1. Menjelaskan struktur virus, dan membedakan virus dengan sel hidup.

2 Melacak asal usul evolusi virus berdasarkan hipotesis saat ini.

3 Karakterisasi bakteriofag, dan membedakan siklus litik dengan siklus lisogenik.
4 Bandingkan infeksi virus dari hewan dan tumbuhan, dan mengidentifikasi spesifik penyakit c
disebabkan oleh virus hewan.
5 Menjelaskan siklus reproduksi dari retrovirus, seperti immunodeficiency manusia defisiensi
virus (HIV).
Virus
Selama 1800-an, ahli botani mencari penyebab penyakit mosaik tembakau, yang stunts
pertumbuhan tanaman tembakau dan memberikan tembakau yang terinfeksi meninggalkan
belang, penampilan mosaik. Mereka menemukan mereka bisa menularkan penyakit ke tanaman
sehat dengan daubing daun mereka dengan getah tanaman yang sakit. Pada tahun 1892, Dmitri
Ivanowsky, seorang ahli botani Rusia, menunjukkan bahwa getah masih infektif setelah itu telah
melewati porselen lters fi dirancang untuk menyaring semua bakteri yang dikenal. Beberapa
tahun kemudian, pada tahun 1898, Martinus Beijerinck, seorang ahli mikrobiologi Belanda,
memberikan bukti bahwa agen yang menyebabkan penyakit mosaik tembakau memiliki banyak
karakteristik organisme hidup. Ia berhipotesis bahwa agen infektif bisa mereproduksi hanya
dalam sel hidup dan menamakannya virus (dari kata Latin virus, yang berarti "racun"). Pada awal
abad ke-20, para ilmuwan menemukan agen infektif, seperti mereka yang bertanggung jawab
untuk penyakit mosaik tembakau, yang dapat menyebabkan penyakit pada hewan atau
membunuh bakteri. Patogen ini begitu kecil bahwa mereka tidak bisa dilihat dengan mikroskop
cahaya. Mereka juga melewati tapis yang dihapus semua bakteri yang dikenal. Anehnya, mereka
tidak bisa tumbuh di dalam kultur laboratorium kecuali sel-sel hidup yang hadir. Penelitian lebih
lanjut dari virus memiliki con fi rmed bahwa mereka memang kecil. Virus polio adalah sekitar 30
nm diameter (tentang ukuran ribosom). Hampir satu juta dari mereka berbaris ujung ke ujung
akan span hanya satu inci. Sebuah virus yang lebih besar, seperti poxvirus yang menyebabkan
cacar, dapat mengukur sampai 300 nm panjang dan 200 nm lebar. The diketahui terbesar virus
adalah Mimivirus, dengan diameter minimal 400 nm, ukuran bakteri kecil (Mycoplasma).
Mimivirus menginfeksi amuba (yang protista).
Virus terdiri dari asam nukleat yang dikelilingi oleh mantel protein
Sir Peter Medawar 1960 pemenang Nobel Kedokteran, didefinisikan virus sebagai
"sepotong berita buruk dibungkus protein." Kita sekarang tahu bahwa virus yang paling dikenal
adalah tidak patogen, yaitu, mereka tidak menyebabkan penyakit. Sebuah virus, atau virion,
adalah, partikel menular kecil yang terdiri dari inti asam nukleat (materi genetik) yang dikelilingi
oleh lapisan protein yang disebut kapsid. Virus tidak terbuat dari sel-sel dan tidak dapat secara
independen melakukan aktivitas metabolik. Mereka tidak memiliki komponen yang diperlukan
untuk melakukan respirasi seluler atau untuk mensintesis protein dan molekul lain. Virus
mereproduksi, tetapi hanya dalam lingkungan yang kompleks dari sel inang hidup mereka
menginfeksi. Virus menggunakan informasi genetik mereka untuk memaksa sel inang untuk

meniru asam nukleat virus. Mereka mengambil alih mekanisme transkripsi dan translasi dari sel
inang. Virus adalah parasit intraseluler obligat, yang berarti bahwa mereka bertahan hidup hanya
dengan menggunakan sumber daya dari sel inang. Virus mungkin berisi baik DNA atau RNA
Sampai saat ini, ahli biologi berpikir bahwa sementara organisme hidup lainnya mengandung
asam deoksiribonukleat (DNA) dan asam ribonukleat (RNA), virus mengandung baik DNA atau
RNA, tidak keduanya. Namun, peneliti baru-baru sequencing genom Mimivirus dan melaporkan
bahwa virus ini DNA besar juga memiliki enam RNA transfer. Virus biasanya memiliki untai
tunggal (ss) DNA, doublestranded (Ds) DNA, ssRNA, atau dsRNA. Seperti yang akan kita
bahas, jenis asam nukleat penting dalam mengklasifikasikan virus.
Kapsid adalah mantel protein pelindung Setelah virus mengambil alih mesin
metabolisme sel, tuan rumah mensintesis capsids untuk virus. Beberapa virus yang dikelilingi
oleh sebuah amplop membran luar, dan sel inang juga menghasilkan amplop tersebut. Capsids
terdiri dari subunit protein, yang disebut kapsomer. Itu kapsomer menentukan bentuk virus.
Capsids virus umumnya baik heliks atau polyhedral, atau kombinasi dari kedua bentuk. Virus
heliks, seperti virus mosaik tembakau (TMV), muncul batang selama atau benang (Gambar. 241a). Kapsid adalah silinder berongga terdiri dari protein yang membentuk alur ke mana ts RNA
fi. Virus polyhedral, seperti adenovirus (yang menyebabkan sejumlah penyakit manusia,
termasuk beberapa infeksi pernafasan), muncul agak bulat (Gambar. 24-1b). The kapsomer diatur
dalam segitiga sama sisi. Kapsid virus besar dapat terdiri dari beberapa ratus kapsomer. The
polyhedral yang paling umum Struktur adalah ikosahedron, struktur dengan 20 wajah permukaan
identik (masing-masing wajah segitiga).
Beberapa virus memiliki kedua komponen heliks dan polyhedral. Virus yang
menginfeksi bakteri disebut bakteriofag ("bakteri pemakan"), atau fag (Gambar. 24-1c). T4 fag
yang menginfeksi bakteri Escherichia coli terdiri dari polyhedral "kepala" yang melekat pada
heliks "ekor," bentuk umum ditemukan di bakteriofag. Banyak fag memiliki anggota-ekor fi
yang menempel pada sel inang. Virus dikelilingi oleh sebuah amplop membran luar yang disebut
sebagai virus menyelimuti. Biasanya, virus memperoleh amplop, yang merupakan bagian dari
membran plasma sel inang, saat meninggalkan sel inang. Menariknya, sementara di sel inang,
virus mensintesis protein tertentu dan memasukkan mereka ke dalam membran plasma inang.
Dengan demikian, amplop virus terdiri dari fosfolipid dan protein dari membran plasma inang,
serta
protein khas yang dihasilkan oleh virus itu sendiri. Beberapa virus memproduksi protein
amplop yang memperpanjang keluar dari amplop sebagai paku. Seperti yang akan kita bahas,
paku ini dapat menjadi sangat penting dalam interaksi virus dengan sel inang. Virus mungkin
telah berevolusi dari sel mana virus ini berasal? Hipotesis yang paling banyak dipegang
adalah bahwa virus berasal dari bit asam nukleat yang "melarikan diri" dari organisme
selular. Virus mungkin berasal sebagai elemen genetik mobile seperti transposon (lihat Bab 13)
atau plasmid (kecil, fragmen DNA melingkar dibahas dalam Bab 15 dan kemudian dalam bab
ini). Fragmen tersebut bisa pindah dari satu sel dan masuk lagi melalui membran sel yang rusak.
Menurut hipotesis ini lolos gen, beberapa virus dapat melacak asal mereka untuk sel-sel hewan,
sel-sel lain untuk menanam atau sel-sel bakteri. Beberapa asal-usul mereka mungkin

menjelaskan mengapa banyak virus adalah spesies spesifik; mungkin mereka hanya menginfeksi
spesies yang terkait erat dengan organisme dari mana mereka berasal.

Hipotesis ini didukung oleh kesamaan genetik antara beberapa virus dan sel-host
mereka kesamaan lebih dekat dari yang ada antara satu jenis virus dan lain. Sebuah hipotesis
yang sangat berbeda menunjukkan bahwa virus muncul di awal sejarah kehidupan, bahkan
sebelum tiga domain menyimpang. Bukti untuk hipotesis ini berasal dari kesamaan ditemukan
dalam struktur protein dari beberapa kapsid virus dan kesamaan genetik antara beberapa virus
yang menginfeksi archaea dan beberapa yang menginfeksi bakteri. Para ahli biologi molekuler
mempelajari hipotesis ini menganggap mustahil bahwa kesamaan ini berkembang secara
independen. Bukti ini menunjukkan bahwa virus menyimpang sangat awal. Namun, virus adalah
parasit, tergantung pada tuan rumah mereka. Bagaimana mungkin mereka
telah ada sebelum host mereka berevolusi? Beberapa peneliti telah menyarankan bahwa
virus DNA memiliki asal usul yang sama dan bahwa mereka berevolusi sebelum evolusi
tiga domain. Menurut hipotesis ini, virus DNA leluhur yang penting dalam evolusi
eukariota. Para peneliti yang sequencing genom Mimivirus melaporkan bahwa genom lebih
besar dari genom 20 yang berbeda
bakteri dan archaea. Juga tidak seperti virus lainnya, Mimivirus memiliki gen yang
mengkode komponen untuk terjemahan protein. Para peneliti ini menunjukkan bahwa virus
raksasa ini berevolusi dari nenek moyang yang lebih kompleks dan secara bertahap kehilangan
beberapa gen yang diperlukan untuk sintesis protein. Hipotesis ini menjelaskan bagaimana virus
bisa ada sebelum tuan rumah mereka berevolusi. Tidak peduli bagaimana virus datang untuk
menjadi, mereka di sini dalam jumlah besar dan merupakan pemain penting dalam evolusi.
Mereka bermutasi terus-menerus, memproduksi berbagai alel baru. Mereka meniru cepat, dan
beberapa gen mereka dimasukkan ke dalam genom sel inang. Bahkan, virus dapat menjadi
sumber utama gen baru untuk sel tuan rumah mereka. Komite Internasional Taksonomi
Virus dikelompokkan es virus Virus menyajikan tantangan taksonomi ahli biologi
karena mereka tidak menunjukkan karakteristik yang mendefinisikan organisme hidup (lihat
Bab 1). Mereka acellular, tidak melakukan kegiatan metabolisme, dan mereproduksi
hanya dengan mengambil alih mesin reproduksi sel lainnya. Virus tidak memproduksi ribosom
sehingga tidak memiliki rRNA khas. Untuk alasan ini, virus tidak dapat diklasifikasikan dalam
salah satu dari tiga domain. Virus dapat diklasifikasikan berdasarkan berbagai tuan rumah
mereka, jenis organisme mereka menginfeksi. Rentang tuan rumah termasuk bakteri, ganggang,
protozoa, jamur, tanaman, invertebrata, dan vertebrata. Virus lanjut diklasifikasikan berdasarkan
karakteristik mereka. Dua mendefinisikan sifat utama jenis asam nukleat virus mengandung dan
apakah asam nukleat adalah tunggal atau ganda terdampar. Ciri-ciri lainnya dipertimbangkan
adalah adanya amplop, ukuran dan bentuk virus, dan metode yang ditularkan dari host ke host.
Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV), sekelompok ahli virus, memutuskan
kriteria untuk mengklasifikasikan dan penamaan virus. The ICTV memiliki diklasifikasikan

virus ke dalam sekitar 56 keluarga dan 233 genera berdasarkan kisaran inang dan
karakteristik. Perhatikan bahwa sistem fi kasi klasi bukanlah sebuah sistem Linnaeus
tradisional dan tidak menetapkan virus ke domain, kerajaan, atau filum. Bakteriofag adalah virus
yang menyerang bakteri Banyak dari pengetahuan kita tentang virus telah datang dari belajar
bakteriofag, karena mereka dapat dibudidayakan dengan mudah dalam bakteri yang hidup di
laboratorium. Para peneliti telah mengidentifikasi ed lebih dari 2000 fag. Bakteriofag adalah
salah satu virus yang paling kompleks (lihat Gambar. 24-1c). Struktur yang paling umum terdiri
dari molekul yang panjang asam nukleat (biasanya dsDNA) melingkar dalam kepala polyhedral.
Sebelum usia obat sulfa dan antibiotik, fag digunakan secara klinis untuk mengobati infeksi.
Pada tahun 1940, mereka ditinggalkan (setidaknya di negara-negara Barat) mendukung
antibiotik, yang lebih dapat diandalkan dan lebih mudah digunakan. Sekarang, dengan masalah
yang tersebar dan berkembang resistensi bakteri terhadap antibiotik, bakteri-membunuh virus ini
sekali lagi fokus penelitian. Dengan pengetahuan baru fag dan teknologi canggih, beberapa
kelompok penelitian sedang menyelidiki fag untuk menentukan mana yang membunuh spesies
bakteri. Para ilmuwan genetik rekayasa fag sehingga bakteri akan lebih lambat berkembang
resistensi terhadap mereka.
Fag juga dapat digunakan untuk meningkatkan keamanan pangan. Misalnya, fag
tertentu dapat membunuh strain mematikan E. coli pada sapi. Bakteri ini tidak muncul untuk
membuat ternak sakit tetapi dapat menyebabkan penyakit dan kematian pada orang yang makan
yang terkontaminasi, matang hamburger. Virus hanya mereproduksi dalam sel inang Siklus
reproduksi virus dimulai dengan virus datang ke dalam kontak dengan sel inang. Virus biasanya
menempel pada permukaan sel inang. Asam nukleat virus harus masuk ke dalam sel inang dan
mensintesis komponen yang dibutuhkan untuk mereproduksi dirinya sendiri. Kemudian,
komponen virus dirakit dan virus dilepaskan dari sel-siap untuk menyerang sel-sel lain. Dua jenis
reproduksi antara virus siklus litik dan lisogenik. Siklus reproduksi litik menghancurkan sel-sel
inang Dalam siklus litik, yang lisis virus (Rusak) sel inang. Ketika virus menginfeksi sel inang
yang rentan, memaksa tuan rumah untuk menggunakan nya mesin metabolisme untuk meniru
partikel virus. Virus yang hanya memiliki siklus litik digambarkan sebagai virulen, yang berarti
bahwa mereka menyebabkan penyakit, dan sering mati.
1 2 3 4 5 Lima langkah yang khas dalam reproduksi virus litik (Gambar 242.):
Lampiran (atau penyerapan). Virus menempel pada reseptor pada sel inang. Proses ini
memastikan bahwa virus menginfeksi hanya yang spesifik tuan rumah. Penetrasi. Virus
menembus membran plasma tuan rumah dan bergerak ke dalam sitoplasma. Banyak virus yang
menginfeksi sel-sel hewan memasuki sel inang utuh. Beberapa fag menyuntikkan hanya asam
nukleat mereka ke dalam sitoplasma sel inang; kapsid tetap di luar. Replikasi dan sintesis.
Genom virus berisi semua informasi yang diperlukan untuk menghasilkan virus baru. Setelah
masuk, virus degradasi asam nukleat sel inang dan menggunakan mesin molekul sel inang untuk
meniru asam nukleat sendiri. Banyak obat antivirus mengganggu replikasi asam nukleat virus.
Setelah replikasi, protein kapsid dan molekul lain yang diperlukan disintesis. Majelis. Komponen
virus yang baru disintesis dirakit menjadi virus baru. Rilis. Virus dirakit dilepaskan dari sel.

Umumnya, enzim litik, diproduksi oleh fag akhir dalam proses replikasi, menghancurkan
membran plasma tuan rumah. Rilis fag biasanya terjadi sekaligus dan hasil dalam lisis sel yang
cepat. Virus hewan sering dirilis secara perlahan atau tunas off dari membran plasma. Setelah
dirilis, virus menginfeksi sel-sel lain, dan proses dimulai lagi. Waktu yang diperlukan untuk
reproduksi virus, dari keterikatan bakteri rilis virus baru, bervariasi dari kurang dari 20 menit
untuk lebih dari satu jam. Bagaimana bakteri melindungi diri dari infeksi fag? Anda mungkin
ingat dari Bab 15 bahwa bakteri menghasilkan enzim restriksi, enzim yang memotong DNA
asing fag tersebut. Sel bakteri melindungi DNA sendiri dengan sedikit memodifikasi setelah
replikasi sehingga enzim restriksi tidak mengenali situs itu akan dipotong. Virus beriklim
mengintegrasikan
DNA mereka ke host virus DNA Iklim tidak selalu menghancurkan tuan rumah mereka.
Dalam siklus lisogenik, genom virus biasanya menjadi terintegrasi ke host DNA bakteri dan
kemudian disebut sebagai provirus, atau profag. Ketika DNA bakteri bereplikasi, provirus juga
ulangan (Gbr. 24-3). Gen virus yang kode untuk protein struktural virus dapat ditekan inde fi
nitely. Sel-sel bakteri membawa provirus disebut sel lisogenik. Kondisi eksternal tertentu (seperti
sinar ultraviolet dan sinar-X) menyebabkan virus beriklim untuk kembali ke siklus litik dan
kemudian menghancurkan tuan rumah mereka. Kadang-kadang virus beriklim menjadi litik
spontan.