Translasi

Proses translasi terjadi ketika penerjemahan informasi genetik, mengikuti perintah

dari kode genetik kedalam urutan dari asam amino dalam produk gen polipeptida yang
kompleks, dan membutuhkan banyak makromolekul. Hal ini termasuk : (1) Lebih dari 50
polipeptida dan dari 3 sampai 5 molekul RNA hadir di setiap ribosom (2) Setidaknya 20 asam
amino mengaktifkan enzim (aminoacil dari sintesis tRNA). (3) Dari 40 sampai 60 molekul
tRNA yang berbeda (4) Dan setidaknya 9 protein larut terlibat dalam polipeptida rantai
inisiasi, elongasi, dan terminasi.
Proses penerjemahan terjadi pada ribosom, struktur makromolekul kompleks yang
terletak di sitoplasma. Proses perjemahan melibatkan tiga jenis RNA, yang semuanya
ditranskripsi dari DNA template. Selain mRNA 3-5 molekul RNA yang hadir sebagai bagian
dari struktur masing-masing ribosom dan molekul RNA kecil 40-60 berfungsi sebagai adapter
mediasi penggabungan asam amino yang tepat dalam menanggapi kodon spesifik di mRNA.
Ribosom digunakan untuk mensintesis setiap polipeptida spesifik oleh molekul mRNA
tertentu.

Pada penelitian awal digunakan pulse-labeling dan autoradiografi untuk mengetahui

protein yang disintesis sebagian besar berada di sitoplasma dalam jumlah kecil, tetapi
kompleks, struktur makromolekul disebut ribosom. Pada prokariotik, ribosom didistribusakan
keluar sel; sedangkan pada eukariotik mereka terletak di sitoplasma, seringkali pada jaringan
membran intraseluler disebut RE. Ribosom adalah setengah protein dan setengah RNA, yang
tersusun dalam subunit besar dan kecil, yang memisah ketika translasi dari molekul mRNA
selesai kemudian bergabung kembali ketika proses inisiasi dari translasi.
Ribosom E.coli seperti pada kebanyakan prokariotik, mempunyai berat molekul 2.7 x
6
10 dan ukuran dari 70S. Ribosom dari eukariotik lebih besar namun, ukurannya berbeda dari
spesies. Pada E.coli ribosom subunit kecil terdiri dari 16S molekul RNA + 21 polipeptida
berbeda dan subunit besar terdiri dari dua molekul RNA + 31 polipeptida. Dalam ribosom
eukariotik subunit kecil terdiri dari 18S molekul RNA dan subunit besar terdiri 5S, 5,8S, dan
28S molekul RNA. Ribosom Drosophila, tetapi tidak di beberapa eukariotik diuji juga
muncul beberapa molekul kecil RNA 2S. Dalam organel, ukuran rRNA sesuai 5S, 13S, 21S.
Dalam kasus E. coli, M. Nomura dan kolega telah selesai memisahkan 30S sub unit ribosom
ke dalam makromolekul induvidu dan menyusun kembali sub unit fungsional 30S dari
komponen komponen. Hal ini telah disetujui untuk mempelajari fungsi dari setiap induvidu
RNA dan molekul protein.

Molekul RNA ribosom yang ditranskipsi dari DNA template seperti molekul mRNA.
Sintesis rRNA pada eukariotik terjadi dalam nukleolus dan dikatalis oleh RNA polimerase
khusus yang ada didalam nukleolus. Transkripsi dari rRNA juga dapat memproduksi
precursor rRNA yang lebih besar daripada molekul RNA di ribosom. Precursor rRNA akan
mengalami proses post-transkripsional untuk memproduksi molekul rRNA dalam proses
translasi. Transkripsi pada E. coli gen rRNA meggunakan precursor 30S yang mengalami
pembelahan oleh endoribonuklease memproduksi 5S, 16S, 23S, rRNA + 4S transfer molekul
RNA.

Pada prokariotik 2S, 5.8S, 18S, dan 28S rRNA dipotong dari precursor 40-45S,
sedangkan 5S rRNA diproduksi oleh proses post-transkripsional dari transkripsi gen yang
terpisah. Pembelahan post-transkripsional dari precursor rRNA metilasi post-transkripsional
dari banyak nukleotida terjadi dalam rRNA. Metilasi bertugas untuk melindungi rRNA dari
ribonuklease intraseluler yang termasuk degradasi mRNA; namun, fungsi ini belum jelas.

Pada eukariotik 5.8S, 18S, dan 28S rRNA disalin bersama duplikasinya nulear
organizer daerah kromosom. Gen rRNA 5s pada eukariotik didistribusikan dari beberapa
kromos. Ribosom yang berfungsi dalam pembentukan sintesis protein, tetapi spesifikasi dari
masing-masing polipeptida ditulis dalam molekul mRNA, translasi dari kode pesan mRNA ke
sekuen asam amino dalam polipeptida membutuhkan satu tambahan molekul tRNA.
Tahun 1958 Crick mengemukakan bahwa molekul adapter bertindak sebagai kodon
pengenal asam amino selama sintesis protein. Molekul adapter kemudian di indentifaksi dan
ditemukan menjadi molekul RNA kecil, yang disebut soluble RNA molekul atau sRNA dan
berikutnya molekul tRNA terdiri dari sekuens dasar triplet yang disebut anticodon, yang
melengkapi dan dikenali sekuens kodon dalam mRNA selama proses translasi. Ada 1-4 tRNA
yang diketahui untuk masing masing asam amino terbentuk dengan dikatalisasi melalui
"pengaktifan enzim" atau amynoacyl-tRNA sintetase menggunakan energi dari adenosine
triphosphate (ATP):

Asam amino-AMP menengah biasanya tidak dilepaskan dari enzim sebelum

menjalani langkah kedua dalam amynoacyl-tRNA sintesis, yaitu reaksi dengan tRNA yang
sesuai :

Aminoasil-tRNA (asam amino-tRNA) merupakan prekursor yang disintesis

polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing tRNA yang diaktifkan kodon mRNA dan
penyajian asam amino dalam pembentukan ikatan peptida. tRNA ditranskripsi dari gen
kromosom. Molekul-molekul tRNA mengandung beberapa nukleosida tidak hadir dalam
mRNA atau dalam tRNA transkripsi. Gen nukleosida primer terdapat inosin, pseudouridine,
dihydrouridine, 1-methylguanosine dan posttranscriptionall, modifikasi enzim-katalis dari
empat nukleosida dimasukkan ke dalam RNA selama transkripsi.
Setiap ribosom memiliki dua situs pengikatan tRNA. A atau
amynoacyl yang mengikat aminoasil-tRNA, tRNA
membawa asam amino kemudian akan ditambahkan
ke rantai polipeptida yang sedang tumbuh. P atau
peptidil yang mengikat tRNA mejadi
polipeptida. Kekhususan untuk aminoasil - tRNA
mengikat dalam situs ini disediakan oleh kodon
mRNA yang membentuk ikatan A dan P. Molekul
tRNA mengandung banyak kekhususan meskipun
ukurannya yang kecil, yaitu (1) memiliki urutan
antikodon yang benar, sehingga dapat merespon kodon yang tepat (2)
diakui oleh sintetase tRNA aminoacyl- dengan benar,
sehingga dapat diaktifkan dengan asam amino yang tepat,
dan (3) mengikat ke situs A dan P di ribosom.
Sintesis protein dimulai oleh tRNA inisiator khusus, ditunjuk tRNAMet, sehingga
sintesis polipeptida dimulai dengan metionin. Amino-terminal metionin selanjutnya dibelah
dari banyak polipeptida. Dengan demikian, protein fungsional tidak perlu memiliki metionin
amino-terminal. tRNAMet yang merespon kodon metionin internal ada di kedua sistem
prokariotik dan eukariotik, baik tRNA metionin memiliki antikodon yang sama dan keduanya
menanggapi kodon yang sama (AUG) untuk metionin. Pada prokariota, gugus amino
formylated pada tRNAMet methionyl- mencegah pembentukan ikatan peptida antara gugus
amino dan gugus karboksil dari asam amino pada akhir rantai polipeptida yang sedang
tumbuh.
Pada eukariota, bagaimanapun, gugus amino dari dari methionyl- tRNA Met tidak
diblokir. Methionyl- tRNAMet akan bereaksi dengan faktor inisiasi protein, IF-1, IF-2, dan IF-
3, dan hanya methionyl- tRNAMet akan berinteraksi dengan faktor elongasi protein, Ts-upaya-
upaya dan Ts. Methionyl-tRNAMet merespon AUG dalam inisiasi kodon dan hanya methionyl-
tRNA Met yang menanggapi inisiator kodon alternatif, GUG (kodon valin ketika hadir pada
posisi internal). Pada prokariota, inisiasi rantai polipeptida terjadi dengan pembentukan
kompleks antara mRNA, menthionyl tRNAff Met, dan 30S ribosom subunit. pembentukan
kompleks inisiasi ini memerlukan aktivitas faktor inisiasi tiga protein, yang ditunjuk IF-1, IF-
2, IF-3, ditambah guanosin trifosfat (GTP). Ini dapat difasilitasi oleh interaksi dasar pasangan
antara urutan basa dekat ujung 3 'dari 16S rRNA dan urutan basa dalam "urutan pemimpin"
dari mRNA.

Inisiasi kompleks maka menggabungkan dengan 50S ribosom subunit, dan methionyl
yang l tRNAff Met, menjadi terikat ke tempat peptidil. Hal ini memerlukan hidrolisis satu
molekul GTP. Keselarasan dari inisiasi AUG kodon dengan antikodon tRNAf f Met, perbaikan
kodon hadir di lokasi A, sehingga membentuk kekhususan untuk aminoasil-tRNA mengikat
di lokasi A, pengikatan alanyl-tRNAala di situs A membutuhkan hidrolisis dari satu molekul
GTP dan faktor elongasi protein ditunjuk EF-Ts dan EF-Tu. Pembentukan ikatan peptida
antara gugus karboksil dari f-metionin terikat pada tRNAf f Met, di tempat P dan gugus amino
dari molekul alanin terikat tRNA ala di situs A kemudian dikatalisis oleh peptidil transferase,
suatu enzim yang terikat pada subunit ribosom 50S . Reaksi ini meninggalkan-f bertemu-ala
dipeptida melekat tRNAala terikat ke situs A ribosom.

Langkah selanjutnya dalam terjemahan, yang disebut translokasi melibatkan (1)

gerakan-f bertemu- tRNA ala dari situs A ke situs P dan (2) pergerakan molekul mRNA tepat
tiga nukleotida, relatif terhadap posisi ribosom , sehingga kodon sebelumnya dalam register
dengan situs A bergerak ke dalam register dengan situs P. tRNA aminoacyl- berikutnya
ditentukan oleh kodon mRNA di situs A kemudian mengikat di lokasi A, dan pembentukan
ikatan peptida dan translokasi langkah yang berulang. Urutan hanya dijelaskan diulang untuk
setiap kodon mRNA sampai kodon terminasi rantai tercapai. Kelompok formil pada metionin
amino-terminal biasanya dihapus oleh deformylase sebelum sintesis polipeptida selesai.

Ketika salah satu dari kodon terminasi rantai tiga polipeptida (UAG, UAA, atau
UGA) datang ke dalam register dengan situs A, polipeptida baru lahir, tRNA terletak P, dan
mRNA dilepaskan, dan subunit ribosom berdisosiasi. Pemutusan membutuhkan aktivitas
salah satu dari dua faktor rilis protein, RF1 ditunjuk DAN RF2, subunit ribosom dipisahkan
kemudian bebas untuk memulai terjemahan molekul mRNA lain.
 Dari pada setiap molekul mRNA diterjemahkan oleh ribosom tunggal, kebanyakan
mRNA secara simultan diterjemahkan oleh beberapa ribosom, berjarak sekitar 90 nukleotida
terpisah di sepanjang molekul mRNA. Ukuran kompleks ini terjemahan, yang disebut
polyribosomes atau polysomes, sangat bervariasi tetapi berkorelasi dengan ukuran
polipeptida yang disintesis. Rantai hemoglobin, misalnya, disintesis pada polyribosome.
 PERTANYAAN

1. Apakah fungsi dari molekul adapter pada pernyataan Crick?

Molekul adapter bertindak sebagai kodon pengenal asam amino selama sintesis protein,
kemudian molekul ini di indentifaksi dan ditemukan menjadi molekul RNA kecil, yang
disebut soluble RNA molekul atau sRNA dan berikutnya molekul tRNA terdiri dari
sekuens dasar triplet yang disebut anticodon, yang melengkapi dan dikenali sekuens kodon
dalam mRNA selama proses translasi.

2. Mengapa sintesis protein melalui ribosom pada sel eukariotik dan prokariotik berbeda?
Karena ribosom adalah setengah protein dan setengah RNA, yang tersusun dalam subunit
besar dan kecil, yang memisah ketika translasi dari molekul mRNA selesai kemudian
bergabung kembali ketika proses inisiasi dari translasi. Pada prokariotik, ribosom
didistribusakan keluar sel; sedangkan pada eukariotik mereka terletak di sitoplasma.