Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO.

1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR DAN AKTIVITAS ANTIKANKER

SENYAWA TURUNAN ESTRADIOL HASIL PERHITUNGAN
METODE SEMIEMPIRIS AM1

SYARIFAH NUGRAHENI1, PONCO ISWANTO1, IQMAL TAHIR2

1
Jurusan Kimia Fakultas MIPA Universitas Jenderal Soedirman Purwokerto
2
Pusat Kimia Komputasi Indonesia Austria Jurusan Kimia FMIPA UGM

INTISARI

T elah dilakukan analisis multivariat hubungan kuantitatif struktur dan aktivitas

antikanker dari satu seri senyawa turunan estradiol berdasarkan perhitungan
sifat kimia senyawa. Data parameter-parameter tersebut diperoleh dari struktur hasil
optimasi geometri menggunakan metode semiempirik AM1 sedangkan aktivitas senyawa
diperoleh dari literatur. Analisis hubungan antara aktivitas antikanker dan sifat kimia
senyawa dilakukan dengan program SPSS. Hasil analisis memberikan model persamaan
terbaik sebagai berikut:
log 1/IC50 = 8,832 + 28,320 qC1 + 39,919 qC4 – 8,356 qC6 – 1,041 μ – 0,584 logP (n
= 19, r = 0,789, SE = 0,384, Fhitung/Ftabel = 1,422)
Kata kunci : QSAR, senyawa antikanker, estradiol.

ABSTRACT

Qestradiols
uantitative Structure-Activity relationship (QSAR) analysis of several substituted
as anticancer compound based on chemical properties have been
done. The parameters are obtained from optimization geometry structure using semi
empirical AM1 methods, and the activity of compounds was taken from literature.
Relationship analysis between anticancer activity and chemical properties was done based
on multilinear regression using SPSS program. The QSAR analysis gave the best model
as follows:
log (1/IC50) = 8.832 + 28.320 qC1 + 39.919 qC4 – 8.356 qC6 – 1.041 μ – 0.584 logP
(n = 19, r = 0.789, SE = 0.384, Fhitung/Ftabel = 1.422)
Keywords: QSAR, anticancer compounds, estradiol.

I. PENDAHULUAN penderita baru dan seperlima di antaranya

Sampai saat ini, kanker masih meninggal dunia. Sebuah studi melaporkan
merupakan suatu penyakit yang menjadi bahwa insiden penderita kanker di dunia
permasalahan besar dalam bidang pada tahun 1999 sekitar sepuluh juta kasus
kesehatan. Menurut Kurniasanti (2003), baru dan sekitar tujuh juta orang di
dalam waktu sepuluh tahun terakhir terjadi antaranya berakhir dengan kematian. Hal
peningkatan peringkat kanker sebagai ini cukup memprihatinkan sehingga perlu
penyebab kematian yaitu dari urutan ke-12 adanya usaha untuk menemukan senyawa
menjadi urutan ke-6. Dengan demikian baru yang aman sebagai antikanker.
diperkirakan setiap tahun terdapat 190.000

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 156

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

Salah satu senyawa yang berpotensi faktor coba-coba (Sardjoko, 1993). Hal ini
sebagai senyawa antikanker adalah dapat membantu mengurangi kegagalan
turunan estradiol. Menurut penelitian riset-riset eksperimental di laboratorium
Muranaka (2001), 2-metoksi estradiol serta dapat mengefisiensikan tenaga,
mempunyai aktivitas sebagai penghambat waktu, biaya riset dan dapat mengurangi
pertumbuhan kanker payudara. Senyawa hewan uji yang digunakan serta untuk
ini termasuk antiestrogen sebagai zat anti melindungi lingkungan dari toksisitas.
tumor pada karsinoma payudara yang Penggunaaan komputer sangat berperan
memerlukan estrogen (kanker payudara), guna membantu mempercepat
suatu neoplasma yang mempunyai reseptor penyelesaian perhitungan-perhitungan
estrogen. Reseptor ini terdapat pada numeris untuk menghitung sifat molekul
sekitar dua pertiga dari semua tumor yang kompleks dan hasil perhitungannya
payudara (Nogrady, 1992). berkorelasi secara signifiakn dengan
Namun dalam pengembangan obat eksperimen.
baru secara laboratorium ada beberapa Salah satu aplikasi kimia komputasi
langkah eksperimen yang perlu dilakukan, yang dapat diterapkan adalah kajian
seperti : desain, sintesis, purifikasi dan Quantitative Structure-Activity Relationship
identifikasi. Kesemuanya itu harus dilalui (QSAR) atau hubungan kuantitatif struktur
sebelum sampai pada tahap uji aktivitas. aktivitas. Kajian ini mempelajari korelasi
Kelemahannya adalah jika semua tahap secara kuantitatif antara struktur molekul
tersebut telah dikerjakan, namun hasil yang dan nilai aktivitas biologis yang terukur
diperoleh (senyawa yang diteliti) ternyata secara eksperimen. Kajian QSAR
mempunyai aktivitas yang tidak lebih baik. menjabarkan suatu model persamaan yang
Sehingga waktu, biaya dan tenaga yang menghubungkan ketergantungan harga
telah dikeluarkan dalam serangkaian kerja aktivitas suatu senyawa secara eksperimen
laboratorium menjadi terbuang. Dalam hal dengan struktur molekul. Secara umum
inilah aplikasi kimia komputasi dapat aktivitas senyawa adalah aktivitas biologis
berperan penting dalam kimia medisinal yang telah diuji secara klinis. Perkem-
terutama dalam hal perancangan obat, bangan kimia komputasi memungkinkan
prediksi teoritis tentang sifat-sifat kimia dan untuk perhitungan kuantum suatu senyawa
aktivitas suatu molekul. Rancangan obat sehingga dapat diperoleh struktur elektronik
diterapkan dalam upaya untuk mendapat- senyawa tersebut, yang dapat dinyatakan
kan obat baru dengan efektivitas yang lebih dengan parameter muatan atom, momen
tinggi berdasarkan penalaran yang rasional dwikutub, kerapatan elektron dan lain-lain
dengan semaksimal mungkin mengurangi (Leach, 1996). Pada analisis hubungan

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 157

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

kuantitatif dan aktivitas antikanker turunan dengan menggunakan cara ini telah
estradiol digunakan prediktor yang meliputi diterapkan dalam memprediksi pengaruh
mukatan atom bersih, momen dwikutub, substituen dalam sejumlah besar uji biologi
dan koefisien partisi oktanol/air (log P). (Richon and Young, 2000).
Kokpol et al (1989) dan Rode et al (1988) Pada penelitian ini dilakukan analisis
telah menggunakan muatan bersih atom hubungan kuantitatif antara struktur
sebagai prediktor pada kajian QSAR. senyawa turunan estradiol dengan aktivitas
Muatan atom bersih sebelumnya juga antikanker, khususnya yang memanfaatkan
digunakan oleh Ferianto et al (1997) dalam komputer berdasarkan teori mekanika
analisis hubungan kuantitatif antara struktur kuantum yaitu dengan menggunakan hasil
dan aktivitas biologis senyawa 2-fenil-1,8- perhitungan metode semiempiris AM1.
nafridin-4-on sebagai obat antikanker. Alim Hasil lebih jauh diharapkan dapat
et al (2000) menggunakan pendekatan digunakan untuk melakukan desain
QSAR untuk mempelajari toksisitas suatu senyawa turunan estradiol baru yang
seri senyawa fenol. Metoda yang sama berkhasiat antikanker.
telah berhasil digunakan oleh Tahir (2000) II. METODOLOGI PENELITIAN
untuk kajian QSAR senyawa nitrobenzena. II.1. Obyek Penelitian
Desain senyawa baru pada kasus senyawa Bahan yang digunakan dalam
tabir surya dengan menggunakan penelitian ini adalah aktivitas antikanker
pendekatan QSAR juga telah dilakukan (dalam log (1/IC50)) senyawa turunan
oleh Tahir et al (2001). Metoda-metoda estradiol yang diperoleh dari literatur,
tersebut dapat berhasil baik untuk memilih berupa jurnal penelitian. Adapun data
variabel bebas yang berpengaruh dan aktivitas antikanker senyawa disajikan pada
hasilnya dapat digunakan untuk mendesain Tabel 1. Struktur senyawa turunan estradiol
senyawa turunan baru. disajikan pada Gambar 1.
Dalam analisis Hansch parameter- OH
parameter diperlakukan sebagai variabel
bebas (prediktor) untuk menerangkan harga C D
3
R 2 4
aktivitas biologis. Analisis regresi
A B
multilinear banyak digunakan dalam
1 5
HO 6
menurunkan koefisien model. Hansch
mempelajari senyawa yang sudah
Gambar 1. Struktur dasar senyawa turunan
mempunyai kerangka dengan variasi estradiol
struktur terbatas pada gugus fungsional
pada sisi yang spesifik. Pendekatan

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 158

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

Tabel 1. Data kadar penghambatan rata-rata terstabil, data mulai disimpan dengan
(IC50) dan Log (1/IC50) eksperimen dari senyawa
estradiol yang tersubstitusi (Muranaka, 2001) melakukan Start log, kemudian dilakukan

No R IC50
Log perhitungan single point, dan dilakukan
(1/IC50)
1. CH3O 2,90 5,54 Stop log untuk mengakhiri proses pereka-
2. C2H5O 0,91 6,04
man hasil perhitungan. Output data
3. n-C3H7O 4,20 5,38
4. i-C3H7O 4,80 5,32 selanjutnya dapat dilihat pada file rekaman
5. CH3 17,00 4,77
6. H2C=CH 2,40 5,62 (file.log).
7. CH3CH=CH 1,10 5,96
Untuk penelitian QSAR ini, parame-
8. C2H5CH=CH 8,60 5,07
9. n-C3H7CH=CH 40,00 4,40 ter-parameter yang digunakan adalah seba-
10. (CH3)2C=CH 9,40 5,03
11. C2H5 7,70 5,11 gai berikut :
12. n-C3H7 4,90 5,31
a. Parameter hidrofobisitas : log P
13. n-C4H9 40,00 4,40
14. n-C5H11 40,00 4,40 b. Parameter elektronik: muatan atom ber-
15. (CH3)2CHCH2 40,00 4,40
16. I 4,80 5,32 sih, momen dwikutub.
17. C2H5S 10,00 5,00
II.2.2. Teknik pemisahan data secara
18. CH3CONH 40,00 4,40
19. C2H6N 3,00 5,52 acak
Data dipisahkan menjadi dua
II.2. Prosedur Kerja
kelompok yaitu data fitting yang berfungsi
II.2.1. Pengambilan data prediktor
untuk mendapatkan model persamaan dan
Dalam penelitian dengan analisis
data uji untuk pengujian model persamaan.
Hansch, setiap senyawa dibuat model
Teknik pemisahan cara acak menggunakan
struktur dua dimensinya menggunakan
perangkat lunak Microsoft Excel. Data awal
paket program Hyperchem. Kemudian
yang digunakan sebanyak 19, diambil 15
model tersebut dilengkapi dengan atom
data sebagai data fitting dan sisanya 4
hidrogen pada setiap atom untuk
sebagai data uji.
melengkapi struktur sebenarnya dan
II.2.3. Analisis regresi multilinear
dibentuk menjadi struktur tiga dimensi.
Untuk mendapatkan persamaan
Proses selanjutnya adalah melakukan
QSAR, terlebih dahulu data disajikan datal
optimasi geometri struktur berupa minimasi
tabel yang meliputi masing-masing aktivitas
energi molekul guna memperoleh
antikanker (dalam log(1/IC50)) sebagai
konformasi struktur yang paling stabil.
variabel tak bebas dan nilai QSAR
Perhitungan dilakukan dengan metode
properties sebagai variabel bebas. Korelasi
semiempirik AM1 dengan batas
parameter dihitung dengan aktivitas
konvergensi 0,001 kkal/Å.mol. Metode
senyawa berdasarkan analisis regresi linear
optimasi dilakukan berdasarkan algoritma
menggunakan program SPSS for Windows
Polak-Ribiero. Setelah diperoleh struktur
metode backward pada 15 data yang telah

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 159

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

dipisahkan (data fitting). Hasil perhitungan muatan bersih atom dan momen dwikutub.
digunakan untuk menunjukkan urutan Untuk log P dapat dilihat dari QSAR
variabel bebas penting yang berfungsi properties. Hasil rekapitulasi ditunjukkan
sebagai deskriptor. Variasi dari beberapa pada Tabel 2. Dari Tabel 2 terlihat bahwa
variabel bebas membentuk beberapa perubahan muatan atom untuk atom bersih
alternatif model persamaan. Untuk setiap pada atom C dari cincin A. Hal ini terjadi
model persamaan alternatif dapat dilakukan karena pengaruh substitusi pada atom C
perhitungan terhadap beberapa parameter nomor 2 dari cincin aromatik. Substitusi
statistik seperti r, r2, SD dan F. Selain pada suatu atom akan berpengaruh
parameter statistik tersebut, dari hasil terhadap bertambah atau berkurangnya
perhitungan juga diperoleh nilai koefisien nilai negatif dari muatan atom pada atom-
setiap variabel bebas yang terlibat dalam atom di posisi berikutnya karena akan
model persamaan. Nilai koefisien yang menginduksi atom-atom pada posisi
diperoleh digunakan untuk menghitung berikutnya. Adanya substitusi satu atom,
aktivitas teoritis. menimbulkan induksi muatan parsial tiap
Data aktivitas teoritis dibandingkan atom yaitu dari C1 sampai C6 pada cincin A
dengan aktivitas eksperimen senyawa. (cincin aromatik). Pada atom C nomor 2
Untuk mengetahui kualitas dan kemampuan mengalami perubahan muatan bersih atom
memprediksi dari setiap model persamaan, yang berbeda jauh dengan muatan bersih
maka dihitung harga PRESS-nya sehingga atom lainnya.
dapat dipilih model persamaan terbaiknya. II.2 Kajian korelasi aktivitas dan
prediktor
Untuk data fitting dilakukan perhitungan
Besaran angka korelasi yang berkisar
PRESS terhadap model tiap model
pada nol menyatakan bahwa kedua
persamaan sehingga didapatkan nilai
variabel tidak ada korelasi sama sekali, dan
PRESSinternal, dan untuk data uji diperoleh
angka korelasi 1 menyatakan bahwa kedua
PRESSeksternal (Tahir et al, 2004).
variabel adalah sempurna. Tanda (-)
Persamaan akhir diperoleh dengan analisis
menunjukkan arah yang berlawanan/
regresi multilinear pada 19 senyawa
variabel satu berbanding terbalik dengan
dengan program SPSS for Windows
variabel yang lain (Algifari, 1997).
dengan metode enter.
Dari tabel 3 terlihat bahwa setiap
II. HASIL DAN PEMBAHASAN
variabel bebas berpengaruh relatif kecil
II.1 Hasil perhitungan deskriptor
terhadap log (1/IC50). Nilai koefisien
Hasil perhitungan metode semiempi-
tertinggi dimiliki oleh log P yaitu sebesar -
ris AM1 menggunakan program HyperChem
0,319. Namun keeratan hubungan antara
akan memberikan output data berupa

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 160

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

Tabel 2. Data muatan atom, momen dwikutub dan log P hasil perhitungan metode semiempiris AM1
Senyawa no Muatan bersih atom (Coulomb) μ Log P Aktivitas
qC1 qC2 qC3 qC4 qC5 qC6 (D) Log (1/IC50)
1 0,056 0,055 -0,177 -0,056 -0,059 -0,189 3,210 1,197 5,538
2 0,054 0,060 -0,180 -0,055 -0,060 -0,189 2,974 1,540 6,041
3 0,055 0,060 -0,174 -0,058 -0,058 -0,191 3,040 2,008 5,377
4 0,054 0,060 -0,173 -0,059 -0,058 -0,191 2,842 1,953 5,319
5 0,074 -0,093 -0,102 -0,087 -0,031 -0,211 2,536 2,344 4,770
6 0,088 -0,070 -0,090 -0,091 -0,021 -0,217 2,881 2,525 5,620
7 0,090 -0,126 -0,087 -0,091 -0,028 -0,161 1,957 2,876 5,959
8 0,090 -0,126 -0,087 -0,091 -0,028 -0,161 1,936 3,272 5,066
9 0,090 -0,125 -0,087 -0,091 -0,029 -0,161 1,893 3,669 4,390
10 0,085 -0,058 -0,095 -0,090 -0,027 -0,217 2,355 3,030 5,027
11 0,076 -0,148 -0,093 -0,090 -0,033 -0,158 1,987 2,740 5,114
12 0,075 -0,144 -0,095 -0,090 -0,034 -0,158 1,985 3,136 5,310
13 0,078 -0,093 -0,099 -0,088 -0,029 -0,213 2,599 3,533 4,398
14 0,078 -0,093 -0,099 -0,088 -0,029 -0,213 2,606 3,929 4,398
15 0,074 -0,142 -0,096 -0,090 -0,034 -0,157 1,968 3,467 4,398
16 0,116 -0,350 -0,065 -0,095 -0,010 -0,165 2,849 2,707 5,319
17 0,133 -0,349 -0,051 -0,108 -0,002 -0,178 3,289 1,883 5,000
18 0,025 0,058 -0,133 -0,059 -0,055 -0,019 2,584 0,299 4,398
19 0,043 0,010 -0,108 -0,078 -0,041 -0,201 2,244 1,242 5,523

variabel dengan aktivitas tidak dapat tistik yang didapatkan. Keempat parameter
digunakan untuk menyatakan bahwa varia- statistik model persamaan terpilih disajikan
bel tersebut berpengaruh terhadap harga pada Tabel 4. Parameter r2 tidak menjamin
aktivitas. Sehingga diperlukan kajian lebih bahwa model yang mempunyai nilai r tinggi
lanjut untuk melihat masih adanya faktor diterima, karena boleh jadi model tersebut
lain yang mempengaruhi signifikansi data. ditolak oleh parameter lainnya. Harga SD dari
Hal ini dilakukan dengan analisis regresi tiap model persamaan relatif tidak jauh
multilinear untuk menentukan model berbeda sehingga penggunaan parameter
persamaan terbaik dengan data yang paling statistik ini dalam penentuan model
signifikan. persamaan terbaik kurang memberikan
Tabel 3. Korelasi antar variabel keterangan yang bermanfaat.
No Variabel Korelasi dengan Dengan mempertimbangkan perbandi-
log (1/IC50)
1 qC1 0,032 ngan nilai Fhitung/Ftabel, maka didipilih model 4
2 qC2 -0,159
3 qC3 0,277 sebagai persamaan QSAR terbaik hasil
4 qC4 -0,231 perhitungan metode semiempiris AM1 meng-
5 qC5 0,173
6 qC6 0,283 gunakan model persamaan sebagai berikut :
7 μ 0,171
8 Log P -0,319 Log 1/IC50 = 9,196 + 31,272 qC1 +
II.3 Hasil analisis regresi multilinear 43,446 qC4 – 8,950 qC6 –1,169 μ – 0,604
QSAR
logP..........................................................(1)
Untuk menentukan model persamaan
dengan n = 15, r = 0,872, SE = 0,396,
terbaik perlu dilihat parameter-parameter sta-
Fhitung/Ftabel = 1,635

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 161

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

Tabel 4. Model persamaan QSAR terpilih turunan estradiol hasil SPSS

No Variabel yang terlibat r r2 SE Fhitung/Ftabel
1 qC1, qC2, qC3, qC4, qC5, qC6, μ, log P 0,893 0,797 0,382 0,710
2 qC1, qC2, qC4, qC5, qC6, μ, log P 0,893 0,797 0,354 1,036
3 qC1, qC4, qC5, qC6, μ, log P 0,886 0,784 0,341 1,353
4 qC1, qC4, qC6, μ, log P 0,872 0,760 0,340 1,635

Pemilihan persamaan 1 sebagai model persamaan disajikan pada Tabel 5

model persamaan HKSA terbaik didukung sedangkan data PRESSeksternal disajikan
oleh parameter PRESSeksternal yang relatif pada Tabel 6. Menurut Kubinyi (1993),
paling minimum dibandingkan dengan model persamaan terbaik dipilih apabila
ketiga model persamaan lain. Nilai memiliki nilai PRESS yang kecil. Hasil
PRESSinternal paling kecil nilai PRESSinternal pengujian persamaan (1) dengan data
terkecil pada senyawa fitting ditunjukkan fitting disajikan pada gambar 2 (a) dan
oleh model persamaan 1, tetapi karena nilai dengan data uji disajikan pada gambar 2
Fhitung/Ftabel tidak memenuhi syarat sebagai (b). Tingkat prediksi yang baik akan
model persamaan terbaik maka model 1 menghasilkan persamaan garis lurus.
tidak dipilih. Data PRESSinternal keempat
Tabel 5. Nilai PRESS internal dan log (1/IC)50prediksi senyawa fitting
Senyawa Log (1/IC50) prediksi
no Log (1/IC50) eksperimen Model 1 Model 2 Model 3 Model 4
1 5,538 5,711 5,705 5,763 5,763
2 6,041 5,700 5,700 5,743 5,743
4 5,319 5,492 5,500 5,519 5,519
6 5,620 5,198 5,201 5,043 5,043
7 5,959 5,550 5,547 5,478 5,478
8 5,066 5,355 5,351 5,271 5,271
10 5,027 5,458 5,463 5,311 5,311
11 5,114 4,934 4,938 5,110 5,110
13 4,398 4,517 4,515 4,527 4,527
14 4,398 4,280 4,276 4,279 4,279
15 4,398 4,453 4,456 4,634 4,634
16 5,319 5,312 5,313 5,222 5,222
17 5,000 5,124 5,123 5,263 5,263
18 4,398 4,441 4,442 4,357 4,357
19 5,523 5,591 5,589 5,598 5,598
PRESSinternal 0,877 0,877 0,933 1,039

Tabel 6. Nilai PRESSeksternal dan log (1/IC50) prediksi senyawa uji

Senyawa Log Log 1/IC50prediksi
no 1/IC50eksperimen Model 1 Model 2 Model 3 Model 4
3 5,377 5,258 5,257 5,260 5,310
5 4,770 5,178 5,185 5,229 5,237
9 4,390 5,176 5,170 5,108 5,074
12 5,310 4,632 4,635 4,701 4,822
PRESSeksternal 1,258 1, 250 1, 111 0, 929

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 162

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik
6,5 6,5

6 6

L o g 1 /IC5 0 predi ks i
Log 1/IC50prediksi

5, 5
5,5

5
5

4,5
4,5

4
4 4 4,5 5 5,5 6 6,5
4 4,5 5 5,5 6 6,5
Log 1/IC50eksperimen Log 1/IC50eksperimen

(a) (b)
Gambar 2.Grafik korelasi log (1/IC50)eksperimen vs log (1/IC50)prediksi model persamaan 4 dari
senyawa fitting (a) dan senyawa uji (b).

II.4 Perumusan persamaan QSAR akhir 6,5

Perumusan persamaan QSAR dari 6

model 4 dilakukan perhitungan dengan 5,5

program SPSS for Windows untuk Log 1/IC50prediksi

5

mendapatkan model persamaan terbaik 4,5

dengan metode enter. Variabel bebas yang 4

digunakan adalah muatan bersih dari atom

3,5

C1, C4, C6, momen dwikutub dan log P, 3,5 4 4,5 5 5,5
Log 1/IC50eksperimen
6 6,5

sehingga didapatkan persamaan terbaik Gambar 3.Grafik korelasi log (1/IC50) eksperimen
adalah: vs log (1/IC50) prediksi menggunakan
19 seri senyawa estradiol.
Log 1/IC50 = 8,832 + 28,320 qC1 + Tabel 7. Nilai log (1/IC50) prediksi
39,919 qC4 – 8,356 qC6 – 1,041 μ – 0,584 Senyawa Log Log Residual2
no (1/IC50) (1/IC50
logP..........................................................(2) eksperimen )prediksi
1 5,538 5,751 0,046
n = 19 r = 0,789 SE = 0,384 Fhitung/Ftabel 2 6,041 5,716 0,105
= 1,422 3 5,377 5,306 0,005
4 5,319 5,494 0,031
Data log (1/IC50)prediksi dan log 5 4,770 5,207 0,191
6 5,620 5,030 0,348
(1/IC50)eksperimen tercantum pada Tabel 7. 7 5,959 5,382 0,333
Hubungan antara log (1/IC50) prediksi terhadap 8 5,066 5,178 0,013
9 4,390 4,985 0,354
log (1/IC50) eksperimen menunjukkan garis 10 5,027 5,245 0,048
11 5,114 5,053 0,004
yang hampir lurus yang disajikan pada 12 5,310 4,777 0,284
Gambar 3. 13 4,398 4,522 0,015
14 4,398 4,282 0,013
Kelima deskriptor yang cukup 15 4,398 4,594 0,039
16 5,319 5,170 0,022
menentukan harga aktivitas adalah muatan 17 5,000 5,242 0,058
atom C no.1, 4 dan 6, momen dwikutub serta 18 4,398 4,455 0,003
19 5,523 5,573 0,003
koefisien partisi n-oktanol/air. Dari persama- PRESS 1,915

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 163

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

maan tersebut dapat diketahui bahwa pertimbangan antara lain kelayakan proses
adanya pengaruh momen dwikutub sintesis.
terhadap aktivitas biologis struktur III. KESIMPULAN
senyawa. Pada atom-atom yang dikaji ada Nilai aktivitas antikanker senyawa
muatan atom yang didapatkan berharga turunan estradiol memiliki keterkaitan
positif, elektron yang ada berkurang akibat secara kuantitatif terhadap berbagai sifat
atom-atom yang ada di sebelahnya. Hal kimia senyawa dan dinyatakan dalam
inilah yang menyebabkan terbentuknya bentuk persamaan QSAR berikut :
momen dwikutub. Terbentuknya momen Log 1/IC50 = 8,832 + 28,320 qC1 +
dwikutub ini akan sangat berperan pada 39,919 qC4 – 8,356 qC6 – 1,041 μ – 0,584
saat interaksi dengan reseptor. Koefisien logP..........................................................(2)
partisi pada model persamaan tersebut juga n = 19 r = 0,789 SE = 0,384 Fhitung/Ftabel
berpengaruh. Hal ini karena pada = 1,422
kebanyakan molekul obat, penembusan
DAFTAR PUSTAKA
selaput sel dihubungkan dengan kelarutan
obat dalam lemak. Nilai log P yang tinggi Algifari, 1997, Analisis Regresi Teori,
Kasus dan Solusi, Edisi pertama,
menunjukkan bahwa senyawa lebih BPFE, Yogyakarta
terdistribusi ke dalam oktanol yang Alim, A.H., Pradipta, M.F., dan Tahir, I.,
nonpolar, seperti lemak, daripada 2000, Jurnal Nasional Kimia Fisik, III,
2, 23-26
terdistribusi ke air yang bersifat non polar.
Ferianto, T.S., Setiaji, B., Armunanto, R.,
Persamaan QSAR tersebut sangat dan Tahir, I., 1997, Hubungan
mendukung dalamtahap awal proses Kuantitatif Antara Struktur dan
Aktivitas Biologis Senyawa 2-fenil-
pembuatan obat baru yaitu antikaknker dari 1,8-nafridin-4-on sebagai Obat
turunan lain estradiol berupa model Antikanker. Prosiding Seminar
Nasional Kimia II, UGM Yogyakarta
senyawa baru dengan perkiraan aktivitas
Kokpol, S.U., Hannongboa, S.V., Thongrit,
yang lebih baik. Peningkatan nilai aktivitas N., Polman, S., Rode, B.M. and
ini dapat dilakukan dengan memvariasi Schwendinger, M.G., 1988, Anal.
Sci., 4, 565-568
gugus-gugus substituen pada atom C yang
Kubinyi, H., 1993, QSAR : Hansch Analysis
berpengaruh. Dengan demikian walaupun and Related Approach, VCH
belum dilakukan sintesis dan pengujian Verlaggessellschaft, Weinheim
Kurniasanti. 2003. Efek Antiangiogenik
senyawa sesungguhnya, model turunan
Infusa Daun Dewa (Gynura
senyawa estradiol baru tersebut telah dapat procumbenclour merr) pada CAM
Terinduksi b-FGF. Skripsi Fakultas
diperkirakan untuk selanjutnya dilakukan
Farmasi UGM. Yogyakarta (Tidak
proses seleksi dengan berbagai Dipublikasikan)

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 164

Prosiding Seminar Nasional Kimia XV ISSN NO. 1410-8313
Yogyakarta, 9 Oktober 2004 Kelompok Organik Fisik

Leach, A.R., 1996, Molecular Modelling : S., 1989, Monastschefte fur Chemie,
Principles and Aplications, Addison 120, 913-921
Wishley, Longman, London Sardjoko, 1993, Rancangan Obat, UGM
Muranaka, K., 2001, J. Chem. Educ., 78, Press, Yogyakarta
1390-1393 Tahir, I., 2000, Analisis Hubungan
Nogrady, T., 1992, Kimia Medisinal: Kuantitatif Struktur dan Karakter
Pendekatan secara Biokimia, Aroma Senyawa Nitrobenzena,
(terjemahan Rasyid, R.), Penerbit Makalah Seminar Jurnal Nusantara
ITB, Bandung Kimia - UNNES, Semarang 17
Richon, A.B dan Young, S.S. 2000. An Oktober 2000
Introduction to QSAR Methodologyg, Tahir, I., Setiaji, B., dan Yahya, M.U.,
Network Science, 2001, Berkala Ilmiah MIPA, 1, XI, 1-
http://www.netsci.org/Science/Compc 29
hem/feature 19.html
Rode, B.M., Schwendinger M.G., Kokpol,
S.U., Hannongboa S.V., and Polman

Syarifah Nugraheni, Ponco Iswanto, Iqmal Tahir 165