p e n g e n a l a n kesultanan Johor Riau disasarkan oleh waris Kesultanan Melayu Melaka. Kerajaan ini juga mewarisi sistem pemerintahan dan pentadbiran serta wilayah jajahan takluk dan naungan Kesultanan Melayu Melaka. Kesultanan Johor Riau juga meneruskan tradisi kegemilangan dan keagungan kerajaan awal di Alam Melayu pengasasan Kerajaan Pusat pemerintahan ●Kesultanan Johor Riau telah diasaskan ●Sultan Alauddin Shah I membina pusat pemerintahan di Kota Kara,Pekan Tua pada tahun oleh Raja Ali,Putera Sultan Mahmud Shah 1528 dan Tun Fatimah.Baginda menggunakan ●Kedudukan Kota Karya yang terletak di sungai gelaran Sultan Alauddin Riayat Shah I yang lebar dan dalam memudahkan kapal untuk ●Bendahara Seri Nara Diraja dititahkan keluar masuk menghimpunkan rakyat untuk membuka ●kawasan berbukit bukau di sekitar Kota Kara negeri di pesisir sungai Johor menjadi benteng pertahanan daripada ancaman luar pusat pusat pemerintahan pemerintahan ●Kota Kara di Pekan Tua telah diserang dan ●Pada tahun 1540,Sultan Alauddin Riayat Shah I dimusnahkan oleh portugis pada tahun 1535 memindahkan pusat pemerintahan ke Kota Batu,Johor Lama ●Sultan Alauddin Riayat Shah I berundur dan ●Kawasan ini juga dokenal sebagai Tanjung Batu membuka pusat pemerintahan di Kota Seyong ●Kedudukannya yang strategik di sungai Johor yang lebar ●Kawasan ini lebih selamat kerana kapal dan dalam memudahkan kemasukan kapal dagang
perang musuh sukar melintasi sungai yang
sempit h u k a h a n d a ? t a Kesultanan Johor Riau yang diasaskan oleh Sultan Alauddin Riayat Shah I telah berkembang dan diperintah oleh suktan daripada dua keturunan.Dari 1528 hingga 1699, pemerintahan Kesultanan Johor Riau diketuai oleh waris berketurunan Kesultanan Melayu Melaka. Manakala dari 1699 hingga 1824, kegemilangan dan kemasyhuran Kesultanan Johor Riau diteruskan pula oleh sultan berketurunan Bendahara Johor