www.umy.ac.

id

Analisis Quantitative
Structure Activity Relationship (QSAR)
Disampaikan pada praktikum prodi UMY Tahun 2022
oleh Apt. Azka Muhammad Rusydan, S.Farm., M.Pharm.Sci.
 TUJUAN PRAKTIKUM

Mahasiswa dapat melakukan analisis Quantitative Structure Activity

Relationship (QSAR), analisis single point, dan optimasi geometri

Mahasiswa dapat mempresentasikan hasil analisis QSAR yang telah

dilakukan

2
www.umy.ac.id
 TEKNIS SKILL
1. Mahasiswa mengunduh software Hyperchem 8.0
2. Mahasiswa melakukan QSAR terhadap molekul pembanding
(sinkron) dan molekul uji (sinkron-asinkron)
3. Mahasiswa melakukan presentasi berdasarkan hasil QSAR yang
didapat (OSCE)

3
www.umy.ac.id
 APA ITU SAR?
• Menurut Crum-Brown dan Fraser (1865), molekul serupa memiliki
aktivitas yang sama
• Maka jika kita dapat memahami hubungan struktur – aktivitas (HSA;
structure-activity relationship/SAR) dari suatu senyawa, kita dapat
memprediksi sifat biologisnya  potensi, toksisitas, biodegradable
• SAR  informasi berharga dalam penemuan dan pengembangan
senyawa baru, menilai potensi risiko kesehatan senyawa
• Memungkinkan modifikasi aktivitas secara rasional  meningkatkan
potensi/mengurangi toksisitas dengan mengubah struktur kimianya

4
www.umy.ac.id
 APA ITU QSAR?
• Model quantitative SAR (QSAR, HKSA) merupakan ketika hubungan
dikuantifikasi, dan model ini menghubungkan serangkaian variabel
"prediktor" (x) dengan potensi variabel respons (y) untuk memprediksi
aktivitas
• Memungkinkan untuk memprediksi tingkat aktivitas biologis atau
potensi
• prediksi  bisa saja SAR bagus, empiris-nya buruk

5
www.umy.ac.id
 JENIS QSAR
1. Metode Hansch
Menggunakan multiple regression correlation dalam menentukan
hubungan kuantitatif antara aktivitas biologi dengan substituen atau
parameter lain (hidrofobisitas , elektrostatis, sterik, dll).
Log A = aeN + beσ + ceEs + d
a,b,c,d : tetapan persamaan regresi
N : sifat hidrofobisitas
e : sifat elektrostatis
Es : sifat sterik
6
www.umy.ac.id
 JENIS QSAR
2. Metode Free Wilson
Menggunakan pendekatan regeresi untuk menentukan keberadaan
gugus dengan aktivitas biologisnya.

7
www.umy.ac.id
 METODE QSAR
• Secara umum, metode QSAR dilakukan dengan:
1. Membuat dataset SAR (training set) dari molekul-molekul sejenis
berdasar sifat (deskiptor)
2. Membuat model matematik QSAR
3. Melakukan validasi model matematika
4. Melakukan prediksi IC50 molekul baru

8
www.umy.ac.id
 9
www.umy.ac.id
 JENIS QSAR
3. Metode QSAR 3D atau CoMFA
(Comparative Molecular Field
Analysis)
Menggunakan teknik korelasi
statistik untuk
memperhitungkan hubungan
kuantitatif antara aktivitas
biologi dan gugus berdasarkan
interaksi sterik dan
elektrostatik.
10
www.umy.ac.id
 PENERAPAN QSAR
• Pengembangan antibiotik golongan 6-quinolone berawal dari asam
nalidiksat (1962) kemudian dikembangkan hingga saat ini (generasi 4:
Trovafloxacin) untuk memperbaiki kekurangan dari generasi O O

sebelumnya F
O OHO

H F
N N OH

H F
H 2N N N
H
F
H2N
H F
Trovafloxacin
F
Trovafloxacin
1 gen
st 2 gen
nd
3 gen
rd 4 gen th

Tidak u/ infeksi sistemik Bisa u/ infeksi sistemik Dosis sekali sehari Aktif vs anaerob dan aerobic
Aktif vs gram negatif Aktif vs P.aeruginosa Aktif vs S. pneumoniae Aktif vs gram positif dan negatif
Inaktif vs P.aeruginosa Lemah vs S. pneumoniae
Inaktif vs anaerob

11
www.umy.ac.id
PENERAPAN QSAR

12
www.umy.ac.id
 LANGKAH KERJA
Penggambaran Struktur Molekul

Perhitungan Single Point

Perhitungan struktur yang telah ditentukan (tanpa optimasi)

Optimasi Geometri
Perhitungan struktur yang telah ditentukan (tanpa optimasi)
13
www.umy.ac.id
STRUKTUR

14
www.umy.ac.id
 CARA KERJA
1. Tutorial%20Instalasi%20Hyperchem.mp4 –
2. Tutorial QSAR Hyperchem 8 Pro.mp4

15
www.umy.ac.id
 OSCE
Buatlah presentasi berdasarkan
hasil QSAR berikut:
•kel 1&6: Gatifloxacin + AM 1-5
•kel 2&7: Levofloxacin + AM 1-5
•kel 3&8: Moxifloxacin + AM 1-5
•kel 4&9: Sparfloxacin + AM 1-5
•kel 5&10: Ciprofloxacin + AM 1-5

16
www.umy.ac.id
 17
www.umy.ac.id