TUGAS 1

KOMPUTASI PENGEMBANGAN OBAT BAHAN ALAM

Nama : Dwi Zacky Al Khoisi

NIM : 3335200052

Keladi tikus (Typhonium flagelliforme) suku Araceae merupakan salah

satu tanaman obat Indonesia yang mengandung beberapa senyawa metabolit
sekunder yaitu senyawa flavonoid, alkaloid, terpenoid, stigmasterol, saponin, dan
steroid (Anggita, 2019).

Tabel Senyawa Metabolit Sekunder Pada Tanaman Keladi tikus (Typhonium

flagelliforme)
No Nama Senyawa Gambar Bobot Kegunaan Referensi
Struktur Molekul
1 Flavonoid Berat Sebagai anti- REDHA,
Molekul oksidan ABDI. 2020.
594,5 Flavonoid:
gr/mol, Struktur, Sifat
Antioksidatif
Dan
Peranannya
Dalam Sistem
Biologis
Jurnal Belian
Vol. 9 No. 2
Sep. 2010:
196 - 202
2 Alkaloid Berat berpotensi Ernawati,
Molekul sebagai anti- Teni dkk.
348.4 g/ anker, anti-tumor, 2018.
mol anti-mikroba, Bioaktivitas
anti-HBV, anti- Senyawa
inflamasi, anti- Turunan
oksidan, Alkaloid
Kinkona. Vol
3.
3 Terpenoid Berat berpotensi Wulansari,
Molekul sebagai Endang Dwi
512.7 g antibakteri, dkk. 2020.
/mol KANDUNGAN
sehingga akan
TERPENOID
dihasilkan agen
DALAM
antibakteri yang
DAUN ARA
juga mampu
(Ficus carica
menghambat
L.) SEBAGAI
pertumbuhan AGEN
bakteri yang ANTIBAKTERI
resisten TERHADAP
terhadap BAKTERI

antibiotik yang Methicillin-

ada. Resistant
Staphylococc
us aureus.
Volume 9
4 Stigmasterol Berat Berpotensi Nasrudin
Molekul sebagai obat dkk. 2017.
412,7 gr untuk penyakit ISOLASI
am/mol akibat kelebihan SENYAWA
atau kekurangan STEROID
hormon, penyakit DARI
 berbahaya serta KUKIT
penyakit lainnya AKAR
seperti radang SENGGUGU
sendi dan alergi (Clerodendru
m serratum
L.Moon).
Vol. 6 No. 3
5 Saponin Berat Berpotensi https://
Molekul sebagai repository.pol
1223.3 g antibakteri, tekkespim.ac.
/mol antifungi, id/id/eprint/
kemampuan 423/3/BAB
menurunkan %20II
kolesterol dalam %20TINJAU
darah dan AN
menghambat %20PUSTA
pertumbuhan sel KA.pdf
tumor
6 Steroid Berat Steroid berperan Nasrudin,
Molekul penting bagi dkk. 2017.
288.4 g/ tubuh dalam ISOLASI
mol menjaga SENYAWA
keseimbangan STEROID
garam,
DARI KUKIT
mengendalikan
AKAR
metabolisme dan
SENGGUGU
meningkatkan
(Clerodendru
fungsi organ
m serratum
seksual serta
L.Moon). Vol.
perbedaan fungsi
biologis lainnya 6 No. 3
antara
jenis kelamin
7. Tabel Persyaratan Obat – Aturan Lipiski Five

N Nama Bobot Log P Iktan Ikatn Molar

o Senyawa Mole < 5 Hidroge Hidroge Refraktivit
kul n n y
< 500 Donor Aksepto 40-130
<5 r
< 10
1. Alkaloid 335.0 1.36050 6 1 89.173775
0
2. Flavonoid 222.0 3.30279 0 2 65.819489
0 9
3. Terpenopid 512 6.65810 0 5 140.34002
2 7
4. Stigmasterol 412 7.80 1 1 128.12274
2
5. Saponin 1222. -4.0692 15 27 283.19665
00 5
6. Steroid 228 3.87919 1 2 82.716774
8
7. Tenofovir 412.0 7.80080 1 1 128.122
(kontrol 0 3
positif)

8. Tabel Nilai Binding Affinity

No Nama Senyawa Binding Affinity
Kcal/mol
1. Alkaloid -5.6
2. Flavonoid -6.7
3. Terpenopid 27.3
4. Stigmasterol -6.7
5. Saponin -6.7
6. Steroid -5.3
7. Tenovorir (kontrol -5.7
positif)
9. Tabel Gambar 2D dan 3D

N Nama Gambar 2D Gambar 3D

o Senyawa
1. Alkaloid

2. Flavonoid
 3. Stigmaster
ol

4. Tenovoir

10. Tabel Residu Asam Amino yang terikat

No Nama Residu Asam Jenis Ikatan

Senyawa Amino
1. Tenofovir GLN A:77 Ikatan hidrogen
VAL A:84 konvensional
MET A:75 Ikatan hidrogen
konvensional
HIS A:8
Ikatan hidrogen
konvensional
 Ikatan hidrogen
ILE A:76 konvensional
ALA A:85
VAL A:86
VAL A:84 Ikatan van der waals
HIS A:79 Ikatan Van der Waals
ILE A:82 Ikatan Van der Waals
CYS A:23 Ikatan Van der Waals
LEU A:5 Ikatan Van der Waals
LEU A:9 Ikatan Van der Waals
VAL A:21 Ikatan Van der Waals
THR A:12 Ikatan Van der Waals
Ikatan Van der Waals
Ikatan Van der Waals
Ikatan Van der Waals

2. Flavonoid ILEA:18 Ikatan Van der Waals

THR A:12 Ikatan Van der Waals
VAL A:21 Ikatan Van der Waals
LEU A:9 Ikatan Van der Waals
LEU A:5 Ikatan Van der Waals
ILE A:82 Ikatan Van der Waals
HIS A:79 Ikatan Van der Waals

VAL A:86 Ikatan Phi-Alkil

CYS A:23 Ikatan Phi-Alkil
VAL A:84 Ikatan Phi-Alkil

HIS A:8 Ikatan Pi-Pi T Shaped

3. Alkaloid HIS A:8 Ikatan Van der Waals

ILE A:82 Ikatan Van der Waals
HIS A:79 Ikatan Van der Waals
VAL A:84 Ikatan Van der Waals
ALA A:85 Ikatan Van der Waals
 MET A:75 Ikatan Van der Waals
ILE A:76 Ikatan Van der Waals
VAL A:86 Ikatan Van der Waals
ILE A:18 Ikatan Van der Waals
THR A:12 Ikatan hidrogen
GLN A:77 konvensional
Ikatan hidrogen
konvensional

4. Stigmasterol VAL A:21 Ikatan Van der Waals

CYS A:23 Ikatan Van der Waals
ILE A:18 Ikatan Van der Waals
LYS A:88 Ikatan Van der Waals
MET A:75 Ikatan Van der Waals
THR A:12 Ikatan Van der Waals
LEU A:9 Ikatan Van der Waals

ILE A:82 Ikatan alkil

LEU A:5 Ikatan alkil

HIS A:8 Ikatan Phi-alkil

HIS A:79 Ikatan Phi-alkil
VAL A:84 Ikatan Phi-alkil
VAL A:86 Ikatan Phi-alkil