UJIAN TENGAH SEMESTER GASAL

TAHUN AKADEMIK 2024

Nama Mata Kuliah : Biokimia
SKS :2
Semester/Tahun : Genap / 2023- 2024
Prodi : Kimia/P. Kimia
Pengampu : Samuel Budi Wardhana Kusuma Ph.D
waktu : 100 menit

Kerjakan soal di bawah ini dengan urut pada kertas. lalu captured dan upload jawaban anda
ke ELENA.
No Soal
1. a. Tuliskan struktur dari asam glutamat dalam setiap rentang pH dari asam ke basa.
Diketahui pKa1= 2,5 pKa2= 3,5 pKa3= 8,7
b. Gambarkan kurva titrasi dari asam glutamat yang dititrasi dengan basa kuat, seperti
NaOH.
c. Hitung dan tunjukkan titik isoelektrik (Pi) dari asam glutamat pada plot. Pastikan
memberi label sumbu x dan y.
d. Jika asam amino ini dipisahkan dengan menggunakan elektroforesis dan pH = 6
apakah asam glutamat akan bergerak ke anoda (+) atau ke katoda (-) atau tidak
bergerak. Jelaskan.

2. Segmen peptida yang di bawah ditemukan di struktur sekunder yang tersusun dari β-sheet
anti-paralel. Dari ujung C peptida di bawah, urutan segera setelah pergantian mengandung
residu asam amino berikut (dari NC) A-F-R-M-Y-A. (lihat di index pada halaman
terakhir)
a) Gambarkan residu ini dalam struktur di bawah, dengan stereokimia yang tepat, dan
menunjukkan ikatan-H yang akan ada dengan untai teratas.
b) Meskipun tidak dituliskan di sini, apa asam amino mungkin terdapat pada bagian
yang menghubungkan dua untai anti-paralel (turn)?
c) Jika β-sheet terletak pada bidang kertas, sisi manakah yang Anda harapkan untuk
membuat kontak hidrofobik permukaan protein lain?
d) sisi manakah yang Anda harapkan berhadapan dengan pelarut? Jelaskan secara
singkat alasan Anda (<3 kalimat).
3.

Tentukan urutan peptida hormon jika diketahui :

a. Hidrolisis mutan protein hormon angiotensin II menghasilkan komposisi asam amino
(D, F, I, M, P, R, Y, V)
b. Hidrolisis dengan tripsin menghasilkan dipeptida (D,R) dan sisa heksapeptida
c. Pemutusan dengan CNBr menghasilkan dipeptida (F, P) dan sisa heksapeptida lain
d. Kimotripsin memutus hormon menjadi 2 tetrapeptida: (D, R, Y, V) dan (F, I, M, P)
e. Komposisi dipeptida (P, F) tidak dapat diputus oleh kimotripsin maupun
karboksipeptidase

4 Struktur α-heliks adalah struktur sekunder protein dengan konfigurasi gulungan teratur
dari rantai polipeptida
a. gambarkan ikatan hidrogen pada gambar α-heliks disamping
b. gambarkan simbol dari struktur α-heliks
c. sebutkan nama protein yang memiliki struktur yang terdiri dari α-heliks saja
5 Raffinose is a trisaccharide and a minor cons tuent in sugar beets.
(a) Is raffinose a reducing sugar? Explain.
(b) What are the monosaccharides that compose raffinose ?
(c) β - Galactosidase is an enzyme that will remove galactose residues from an oligosaccharide. What
are the products of β - galactosidase treatment of raffinose ?

6 Platelet-ac va ng factor (PAF) is a phospholipid that plays a role in allergic and inflammatory
responses, as well as in toxic shock syndrome. The structure
of PAF is shown here. How does it differ from the structures of the phospholipids

Appendix