Mengenal

Varian Omicron
Erlina Burhan
Departemen Pulmonologi dan
Kedokteran Respirasi
FKUI – RSUP Persahabatan
Situasi Varian
Omicron

BEST FOR You 2

O R G A N I C S C O M PA N Y
 Sejarah

Kasus pertama dari Afrika Selatan, dari spesimen yang dikumpulkan 9 November
2021

Varian ini dilaporkan oleh Afrika Selatan ke WHO pada 24 November 2021

Di beberapa minggu terakhir, kasus COVID-19 di Afrika Selatan meningkat tajam,

sebagian besar data WGS adalah varian Omicron

Botswana melaporkan varian Omicron dari sampel yang diperoleh tanggal 11

November 2021

Pada 28 November 2021, kasus sudah menyebar di beberapa negara lain di 4 region
WHO, dan sebagian besar berkaitan dengan perjalanan
BEST FOR You 3
O R G A N I C S C O M PA N Y
WHO. Enhancing readiness for Omicron (B.1.1.529): technical brief and priority actions for member states. 28 Nov 2021 [updated 29 Nov 2021]
 Varian Omicron (B.1.1.529)
Ditetapkan sebagai Variants of Concern (VOC) oleh WHO
pada 26 November 2021, 2 hari setelah ditetapkannya
varian ini sebagai Variants under Monitoring (VUM)
» Varian ini memiliki 45-52 mutasi asam amino,
dibandingkan dengan strain awal
• Termasuk 26-32 mutasi di protein Spike
» Beberapa mutasi tersebut diduga berhubungan dengan
kemampuan immune escape dan penularan yang lebih
tinggi, tetapi masih diperlukan data lebih banyak
» Tidak memiliki perubahan pada RdRp G671S yang https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/

berkaitan dengan penurunan Ct value pada varian Delta

BEST FOR You 4

WHO. Enhancing readiness for Omicron (B.1.1.529): technical brief and priority actions for member states.
O R G A28
N INov
C S 2021
C O M[updated
P A N Y 29 Nov 2021]
NGS-SA. SARS-CoV-2 sequencing update. 1 Dec 2021
 Mutasi Varian Omicron Dibandingkan dengan Varian Lain

• Memiliki banyak mutasi di dua regio immunogenik dari subunit S1: NTD dan RBD
• Memiliki mutasi di lokasi pemecahan furin, termasuk N679K dan P681H
• Efek dari mutasi pada sebagian besar subunit S2 belum diketahui
BEST FOR You 5
O R G A N I C S C O M PA N Y
NGS-SA. SARS-CoV-2 sequencing update. 1 Dec 2021
 Pemeriksaan Laboratorium
Dilaporkan memiliki delesi pada gen S di protein Spike
posisi 69-70 = S gene target failure (SGTF)
Serupa dengan varian Alpha (B.1.1.7)

» Pemeriksaan PCR ThermoFisher TaqPath

assay dapat memeriksa gen S  bisa
digunakan untuk diagnosis dan juga
skrining terduga infeksi virus varian
Omicron (sebelum dilakukan Whole
Genome Sequencing)
» Mutasi pada nukleokapsid diperkirakan
tidak berdampak ada tes cepat antigen

https://www.bbc.com/indonesia/majalah-59486346

BEST FOR You 6

WHO. Enhancing readiness for Omicron (B.1.1.529): technical brief and priority actions for member states.
O R G A28
N INov
C S 2021
C O M[updated
P A N Y 29 Nov 2021]
NGS-SA. SARS-CoV-2 sequencing update. 1 Dec 2021
Persebaran
PersebaranKasus
KasusVarian
VarianOmicron
OmicrondidiBeberapa
BeberapaNegara
Negara(per
(per04/12/2021)
04/12/2021)

https://www.gisaid.org/hcov19-variants/ BEST FOR You 7

O R G A N I C S C O M PA N Y
 Rekapitulasi Jumlah Kasus Varian Omicron Beberapa Negara (per 4/12/2021)
» Berdasarkan data dari GISAID dan kompilasi berita oleh BNO News

Total kasus Jumlah kasus Total kasus Jumlah kasus Total kasus Jumlah kasus
Negara (terdata di (dikompilasi Negara (terdata di (dikompilasi Negara (terdata di (dikompilasi
GISAID) BNO News) GISAID) BNO News) GISAID) BNO News)
Afrika Selatan 217 217 Italia 4 4 Finlandia - 5
Britania Raya 58 134 Norwegia 3 15 Nigeria - 3
Ghana 33 33 Brazil 3 5 Islandia - 3
Botswana 19 21 Korea Selatan 3 9 Sri Lanka - 1
Belanda 17 16 Israel 3 7 Yunani - 1
Jerman 15 12 Jepang 2 2 Arab Saudi - 1
Portugal 13 28 Prancis 2 12 Uni Emirat Arab - 1
Amerika Serikat 12 29 Reunion 2 1 Malaysia - 1
Australia 11 14 India 2 2 Meksiko - 1
Kanada 10 16 Denmark 2 18 Mozambik - 2 suspek
Austria 10 4 Swedia 1 7 Singapura - 2 suspek
Hong Kong 8 8 Luxembourg 1 -
Spanyol 7 5 Irlandia 1 1
https://www.gisaid.org/hcov19-variants/
Swiss 6 3 Ceko 1 1 https://bnonews.com/index.php/2021/11/omicron-tracker/
Belgia 6 2 Zimbabwe - 50

BEST FOR You 8

O R G A N I C S C O M PA N Y
Gejala Varian Omicron

Amerika Serikat: gejala Inggris Raya: isolasi

Australia: gejala ringan
ringan, isolasi mandiri mandiri, gejala ringan

https://www.cdc.gov/media/releases/2021/s1201-omicron-variant.html https://www.gov.uk/government/news/covid-19-variants-identified-in-the-uk https://www.health.gov.au/news/health-alerts/novel-coronavirus-2019-

ncov-health-alert/omicron-variant

Afrika Selatan: tidak

Israel: 2 dari 7 sudah
ada gejala khusus yang
divaksin 3 dosis Pfizer. Belanda: gejala ringan
berbeda dari varian lain.
Sebagian besar tidak atau tanpa gejala
Beberapa tidak
bergejala
bergejala
https://www.nicd.ac.za/frequently-asked-questions-for-the-b-1-1-529- https://www.rivm.nl/coronavirus-covid-19/actueel
https://datadashboard.health.gov.il/COVID-19/general mutated-sars-cov-2-lineage-in-south-africa/

Korea Selatan: kasus

Jepang: 1 dari 2 kasus
pertama adalah
sudah vaksin Pfizer
pasangan yang sudah
dosis lengkap
divaksin dosis lengkap
BEST FOR You 9
O R G A N I C S C O M PA N Y
https://en.yna.co.kr/view/AEN20211204000851320 https://www3.nhk.or.jp/nhkworld/en/news/20211202_04/
 Dr. Angelique Coetzee, chair of the South African Medical Association, dan anggota
South Africa’s Ministerial Advisory Committee on Vaccines:

Menemukan gejala yang unik pada seorang pasien laki-laki dengan infeksi
Omicron:
 kelelahan/fatigue,
 sakit kepala,
 nyeri di seluruh tubuh (myalgia/artralgia)

» Istri dan anak pasien juga mengalami gejala serupa, dan beberapa pasien
lain (total 7 pasien)
» Berbeda dengan Delta:
 tidak ditemukan anosmia atau ageusia

BEST FOR You 10

O R G A N I C S C O M PA N Y
 Bahaya Varian Omicron
Menurut analisis UK Health Security Agency:

Penularan (confidence level: low)

• Tingkat penularannya setidaknya sama (dapat lebih tinggi) dengan varian yang sedang bersirkulasi
• Ada kemungkinan lebih tinggi karena memiliki mutasi di RBD, lokasi pemecahan furin (cleavage site), dan nukleokapsid,
yang secara in vitro dapat meningkatkan replikasi
• Berdasarkan modeling struktural, afinitas ikatan dengan ACE2 jauh lebih tinggi

Keparahan penyakit: belum ada data resmi

Imunitas (confidence level: low)

• Imunitas alami (penyintas): sugestif ada penurunan karena mutasi di semua 4 RBD neutralizing antibody binding site dan S
NTD antigenic site
• Analisis dari Afrika Selatan: ada penurunan perlindungan dari infeksi sebelumnya, termasuk infeksi Delta yang baru
• Imunitas oleh vaksin: sugestif ada penurunan karena ada mutasi di semua 4 RBD neutralizing antibody binding site
• Laporan kasus dari Israel, Korea Selatan, dan Jepang  penderita infeksi Omicron sudah vaksin lengkap (sebagian booster)

Terapi (confidence level: low)

• Berdasarkan modeling struktural, ada kemungkinan terdapat penurunan ikatan antibodi monoklonal terapeutik yang saat
ini ada BEST FOR You 11
O R G A N I C S C O M PA N Y
UK Health Security Agency. Risk assessment for SARS-CoV-2 variant: Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529). 3 Dec 2021
 Dampak terhadap Beberapa Parameter
Penularan
» Di Afrika Selatan terjadi lonjakan kasus positif yang signifikan,
tetapi masih diteliti apakah diakibatkan oleh Omicron atau
faktor lain
» Diduga varian Omicron lebih mudah menular antar manusia
Reinfeksi
» Beberapa bukti awal menunjukkan adanya kemungkinan
peningkatan risiko reinfeksi akibat varian Omicron, jika
dibandingkan dengan VOC lain
» Namun data masih terbatas dan belum dapat dipastikan
Vaksin
» Dampak potensial varian ini terhadap vaksin sedang diselidiki
» Meskipun demikian, berdasarkan data terhadap varian lain,
vaksin yang ada saat ini masih efektif dalam mencegah
penyakit yang berat dan kematian
https://www.who.int/news/item/28-11-2021-update-on-omicron
https://www.health.gov.au/news/health-alerts/novel-coronavirus-2019-ncov-health-alert/omicron-variant
Derajat Penyakit
» Belum diketahui apakah Omicron menyebabkan penyakit yang
lebih berat dibandingkan varian lain, termasuk Delta
» Data awal menunjukkan tingginya angka rawat inap di Afrika
Selatan, tetapi ini dapat disebabkan tingginya kasus saat ini
» Data awal Australia menunjukkan kecenderungan gejala ringan
Pemeriksaan Laboratorium
» PCR masih dapat mendeteksi infeksi akibat varian Omicron
» Masih perlu dipelajari apakah ada dampak varian Omicron
terhadap pemeriksaan lain, termasuk tes cepat antigen
Terapi
» Pengobatan yang efektif untuk pasien COVID-19 derajat berat
(kortikosteroid, anti IL-6) masih efektif
» Obat lain akan dikaji efektivitasnya terhadap varian Omicron
ini
BEST FOR You 12
O R G A N I C S C O M PA N Y
Langkah
Menghadapi
Omicron
Rekomendasi WHO
 Pencegahan terbaik adalah mencegah virus masuk ke tubuh

Ventilasi
Menggunakan Menjaga jarak
ruang
masker fisik
tertutup

Disertai
Menghindari Mencuci
pelacakan
kerumunan tangan
kontak
BEST FOR You 14
O R G A N I C S C O M PA N Y
WHO. Enhancing readiness for Omicron (B.1.1.529): technical brief and priority actions for member states. 28 Nov 2021 [updated 29 Nov 2021]
 Tindakan prioritas yang perlu diambil (rekomendasi WHO)

Meningkatkan surveilans
• Pelacakan, pemeriksaan, pelaporan

Meningkatkan pemeriksaan laboratorium

• Untuk wilayah yang bisa memeriksa gen S  lakukan WGS kepada COVID-19 positif dengan S negatif (SGTF)
• Bagi yang tidak bisa, direkomendasikan meningkatkan surveilans dan melakukan WGS
• Melakukan sampling retrospektif hingga Oktober 2021 dan sampling prospektif kepada pelaku perjalanan

Vaksinasi
• Meskipun belum ada data, tetapi kesimpulan terbaik saat ini adalah melanjutkan vaksin karena terbukti mengurangi risiko penyakit berat
dan kematian
• Meningkatkan cakupan vaksinasi

Membuat peraturan terkait perjalanan internasional berdasarkan risiko

Protokol kesehatan

Persiapan sistem layanan kesehatan

Komunikasi risiko dan pendekatan komunitas BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
15
WHO. Enhancing readiness for Omicron (B.1.1.529): technical brief and priority actions for member states. 28 Nov 2021 [updated 29 Nov 2021]
 Langkah prioritas yang diambil pemerintah

Berdasarkan rapat terbatas Menteri Kesehatan Republik Indonesia 1 Desember 2021:

1. Memperpanjang masa karantina bagi pelaku perjalanan luar negeri, dari yang
sebelumnya 7 hari menjadi 10 hari
• Khusus untuk yang melakukan perjalanan dari negara dengan transmisi komunitas varian
Omicron (dan negara yang berdekatan secara geografis), karantina selama 14 hari
2. Menyempurnakan metode testing:
• Sampling retrospektif: mengkaji data sekuensing dari sampel yang diambil sejak pertengahan Oktober
2021
• Menilai adanya SGTF pada sampel yang didapat sejak pertengahan Oktober 2021
• WGS untuk semua sampel dari pelaku perjalanan luar negeri yang masuk ke Indonesia dan terbukti
positif PCR
• Memperbaiki turn around time dari sekuensing
3. Meningkatkan cakupan vaksinasi, terutama kelompok prioritas (lansia, tenaga
kesehatan, dan kelompok berisiko tinggi mengalami COVID-19 berat)
BEST FOR You 16
O R G A N I C S C O M PA N Y
Menteri Kesehatan Republik Indonesia. Perkembangan Omicron – RATAS. 1 Dec 2021
 Perkembangan Covid-19 di Indonesia Saat ini

• Tren kasus COVID-19 di Indonesia sudah

menunjukkan penurunan dan sudah
melewati puncaknya di bulan juli 2021
• Jumlah kasus harian menurun 98% sejak Juli
2021
• Tren kasus harian sejak bulan September
terus menurun

• Pelonggaran PPKM di berbagai wilayah

(level 1)
• Mobilitas Masyarakat meningkat ( pada
PPKM level 1 di Jakarta menunjukan
mobilitas naik 5 x lipat )

BEST FOR You

sumber: covid.go.id O R G A N I C S C O M PA N Y
 SITUASI INDONESIA SAAT INI

Apakah kita boleh lengah?

» Potensi Ancaman Gelombang ke-3
• Capaian vaksin rendah (<50%)
• Relaksasi PPKM
• Kemampuan 3T yang bervariasi antar daerah
• Periode peningkatan mobilitas penduduk di
akhir tahun
• Pemberlakuan WFO dan sekolah offline
• Mutasi virus: varian baru

BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
Ancaman Gelombang Ketiga Covid-19 RI di Akhir Tahun (cnnindonesia.com)
Penyebaran subvarian AY.4.2
( turunan dari varian delta )

• AY 4.2 pertama kali

ditemukan di UK, dan
diperkirakan sudah
menyebar hingga Singapura
dan Malaysia.
• Diperkirakan memiliki
tingkat penularan yang
cukup tinggi, tingkat
mortalitas belum diketahui
• Diperkirakan 15% lebih
menular dibanding delta
Beberapa negara
tetangga mulai
menunjukkan
trend peningkatan
kasus mingguan
(Malaysia,
Vietnam)
Lonjakan Kasus terjadi di Berbagai Negara di Benua Eropa

BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
1. https://edition.cnn.com/videos/health/2021/11/23/who-hans-kluge-europe-
covid.cnn/video/playlists/amanpour/
2. https://www.dw.com/en/covid-germany-faces-national-emergency/a-59873728
BEST FOR You
O R G A N I C S C O M PA N Y
 Kemungkinan Penyebab Lonjakan Kasus di Eropa

Dr. Hans Kluge (WHO Europe Director) menganalisis

penyebab lonjakan kasus:
1. Hanya sekitar 48% penduduk yang mengenakan
masker di dalam ruangan  peraturan longgar  angka
sangat rendah
2. Vaksinasi masih belum merata

Selain itu, diperlukan Vaksin DAN

» Booster vaksin protokol kesehatan
» Meningkatkan ventilasi adalah kunci
» Memperbarui protokol tata laksana COVID-19
utama. Tidak dapat
berdiri sendiri
BEST FOR You
https://edition.cnn.com/videos/health/2021/11/23/who-hans-kluge-europe-covid.cnn/video/playlists/amanpour/
O R G A N I C S C O M PA N Y
 Mempersiapkan Infrastruktur untuk Antisipasi bila
terjadsi lonjakan kasus
● Kecukupan Bed Faskes
● SDM yang memadai
● Kecukupan Alat Kesehatan
● Alur pemeriksaan yang efisien
● Supply Obat

● Supply Oksigen

● Supply APD BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
Akankah Pandemi Teratasi dan
Berubah Menjadi Endemi?

Pilihan ada pada Kita

BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
Perbedaan Pandemi dan Endemi
Epidemi: Penyakit
Pandemi: Wabah yang menular yang berjangkit
berjangkit serempak di dengan cepat, meningkat
berbagai tempat meliputi secara tiba-tiba di suatu
area geografis yang luas populasi dan geografis
tertentu
BEST FOR You
O R G A N I C S C O M PA N Y
Endemi: Penyakit yang
berjangkit di suatu daerah
atau suatu golongan
masyarakat; biasa ada
pada suatu populasi atau
area geografis tertent
 Vaksinasi COVID-19 di Indonesia (per 04/12/2021)

https://covid19.go.id/berita/data-vaksinasi-covid-19-update-04-desember-2021

47,4%
68,2% dari
dari
target
target
BEST FOR You
O R G A N I C S C O M PA N Y
Apa yang Harus Kita Lakukan?

Membantu untuk
meningkatkan cakupan Jaga protokol Kesehatan
vaksinasi ( ajak teman dan terutama di keramaian
keluarga)
GELOMBANG
KETIGA DAPAT
DICEGAH
Jaga dan tingkatkan Jadilah agen edukasi untuk
imunitas keluarga dan lingkungan

BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y
Kesimpulan
» Walaupun telah mendapatkan vaksinasi,
namun protokol kesehatan tetap harus
dijalankan untuk mencegah penularan.
» Gaya hidup baru dengan menerapkan
penggunaan masker, mencuci tangan,
dan menjaga jarak akan menjadi norma
masyarakat untuk waktu yang lama,
bahkan bila kasus COVID-19 sudah
minim
» Apapun varian nya, protocol
kesehatannya sama saja

BEST FOR You

O R G A N I C S C O M PA N Y