Anda di halaman 1dari 74

LAPORAN PRAKTIKUM

SITOGENETIKA

Nama : Thea Putri Carrissa


NIM : H0721176
Co-Ass : Kristina Ayu Isnaeni

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI


FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2023
ii
KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Esa yang telah melimpahkan
rahmat, karunia, dan ijin-Nya sehingga penulis dapat menyusun laporan
Praktikum Sitogenetika ini. Laporan Praktikum Sitogenetika ini dibuat untuk
melengkapi tugas Mata Kuliah Sitogenetika.
Dalam penyusunan laporan ini, penulis tidak lepas dari bimbingan,
pengarahan dan bantuan dari berbagai pihak, maka pada kesempatan ini penulis
menyampaikan ucapan terima kasih kepada:
1. Dekan Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret;
2. Tim dosen Mata Kuliah Sitogenetika;
3. Co-Assisten yang telah membimbing dan mengarahkan praktikan;
4. Rekan-rekan dan semua pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu per
satu.
Penulis menyadari seandainya dalam penulisan laporan ini masih ada
kekurangan, untuk itu penulis mengharapkan kritik dan saran yang bersifat
membangun demi hasil yang lebih baik lagi. Penulis juga berharap semoga
laporan ini dapat bermanfaat dan memberi tambahan ilmu bagi pembaca. Amin.

Surakarta, Desember 2023

Penyusun

iii
DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL ........................................................................................ i


HALAMAN PENGESAHAN........................................................................... ii
KATA PENGANTAR....................................................................................... iii
DAFTAR ISI...................................................................................................... iv
DAFTAR TABEL.............................................................................................. vi
DAFTAR GAMBAR......................................................................................... vii
I. MENGENAL MIKROSKOP.....................................................................1
A. Pendahuluan............................................................................................1
1. Latar Belakang.......................................................................................1
2. Tujuan Praktikum..................................................................................2
B. Tinjauan Pustaka.....................................................................................3
C. Metodologi Praktikum............................................................................6
1. Waktu dan tempat Praktikum................................................................6
2. Alat dan Bahan......................................................................................6
3. Cara Kerja..............................................................................................6
D. Hasil pengamatan dan Pembahasan......................................................7
1. Hasil Pengamatan..................................................................................7
2. Pembahasan...........................................................................................9
E. Kesimpulan dan Saran............................................................................12
1. Kesimpulan............................................................................................12
2. Saran......................................................................................................12
DAFTAR PUSTAKA
II. PENGAMATAN PREPARAT KERING..................................................15
A. Pendahuluan............................................................................................15
1. Latar Belakang.......................................................................................15
2. Tujuan Praktikum..................................................................................15
B. Tinjauan Pustaka.....................................................................................16
C. Metodologi Praktikum............................................................................18
1. Waktu dan tempat Praktikum................................................................18

iv
2. Alat dan Bahan......................................................................................18
3. Cara Kerja..............................................................................................18
D. Hasil pengamatan dan Pembahasan......................................................20
1. Hasil Pengamatan..................................................................................20
2. Pembahasan...........................................................................................22
E. Kesimpulan dan Saran............................................................................21
1. Kesimpulan............................................................................................24
2. Saran......................................................................................................24
DAFTAR PUSTAKA
III. PEMBUATAN PREPARAT KROMOSOM TANAMAN......................26
A. Pendahuluan............................................................................................26
1. Latar Belakang.......................................................................................26
2. Tujuan Praktikum..................................................................................26
B. Tinjauan Pustaka.....................................................................................28
C. Metodologi Praktikum............................................................................30
1. Waktu dan tempat Praktikum................................................................30
2. Alat dan Bahan......................................................................................30
3. Cara Kerja..............................................................................................30
D. Hasil pengamatan dan Pembahasan......................................................31
1. Hasil Pengamatan..................................................................................31
2. Pembahasan...........................................................................................38
E. Kesimpulan dan Saran............................................................................42
1. Kesimpulan............................................................................................42
2. Saran......................................................................................................42
DAFTAR PUSTAKA
IV. IDENTIFIKASI DAN KARAKTERISASI KROMOSOM TANAMAN41
A. Pendahuluan............................................................................................45
1. Latar Belakang.......................................................................................45
2. Tujuan Praktikum..................................................................................46
B. Tinjauan Pustaka.....................................................................................47
C. Metodologi Praktikum............................................................................50

v
1. Waktu dan tempat Praktikum................................................................50
2. Alat dan Bahan......................................................................................50
3. Cara Kerja..............................................................................................50
D. Hasil pengamatan dan Pembahasan......................................................51
1. Hasil Pengamatan..................................................................................51
2. Pembahasan...........................................................................................52
E. Kesimpulan dan Saran............................................................................54
1. Kesimpulan............................................................................................54
2. Saran......................................................................................................54
DAFTAR PUSTAKA
V. KARYOTIPING KROMOSOM TANAMAN..........................................56
A. Pendahuluan............................................................................................56
1. Latar Belakang.......................................................................................56
2. Tujuan Praktikum..................................................................................57
B. Tinjauan Pustaka.....................................................................................58
C. Metodologi Praktikum............................................................................61
1. Waktu dan tempat Praktikum................................................................61
2. Alat dan Bahan......................................................................................61
3. Cara Kerja..............................................................................................61
D. Hasil pengamatan dan Pembahasan......................................................62
1. Hasil Pengamatan..................................................................................62
2. Pembahasan...........................................................................................62
E. Kesimpulan dan Saran............................................................................65
1. Kesimpulan............................................................................................65
2. Saran......................................................................................................65
DAFTAR PUSTAKA

vi
DAFTAR TABEL

Tabel 1.1 Bagian-bagian mikroskop binokuler dan fungsinya..................................8


Tabel 2.1 Bagian Sel Daun Karet Merah (Ficus elastica) dan Fungsinyaa
Semarang...................................................................................................21
Tabel 3.1 Hasil Pengamatan Preparat Kromosom Bawang Merah
(Allium cepa L.).........................................................................................34
Tabel 3.2 Fase-fase Mitosis Kromosom Bawang Merah (Allium cepa L.) ...............37
Tabel 4.1 Hasil Identifikasi dan Karakterisasi Kromosom Salak
(Salacca zalacca) .......................................................................................51

vii
DAFTAR GAMBAR

Gambar 1.1 Mikroskop Binokuler.............................................................................7


Gambar 2.1 Penampang Melintang Daun Karet Merah (Ficus elastica) pada
Mikroskop..................................................................................................................20
Gambar 2.2 Penampang Melintang Daun Karet Merah ( Ficus elastica)) ..............20
Gambar 3.1 Skema Pembuatan Preparat Kromosom Tanaman dengan pra
Perlakuan....................................................................................................................32
Gambar 3.2 Skema Pembuatan Preparat Kromosom Tanaman dengan pra
Perlakuan....................................................................................................................33
Gambar 4.1 Kromosom Salak....................................................................................52
Gambar 4.2 Karyotiping Kromosom Salak (Salacca zalacca) .................................52
Gambar 5.1 Idiogram Kromosom Salak (Salacca zalacca) ......................................62

viii
I. MENGENAL MIKROSKOP

A. Pendahuluan
1. Latar Belakang
Salah satu alat laboratorium yang keberadaannya sangat penting
dalam menunjang terlaksananya Tri Darma Perguruan Tinggi adalah
mikroskop. Alat ini merupakan alat bantu untuk mengamati benda-benda
atau jasad renik yang berukuran sangat kecil (mikroskopis) yang tidak bisa
dilihat dengan mata biasa (manusia). Mikroskop adalah alat yang
berfungsi untuk melihat/mengamati benda-benda yang berukuran sangat
kecil yang tak dapat terlihat dengan mata telanjang. Mikroskop berasal
dari bahasa latin, yaitu "micro" yang berarti kecil dan kata "scopein" yang
berarti melihat, jadi mikroskop adalah alat untuk melihat benda-benda
kecil atau objek mikroskopis.
Satuan ukuran untuk benda yang diamati dengan mikroskop adalah
mikrometer (μm) atau mikron yang setara dengan 0,001 centimeter.
Dengan menggunakan mikroskop, obyek dengan ukuran kecil akan dapat
dilihat karena mikroskop mampu memperbesar ukuran benda yang dilihat.
Ukuran perbesarannya mulai dari 40 kali, 100 kali, 400 kali, 1000 kali
bahkan lebih. Jika mengunakan ukuran 1000 kali perlu menggunakan
minyak imersi karena lensa obyektif menempel pada preparat. Minyak ini
melapisi lensa tidak langsung kontak dengan obyek. Meski mikroskop
dapat digunakan untuk melihat obyek yang berukuran kecil, namun obyek
yang akan dilihat harus disiapkan dengan baik yaitu sel harus menyebar
tidak saling menumpuk.
Berdasarkan sumber cahayanya, mikroskop dibagi menjadi dua,
yaitu, mikroskop cahaya dan mikroskop elektron. Berdasarkan jumlah
lensa okuler yang digunakan, mikroskop dibedakan menjadi beberapa
jenis, yakni: Mikroskop monokuler, Mikroskop binokuler, dan Mikroskop
trinokuler.

1
2

2. Tujuan Praktikum
Tujuan praktikum ini adalah mengenal bagian-bagian mikroskop dan
fungsinya.
3

B. Tinjauan Pustaka
Ketika mikroskop pertama kali diperkenalkan kepada para ilmuwan
pada abad ke -17, sebuah revolusi dimulai. Tiba-tiba, sebuah dunia baru, yang
tidak terlihat dengan mata telanjang, terbuka bagi para penjelajah yang
penasaran. Sejak Grew melakukan pengamatannya, mikroskop telah
mengalami banyak variasi, berkembang dari mikroskop majemuk awal
tabung logam berongga dengan lensa di setiap ujungnya hingga mikroskop
resolusi super yang modern, canggih, dan unik yang tersedia bagi para
peneliti saat ini. Kemajuan ini dimulai dengan kesadaran Grew yang
sederhana dan pada saat itu mengejutkan bahwa sel tumbuhan sama rumitnya
dengan sel hewan, dan bahwa berbagai bagian tubuh tumbuhan memang
memenuhi syarat untuk disebut “organ”, kemudian berlanjut ke
perkembangan sel-sel hewan (Somssich 2022).
Tidak diketahui secara persis siapa sebenarnya penemu Mikroskop
pemindai elektron (Scanning Electron Microscope-SEM) ini. Publikasi
pertama kali yang mendiskripsikan teori SEM dilakukan oleh fisikawan
Jerman Dr. Max Knoll pada 1935, meskipun fisikawan Jerman lainnya Dr.
Manfred von Ardenne mengklaim dirinya telah melakukan penelitian suatu
fenomena yang kemudian disebut SEM hingga tahun 1937. Tahun 1942 tiga
orang ilmuwan Amerika yaitu Dr. Vladimir Kosma Zworykin, Dr. James
Hillier, dan Dr. Snijder, benar-benar membangun sebuah mikroskop
elektron metode pemindaian (SEM) dengan resolusi hingga 50 nm atau
magnifikasi 8.000 kali. Sebagai perbandingan SEM modern sekarang ini
mempunyai resolusi hingga 1 nm atau pembesaran 400.000 kali. Mikroskop
elektron cara ini memfokuskan sinar elektron (electron beam) dipermukaan
objek dan mengambil gambarnya dengan mendeteksi elektron yang muncul
dari permukaan objek (Heuser 2016).
Mikroskop adalah suatu benda yang berguna untuk memberikan
bayangan yang diperbesar dari benda-benda yang terlalu kecil untuk dilihat
dengan mata telanjang. Antony Van Leuwenhoek orang yang pertama kali
menggunakan mikroskop walaupun dalam bentuk sederhana. Tahun 1600
4

Hans dan Z Jansen telah menemukan mikroskop yang lebih maju dengan
nama mikroskop ganda. Seiring perkembangan dan kemajuan teknologi yang
sangat cepat, perkembangan mikroskop saat ini telah semakin canggih. Di
mana saat ini keberadaan mikroskop telah terintegrasi dalam satu paket unit,
berupa mikroskop digital (digital microscope) yang terdiri dari mikroskop
biasa dengan kamera digital yang dibangun ke dalamnya. Gambar yang
terlihat melalui Mikroskop Digital langsung diproyeksikan ke monitor
komputer dan disimpan pada file komputer. Mikroskop terdiri dari beberapa
bagian yang memiliki fungsi tersendiri (Merlina 2021).
Abad 20 yaitu zaman modern di mana teknologi berkembang pesat.
Abad 20 ini menghasilkan mikroskop yang dapat dihubungkan dengan
gadget, sehingga hasil preparat dapat dilihat di gadget secara online.
Terkhusus pada mikroskop jenis trinokuler yang dapat dilihat menggunakan
dua lensa okuler dan lensa satunya dapat dihubungkan dengan gadget
(Sugianto et al. 2020).
Fungsi utama mikroskop adalah untuk melihat dan juga untuk
mengamati objek dengan ukuran sangat kecil yang tidak bisa dilihat dengan
mata normal. Fungsi lainnya dari mikroskop tetap akan selaras pada fungsi
utamanya, bedanya beberapa dari jenis mikroskop dibuat untuk fungsi yang
lebih detail lagi. Contohnya ada jenis mikroskop yang dibuat hanya untuk
mengamati satu jenis objek mikroskopis saja. Fungsi mikroskop tetap untuk
mengamati objek dengan ukuran sangat kecil (mikroskopis) yang tidak
mampu dilihat dengan mata telanjang (Irhami, 2019).
Mikroskop cahaya meneruskan cahaya yang tampak kemudian
diteruskan ke lensa kaca. Lensa ini membengkokkan cahaya dengan citra
spesimen yang diperbesar ketika diproyeksikan ke mata. Mikroskop cahaya
mempunyai perbesaran maksimum 1000 kali. Mikroskop elektron berfungsi
memfokuskan seberkas elektron melalui spesimen atau pada permukaannya.
Resolusi berbanding terbalik dengan panjang gelombang radiasi yang
digunakan mikroskop untuk bercitra, dan berkas elektron memiliki panjang
gelombang yang jauh lebih pendek daripada cahaya. Mikroskop elektron
5

mempunyai perbesaran sampai 100.000 kali. Mikroskop elektron mempunyai


2 tipe, yaitu mikroskop elektron scanning yang digunakan untuk studi detail
arsitektur permukaan sel serta objek yang diamati secara 3 dimensi dan
mikroskop elektron transmisi yang digunakan untuk mengamati struktur
detail internal sel (Fischer et al. 2016).
Mikroskop diciptakan untuk mengetahui objek-objek mikro pada
cabang biologi. Berdasarkan fungsinya dalam mengamati objek mikroskopis,
mikroskop juga terdapat beberapa jenis. Contohnya Flourenscence
Microscope yang berfungsi untuk mendeteksi benda asing atau Antigen
(seperti bakteri, ricketsia, atau virus) dalam jaringan. Salah satu mikroskop
cahaya yaitu mikroskop trinokuler yang memiliki fungsi agar objek dapat
dilihat secara online melalui gadget sangat membantu dalam pengetahuan
mengenai komponen dan struktur mikroskopis biologi (Firdaus 2022).
Mikroskop majemuk dibagi menjadi tiga komponen struktural dasar.
Mereka adalah tubuh, pangkal, dan lengan. Tubuh berisi bagian optik yang
berfungsi untuk pengamatan, pangkal membantu menopang mikroskop serta
berisi iluminator, sedangkan lengan berfungsi sebagai penghubung antara
tubuh dan kepala. Itu juga telah dikategorikan terutama menjadi bagian optik
dan mekanik berdasarkan fungsinya. Bagian optik meliputi sumber cahaya,
diafragma, filter, kondensor, objektif, dan lensa okuler. Bagian optik
digunakan untuk melihat dengan jelas objek mikro saat pengamatan. Bagian
mekanis meliputi alas, kenop giling, panggung mekanis, penghenti rak,
lengan melengkung, bagian hidung, pemisah balok, penarik dan tabung
badan. Bagian mekanis berfungsi sebagai penghubung, pengatur, dan
penyangga saat dilakukan pengamatan (Lavanya et al. 2017).
6

C. Metodologi Praktikum
1. Waktu dan Tempat
Praktikum Sitogenetika mengenai mengenal mikroskop dilaksanakan
di Ruang Sidang Pemuliaan Tanaman Gedung C Lantai 2 FP UNS pada
tanggal 26 Oktober 2023 pukul 11 WIB.
2. Alat dan Bahan
Alat dan bahan yang digunakan pada praktikum Sitogenetika
mengenal mikroskop adalah sebagai berikut:
a. Mikroskop Monokuler
b. Mikroskop Binokuler
c. Mikroskop Trinoluker
3. Cara Kerja
1. Mengamati bagian-bagian mikroskop.
2. Menggambarkan mikroskop (monokuler, binokuler dan trinokuler).
3. Menyebutkan dan menjelaskan fungsi bagian bagian mikroskop.
7

D. Hasil Pengamatan dan Pembahasan


1. Hasil Pengamatan
Gambar 1.1 Mikroskop Binokuler

Sumber: Laporan Sementara


8

Tabel 1.1 Bagian-bagian mikroskop binokuler dan fungsinya


No Bagian-bagian Fungsi
Mikroskop
1 Lenda Okuler berfungsi untuk memperbesar bayangan
yang dihasilkan lensa objektif
2 Tabung Lensa Berfungsi sebagai tempat melekatnya
lensa okuler
3 Makrometer Berfungsi mengukur jarak antara objek
yang dilihat dalam lapangan pandang
mikroskop secara kasar
4 Mikrometer Berfungsi mengukur jarak antara objek
yang dilihat dalam lapangan pandang
mikroskop secara halus
5 Penjepit Preparat Berfungsi menjepit preparat untuk
meletakan objek
6 Meja preparat Berfungsi meletakan preparat sebagai
tempat objek untuk dilihat
7 Sendi Inklinasi Berfungsi mengatur derajat kemiringan
atau sudut tegak mikroskop yang
diperlukan observer untuk mengamati
objek pengamatan
8. Kaki mikroskop Berfungsi sebagai penyangga atau
penopang mikroskop
9. Sumber cahaya Sebagai sumber cahaya untuk menerangi
objek

No Bagian-bagian Fungsi
Mikroskop
10 Lengan Mikrospkop berfungsi sebagai pegangan ketika
mikroskop akan dipindahkan atau dibawa
9

menuju ke tempat lain


11 Diafragma berfungsi mengatur jumlah cahaya yang
masuk, sehingga observer bisa
memfokuskan dan menentukan jumlah
cahaya ke dalam objek pengamatan
12 Kondensor berfungsi mengumpulkan cahaya yang
dipantulkan oleh cermin kemudian
memfokuskan cahaya tersebut sebagai
penerangan pada objek yang sedang
diamati
13 Lensa Objektif berfungsi dalam pembentukan bayangan
pertama, struktur dan bagian renik yang
akan terlihat di bayangan akhir
14 Revolver berfungsi mengatur pembesaran lensa
objektif untuk mempermudah pengaturan
nilai pengamatan dari mikroskop
tersebut.
Sumber: Laporan Sementara
2. Pembahasan
Mikroskop Monokuler adalah mikroskop cahaya yang hanya
dilengkapi dengan satu lensa okuler. Fungsi dari mikroskop monokuler
adalah untuk mengamati secara lebih terperinci struktur di dalam sel.
Menurut Louk et al. (2019), mikroskop monokuler adalah mikroskop yang
penampakannya paling sederhana di antara mikroskop binokuler dan
trinokuler. Menurut Robika (2023), mikroskop trinokuler dapat langsung
tersambung pada gadget untuk melihat gambar, tidak seperti mikroskop
binokuler dan monokuler yang harus difoto terlebih dahulu dari lensa.
Bagian optik berfungsi untuk memperbesar bayangan dari ukuran
yang sebenarnya, bagian optik terdiri dari lensa objektif, lensa okuler,
Diafragma dan kondensor. Menurut Chen et al. (2016), bagian optik
mikroskop terutama mencakup lensa objektif dan lensa okuler yang
10

memiliki tujuan untuk melihat dan memperbesar bayangan agar objek


dapat dilihat dengan jelas. Lensa okuler merupakan lensa yang digunakan
untuk melihat objek hasil dari perbesaran lensa objektif. Lensa objektif
berfungsi untuk membentuk bayangan pertama objek yang sudah
diperbesar yang disalurkan ke lensa okuler.
Bagian optik yang berfungsi untuk memantulkan dan mengatur
cahaya agar objek terlihat adalah diafragma dan konsendor. Menurut
Subali (2019), supaya bayangan terlihat terang, di bawah objek diletakkan
sebuah cermin cekung yang berfungsi untuk mengumpulkan cahaya dan
diarahkan pada objek. Diafragma terletak di atas kondensor. Diafragma
berfungsi mengatur jumlah cahaya yang masuk, sehingga observer bisa
memfokuskan dan menentukan jumlah cahaya ke dalam objek
pengamatan. Kondensor adalah bagian optik yang berfungsi
mengumpulkan cahaya yang dipantulkan oleh cermin kemudian
memfokuskan cahaya tersebut sebagai penerangan pada objek yang sedang
diamati.
Bagian mekanik merupakan bagian-bagian mikroskop yang
berfungsi sebagai tempat bagian lainnya terpasang. Menurut Suprapto
(2019), bagian mekanik merupakan bagian untuk mengatur dan sebagai
tempat dari bagian optik. Bagian mekanik mikroskop terdiri dari penjepit
preparat, tabung, sekrup pengatur kasar, sekrup pengatur halus, revolver,
sendi inklinasi dan sekrup penggeser preparat. Meja preparat merupakan
salah satu bagian dari Mikroskop yang berfungsi sebagai tempat untuk
meletakan bagian atau sel makhluk hidup yang tidak dapat terlihat oleh
mata. Preparat yang diletakkan di atas meja preparat akan dijepit oleh
penjepit preparat yang berfungsi agar kaca preparat tidak bergerak. Tabung
lensa pada mikroskop berfungsi sebagai tempat melekatnya lensa okuler.
Sendi inklinasi berfungsi mengatur derajat kemiringan atau sudut tegak
mikroskop yang diperlukan observer untuk mengamati objek pengamatan
Mikroskop memiliki sekrup pengatur lensa dan meja preparat.
Menurut Leitão (2016), mikrometer dan makrometer adalah instrumen
11

mikroskop yang digunakan untuk mengatur posisi lensa untuk melihat


gambar objek dari lensa yang diperoleh di mikroskop cahaya. Makrometer
berfungsi mengukur jarak antara objek yang dilihat dalam lapangan
pandang mikroskop secara kasar, sedangkan mikrometer secara halus.
Revolver berfungsi untuk mengatur lensa objektif untuk mengubah
perbesaran.
Bagian pendukung mikroskop adalah bagian tambahan pada
mikroskop untuk menghubungkan atau sebagai tempat penyangga bagian
lain. Menurut Salido et al. (2022), penyangga pada mikroskop harus sesuai
agar dapat tetap seimbang dalam menyangga bagian-bagian mikroskop di
atasnya. Bagian pendukung mikroskop terdiri dari lengan mikroskop, kaki
mikroskop dan meja preparat. Kaki mikroskop berfungsi sebagai
penyangga atau penopang mikroskop. Lengan mikroskop berfungsi untuk
pegangan ketika mikroskop akan dipindahkan atau dibawa menuju ke
tempat lain. Meja preparat berfungsi untuk meletakkan preparat sebagai
tempat objek untuk dilihat. Menurut Hongyuan et al. (2020), meja preparat
mempengaruhi jelas tidaknya preparat saat dilihat.
12

E. Kesimpulan dan Saran


1. Kesimpulan
Berdasarkan praktikum acara 1 mengenai mengenal mikroskop dapat
ditarik kesimpulan sebagai berikut.
a. Mikroskop cahaya dibedakan menjadi tiga jenis yaitu mikroskop
monokuler (satu lensa okuler), mikroskop binokuler (dua lensa okuler),
dan mikroskop trinokuler (dua lensa okuler dan satu lensa
dihubungkan dengan gadget.
b. Bagian mikroskop optik yaitu berfungsi untuk memperbesar bayangan
dari ukuran yang sebenarnya, terdiri dari lensa objektif, lensa okuler,
Diafragma dan kondensor.
c. Bagian mekanik merupakan bagian-bagian mikroskop yang berfungsi
sebagai tempat bagian lainnya terpasang, terdiri dari penjepit preparat,
tabung, sekrup pengatur kasar, sekrup pengatur halus, revolver, sendi
inklinasi dan sekrup penggeser preparat.
d. Bagian pendukung mikroskop adalah bagian tambahan pada
mikroskop untuk menghubungkan atau sebagai tempat penyangga
bagian lain, terdiri dari dari lengan mikroskop, kaki mikroskop dan
meja preparat
2. Saran
Saran yang dapat diberikan untuk praktikum Sitogenetika acara 1
mengenai mengenal mikroskop adalah sebaiknya terdapat mikroskop
binokuler secara langsung di laboratorium. Praktikkan sebaiknya
memperhatikan praktikum dengan seksama. Praktikum sudah berjalan
dengan baik dan lancar.
DAFTAR PUSTAKA
Chen X, Zheng B, Liu H. 2016. Optical and digital microscopic imaging
techniques and applications in pathology. Anal Cell Pathol (Amst) 34(2):
5-18.
Firdaus Z, Izza JN, Aruna A. 2022. Pengembangan mikroskop online interaktif
pada materi biologi sel guna revitalisasi pembelajaran praktikum daring.
JINoP (J Inovasi Pembelajaran) 8(1): 95-105.
Fischer ER, Hansen BT, Nair V et al. 2016. Scanning electron microscopy. Curr
Protoc Microbiol 2(2): 1-16. doi: 10.1002/9780471729259.mc02b02s25.
Irhami SN. 2019. Implementasi Pendekatan Konstekstual untuk Meningkatkan
Gairah Siswa dalam Pembelajaran Biologi di Madrasah Aliyah Negeri 02
Banyumas. J Kependidikan 7(1): 30-42.
Heuser JE. 2016. The origins and evolution of freeze-etch electron microscopy. J
Electron Microsc (Tokyo) 260(1): 23-29. doi: 10.1093/jmicro/dfr044.
PMID: 21844598; PMCID: PMC3202940.
Hongyuan J, Wang X, Zhou H et al. 2020. Comparison of Sample Preparation
Techniques for Inspection of Leaf Epidermises Using Light Microscopy
and Scanning Electronic Microscopy. Technical Advances in Plant
Science 11: 113-136.
Lavanya A, Sowmya SV, Rao RS et al. 2017. Troubleshooters in Light
Microscopy. World Journal of Dentistry 8(6): 511-518.
Leitão CAE. 2016. An Alternative Stage Micrometer For Use At Light
Microscope. J Perspectivas da Ciência e Tecnologia 8(2): 58-61.
Louk AC, Supardi HI, Suparta GB. 2019. Pemutakhiran Mikroskop Cahaya
Monokuler Menjadi Mikroskop Digital Untuk Pembelajaran Siswa SMA /
Sederajat. J Fisika Sains dan Aplikasinya 2(2): 101-104.
Merlina D. 2021. Pengembangan Kinerja Mikroskop Binokular Menjadi
Mikroskop Berkamera untuk Alat Praktikum dan Penelitian. Indonesian J
of Laboratory 4(1): 15-20.
Robika, Anggraeni, Irwanto R. 2023. Pelatihan Pembuatan Preparat Biologi
Sebagai Sarana Peningkatan Media Pembelajaran Bagi Guru-Guru Biologi
Di Kabupaten Bangka. J Pengabdian Kepada Masyarakat 2(11): 6805-
6813.
Salido J, Bueno G, Ruiz-Santaquiteria J et al. 2022. A review on low-cost
microscopes for Open Science. Microsc Res Tech 85(10): 3270-3283.
Somssich, M. 2022. A Short history of plant light microscopy. J of Current
Protocols 2(10): 577-606. doi: 10.1002/cpz1.577
Subali B, Yulianti I, Susilo et al. 2019. Implementasi Model Pelatihan
Pembelajaran IPA Berbasis DIGITAL IMAGE CREATOR FOR OPTICAL
MICROSCOPE (DIGICOM) pada Guru Fisika Kabupaten Demak. Unnes
Physics Education J 7(3): 91-96.
Sugianto S, Fitriani A, Anggraeni S et al. 2020. Pengembangan mikroskop digital
berbasis blended learning untuk meningkatkan kecerdasan jasmaniah
kinestetik mahasiswa pada praktikum anatomi tumbuhan. J Inovasi
Pendidikan Dan Sains 1(2): 53-58.
Suprapto PK, Ali M, Nuryadin P. 2019. Pelatihan Penggunaan dan Pemeliharaan
Mikroskop Bagi Guruguru Ipa Madrasah Tsanawiyah (MTS) di Wilayah
Kabupaten Tasikmalaya. J Pengabdian Siliwangi 4(1): 43-50.
II. PENGAMATAN PREPARAT KERING

A. Pendahuluan
1. Latar Belakang
Secara umum, mata manusia tidak didesain untuk dapat melihat
benda dengan berbagai ukuran. Manusia tidak bisa melihat benda
berukuran kecil atau mikro seperti bakteri, virus, dan struktur jaringan
daun dengan kasat mata. Diperlukan alat bantu khusus untuk melihat
benda berukuran mikro yang disebut dengan mikroskop. Mikroskop
adalah alat yang digunakan untuk melihat objek mikroskopis yang tidak
dapat dilihat oleh mata.
Praktikum kali ini adalah penggunaan preparat kering jaringan
tumbuhan sebagai objek untuk diamati menggunakan mikroskop. Tujuan
dari pengamatan preparat kering adalah agar mengetahui struktur-struktur
jaringan preparat tersebut. Preparat kering adalah sayatan dari jaringan
mikroskopis yang telah diawetkan (menggunakan formalin). Praktikum
kali ini menggunakan preparat kering daun karet merah (Fiscus elastica).
Pengamatan preparat sangat diperlukan alat bantu mikroskop karena
pada praktikum ini mengamati preparat jaringan. Pengamatan preparat
kering dengan mikroskop dilakukan dengan beberapa langkah-langkah
seperti mengatur lensa dan meja preparat. Langkah-langkah dalam
menggunakan mikroskop harus diperhatikan dan dilakukan dengan tepat
agar tidak terjadi kerusakan pada mikroskop.
2. Tujuan Praktikum
Tujuan praktikum ini adalah mendapatkan gambar mikroskopik
dengan menggunakan preparat jadi/preparat kering.

15
16

B. Tinjauan Pustaka
Preparat adalah gelas objek yang berisi sampel hewan, tumbuhan atau
benda hidup lainnya yang dapat diamati menggunakan mikroskop. Pembuatan
preparat mikroskopis dapat disesuaikan dengan sifat preparat masing-masing
jaringan. Sifat preparat mikroskopis ada tiga yaitu sementara, semi permanen,
dan permanen. Preparat sementara hanya untuk keperluan sementara dan
tidak untuk disimpan dalam jangka waktu lama. Preparat semi permanen
adalah sediaan yang dapat disimpan dalam jangka waktu beberapa bulan
sedangkan preparat permanen dapat disimpan dalam jangka waktu lebih lama
(bertahun-tahun). Preparat semi permanen dan permanen adalah preparat
awetan atau preparat yang sudah diawetkan melalui beberapa metode (Robika
et al. 2023).
Keuntungan penggunaan media berupa specimen atau preparat awetan
antara lain adalah sebagai berikut: efektif mengenalkan gejala struktural
objek, mudah dilakukan penyimpanan, tidak merusak sumberdaya alam,
mudah dibawa atau dipindahkan dan memudahkan pengenalan objek,
terutama untuk objek yang sulit ditemukan, karena terbatas atau tidak setiap
saat tersedia. Definisi preparat kering yaitu preparat basah yang diawetkan
dengan cara fiksasi dan disimpan dalam wadah dengan diberi komponen satu
macam zat seperti formalin (Setiati et al. 2021).
Formalin digunakan untuk fiksasi hasil sayatan pada jaringan
organisme. Jaringan yang telah difiksasi dengan formalin buffer fosfat 10%
selama kurang lebih 5 tahun, menunjukkan bahwa jaringan dapat tetap dapat
digunakan untuk pengamatan setelah jangka waktu yang relatif
lama. Penggunaan formalin dapat meningkatkan fleksibilitas preparat,
sehingga metode ini dapat diterapkan (Shigano et al. 2016).
Formalin memiliki unsur aldehid yang mudah bereaksi dengan protein,
ketika diberikan ke jaringan formalin akan mengikat unsur protein mulai dari
bagian permukaan jaringan sampai ke bagian dalamnya. Matinya protein
setelah terikat unsur kimia dari formalin akan membuat jaringan tidak akan
diserang bakteri pembusuk yang menghasilkan senyawa asam, sehingga
17

preparat akan menjadi lebih awet. Formalin tersebut mengikat dengan protein
serta senyawa lain dan sisanya tetap dalam bentuk formalin bebas yang
kemudian akan diserap ke dalam jaringan (daging). Jaringan akan terlindungi
dari udara luar sehingga penguapan terjadi sangat lambat (Dewi 2019).
Sel epidermis adalah jaringan yang terdapat di atas dan bawah jaringan
daun, berfungsi melindungi bagian-bagian di bawahnya dan di atasnya.
Jaringan pengangkut adalah xilem yang berfungsi mengalirkan air dan
mineral dan floem yang berfungsi menyalurkan hasil fotosintesis ke seluruh
bagian tumbuhan. Jaringan palisade dan spons sama-sama berfungsi sebagai
tempat berlangsungnya fotosintesis, tetapi penelitian menunjukkan bahwa
jaringan palisade lebih banyak memiliki kloroplas sehingga lebih sering
terjadi fotosintesis di jaringan palisade dengan cahaya langsung. Jaringan
spons juga berfungsi sebagai tempat penyimpanan sementara hasil
fotosintesis (Xiao et al. 2016).
Pada daun karet merah terdapat sistolit. Sistolit atau kristal kalium
oksalat berada di Sel litokis yaitu senyawa metabolit sekunder. Kristal ini
terbentuk akibat adanya aktivitas metabolisme dalam tumbuhan. Sistolit
memiliki fungsi seperti metabolit sekunder pada umumnya, yaitu
mempertahankan bentuk dan tekstur daun. Secara otomatis, sistolit dapat
melindungi bagian-bagian daun lainnya (Febriyani et al. 2022).
18

C. Metodologi Praktikum
1. Waktu dan Tempat
Praktikum Sitogenetika mengenai mengenal mikroskop dilaksanakan
di Ruang Sidang Pemuliaan Tanaman Gedung C Lantai 2 FP UNS pada
tanggal 26 Oktober 2023 pukul 11 WIB.
2. Alat dan Bahan
Alat dan bahan yang digunakan untuk acara 2 tentang pengamatan
preparat kering adalah sebagai berikut.
a. Mikroskop
b. Preparat kering
3. Cara Kerja
a. Mengatur meja preparat dalam permukaan yang darat agar
memudahkan pengamatan.
b. Mengatur perbesaran lensa objektif pada fase yang lebih rendah
menggunakan revolver (10X).
c. Menyalakan lampu dan atur sedemikian rupa agar jumlah sinar yang
diperlukan dapatcterpenuhi untuk melakukan pengamatan preparat.
d. Membuka diafragma dengan menggunakan tuas dan sesuaikan
lubangnya agar sinar yang diterima mata dapat optimal, tidak terlalu
redup maupun terang.
e. Memastikan lensa objektif berada cukup jauh dari meja preparat
dengan cara mengatur makrometer searah jarum jam.
f. Meletakkan preparat jadi/kering yang telah disiapkan pada meja
preparat, tepat di bawah lensa objektif. Menggunakan penjepit agar
preparat tidak bergeser.
g. Menaikkan meja preparat mendekati lensa objektif hingga berjarak
sekitar 0.5 cm dengan menggunakan makrometer.
h. Melihat bayangan benda melalui lensa okuler sambil menaikturunkan
meja preparat menggunakan mikrometer agar mendapatkan bayangan
objek yang jelas.
19

i. Melihatl objek preparat dari arah samping sambil menyesuaikan lensa


objektif dengan perbesaran yang lebih tinggi pada kedudukannya.
j. Memastikan lensa objektif tidak bersentuhan dengan preparat karena
dapat merusak lensa.
k. Memfokuskan preparat dengan cara memutar mikrometer ke arah
berlawanan jarum jam dengan perlahan.
l. Jika hasil pengamatan belum terlihat jelas maka mengatur
pencahayaan.
m. Jika telah mendapatkan gambar yang jelas. Memfoto dan menggambar
hasil pengamatan
n. Memutar revolver pada perbesaran yang lebih besar (40X), dan
menggambar/memfoto hasil pengamatan.
o. Memutar revolver pada lensa objektif ke keadaan semula yaitu
perbesaran paling kecil setelah Anda selesai melakuka pengamatan.
p. Menurunkan meja preparat dan naikkan tabung mikroskop.
q. Mengambil preparat dari meja preparat dan kembalikan/simpan
preparat pada tempat semula.
20

D. Hasil Pengamatan dan Pembahasan


1. Hasil Pengamatan

Gambar 2.1 Penampang Melintang Gambar 2.2 Penampang Melintang


Daun Karet Merah Daun Karet Merah
( Ficus elastica) pada ( Ficus elastica)
Mikroskop

Tabe

T
21

Tabel 2.1 Bagian Sel Daun Karet Merah (Ficus elastica) dan Fungsinya
No Bagian Sel Daun Karet
Fungsi
. Merah
Memberikan perlindungan fisik
terhadap hilangnya kadar air dan
1. Epidermis atas
kerusakan mekanis pada jaringan
di bawahnya
sebagai tempat di mana
fotosintesis berlangsung karena
klorofil banyak terkandung di
2. Palisade atas
jaringan ini sehingga dapat
menyerap cahaya matahari untuk
energi
Jaringan xilem berfungsi untuk
mengangkut air dan garam
3. Jaringan pengangkut mineral, sedangkan jaringan
floem berfungsi untuk
mengangkut hasil fotosintesis
untuk melindungi jaringan daun
4. Epidermis bawah
di atasnya
Tempat berlangsungnya proses
5. Palisade bawah
fotosintesis
sebagai tempat penyimpanan
sementara hasil fotosintesis yang
6. Jaringan spons
berupa oksigen dan tempat
terjadinya fotosintesis
untuk pelindungan dan
7. Sistolit
mempertahankan bentuk daun
Sumber : Laporan Sementara
22

2. Pembahasan
Langkah pertama yang dilakukan untuk mengamati preparat di
mikroskop adalah mengatur meja preparat dalam permukaan yang darat
agar memudahkan pengamatan. Mengatur perbesaran lensa objektif pada
fase yang lebih rendah menggunakan revolver (10X). Menurut Subali et al.
(2019), untuk dapat melihat objek preparat dengan jelas, harus menggeser
lensa okuler dengan memutar makrometer untuk secara kasar dan
mikrometer secara halus. Menyalakan lampu dan atur sedemikian rupa
agar jumlah sinar yang diperlukan dapat terpenuhi untuk melakukan
pengamatan preparat. Membuka diafragma dengan menggunakan tuas dan
sesuaikan lubangnya agar sinar yang diterima mata dapat optimal, tidak
terlalu redup maupun terang. Memastikan lensa objektif berada cukup jauh
dari meja preparat dengan cara mengatur makrometer searah jarum jam.
Menurut Thorn (2016), lensa objektif merupakan bagian terpenting yang
digunakan untuk melihat preparat melalui perbesaran yang diinginkan
dengan memutar revolver.
Preparat jadi/kering diletakkan di bawah lensa objektif dan dijepit
dengan penjepit agar preparat tidak bergeser. Menaikkan meja preparat
mendekati lensa objektif hingga berjarak sekitar 0.5 cm dengan
menggunakan makrometer. Melihat bayangan benda melalui lensa okuler
sambil mengatur meja preparat menggunakan mikrometer agar
mendapatkan bayangan objek yang jelas. Melihat objek preparat dari arah
samping sambil menyesuaikan lensa objektif dengan perbesaran yang lebih
tinggi pada kedudukannya. Memfokuskan preparat dengan cara memutar
mikrometer ke arah berlawanan jarum jam dengan perlahan. Jika hasil
pengamatan belum terlihat jelas maka mengatur pencahayaan. Memutar
revolver pada perbesaran yang lebih besar (40X) untuk pengamatan yang
lebih besar sehingga lebih jelas. Menurut Mertha et al. (2019), pengamatan
pada preparat diamati dengan perbesaran kecil hingga perbesaran besar
untuk mempermudah saat pengamatan preparat. Memutar revolver pada
lensa objektif ke keadaan semula yaitu perbesaran paling kecil setelah
23

Anda selesai melakukan pengamatan. Menurunkan meja preparat dan


naikkan tabung mikroskop. Mengambil preparat dari meja preparat dan
kembalikan/simpan preparat pada tempat semula.
Bagian-bagian sel jaringan daun karet adalah epidermis atas dan
bawah, palisade atas dan bawah, jaringan pengangkut, jaringan spons dan
sistolit. Bagian terluar daun terdapat epidermis yang ada di atas dan bawah
daun. Menurut Zuch et al. (2022), sebagai lapisan terluar pada tumbuhan,
epidermis berfungsi sebagai penghubung penting antara tumbuhan dan
lingkungan, yaitu jaringan penjaga jaringan dan sel daun yang lain. Bagian
daun karet juga terdapat jaringan pengangkut seperti jaringan daun pada
umumnya. Jaringan pengangkut terdiri dari xilem dan floem yang terdapat
pada organ daun, batang dan akar tumbuhan. Menurut Punjungsari dan
Ulfa (2022), jaringan pengangkut xylem memiliki tugas untuk mengangkut
ion-ion dari tanah termasuk aluminium, sedangkan floem bertugas untuk
mengangkut senyawa hasil fotosintesis dari daun keseluruh bagian
tumbuhan.
Jaringan daun karet juga terdapat jaringan palisade dan jaringan
spons seperti daun pada umumnya. Jaringan palisade terdapat di atas dan
bawah daun. Fotosintesis berlangsung karena klorofil banyak terkandung
di jaringan ini sehingga dapat menyerap cahaya matahari untuk energi.
Jaringan spons hanya terdapat di satu bagian yaitu di antara jaringan
palisade bawah dan jaringan pengangkut. Jaringan spons sebagai tempat
penyimpanan sementara hasil fotosintesis yang berupa oksigen dan tempat
terjadinya fotosintesis. Jaringan daun karet merah juga terdapat metabolis
sekunder di dalam sel litosis, yaitu sistolit. Sistolit berfungsi untuk
mempertahankan bentuk daun dan membuat daun menjadi kokoh. Menurut
Dewi et al. (2022), keberadaan kristal khususnya sel litosis yang
mengandung kristal sistolit bertangkai pada Ficus sp. dapat dibedakan
keberadaannya pada salah satu sisi daun, yaitu hanya pada sisi abaksial
atau adaksial, atau dapat juga ditemukan pada kedua sisi daun.
24

E. Kesimpulan dan Saran


1. Kesimpulan
Berdasarkan praktikum acara 2 mengenai pengamatan preparat
kering dapat ditarik kesimpulan sebagai berikut.
a. Preparat kering adalah sayatan dari jaringan mikroskopis yang telah
diawetkan (menggunakan formalin).
b. Bagian-bagian sel jaringan daun karet adalah epidermis atas dan
bawah, palisade atas dan bawah, jaringan pengangkut, jaringan spons
dan sistolit yang memiliki fungsi untuk melindungi jaringan, tempat
untuk fotosintesis, mengangkut garam mineral dan hasil fotosintesis,
serta mempertahankan bentuk daun.
c. Mengamati preparat menggunakan mikroskop dilakukan dengan
langkah-langkah seperti mengatur lensa okuler, lensa objektif dan meja
preparat menggunakan pemutar seperti mikrometer, makrometer,
pemutar meja preparat dan revolver.
2. Saran
Saran yang dapat diberikan untuk praktikum acara dua mengenai
pengamatan preparat kering adalah Co-Ass diharapkan mendampingi
praktikkan tata cara penggunaan mikroskop secara langsung. Praktikkan
sebaiknya melakukan pengaturan ke mikroskop secara mandiri. Praktikum
yang dilakukan sudah berjalan dengan lancar.
DAFTAR PUSTAKA
Dewi AP, Peniwidiyanti, Irsyam ASD et al. 2022. Karakter mikromorfologi daun
Ficus spp. Rekaman baru di jawa. J Floribunda 6(8): 288-300.
Dewi SR. 2019. Identifikasi formalin pada makanan menggunakan ekstrak kulit
buah naga. J Nasional Ilmu Kesehatan (JNIK) 2(1): 45-51.
Febriyani H, Puspitawati RP, Bashri A. 2022. Variasi struktur anatomi dan
sekretori pada spesies annona yang berpotensi sebagai tanaman obat. J
Lentera Bio 11(3): 575-585.
Mertha IG, Al Idrus A, Bahri S et al. 2019. Pelatihan Pembuatan Preparat Squash
jung Akar Untuk Pengamatan Kromosom Pada Guru-Guru Biologi di Kota
Mataram. J Pendidikan dan Pengabdian Masyarakat 2(4): 16-23.
Punjungsari TN, Ulfa F. 2022. Jaringan pengangkut tanaman pepaya (Carica
papaya l.) Yang tumbuh pada tanah tinggi alumunium. J Viabel Pertanian,
16(1): 74-81.
Robika Anggraeni, Irwanto R. 2023. Pelatihan pembuatan preparat biologi
sebagai sarana peningkatan media pembelajaran bagi guru-guru biologi di
Kabupaten Bangka. J Pengabdian Kepada Masyarakat 2(11): 6805-6812.
Setiati N, Indriyanti DR, Rudyatmi E et al. 2021. Pengembangan media
pembelajaran daring melalui video pembuatan berbagai awetan hewan
bagi Guru IPA-Biologi Sekecamatan Gunungpati Kota Semarang. J of
Community Empowerment 1(1): 12-18.
Shigano M, Takashima R, Takashawa H et al. 2016. Optimization of specimen
preparation from formalin-fixed liver tissues for liver micronucleus assays:
Hepatocyte staining with fluorescent dyes. J Mutation Research/Genetic
Toxicology and Environmental Mutagenesis, 800(1): 35-39.
Subali B, Yulianti I, Susilo et al. 2019. Implementasi model pelatihan
pembelajaran ipa berbasis digital image creator for optical microscope
(digicom) pada guru fisika Kabupaten Demak. Unnes Physics Education
Journal 7(3): 91-96.
Thorn K. 2016. A quick guide to light microscopy in cell biology. J of Mol Biol
Cell. 27(2): 219-222.
Xiao Y, Tholen D, Zhu XG. 2016. The influence of leaf anatomy on the internal
light environment and photosynthetic electron transport rate: exploration
with a new leaf ray tracing model. J Exp Bot. 67(21): 6021-6035.
Zuch DT, Doyle SM, Majda M et al. 2022. Cell biology of the leaf epidermis:
Fate specification, morphogenesis, and coordination. J Plant Cell 34(1):
209-227.
III. PEMBUATAN PREPARAT KROMOSOM TANAMAN

A. Pendahuluan
1. Latar Belakang
Kromosom merupakan objek kajian yang penting dalam
sitogenetika. Kromosom adalah suatu badan dalam sel hidup yang
mengandung materi genetik. Secara kimia, kromosom terdiri atas DNA,
protein histon, dan protein non histon. DNA adalah bahan yang
mengandung informasi genetik. Sebagian besar DNA suatu organisme
berada pada suatu badan yang disebut kromosom.
Pembuatan preparat (sediaan) kromosom merupakan tahap kegiatan
penting dalam pengamatan (penelitian) kromosom suatu jenis tanaman.
Pengamatan kromosom dilakukan dengan pembuatan preparat mikroskopis
dan pengamatan kromosom dengan mikroskop. Pengamatan kromosom
biasanya dilakukan pada metafase mitosis, karena pada fase tersebut
kromosom telah mengalami kontraksi maksimum menjadi lebih pendek
dan tebal sehingga mudah diamati. Pada pewarnaan sederhana, kromosom
tampak sebagai struktur yang homogen, sehingga hanya dapat diketahui
jumlah, bentuk dan ukuran kromosom.
Pembuatan preparat kromosom dapat dilakukan dengan metode
Squash (pencet) dengan tahapan kegiatan yaitu yang pertama pengambilan
bahan tanam berupa jaringan meristematik, kedua pra-perlakuan, ketiga
fiksasi, keempat Maserasi, kelima Pengecatan, dan dan Squash
(Pemencetan). Setiap jenis tanaman diperlukan optimasi, yaitu penentuan
bahan dan cara pelaksanaan yang optimal pada setiap tahapan kegiatan
pembuatan preparat, agar diperoleh preparat yang baik.
2. Tujuan
Tujuan praktikum Sitogenetika Acara 3, yaitu Pembuatan Preparat
Kromosom Tanaman adalah sebagai berikut:
a. Mempelajari teknik/metode pembuatan preparat mikroskopis untuk
pengamatan kromosom tanaman.

26
27

b. Menentukan (optimasi) prosedur pembuatan preparat mikroskopis untuk


pengamatan kromosom suatu jenis tanaman.
28

B. Tinjauan Pustaka
Bawang merah adalah tanaman yang banyak dimanfaatkan dan
dibudidayakan. Tanaman ini sering digunakan pada pengamatan mitosis
karena memiliki pertumbuhan yang cepat, mudah didapat, dan harganya
terjangkau. Pengamatan mitosis yang menggunakan akar bawang merah akan
memudahkan pengamatan karena memiliki jumlah kromosom yang sedikit
dan berukuran besar (Abdullah et al. 2019).
Bawang merah merupakan spesies diploid (2 n = 2 x = 16) dengan
ukuran genom kira-kira. 16.400 Mb/1C. Data tersebut menunjukkan bahwa
bawang merah adalah tanaman diploid terbesar yang dibudidayakanF. Ukuran
genom yang besar sering dikaitkan dengan akumulasi kromosom yang
berulang. Hal tersebut memudahkan pengamatan kromosom pada preparat.
Bawang merah sering digunakan sebagai preparat mitosis dalam pengamatan
kromosom (Finkers et al. 2021).
Pembuatan sediaan atau preparat kromosom untuk pengamatan proses
mitosis dan morfologi kromosom umumnya dilakukan menggunakan teknik
yang sangat sederhana, yaitu metode squash. Untuk menghasikan Adanya
preparat squash ujung akar bawang (Allium cepa) tanpa perlakuan zat
antimitosis, dapat dengan mudah menemukan fase-fase mitosis yang
mencakup profase, metafase, anafase dan telofase dibawah mikroskop
(Mertha et al. 2019). Metode squash adalah suatu metode untuk memperoleh
kaca objek dengan cara meremas suatu potongan jaringan atau suatu
organisme secara keseluruhan sehingga kaca objek tipis dapat diamati di
bawah mikroskop. Kriteria preparat yang baik yang dimaksud dalam metode
pembelahan sel squash adalah memperlihatkan sel-sel yang merupakan sel
yang saling tersebar, tidak terakumulasi dan membentuk satu lapisan sel, serta
fase pembelahan sel dan kromosom tampak berwarna (Susilawati 2020).
Metode squash adalah metode yang digunakan untuk mendapatkan
suatu sediaan dengan cara memencet suatu potongan jaringan sehingga
kromosom dapat menyebar dan dapat diamati di bawah mikroskop. Tahapan
dalam metode squash yaitu pemilihan sampel, perendaman bahan dengan
29

larutan perlakuan awal, fiksasi, hidrolisis, pewarnaan dan pembuatan preparat


dengan cara memencet (squash). Tahapan terakhir adalah squashing dengan
cara menekan kaca penutup menggunakan tissue dan tangan. Kaca penutup
diketuk-ketuk menggunakan ujung pensil agar sel-sel pucuk daun menyebar
(Iriani et al. 2019).
Teknik pita kromosom secara umum dibagi menjadi dua jenis: (1) pita
yang tersebar di seluruh kromosom, misalnya pita Giemsa-tripsin (G-
banding), pita Q, dan pita R yang paling sering digunakan; (2) pita terletak di
wilayah kromosom tertentu, termasuk pita C (heterokromatin konstitutif),
pewarnaan Ag-NOR (wilayah pengatur nukleolus), dan pita T
(telomer). Setiap kromosom memiliki pola pita unik yang dapat diidentifikasi
secara andal berdasarkan teknik pita yang sesuai. Pita yang bernoda gelap
akibat perlakuan tertentu mungkin tampak bernoda terang pada perlakuan
lain. G-banding adalah metode yang paling sering digunakan di laboratorium
klinis karena stabilitas dan efektivitas biaya. Teknik pengamatan tersebut
membutuhkan pewarnaan dengan giemsa. Diagnosis mikroskopis yang akurat
memerlukan apusan berkualitas tinggi dan untuk mencapai hal ini, pewarnaan
apusan yang tepat adalah suatu keharusan. Pewarna yang umum digunakan
adalah pewarna Romanowsky berair, seperti pewarna Field’s dan JSB, atau
pewarna Romanowsky berbahan dasar alkohol, seperti pewarna Giemsa,
Leishman, dan Wright (Zhu et al. 2019).
30

C. Metode Praktikum
1. Waktu dan Tempat
Praktikum Sitogenetika Acara 3 yaitu Pembuatan Preparat
Kromosom Tanaman dilaksanakan pada hari Kamis, 16 November 2023
pukul 11.00 – 12.00 WIB. Praktikum dilaksanakan di Ruang Sidang Akhir
Pemuliaan Tanaman Gedung D Lantai 2 Fakultas Pertanian Universitas
Sebelas Maret Surakarta
2. Alat dan Bahan
Alat dan bahan yang digunakan untuk pembuatan preparat
kromosom tanaman adalah sebagai berikut.
a. Jaringan meristimatis bawang merah (Allium cepa L.)
b. Object glass dan deglass
c. Mikroskop Binokuler
d. Pinset
e. Gunting
f. Jarum pentul
g. Pensil berpenghapus
h. Larutan aceto-orcein
i. Bahan lain: asam acetat 45%, HCl 1N, aquades, gliserin
3. Cara Kerja
Metode Pemencetan (squashing) dan pengecatan aceto-orcein
a. Mengambil cuplikan bahan tanam berupa ujung akar/daun
b. Melakukan Pra-perlakuan untuk memperoleh penyebaran kromosom
dengan air es (cold water), yakni bahan direndam selama 24 jam.
c. Fiksasi untuk mematikan sel dengan larutan asam asetat 45 %
d. Hidrolisis menggunakan larutan HCl 1N (5-10 menit suhu kamar)
e. Pewarnaan kromosom dengan larutan aceto-orcein 2%
f. Pemencetan (squashing) cuplikan bahan tanam pada obyek glas.
g. Mengamati kromosom menggunakan mikroskop (digambar/difoto).
h. Evaluasi kualitas preparat berdasar foto kromosom.
31

D. Hasil Pengamatan dan Pembahasan


1. Hasil Pengamatan

Memasukan cuplikan akar bawang Memasukkan cuplikan akar


merah ke aquades sebanyak 3 kali bawang merah ke lemari es
selama 24 jam

Memasukkan cuplikan akar bawang Memasukkan cuplikan ke asam


merah ke aquades 3 kali asetat 45% 20 menit

Mencelupkan cuplikan ke HCN 1N 5 Memasukkan cuplikan ke aquades


menit 3 kali
32

Mengambil cuplikan dan diletakkan Mencelupkan cuplikan ke Aceto-


di kaca preparat lalu ditetesi dengan orcein 2% 1 menit
gliserin

Menutup dengan de glass lalu


dilakukan metode pemencetan
(squeeze)

Gambar 3.1 Skema Pembuatan Preparat Kromosom Tanaman dengan pra


Perlakuan

Memasukkan cuplikan akar bawang Memasukkan cuplikan ke asam


merah ke aquades 3 kali asetat 45% 20 menit
33

Memasukkan cuplikan ke aquades


3 kali

Mencelupkan cuplikan ke HCN 1N 5


menit

Mengambil cuplikan dan diletakkan Mencelupkan cuplikan ke Aceto-


di kaca preparat lalu ditetesi dengan orcein 2% 1 menit
gliserin

Menutup dengan de glass lalu


dilakukan metode pemencetan
(squeeze)

Gambar 3.2 Skema Pembuatan Preparat Kromosom Tanaman tanpa pra


Perlakuan
34

Tabel 3.1 Hasil Pengamatan Preparat Kromosom Bawang Merah (Allium cepa L.)
Evaluasi Kualitas Preparat
Metod Pra Kejelasan Kejelasan
Fiksasi Hasil Foto Preparat Kromosom Kejernihan Penyebaran
e Perlakuan Gambar Warna
Sitoplasma Kromosom
Kromosom Kromosom

Asam Gambar 3.3 Kromosom Tanpa


Asetat A.Asetat (1 Jam) Jernih Agak
1 Tanpa Jelas Jelas
45% (1 tersebar
jam)

Metod Pra Fiksasi Hasil Foto Preparat Kromosom


e Perlakuan Evaluasi Kualitas Preparat

Kejernihan Kejelasan Kejelasan Penyebaran


Sitoplasma Gambar Warna Kromosom
35

Kromosom Kromosom

Asam
Asetat Kurang Tidak
2 Air Es Agak jelas Agak jelas
45% (1 Jernih tersebar
jam)
Gambar 3.4 Kromosom Air Es
A.Asetat (1 Jam)

Asam
Asetat Agak
3 Tanpa Agak Jernih Agak Jelas Agak Jelas
45% (3 tersebar
jam)
Gambar 3.5 Kromosom Tanpa
A.Asetat (3 Jam)

Evaluasi Kualitas Preparat


Metod Pra Kejelasan Kejelasan
Fiksasi Hasil Foto Preparat Kromosom Kejernihan Penyebaran
e Perlakuan Gambar Warna
Sitoplasma Kromosom
Kromosom Kromosom
36

Asam
Asetat Tidak
4 Air Es Tidak Jernih Tidak jelas Tidak jelas
45% (3 tersebar
jam)

Gambar 3.6 Kromosom Air Es


A.Asetat (3 Jam)
Sumber : Laporan Sementara
37

Tabel 3.2 Fase-fase Mitosis Kromosom Bawang Merah (Allium cepa L.)

Foto Interfase Foto Profase Foto Metafase Foto Anafase Foto Telofase

Gambar 3.1 Interfase Gambar 3.2 Profase Gambar 3.3 Metafase Gambar 3.4 Anafase Gambar 3. 5 Telofase
38

2. Pembahasan
Langkah-langkah pembuatan preparat kromosom adalah dapat
dimulai dengan penentuan bahan tanam, dapat berupa ujung daun atau
ujung akar. Sampel bahan tanam dimasukkan ke dalam aquades
sebanyak 3 kali. Untuk pra perlakuan sampel dilakukan penyimpanan
di kulkas selama 24 jam. Sayatan dimasukkan ke asam asetat selama
45% selama 20 menit setelah dilakukan pra perlakuan, maupun yang
tidak dilakukan pra perlakuan. Menurut Dafrita dan Sari (2020),
fiksasi dilakukan dengan larutan asam asetat glasial 45% kurang lebih
20 menit setelah itu, potongan ujung akar tersebut dicuci dengan
akuades sebanyak 3 kali pengulangan. Preparat yang sudah dicuci
dengan akuades sebanyak 3 pengulangan, dimasukkan ke HCl 1N
selama 5 menit. Menurut Aziz (2019), proses maserasi dilakukan
dengan menggunakan larutan HCl 1N selama 15 menit, maserasi
bertujuan untuk melisiskan lamela tengah.
Preparat yang sudah dicuci dengan akuades sebanyak 3
pengulangan, preparat dimasukkan ke aceto orcein 2% selama 1 menit
untuk pewarnaan. Preparat yang sudah dilakukan pewarnaan
diletakkan di kaca preparadan ditetesi dengan larutan gliserin. Tahap
selanjutnya preparat ditutup dengan de glass dan dilakukan
pemencetan (squashing). Menurut Yuniastuti et al. (2023), metode
squash pada preparat dapat dilakukan dengan menggunakan ujung
kuas atau karet penghapus di atas preparat yang sudah ditutup de
glass.
Tujuan dilakukannya fiksasi adalah untuk membuat struktur
unsur-unsur jaringan menjadi stabil, tidak mengalami perubahan
(post-mortem) pasca kematian. Apabila individu mati maka ada
dua hal yang bisa merusak struktur jaringan yaitu pengaruh enzim
proteolitik dan pengaruh bakteri pembusuk. Menurut Rusmiatik
(2019) dengan fiksasi, jaringan lebih tahan terhadap perlakuan dan
dapat menaikkan indeks bias jaringan. Hidrolisis adalah kegiatan
39

merendam preparat pada larutan asam atau garam atau basa untuk
memisahkan molekul air. Menurut Sari dan Harlita (2020) hidrolisis
adalah suatu usaha untuk melunakkan elemen-elemen sel atau

jaringan, sehingga mudah menyerap warna. Ujung akar yang lunak


memudahkan proses squashing (pemencetan). Jaringan mudah
menerap zat warna sehingga bagian-bagian dalam sel tersebut mudah
terlihat di bawah mikroskop.
Pewarnaan pada pembuatan preparat penting untuk pengamatan
preparat dalam mikroskop. Menurut Jannah et al. (2019) penggunaan
pewarna pada preparat bertujuan untuk mempertajam dan
memperjelas gambaran sel-sel sehingga mempermudah untuk diteliti
di bawah mikroskop. Zat warna memiliki afinitas selektif terhadap
bagian-bagian sel dan jaringan yang berbeda. Hal tersebut dapat lebih
mudah membedakan bagian sel satu dengan yang lain.
Pra perlakuan air dingin terhadap kromosom menyebabkan pola
kromosom yang semakin padat dan kurang menyebar. Menurut
Kobayashi et al. (2021), semakin lama perendaman kromosom ke
dalam air dingin maka kromosom semakin padat dan kurang
menyebar. Kepadatan kromosom menyebabkan kromosom menjadi
sulit untuk diamati. Perlakuan asam asetat selama tiga jam
menghasilkan warna yang tetap jelas, tetapi kromosom lebih besar dan
kejernihan berkurang. Menurut Ami et al. (2017), asam asetat
menyebabkan peningkatan volume sel secara dramatis, diikuti dengan
penyebaran dan pembengkakan kromosom, yang juga meningkatkan
dimensinya hingga lima kali lipat atau lebih.
Hasil pengamatan dari empat perlakuan preparat bawang merah
yang paling bagus adalah tanpa pra perlakuan dan direndam asam
asetat 45% selama 1 jam. Perlakuan tersebut menunjukkan sitoplasma
yang jernih, kromosom yang jelas, warna kromosom jelas, dan
penyebaran kromosom agak tersebar. Menurut Marina et al. (2017),
terdapat bukti bahwa perubahan sitoplasma setelah penggunaan asam
40

asetat berkontribusi terhadap pemutihan aseto. Asam asetat dapat


memudarkan kejernihan sitoplasma, sehingga perlakuan kromosom
dengan merendam asetat masih menghasilkan sitoplasma yang jernih.
Terdapat empat fase pembelahan mitosis, yaitu profase,
metafase, anafase, dan telophase. Fase interfase, terjadi proses
persiapan dan penimbunan energi oleh sel untuk melakukan
pembelahan. Selama interfase, inti sel (nukleus) dan anak inti sel
(nukleolus) tampak terlihat jelas. Kromosom pada sel tidak terlihat
karena masih dalam bentuk kromatin, yaitu benang-benang halus yang
tersusun atas molekul DNA, RNA, dan protein. Menurut Probowati
dan Putranti (2020), interfase dan mitosis tidak terjadi secara bersama-
sama pada sel-sel yang menyusun makhluk hidup, artinya pada waktu
tertentu ada sel yang sedang mengalami interfase dan bersamaan
dengan itu ada pula yang sedang mengalami mitosis.
Pada awal profase, sentrosom mengalami replikasi, sehingga
menghasilkan dua sentrosom. Setiap sentrosom akan bergerak ke
kutub-kutub inti sel yang letaknya berlawanan. Di saat yang
bersamaan, mikrotubulus mulai terlihat di antara dua sentrosom.
Mikrotubulus ini merupakan serat protein panjang yang memanjang
dari sentriol ke segala arah. Mikrotubulus akan membentuk seperti
gulungan benang yang bisa kita sebut dengan benang-benang spindel.
Menurut McIntosch (2019), pada fase ini benang-benang kromatin
mulai memadat dan mengalami penebalan yang kemudian membentuk
kromosom.
Tahap anafase nukleus dan membran inti sel sudah tidak terlihat.
Masing-masing kinetokor pada sentromer dihubungkan ke satu
sentrosom oleh benang-benang spindel. Pasangan kromatid bergerak
ke bagian tengah sel (bidang ekuator) dan membentuk lempeng
metafase. Posisi kromosom yang terletak pada bagian tengah sel ini
membuat jumlah kromosom dapat dihitung dengan tepat dan bentuk
kromosom juga dapat diamati dengan jelas. Tahap anafase ditandai
41

dengan pemisahan kromatid dari bagian sentromer yang kemudian


membentuk kromosom baru. Masing-masing kromosom ditarik oleh
benang-benang spindel menuju kutub yang berlawanan. Jumlah
kromosom yang menuju ke kutub yang satu akan sama dengan jumlah
kromosom yang menuju ke kutub lainnya. Tahap akhir anafase,
kromosom hampir sampai ke kutubnya masing-masing. Sitokinesis
terjadi pada fase ini, yaitu fase pembelahan atau pemisahan
sitoplasma, organel, dan membran selular. Pembelahan ini dimulai
dari luar sel (membran sel) menuju ke bagian tengah sel, sehingga
akan menghasilkan dua sel yang disebut sel anak.
Tahap akhir pembelahan sel mitosis yaitu tahap telofase. Pada
tahap ini, kromosom telah sampai di kutubnya masing-masing.
Benang-benang spindel mulai menghilang dan membran inti sel juga
mulai terbentuk di antara dua kelompok kromosom yang terpisah.
Menurut Kurinianingsih et al. (2021), pada tahap telofase, kromosom
mulai mengendur, sel membelah menjadi dua dengan terbentuknya
dinding sel yang baru. Kromosom semakin lama akan menipis dan
berubah menjadi benang-benang kromatin kembali.
42

E. Kesimpulan dan Saran


1. Kesimpulan
Berdasarkan Praktikum Acara 3 mengenai pembuatan kromosom
tanaman dapat ditarik kesimpulan yaitu sebagai berikut.
a. Tahapan pembuatan preparat kromosom yaitu pra perlakuan apabila
diberikan, fiksasi menggunakan asam asetat, hidrolisis menggunakan
HC1 1 N dan pewarnaan.
b. Tujuan dilakukannya fiksasi adalah untuk membuat struktur unsur-
unsur jaringan menjadi stabil. Hidrolisis adalah suatu usaha untuk

melunakkan elemen-elemen sel atau jaringan, sehingga mudah


menyerap warna. Penggunaan pewarna pada preparat bertujuan untuk
mempertajam dan memperjelas gambaran sel-sel sehingga
mempermudah untuk diteliti di bawah mikroskop.
c. Hasil pengamatan dari empat perlakuan preparat bawang merah yang
paling bagus adalah tanpa pra perlakuan dan direndam asam asetat
45% selama 1 jam. Pra perlakuan air dingin terhadap kromosom
menyebabkan pola kromosom yang semakin padat dan kurang
menyebar. Asam asetat menyebabkan peningkatan volume sel secara
dramatis, penyebaran kromosom, pembengkakan kromosom dan
memudarnya kejernihan sitoplasma.
d. Interfase adalah fase istirahat sel menuju pembelahan mitosis.
Terdapat empat fase pembelahan mitosis, yaitu profase, metafase,
anafase, dan telophase.
2. Saran
Saran yang dapat diberikan pada praktikum sitogenetika Acara 3
sudah baik dan lancar. Semoga kedepannya fasilitas laboratorium
ditambah sesuai kelengkapan.
DAFTAR PUSTAKA
Abdullah FN, Jaya AS, Widayat. 2019. Penentuan waktu perendaman sel (fase
mitosis) akar bawang merah (Allium ascalonicum L.) menggunakan safranin
untukmendukung praktikum biologi. J BIOLEUSER 1(3): 86-91.
Ami D, Di Segni M, Forcella M et al. 2017. Role of water in chromosome
spreading and swelling induced by acetic acid treatment: a FTIR
spectroscopy study. Eur J Histochem. 58(1): 2330-2338.
Aziz IR. 2019. Kromosom tumbuhan sebagai marka genetik. J Teknosains13(2):
125 – 131
Dafrita IE, Sari M. 2020. Senduduk dan ubi jalar ungu sebagai pewarna preparat
squash akar bawang merah. J Pendidikan Biologi 5(1): 46-55.
Finkers R, van Kaauwen M, Ament K et al. 2021. Insights from the first genome
assembly of Onion (Allium cepa). J G3 (Bethesda) 11(9): 243-255.
Iriani NA, Dwiranti A, Salamah A. 2019. Indeks mitosis pucuk daun Hibiscus
rosa-sinensis l. Variasi single pink pada beberapa variasi waktu. AL-
KAUNIYAH: J Biologi 13(1): 1-8.
Jannah N, Mahmud NRA, Karo NAK et al. 2019. Pemanfaatan Filtrat Bunga
Flamboyan (Delonix regia (Hook.) Raf.) sebagai Pewarna Alternatif dalam
Pengamatan Preparat Jaringan Tumbuhan. J Biosains dan Edukasi 1(1): 5-9.
Kobayashi T, Takahashi M, Nishijima R et al. Effective Chromosomal
Preparation Protocol for the Dioecious Plant Silene latifolia. J of Cytologia
86(4): 323–328.
Kurnianingsih R, Rosidah S, Ayu DS et al. 2021. Identification of Morphological
Characters and Time of Mitotic Musa paradisiaca cv. Haji. J Biologi Tropis
21 (3): 1096 – 1105.
Marina OC, Sanders CK, Mourant JR. 2017. Effects of acetic acid on light
scattering from cells. J Biomed Opt. 17(8): 85002-85015.
McIntosh JR. 2019. Observing onion (Allium cepa L.) chromosomes during
mitotic division. Cold Spring Harb Perspect Biol. 8(9): 23218-23227.
Mertha IG, Idrus AA, Bahri S et al. 2019. Pelatihan pembuatan preparat squash
ujung akar untuk pengamatan kromosom pada guru-guru biologi di kota
mataram. J Pendidikan dan Pengabdian Masyarakat 2(4): 454-459.
Probowati W, Putranti AH. 2020. Indeks mitosis dan jumlah kromosom kentang
hitam (Coleus tuberosus) J Vegetalika 9(4): 562-571.
Rusmiatik A. 2019. Perbandingan fiksasi larutan bouin dan formalin pada sediaan
preparat histologi testis marmut. J Kedokteran 4(2): 5-9.
Sari DP, Harlita. 2020. Optimalisasi Pemanfaatan Pewarna Alami (Natural Dyes)
Untuk Preparat Maserasi (Gosok) Tulang. Florea : J Biologi dan
Pembelajarannya 7(1): 31-40.
Susilawati PR. 2020. The implementation of flipped learning model in squash
method material in microtechnique courses. J of BIOEDUSCIENSI 4(2):
166–176.
Yuniastuti E, Masailla APD, Nandariyah et al. 2023. Karyotyping of green,
yellow and red matoa (Pometia pinnata J.R.Forst. & G.Forst.) from Central
Java, Indonesia. J Biodiversitas 24(1): 40-46.
Zhu JJ, Qi H, Cai LR et al. 2019. C-banding and AgNOR-staining were still
effective complementary methods to indentify chromosomal
heteromorphisms and some structural abnormalities in prenatal diagnosis. J
of Mol Cytogenet 12(1): 41-52.
IV. IDENTIFIKASI DAN KARAKTERISASI KROMOSOM TANAMAN

A. Pendahuluan
1. Latar Belakang
Kromosom (badan dalam sel hidup yang mengandung materi
genetik) terdiri atas beberapa bagian, yakni: sentromer (lekukan primer),
lekukan sekunder dan satelit, nukleolus, telomer, daerah heterokromatin
dan eukromatin. Sifat-sifat yang sering digunakan dalam identifikasi dan
klasifikasi kromosom adalah ukuran kromosom, letak sentromer, dan pola
pita kromosom dengan teknik pemetaan.
Letak sentromer merupakan salah satu sifat morfologi kromosom
yang penting. Kromosom terbagi oleh sentromer atas dua lengan, yakni
lengan pendek (disingkat p) dan lengan panjang (disingkat q). Berdasarkan
letak sentromer, dibedakan atas beberapa bentuk kromosom, yaitu
metasentris, sub-metasentris, akrosentris dan telosentris. Metasentris
adalah sentromer terletak di tengah-tengah kromosom, sub-metasentris
adalah sentromer terletak lebih dekat ke salah ke salah satu ujung
kromosom, akrosentris adalah sentromer terletak di dekat ujung
kromosom, dan telosentris adalah sentromer terletak di ujung kromosom.
Jumlah, bentuk, ukuran kromosom dan posisi sentromer pada
kromosom tumbuhan bersifat khas, sehingga memudahkan proses
karakterisasi kromosom pada spesies. Karakterisasi kromosom tersebut
ditampilkan dalam bentuk karyotype atau karyogram sebagai susunan
lengkap pasangan homolog yang disusun dalam seri kromosom dari yang
terbesar hingga terkecil. Pasangan kromosom yang digambar tunggal
disebut ideogram. Parameter yang diamati dalam penyusunan karyotype
antara lain: panjang kromosom, jumlah kromosom, posisi sentromer,
ukuran dan posisi satelit, ukuran dan posisi lekukan sekunder, derajat dan
distribusi heterokromatin, perbandingan pasangan kromosom terpanjang
dan terpendek, serta perbandingan lengan panjang dan pendek.

45
46

2. Tujuan
Tujuan dari praktikum Sitogenetika acara 4 mengenai Identifikasi
dan karakterisasi kromosom adalah sebagai berikut.
a. Mempelajari teknik identifikasi/karaktersisasi kromosom tanaman.
b. Melakukan identifikasi sifat-sifat kromosom suatu jenis tanaman
(jumlah, ukuran, dan bentuk kromosom).
47

B. Tinjauan Pustaka
Buah salak ( Salacca zalacca) adalah pohon palem tropis unik yang
menghasilkan buah, yang secara botani dikenal sebagai buah berbiji, dengan
kulit kasar dan bersisik menyerupai sisik ular. Pohon salak merupakan
tanaman berbunga kecil (1–5 m) dengan daun majemuk, bertangkai, berduri,
anak daun tidak bertangkai, bentuk lanset, ujung runcing, tepi dan pangkal
rata, permukaan bawah berlapis lilin, selalu hijau dan berasal dari Asia
Tenggara. Bunga salak adalah bunga jantan yang memiliki tongkol dan
bunga betina pada pohon yang berbeda. Penyerbukan alami pohon salak
adalah xenogami yang difasilitasi oleh angin, hujan atau serangga sedangkan
penyerbukan buatan manusia dilakukan dengan pemeriksaan manual oleh
petani untuk meningkatkan produksi buah, karena bunga betina mulai layu di
dalamnya 2–3 hari setelah pembukaan jika tidak diserbuki (Mazumdar et al.
2019).
Kromosom memiliki tiga elemen struktur utama yang diperlukan
untuk replikasi dan pemeliharaan: sentromer, telomer dan unit replikasi.
Sentomer merupakan daerah lekukan primer di bagian tengah kromosom
yang bersifat khusus dan tetap, berfungsi sebagai titik terlekatnya spindel
mikrotubul yang bertanggung jawab dalam pergerakan kromosom saat
pembelahan sel. Sentromer juga digunakan sebagai tempat melekatnya sister
kromatid. Peranan sentromer merupakan komponen kunci dalam proses
segregasi kromosom. Proses pembelahan sel, DNA repetitif pada sentromer
berperan memisahkan kohesi antar sister kromatid dan mengatur kromatin
pada nukleus saat interfase. Telomer memiliki peranan penting dalam
melindungi ujung pada kedua lengan kromosom, yang ditandai dengan
adanya urutan nukleotida yang khas. Pada telomer juga ditemukan DNA
repetitif. DNA repetitif pada telomer mengikat protein yang melindungi
ujung kromosom dari degradasi serta mencegah gen hilang pada saat DNA
memendek setelah satu putaran replikasi (Aziz 2019).
Kromosom dilipat menjadi wilayah lokus yang sangat berinteraksi,
yang disebut domain asosiasi topologi (TAD), yang diyakini menentukan
48

unit yang mengandung gen dan elemen pengaturnya. Bentuk kromosom


dibedakan oleh letak sentromer. Sentromer merupakan dasar bagi penentuan
bentuk kromosom dan salah satu faktor yang menentukan dalam kariotipe.
Pada saat pembuatan preparat kromosom tidak semua sel dapat menunjukkan
adanya lekukan utama (primary constriction) di kromosom. Selain itu,
ketelitian peneliti dalam melakukan teknik squeeze juga sangat menentukan
untuk memperoleh metafase atau prometafase dengan posisi sentromer yang
jelas (Puspita et al. 2020).
Bentuk kromosom dibedakan menjadi metasentris, sub-metasentris,
akrosentris dan telosentris. Metasentris adalah sentromer terletak di tengah-
tengah kromosom, sub-metasentris adalah sentromer terletak lebih dekat ke
salah ke salah satu ujung kromosom, akrosentris adalah sentromer terletak di
dekat ujung kromosom, dan telosentris adalah sentromer terletak di ujung
kromosom. Bentuk-bentuk tersebut memperlihatkan kromosom yang
membentuk huruf-huruf seperti H, V, L dan huruf lainnya (Soto et al. 2021).
Jumlah kromosom merupakan data yang paling sering digunakan
dalam penelitian taksonomi karena pengamatannya yang mudah dilakukan.
Jumlah kromosom ditentukan dengan menghitung kromosom yang terlihat
pada mikroskop. Setiap kromosom memiliki sentromer, karena sentromer
berfungsi sebagai tempat berpegangannya benang-benang plasma dari spindel
atau gelendong inti di waktu pembelahan sel berlangsung. Apabila benang
spindel berkontraksi sehingga memendek, maka kromosom bergerak
(tertarik) ke arah kutub sel pada fase anafase. Letak sentromer merupakan
salah satu sifat morfologi kromosom yang penting dalam identifikasi
kromosom (Friska, 2019).
Penyusunan karyotipe dilakukan dengan cara mengurutkan pasangan
kromosom dari ukuran terbesar sampai terkecil berdasarkan kehomologan
bentuk dan ukuran. Analisis karyotipe ditekankan pada variasi panjang lengan
kromosom, variasi panjang total komplemen haploid kromosom, indeks
asimetri, variasi bentuk dan struktur kromosom, klasifikasi kromosom, dan
49

rumus karyotipe. Ukuran ditentukan dari panjang lengan kromosom dan


bentuk kromosom ditentukan dari letak sentromer (Mertha et al. 2021).
50

C. Metode Praktikum
1. Waktu dan Tempat
Praktikum Sitogenetika mengenai mengenal mikroskop dilaksanakan
di Ruang Sidang Pemuliaan Tanaman Gedung C Lantai 2 FP UNS pada
tanggal 2 November 2023 pukul 11 WIB.
2. Alat dan Bahan
a. Preparat mikroskopis kromosom tanaman
b. Mikroskop cahaya
c. Camera
d. Komputer dan Software pengolah data digital foto.
3. Cara Kerja
a. Menggambar kromosom salak yang sudah diberikan menggunakan
Corel Draw.
b. Pengamatan panjang kromosom, yakni panjang lengan pendek (p),
panjang lengan panjang (q), dan panjang total (p+q), dilakukan dengan
memaparkan gambar kromosom pada millimeter block kemudian
diukur berdasar mikrografi obyek mikrometer.
c. Bentuk masing-masing kromosom ditentukan berdasarkan nisbah
panjang lengan kromosom (q/p)
d. Mengurutkan kromosom berdasarkan ukuran yang sudah diidentifikasi.
51

D. Hasil Pengamatan dan Pembahasan


1. Hasil Pengamatan
Tabel 4.1 Hasil Identifikasi dan Karakterisasi Kromosom Salak (Salacca
zalacca)
Lengan Lengan
Nomor Panjang Pendek Rasio Bentuk
Kromosom Kromosom Kromosom Lengan (r) Kromosom
(q) (p)
7 4 3 1,33 Metasentrik
2 3 3 1,00 Metasentrik
3 3 3 1,00 Metasentrik
10 3 3 1,00 Metasentrik
18 3 3 1,00 Metasentrik
23 3 3 1,00 Metasentrik
26 3 3 1,00 Metasentrik
5 3 2 1,50 Metasentrik
6 3 2 1,50 Metasentrik
8 3 2 1,50 Metasentrik
9 3 2 1,50 Metasentrik
13 3 2 1,50 Metasentrik
16 3 2 1,50 Metasentrik
17 3 2 1,50 Metasentrik
19 3 2 1,50 Metasentrik
21 3 2 1,50 Metasentrik
24 3 2 1,50 Metasentrik
25 3 2 1,50 Metasentrik
1 2 2 1,00 Metasentrik
4 2 2 1,00 Metasentrik
11 2 2 1,00 Metasentrik
12 2 2 1,00 Metasentrik
52

20 2 2 1,00 Metasentrik
22 2 2 1,00 Metasentrik
27 2 2 1,00 Metasentrik
28 2 2 1,00 Metasentrik
Submetasentr
14 2 1 2,00 ik
Submetasentr
15 2 1 2,00 ik
Sumber : Laporan Sementara

Gambar 4.1 Kromosom Salak Gambar 4.2 Karyotiping


(Salacca zalacca) Kromosom Salak
(Salacca zalacca)

2. Pembahasan
Jumlah kromosom salak yang sudah diidentifikasi berjumlah 14
pasang atau 28 kromosom. Menurut Febriadi et al. (2023), kromosom
memiliki fungsi utama dalam bertanggung jawab pada pemisahan DNA
dalam jumlah yang sama dan berpasangan, membawa sifat dari kedua
orangtua pada setiap pembelahan sel. Jumlah kromosom salak yang
diidentifikasi sesuai dengan jumlah kromosom salak pada umumnya yaitu
14 pasang. Jumlah kromosom menentukan ciri-ciri suatu spesies.
53

Bentuk kromosom salak yang sudah diidentifikasi memiliki bentuk


rata-rata metasentrik dan ada dua kromosom sub-metasentrik. Penelitian
lain yaitu menurut She et al. (2023), semua spesies yang diteliti memiliki
kariotipe simetris yang terdiri dari kromosom metasentrik dan sub-
metasentrik atau hanya metasentrik saja, tetapi struktur kariotipenya dapat
dibedakan dengan bentuk polanya. Hal tersebut disebabkan karena
kromosom yang diteliti sedang mengalami fase metafase atau pembelahan
sel.
Ukuran kromosom salak yang diidentifikasi memiliki panjang lengan
terpanjang 4 dan terpendek 1. Menurut Aristya et al. (2019), pengukuran
panjang lengan pendek (p) dan panjang lengan panjang (q) kromosom
pada masing-masing kultivar dilakukan menggunakan analisis jumlah
kromosom, karyotyping berupa ukuran lengan panjang, lengan pendek,
indeks sentromer, penentuan bentuk kromosom. Ukuran kromosom
berdasarkan lengan menggunakan mikrometer blok pada aplikasi Corel
Draw. Rasio lengan kromosom menghasilkan 1 sampai 2.
Jumlah kromosom 2n pada salak adalah 28, hal terebut berbeda
dengan jumlah kromosom anggrek. Menurut Istiqomah et al. (2023),
anggrek Phalaenopsis mempunyai jumlah kromosom 2n=38, jika terjadi
polipoidi maka kromosom akan berlipat dan bertambah. Ukuran dan
bentuk kromosom berbeda karena ukuran kromosom dan posisi
sentromernya berbeda. Masing-masing kromosom juga memiliki suatu
pola pita atau garis tertentu ketika diberi zat warna tertentu. Tampilan
visual kromosom setiap individu dinamakan kariotipe. Tanaman anggrek
memiliki ukuran yang berbeda juga pada setiap varietasnya. Bentuk
kromosom tanaman anggrek yang diamati juga rata-rata metasentrik dan
sedikit sub-metasentrik sama seperti kromosom salak.
54

E. Kesimpulan dan Saran


1. Kesimpulan
Berdasarkan praktikum Sitogenetika acara 4 mengenai identifikasi
dan karakterisasi kromosom tanaman dapat ditarik kesimpulan sebagai
berikut.
a. Identifikasi kromosom salak dilakukan dengan menentukan bentuk,
ukuran dan jumlah kromosom.
b. Jumlah kromosom salak yang sudah diidentifikasi berjumlah 14 pasang
atau 28 kromosom.
c. Bentuk kromosom salak yang sudah diidentifikasi memiliki bentuk
rata-rata metasentrik dan ada dua kromosom sub-metasentrik.
d. Pengukuran kromosom salak dengan menentukan lengan panjang (q)
dan lengan pendek (p) di mana lengan terpanjang adalah 4 dan lengan
terpendek adalah 1.
e. Kromosom salak dan anggrek memiliki perbedaan jumlah kromosom
dan ukuran kromosom, sedangkan bentuknya hampir sama.
2. Saran
Saran yang dapat diberikan untuk praktikum Sitogenetika acara 4
adalah sebaiknya praktikkan sudah mempelajari cara mengidentifikasi
kromosom lewat Corel Draw terlebih dahulu di rumah. Sebaiknya
praktikum dapat digabung menjadi satu dengan acara 5 supaya lebih
efisien.
DAFTAR PUSTAKA

Aristya GR, Zuyyina C, Febiansi D et al. 2019. Karakterisasi kromosom spesies


anggota familia solanaceae. J Biotropic 3(1): 24 – 38
Aziz IR. 2019. Kromosom Tumbuhan Sebagai Marka Genetik. Jurnal Teknosains
13(2): 125 – 131.
Febriadi N, Nofisulastri, Sukri A. 2023. Studi penggunaan safranin dan kolkisin
dalam pengamatan kromosom pada sel akar bawang bombay (Allium cepa
Var). Bioscientist: J Ilmiah Biologi, 11(1): 839-846.
Friska M. 2019. Identifikasi kromosom hasil cangkok anakan salak Sidempuan
(Salacca sumatrana Becc.) di Kecamatan Angkola Barat. J Pertanian Tropik
6(3): 466- 471.
Istiqomah NL, Rahayu T, Jayanti GE. 2023. Pengaruh Kolkisin Metode Semprot
dan Tetes terhadap Respon Fenotipik dan Profil Kromosom Phalaenopsis
pulcherrima. J Buletin Anatomi dan Fisiologi 8(2): 82-95.
Mazumdar P, Pratama H, Lau SE et al. 2019. Biology, phytochemical profile and
prospects for snake fruit: An antioxidant-rich fruit of South East Asia. J of
Trends in Food Science & Technology 91(1): 147-158.
Mertha IG, Idrus AA, Raksun A et al. 2021. Pelatihan preparasi kromosom dan
analisis karyotipe pada dosen-dosen biologi di universitas nahdlatul wathan
mataram. J Pengabdian Magister Pendidikan IPA 4(4): 376-382.
Puspita A, Setiawan AB, Purwantoro A et al. 2020. Identifikasi Kromosom
Homolog Melalui Deteksi Nucleolus Organizer Regions Dengan Pewarnaan
Agno3 Pada Tanaman Bawang Merah. J Bioteknologi & Biosains Indonesia
7(1): 9-17.
She CW, Jiang XH, He CP. 2023. Comparative karyotype analysis of eight
Cucurbitaceae crops using fluorochrome banding and 45S rDNA-FISH. J of
Comp Cytogenet. 17(1): 31-58.
Soto C, Bryner D, Neretti N, Srivastava A. 2021. Toward a Three-Dimensional
Chromosome Shape Alphabet. J Comput Biol. 8(6): 601-618.
V. KARYOTIPING KROMOSOM TANAMAN

A. Pendahuluan
1. Latar Belakang
Kromosom adalah bentuk nukleoprotein, yang membawa materi
informasi genetik yaitu DNA yang berfungsi sebagai unit penurunan sifat
dan juga membawa informasi untuk mengatur aktivitas sel. Kromosom
pada tumbuhan memiliki jumlah yang banyak jika dilihat menggunakan
mikroskop. Kromosom manusia dengan kromosom tumbuhan sangat
berbeda, dimana kromosom tumbuhan terdapat berbagai macam jenis
sesuai dengan spesies tumbuhan yang ada, perbedaan dapat terlihat antara
tumbuhan itu sendiri dimana setiap spesies tumbuhan berbeda dengan
tumbuhan lainnya, bahkan dapat berbeda antar tipe kultivar dan tumbuhan
liar. Kromosom memiliki fungsi utama yaitu dalam pemisahan DNA
dalam jumlah yang sama dan kromosom juga menentukan bahwa
keturunan yang dihasilkan memiliki sifat dari tetua pada setiap
pembelahan sel
Kromosom dapat digunakan sebagai penanda genetik (penciri
makhluk hidup) karena kromosom bersifat kekal dan diwariskan dari satu
generasi ke generasi berikutnya. Susunan kromosom setiap spesies bersifat
spesifik, baik dalam hal jumlah maupun struktur. Susunan kromosom
lengkap suatu individu/spesies yang menunjukkan jumlah, ukuran, bentuk,
dan sifat-sifat morfologi kromosom disebut kariotipe. Kromosom-
kromosom tersebut apabila disusun secara berderet mulai dari ukuran
terpanjang sampai yang terpendek disebut karyogram. Karyogram
disajikan dalam bentuk diagram yang disebut idiogram.
Penyusunan kromosom dilakukan dengan menggunakan aplikasi
desain grafis seperti CorelDraw, photoshop, atau aplikasi grafis yang lain.
Penyusunan karyotype dengan bantuan sistem komputer telah banyak
diterima oleh laboratorium sitogenetika. Sistem ini sangat akurat, efisien

56
57

dan tidak diragukan. Sistem ini banyak membantu untuk mengetahui


sebagian besar karyotype dari suatu individu.
2. Tujuan
Praktikum Sitogenetika acara 5 mengenai Karyotyping Kromosom
Tanaman mempunyai beberapa tujuan, diantaranya yaitu:
a. Mempelajari teknik penyusunan karyotipe (susunan kromosom)
tanaman.
b. Melakukan penyusunan karyotipe (susunan kromosom) suatu jenis
tanaman.
58

B. Tinjauan Pustaka
Letak sentromer merupakan salah satu sifat morfologi kromosom
yang penting dalam identifikasi kromosom. Langkah-langkah utama untuk
mengidentifikasi sentromer adalah sebagai berikut poros tengah dari satu
kromosom diekstraksi, kemudian sentromer diidentifikasi sesuai dengan
parameter karakteristik kromosom. Sebagian besar metode ekstraksi garis
tengah didasarkan pada MAT (transformasi sumbu medial) dan metode
penjarangan yang berbeda, seperti transformasi jarak, ekstraksi batas dan
penyempurnaan. Identifikasi sentromer, sebagian besar metode didasarkan
pada karakteristik sentromer, misalnya ciri geometris dan piksel
kromosom. Sebagian besar segmentasi kromosom terutama untuk analisis
kariotipe, dalam mengidentifikasi dan menghitung kromosom disentrik dapat
menggunakan perangkat lunak (Shen et al. 2019).
Kariotipe adalah pengaturan dan penyusunan kromosom secara
standar berdasarkan panjang, jumlah serta bentuk kromosom dari suatu
organisme. Pengamatan kariotipe dilakukan pada jaringan meristem pada fase
tertentu seperti metafase. Kariotipe dilakukan dengan melihat kromosom di
mikroskop lalu diurutkan dari kromosom terpanjang ke yang terpendek.
Kariotipe dilakukan dengan tujuan menentukan konsistensi antar individu.
Setiap klon dipetakan ke preparasi kromosom dari setidaknya tujuh individu
dari setiap spesies dan tiga aksesi berbeda (Lusinska et al. 2018).
Kegiatan kariotipe, kromosom metafase pita G yang diperoleh dari
jaringan aktif (meristematik) diklasifikasikan berdasarkan panjang dan pola
pitanya untuk menyusun kariogram. Kariogram merupakan urutan
kemunculan kromosom berdasarkan ukurannya yang disajikan dalam
idiogram. Kegiatan tersebut merupakan langkah awal tahap analisis seluruh
sampel yang diterima di laboratorium sitogenetika. Kariogram dilakukan
dengan menggunakan perangkat lunak dengan menyusun menggunakan
idiogram. Zaman modern saat ini hasil gambar kariogram yang jelas dan
jernih dapat dihasilkan mengguanakn alat elektronik (Bokkhari et al. 2022).
59

Karyogram merupakan susunan sistematis kromosom sel tunggal


individu selama tahap metafase. Penggunaan karyogram dilakukan dengan
menyejajarkan kromosom sepanjang sumbu horizontal yang dibagi oleh
sentromernya. Setiap kromosom selalu digambarkan dengan lengan p (petite)
untuk lengan yang pendek, dan lengan q (queue) untuk lengan yang panjang.
Penempatan sentromer juga dapat digunakan untuk mengidentifikasi
morfologi kasar atau bentuk kromosom. Penyusunan kromosom menjadi
karyogram dapat menyederhanakan identifikasi kelainan apapun pada
makhluk hidup. Karyogram tanaman telah dirakit berdasarkan fitur
morfologis dari semua kromosom dalam komplemen tertentu. Setiap
kromosom harus dipotong secara individual untuk menyajikan karyogram
(Hernandez-Mier et al. 2020).
Idiogram adalah representasi diagram atau diagram skematik dari
kariotipe suatu spesies. Idiogram menunjukkan peta kromosom yang
menunjukkan lokasi gen sebagai pita. Idiogram memberikan banyak
informasi tentang setiap kromosom dan menyediakan lokasi gen individu
yang ada dalam kromosom. Penyusunan idiogram ditujukan untuk
memudahkan pengamatan peta kromosom. Panjang rata-rata lengan panjang
dan lengan pendek pasangan-pasangan kromosom dalam karyogram
digunakan untuk pembentukan idiogram (Mertha et al. 2021).
Rumus karyogram adalah formula dari karyotipe suatu organisme,
yang menggambarkan jumlah dan jenis kromosom yang dimiliki oleh
organisme tersebut. Asimetri Kromosom Dihitung menggunakan rumus A1
dan A2. Hasil rumus kariogram menghasilkan jumlah, bentuk dan ukuran
kromosom. Ketiga jenis matoa mempunyai rumus kariotipe yang sama yaitu
2n=2x=22=11m, dimana m bersifat metasentrik. Hal tersebut juga ada pada
jenis lain di mana rumus karyogram tanaman salak adalah 2n = 28 = 11 m + 1
m (SAT) + 2 sm, yang menunjukkan bahwa tanaman salak memiliki 28
kromosom, dengan 11 pasang kromosom metasentrik, 1 pasang kromosom
metasentrik subterminal (SAT), dan 2 kromosom submetasentrik (Yuniastuti
et al. 2023).
60

Kariotipe kromosom disusun berderet mulai dari ukuran terpanjang


sampai yang terpendek menghasilkan suatu gambar disebur karyogram.
Untuk memudahkan dalam identifikasi kromosom maka, disajikan dalam
bentuk diagram disebut idiogram. Idiogram berguna dalam mengidentifikasi
berbagai kelainan yang terkait dengan berbagai gangguan kromosom dan
menentukan hubungan antara kelainan struktural dan gen individu yang
berkorelasi dengan berbagai penyakit atau sindrom. Perbedaan kariogram dan
idiogram terletak pada penyajian datanya, kariogram berupa gambaran ulang
dari kromosom sedangkan idiogram berbentuk grafik yang mana datanya
diperoleh setelah membuat kariogram dan menganalisis panjang lengan
masing-masing kromosom (Mertha et al. 2019).
61

C. Metode Praktikum
1. Waktu dan Tempat
Praktikum Sitogenetika acara 5 mengenai Karyotiping Kromosom
Tanaman dilaksanakan pada hari Kamis, 9 November 2023 pukul 11.00 –
12.00 WIB. Praktikum dilaksanakan di Ruang Sidang Akhir Pemuliaan
Tanaman Gedung D Lantai 2 Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret
Surakarta.
2. Alat dan Bahan
Alat dan bahan yang digunakan pada praktikum acara 5 ini yaitu
sebagai berikut:
a. Foto kromosom tanaman
b. Komputer dan Software pengolah data digital foto.
3. Cara Kerja
Cara kerja yang dilakukan pada praktikum Acara 5 sitogenetika
mengenai Karyotyping Kromosom Tanaman ini yaitu:
a. Menentukan pasangan kromosom homolog berdasar kemiripan bentuk
dan ukuran kromosom.
b. Menyusun kromosom secara berurutan, dari ukuran terpanjang sampai
terpendek.
c. Menentukan rumus karyotipe (susunan kromosom) yang mencakup
jumlah dan bentuk kromosom.
62

D. Hasil Pengamatan dan Pembahasan


1. Hasil Pengamatan

Gambar 5.1 Idiogram Kromosom Salak (Salacca zalacca)


Sumber: Dokumentasi pribadi
2. Pembahasan
Penyusunan kromosom salak dilakukan dengan mengurutkan
kromosom dari yang terpanjang ke yang terpendek. Menurut Fauziah et al.
(2020), dari data ukuran panjang setiap pasang kromosom disusun
karyotipe berdasarkan ukuran kromosom mulai dari terpanjang sampai
yang terpendek. Foto kromosom yang telah diperoleh dari pengamatan sel
pada tahap pro metaphase menggunakan mikroskop digambar pada
perangkat lunak pengolah gambar. Kromosom lalu ditempatkan pada
sebuah garis bantu yang membagi kromosom menjadi dua bagian, yaitu
lengan panjang (q) dan lengan pendek (p). Kromosom disusun berdasarkan
panjang serta letak sentromernya, sehingga diperoleh karyotipenya.
Masing-masing kromosom dihitung panjang lengan panjang (q) dan
lengan pendek (p) kromosom dan memasukan data ke perangkat lunak
pengolah data. Hasil dari kayotyping kromosom yaitu urutan kromosom
63

yang memiliki jumlah lengan panjang (q) dan lengan pendek (p) terbesar
ke yang terkecil. Kromosom tahap prometafase atau metafase awal
diprotret dan dibuat mikrografinya. Gambar kromosom hasil pemotretan
diperbesar dan dicetak dengan program photoshop, selanjutnya hasil cetak
gambar kromosom digunakan untuk pengamatan jumlah kromosom,
ukuran kromosom (panjang lengan panjang, lengan pendek, dan panjang
total), bentuk kromosom berdasarkan rasio lengan kromosom (r = p/q),
dan parameter lainnya.
Penentuan rumus karyogram kromosom salak (Salacca zalacca)
didasarkan pada letak sentromernya. Hal tersebut dikarenakan letak
sentromer menentukan bentuk satu pasang kromosom. Pasangan
kromosom homolog didasarkan pada kemiripan bentuk dan ukuran
kromosom. Menurut Puspita et al. (2020), ketelitian dalam melakukan
teknik squeeze juga sangat menentukan untuk memperoleh metafase atau
prometafase dengan posisi sentromer yang jelas. Hasil yang terlihat adalah
kariogram yang menunjukkan urutan kromosom dari yang terpanjang
sampai terpendek dan berpasangan berdasarkan kemiripan bentuk serta
ukuran kromosom. Berdasarkan praktikum ini terdapat 12 pasang
kromosom salak (Salacca zalacca) yang berbentuk metasentrik (m) dan 2
pasang kromosom salak (Salacca zalacca) yang berbentuk submetasentrik
(sm). Rumus karyogram dari salak (Salacca zalacca) adalah 2n = 28 =
11m + 2 sm.
Kromosom yang telah disusun pada software coreldraw kemudian
disusun berdasarkan ukuran kromosom yang terpanjang hingga terpendek.
Hasil kariotiping disajikan dalam bentuk karyogram dan ideogram
berbentuk diagram batang. Ideogram dibuat menggunakan MS Office
Visio atau website draw.io. Menurut Yusuf (2018), ideogram standar yang
dihasilkan di sini membantu memetakan prediksi fragmen kromosom
(PCF) dari urutan genom langsung ke kromosom dan menghasilkan
kumpulan urutan tingkat kromosom spesies. Langkah pertama yaitu
mengatur ukuran grid di halaman baru, lalu membuat garis koordinat yang
64

sejajar berjumlah 2 garis dengan ketentuan garis yang atas adalah untuk
lengan panjang dan garis yang bawah adalah untuk lengan pendek. Rasio
panjang lengan kromosom ditentukan berdasarkan panjang lengan
terpanjang dari kromosom hasil gambar ulang. Langkah selanjutnya
adalah membuat bangun balok berwarna hitam dengan ketinggian atau
rasio panjang lengan kromosom masing-masing sesuai dengan data yang
ada di MS Excel. Gambar 5.1 menunjukan bahwa diagram bagian bawah
merupakan lengan pendek dan diagram atas merupakan lengan panjnag.
Diagram menghasilkan kromosom yang memiliki ukuran dari terpanjang
ke terpendek.
Kelainan kromosom atau mutasi genetik pada organisme dapat
mengakibatkan perubahan pada struktur atau jumlah kromosom yang
mendasari karakteristik individu tersebut. Kromosom salak yang diamati
tidak terjadi kelainan, artinya struktur dan jumlah kromosom dalam sel
salak tersebut normal. Setiap spesies memiliki jumlah kromosom yang
khas, pada manusia, jumlah kromosom normal adalah 46, dengan 23
pasang (satu set dari masing-masing tetua). Menurut Nirmala (2019), tidak
adanya kelainan kromosom dalam sampel salak yang diamati bisa
menunjukkan bahwa kromosom salak tersebut memiliki struktur dan
jumlah yang normal sesuai dengan spesiesnya. Kromosom yang normal
sangat penting karena kelainan kromosom atau mutasi genetik bisa
memengaruhi pertumbuhan, perkembangan, atau reproduksi organisme.
65

E. Kesimpulan dan Saran


1. Kesimpulan
Berdasarkan praktikum Sitogenetika acara 5 tentang Karyotiping
Kromosom Tanaman yang telah dilakukan maka dapat ditarik beberapa
kesimpulan sebagai berikut:
a. Hasil dari kayotyping kromosom yaitu urutan kromosom yang
memiliki jumlah lengan panjang (q) dan lengan pendek (p) terbesar ke
yang terkecil.
b. Rumus kariogram dibuat berdasarkan bentuk kromosom yang
berkaitan dengan letak sentromer, pada praktikum kali ini rumusnya
2n = 28 = 12m + 2sm, artinya kromosom terdiri dari 28 kromosom,
dengan 12 pasang berbentuk metasentrik dan 2 pasang berbentuk
submetasentrik.
c. Hasil idiogram berupa yaitu menunjukkan bahwa bagian bawah
merupakan lengan pendek dan diagram atas merupakan lengan
panjang. Diagram menghasilkan kromosom yang memiliki ukuran
dari terpanjang ke terpendek.
2. Saran
Saran yang diberikan untuk praktikum selanjutnya yaitu
kedepannya praktikum dilaksanakan lebih lama lagi durasinya. Co-Ass
diharapkan memberikan bimbingan lebih detail agar memahami betul cara
membuat karyotyping.
DAFTAR PUSTAKA

Bokhari Y, Alhareeri A, Aljouie A. 2022. ChromoEnhancer: An Artificial-


Intelligence-Based Tool to Enhance Neoplastic Karyograms as an Aid for
Effective Analysis. J of Cells 11(14): 2244-2255.
Fauziah S, Sulmartiwi S, Widjiati. 2020. Identifikasi Kromosom Ikan Nila
(Oreochromis niloticus) Strain Merah Jatimbulan dan Larasati yang Diambil
dari Lokasi Berbeda. J of Marine and Coastal Science 9(2): 76-85.
Hernández-Mier Y, Nuño-Maganda MA, Polanco-Martagón S, et al. 2020.
Machine learning classifiers evaluation for automatic karyogram generation
from g-banded metaphase images. J Applied Sciences 10(8): 2758.
Lusinska J, Majka J, Betekhtin A et al. 2018. Chromosome identification and
reconstruction of evolutionary rearrangements in Brachypodium
distachyon, B. stacei and B. Hybridum. J Annals of Botany 122(3): 445–
459.
Mertha IG, Agil AI, Ahmad R et al. 2021. Pelatihan preparasi kromosom dan
analisi karyotype pada dosen-dosen di Universitas Nahdlatul Wathan
Mataram. J Pengabdian Magister Pendidikan IPA 4(4): 376-382.
Mertha IG, Syamsul B, Zulkifli L, Agus R et al. 2019. Pelatihan pembuatan
preparate kromosom dan penyusunan karyotype di Fakultas Mipa Program
Studi Biologi Universitas Islam Al-Azhar Mataram. J Pengabdian Magister
Pendidikan IPA 2(1):75-78.
Nirmala, S. 2019. Pengaruh konsentrasi giberelin (GA3) dan lama perendaman
terhadap viabilitas jeruk (Citrus limonia Osbeck) kultivar Japansche citroen
(Doctoral dissertation, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim).
Puspita A, Setiawan AB, Purwantoro A et al. 2020. identifikasi kromosom
homolog melalui deteksi nucleolus organizer regionsdengan pewarnaan
agno3 pada tanaman bawang merah. J Bioteknologi & Biosains Indonesia
7(1): 9-17.
Shen X, Qi Y, Ma T et al. 2019. A dicentric chromosome identification method
based on clustering and watershed algorithm. J of Sci Rep 9: 2285-2296.
Yuniastuti E, Masailla APD, Nandariyah et al. 2023. Karyotyping of green,
yellow and red matoa (Pometia pinnata J.R.Forst. & G.Forst.) from Central
Java, Indonesia. J Biodiversitas 24(1): 40-46.
Yusuf F, O’Connor FE, Mutery AFA et al. 2018. Chromosome Level Genome
Assembly and Comparative Genomics between Three Falcon Species
Reveals an Unusual Pattern of Genome Organisation. J of Diversity 10(4):
113-120.

Anda mungkin juga menyukai