ds)
Virus DNA
 Genom berupa molekul tunggal
 semua ds, kecuali Parvoviridae & Circoviridae
 Bentuk linier atau sirkuler
 Polaritas / sense plus (+) atau minus (-)

Virus RNA
 Genom berupa molekul tunggal atau
bersegmen
 Semua ss, kecuali Reoviridae & Birnaviridae
 Polaritas / sense plus (+) atau minus (-)
 Polaritas hanya berlaku untuk genom
untai tunggal (ss)
 Polaritas plus : memiliki urutan
nukleotida yang sama dengan urutan
nukleotida mRNA
 Polaritas minus : memiliki urutan
nukleotida yg berkomplemen dengan
urutan nukleotida mRNA
Polaritas (+) : 5’-A-T-T-G-C-C-A-T-T-3’

Polaritas (-) : 3’-T-A-A-C-G-G-T-A-A-5’

RNA : 5’ -A-U-U-G-C-C-A-U-U -3’

 UKURAN DAN MORFOLOGI
VIRUS
1. Tipe simetri
 Kubus / Icosahedral (V. DNA, kecuali V. Pox 
komplex)
 Helix (V. RNA, kecuali Reo, Toga, Picorna virus 
icosahedral)
2. Ada / tanpa amplop
3. Jumlah kapsomer pd icosahedral / diameter
nukleocapsid pd helikal

KEPEKAAN THD ZAT KIMIA & KEADAAN FISIK

 Peka thd eter, khloroform  Virus mempunyai amplop
 TATANAMA
 Urutan tatanama :
Ordo, famili, subfamili, genus, spesies
- Ordo : akhiran -virales
– Famili : -viridae
– Subfamili : -virinae
– Genus : -virus
– Spesies
– Dibawah spesies : subspesies, strain &
varian
(hanya untuk tujuan praktis :
pengembangan vaksin & diagnostik)
 CONTOH : VIRUS DNA
 Famili (Ordo) :Poxviridae
 Subfamili : Chordopoxvirinae
– Genus : Orthopoxvirus (v. vaccinia)
– Genus : Capripoxvirus (v. sheeppox)
– Genus : Leporipoxvirus (v. myxoma)
– Genus : Suipoxvirus (v. swinepox )
– Genus : Molluscipoxvirus (v. moluscum
contagiosum)
– Genus : Yatapoxvirus (v. yabapox & tanapox)
– Genus : Avipoxvirus (v fowlpox)
– Genus : Parapoxvirus (v. orf)
 Subfamili : Entomopoxvirinae
– Genus Entomopoxvirus A, B, C
 CENTRAL DOGMA

DNA RNA Protein

Gen Protein

Replikasi
Untai lama 5’-A-T-T-G-C-C-A-T-T-3’
Untai baru 3’-T-A-A-C-G-G-T-A-A-5’

3’ arah replikasi 5’
Transkripsi
DNA sense strand (+) 5’-A-T-T-G-C-C-A-T-T-3’

Antisense strand (-) 3’-T-A-A-C-G-G-T-A-A-5’

RNA 5’ A U U G C C A U U 3’

3’ arah transkripsi 5’
Translasi
5’-A-U-U-G-C-C-A-U-U-3’

ILE ALA ILE

N C
arah translasi