Praktek Analisis Survival
Praktek Analisis Survival
OUTPUT
Life Tablea
Cumulative
Std. Error of
Proportion
Cumulative
Surviving
Proportion
Interval
Number
Number
Number
Number of
Std. Error
Start
Entering
Withdrawing
Exposed
Terminal
Proportion
Proportion
at End of
Surviving at End
Probability
of Probability
Hazard
Std. Error of
Time
Interval
during Interval
to Risk
Events
Terminating
Surviving
Interval
of Interval
Density
Density
Rate
Hazard Rate
42
42.000
.17
.83
.83
.29
.033
.012
.04
.01
35
34.000
10
.29
.71
.59
.26
.049
.021
.07
.02
10
23
22.000
.27
.73
.43
.24
.032
.018
.06
.03
15
15
14.000
.21
.79
.34
.25
.018
.014
.05
.03
20
10
9.500
.42
.58
.19
.16
.028
.024
.11
.05
25
4.500
.00
1.00
.19
.18
.000
.000
.00
.00
30
2.500
.00
1.00
.19
.20
.000
.000
.00
.00
35
.500
.00
1.00
.19
.21
.000
.000
.00
.00
Interpretasi:
- Pada akhir waktu penelitian, 19% pasien leukemia survive/tidak mati.
- Median survival time = 12 minggu 50% pasien leukemia masih survive sampai
waktu 12 minggu.
Langkah 2: Life tabel dengan faktor sex
Klik Analize survival life table isi time dengan week display time interval
( 36 , 5) status (status) define event ( 1) factor ( sex) Define min (0) max (1)
pilih option klik life table, plot : survival continue OK ,
Life Table
Std. Error
Firstorder
Controls
Interval
Start
Time
Sex
female
5
10
15
20
Male
0
5
10
15
20
25
30
35
Number
Entering
Interval
Number
Withdrawing
During
Interval
Number
Exposed
to Risk
Number of
Terminal
Events
Proportion
Terminating
Proportion
Surviving
22
22.000
.00
1.00
22
21.000
.33
.67
13
12.000
.50
.50
4.000
.50
.50
1.000
1.00
.00
20
20.000
.35
13
13.000
10
10.000
10
Cumulative
of Cumulative
Proportion
Proportion
Surviving at
Surviving at
End of
End of
Probability
of Probability
Hazard
of Hazard
Interval
Interval
Density
Density
Rate
Rate
Std.
Std. Error
Error
1.00
1.00
.000
.000
.00
.00
.67
.70
.067
.070
.08
.03
.33
.36
.067
.072
.13
.05
.17
.20
.033
.040
.13
.09
.00
.00
.033
.040
.40
.00
.65
.65
.20
.070
.021
.08
.03
.23
.77
.50
.30
.030
.018
.05
.03
.00
1.00
.50
.39
.000
.000
.00
.00
10.000
.10
.90
.45
.55
.010
.012
.02
.02
8.500
.35
.65
.29
.38
.032
.042
.09
.05
4.500
.00
1.00
.29
.41
.000
.000
.00
.00
2.500
.00
1.00
.29
.43
.000
.000
.00
.00
.500
.00
1.00
.29
.45
.000
.000
.00
.00
Med Time
female
12.50
male
15.00
Interpretasi:
50% pasien leukemia perempuan yang masih survive sampai dengan 12 minggu. Sedangkan
laki-laki 15 minggu.
Pada grafik dengan variable sex tidak memenuhi asumsi regresi-cox (nonproportional hazard) karena terjadi cross (garis bersilangan), artinya tidak
parallel, maka asumsi tidak terpenuhi sehingga diuji dengan time dependen.
OUTPUT:
Median
Std. Error
15.339
Lower Bound
1.860
Upper Bound
11.693
Estimate
18.985
Std. Error
12.000
Lower Bound
1.717
Upper Bound
8.636
INTERPRETASI:
50% pasien leukemia yang masih survive (hidup) sampai dengan 12 minggu.
Median
Sex
Estimate
Upper Bound
female
12.578
1.309
10.013
15.143
12.000
.960
10.118
13.882
male
16.269
3.084
10.224
22.313
8.000
11.180
.000
29.913
Overall
15.339
1.860
11.693
18.985
12.000
1.717
8.636
15.364
50% pasien leukemia perempuan yang masih survive (hidup) sampai dengan 12
minggu. Sedangkan laki-laki hanya 8 minggu.
3. Analisi Regresi cox
CARANYA: Klik Analize survival cox regression (time : week, status : status 1,
Covariates
(rx, sex, l_wbc) catagorikal (jika variable ada yang
numeric mau dikatagorikan) plot ( survival, hazard )
Hasil :
Omnibus Tests of Model Coefficients
-2 Log
Likelihood
187.970
15.364
a,b
Omnibus Tests of Model Coefficients
-2 Log
Likelihood
144.218
Chi-square
44.571
Overall (score)
df
3
Sig.
.000
a. Beginning Block Number 0, initial Log Likelihood function: -2 Log likelihood: 187.970
b. Beginning Block Number 1. Method = Enter
Interpretasi : table diatas menunjukan nilai chi squarenya adalah = 43.752, yang berasal
dari 187.97 144.218, nilai ini sangat bermakna dengan nilai sig
p = 0.000, artinya bahwa paling tidak ada satu variable independen yang bermakna.
Testing signifikasi variable :
Variables in the Equation
B
.263
SE
.449
Wald
.343
l_wbc
1.594
.330
rx
1.391
.457
sex
df
1
Sig.
.558
Exp(B)
1.301
23.321
.000
4.922
9.277
.002
4.018
hasil pada table diatas terdapat 1 variabel yang bermakna yaitu variable l_wbc, dan
variable rxsedangkan yang lainnya tidak bermakna dengan nilai sig p > 0.05 ( sex p=
0.558).
Interpretasi regresi cox :
Kelompok yang tidak mendapatkan treatmen mempunyai resiko untuk terjadinya relaps 4
kali lipat dibandingkan dengan kelompok yang mendapatkan treatmen, setelah
mempertimbangkan pengaruh dari sex dan kadar darah putih.
Kelompok perempuan memiliki resiko untuk relaps 1 kali lebih tinggi dibandingkan
dengan kelompok pria, setelah mempertimbangkan pengaruh dari treatment dan kadar
darah putih.
4.
Hasil :
Variables in the Equation
sex
T_COV_*sex
B
2.008
-.268
SE
.817
.085
Wald
6.044
9.881
df
1
1
Sig.
.014
.002
Exp(B)
7.448
.765
dari table diatas pada varaibel T_COV_*sex analisis yang cocok untuk variable sex
adalah regresi cox time dependen, dengan nilai p = 0.02
B
1.596
SE
.776
Wald
4.227
-.008
.061
.018
df
1
Sig.
.040
Exp(B)
4.934
.894
.992
dari table diatas pada variable T_COV_*rx nilai sig p =0.894 artinya tidak bermakna
sehingga asumsi time dependen (proporsional hazard) terpenuhi.
Variables in the Equation
l_wbc
T_COV_*l_wbc
B
1.499
SE
.503
Wald
8.901
.013
.055
.053
df
1
Sig.
.003
Exp(B)
4.478
.818
1.013
dari table diatas pada variable T_COV_*l_wbc nilai sig p =0.818 artinya tidak bermakna
sehingga asumsi time dependen (proporsional hazard) terpenuhi.
B
1.586
SE
.895
Wald
3.142
l_wbc
1.455
.335
rx
1.095
T_COV_*sex
-.155
df
1
Sig.
.076
Exp(B)
4.885
18.925
.000
4.286
.479
5.231
.022
2.989
.091
2.902
.088
.856
dari table diatas variable interaksi sex dengan time dependen tidak signifikan p
= 0.088 lebih dari 0.05 sehingga tidak dimasukan dalam model.
Variables in the Equation
l_wbc
rx
B
1.604
1.294
SE
.329
.422
Wald
23.732
9.399
df
1
1
Sig.
.000
.002
Exp(B)
4.975
3.648
jika dalam model dikeluarkan sek maka terjadi perubahan pada variable treatment lebih
dari 10 % maka varaibel sex tetap dimasukan sebagai varaibel pengontrol, sehingga
didapatkan model akhir :
B
1.586
1.455
1.095
-.155
SE
.895
.335
.479
.091
Wald
3.142
18.925
5.231
2.902
df
1
1
1
1
Sig.
.076
.000
.022
.088
Exp(B)
4.885
4.286
2.989
.856
Kesimpulan :
Faktor yang mempengaruhi survival time seorang penderita leukemia untuk relaps
adalah jenis pengobatan (treatment), kadar darah putih (l-WBC), dan sex yang
tergantung pada waktu