Majlis diketuai oleh seorang khalifah. Kemudian, membaca istighfar 3 kali diikuti dengan :
اﻟﻔﺎﺗﺤﺔ,اﻟﻰ ﺣﻀﺮة اﻟﻨﺒﻲ ﺻﻠﻰ اﷲ ﻋﻠﯿﻪ وﺳﻠﻢ
Kemudian barulah majlis khatam dimulakan dengan bacaan surah ad-Dhuha ()ﺳﻮرة اﻟﻀﺤﻰ
sehingga sampai surah an-Nas ()ﺳﻮرة اﻟﻨﺎس.
Apabila sampai pada ayat terakhir surah yang dibaca dan hendak beralih ke surah yang
seterusnya hendaklah dibaca takbir secara beramai-ramai ( )ﻻ اﻟﻪ اﻻ اﷲ واﷲ اﻛﺒﺮ وﷲ اﻟﺤﻤﺪSunat
bagi pembaca al-Quran menyebut lafaz Takbir. Apabila selesai hendaklah membaca :
115: وﺗﻤﺖ ﻛﻠﻤﺔ رﺑﻚ ﺻﺪﻗﺎ وﻋﺪﻻ ﻻ ﻣﺒﺪل ﻟﻜﻠﻤﺘﻪ وﻫﻮ اﻟﺴﻤﯿﻊ اﻟﻌﻠﯿﻢ )ﺳﻮرة اﻷﻧﻌﺎم
Untuk majlis khatam secara berkumpulan, bacaan surah dilakukan secara bergilir-gilir oleh
pengkatam-pengkhatam dengan membaca Surah Ad-Dhuha sehinggalah ke surah an-Nas.
Apabila samapai pada ayat terakhir surah-surah yang dibaca hendaklah dibaca secara
beramai-ramai diikuti membaca takbir ( )ﻻ اﻟﻪ اﻻ اﷲ واﷲ اﻛﺒﺮ وﷲ اﻟﺤﻤﺪapabila hendak beralih ke
surah yang seterusnya.
Majlis diakhiri dengan membaca doa khatam al-Quran. Mengenai doa khatam al-Quran,
sebenarnya tiada nas atau doa khas dan khusus untuk khatam al-Quran. Apa-apa sahaja
doa yang baik adalah diharuskan. Namun demikian, lazimnya doa ini dibaca ketika majlis
khatam al-Quran.