Mata Kuliah Biokimia MKK4213

METABOLISME:
GLIKOLISIS,
SIKLUS TCA (KREBS)
GLUKONEOGENESIS
STF MUHAMMADIYAH

GLYCOGENOLYSIS
glycogen
glucose-6-phosphate
GLYCOGEN SYNTHESIS

glucose
( 6 carbons)

GLYCOLYSIS

GLUCONEOGENESIS

Overview of metabolism

computing

pyruvate
(3 carbons)

lactate
triacylglycerols

CO2
FATTY ACID SYNTHESIS
acetyl CoA
fatty acids
(2 carbons) FATTY ACID OXIDATION

ketones
KETOGENESIS

oxaloacetate

LIPASE

citrate

CITRIC ACID CYCLE

CO2
CO2

resentation copyright 2002 David A Bender and some images copyright 2002 Taylor & Francis Ltd

GLIKOLISIS
Nama lain:
Embden-Meyerhof pathway

Apa ciri2 utama glikolisis?

Glikolisis:
Alur metabolic pertama yang berhasil diungkapkan
Reaksi terjadi di sitosol
1 glukosa (6C) menjadi 2 mol piruvat (3C)
Mengapa glikolisis penting?
a. Otak, medula ginjal, otot yg berkontraksi, sel eritrosit dan sel
spermaglukosa satu-satunya sumber energi
b. Piruvat dapat dioksida menjadi CO2 (produksi ATP pada siklus
KREBS)proses aerobic
c. Piruvat dapat direduksi menjadi laktat (fermentasi asam laktat
atau ethanol (fermentasi alkohol)proses anaerobic

Total ada 10 tahap katalisis enzim

(1) sampai (5) Glikolisis Fase I

(6) sampai (10) Glikolisis Fase II

Apa perubahan kimia pada glikolisis fase I?

Glikolisis fase I: PERUBAHAN 1 GLUKOSA MENJADI 2 TRIOSA
FOSFAT (G-3-P)
Ada 5 reaksi enzimatis
Reaksi 1: Fosforilasi Glc oleh ATP
o Enzim: hexokinase/glucokinase
o Kofaktor: Mg2+
o 1 ATP dikonsumsi

 Reaksi 2: Isomerisasi glukosa 6-fosfatfruktosa 6-fosfat

o Enzim: phosphoglucoisomerase (=phospoglucose
isomerase = glucose phosphate isomerase)
o Kofaktor: Mg2+
o Mengapa isomerisasi?
- Menyiapkan gugus OH primer utk fosforilasi
berikutnya.
- Aktifasi C3 (mll pembentukan fruktosa) utk memfasilitasi
pemutusan kovalen C3-C4 pd tahap lanjut

 Reaksi 3: Fosforilasi fruktosa 6-P menjadi fruktosa 1,6bisfosfat (FBP)

o Enzim: fosfofruktokinase
o Fosfofruktokinase mempunyai 2 tempat ikatan berbeda
untuk ATP (high-affinity substrate site dan low-affinity
regulatory siteenzim allosteric)
o Kofaktor: Mg2
o 1 ATP dikonsumsi
o Reaksi 3 diregulasipenentu kecepatan glikolisis
o Mekanisme regulasi: ATP sitosol tinggi, glikolisis berhenti

 Reaksi 4: Pemutusan FBP menjadi triosa fosfat (G-3-P)

o Reaksi pemutusan pd C3-C4 dari fruktosa1,6-bisfosfat
menjadi dihidroksi aseton fosfat (DHAP) dan Dgliseraldehida-3-fosfat
o Enzim: fruktosa bisfosfat aldolase (ada 2 kelas)
o Aldolase kelas I (pada jaringan hewan) tidak
membutuhkan kofaktor
o Aldolase kelas II (bakteri dan fungi) membutuhkan
kofaktor logam: Zn2+
o Produk: 2 G-3-P

 Reaksi 5: Isomerisasi DHAP menjadi G-3-P

o Hanya G-3-P mengalami oksidasi lebih lanjut
untuk mendapatkan produksi energi pada
fase II.
o DHAP diubah menjadi G-3-P dengan bantuan
enzim triosa fosfat isomerase.

Apa perubahan kimia pada glikolisis fase II?

Pada fase II terjadi pembangkitan
komponen energi tinggi !!
Reaksi 6: Oksidasi G-3-P
o Koenzim: NAD+
o Enzim: G-3-P dehidrogenase
o G-3-P teroksidasi 1,3bisphospoglycerate (berenergi
tinggi, 1,3-BPG)
o NAD+ tereduksi menjadi NADH
o Produk: dua 1,3-BPG dan dua
NADH

 Reaksi 7: Transfer fosfat

dari 1,3-BPG ke ADP
menjadi ATP
o Break even point energi
terjadi setelah reaksi ini
o Gugus fosforil pada C-1
ditransfer ke ADP
o Enzim: Phosphoglycerate
kinase
o Kofaktor: Mg2+
o Substrate : MgADPo Produk: dua ATP dan dua
3- Phosphoglycerate (3PG)

 Reaksi 8: Pemindahan gugus fosforil dari C-3 ke

C-2
o Tahap awal synthesis ATP
o 3-PG diubah menjadi 2-PG
o Enzim: fosfogliserat mutase (apa perbedaan
mutase dan kinase?)
Reaksi 9: Dehidrasi 2-PG menjadi
Phospoenolpyruvate (PEP)
o 2-PG melepaskan 1 H2O menjadi PEP
o PEP: senyawa enol berenergi tinggi
o Enzim: Enolase
o Kofaktor: Mg2+

 Reaksi 10: Hidrolisis PEP menjadi Pyruvat

o Enzim: pyruvate kinase
o Enzim memindahkan gugus fosforil dari PEP
ke ADP menjadi ATP
o Koaktor: Mg2+, dan ion monovalent lain
seperti K+
o Produk: 2 ATP dan 2 pyruvate
o Pyruvate kinase:
Meregulasi glikolisis krn energy bebas
negatifnya tinggi
Allosteric enzymes utk beberapa effectors
Diaktifasi oleh AMP dan F-1,6-BP
Diinhibisi oleh ATP, Acetyl-CoA, dan
alanine

Reaksi 8

Reaksi 9

Reaksi 10

Apa nasib NADH dan piruvat yang dihasilkan

glikolisis?
o NADH harus dikembalikan ke NAD+ untuk
glikolisis selanjutnya
o Bagaimana caranya?
o 2 mekanisme: proses aerobik dan proses
anaerobik
o Aerobik: pyruvat masuk siklus TCA(= siklus asam
sitrat)NADH dioksidasi menjadi NAD+
dibahas tersendiri
o Anaerobik: 1. Alcoholic fermentation
2. Lactic acid fermentation

Pyruvate
decarboxylase

o Dekarboksilasi pyruvate: reaksi irreversibel

o Kofaktor: thiamine pyrophosphate
o Contoh aplikasi?

o Reduksi pyruvate terjadi pada jaringan hewan/tumbuhan dimana aliran darah

rendah (contoh?)
o Sebagian besar laktat diangkut oleh sirkulasi darah menuju hati untuk disintesis
kembali menjadi glukosa melalui glukoneogenesis

TCA (Tricaboxylic acid) cycle

Nama lain:
Siklus trikarboksilat (TCA cycle)
Siklus asam sitrat (citric acid cycle)
Siklus Krebs (Krebs Cycle)

Gambaran umum siklus TCA

o Kondisi: aerobic
o Puryvate diubah menjadi acetyl-CoA, lalu dioksidasi
menjadi CO2
o Elektron yg dibebaskan dibawa oleh NADH dan
FADH2
o Penerima elektron akhir: O2
o Banyak molekul ATP dihasilkan dari sikus TCAjadi
siklus ini adalah pembangkit energi untuk sel
o ATP yang terbentuk karena transport elektron
disebut: oxydative phosphorylation. Apakah ada
cara lain produksi ATP?

Bagaimana pyruvate didekarboksilasi menjadi

Acetyl-CoA?
o Pyruvate dibuat di cytosol akan masuk ke mitokondria
o Dekarboksilasi pyruvate adalah jembatan antara glukolisis dan
siklus TCA
Pyruvate + CoA + NADP+ + H2O Acetyl-CoA + CO2 + NADPH

o Enzim: pyruvate dehydrogenase complex (PDC):

Tersusun dari 3 enzim (E1, E2 dan E3)
Sisi aktif ketiga enzim berdekatan sehingga substrat tidak
harus berdifusi melewati larutan

o Proses aerobik dihasilkan 30-38 ATP per glukosa

o Oksidasi lengkap glukosa, 24 elektron
dibebaskan:
Glikolisis: 2 NADH membawa 4e
Dekarboksilasi 2 pyruvate menjadi 2 AcetylCoA: 2 NADH membawa 4e
Siklus TCA: setiap Acetyl-CoA yang dioksidasi:
3 NADH membawa 6e dan 1 FADH2 membawa
2e. 1 Glukose = 2 Acetyl-CoA, atau
melepaskan 16e

Secara kimia, mengapa siklus TCA diperlukan?

Oksidasi asetat menjadi CO2tidak umum dalam reaksi biokimia

Reaksi pemutusan ikatan C-C yang umum dalam reaksi biokimia adalah:

Pemutusan ikatan C dan C:

-cleavage

Pemutusan ikatan -hidroksi ketone:

-cleavage

o Unit karbon baru masuk ke siklus TCA melalui Acetyl-CoA.

o Sumber Acetyl-CoA: glikolisis atau oksidasi asam lemak/asam
amino
o Transfer ggs acetyl (2C) ke oxaloacetate (4C) menghasilkan
citrate (6C)
o Dehydrasi/rehidrasi citrate menghasilkan iso-citrate (6C)
o Dekarboksilasi menghasilkan -ketoglutarat (5C) dan CO2
o Dekarboksilasi kedua menghasilkan succinyl-CoA (succinyl
adalah 4C) dan CO2
o Setelah beberapa tahap, oxaloacetate diregenerasi dan siap
untuk berikatan dengan Acetyl-CoA berikutnya
o Apa yang bisa disimpulkan?
Karbon memasuki siklus TCA sebagai acetyl-CoA dan keluar
sebagai CO2. Dalam proses, energi metabolik tersimpan dalam
bentuk ATP, NADH, FADH2 (terikat enzim).
Jadi: siklus TCA memfasilitasi pemotongan senyawa 2 karbon
(acetyl) menjadi 1 karbon (CO2 sbg produk akhir)

GLUCONEOGENESIS

Gambaran umum Gluconeogenesis

o
o
o
o
o

Adalah sintesis glukosa dari prekursor bukan karbohidrat

Penting utk sumber energi otak (120 g per hari)
Sel darah merah juga membutuhkan glukosa
Tempat utama gluconeogenesis: hati
Tempat lain: korteks ginjal (1/10 hati). Juga otak, otot rangka, dan
otot jantung (sangat sedikit)
o Prekursor utama untuk gluconeogenesis adalah: laktat, asam
amino dan glycerol
laktat dari mana?
asam amino dari mana?
glycerol dari mana?

o Prekursor bukan-karbohidrat memasuki gluconeogenesis melalui

pyruvate, oxaloacetate dan dihydroxyacetone phosphate
o Hewan tidak dapat mensintesis glukosa dari asam lemak

Gluconeogenesis bukan pembalikan

glikolisis
o Glikolisis: glukosa puruvate
o Gluconeogenesis: pyruvate glukosa
o Namun, gluconeogenesis bukan pembalikan
glikolisis
o GLIKOLISIS dan GLUKONEOGENESIS proses
yang tidak dapat balik di dalam sel.
o GLUKONEOGENESIS dan GLIKOLISIS diatur
sendiri-sendiri melalui pengontrolan tahap-tahap
enzimatik spesifik yang tidak sama pada kedua
lintas tersebut
o Lintas Glukoneogenesis memiliki tujuh tahap
bersama-sama dengan lintas Glikolisis

THANK YOU