LAPORAN PRAKTIKUM

KIMIA MEDISINAL

DISUSUN OLEH:
Nama : Zaza Eza Mus;imah
NIM: 1908010150
Gol. : C1/5

LABORATORIUM KIMIA ORGANIK DAN KOMPUTASI

FAKULTAS FARMASI
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO
2021
 PERCOBAAN 2
DOCKING MOLEKULER

A. TUJUAN
B. DASAR TEORI
C. LEMBAR KERJA
Gambar struktur 2D ligan alami: Gambar struktur 2D ligan uji:

Protein (kode protein : 5zc9)

Ada di manusia dan sintesis
System eksresi dari bakteri E.Coli
Resolusi 2.00 Å
Ada 3 ligan yaitu ANP, RCG dan MG
Terdiri dari 2 rantai
Tidak bermutasi
Center Grid Box X: 40
Y: 40
Z: 40
Validasi RMSD :
1. 7.07
2. 6.98
3. 7.10
4. 7.13
5. 7.14
6. 6.99
7. 7.02
8. 7.14
9. 7.15
10. 6.97
Hasil docking ligan alami(energi) 1. -3.92
2. -3.63
3. -3.30
4. -3.85
5. -3.25
6. -3.30
7. -3.87
8. -3.99
9. -3.94
10. -2.99

Hasil docking ligan uji (energi) 1.

2.
 3.
4.
5.

Kesimpulan Jadi, Data validasi RMSD buruk karena

lebih dari 2,5

D. PEMBAHASAN
- Tujuan tiap Langkah dalam docking (preparasi, validasi, docking)
- Interpretasi hasil docking

E. DAFTAR PUSTAKA