Nama : Fara Kirana Aurora

Kelas : XII . IPA . 1

Lembar Kerja Peserta Didik (LKPD) Sintesis Protein

Tujuan ; Memahami proses pada sintesis protein.

Bahan diskusi;

1. Jelaskan tahap-tahap pada saat transkripsi!

2. Di manakah lokasi terjadinya transkripsi?

3. Substansi apakah yang terlibat dalam transkripsi?

4. Bagaimana mekanisme translasi?

5. Dimanakah terjadinya translasi?

6. Jelaskan tahapan lengkap sintesa Protein hingga dihasilkan asam amino.

Jawab :

1. Transkripsi merupakan proses pencetakan atau penulisan ulang DNA ke dalam mRNA (kodon) yang
terjadi di nukleus, yaitu:

 DNA di dalam nukleus (inti sel) membentuk RNAd (duta) dengan diawali membukanya rantai
helix pada dNA dengan bantuan enzim helikase.
 Enzim RNA polimerase menempel pada bagian promotor dan berperan membuka pita DNA
serta menambahkan nukleotida pada rantai RNAd.
 Setelah mencapai bagian terminator, RNA polimerase dan RNAd lepas dari DNA.
 RNAd yang sudah jadi meninggalkan nukleus menuju ke sitoplasma dan melekat di ribosom.

2. Nukleus

3. Inisiasi : RNA polimerase terikat pada untaian DNA, yang disebut promoter, yang ditemukan didekat
awal dari suatu gen. Setiap gen mempunyai promoternya tersendiri. Setelah terikat, RNA polimerase
memisahkan untaian ganda DNA, menyediakan template atau cetakan untaian tunggal yang siap untuk
ditranskripsi.

Elongasi : Satu untaian DNA, untaian cetakan, bertindak sebagai cetakan untuk digunakan oleh enzim
RNA polimerase. Sambil ‘membaca’ cetakan ini, RNA polimerase membentuk molekul RNA keluar dari
nukleotida, membuat sebuah rantai yang tumbuh dari 5′ ke 3′. RNA transkripsi membawa informasi yang
sama dari untaian DNA non-template (coding).
Terminasi : Urutan ini memberikan sinyal bahwa transkripsi RNA telah selesai. Setelah ditranskripsi, RNA
polimerase melepaskan hasil transkripsi RNA.

4. Sitoplasma dengan bantuan Ribosom

5. Translasi.

Inisiasi : mRNA hasil proses transkripsi akan bergabung dengan RIbosom. Bersama dengan jenis RNA lain
yang dinamakan tRNA, ketiganya memulai proses translasi. tRNA dan kodon (nukleotida ke 3 pada
mRNA) akan bertemu di kamar P ribosom.

Elongasi : tRNA yang lain akan masuk ke kamar A. Asam amino tRNA di kamar A ini akan bersatu dengan
asam amino tRNA di kamar P, lalu keduanya akan pindah ke kamar E sebelum akhirnya lepas.

Terminasi : Proses translasi akan berakhir setelah translasi sampai ke kodon stop. Rantai asam amino
lalu akan terlepas dari ribosom-RNA.

6. A.) Replikasi DNA :

1.) DNA helikase yang berfungsi untuk membuka rantai ganda DNA induk.

2.) Enzim primase yang membentuk primer yang merupakan segmen pendek dari RNA sebagai
pemula untuk terjadinya sintesis protein.

3.) Dari ujung 3´ RNA primer, DNA polimerase telah menambahkan pasangan basa nitrogen (dari
nukleotida-nukleotida) pada rantai tunggal DNA induk dan terbentuk rantai DNA yang bersambungan
secara kontinyu (tanpa terpisah-pisah) yang disebut sebagai leading strand.

4.) Pada rantai tunggal DNA induk yang lain, DNA polimerase akan membentuk lagging strand
(merupakan keseluruhan rantai kopian DNA yang pertumbuhannya tidak kontinyu) dengan
memperpanjang RNA prime.

5.) RNA primer di beberapa tempat akan membentuk segmen-segmen DNA baru yang saling terpisah.

6.) Segmen-segmen itulah yang disebut juga sebagai fragmen Okazaki.

7.) DNA polimerase yang lainnya, akan menggantikan RNA primer dengan DNA dan enzim ligase
menghubungkan segmen-segmen okazaki, sehingga terbentuk salinan DNA baru. DNA baru yang telah
terbentuk (identik dengan DNA induk) akan melanjutkan tahapan untuk mensintesis protein yaitu suatu
tahapan transkripsi dan translasi.

B.) Transkripsi

• ) RNA polimerase yang melekat pada molekul DNA sehingga menyebabkan sebagian dari double helix
terbuka.
• ) Akibat terbukanya pita DNA, basa-basa pada salah satu pita akan menjadi bebas, sehingga memberi
kesempatan pada basa-basa pasangannya menyusun mRNA. Misalnya pada Timin (T) dari DNA akan
membentuk Adenin (A) pada mRNA, Sitosin (C) dari DNA akan membentuk Guanin (G) pada mRNA, dan
seterusnya. Oleh karena itu enzim RNA polimerase bergerak di sepanjang pita DNA yang menjadi model.
DNA yang akan melakukan transkripsi adalah DNA sense/template.

• ) mRNA yang sudah selesai dicetak akan meninggalkan inti sel dan akan menuju sitoplasma dan
melekat pada ribosom. Ribosom adalah granula-granula dalam sitoplasma yang juga berperan dalam
sintesis protein. Biasanya berderet 4 atau 5 dan disebut juga polisom.

C.) Translasi

• ) Pemindahan asam amino dari sitoplasma ke ribosom akan dilakukan oleh tRNA. Asam amino terlebih
dahulu diaktipkan dengan ATP (Adenosin Trifosfat), proses ini dapat dipengaruhi oleh enzim amino asil
sintetase. Hasilnya juga berupa Aminoil Adenosin Monofosfat (AA-AMP) dan fosfat organik.

• ) AA-AMP diikat oleh tRNA untuk dibawa menuju ke ribosom.

• ) Ujung bebas tRNA akan mengikat asam amino tertentu yang telah diaktifkan. Di bagian lengkungan
terdapat tiga basa nukleotida yang disebut juga antikodon, yang nantinya berpasangan dengan tiga basa
yang disebut kodon pada pita mRNA.

• ) Dalam ribosom terdapat situs (tempat) yang melekatnya mRNA dan dan dua situs tRNA (P site dan A
site). Anti kodon pada tRNA harus sesuai juga dengan pasangan basa dari kodon pada mRNA. Jika asam-
asam amino yang terdapat pada P site telah bergabung ke asam amino yang terdapat pada tRNA di A
site maka ribosom akan bergerak langsung sepanjang mRNA ketiga basa berikutnya.

• ) tRNA yang telah melepaskan asam amino kemudian akan meninggalkan ribosom, bebas dalam
sitoplasma untuk selanjutnya mampu mengikat asam amino lain semacam yang telah diaktifkan oleh
ATP, sedangkan tRNA dengan suatu rantai asam amino menempati P site, tRNA berikutnya dengan asam
amino akan datang ke ribosom ke P site. Demikian seterusnya sehingga dalam polisom yang terangkai
bermacam-macam asam amino dan tersusun menjadi rangkaian polipeptioda yang selanjutnya akan
membentuk suatu protein fungsional.

• ) Proses translasi ini akan berakhir jika sampai ke kodon akhir. Perlu diingat bahwa pada setiap tahap
akan diperlukan enzim dan dua tahap pertama memerlukan energi. Jadi dalam ribosom akan
berlangsung penerjemahan urutan nukleotida DNA ke protein