SKRINING VIRTUAL SENYAWA INHIBITOR HORMON GHRELIN DARI DERIVAT METIL ASAM KLOROGENAT

SEBAGAI ANTIOBESITAS
Oleh:
Suci Fitri Diniah (2018210306)
Pembimbing:
apt. Dra. Faridah, M.Si. ; apt. Andri Prasetiyo, M.Si, M.Farm.

SARJANA 1 FARMASI UNIVERSITAS PANCASILA

DESEMBER 2022

ABSTRA
K

Hasil Riset kesehatan dasar (Riskesdas 2018) menunjukan angka obesitas orang dewasa di Indonesia cukup tinggi, yaitu 21,8%. Kopi hijau marak digunakan sebagai
antiobesitas, kandungan utamanya adalah asam klorogenat yang diduga mempunyai aktivitas tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui senyawa derivat metil asam
klorogenat yang memiliki aktivitas sebagai antiobesitas dengan menginhibisi hormone Ghrelin, mengetahui interaksi asam amino yang terlibat dan memprediksi absorpsi,
distribusi, metabolisme, ekskresi, dan toksisitas (ADMET). Metode penelitian menggunakan molecular docking dengan aplikasi dan website Pubchem, PDB, molegro virtual
docker, chemdraw dan pkCSM. Proses docking dilakukan pada 30 senyawa uji dengan hasil rerank score berkisar -97,1139--116,361 dan senyawa pembanding (Rimonabant)
dengan hasil rerank score -97,4864 pada protein yang telah tervalidasi. Hasil penelitian diperoleh 10 senyawa derivat metil asam klorogenat dan kontrol positif yang
diprediksi memiliki aktivitas antiobesitas dengan menginhibisi hormon Ghrelin , serta diprediksi memiliki absopsi, distribusi, metabolisme, toksisitas (ADMET) yang baik,
yaitu Asam 7,4,3-Trimetil Klorogenat, Asam 3,4’-Dimetil Klorogenat,Asam 4,3,3’,4'-Tetrametil Klorogenat, Asam 3,3’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4’-Dimetil Klorogenat,
Asam 7,4,3,3’-Tetrametil Klorogenat, Asam 4,3,3'-Trimetil Klorogenat tidak bersifat toksik.

PENDAHULUAN

PRINSIP PENELITIAN
Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan perangkat keras (Laptop) dengan beberapa software
seperti Pubchem, MOLEGRO virtual docker, ChemDraw, pkCSM. Penelitian ini dilakukan dengan
skrining virtual terhadap senyawa derivat metil asam klorogenat dengan protein target ghrelin yaitu
Protein diunduh dari Protein Data Bank (PDB) kemudian ligan dari protein tersebut dipreparasi
menggunakan ChemDraw, divalidasi dengan RMSD (validasi internal), lalu didocking dengan
menggunakan aplikasi Molegro Virtual Docker. Protein yang mempunyai nilai RMSD ≤ 2 Å akan
digunakan untuk simulasi docking pada senyawa pembanding dan senyawa uji.

HASIL PENELITIAN
Tabe!V.2Reseptorterpilihsealshvalidasimierna

PDF Reseptor Ligand RadRMSD

score

garama
9011219
TabelV.1HasilValidasiIntemalReseptorGhrelin
F9Y receptori Cholesterol 112,71 112,23 117,15 2,25457
53,7826
Algoritma CoMPlex

Kode MOMe Molarantimm Moldock:SE IteratedSimplex withGa

Himan
»FOY Moldock:Score
Moldock:Score(Grid) 3,32253 4,92015 6CMJ F6J 37.18 49.10 8.61 10 0.781651-125635
PlantScore ,31605 GSK630393
PiantStore(Grid) 2,23457 4,42998 86842
6CM. Moldock: ‚818661 ,781651 0,819797
Moldock:Score(Grid) 0,939978
lant 0.841916 0.844437 0.885496
1698

BAHAN
30 senyawa derivat metil asam klorogenat
2 kode protein (7F9Y dan 6CMJ)
7 senyawa pembanding (kontrol positif)

ALAT
a. Webserver : PDB (Protein Data Bank)
b. Webserver : Pubchem
c. Aplikasi MOLEGRO virtual docker
 d. Aplikasi ChemDraw
e. Webserver : pkCSM

SKEMA KERJA

Preparasi Protein Gambar senyawa uji

Preparasi Native Ligan,

R Pembanding,
Ligan
edocking dengan
molegro dan Ligan Uji

Docking dengan molegro Visualisasi dengan molego

Analisis farmakokinetik dan toksisitas

KESIMPULAN
1. Terdapat sepuluh (10) senyawa aktif yang bekerja pada reseptor Ghrelin berdasarkan kontrol positif (Rimonabant) dengan hasil rerank score berkisar (-97,1139) - (-102,221)
2. Interaksi yang terjadi pada senyawa uji dengan asam amino Ghrelin adalah interaksi ikatan hidrogen dengan asam amino yang berperan penting dalam interaksi protein-ligan
adalah Asam aspartat (Asp)-330, Glutamat (Glu)-236, Lisin (Lys)-194, fenilalanina (Phe)-331, Asparagina (Asn)-317 ,Serina (Ser)-316, Isoleusin (Ile)-171.
3. Sepuluh senyawa yaitu Asam 3’4’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4,3-Trimetil Klorogenat, Asam 3,4’-Dimetil Klorogenat, Asam 3,3’,4’-Trimetil Klorogenat, Asam 4,3,3’,4'-
Tetrametil Klorogenat, Asam 3,3’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4,3,3’-Tetrametil Klorogenat, Asam 4,3,3'-Trimetil Klorogenat, Asam
7,3,3’,4’-Tetrametil Klorogenat diprediksi memiliki aktivitas inhibitor terhadap Ghrelin, 7 senyawa yaitu Asam 7,4,3-Trimetil Klorogenat, Asam 3,4’-Dimetil
Klorogenat,Asam 4,3,3’,4'-Tetrametil Klorogenat, Asam 3,3’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4’-Dimetil Klorogenat, Asam 7,4,3,3’-Tetrametil Klorogenat, Asam
4,3,3'-Trimetil Klorogenat memiliki hasil toksisitas yaitu tidak toksik sedangkan 3 lainnya yaitu Asam 3’4’-Dimetil Klorogenat, Asam 3,3’,4’-Trimetil Klorogenat, Asam
7,3,3’,4’-Tetrametil Klorogenat memiliki hasil toksisitas yaitu toksik.
DAFTAR PUSTAKA
1. Obesity and overweight [Internet]. Diambil dari : https://www.who.int/news- room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight. Diakses 4 Desember 2019.
2. Obesity [Internet]. Diambil dari : https://www.who.int/topics/obesity/en/. Diakses pada 4 Desember 2019.
3. Low S, Chin MC, Deurenberg YM. Review on epidemic of obesity. Annals of the Academy of Medicine Singapore. 2009;38:57-65.

Disahkan Oleh:

apt. Dra. Faridah, M.Si apt. Andri Prasetiyo, S.Si, M.Farm.