Mikrobiologi dan Imunologi

Virus

 Bakteri lebih besar 100x virus, virus ukurannya nanometer

 Virus = submikroskopic organisme yang dapat menginfeksi
 = partikel, X sel
 tidak punya organel, sitoplasma, nukleus, mesin biokimia utuk buat energy atau senyawa
kimia  parasit obligat intraseluler
o Harus infeksi dan menguasai sel inang untuk berkembang biak
o Sepenuhnya bergantung dengan sel inang
 Struktur virus lengkap = virion

o Genome (asam nukelat)

o Capsid (protein)
o Nucleocapsid = genome & capside
o Beberapa ada envelop (lipid/carbohydrate spikes) (virus berenvelope)
 Corona virus
o tidak ada envelope = virus telanjang
o struktur virus menentukan :
 rentang sel inang
 smallox : humans
 poliovirus : human n primates
 rabies : banyak warm-blooded animals
 jaringan target yang spesifik
 HIV : sel darah putih spesifik sel T-helper
 Rabies : sel saraf
 Bentuk virus
 o
 Klasifikasi

o
Positif = 5` ke 3`
o Virus DNA
 Single stranded DNA
 Double stranded DNA
o Virus RNA
 Single stranded DNA
 Double stranded DNA
 Ada 5`ke 3` dan 3` ke 5`
 Positive strand
 Ekuivlalen mRNA
 Negative strand
 Komplementer mRNA
 o Taksonomi

 Family : -viridae
 Genus : -virus
Bakteriofaga

Replikasi

1. Attachment
o Nempel ke dinding sel bakteri
 2. Penetration
o Mengeluarkan materi genetik
3. Biosynthesis
o Replikasi (DNA polimerasi) , transkripsi(RNA polimerase), translasi (ribosom) 
protein struktural (capsid)
o Bakteri ada DNA dan RNA polimerasi dan ribosom, virus gk bawa
4. Maturation
o Materi genetik dibungkus capsid => virus baru
5. Release
o Keluar dan sel inang rusak

Siklus replikasi

1. Lisogenik
o Ikut replikasi dengan sel inang, tp gk ekspresi gen (transkripsi & translasi)
o DNA virus terintegrasi dalam DNA sel inang
o Lama dan jumlahnya banyak
2. Litik
o Cepet tapi dikit

Replikasi Virus hewan

1. Attachment
o Nempel ke membran plasma
o Spikes or protein di permukaan virus (tidak ada ekor fiber)
2. Penetration
o Seluruh virus masuk ke dalam sel
3. Uncoating
o Melepaskan kapsid untuk melepaskan asam nukleat virus
4. Replikasi
5. Release
o Sel berenvelope – sekalian ambil lipid n karbo
Jalan masuk virus

 Fusi – envelope virus dan membran sel inang

 Nucleocapsid masuk ke sel inang – fagositosis
 Uncoating – pelepasan lapisan proten- asam nukelat masuk ke sitoplasma

 Membentuk vesikel
 Fusi
 Uncoating

Perbedaan replikasi virus DNA dan virus RNA

 DNA virus
o Langsung sintesis protein virus & DNA
 RNA virus
o Positive strand
 Sintesis : protein virus dan -RNA
 -RNA membuat +RNA
 +RNA dan protein => virus baru
o Negative strand
 sintesis : +RNA
 +RNA membuat protein dan -RNA
 -RNA dan protein => virus baru
 template mRNA = 3` ke 5` (negative strand; single strand gk punya)
 o buat dulu negative strand dari positive strand (DNA polimerase sel inang)
 positive strand = mRNA
o membuat negative strand  jadi template  buat positve strand
 enzim RDRP RNA Dependent RNA Polymerase
o sel inang tidak punya, virus bawa sendiri
o RNA  RNA
 enzime DdRP RNA dependent RNA Polymerase

Replikasi virus DNA Replikasi virus RNA

Replikasi virus DNA animal Replikasi virus RNA

Provirus

 materi RNA bergabung/integrasi dengan DNA (ikut replikasi)

o enzim integrase (virus doang yg punya)
  virus ubah RNA dulu jadi DNA dengan reversetranscriptase (virus doang yang punya)
 HIV

Obat-obat

 Aktivitas antibodi
o Mencegah virus nempel di sel inang
o Vaksinasi (protein antigenik)
o Antibodi mengiket, yang menghancurkan sel fagosit
 Obat antivirus
o Mencegah attachment
 Reverse transcriptase inhibitor
 Neuraminidase inhibitor
o Neurmainidase (influenza)

Interferon

 Interferon => mencegah sel lain disintesis protein

Baltimore Classification
Hepatitis B

 HBsAg = Hepatitis B surface Antigen

Corona Virus

 Covid akan nempel di reseptor ACE2 tepatnya bagian spike

 Protein protease (TMPRSS2) membantu virus masuk ke sel kita
o Memotong bagian spike  membantu fusi
 Membentuk vesikel
 Covid = +RNA
 5` ke 3` mengkode prontein nonfungsional/nonstruktural = protein panjang (dipotong
oleh proteolisis)
 Salah satu yang dibuat = RDRP membuat mRNA + yang akan buat virus baru
 3`ke 5` membuat materi genetik
 Protein struktural juga dibuat
 Obat :
o Remdesivir paplipavir (?) antivirus
 o Kloroquin menghambat fusi

VIRUS HIV

Virus Influenza

 Famili orthomyoxviruses
 RNA single strand berjumlah 8
 Envelope = lipid bilayer
 Spike glikoprotein
jenis :
o Hemagglutin (HA)
 Ditrigger saat berikatan dengan sel epitel pulmonary (paru-paru)
o Neuraminidase (NA)
 Hidrolisis mukus di paru2 agar virus bisa ke permukaan sel
 H5N1, avian flu


 Mudah mengalami mutasi antigenik
jenis :
o Antigenic drift
 Perbedaan minor di HA dan NA
 Influenza A dan B
 Antibodi tidak efektif terhadap mutasi baru
 Menyebabkan epidemi minor setiap 2 tahun
o Antigenic shift
  Perbedaan mayor di HA dan NA
 Influenza A
 2 jenis influenza masuk ke sel dan bergabung => influenza strain baru
 Menyebabkan epidemi mayor tiap 10 tahun

Prion

 Partikel protein yang bisa menginfeksi (proteinaceous infections particle)

 Menyerang sistem saraf pusat
 = misfolded/abnormally folded protein (interaksi gugus R dengan gugus R lain)
 Menyebabkan protein lain misfold
 2 keadaan :
o PrP sen (normal)
o PrP res (abnormal)

Viroid
= partikel seperti virus; subvirus; RNA kecil dan circular tanpa lapisan protein

 Tediri dari RNA saja

 Menyerang tumbuhan dan manusia
 Menggunakan polimerase inang
 Sudah ditemukan 40 spesies
 Penyakit : Potato spindle tuber viroid (PSTVd)