Ketua Sekretaris Anggota

: Fezza Uktolseja (1102009113) : Istiadi Mukharam (1102009147) : Ayu Wijayanti (1102009049) Azizah Ridwan (1102009050) Bagus Hilmawan (1102009051) Faisal D Brawidya (1102009104) Filiana Efriska A (1102009114) Isti Iryan Prianti (1102009146) Istiadi Mukharam (1102009147) Annisa A Al-Halim (1102008036)

Biologi dibagi menjadi tiga kerajaan besar: Eubacteria, Archaea dan Eukaryota. Kromosom merupakan jantung dari sebuah paradoks sentral dalam evolusi. Stabilitas versus perubahan adalah dikotomi penting dalam biologi molekular. Peristiwa-peristiwa yang membawa stabilitas dan perubahan dalam struktur DNA melibatkan proses replikasi, transkripsi dan rekombinasi.

Kebanyakan bakteri memiliki satu kromosom dengan DNA yang adalah sekitar 2 MBP (mega pasang basa) panjang (1 MBP = 1 000 000 pasangan basa), tapi isi DNA dari berbagai spesies bervariasi 0,58-10 MBP DNA, dan beberapa bakteri telah beberapa kromosom. Organisme eukariotik umumnya memiliki kromosom lebih besar daripada bakteri. DNA eukariotik dilokalisasi dalam sebuah kompartemen, inti, yang dipisahkan oleh sebuah membran yang mengandung fosfolipid dari sitoplasma ribosom dan protein aktivitas penerjemahan. Selama pembelahan sel, pada membran nukleus eukariotik rusak sekali per siklus sel untuk mendistribusikan diploid kromosom 46 sama antara dua sel anak.

Bakteri mempunyai tambahan molekul DNA yang disebut plasmid (atau episomes). Plasmid adalah molekul DNA yang terpisah yang berisi asal replikasi yang memungkinkan mereka untuk melipatgandakan secara independen dari kromosom inang. Plasmid ukuran berkisar dari 1 KBP (kilo pasangan basa) (1000 bp) menjadi 100 KBP, dan molekulmolekul DNA ini mengkodekan sistem genetik untuk fungsifungsi khusus. Beberapa plasmid membuat pelengkap ekstraseluler, Plasmid sering membawa gen-gen yang memberi kemampuan untuk bertahan di hadapan antibiotik, banyak plasmid juga mengandung gen yang mempromosikan mentransfer DNA plasmid gen.

Kromosom eukariotik selalu linier, dan mereka memiliki dua tujuan, masing-masing membawa struktur khusus yang disebut telomer, dan wilayah yang terorganisir yang disebut sentromer, kromosom yang memungkinkan untuk menempelkan mesin selular, yang bergerak ke tempat yang tepat selama pembelahan sel. Salah satu aspek penting dari struktur kromosom adalah bahwa DNA adalah heliks plectonemic, yang berarti bahwa dua untai heliks membelitkan tentang satu sama lain. Molekul DNA kromosom sangat panjang dan tipis, sehingga DNA harus berlipat berkali-kali untuk sesuai dalam batas-batas sel bakteri.

Enzim yang memecahkan masalah penguraian adalah topoisomerases. topoisomerases dibagi menjadi dua kelas. Tipe I enzim, yang meliputi TopoI dan TopoIII (yang topoisomerases ganjil), istirahat satu untai per siklus, dan tipe II enzim (genap), girase, eukariotik TOPOII, dan E. coli TOPOIV, ganda. Eukariota memiliki tiga topoisomerases: TOPOI dan TOPOIII adalah tipe enzim yang melanggar hanya satu untai dan TOPOII adalah satu-satunya aktivitas yang istirahat secara bersamaan.

Kromatin adalah istilah yang merujuk bukan hanya pada DNA, tetapi juga kepada protein yang melekat pada suatu kromosom. Interwound supercoiling diproduksi dengan mengorbankan ATP oleh enzim girase, dan supercoiling menghasilkan dua konsekuensi penting. Dalam nukleus eukariotik, enzim seperti polimerase RNA mendapatkan akses ke DNA, yang tetap terikat histon seluruh transaksi paling biokimia. Di samping histon, kromosom eukariotik mengandung protein regulasi yang jauh lebih berlimpah.

Masalah utama dalam replikasi kromosom menghasilkan dan mendistribusikan salinan DNA mereka untuk kompartemen yang menjadi sel anak. yang mengontrol replikasi di sebuah situs disebut oriC .

Inisiasi melibatkan protein DnaA perakitan dibantu dua replisomes, masing-masing didedikasikan untuk mereplikasi kromosom setengah. Setiap replisome memiliki sepasang polymerase subunit: satu mensintesis DNA yang terus menerus sepanjang untai dengan 5 'ke 3' polaritas, dan yang lain mensintesis DNA subunit kecil disebut fragmen Okazaki potong. Jadi replikasi DNA semi-kontinu. Pada eukariotik replikasi, langkah-langkah inisiasi tidak sepenuhnya dipahami

Setelah inisiasi, duplikasi dari seluruh 4.6-MBP kromosom E. coli butuh 50 menit. Replikasi semi-konservatif, yang berarti bahwa satu untai yang baru disintesis dibuat untuk menyesuaikan setiap orangtua template. Karena DNA mensintesis DNA polimerase hanya dalam 5 'ke 3' arah. Untai cetakan dengan 5 'ke 3' polaritas dalam arah searah jarum jam selalu mengandung DNA replichore inti, yang terbuat discontinuously, dan DNA replichore II, yang dibuat secara terus menerus. Telomerase mensintesis urutan ulangi sederhana yang ditambahkan pada setiap kromosom menggunakan template RNA yang merupakan bagian dari enzim.

Pada E. coli, replikasi selesai dalam satu daerah kromosom yang disebut terminus, yang adalah 180 sekitar melingkar peta genetik dari oriC. Dua tempat khusus yang ditemukan di dekat terminal. Pertama, terminus dikelilingi oleh sedikitnya sepuluh ter situs yang mengikat protein Tus. Situs ter bekerja dalam satu orientasi, dan mereka memerintahkan garpu replikasi sehingga dapat melanjutkan ke terminal tapi tidak melanjutkan ke arah yang berlawanan dengan gerakan garpu normal. Kedua situs khusus di terminal disebut bda, yang berfungsi untuk monomerize dimer kromosom selama segregasi

Karena bakteri tidak dapat membuat inti yang memisahkan kromosom dari sitoplasma di mana terjemahan terjadi, sebuah segregasi kromosom mekanisme yang dikembangkan dalam E. coli dan sebagian besar bakteri lainnya yang menggunakan didorong girase supercoiling, bakteri condensin (MukB untuk E. coli), dan kromosomprotein terkait yang untuk membentuk badan yang disebut nucleoids kental. Bakteri dapat menyempitkan siklus sel untuk membagi lebih cepat daripada periode 40-menit yang diperlukan untuk menyalin kromosom.

pada eukariota replikasi DNA, yang terjadi di bagian siklus pertumbuhan yang disebut fase S, sel-sel bergerak melalui siklus mekanik yang disebut mitosis untuk mendistribusikan kromosom direplikasi untuk setiap anak sel. Mitosis berlangsung melalui empat tahap : Tahap 1 Profase Tahap 2 Metafase Tahap 3 Anafase Tahap 4 Telofase

Proses pembuatan pelengkap RNA gen DNA disebut transkripsi. Untuk mengakomodasi skenario regulasi kompleks, kromosom dibagi menjadi modul transkripsional diskrit disebut operon. Operon memiliki dua komponen fungsional: operator (atau wilayah kontrol) dan urutan pengkodean yang mengkodekan protein atau RNA produk. Promotor mengandung protein regulator positif dan negatif. Protein regulator negatif disebut represor, Ada juga bertindak positif protein yang disebut aktivator, yang menstimulasi transkripsi RNA polimerase,

Kromosom mengalami tiga jenis rekombinasi genetik: rekombinasi homolog, rekombinasi spesifik situs dan transposisi. Rekombinasi adalah jalur perbaikan penting dalam kromosom mamalia maupun bakteri. Protein yang melaksanakan reaksi biokimia yang serupa dengan sistem RecABC E. coli telah diidentifikasi. Sebuah protein yang disebut P53 mengkoordinasikan aktivitas banyak perbaikan DNA protein. Perbaikan enzim yang disimpan di kromosom telomeres, dan setelah sinyal dari P53 protein ini bermigrasi ke situs kerusakan DNA untuk mengembalikan fungsi kromosom.

Satu urutan dalam E. coli akan mempengaruhi efisiensi dan arah rekombinasi: chi urutan, GCTGGTGG. Sebuah situs chi merangsang rekombinasi directionally, dengan memicu pasangan kromosom sekuens dekat chi. Seperti situs ter replikasi, situs chi bertindak hanya satu arah. Sekitar 75% dari semua situs chi diatur dalam arah searah jarum jam replichore I dan berlawanan arah jarum jam di replichore II, sehingga mereka menginstruksikan rekombinasi untuk melanjutkan sesuai dengan arah replikasi DNA.

Transposon yang diskrit unsur genetik yang bergerak dari satu situs atau dari satu kromosom ke yang lain, seringkali dengan sedikit hal tertentu sekuens target DNA. Transposon dengan mereka kadang-kadang membawa gen untuk ketahanan terhadap antibiotik Pada eukariota, transposon (biasanya disebut retrotransposons karena kesamaan mereka untuk retrovirus dan ketergantungan mereka pada reverse transcriptase untuk replikasi) membuat sebagian besar dari total kromosom DNA.

Situs rekombinasi spesifik menyediakan mekanisme yang efisien untuk mengatur situs DNA pada kurang dari 100 bp panjangnya (di bawah tingkat yang diperlukan untuk rekombinasi homolog). Situs-sistem rekombinasi spesifik menyebabkan penyisipan dan eksisi virus lisogenik yang berbeda. Pada eukariota, rekombinasi spesifik situs juga memiliki banyak peran penting dalam perkembangan biologis. Salah satu contoh spektakuler adalah sistem kekebalan tubuh mamalia, di mana segmen kromosom yang berbeda disebut V, D dan J gen dipotong dan disusun menjadi satu untuk menghasilkan antibodi.

Chromosome Structure
N Patrick Higgins, University of Alabama, Brimingham,
Alabama, USA