LATIHAN

BIOKIMIA UMUM



1. Air merupakan komponen utama sel, berperan untuk memediasi interaksi antar molekul,
menyebabkan ionisasi molekul-molekul, dan terlibat pada reaksi-reaksi di dalam sel. (15)

a. Tuliskan 3 nama asam amino yang dihasilkan dari hidrolisis sempurna larutan oligopeptida
H3N–I-Q–K-COOH

b. Spesi konjugat PO$%

# adalah

Spesi konjugat tersebut bersifat

c. Dibawah ini terdapat data nilai Ka (pada 25°C) dari berbagai jenis bufer. Tuliskan kemikalia
yang tepat untuk membuat buffer pH 8,0 (Jawaban ditulis dalam kotak).
i. Bufer karbonat Ka = 4,3 × 10%(
ii. Bufer glisin NaOH Ka = 2,5 × 10%)*
iii. Bufer tris HCl Ka = 8,5 × 10%+
2. Dalam suatu eksperimen biokimia, Anda diminta untuk membuat larutan bufer pH 5,0.

a) Senyawa manakah di bawah ini yang tepat untuk dipilih sebagai komponen bufer pH 5,0?
Jelaskan alasannya.
Opsi 1: Asam format Ka = 2,1 x 10–4
Opsi 2: Asam asetat Ka = 1,8 x 10–5
Opsi 3: Etilamin Kb = 4,7 x 10–4

b) Bila Anda memiliki larutan asam asetat 0,2 M dengan volume 1 L, tentukan massa natrium
asetat (MM = 82 g/mol) yang harus ditambahkan ke dalam larutan tersebut untuk membuat
larutan bufer asetat dengan pH 5,0. Asumsi penambahan padatan tidak mengubah volume
larutan.

c) Bila Anda membuat larutan bufer pH 5,0 menggunakan bahan (zat kimia) yang sama dengan
soal (b), tetapi konsentrasi asetat total adalah 0,3 M, berapakah konsentrasi asam asetat dan
natrium asetat yang diperlukan (dalam satuan molar)?

3. a. Ikatan peptida pembentuk struktur primer protein bersifat rigid. Mengapa struktur heliks
dapat terbentuk dari struktur primer dengan ikatan peptida yang rigid? Jelaskan.

b. Urutan 23 asam amino pertama pembentuk sitrat sintase adalah

TNLKDVLAALIPKEQARIKTFRQ. Apa pengaruh residu P pada pembentukan struktur
sekunder pada ujung 23 asam amino pertama sitrat sintase tersebut? Jelaskan.

c. Gambarkan struktur oligopeptida (tanpa muatan) dengan urutan (1-2-3) yang memiliki
rantai samping:
(1) ¾(CH2)2-S-CH2 (2) ¾CH2-CONH2 (3) ¾CH2-OH
Beri nama oligopeptida tersebut. Tentukan muatan keseluruhan oligopeptida tersebut
pada pH 7,0. Diketahui pKa ¾NH$- = 9,6 dan pKa ¾COOH = 2,3

Halaman 1 of 2
 4. Pertanyaan-pertanyaan di bawah ini terkait dengan topologi (kartun) struktur tiga dimensi suatu
protein sitoplasma. (24)

NH3+

-
OOC

a. Mengapa protein yang ada di alam diawali dengan ujung-N (¾NH2) dan diakhiri oleh ujung-C
(¾COOH)?

b. Daerah B pada gambar di atas mengandung satu jembatan garam dan satu ikatan disulfida.
Tulis residu asam amino yang terlibat dalam pembentukan jembatan garam dan ikatan
disulfida tersebut.

c. Daerah C pada struktur protein di atas berada di bagian dalam (interior). Tuliskan jenis
interaksi yang terdapat pada daerah C. Tuliskan juga 4 residu asam amino yang terlibat dalam
interaksi tersebut.

Halaman 2 of 2