Bunga Rafflesia merupakan parasit tidak berakar, tidak berdaun, dan tidak bertangkai.
Diameter bunga ketika sedang mekar bisa mencapai 70–110 sentimeter dengan tinggi mencapai 50
sentimeter. Bunga ini berbobot sekitar 11 kilogram. Bunga mengisap unsur anorganik dan organik
dari tanaman inang Tetrastigma. Satu-satunya bagian yang bisa disebut sebagai "tanaman" adalah
jaringan yang tumbuh di tumbuhan merambat Tetrastigma.
Bunga mempunyai lima daun mahkota yang mengelilingi bagian yang terlihat seperti mulut
gentong. Di dasar bunga terdapat bagian seperti piringan berduri, berisi benang
sari atau putik bergantung pada jenis kelamin bunga, jantan atau betina. Hewan penyerbuk
adalah lalat yang tertarik dengan bau busuk yang dikeluarkan bunga. Bunga hanya berumur sekitar
satu minggu (5–7 hari) dan setelah itu layu dan mati. Persentase pembuahan sangat kecil, karena
bunga jantan dan bunga betina sangat jarang bisa mekar bersamaan dalam satu minggu, itu pun jika
ada lalat yang datang membuahi.
Penggolongan jenis Rafflesia masih didasarkan pada bentuk struktur dan morfologi bunga. Belum
adanya kesepakatan antara para ahli taksonomi untuk mendeskripsikannya ke dalam karakter
tertentu. Sampai saat ini karakter yang digunakan untuk membedakan jenis Rafflesia adalah: