B I O M A T E R I A L – 0 1
Review Jurnal
“Influence of cross-link structure, density and mechanical properties in
the mesoscale deformation mechanisms of collagen fibrils”
Andi Ridzky Widarto - 1906356424
Departemen Teknik Metalurgi dan Material, Universitas Indonesia, Jalan Kampus UI, Kukusan, Beji,
Kukusan, Kecamatan Beji, Kota Depok, Jawa Barat 16424
1. L A T A R BELAKANG
Kolagen merupakan keluarga protein yang
mewakili komponen utama jaringan ikat pada
vertebrata, yang menyusun sekitar 25% sampai
35% dari kandungan protein tubuh (Fratzl, 2008;
Kadler dkk., 2007). Mereka adalah protein yang
bertanggung jawab untuk menjaga integritas
struktural dan fungsi mekanis jaringan di
sebagian besar organisme multiseluler
Kolagen yang sudah teridentifikasi pada
jaringan tubuh mamalia sampai saat ini ada 27
tipe kolagen. Tipe satu adalah yang paling
banyak ditemukan di tubuh manusia. Kolagen
ini memiliki struktur fibrillar yang membentuk
dasar struktural untuk dapat menahan gaya
tarik, geser, atau kompresi. Kolagen tipe ini
ditemukan pada jarungan seperti kulit, tendon,
ligamen, tulang rawan, pembuluh dara, tulang,
dan gigi.
Struktur fibril pada kolagen distabilkan oleh
ikatan-silang antarmolekul baik itu hasil dari
reaksi enzimatik maupun dari Advanced
Glycation End-products (AGEs).
2. T U J U A N
Jurnal ini membahas kolagen butir kasar tiga
dimensi serta analisis pengaruh ikatan silang
enzimatik pada mekanisme fibril kolagen.
Kolagen sendiri merupakan protein yang
memiliki sifat mekanik yang sangat elastis dan
memungkinkan disipasi energi yang besar pada
proses deformasi.
Jurnal ini menyajikan penelitian dengan
melakukan uji tarik pada model fibril dengan
variasi jenis dan sifat mekanik dari cross-link
fibril untuk menyelidiki mekanisme deformasi
ikatan silang (cross-link) pada fibril kolagen.
Respon mekanik fibril dari hasil pengujian yaitu
: (i) deformasi elastis awal yang sesuai dengan
pelepasan molekul kolagen, (ii) area linier yang
didominasi oleh geseran molekul dan (iii) Area
elastis kedua yang lebih kaku akibat dari
regangan tulang punggung molekul
tropocollagen hingga fibrilnya pecah (rupture).
Penelitian menitikberatkan pada ikatan silang
secara khusus ikatan silang enzimatik, baik itu
dari segi konsentrasi, ikatan kimia,
karakteristik, pengaruh jumlah, dan jenis dari
ikatan silang ini yang kemudian akan
menentukan sifat mekanik dari kolagen fibrils
Hasil penelitian ini akan menunjukkan bahwa
kepadatan dan jenis tautan silang menentukan
kekakuan deformasi kolagen yang disebabkan
meningkatnya jumlah molekul yang saling
berhubungan. Sementara sifat mekanik ikatan
silang akan menentukan nilai failure dari
kekuatan dan regangan fibril.
3. M E T O D E
simulasi yang dilakukan dalam penelitian ini
dihasilkan menggunakan model mesoscopic
yang dibuat terlebih dahulu.
Atom-atom dari molekul tropokolagen triple
heliks disederhanakan menjadi rantai tunggal
‘beads’ untuk memudahkan dan mempercepat
proses penyusunan dan penyelarasan molekul.
 B I O M A T E R I A L – 0 1

Setelah selaras fibril kemudian dibentuk dengan
replikasi tropocollagen untuk membentuk
silinder berdiameter 20 nm.
3.2 Pembentukan Ikatan-silang
Dari hasill analisis penelitian eksperimental
ikatan-silang enzimatik antarmolekul
berkembang pada lysine atau hydroxylysine
pada ujung molekul tropokolagen. Ikatan silang
enzimatik membentuk ikatan kovalen antara
rantai samping residu dua molekul
tropokolagen.
3.3 Metode pengukuran
Ada dua struktur representatif dari ikatan silang
divalen dan trivalen (dehydro-lysino-norleucine
dan Lysyl-pyridinoline (Eyre dan Wu, 2005.
Perilaku mekanik tautan silang telah dinilai oleh
dinamika molekul yang diarahkan di LAMMPS
(Plimpton, 1995). Menggunakan medan gaya
ReaxFF reaktif, kami dapat mengevaluasi
perilaku mekanis tautan silang sampai kegagalan
Untuk ikatan silang trivalen, uji tarik telah
dilakukan dalam tiga kemungkinan arah
menggunakan Material studi 4.4. Karena perilaku
yang sangat mirip, respons mekanis tautan
silang telah dirata-ratakan ke satu set parameter
ikatan dalam representasi coars-grained nya.
Tanggapan dari crosslinks telah diasumsikan
bilinear. Kemudian akan dilakukan simulasi
dinamika molekul pengujian menggunakan
LAMMPS code.
4. H A S I L & D I S K U S I
Respon dan karakteristik kolagen fibril diperoleh
dari kurva tegangan regangan setelah
melakukan simulasi uji tarik yang dibagi menjadi
lima area. Nilai ketangguhan fibril diperoleh
dengan menghitung luas wilayah dibawah kurva
tegangan regangan. Yielding terjadi pada
regangan sekitar 10-15%. Melewati titik hasil,
fibril menunjukkan kedua. Sekitar 30%
deformasi, fibrils mencapai tegangan
maksimumnya ketika cross-link pertama putus.
eksperimen
menunjukkan bahwa ikatan silang saja
merupakan sumber utama kekuatan mekanik
dalam jaringan ikat. Model molekuler yang
dikembangkan di sini memungkinkan kita untuk
mengeksplorasi mekanisme di balik perilaku tiga
fase yang diamati secara eksperimental selama
uji tarik kolagen fibril.
Penelitian ini juga membuktikan bahwa
pematangan ikatan silang enzimatik
meningkatkan kemampuan mekanik dari
fibrils. Dibandingkan dengan ikatan silang yang
belum matang, bentuk yang matang
menyebabkan peningkatan kekuatan dua kali
lipat dan peningkatan ketangguhan tiga kali
lipat untuk strain yang sebanding. Di sisi lain,
fibril yang diperkuat dengan ikatan silang trivalen
menampilkan perilaku yang lebih getas. Valensi
ikatan silang dapat digunakan untuk
memodulasi sifat mekanik jaringan. Misalnya,
kulit janin sebagian besar terdiri dari ikatan
silang yang belum matang karena pergantian
yang tinggi ketika lebih besar diperlukan
eksibilitas. Selama pertumbuhan, jaringan
distabilkan dengan ikatan silang yang lebih
trivalen dengan peningkatan yang sesuai dalam
sifat mekaniknya
5. K E S I M P U L A N
Dari penelitian ini kita mendevelop model 3
dimensi kolagen fibril butir kasar. Melanjutkan
penelitan sebelumnya yang masih dalam
bentuk dua dimensi. Ini memungkinkan kita
untuk mempelajari banyak sifat-sifat lain seperti
bending atau torsion.
Kita juga dapat memahami lebih dalam
pengaruh ikatan-silang terhadap sifat mekanik
kolagen fibril. Ikat-silang melewati tiga fase
utama dimana pada fase kedua dan ketiga ini
kekakuan ditentukan oleh konektivitas
antarmolekul yang bergantung pada jenis
ikatan-silang dan densitas nya.
Secara keseluruhan penelitian ini jelas dapat
menunjukkan hubungan yang jelas antara sifat
mekanik dari ikatan-silang pada respon
mekanik dari fibril.