SISTEMATIKA KIMIAWI

(CHEMOSYSTEMATICS)
Klasifikasi Kimiawi: Khemotaksonomi
KHEMOTAKSONOMI: METODE ANALISIS FISIKO-
KIMIAWI SEPERTI GC, TLC, HPLC, SPECTROSCOPY
DAN ELEKTROFORESIS

ANALISIS:
KOMPOSISI KIMIAWI SEL ATAU KOMPONEN SEL,
MISALNYA DINDING SEL, MEMBRAN SEL,
PRODUK AKHIR METABOLISME

TUJUAN ANALISIS: KLASIFIKASI DAN

IDENTIFIKASI MIKROBIA
 Komponen kimiawi sel
Protein
Lipid
Karbohidrat
 Analisis Protein

Comparative Serology of Protein

Comparative Electrophoresis of cellular Protein
Multilocus Enzyme Electrophoresis (MEE)
Protein electrophoresis
Analisis Sidikjari Protein
Sidikjari protein
↓
Coding (Pengkodean)
↓
Tabel n x t
↓
Analisis Numerical Systematics
↓
Clustring
↓
Dendrogram
↓
Klasifikasi & Identifikasi
FINGER PRINTING PROTEIN
 INDEKS SIMILARITAS
B.megateriu
PPK5 PPK6 PSA10 B.subtilis B.cereus m FNCC B.pumilus
ATCC 6051T ATCC 14579T 0083 ATCC 700814

PPK5 1 0.639 0.472 0.833 0.639 0.472 0.528

PPK6 0.639 1 0.833 0.639 0.833 0.778 0.444

PSA10 0.472 0.833 1 0.583 0.667 0.833 0.5

B.subtilis ATCC 6051T 0.833 0.639 0.583 1 0.528 0.472 0.639

B.cereus ATCC 14579T 0.639 0.833 0.667 0.528 1 0.778 0.389

B.megaterium FNCC
0083 0.472 0.778 0.833 0.472 0.778 1 0.333
B.pumilus ATCC
700814 0.528 0.444 0.5 0.639 0.389 0.333 1
 DENDROGRAM
FINGER PRINTING PROTEIN
FENOTIPIK
CLADOGRAM (MOLEKULAR)
Data Finger printing
Diagramatic representative
Dendrogram
Clustering
 Analisis Envelop sel
Petidoglycan:
TLC peptidoglikan: isomer diaminopimelic acid

Lipids:
Longchain fatty acids: GC asam lemak
Mycolic acids: TLC mycolic acid
Polar lipids: TLC polar lipids
Isoprenoid quinon: HPLC isoprenoid quinones
GC atau HPLC
Analisis Produk Akhir metabolisme
Produk akhir metabolisme:
Asam organik:
Analisis GC atau HPLC:
Asam asetat
Asam propionat
Asam butirat
 Analisis Whole cell: Py-MS
Pyrolysys Mass Spectrometry (PyMS):
Prinsip kerja:
pemanasan sel dengan suhu tinggi tanpa oksigen –
komponen sel akan terurai menjadi molekul yang lebih
kecil
Molekul kecil dianalisis dengan Mass spectrometry
Karakteristik:
Waktu analysis cepat
Dapat mengakomodasi dalam jumlah besar
Biaya operasional murah
Biaya investasi mahal
Pyrogram
Pyrogram
Presentasi analisis PyMS
PyMS analysis: tampak samping
Tampak atas
Pyrolysis-Mass Spectrometry

Side view Top view