antigen eksogen adalah antigen-antigen yang disajikan dari luar kepada hospes dalam

bentuk mikroorganisme,tepung sari,obat-obatan atau polutan. Antigen ini bertanggungjawab

terhadap suatu spektrum penyakit manusia, mulai dari penyakit infeksi sampai ke penyakitpenyakit yang dibenahi secara immologi, seperti pada asma. Virus influenza misalnya yang
merupakan penyebab utama epidemik penyakit saluran pernapasan pada manusia, terdapat di
alam dalam berbagai jenis antigenic yang dikenal sebagai A, B, dan C. Jenis-jenis ini
menggambarkan berbagai macam-macam mutasi virus. Populasi yang rentan akan diinfeksi oleh
serotype tertentu. Setelah sembuh dan imunitas terbentuk, virus ini tidak lagi memperbanyak
diri, karena mereka tidak cukup mendapat individu rentan untuk mendapatkan infeksi
lanjutan.Namun sesuai dengan tekanan selektif, virus ini diketahui melakukan mutasi, kemudian
akan melakukan mutasi, kemudian akan muncul varian baru virus influenza. Varian baru ini, bila
cukup virulen bertanggungjawab pada epidemik baru. Dengan demikian manusia mampu
mengatasi suatu epidemik, tetapi organisme menciptakan epidemi baru.
Antigen endogen adalah antigen yang terdapat didalam tubuh dan meliputi antigenantigen berikut:antigen senogeneik (heterolog), antigen autolog dan antigen idiotipik atau
antigen alogenik (homolog). Antigen senogeneik adalah antigen yang terdapat dalam aneka
macam spesies yang secara filogenetik tidak ada hubungannya, antigen-antigen ini penting untuk
mendiagnosa penyakit. Kelompok-kelompok antigen yang paling banyak mempunyai arti klinik
adalah kelompok-kelompok antigen yang digunakan untuk membedakan satu individu spesies
dengan individu spesies yang sama. Pada manusia determinan antigen semacam ini terdapat
pada sel darah merah,sel darah putih trombosit, protein serum, dan permukaan sel-sel yang
menyusun jaringan tertentu dari tubuh, termaksud antigen-antigen histokompatibilitas. Antigen
ini dikenal antigen polomorfik, karena adanya dua atau lebih bentuk-bentuk yang berbeda secara
genetik didalam populasi.
Autoantigen adalah antigen yang merupakan penyusun tubuh normal terhadap sistem
kekebalan tubuh yang menghasilkan autoantibodi