Anda di halaman 1dari 1

Buka aplikasi,masukkan 1xkk dengan mengeklik file >> impor molekul >> pilih 1xkk

2. Muncul tampilan, un centang water>> muncul gambar

3. Klik preparation >> detect cavities >> OK

4. Un centang kofaktor dan protein

5. Pilih cavities >> docking>> docking wizard

6. Refrence ligand >> pilih yang bawah (FMM_91 (A) >> next

7. Refrence ligand , pilih cavities yang sudah dipilih tadi >> klik next hingga muncul data output>>
mau disimpan dimana>> start

8. Skip run, lalu klik proses >> pilih RMSD yang paling kecil (di ss, dimasukin datanya) >> close

9. File >> import docking result

10. Pilih file yang tadi,akan muncul hasil data

11. Centang data dg RMSD paling kecil>> OK

12. Klik ligand map >> ligand (bagian atas) diganti dengan hasil data yang paling kecil tadi >> show
interaction

13. Kemudian di cari elemen elemennya, bisa di zoom in zoom out. Kemudian di ss

14. Buka chem draw >> convert name to structure >> masukkan nama obat >> OK >> struktur di copy

15. Buka chem draw 3D >> paste struktur

16. Klik file>>save as>>dikasih nama>> type di ubah menjadi “SYBYL2 (*mol2)>> save

17. Buka apk molegro>>file>> impor molekul>>pilih obat tadi>> open>>import

18. Klik docking >> docking wizard >>muncul tampilan, dan di centang obatnya (FMM_91 [A] di
uncentang) >> next >> pilih cavities yang sudah dipilih >> next terus sampai muncul data
output>>mau di simpan dimana>> OK>> Start >> continue >> skip run

19. Pencet proses >> Dilihat MolDock yang paling kecil >> close

20. Pencet file >>import docking result >> pilih yang kedua >> open

21. Centang MolDock yang paling kecil >> OK

22. Klik ligand map >> ligand (bagian atas) diganti dengan obatnya yang 00 >> show interaction

23. Buat tabel untuk semua data , dan ditambahkan hasil screenshot

Anda mungkin juga menyukai