Sebelum menggunakan EMR dokumen rekam medis menghabiskan banyak tempat dan terlihat

tidak rapi. Tetapi setelah menggunakan EMR di tahun 2019 rak penyimpanan jauh terlihat lebih rapi
dan tertata. Penyimpanan berkas rekam medis di RSUP Dr. Sardjito menggunakan sistem rak
terbuka. Sebelum menggunakan rak terbuka sebenarnya tempat penyimpanannya menggunakan rak
tertutup. Akan tetapi, karena banyaknya dokumen pasien sehingga rak tersebut tidak mampu
menampung banyak dokumen, maka yang digunakan adalah rak terbuka. Selain itu, dengan
digunakannya rak terbuka petugas akan lebih mudah mengambil dan mengecek dokumen rekam
medis yang tersimpan. Proses penyimpanan di RSUP Dr. Sardjito menggunakan sistem Sentralisasi
yaitu semua data-data dari Unit Rawat Jalan maupun Rawat Inap dijadikan satu untuk kemudian
diolah menjadi satu informasi rumah sakit.