Biosintesis Protein

melibatkan proses translasi

merupakan proses yang mengubah informasi genetic yang
terdapat pada mRNA menjadi polipeptida dengan urutan
asam amino tertentu
translasi melibatkan suatu
sistem
o yang membawa mRNA dan
tRNA bersama-sama
o mengkatalisis polimerisasi
asam amino - asam amino
menjadi polipeptida
Central dogma of
genetic
information flow

komponen yang terlibat:

o mRNA (messenger RNA)
o tRNA (transfer RNA)
o Ribosome
o Ensim2
Pesan yang ada pada mRNA selalu dibaca dengan arah 5 3
Rantai polipeptida yang dihasilkan berawal dari N terminal dan
berakhir dgn C (karboksi) terminal
Proses translasi terdiri dari :
o inisiasi
o elongasi

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

o terminasi
Messenger RNA (mRNA)
merupakan
RNAmenjadi
rantai tunggal yang berisi pesan yang akan
diterjemahkan
pada
organisme prokaryotic pesan untuk beberapa protein
protein
mungkin dibawa atau terdapat pada satu rantai mRNA :
polycistronic message
Hanya ada 4 macam nukleotida
(DNA/RNA) & ada 20 asam amino !!!

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

 setiap asam amino dikode oleh tiga nukleotida

43

ada 64 kombinasi berbeda

lebih dari cukup untuk mengkode 20 asam amino hampir

semua asam amino dikode oleh lebih dari 1 kodon
kodon urutan 3 nukleotida pada mRNA yang mencirikan
asam amino tertentu
hubungan antara kodon dengan asam amino yang dikode
kode genetic
anti kodon urutan 3 nukleotida yang terdapat pada tRNA
yang merupakan komplemen dari kodon
Pd prokaryotic simple dan tidak bersela
Pd eukaryotic ada proses yang diperlukan sebelum mRNA
siap diterjemahkan dalam proses translasi post translasi
o editing,
o splicing
o poli A tail

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

K
O
D
E

G
E
N
E
T
I
K

kode genetic hampir universal untuk semua organisme,

pengecualian ditemukan pada mitokondria dan protozoa
pengecualian yang sering ditemukan pada bbrp organisme UGA
STOP , mengkode Senelosistein
Wobble Hypothesis

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

Pada umumnya, setiap asam amino dispesifikasikan oleh dua

nukleotida yang pertama dari kodon
Example Proline mempunyai codon : CCValine mempunyai codon : GUJadi basa nitrogen yang ke-3 tidak tertentu
kondisi ini memungkin satu tRNA untuk mengenal lebih dari satu
kodon untuk asam amino yang sama
Basa nitrogen yang ke 3 disebut posisi Wobble
( karena ketidakpastian dalam complementary basa nitrogen antara
kodon mRNA dan anti kodon tRNA)

Wobble hipotesis juga untuk keberadaan inosine uncommon

nucleotide yang dapat berpasangan dengan A,U, atau C
Stop kodon UAA, UAG, UGA
Start kodon AUG
o Prokaryotic organism N-formylmethionine
o Eukaryotic organism methionine
TRANSFER RNA (tRNA)
Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

Ada 61 kodon yang mengkode 20 asam amino,

macam tRNA yg ada kurang dari <61 karena wobble hipotesis
tRNA dapat mengidentifikasi lebih dari 1 kodon
struktur tRNA seperti daun waru

Asam amino terikat dengan tRNA molekul dengan ikatan kovalen

antara gugus karboksil pada asam amino
gugus hidroksil pada 3 adenosine dari tangkai akseptor
tRNA
tRNA + asam amino teraminoasilasi

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

Aminoacyl-tRNA synthetase mampu mengidentifikasi asam amino

yang cocok

RIBOSOME
Ribosome terdiri dari multiple protein dan RNA.
Untuk prokaryotic 70s terdiri dari : 50s dan 30s
Untuk eukaryotic 80s terdiri dari 60s dan 40s

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

KECEPATAN TRANSLASI
Pada 37C, ribosome dari E. coli mampu mensintesis rantai
polipeptida yang terdiri dari 300 residu asam amino = 20 detik
Hampir sama dengan kecepatan dari transkripsi, sehingga mRNA
dapat ditranslasikan sama cepatnya dengan transkripsinya kadang
dalam 1 mRNA dapat ditranslasi oleh banyak ribosom
polyribosome

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

Post translasi
Sebelum polipeptida yang baru ditranslasi dapat aktif harus dilipat
membentuk konformasi 3D yang tepat
Folding dapat berlangsung bersamaan dengan proses translasi
Atau setelah proses translasi selesai
Salah satu contoh preproprotein preproinsulin

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

Metabolisme asam amino dan protein

TRN/2004

10