1

SIFAT VIRUS

TEORI ASAL MULA VIRUS

1. Teori regresif: virus merupakan bentuk degeneratif dari parasit intraseluler Teori progresif : asam nukleat sel normal yang mampu bereplikasi di dalam sel . Mislanya Virus DNA berasal dari plasmid. Retrovirus berasal dari retrotransposom dan RNA virus berasal dari mRNA Teori Ko-evolusi: Virus berevolosi secara sejajar dengan kehidupan Semua teori ini ada benarnya

SIFAT-SIFAT VIRUS
Agen infeksius yang berukuran sangat kecil Mempunyai susunan yang sederhana. Hanya dapat bereplikasi dalam sel hidup (manusia, hewan, tanaman dan bakteri). Tidak bermetabolisme di luar sel inang memperbanyak diri dengan mengandalkan proses metabolisme dari sel inang. Penyakit akibat infeksi virus terjadi karena interaksi antara virus sel inang

Definisi virus
Merupakan parasit sub-mikroskopik yang mutlak memerlukan sel hidup. Ukuran virus 20-400 nm. Berbentuk batang, sferik atau pleomorfik. Hanya dapat tumbuh dalam sel hidup. Tidak mempunyai informasi genetik untuk menyandi apparatu untuk membentuk energi metabolk yang diperlukan sintesis protein.

Struktur Virus
Partikel virus (virion) terdiri atas asam nukleat dan protein (kapsid) Beberapa virus dilengkapi dengan envelope (membran glikoprotein ) e.g. vesicular stomatitis

Kapsid
envelope enveloped virus

capsomeres

a virion

Nucleocapsid

(nukelokapsid tanpa genom adalah kapsid)

Simetri virus
Icosahedral
Constructed of 20 equilateral triangular faces e.g. foot-and
mouth disease virus

Helical
Tubular construction with the subunits arranged around the nucleic acid in a coil
e.g. rabies virus See page 12 to 15 Veterinary Virology 3 for more detail

Simetri virus
Icosahedral
Tersusun atas 20 permukaan segitiga sama sisi Contoh : virus mulut dan kuku

Helical
Tabung yang tersusun atas berbagai subunit yang tersusun berbentuk kil menutupi asam nukleat Contoh : virus rabies

Kompleks Belum sepenuhnya diketahui e.g. smallpox virus Filamen pleomorfic e.g. ebolavirus

10

Virologi: Sejarah, sifat dan klasifikasi

Viruses:
Nucleic acid (genome) is DNA or RNA, but not both; it provides the information for directed cell synthesis of new virus particles Nucleic acid is enclosed in a protein coat Require a cell for replication (remember viruses replicate not multiply) Rely upon cell receptors for entry to the cell

11

Asam inti (genom)

DNA

serat tunggal (Single Stranded)

Serat Ganda (Double Stranded)

Asam Inti
RNA

Serat ganda (Double Stranded)

(serat tunggal) Single Stranded Positive

Negative
RNA DNA

12

Struktur Kimia genom

Semua virus DNA mempunyai serat beruntai ganda kecuali
circoviruses and parvoviruses

Semua virus DNA mempunyai 1 molekul asam nukleat (tidak bersegmen

13

Virus RNA dapat mempunyai asam nukleat berserat tunggal atau ganda dan juga dapat bersegmen atau berupa satu molekul, polarisasi positif ata negatif

14

Struktur kimia kapsid (Protein)

Protein struktural
Menjaga kesetabilan virus dan berperan dalam perlekatan virus ke sel inang

Protein non-struktural
Enzim yang diperlukan dalam replikasi virus Antibodi biasanya terbetuk terhadap protein struktural.

15

Fungsi protein struktural

Melindungi asalm nukleat Melekatkan virus pada reseptor sel inang Menembus membran sel inang Replikasi asam nukleat virus (beberapa virus) Memodifikasi sel inang

16

Sifat-sifat Virus yang berhubungan dengan disinfeksi

Sensitivitas terhadap pemanasan
Virus yang mempunyai amplop relatif lebih sensitif terhadap pemasanan

Sensitivitas terhadap pH
pH yang ekstim dapat merusak virus

Palarut lemak
Virus yang mempunyai amplop umumnya lebih sensitif

Zat kimia
Bereaksi dengan asam amino dari protein beberapa di antaranya menginaktifkan DNA atau RNA

Radiasi dan sinar ultraviolet

17

Sifat-sifat virus yang berhubungan dengan diagnosis

Virus dapat dilihat dengan mikroskop elektron Virus dapat diisolasi dalam sel hidup DNA atau RNA dapat dilacak dengan Polymerase chain reaction (PCR) Antibodi khas virus dapat dilacak pada hewan yang terinfeksi virus

18

Klasifikasi Virus
Didasarkan pada
Genom (RNA, DNA, SS, DS etc) Morfologi virion, envelope Cara Replikasi Hubungan serologis (Serotipe)
International Committee on Taxonomy of Viruses

19

Dasar-dasar penamaan virus

Ordo ( - virales) Familia ( - viridae) Sub-familia ( -virinae) Genera ( - virus) Nama umum

20

Perbandingan bentuk dan ukuran virus dari berbagai Familia

21

Perbandingan bentuk virus dari berbagai Familia dengan pewarnaan negative pada mikroskop elektron

A: Pox B: Papilloma C: Filo D: Reo E: Herpes F: Rhabdo G: Calici H: Bunya I: Orthomyxo

22

Sistem Taksonomi Universal agen penyakit pada hewan dan manusia

Family (Order) THE DNA VIRUSES The Double-Stranded DNA Viruses Subfamily Genus Type Species

Poxviridae

Chordopoxv irinae

Orthopoxvirus

vaccinia virus

Parapoxvirus

orf virus

Avipoxvirus

fowlpox virus

Capripoxvirus

sheeppox virus

Leporipoxvirus

myxoma virus

Suipoxvirus

swinepox virus

Molluscipoxvirus

Molluscum contagiosum virus

Yatapoxvirus

Yaba monkey tumor virus

Etc, etc

Entomopox virinae

Entomopoxvirus genera A, B,C

(Insect viruses, but likely also pathogens of fish)

23

Virus dengan genom DNA serat ganda

Papovaviridae Adenoviridae
Herpesviridae Poxviridae Asfaviridae
papillomaviruses adenoviruses bovine herpesvirus-1,2

equine herpesviruses -1,4 porcine cytomegalovirus

poxviruses african swine fever virus

24

Viruses with ss DNA genomes

porcine circovirus

Circoviridae
canine parvovirus-2

Parvoviridae

feline panleukopenia virus

porcine parvovirus (SMEDI)

25

Viruses with ds RNA genomes

Reoviridae Birnaviridae
infectious bursal disease (chickens) infectious pancreatic necrosis (salmonid fish) rotaviruses bluetongue virus african horse sickness

26

Viruses with +ve RNA genomes

Picornaviridae Caliciviridae
Coronaviridae Arteriviridae Flaviviridae Togaviridae
foot and mouth disease virus porcine enteroviruses

feline calicivirus
coronaviruses equine arterivirus pestiviruses (BVD) equine encephalitis viruses

27

Viruses with -ve RNA genomes

Orthomyxoviridae Paramyxoviridae influenzaviruses parainfluenza virus canine distemper virus respiratory syncytial virus rabies virus vesicular stomatitis virus Ebola virus Haantan virus

Rhabdoviridae
Filoviridae Bunyaviridae

28

Viruses with reverse transcriptase

feline leukemia virus

Retroviridae
feline, bovine immunodeficiency viruses bovine, avian leukosis viruses caprine arthritis-encephalitis virus

Hepadnaviridae

29

Grup, tipe, strain dan isolat

Type 1 specific antigen

Grup (e.g. Virus blue tongue)

Tipe 1 ..sampai 24 Strain merupakan virus yang Group specific antigen dikarakterisasi dengan baik. Strain virus yang berbeda mempunyai karakteristik yang berbeda seperti virulensi Isolat menunjukkan virus yang diisolasi Type 2 specific dari inang atau lokasi tertentu antigen Tipe umumnya berarti kekebalan tidak conferred oleh pemamaparan

30

Pengelompokkan virus berdasarkan kriteria epidemiologi

Selain cara di atas virus juga dapat dikelmpokan berdasarkan kriteria epidemiologi sepert Tropisme jaringan dan cara penularan Enteric viruses (penularan fecal-oral) and replicate primarily in the intestinal tract. Enteric viruses are included in the families Picornaviridae (genus Enterovirus), Caliciviridae, Astroviridae, Coronaviridae, Reoviridae (genera Rotavirus and Reovirus), Parvoviridae, and Adenoviridae.

31

Respiratory viruses Picornaviridae (genus Rhinovirus), Caliciviridae, Coronaviridae (genus Coronavirus), Paramyxoviridae (genera Paramyxovirus, Rubulavirus and Pneumovirus), Orthomyxoviridae, and Adenoviridae. Arboviruses arthropod-borne viruses) Thus, the cycle is perpetuated. Arboviruses are included in the families Togaviridae, Flaviviridae, Rhabdoviridae, Bunyaviridae, Reoviridae (genera Orbivirus and Coltivirus), and Asfarviridae. Oncogenic viruses Viruses that have demonstrated the capacity to be oncogenic, in experimental animals or in nature, are included in the families Retroviridae, Hepadnaviridae, Papovaviridae, Adenoviridae, and Herpesviridae.

Postulat Kochs

1. Agen penyakit harus ditemukan pada setiap kasus penyakit 2. Agen penyakit harus dapat diisolasi dari inang dan ditumbuhkan in vitro 3. Penyakit harus muncul kembali bila agen yang diisolasi diinfeksikan kembali pada inang yang rentan 4. Agen penyakit yang sama harus dapat diisolasi kembali dari inang yang diinfeksi