Coronavirus Disease 2019: Sebaran dan Metode Deteksi

Putra Adi Irawan, S.ST., M.Si.

Poltekkes Kemenkes Bengkulu
Email: putraadiirawan45@gmail.com

Sebaran kasus penyakit yang disebabkan
Coronavirus atau yang juga dikenal dengan
sebutan Covid-19 di Indonesia bermula terjadi
pada 2 Maret 2020 Depok, Jawa Barat. Virus
yang pertama kali terdeteksi di Wuhan
(China) pada akhir Desember 2019 lalu,
perlahan namun pasti, menyebar dengan cepat
ke seluruh dunia (Kemnkes, 2020; ). Secara
global kasus covid 19 di laporkan oleh WHO
per 22 Juni 2020. 8,807,398 kasus dengan
angka kematian sebanyak 464.483 yang
tersebar diseluruh negara sebagaimana yang
ditunjukkan pada gambar dibawah ini:

Gambar 1. Sebaran Kasus Covid 19 di Seluruh Dunia

(Sumber: WHO, 2020b)

Penyakit ini tergolong unik karena
cenderung dianggab menakutkan, namun tidak
sedikit pasien dapat sembuh dengan
sendirinya. Hal ini juga tergantung kondisi
kesehatan dan imunitas tubuh seseorang.
Tidak sedikit angka kematian yang dipicu oleh
virus ini pada mereka yang memiliki penyakit
bawaan (komorbid), diantaranya: Kanker
(CFR = 5,6; n=107), diabetes (CFR= 7,3;
n=1.102), penyait jantung (CFR = 10,5;
n=873), penyakit saluran nafas kronis (CFR =
6,3; n=511), hipertensi (CFR = 6,0; n=2.683)
dan sebagainya. Sedangkan berdasarkan jenis
kelamin pada kasus di China, pria lebih
beresiko (CFR = 2,8; n= 22.981) dibanding
wanita (CFR = 1,7; n=21.619) (China-CDC,
2020)
 Perkembangan Covid-19 di Indonesia
tergolong masif dan fluktuatif, dan berdampak
signifikan pada seluruh wilayah Indonesia.
Mulai dari karantina wilayah, Pembatasan
Sosial Berskala Besar (PSBB), penutupan
Grafik 1. Perkembangan Kasus Baru dan Kematian Baru Covid-19 di
50000
45000
Frekuensi
40000
35000
30000
25000
20000
15000
10000
5000
0
02/03/2020 02/04/2020
(Sumber: Data Sekunder)
Berdasarkan grafik tersebut di atas,
jumlah kasus total Covid-19 masih
menunjukkan grafik yang masih terus
meningkat. Data positif COVID-19 provinsi
5 besar dengan kasus positif terbanyak secara
kumulatif adalah mulai dari DKI Jakarta:
10.098 kasus, Jawa Timur: 9.857, Sulawesi
Selatan: 3.908, Jawa Barat: 2.865 dan Jawa
Tengah 2.717. Selain itu, Gugus Tugas
Nasional juga merincikan akumulasi data
positif COVID-19 lainnya di Indonesia yaitu
di Provinsi Aceh; 49 kasus, Bali: 1.080
kasus, Banten: 1.361 kasus, Bangka Belitung:
148 kasus, Bengkulu: 116 kasus, Yogyakarta:
288 kasus. Selanjutnya di Jambi: 112 kasus,
Kalimantan Barat: 298 kasus, Kalimantan
Dermaga dan Bandara, serta masih banyak
lagi. Berikut ini merupakan data
perkembangan kasus Covid-19 Per Juni 2020
yaitu:
Indonesia
Kasus Baru
Total Kasus
Kematian Baru
Total Kematian
02/05/2020 02/06/2020
Timur: 435 kasus, Kalimantan Tengah: 785
kasus, Kalimantan Selatan: 2.685 kasus, dan
Kalimantan Utara: 177 kasus. Kemudian di
Kepulauan Riau: 281 kasus, Nusa Tenggara
Barat: 1.067 kasus, Sumatera Selatan: 1.839
kasus, Sumatera Barat: 707 kasus, Sulawesi
Utara: 854 kasus, Sumatera Utara: 1.115
kasus, dan Sulawesi Tenggara: 334 kasus.
Adapun di Sulawesi Tengah: 176 kasus,
Lampung: 181 kasus, Riau :166 kasus,
Maluku Utara: 431 kasus, Maluku: 633
kasus, Papua Barat: 224 kasus, Papua: 1.440
kasus, Sulawesi Barat: 104 kasus, Nusa
Tenggara Timur: 111 kasus dan Gorontalo:
230 kasus (Yurianto, 2020).
 Yurianto (2020) juga menjelaskan bahwa
terjadi penambahan jumlah kasus positif
sebanyak 954 orang per tanggal 22 Juni 2020,
sehingga totalnya menjadi 46.845 orang.
Jumlah yang sembuh mencapai 18.735 orang
dan angka kematian mencapai 2.500 orang.
Angka tersebut tidak tersebar merata di
seluruh wilayah Indonesia. Penambahan kasus
tertinggi adalah provinsi Jawa Timur sebanyak
315 orang dan sembuh 66 orang. Kemudian
DKI Jakarata 127 orang, sembuh 74 orang.
Selain itu, Sulawesi Selatan: 111 orang kasus
Grafik 2. Sebaran Kasus, Angka Kesembuhan, dan Angka Kematian, Covid-19 di Indonesia
(Sumber: BBC.Com, 2020)
Dilaporkan juga ada sebelas (11) provinsi
yang tidak mengelami penambahan kasus
positif yakni: Aceh, Bangka Belitung,
Bengkulu, DI Yogyakarta, Jambi, Kalimantan
Barat, Sumatera Barat, Lampung, Papua
Barat, Sulawesi Barat dan Nusa Tenggara
Timur (Yurianto, 2020). Provinsi Bengkulu
sendiri data terkonfirmasi positif per tanggal
22 Juni 2020 yaitu sebanyak 116 kasus,
baru dan 38 sembuh, Kalimantan Selatan: 89
kasus baru dan 10 sembuh, Sumatera Selatan:
60 kasus baru dan 17 sembuh. Berdasarkan
data dari 34 Provinsi di Tanah Air, Provinsi
DKI Jakarta menjadi wilayah penambahan
kasus sembuh tertinggi yakni 5.128 disusul
Jawa Timur sebanyak 2.855, Sulawesi Selatan
1.321, Jawa Barat 1.287, Jawa Tengah 970.
Berikut ini adalah grafik 2. Sebaran
Kasus, Angka Kesembuhan, dan Angka
Kematian, Covid-19 di Indonesia
sembuh 72 orang dan 8 orang meninggal
(Kemenkes, 2020 dalam BBC 2020).
Di bawah ini adalah peta sebaran
kasus, angka kematian, dan angka
kesembuhan Covid-19 di wilayah Indonesia
(Gambar 2) dan angka lonjakan kasus yang
cukup besar per Mei-Juni 2020 yang menjadi
perhatian pemerintah (Grafik 2) yaitu:
 Gambar 2. Sebaran Kasus, Angka Kematian, dan Angka Kesembuhan Covid-19
(Sumber: Kemenkes RI, 2020 dalam BBC.Com, 2020)

Grafik 2. Lonjakan Tertinggi Kasus Covid-19 per Mei-Juni 2020

1400
1200 1241

1000 1043
973 949 993 954
800
689 Jumlah Lonjakan
600
484 533 Kasus
400
200
0
05 09 13 21 23 06 09 10 22
Mei Mei Mei Mei Mei Juni Juni Juni Juni

(Sumber: Data Sekunder)

Metode deteksi yang umum digunakan
dalam pemeriksaan Covid-19 diantaranya
adalah:
a) Rapid Diagnostic Test (RDT) berbasis
antibodi (Ab)
Metode ini tergolong mudah dan
murah digunakan dengan waktu
pemeriksaan yang cuckup singkat yakni
sekitar 15-30 menit. Pemeriksaandengan
metode ini umumnya mendektisi Ab baik
IgG dan IgM. Sampel yang digunakkan
dapat menggunakan whole blood, serum,
atau plasma (Liu, et al., 2020; Li, et al.,
2020; WHO, 2020c). Pada paparan awal
(1-3 hari) hasil pemeriksaan Ab terkadang
non-reaktif. Sejumlah pasien Covid-19
yang terkonfirmasi positif melalui tes
molekuler dilaporkan memiliki respon Ab
yang lemah, terlambat, bahkan tidak
terbentuk (Zhao, et al., 2020; Okba, 2020;
Lin, 2020; WHO,2020c). Sehingga pada
kondisi ini pemilihan metode uji RDT
berbasis Ab dianggap kurang tepat.
Antibodi akan dihasilkan setelah beberapa
hari atau minggu setelah terjadinya infeksi
virus. Respons antibodi bergantung pada
beberapa faktor, seperti usia, status nutrisi,
tingkat keparahan penyakit, dan
pengobatan serta masalah imunodefisiensi
akut dan kronis (Zhao, et al., 2020; Okba,
2020; WHO,2020c).
Sejumlah riset melaporkan bahwa
mayoritas respons antibodi pasien baru
muncul pada pekan kedua setelah muncul
gejala.2,6,7,10-14 (Zhao, et al., 2020;
Okba, 2020; Wolfel, et al., 2020; WHO,
2020c: WHO, 2020d). Hal ini berarti
diagnosis infeksi COVID-19 berbasis
respons antibodi baru mungkin dilakukan
pada fase pemulihan, di saat kesempatan
intervensi atau interupsi klinis terhadap
penularan penyakit telah terlewat. Deteksi
antibodi yang menyasar antibodi COVID-
19 juga menghasilkan kemungkinan
bereaksi silang dengan patogen lain seperti
jenis coronavirus manusia yang lain
(misal: MERS) (Okba, 2020; Wolfel, et
al., 2020; WHO, 2020c: WHO, 2020d).
Hal tersebut berpotensi memberikan hasil
positif palsu. Akan tetapi, deteksi IgG dan
IgM Covid-19 juga perlu dilakukan untuk
mendukung upaya penemuan vaksin,
monitoriung atau pemantauan awal tingkat
infeksi (WHO, 2020c).
Berdasarkan sejumlah keterbatasan
yang ada, maka WHO tidak
merekomendasikan penggunaan tes
diagnostik cepat berbasis deteksi antibodi
untuk perawatan pasien, namun dapat
digunakan untuk surveilans penyakit dan
penelitian epidemiologis (WHO, 2020c).
Alternatif lain dapat memilih metode
ELISA dalam monitoriung dan evaluasi
kadar IgG dan IgM pasien (Gorse, et al.,
2020).
b) Rapid Diagnostic Test (RDT) berbasis
antigen (Ag)
Tes diagnostik cepat (RDT) berbasis
Ag sebaiknya menggunakan sampai
sampel nosofaring ataupun orofaring
(Kemenkes 2020, WHO, 2020c). Antigen
dapat terdeteksi pada saat virus
bereplikasi secara aktif, sehingga metode
pemeriksaan ini sangat baik digunakan
untuk mengidentifikasi infeksi akut atau
infeksi tahap awal. Keterbatasan metode
ini dipengaruhi oleh beberapa faktor,
diantaranya: waktu munculnya gejala
penyakit, konsentrasi virus pada sampel,
kualitas preparasi sampel dan mutu
reagen yang digunakan. Berdasarkan
pengamatan penggunaan RDT berbasis
antigen untuk penyakit-penyakit saluran
pernapasan lain misalnya: influenza,
konsentrasi virus pada sampel dari
saluran pernapasan pasien sebanding
dengan Covid-19, sensitivitasnya pun
diperkirakan berkisar dari 34- 80%
(Bruning, et al., 2017; WHO, 2020c).
Hasil studi lain menunjukkan bahwa
metode ini berpeluang terjadi bias sekitar
50% atau bahkan lebih dari jumlah pasien
terinfeksi Covid-19 yang diperiksa.
Namun hal ini, masih perlu diteliti lebih
lanjut untuk memahami tingkat keakuratan
metode tersebut. Selain itu, positif palsu
dapat terjadi jika antibodi pada strip uji
juga bereaksi bereaksi terhadap antigen
virus selain Covid-19, seperti tipe
coronavirus manusia penyebab batuk
pilek. Dengan segala keterbatasan yang
ada, WHO tidak merekomendasikan
penggunaan tes diagnostik cepat berbasis
deteksi antigen untuk perawatan pasien di
 Rumah Sakit (WHO, 2020c: WHO,
2020d).
c) Molekuler
Salah satu Pemeriksaan secara
molekuler yang digunakan untuk deteksi
RNA virus Covid-19 adalah Real Time
Polimerase Chain Reaction (RT-PCR).
Sampel yang digunakan sebaiknya berasal
dari swab nosofaring dan orofaring
(Kemenkes 2020; WHO, 2020c). Hingga
saat ini, metode ini dinilai sangat efektif
dalam penetapan diagnosis Covid-19,
Referensi:
Bruning AHL, Leeflang MMG, Vos JMBW, Spijker R, de
Jong MD, Wolthers KC, et al. (2020). Artikel Ilmiah
(online). Rapid Tests for Influenza, Respiratory
Syncytial Virus, and Other Respiratory Viruses: A
Systematic Review and Meta-analysis. Clinical
Infectious Diseases, 65 (6): 1026–1032, Diakses pada
Juni, 2020 melalui:
https://academic.oup.com/cid/article/65/6/1026/382959
0 World Health Organization. (2020a). Novel Coronavirus
Center of Disease Center and Pevention (CDC). (2020).
Coronavirus Disease (Covid-19).
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/symptoms-
testing/symptoms.html
China-CDC. (2020). Artikel lmiah. Vital Surveillances: The
Epidemiological Characteristics of an Outbreak of 2019
Novel Coronavirus Diseases (COVID-19)-China, 2020.
CCDC Weekly 2(8): 113-122.
Gorse GJ, Donovan MM, Patel GB. (2020). Artikel Ilmiah
(online). Antibodies to coronaviruses are higher in older
compared with younger adults and binding antibodies
are more sensitive than neutralizing antibodies
identifying coronavirus-associated illnesses. Journal of
medical virology. https://doi.org/10.1002/jmv.25715
Kemenkes RI. 2020, Pedoman kesiapsiagaan menghadapi
coronavirus deasease (covid 19) . Jakarta: Balitbang
Kemenkes RI
Liu Y, Liu Y, Diao B, Ren Feifei, et al. (2020). Artikel Ilmiah
(online). Diagnostic indexes of a rapid IgG/IgM
combined antibody test for SARS-CoV- 2. Medxriv.
Diakses pada Juni 2020 melalui:
https://doi.org/10.1101/2020.03.26.20044883.
Li Z, Yi Y, Luo X, Xion N, et al. (2020). Artikel Ilmiah
(online). Development and clinical application of a rapid
IgM-IgG combined antibody test for SARS-CoV-2
infection diagnosis. Journal of medical virology: 1-7.
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/jmv.257
27
Lin D, Liu L, Zhang M, Hu Y, et al. (2020). Artikel Ilmiah
(online). Evaluation of serological tests in the diagnosis
of 2019 novel coronavirus (SARS- CoV-2) infections
meskipun kondisi pasien tanpa gejala
sekalipun. Keterbatasan metode ini
diantaranya adalah biaya reagen yang
tidak murah, jumlah reagen yang terbatas,
dan waktu uji yang relatif lama. Akan
tetapi, dengan segala keterbatasan yang
ada, WHO dan Kemenkes RI lebih
merekomendasikan metode ini dalam
perawata pasien Covid 19 (Kemenkes,
2020; WHO, 2020c; WHO, 2020d).
during the COVID-19 outbreak. Diakses pada Juni, 2020
melaui:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.0
3.27.20045153v1.full.pdf
Okba N.M.A, Muller M.A., Li W, Wang C, et al. (2020).
Artkel ilmiah (online). SARS-COV-2 specific antibody
responses in COVID-19 patients.
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.18.20
038059v1
– China. https://www.who.int/csr/don/12-january-
2020-novel-coronavirus-china/en/
World Health Organization. (2020b). WHO Coronavirus
Disease (COVID-19). Dashboard
Data.https://covid19.who.int/?gclid=EAIaIQobChMI0p
invaSV6gIV2yMrCh1E4Q5NEAAYAiAAEgIETPD_BwE
World Health Organization. (2020c).Saran penggunaan tes
imunodiagnostik di fasyankes (point ofcare) untuk
COVID-19.
World Health Organization. (2020d). “Paspor imunitas”
dalam konteks COVID-19
Wolfel R, Corman V, Guggemos W, Seilmaier M, Mueller M,
Niemeyer D, et al. (2020). Artikel Ilmiah (online).
Virological assessment of hospitalized patients with
COVID-2019. Nature, 581: 465-469. Diakses pada Juni,
2020 melaui: https://www.nature.com/articles/s41586-
020-2196- x
Yurianto, A. (2020). Laoran Harian Gugus Tugas Percepatan
Penanganan COVID-19, Senin, 22 Juni 2020 (online).
Graha Badan Nasional Penanggulangan Bencana
(BNPB), Jakarta. https://covid19.go.id/p/berita/kasus-
positif-covid-19-bertambah-954-pasien-sembuh-jadi-
18735-meninggal-naik-35-orang
Zhao J, Yuan Q, Wang H, Liu W, Liao X, Su Y, et al. (2020).
Artikel ilmiah (online). Antibody responses to SARS-
CoV-2 in patients of novel coronavirus disease 2019.
Diakses pada Juni, 2020 melalui:
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.20
030189v1.full.pdf