MUHAMMAD FAJAR
Muhammad Fajar
NIM B04100164
ABSTRAK
MUHAMMAD FAJAR. Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Kloaka Imago
Betina Ulat Sutera Liar Attacus atlas L. (Lepidoptera: Saturniidae). Dibimbing
oleh USAMAH AFIFF dan DAMIANA RITA EKASTUTI.
ABSTRACT
This study aimed to identify bacteria in the cloaca of wild silkworms Attacus
atlas using common methods. Samples that have been prepared are taken using
the ose and planted into the blood agar and MacConkey Agar (MCA) with T
streaking. Each form colonies growing on blood agar and MCA were subculture
onto trypticase soy agar (TSA). Identification of bacteria used media
identification i.e. indole, Simmon's citrate Agar, TSIA, Oxidase, Urea, Voges
proskauer (VP) and broth of karbohidrat (glucose, sucrose, maltose, manitol and
lactose). The results showed that on the imagoes there were 3 genera of bacteria
such as Bacillus sp., Aeromonas sp., and Pseudomonas sp..
MUHAMMAD FAJAR
Skripsi
sebagai salah satu syarat memperoleh Gelar
Sarjana Kedokteran Hewan pada
Fakultas Kedokteran Hewan
Institut Pertanian Bogor
Disetujui oleh
Drh Usamah Afiff, MSc Dr Drh Damiana Rita Ekastuti, MS, AIF
Pembimbing I Pembimbing II
Tanggal Lulus:
.1 4 JAN 2015
PRAKATA
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah subhanahu wa ta’ala atas
segala karunia-Nya sehingga karya ilmiah ini berhasil diselesaikan. Tema yang
dipilih dalam penelitian yang dilaksanakan sejak bulan Januari 2014 ini ialah
identifikasi bakteri, dengan judul Identifikasi Bakteri pada Kloaka Imago betina
Ulat Sutera Liar Attacus atlasL.(Lepidoptera : Saturniidae).
Ungkapan terima kasih penulis sampaikan teruntuk Bapak Syahruddin dan
Mama Nurrahmah atas doa yang tak henti mengalir serta teruntuk Fauzan, Faisal,
Om Hadi dan Acil Maris yang senantiasa memberi dukungan. Terima kasih
penulis ucapkan pula kepada Bapak Drh Usamah Afiff, MSc dan Ibu Dr Drh
Damiana Rita Ekastuti MS. AIF selaku pembimbing. Di samping itu, penghargaan
penulis sampaikan kepada Bapak Nursam dari perkebunan teh PTPN VIII
Panleujar kabupaten Purwakarta provinsi Jawa Barat, yang telah membantu
selama pengumpulan bahan penelitian Serta, Pak Ismed yang membantu dalam
menyiapkan bahan penelitian. Selain itu, penulis juga mengucapkan terimakasih
kepada sahabat yang selalu mendukung saya yakni Hairiah Latief, Bagus
Satriawan, Marwani Dianty, Diana Asriastita, Haryati Istiqomah, Windy Alvianty
serta sahabat lemes yakni Mas Abid, Mbak Intan, Gambreng, Tri, Dince, Novan
dan Kukuh serta kepada Rahmad Arsy dan Andra sebagai sahabat seperjuangan
dalam penelitian yang penulis jalani. Tak lupa teruntuk Deviana Novitasari yang
selalu membantu dan mendoakan penulis selama ini.
Semoga karya ilmiah ini bermanfaat.
Muhammad Fajar
DAFTAR ISI
PENDAHULUAN
Latar Belakang 1
Tujuan Penelitian 1
Manfaat Penelitian 1
TINJAUAN PUSTAKA
Taksonomi Ulat Sutera Liar (Attacus atlas) 2
Bakteri 3
Bakteri pada Ulat Sutera Bombyx mori 4
MATERI DAN METODE
Lokasi dan Waktu Penelitian 4
Bahan dan Alat 4
Prosedur Penelitian 5
Identifikasi Bakteri 7
Analisis Data 7
HASIL DAN PEMBAHASAN
Isolasi Bakteri 8
Pewarnaan Gram 10
Identifikasi Bakteri 11
SIMPULAN DAN SARAN
Simpulan 14
Saran 14
DAFTAR PUSTAKA 14
DAFTAR TABEL
1 Identifikasi bakteri pada ulat sutera B. mori yang sakit 4
2 Hasil pengamatan morfologi koloni yang tumbuh pada media Agar
darah 8
3 Hasil pengamatan morfologi koloni yang tumbuh pada media Mac
Conkey Agar (MCA) 8
4 Hasil pengamatan morfologi koloni dari agar darah ke trypticase soy
agar (TSA) 9
5 Hasil pengamatan morfologi koloni dari macconkey agar (MCA)
ketrypticase soy agar (TSA) 9
6 Hasil pengamatan mikroskopis pada koloni yang berasal dari agar darah 10
7 Hasil pengamatan mikroskopis pada koloni yang berasal dari MCA 10
8 Hasil uji Indol, TSIA, Oksidase, Urea, Sitrat dan VP 11
9 Hasil uji kaldu gula-gula 12
DAFTAR GAMBAR
1 Siklus hidup Attacus atlas 2
2 Diagram alir identifikasi bakteri Gram positif 6
3 Diagram alir identifikasi bakteri Gram negatif 7
4 Koloni β hemolitik pada media Agar darah 8
5 Koloni yang terbentuk pada media MCA 9
6 Uji Oksidase 12
7 Uji TSIA 12
8 Uji Urea 13
9 Uji Indol 13
10 Uji Sitrat 14
11 Uji VP 14
12 Uji Gula-gula 15
13 Aeromonas sp., pewarnaan Gram, perbesaran objektif 100x 16
1
PENDAHULUAN
Latar Belakang
Indonesia merupakan negara yang diapit oleh dua benua yakni benua Asia
dan Australia serta diantara 2 samudra yakni Samudera Pasifik dan Hindia. Selain
itu, Indonesia juga terletak pada 60 LU, 110 LS, 97-1410 BT. Indonesia menjadi
negara yang berbasis pertanian karena letak yang sangat strategis dan memiliki
kesuburan tanah yang tinggi. Selain itu, lingkungan tropis membuat banyak flora
dan fauna dapat hidup dengan baik di Indonesia. Salah satu hasil pertanian yang
memiliki nilai jual tinggi adalah sutera. Menurut Riskomar (2000), permintaan
dan harga sutera yang berasal dari ulat sutera liar lebih tinggi dibandingkan sutera
biasa. Hal ini karena memiliki warna benang sutera yang menarik yaitu cokelat
keemasan, lebih mengkilat, dan harga jual kokon yang tinggi (Rianto 2009). Salah
satu ulat sutera liar yang mulai banyak dibudidayakan adalah Attacus atlas (A.
atlas).
Keindahan serta keunggulan yang dimiliki sutera yang berasal dari Attacus
atlas menyebabkan permintaan terhadap sutera tersebut cukup tinggi sehingga
kebutuhan kokon pun menjadi ikut meningkat sedangkan produksi kokon belum
banyak. Saat ini kebanyakan kokon A. atlas diambil dari alam, jika hal ini di
lakukan terus menerus akan menyebabkan kelangkaan ulat sutera liar A. atlas. Di
alam tingkat keberhasilan budidaya A. atlas masih rendah. Hal ini dikarenakan
perubahan lingkungan yang tidak menentu (anomali cuaca) serta pengaruh
predator, parasite,dan faktor penyebab lainnya (Rianto 2009), sehingga diperlukan
pembudidayaan yang tepat agar kelangkaan tersebut dapat dihindari dan dapat
meningkatkan nilai ekonomi.
Dewasa ini banyak penyakit dari hewan liar yang muncul dan menjadi
outbreak di dunia seperti Middle East Respiratory Syndrome (MERS), ebola, dan
Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). Hal ini harus diwaspadai
keberadaannya karena ditakutkan zoonosis ke manusia dan hewan lainnya. Oleh
karena itu, perlu dilakukan pengamatan keberadaan bakteri pada A. atlas agar
dapat diketahui jenis bakteri dan sifatnya sehingga dapat dilakukan pencegahan
penularan ke manusia atau ke hewan lainnya.Kloaka merupakan salah satu bagian
tubuh yang penting karena dalam reproduksi A. atlas kloaka akan menjadi saluran
utama untuk mengeluarkan telur, apabila kloaka terkontaminasi maka akan ikut
mengkontaminasi telur tersebut. Telur yang terkontaminasi akan mempengaruhi
perkembangan telur selanjutnya dan dapat membahayakan pembudidayanya.
Tujuan Penelitian
Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui bakteri yang terdapat dalam
kloakaimago betina ulat sutera liar Attacus atlas.
2
Manfaat Penelitian
TINJAUAN PUSTAKA
Filum : Arthropoda
Kelas : Insecta
Ordo : Lepidoptera
Famili : Saturniidae
Genus : Attacus
Spesies : Attacus atlas
Bakteri
Bakteri berkembang biak dengan membelah diri dan hanya dapat dilihat
menggunakan mikroskop. Bakteri mempunyai beberapa organel yang dapat
melaksanakan beberapa fungsi hidup (Waluyo 2004).Spesies bakteri dapat
dibedakan berdasarkan morfologi (bentuk), komposisi kimia (umumnya dideteksi
dengan reaksi biokimia), kebutuhan nutrisi, aktivitas biokimia, dan sumber energi
(sinar matahari atau bahan kimia) (Pratiwi 2008).
Dinding sel bakteri yang kaku dapat mempertahankan bentuknya dan
melindungi sel dari perubahan tekanan osmotik antara sel dengan lingkungannya.
Dinding sel bakteri Gram positif memiliki lapisan peptidoglikan yang tebal dan
membran sel, sementara dinding sel bakteri Gram negatif memiliki tiga lapisan:
membran dalam, membran luar dan lapisan peptidoglikan yang lebih tipis. Bakteri
merupakan organisme prokariot yaitu memiliki kromosom tunggal dan tidak
memiliki nukleus. Untuk mengemas kromosom di dalam sel, DNA menggulung
(coil dan supercoil); suatu proses yang diperantarai oleh sistem enzim DNA girase.
Ribosom bakteri berbeda dengan ribosom eukariot, menjadikannya target untuk
terapi antibakteri. Bakteri juga mengandung DNA tambahan dalam bentuk
plasmid (Gillespie 2008).
Menurut Gillespie (2008) bakteri diklasifikasikan berdasarkan bentuknya:
kokus berbentuk sferis, bacillus berbentuk panjang dan tipis, dengan kokobasilus
diantara bentuk keduanya dan ada juga bacillus berbentuk melengkung dan spiral
dengan panjang lengkungan yang berbeda. Menurut Pratiwi (2008) bentuk-bentuk
bakteri yaitu bulat (tunggal: coccus, jamak: cocci), batang atau silinder (tunggal:
bacillus, jamak: bacilli), dan spiral yaitu berbentuk batang melengkung atau
melingkar-lingkar.
Kokus Gram positif dibagi menjadi dua kelompok utama: stafilokokus
(katalase positif), contoh patogen utamanya yaitu Staphylococcus aureus dan
Streptokokus (katalase negatif), contoh patogen utamanya yaitu Streptococcus
pyrogenes. Kokus Gram negatif meliputi Neisseria meningitides, sedangkan
Kokobasilus Gram negatif meliputi patogen saluran nafas Haemophilus dan
Bordetella, agen zoonotik seperti Brucella dan Pasteurella (Gillespie 2008).
Bacillus Gram positif dibagi menjadi bacillus yang membentuk spora dan
bacillus yang tidak membentuk spora. Kelompok yang membentuk spora dibagi
menjadi organisme aerob (Bacillus) dan organisme anaerob (Clostridium).
Bacillus bakteri Gram negatif meliputi keluarga bakteri fakultatif
Enterobacteriaceae yang merupakan bagian dari flora normal pada manusia dan
4
hewan dan dapat ditemukan di lingkungan. Termasuk dalam kelompok ini yaitu
Salmonella, Shigella, Escherichia, Proteus danYersinia (Gillespie 2008).
Tabel 1. Identifikasi bakteri pada ulat sutera Bombyx mori yang sakit (Sakthivel et
al. 2012)
No Bakteri
1 Bacillus subtilis
2 Streptococcus pneumoniae
3 Staphylococcus aureus
4 Escherichia coli
5 Pseudomonas fluorescence
6 Bacillus cereus
7 Klebsiella cloacae
Bombyx mori merupakan salah satu jenis ulat sutera yang juga
memberikan keuntungan ekonomis karena mampu menghasilkan benang
sutera. Ulat sutera memiliki bentuk tubuh yang berwarna putih. Ulat sutera dapat
melakukan molting (berganti kulit) pada saat memasuki instar baru. Larva ulat
sutera mempunyai tanduk anal yang pendek dan memakan daun murbei (Morus
sp.) (Borror 1992).
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari 2014 sampai dengan Oktober
2014. Pemeliharaan ulat sutera liar Attacus atlas dilaksanakan di Laboratorium
Metabolisme Bagian Fisiologi Departemen Anatomi Fisiologi dan Farmakologi
Fakultas Kedokteran Hewan Institut Pertanian Bogor. Pengamatan dan
identifikasi bakteri dilaksanakan di Laboratorium Bakteriologi Bagian
Mikrobiologi Medis Departemen Ilmu Penyakit Hewan dan Kesehatan
Masyarakat Veteriner Fakultas Kedokteran Hewan Institut Pertanian Bogor.
Bahan yang digunakan pada penelitian ini adalah imago ulat sutera liar
Attacus atlas sejumlah 5 ekor, akuades steril, media untuk mengisolasi bakteri
5
yakni agar darah, MacConkey Agar (MCA) dan trypticase soy agar (TSA). Media
untuk mengidentifikasi bakteri yakni Indol, Triple Sugar Iron Agar (TSIA),
Oksidase, Urea, Simmon’s citrate Agar, Voges-proskauer (VP) dan kaldu gula-
gula (glukosa, sukrosa, manitol, maltosa, dan laktosa). Bahan-bahan untuk
pewarnaan Gram yakni kristal violet, lugol, aseton alkohol, safranin, dan alkohol
70%.
Alat yang digunakan pada penelitian kali ini adalah kandang kasa berukuran
50 cm x 50 cm x 50 cm, alat bedah minor seperti pinset, gunting dan scalpel, ose,
needel, korek api, cawan petri, pipet, mikropipet, pembakar bunsen, inkubator,
tabung reaksi, botol kaca 5 ml, tabung evendorf, mikroskop cahaya, pensil, kertas
label, lemari pendingin dan kamera.
Prosedur Penelitian
Pengambilan kloaka
Sampel diambil dari 5 ekor imago betina A. atlas. Imago betina A. atlas
dimasukkan ke dalam freezer selama 60 menit agar imago mati. Dilakukan
nekropsi pada imago menggunakan alat bedah minor yang sebelumnya telah
disterilkan. Pengambilan kloaka dilakukan menggunakan pinset steril lalu
dimasukkan ke dalam botol kaca yang berisi aquades steril 2 ml.
Isolasi bakteri
Sampel yang telah disiapkan diambil menggunakan ose dan dibiakkan ke
dalam agar darah dan MacConkey Agar (MCA) dengan tehnik goresan T. Agar
yang telah diinokulasi dengan sampel dimasukkan ke dalam inkubator selama 24
jam dengan suhu 370C. Setelah itu, koloni yang tumbuh dilakukan pengamatan
dan pencatatan koloninya. Setiap bentuk koloni berbeda yang terpisah dibiakkan
kembali ke agar miring trypticase soy agar (TSA) dan diberikan label agar tidak
terjadi kekeliruan. Agar miring yang telah dibiakkan dimasukkan ke dalam
inkubator selama 24 jam dengan suhu 370C.
Pewarnaan Gram
Koloni yang tumbuh pada media agar miring diwarnai dengan pewarnaan
Gram untuk melihat morfologi, sifat Gram, dan kemurniannya. Kaca objek
dibersihkan menggunakan alkohol kemudian dikeringkan dengan cara didekatkan
api bunsen. Kemudian, kaca objek ditetesi dengan aquades diatasnya. Ose dibakar
terlebih dahulu sampai berwarna merah, didinginkan sejenak lalu masukkan
kedalam tabung kaca berisi isolat bakteri kemudian tempelkan ose ke aquades
pada kaca objek. Aquades dihomogenkan perlahan dengan cara membentuk
lingkaran biarkan sejenak kemudian difiksasi dengan api bunsen dan diletakkan di
6
atas rak kaca objek. Ditetesi kristal violet dan didiamkan selama satu menit.
Dicuci dengan aquades. Ditetesi lagi dengan lugol pada kaca objek dan didiamkan
selama satu menit dan dicuci dengan aquades. Kemudian, ditetesi dengan larutan
pemucat (aseton alkohol)selama 10 detik, kemudian dicuci lagi dengan aquades.
Terakhir, ditetesi dengan safranin selama 10-20 detik lalu dicuci dengan aquades
hingga bersih. Dikeringkan kaca objek dengan kertas saring lalu diamati di bawah
mikroskop dengan perbesaran 1000x dengan bantuan minyak emersi dan
ditentukan sifat Gramnya. Bakteri Gram positif akan berwarna ungu sedangkan
bakteri Gram negatif akan terlihat berwarna merah. Jika koloni bakteri yang
terlihat belum murni, maka dilakukan kembali isolasi pada agar darah maupun
MCA dengan goresan T. Apabila hasil dari pewarnaan Gram tidak meyakinkan,
dapat dilakukan Uji KOH 3% untuk menentukan sifat Gramnya. Jika pada hasil
uji terlihat massa gelatin berupa benang-benang halus ketika diangkat
menggunakan ose artinya sampel merupakan bakteri Gram negatif. Identifikasi
Gram positif dan Gram negatif dapat dilihat dari Gambar 2 dan Gambar 3.
Bakteri
Gram
positif
kokus Batang
Katalase Katalase
Negatif positif
Streptoc Microco
occus sp. ccaceae
Uji
α-hemolitik β-hemolitik γ-hemolitik Glukosa
Mikroaer
olitik
(+) (-)
Tanam ke
MSA Micrococcaceae
Anaaero
Merah Aerob
kuning
(tidak
b
(fermentasi)
fermentasi
Batang Batang Clostridium
Stapylococcus kecil tidak besar
aureus membent memben
Staphylococcus
uk spora tuk spora
epidermidis
Bacillus
Tidak
Tahan
tahan
asam
asam
Mycobacterium Listeris
Erysopelothrix
Corynebacteriu
m
Lactobacillus
Gambar 2 Diagram identifikasi bakteri Gram positif (Bergey dan Breed 1994; Lay 1994)
7
Bakteri Gram
Negatif
Batang Kokus
Uji oksidase
Nonenterobakteriaceaae Enterobakteriaceae
Pewarnaan Zielhl
MacConkey Agar
Neelsen
Pseudomonas
Aeromonas Laktosa
Laktosa positif
Vibrio Negatif
TSIA
Indol
Sitrat
MRVP
Fermentasi Karbohidrat
Gambar 3 Diagram identifikasi bakteri Gram negatif (Bergey dan Breed 1994; Lay 1994)
Identifikasi bakteri
Isolat dikeluarkan dari lemari pendingin dan dihangatkan dulu dalam
inkubator selama beberapa menit. Ose dibakar terlebih dahulu pada api bunsen
sampai terlihat merah, didinginkan beberapa saat lalu disentuhkan dengan isolat
yang telah disiapkan kemudian ditanam ke setiap media identifikasi seperti indol,
tripel sugar iron agar (TSIA), oksidase, urea, Simmon’s citrate agar, voges-
proskauer (VP) serta kaldu gula-gula yang terdiri atas glukosa, sukrosa, manitol,
maltosa dan laktosa Setelah itu, dimasukkan ke dalam inkubator selama 24 jam
pada suhu 370C.
Analisis Data
Analisis data menggunakan metode deskripsi.
8
Isolasi Bakteri
Sampel ditanam ke dalam media agar darah atau Blood agar (BA) dan
MacConkeyAgar (MCA) dengan goresan T dan dimasukkan ke dalam inkubator
selama 24 jam dengan suhu 370C. Setelah inokulasi, dilakukan pengamatan
makroskopik pada Agar darah dan MCA dari 5 sampel yang digunakan. Hasilnya
terdapat beberapa koloni berbeda dari setiap sampel yang disajikan pada Tabel 2
dan Tabel 3.
Tabel 2 Hasil pengamatan morfologi koloni yang tumbuh pada media Agar darah
Parameter Agar Darah
A.1 B.1 B.2 C.1 C.2 D.1 D.2 E.1 E.2
Ukuran Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang
Bentuk Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat
Permukaa Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak
n halus halus halus halus halus halus halus halus halus
Aspek Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak Tidak
mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil
at at at at at at at at at
Tepi Tepi Tepi rata Tepi Tepi rata Tepi Tepi rata Tepi Tepi rata Tepi
kasar kasar kasar kasar kasar
Elevasi Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun
g g g g g g g g g
Warna Krem Krem Krem Krem Krem Krem Krem Krem Krem
Hemolisis β - β - β - β - β
Tabel 3 Hasil pengamatan morfologi koloni yang tumbuh pada media Mac ConkeyAgar
(MCA)
Parameter MCA
A.1 B.1 C.1 C.2 C.3 D.1 D.2 E.1 E.2
Ukuran Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang Sedang
Bentuk Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat Bulat
Permukaa halus halus halus halus halus halus halus halus halus
n
Aspek mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil mengkil
at at at at at at at at at
Tepi Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata Tepi rata
Elevasi Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun Cembun
g g g g g g g g g
Warna Pink Pink Merah Pink Putih Merah Pink Merah Pink
(Tepi (Tepi (Tepi (Tepi (Tepi
Putih) Putih) Putih) Putih) Putih)
Hemolisis - - - - - - - - -
Inokulasi pada media MCA terdapat beberapa koloni yang berbeda. Pada
sampel 1 dan 2 hanya terdapat 1 koloni. Sampel 3 terdapat 3 koloni dengan
perbedaan parameter warna koloni yaitu merah, pinkdengan tepi putih dan putih.
Sampel 4 dan 5 terdapat 2 koloni berbeda dengan perbedaan parameter warna
yaitu merah dan pink dengan tepi putih.
Setiap koloni yang tumbuh pada media agar darah maupun MCA di
biakkan kembali ke agar miring TSA sebagai biakan murni isolat. Agar miring
yang telah diinokulasi dimasukkan kedalam inkubator selama 24 jam pada suhu
37°C. TSAberfungsi sebagai salah satu media yang umum digunakan dalam
prosedur bakteriologi seperti untuk pertumbuhan sampel pada uji bakteri, dan
untuk mengisolasi organisme dalam kultur murni(Dwidjoseputro 1994). Lay
(1994) menyatakan bahwa biakkan murni merupakan biakan yang hanya
mengandung satu jenis bakteri.Hasil pengamatan makroskopis disajikan pada
Tabel 4 dan Tabel 5. Untuk mengetahui kemurnian yang dari isolat yang ditanam
pada TSA dilakukan pengamatan secara makroskopis pada sifat pertumbuhannya
dan pengamatan secara makroskopis.
10
Penanaman koloni ke media agar miring TSA baik dari koloni agar darah
maupun dari MCA menghasilkan pertumbuhan yang subur dan seragam.
Pewarnaan Gram
Koloni yang telah tumbuh pada media agar miring dilakukan pewarnaan
Gram untuk melihat bentuk, susunan dan sifat Gram. Pewarnaan Gram dilakukan
pada setiap koloni dan diamati dibawah mikroskop dengan perbesaran 100x.
Bakteri Gram positif akan terlihat berwarna ungu sedangkan bakteri Gram negatif
berwarna merah (Lay 1994). Hasil pengamatan mikroskopis pada setiap koloni
dengan pewarnaan Gram disajikan pada Tabel 6.
Tabel 6 Hasil pengamatan mikroskopis pada koloni yang berasal dari agar darah
Morfologi BA
Koloni A.1 B.1 B.2 C.1 C.2 D.1 D.2 E.1 E.2
Bentuk Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang
Halus Halus
Susunan Tunggal Berantai Berantai Berantai Berantai Berantai Berantai Tunggal Berantai
Gram Negatif Positif Positif Positif Positif Positif Positif Negatif Positif
Spora + + + + + + +
dapat dijumpai di tanah dan di air. Pada penelitian Anand et al. (2010), Bacillus
sp. di temukan pada larva instar ke lima dan merupakan flora normal pada
Bombyx mori. Bakteri yang terdapat pada tahap larva ini diduga bertahan dan
menyebar dalam tubuh A. atlas hingga imago karena menurut Keynan dan Sandler
(1983), Bacillus sp. mempunyai ketahanan yang tinggi terhadap faktor kimia dan
fisika, seperti suhu ekstrim, alkohol, dan sebagainya.
Dari pengamatan mikroskopis pada koloni yang berasal dari MCA di
dapatkan 2 bentuk morfologi yakni batang halus dan batang yang didominasi
bentuk batang. Susunan tidak terdapat perbedaan yakni tunggal. Sifat Gram juga
tidak terdapat perbedaan yakni negatif karena media MCA menghambat
pertumbuhan bakteri Gram positif (Lay 1994). Hasil pengamatan mikroskopis
dapat dilihat pada Tabel 7.
Tabel 7 Hasil pengamatan mikroskopis pada koloni yang berasal dari MCA
Morfologi MCA
Koloni A.1 B.1 C.1 C.2 C.3 D.1 D.2 E.1 E.2
Bentuk Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang Batang
Halus
Susunan Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal Tunggal
Gram Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif
Identifikasi Bakteri
Uji biokimia yang pertama dilakukan yakni uji Oksidase yang berfungsi
untuk mengetahui ada tidaknya enzim oksidase (MacFaddin2000). Selain itu, uji
oksidase berfungsi untuk membedakan bakteri Enterobactericeae jika hasilnya
negatif dan non-Enterobactericeaejika hasilnya positif (Bergey dan Breed 1994).
Isolat yang telah diuji oksidase menghasilkan hasil positif pada semua sampel.
Hal ini menjelaskan bahwa bakteri yang terdapat pada sampel termasuk dalam
famili Enterobactericeae. Selanjutnya, untuk membedakan famili
12
Enterobactericeaedilakukan uji lain yaitu uji TSIA, uji Indol, uji Sitrat, uji Urea
dan fermentasi karbohidrat serta uji VP sebagai tambahan (Lay 1994).
Uji biokimia selanjutnya yakni uji urea. Uji urea bertujuan untuk melihat
kemampuan bakteri dalam mengurai urea menggunakan enzim urease
(MacFaddin2000). Semua isolat yang diuji urea menghasilkan hasil negatif. Dari
13
hasil ini, isolat A.1 dan E.1 mengarah pada Aeromonas sp. dan E. Coli (Jang et al
1976). Isolat C.1, C.2 dan C.3 mengarah pada Alcaligenes sp., Pseudomonas sp.,
Flavobacterium sp. dan Chromobacterium sp. (Jang et al. 1976).
Setelah uji Urea, dilakukan uji indol berfungsi untuk melihat kemampuan
bakteri dalam memecah asam amino tryptophan menggunakan enzim
tryptophanase (Isenberg dan Sundheim 1958). Hasil uji indol dapat dilihat pada
tabel 7. Hasil negatif dari uji indol pada isolat A.1 dan E.1 mengarah pada
Aeromonas sp. (Jang et al 1976). Hasil negatif juga ditemukan pada isolat C.1,
C.2 dan C.3 yang mengarah pada Alcaligenes sp., Pseudomonas sp. dan
Chromobacterium sp. (Jang et al. 1976).
Uji VP merupakan uji tambahan yang dilakukan. Uji ini dilakukan untuk
mendeteksi adanya butylene glycol yang diproduksi bakteri(Madigan dan
Martinko2008). Menurut Spring (2009), isolat A.1 dan E.1 menghasilkan hasil
negatif mengarah ke genus Aeromonas sp.. Pada sampel C.1, C.2 dan C.3
menghasilkan hasil positif pada uji VP yang mengarah pada genus Pseudomonas
sp.
Gambar 11 Uji VP
Berdasarkan hasil semua uji biokimia dapat disimpulkan bahwa isolat A.1
dan E.1 mengarah pada genus Aeromonas sp.. Isolat C.1, C.2 dan C.3 mengarah
pada genus Pseudomonas sp.. Aeromonas sp. merupakan bakteri gram negatif,
berbentuk batang dan bersifat non-spora. Bakteri ini termasuk dalam famili
Vibrionaceae (Popoff 1984). Bakteri Aeromonas sp. yang berhasil diisolasi dan
diidentifikasi pada kloaka ulat sutera liar A. atlas berasal dari lingkungan sekitar.
Hal ini karena daerah Purwakarta merupakan salah satu daerah yang telah
tercemar bakteri Aeromonas sp. (BKIPM 2011). Bakteri ini merupakan salah satu
flora normal pada saluran pencernan Bombyx mori yang berfungsi sebagai
pendegradasi polysakarida (Anand et al. 2010). Bakteri ini dapat menyebabkan
diare dan cellulitis jika terinfeksi pada manusia (Janda dan Duffey 1988). Akan
tetapi, kemampuan Aeromonas sp. menyebabkan penyakit dipengaruhi oleh
jumlah paparan, usia, imunokompetensi, dosis infeksi dan faktor virulensi yang
menginfeksi organisme (Nichols et al. 1996).
16
Simpulan
Isolasi dan identifikasi bakteri pada kloaka imago betina ulat sutera liar A.
atlas mendapat 3 genus bakteri yakni Bacillus sp., Aeromonas sp. dan
Pseudomonas sp.
Saran
DAFTAR PUSTAKA
Anand AAP, Vennison SJ, Sankar SG, Prabhu DIG, Vasan PT, Raghuraman T,
Geoffrey CJ, Vendan SE. 2010. Isolation and characterization of bacteria
from the gut of Bombyx mori that degrade cellulose, xylan, pectin, and
starch and their impact on digestion. Journal of Insect Science 10:107.
Arnaut RI., Vauterin L, De Vos P, Massart D.L, Devriese L.A, De Zutter L, Van
Hoof J. 1999. A numerical taxonomic study of the Pseudomonas flora
isolated from poultry meat. J Appl Microbiol. 87: 15-28.
Arwiyanto T, Maryudani YMS, Azizah NA. 2007. Sifat-sifat fenotipik
Pseudomonas fluoresen, agensia pengendalian hayati penyakit lincat pada
tembakau temanggung. Biodiversita. 8:147-151.
Awan A. 2007. Domestikasi ulat sutera liar Attacus atlas (Lepidoptera:
Saturniidae) dalam usaha meningkatkan persuteraan nasional [disertasi].
Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.
Bergey DH, Breed RS. 1994. Identification flow charts Bergey’s manual of
determinative bacteriology. [internet]. [diunduh 1 september 2014].
Tersedia pada: http://www.uiweb.uidaho.edu/micro_biology/
250/IDFlowcharts.pdf.
BKIPM [Badan Karantina Ikan dan Pengendalian Mutu]. 2011. Stasiun karantina
ikan pengendalian mutu dan keamanan hasil perikanan kelas II Cirebon.
[internet]. [diunduh 1 September 2014]. Tersedia
pada :http://www.bkipm.kkp.go.id/bkipm/profil/upt/37.0/Stasiun%20Kara
ntina%20Ikan%20Kelas%20II%20Cirebon.html.
Borror. 1992. Pengenalan Pelajaran Serangga. Yogyakarta (ID) : Gajah Mada Pr.
Brooks,GF. 2005. Mikrobiologi Kedokteran Edisi Pertama. Jakarta (ID): Salemba
Medika
Buchanan RE, Gibbons. 2006. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology.
Baltimore (US): Woverly.
Difco M. 1984. Dehydrated culture media and reagents for microbiology, 10th
ed.Detroit (US): Difco Laboratories.
Driscoll JA, Brody SL, Kollef MH. 2007. The epidemiology, pathogenesis and
treatment of Pseudomonas aeruginosa infections. Drugs. 67(3):351-68
Dwidjoseputro D. 1994. Dasar-Dasar Mikrobiologi. Jakarta (ID) : Djambatan.
Fischetti AV, RP Novick, JJ Ferreti, DA Portnoy,JI Rood. 2000. GramPositife.
Washington (US): ASM Pr
Gillespie, Stephen, Kathleen Bamford. 2008. At a Glance Mikrobiologi Medis dan
Infeksi Edisi Ketiga. Jakarta (ID) : Erlangga
Isenberg H. D., and L. H. Sundheim. 1958. Indole reactions in bacteria. J.
Bacteriol. 75:682–690.
Janda JM, Duffey PS (1988). Mesophilic aeromonads in human disease: current
taxonomy, laboratory identification, and infectious disease spectrum.
Reviews in Infectious Diseases, 10:980–987.
Jang SS, Biberstein EL, Hirsh DC. 1976. A Manual of Vetrinary Clinical
Bacteriology and Miology. Davis (US) : Univercity of California
Jawetz E, JL Melnick, EA Adelberg, GF Brooks, JS Butel, LN Ornston,
1995.Mikrobiologi Kedokteran, ed. 20. SanFrancisco (US) : University of
California,
18
Keynan, A. and N. Sandler 1983. The Bacterial Spore, vol 2. (Hurst, A. and
Gould, G. W., eds). New York (US) : Academic Press.
Kipnis E, Sawa T, Wiener-Kronish J.2006.Targeting mechanisms of pseudomonas
aeruginosa pathogenesis. Médecine et maladies infectieuses. 36: 78–91.
Lay BW. 1994. Analisis Mikroba di Laboratorium. Jakarta (ID): Raja Grafindo
Persada.
MacFaddin JF.2000. Biochemical Tests for the Identification of Medical Bacteria,
3rd ed.Philadelphia (US) : Lippincott Williams & Wilkins.
Madigan, M. T., and J. M. Martinko. 2008. Brock biology of microorganisms,
12th ed. New Jersey (US) : Benjamin Cummings, Upper Saddle River.
Mulyani N. 2008. Biologi Attacus atlas (Lepidoptera: Saturniidae) Dengan Pakan
Daun Kaliki (Ricinus communis L.) dan Jarak Pagar (Jatropha curcas L.)
di Laboratorium [tesis]. Bogor (ID): Sekolah Pascasarjana, Institut
Pertanian Bogor.
Nichols GL et al. 1996. Health Significance of Bacteria in Distribution Systems
Review of Aeromonas. London (UK) : Water Industry Research Ltd
(Report DW-02/A).
Palleroni NJ. 1992. Present situation of the taxonomy of aerobic pseudomonads.
Di dalam:E. Galli, S. Silver, and B. Witholt, editor. Pseudomonas
Molecular Biology and Biotechnology. Washington (DC): ASM Press.
Peigler RS. 1989. A Revision of The Indo-Australian Genus Attacus. California
(US): The Lepidoptera Researc Foundation, Inc.
Pratiwi, Sylvia T. 2008. Mikrobiologi Farmasi. Jakarta (ID) : Erlangga
Pelczar MJ, ECSChan. 1986. Microbiology.New York (US) :MC Graw Hill Book
Company.
Popoff M. 1984. Genus III Aeromonas Kluyver and van Niel 1936 398AL. In:
Krieg NR, Holt JG, eds. Bergey’s manual of systematic bacteriology, Vol.
1.Baltimore (US) : Williams & Wilkins: 545–548.
Purves Bill, Sadava D. 2003. Life The Science of Biology 7th Edition. Sinauer
Associates Inc. New York.
Rianto F. 2009. Performa reproduksi imago Attacus atlas L. yang berasal dari
perkebunan teh Purwakarta [skripsi]. Bogor (ID): Fakultas Peternakan,
Institut Pertanian Bogor.
Riskomar D. 2000. Soleh:”Kesulitan Bahan Baku untuk Memenuhi Pesanan
Barang”. Mitra Bisnis. Minggu III April 2000 hal 8 kolom 1-4.
Sakthivel S, Angaleswari C, Mahalingam PU. 2012. Isolation and identification of
bacteria responsible for flacherie in silkworms. Adv Appl Sci Res. 3:4066-
4068
Schroth M, D C Hildebrand, N. Panopoulos. 1992. Phytopathogenic
pseudomonads and plant-associated pseudomonads. Di dalam:A. Balows,
H G. Trüper, M. Dworkin, W. Harder, and K.-H. Schleifer, Editor. Ney
York (US) The Prokaryotes, 2nd ed. Springer-Verlag. New York (US),
NY. 3:3104–3131.
Singleton, Sainsbury. 2006. Dictionary of Microbiology and Molecular Biology
3rd Edition.England (UK) J Wiley.
Smith Keary PF. 1988.Genetic Elements in Escherichia coli,
MacmillanMolecular biology series. London (UK), p. 1-9, 49-54
19
RIWAYAT HIDUP