Kajian arkeologi adalah meliputi tinggalan artifak, ekofak
dan fitur. Istilah artifak bermaksud sebarang benda yang dibuat atau diubahsuai oleh manusia misaln ya tembikar tanah, arca, manik, pecahan porselin, pecahan tembikar, damar, anak panah, alat batu, gendang dan gangsa. Istilah ekofak pula bermaksud hasil tinggalan aktiviti manusia yang dapat dilihat dalam bentuk kulit siput, sisa tulang binatang, flora dan fauna, dan bekas pembakaran. Fitur pula bermaksud objek atau mana-mana data yang tidak boleh dipindahkan dan berada kekal ditempatnya seperti bekas saluran air, struktur candi, struktur bangunan, dan makam. Kebiasaannya bukti fitur yang ada hanya dilukiskan semula ataupun diambil gambarnya sahaja Istilah ekofak pula bermaksud hasil tinggalan aktiviti manusia yang dapat dilihat dalam bentuk kulit siput, sisa tulang binatang, flora dan fauna, dan bekas pembakaran. Fitur pula bermaksud objek atau mana-mana data yang tidak boleh dipindahkan dan berada kekal ditempatnya seperti bekas saluran air, struktur candi, struktur bangunan, dan makam. Kebiasaannya bukti fitur yang ada hanya dilukiskan semula ataupun diambil gambarnya sahaja
Kawasan-kawasan penting yang memiliki data artifak, ekofak dan fitur ini misalnya di Perak yang terdapat di gua Gunung Runtuh di Lembah Lengong dan Kota Tampan. Manakala di Terengganu terdapat di gua Batu Tok Bidan di gunung Bewah. Di Sarawak terdapat di sekitar gua Niah dan gua Kain Hitam. Manakala gua Cha di Kelantan Dalam keadaan tidak ada rekod bertulis maka data artifak sangat penting dapat membantu menentukan usia sesebuah masyarakat[3] dan seterusnya membantu menjelaskan sejarah awal Malaysia. Walaupun kebanyakan artifak yang ada adalah daripada batu dan gangsa tetapi ia tidak bermaksud bahan buatan daripada material yang lain tidak wujud. Misalnya daripada buluh, kayu dan rotan. Disebabkan cuaca di Malaysia yang beriklim panas dan lembap sepanjang tahun, semua bahan organik ini tidak dapat dikesan disebabkan telah mereput. Di Semenanjung Malaysia jumpaan artifak menunjukkan bahawa manusia telah menduduki seawal-awal 74,000 tahun yang lalu melalui jumpaan di Gua Gunung Runtuh, Perak. Manakala jumpaan di Gua Niah pula membuktikan manusia telah menduduki kepulauan Borneo seawal-awal 40,000 tahun yang lalu.[4] Justeru, bermula daripada utara Semenanjung Tanah Melayu hingga ke Sabah dan Sarawak telah ada bukti-bukti yang menunjukkan aktiviti manusia zaman lampau. Mereka tinggal di gua-gua dan memperoleh makanan melalui aktiviti berburu. Mereka memasak makanan di dalam gua dan kadang-kadang mengkebumikan mayat di tempat yang sama.[5] Pada zaman neolitik antara artifak yang dijumpai ialah alat pemotong makanan, pemukul batu, cincin atau gelang, mangkuk, pot dan kapak Sejarah Malaysia bermula seawal-awal pada zaman penglasieran yang kedua apabila terdapat jumpaan wujudnya bukti artifak di Kota Tampan, Perak.[7] Artifak yang dikesan merupakan tinggalan- tinggalan berupa alat-alat yang menunjukkan mereka bergantung hidup kepada hasil pemburuan dan mengamalkan budaya berpindah randah dan tinggal di gua-gua. Kesan tinggalan di gua- gua, bukit dan lembah sungai yang menunjukkan ia adalah budaya zaman paleolitik. Artifak yang dijumpai di sini meliputi alat-alat pemotong yang digunakan dalam kehidupan harian manusia purba yang dianggarkan sejak zaman manusia homosapien lagi.[8]Jumpaan lain misalnya alat pengetuk batu (Nut Craker) yang digunakan memotong makanan. Selain itu artifak zaman mesolitik turut dijumpai misalnya batu yang pipih dan simetri pada kedua- dua sisinya untuk kegunaan harian.[9] Batu kelikir ini dipercayai untuk kegunaan harian misalnya memotong makanan oleh manusia zaman awal. Manakala penemuan yang hampir sama turut didapati di gua Cha, Kelantan misalnya alat pemukul batu turut dijumpai di sini yang bertujuan untuk melicinkan permukaan kulit kayu yang berkemungkinan digunakan sebagai pakaian. Selain pemotong dan kapak beliung, batu berbentuk bujur, cincin gelang, pinggan, mangkuk, kendi pelbagai bentuk, batu penumbuk, periuk tanah dan batu pengasah, dan tembikar adalah antara yang terpenting didapati di Gua Cha dan Bukit Tengku Lembu, Perlis.[10] Penemuan tembikar ini menunjukkan bahawa mereka telah mahir membuat sendiri tembikar berasaskan bahan-bahan tempatan. Selain itu jumpaan yang agak menarik di Gua Cha meliputi artifak berbentuk cincin atau gelang (bracelit) yang diperbuat daripada batu.[11] Agak sukar untuk mengetahui kegunaan cincin dan gelang ini. Walau bagaimanapun kita dapati kesedaran terhadap aspek kesenian telah wujud pada waktu ini. Manakala di Gua Niah melalui ekpedisi Tom Harrison, turut dijumpai banyak tingalan seramik yang dipercayai untuk tujuan kehidupan harian.[12] Pada zaman paleolitik, alat-alat utama yang digunakan untuk berburu, memotong, atau memepertahankan diri diperbuat daripada batu. Matlamat penciptaan alat-alat batu itu ialah untuk membantu mereka meneroka sumber alam sekitar. Alat-alat itu dibentuk daripada alat-alat batu sungai dan secara amnya alat-alat batu itu dikenali sebagai alat pemotong kapak. Terdapat juga alatan yang memiliki pemegang ataupun berulu. Alat batu zaman ini tidak menunjukkan tahap pencapaian yang tinggi dalam kesenian. Peralatan yang digunakan lebih mengutamakan fungsi untuk memenuhi keperluan hidup manusia semasa berburu. Selain jumpaan di Perak dan Gua Cha, terdapat juga jumpaan lain yang meliputi era Mesolitik seperti kepala kapak empat segi bujur, pisau di sungai Tembeling; dan juga pinggan, piring, ketul batu pengasah dan periuk tanah liat di Gua Cha dan di Perak. Jumpaan pisau tembeling menunjukkan telah wujud daya pemikiran tinggi, misalnya rekacipta barangan daripada tanah liat dan telah melapah daging menggunakan pisau (pisau tembeling). Sejarah awal Malaysia turut melalui zaman logam yang meliputi kebudayaan Dongson iaitu sekitar abad ke-3 SM. Terdapat beberapa jumpaan yang menunjukkan telah ada bukti penggunaan gangsa digunakan misalnya jumpaan di Kelang dan sungai Tembeling. Di Kelang ahli arkeologi telah menemui loceng gangsa, manakala di sungai Tembeling ditemui cattle drum yang berupa kawah yang besar.[13] Jumpaan ini membuktikan telah wujud perhubungan perdagangan antara empayar Funan, Lembah Mekong dan Semenanjung Malaysia (Lembah Kelang). Kesimpulan Disebabkan sumber penulisan awal tentang sejarah Malaysia sangat sedikit justeru tidak hairanlah seringkali sejarah awal Malaysia dikatakan bermula sejak zaman kesultanan Melaka. Sejarah awal Malaysia sebelum Melaka sangat kabur. Justeru, wujud persoalan bila dan bagaimana manusia mula menduduki Semenanjung Malaysia dan juga Sabah dan Sarawak. Maka dengan penemuan data artifak, ekofak dan fitur maka kita dapat membuktikan bahawa sejarah awal Malaysia sebenarnya bermula lebih awal lagi iaitu sejak 70,000 tahun yang lalu melalui jumpaan di Gua Gunung Runtuh, Lenggong, Perak. Penemuan bahan-bahan artifak, ekofak dan fitur dapat membantu kekurangan bukti-bukti catatan awal sejarah awal Malaysia sekurang-kurangnya sebelum zaman protosejarah. Pemahaman yang jelas terhadap budaya masyarakat awal dapat membantu memahami taburan dan serakan penduduk seperti yang ada pada hari ini.