Mencari Transduksi Sinyal Terkait

dengan Protein Tertentu

Dengan membuka situs http://cgap.nci.nih.gov/Pathways
Tampilan Ligand
Tabel Hasil Pengamatan
 Penjelasan Data Hasil Pengataman (Tabel Pengamatan)

1 Tm Primer 3
Panjang Primer • Nilai Tm untuk Primer 1 (Foward) adalah sebesar
Pada primer 1 dan primer 2 memiliki panjang 60,03 dan untuk Primer 1 (Reverse) adalah 60,69.
primer 20 bp nukleotida, baik untuk Foward • Nilai Tm untuk Primer 2 (Foward) adalah sebesar
maupun Reverse Primer. Sedangkan pada primer 60,69 dan untuk Primer 2 (Reverse) adalah 60,04.
3 memiliki panjang 21 bp nukleotida pada Foward
• Nilai Tm untuk Primer 3 (Foward) adalah sebesar
Primer dan memiliki panjang 20 bp nukleotida
60,00 dan untuk Primer 3 (Reverse) adalah 60,11.
pada Reverse Primer. Hal ini menunjukkan ketiga
primer memenuhi kriteria primer yang baik yaitu
antara 18-24. Sedangkan untuk panjang
produknya yaitu 402 untuk primer 1, 264 untuk
primer 2, dan 158 untuk primer ketiga.
Selisih Tm antar primer 4
Pasangan primer yang baik memiliki selisih Tm kurang
dari 5. Jika selisih Tm primer lebih dari 5 akan
Kandungan GC 2 menyebabkan penurunan proses amplifikasi, atau
bahkan memungkinkan tidak terjadi proses amplifikasi.
Dari hasil pengamatan didapatkan nilai Pada praktikum kali ini diperoleh data dimana selisih
kandungan GC untuk primer 1 dan primer 2 baik Tm primer pada masing-masing primer adalah kurang
untuk Foward maupun Reverse Primer nilainya dari 5. Jadi dapat dikatakan nilanya baik.
sama yaitu sebesar 55%. Sedangkan untuk primer
3 untuk Foward memiliki nilai GC 57,14% dan
nilai untuk Reverse memiliki nilai 55%. Hasil
tersebut menyatakan bahwa kandungan GC
5
ketiga primer memenuhi kriteria primer yang baik Dari data hasil pengamatan didapatkan nilai hasil
karena berada pada rentang 40-60%. BLAST ketiga primer sebesar 100%