Hemostasis Selular Auxin: Kontrol sebagai pembenahan

Abstrak
Fytohormon auksin sangat penting untuk perkembangan tanaman dan berperan hampir
pada semua aspek siklus hidup tanaman. Distribusi spatio-temporal auxin bergantung pada
interaksi yang kompleks antara metabolisme auksin dan transport auksin sel ke sel.
Metabolisme dan transportasi auxin penting untuk perkembangan tanaman. Namun, sebagian
besar masih harus diamati mengenai bagaimana proses terintegrasi ini untuk memastikan
tingkat auxin seluler tertentu atau gradien dalam jaringan atau organ tubuh. Dalam tinjauan ini,
kami memberikan topik yang sangat beragam tentang biologi auksin, seperti biosintesis,
konjugasi, oksidasi, dan pengangkutan auksin. Ikhtisar yang luas namun masih belum
mendalam ini menyoroti pentingnya metabolisme dan transportasi auxin. Selain itu, ini
memungkinkan penentuan bagaimana metabolisme dan transportasi auxin yang terintegrasi
untuk mengatur homeostasis auksin seluler secara bersama-sama. Meskipun proses-proses ini
hanya dipelajari secara terpisah, kita berasumsi bahwa phrosohormonal crosstalk
mengintegrasikan dan mengkoordinasikan metabolisme serta transportasi auxin. Selain
kekuatan integratif dari sinyal hormon global, kami juga mengenalkan hipotetis yang
mengingat komponen transportasi auksin sebagai pengendalian respon auksin.

Pendahuluan: Auxin dan konsep pembenahan

Hewan dan tumbuhan memiliki strategi bertahan yang sangat berbeda untuk
beradaptasi dengan lingkungan yang selalu berubah, kebanyakan hewan memiliki kemampuan
sensorik dan motorik yang memungkinkan respons perilaku yang kompleks, sedangkan
tanaman menunjukkan peningkatan toleransi fisiologis dan plastisitas fenotipik. Untuk
mencapai adaptasi ini, tanaman mempertahankan populasi sel induk (meristem) permanen pada
akar tumbuh dan apeks tunas yang mampu mendefinisikan ulang arah perkembangan, misalnya
pembentukan sel induk. Dengan demikian, tanaman dapat mempertahankan dan mengatur
tingkat pertumbuhannya secara post-embrio membentuk organ baru, dan menampilkan
kapasitas regenerasi jaringan yang tinggi. Beberapa spesies hewan juga memiliki kemampuan
ini sampai batas tertentu. Namun, tanaman lebih unggul dalam memanfaatkan mekanisme
pertumbuhan postembrio yang secara individual membentuk tubuh mereka sesuai dengan
lingkungan. Sifat fleksibel perkembangan tanaman berhubungan erat dengan ulkus fitokormon
triptofan (Trp) yang terkait. Auxin berkontribusi terhadap hampir semua aspek pengembangan
tanaman, termasuk pembentukan sumbu basikal apikal, perkembangan pembuluh,
organogenesis postembrio, pertumbuhan tropistik, perkembangan buah, respon stres, penuaan,
dan dominasi apikal. Pada tingkat sel, auksin mengatur beberapa respons ini dengan
menyeimbangkan pembelahan sel, perpanjangan, dan diferensiasi. Mengingat banyaknya
proses yang dihadapinya, auxin merupakan pengatur perkembangan tanaman. Alih-alih
membawa informasi spesifik, auxin bisa dianggap sebagai pusat pengaturan pertumbuhan
tanaman. Fitohormon lain secara agonis atau antagonis memberi makan ke dalam proses yang
mengandung auksin ini. Jaringan hormonal interdependen (crosstalk) ini terintegrasi pada
berbagai tingkatan, seperti pada auxin signaling, auxin metabolisme, dan bergantung distribusi
pembawa auxin.
 Auxin tampaknya menggunakan sebagian besar aksinya dengan mengikat reseptor
TOM1/AFB TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE1/AUXIN (TIR1/AFB). Auxin
menstabilkan kompleks co-receptor protein TIR1/AFB dan AUXIN RESISTANT/INDOLE-
3-ACETIC ASID, yang memicu degradasi proteasom dari regulator transkripsional Aux/IAA.
Aux/IAAs mengatur transkripsi gen yang mengandung auksin dengan membentuk dimer
dengan protein AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF). Pelepasan faktor transkripsi ARF yang
berurutan menyebabkan onset pemrograman ulang transkripsi auksin.
Mengingat sifat kaskade pensinyalan yang relatif sederhana, kekuatan auxin untuk
mengatur berbagai aspek perkembangan seperti itu masih membingungkan. Keberadaan
beberapa kombinasi Aux / IAA-ARF memberikan tanggapan spesifik. Selain itu, kaskade
pensinyalan auksin ditentukan oleh perbedaan afinitas pengikatan kombinasi ko-reseptor
TIR1/AFB-Aux/IAA tertentu, sehingga menghasilkan transkripsi yang bergantung pada
konsentrasi auksin. Faktanya, auxin disarankan sebagai pemicu spesifik ambang perkembagan
tanaman. Kompleksitas lebih lanjut mungkin timbul dari pengikatan auksin ke subpopulasi
AFB tertentu yang menekan auksin. Reseptor auksin lainnya, seperti AUXIN BINDING
PROTEIN 1 (ABP1) dan PROTEIN 2-PROCEIN 2A (SKP2A) terlibat dalam reaksi non-
genomik cepat dan regulasi siklus sel. Namun, crosstalk reseptor auxin yang mendasarinya
dan kontribusi terhadap perkembangan tanaman sebagian besar tidak diketahui. Akhirnya,
distribusi spesifik jaringan dari semua komponen pensinyalan auksin ini mungkin sangat
menentukan kepekaan seluler terhadap hormon. Skenario pensinyalan yang kompleks
semacam itu dapat menyebabkan respons seluler dan sel tipe dependent.
Mekanisme persepsi yang bergantung konsentrasi ini memerlukan tingkat auxin seluler
yang dikontrol ketat. Auxin maxima dan konsentrasi auksin bergradasi telah berulang kali
disarankan pada berbagai jaringan tanaman. Namun, sebagian besar temuan didasarkan pada
synthetic auxin responsive promoter element DR5 atau sensor auxin-signaling serta bukti
eksperimental langsung pada gradien auksin dan tindakan seperti morphogen. Namun auxin
lokal menandakan kontrol maximal dan minimal dari berbagai proses perkembangan, termasuk
pembentukan sumbu embrio, pertumbuhan tropik, inisiasi organ lateral, pembentukan buah,
pola meristem akar, regenerasi jaringan, dan diferensiasi jaringan vaskular.
Auxin ini unik jika dibandingkan dengan antara hormon tanaman lainnya, karena
distribusi spatiotemporalnya tidak hanya bergantung pada metabolismenya, tetapi juga pada
transportasi sel ke sel. Mekanisme pembawa auksin ini memungkinkan regulasi distribusi
auksin yang sangat fleksibel. Transportasi auxin interselular bersifat dinamis, bahkan mungkin
berfluktuasi, dan merupakan penentu penting lainnya dari distribusi auksin spatiotemporal.
Oleh karena itu, regulasi metabolisme auksin dan transport auksin polar saling penting untuk
pembentukan auxin maksimum dan minimum.
Salah satu tantangan terbesar dalam biologi tanaman tetap ada: bagaimana auxin '
master regulate ' pengembangan tanaman di tingkat sel? Jawabannya tentu saja terletak
setidaknya sebagian dalam mekanisme pensinyalan auksin. Selain kemungkinan yang menarik
bahwa komponen sinyal auxin mungkin berbeda pada tingkat hormonal, kami berasumsi
bahwa mekanisme pengendalian homeostasis seluler auksin sangat menentukan respons seluler
terhadap auksin. Sementara berbagai aspek metabolisme dan transpor auksin telah ditangani
secara independen, mekanisme kepentingan bersama dan mekanisme pengatur bersama tetap
tidak terurai. Oleh karena itu, fokus khusus ini harus diberikan pada kontrol gabungan
metabolisme dan transpor auksin untuk menyoroti bagaimana pemicu internal dan eksternal
mengkoordinasikan gradien auksin pada berbagai tingkat.
Kami meninjau berbagai mekanisme yang mengatur homeostasis auksin seluler, seperti
metabolisme auksin (biosintesis, konjugasi, dan degradasi) dan transport auksin interselular
dan intraselular carrier-dependent. Lingkup kerja adalah memberi gambaran kasar dari
beragam topik ini dan menyoroti kepentingan bersama serta sinyal yang mengkoordinasikan
metabolisme dan transportasi auksin. Untuk pembacaan yang lebih khusus mengenai
biosintesis, de/konjugasi, oksidasi, dan transport auxin antar/intraselular, kami menyarankan
ulasan yang sangat baik sepanjang manuskrip.
Biosintesis Auxin: bagaimana bisa banyak yang berperan dalam menciptakan auxin
Indole-3-acetic acid (IAA) adalah auksin endogen paling banyak dan penting untuk
perkembangan, namun beberapa senyawa auksin endogen tambahan, seperti asam 4-
kloroindol-3-asetat (4-Cl-IAA), asam indole-3-butyric (IBA), dan asam fenilasetat (PAA),
telah diidentifikasi. Dalam tinjauan ini, kami terutama akan berkonsentrasi pada mekanisme
yang mengatur tingkat IAA seluler. Mengingat peran dasar auksin untuk pengembangan
tanaman, tampak mengejutkan bahwa jalur biosintesisnya tetap menjadi 'teka-teki', dengan
beberapa 'bagian’ yang masih hilang. Persiapan biosintesa IAA didefinisikan berdasarkan
kekhasanya dan terbagi menjadi dua kategori: jalur Trp-independent dan Trp-dependent
(Gambar 1). Secara tradisional, biosintesis auxin dianggap lebih disukai terletak pada bagian
udara tanaman, terutama pada daun dan meristem muda yang sedang berkembang dari mana ia
dibawa ke bagian tanaman lainnya. Namun, biosintesis auksin lokal telah ditunjukkan pada
jaringan lain, seperti daerah meristematik akar primer atau ujung akar lateral yang muncul.
Jalur Biosintesis Auxerre Triptophan-Independent
Jalur Trp-independen pertama kali diidentifikasi pada perikarp oranye, sebuah mutan
Trp-auxotroph Zea mays pada aktivitas Trp synthase β, yang menunjukkan tingkat Trp yang
rendah, namun jumlah IAA 50 kali lipat lebih banyak jika dibandingkan dengan tipe liar (wild
type). Indole, intermediate terakhir dari jalur biosintesis Trp, telah diusulkan sebagai prekursor
untuk jalur ini. Studi kuantitatif menggunakan beberapa mutan biosintesis Trp dan pendekatan
knockdown IGP synthase mengusulkan indole-3-gliserol fosfat (IGP) sebagai prekursor. Jalur
non-triptofan bertindak sebagai mode utama biosintesa IAA selama embriogenesis somatik
pada wortel, sedangkan konversi triptofan mendominasi kultur suspensi yang tidak
berdiferensiasi, yang pada akhirnya menunjukkan adanya kontrol perkembangan jalur triptofan
dan jalur independen. Meskipun tidak ada enzim atau zat antara yang memiliki karakteristik
molekuler, garis tambahan dari bukti eksperimental menunjukkan bahwa jalur tersebut pada
tanaman.
Jalur Biosintesis Auxerre Triptophan-Dependent
Berdasarkan intermediet utamanya, jalur Trp-dependent dibagi menjadi indole-3-
acetaldoxime (IAOx), indole-3-acetamide (IAM), tryptamine (TAM), dan indol-3-yl pyruvic
acid (IPA). Namun, perdebatan mengenai pandangan saat ini (Gambar 1) masih ada. CYP79B2
dan CYP79B3 adalah monooxygenase sitokrom P450 yang mengkatalisis konversi Trp
menjadi IAOx. Identifikasi mereka pada beberapa spesies penghasil glukosinolat yang
membatasi jalur IAOx terhadap gen tertentu. Jalur IAM ditandai dengan baik pada bakteri dan
tampaknya juga dilestarikan pada tanaman. Studi genetika dan biokimia mengungkapkan
pentingnya gen ARABIDOPSIS1 (TAA1) WEAK ETHYLENE INSENSITIVE8
(WEI8)/TRYPTOPHAN AMINOTRANSFERASE gen ARABIDOPSIS1 (TAA1) pada jalur
IPA, yang mengkodekan aminotransferase Trp yang mengubah Trp menjadi IPA. Keluarga gen
YUCCA (YUC) mengkodekan protein mirip flavin monooxygenase dan pada awalnya
dikaitkan dengan jalur TAM. Namun demikian, bukti eksperimental baru-baru ini
menunjukkan bahwa protein YUC berfungsi di hilir TAA1 pada jalur IPA, yang tampaknya
menjadi jalur biosintesis auxin utama di Arabidopsis dan jagung.
Pemeriksaan jalur yang bergantung pada trp telah menimbulkan gagasan akan penting
biosintesis auksin lokal (dalam jaringan atau sel tertentu) diperlukan untuk tindakan spasioo
temporal auksin. Fenotipe mutan biosintesis auksin dapat diselamatkan dengan ekspresi lokal
gen biosintesis bakteri auksin, tetapi tidak dengan penerapan auksin eksogen. Selain itu,
ekspresi beberapa gen yang mengkodekan enzim auksin biosintesis sebagian tumpang tindih
dengan lokasi auxin signaling maxima.
Sinyal Lingkungan Menginformasikan Biosintesis Auxin untuk Adaptasi Pertumbuhan
Fleksibel
Meskipun memiliki wawasan molekuler yang substansial terhadap biosintesis auksin,
pemahaman global terhadap jalur tersebut masih belum jelas. Banyaknya jalur biosintesis auxin
yang diusulkan mungkin sesuai dengan strategi berlebihan untuk memastikan produksi
phytohormon, namun jalur yang berbeda mungkin juga memiliki fungsi yang berbeda selama
pengembangan tanaman. Integrasi sinyal lingkungan untuk mengatur biosintesis auksin
tampaknya merupakan mekanisme umum untuk menyesuaikan perilaku pertumbuhan tanaman
dengan lingkungan yang selalu berubah. Dalam hal ini, jalur Trp-dependent dan Trp-
independent mungkin diatur secara berbeda. Misalnya, di duckweed (Lemna gibba), sintesis
Trp-dependent dan Trp-independent nampaknya mendominasi pada temperatur rendah (15° C)
dan tinggi (30° C),. Contoh lain biosintesis auksin yang terkontrol lingkungan mungkin
disediakan oleh jalur IAM pabrik. Seperti yang ditunjukkan oleh data microarray, AMIDASE1
(AMI1) (Gambar 1) sangat down-diatur oleh kekeringan dan dingin serta oleh Blumeria
graminis dan infeksi Pseudomonas syringae. Wounding, jenis stres lainnya, serupa dengan
induksi jalur Trp-dependent yang mungkin memerlukan aktivitas YUC. Selain itu, respon
naungan secara dramatis meningkatkan laju biosintesis IAA pada tipe liar, namun gagal untuk
menstimulasi respons serupa pada mutan taa1.
Contoh-contoh ini menunjukkan bahwa jalur biosintesis auxin yang berbeda dapat
dikontrol secara berbeda dalam menanggapi berbagai pemicu eksternal. Oleh karena itu, jalur
auxin yang berlebihan memungkinkan reaksi kombinasi untuk mengintegrasikan isyarat
lingkungan yang beragam. Kemungkinan spekulatif lain mungkin adanya gen IAA yang
berbeda dan terkotak-kotak pada sel tumbuhan. Dalam skenario seperti itu, lokalisasi subselular
enzim IAA-biosintesis dapat menyebabkan produksi lokal/kompartemental dalam sel.
Crosstalk Hormonal dan Masukan Metabolik ke Fine Tune Auxin Biosintesis
Crosstalk hormonal dan faktor intrinsik lainnya menentukan regulasi spatiotemporal
biosintesis auxin. Analisis TAA1 (Gambar 1) dan paralognya menunjukkan hubungan antara
produksi auksin lokal, efek etilen spesifik jaringan, dan pengembangan organ. Selain modulasi
jalur IPA Juga, sitokinin terbukti meningkatkan biosintesis auksin lokal aa TAA1 di akar
Arabidopsis oleh mekanisme yang berbeda. Selain jalur TAA1, sitokinin juga mempengaruhi
ekspresi beberapa keluarga YUCCA dan CYP79B2/CYP79B3, yang menunjukkan efek yang
agak luas pada biosintesis auxin. Di sisi lain, auxin dengan cepat menurunkan-mengatur
biosintesis sitokinin dalam tunas
Isyarat metabolik, seperti aplikasi glukosa, mengaktifkan transkripsi gen YUC2 di akar
Arabidopsis (Mishra et al., 2009). Selain itu, perubahan metabolisme gula akibat cacat pada
aktivitas invertase dinding sel menurunkan ekspresi gen ZmYUC dan mengurangi kadar
biosintesis IAA (LeClere et al., 2010). Biosintesis Auxin mungkin juga diatur oleh nutrisi lain,
seperti nitrogen (Caba et al., 2000; Forde, 2002). Oleh karena itu, biosintesis nutrisi dan
biosintesis auksin dapat secara langsung menghubungkan ketersediaan nutrisi dan respons
pertumbuhan tergantung auksin.
Inaktivasi temporal dan degradasi auxin: mendapatkan rid of the regulator
Tidak hanya produksi auksin tapi juga inaktivasinya harus dikontrol ketat pada tingkat
seluler, jaringan, dan organ. Inaktivasi auksin sementara atau ireversibel secara substansial
memperpanjang kompleksitas homeostasis auksin seluler. Sebagian besar hormon tanaman
alami muncul dalam bentuk konjugasi berbagai asam amino, peptida, dan gula. Selain bentuk
bebasnya, auksin ditemukan pada setidaknya tiga kelompok yang berbeda dari konjugat yang
tidak aktif: dua kelompok dengan berat molekul rendah yang terdiri dari (1) ester gula dan (2)
konjugasi amida menjadi asam amino, dan kelompok ketiga dari berat molekul tinggi (3) amida
konjugat ke peptida atau protein.
Konjugasi Auxin
IAA seluler muncul sebagai turunan amida dan pada tingkat yang lebih rendah sebagai
ester-linked konjugat di Arabidopsis. Konjugat auksin yang paling umum di Arabidopsis
adalah konjugat IAA-Ala, IAA-Leu, IAA-Asp, IAA-Glu, IAA-glukosa, dan protein/peptida.
Konjugat Auxin dianggap sebagai penyimpanan sementara IAA tidak aktif, melepaskan
hormon aktif bebas pada hidrolisis (Gambar 2). Namun, konjugasi ke bagian tertentu, seperti
Asp dan Glu nampaknya tidak dapat diubah yang pada akhirnya menyiratkan fungsi alternatif
untuk konjugat auksin ini. Dalam Arabidopsis thaliana, konjugasi IAA dengan glukosa
memerlukan transfer UDP-glukosa UGT84B1. IBA-glukosa terbentuk melalui UGT74E2
hidrogen peroksida lain yang dapat diinduksi peroksida. Namun, tidak banyak yang diketahui
tentang enzim yang terlibat dalam konjugasi auxin dengan molekul gula. Sintesis konjugat
auksin amina yang bergantung ATP dikatalisis oleh sintetase Gretchen Hagen 3 (GH3). Gen
GH3 diinduksi oleh auksin atau herbisida auksin dan setelah infeksi patogen tanaman yang
meningkatkan tingkat auksin seluler yang mengisyaratkan sebuah siklus yang
menyeimbangkan tingkat IAA bebas yang ditinggikan. Pentingnya protein GH3 selama
pengembangan tanaman dan juga selama respon stres dan pertahanan yang telah
didokumentasikan. The GH3/WES1 overexpressors menunjukkan perkembangan yang cacat,
seperti penurunan hipokotil dan pertumbuhan akar. Ekspresi WES1 berada di bawah kendali
hormon stres asam salisilat dan asam absis serta diinduksi oleh kondisi stres, seperti
kekeringan, salinitas tinggi, atau dingin. Mutan dari fungsi WES1 tahan terhadap tekanan biotik
dan abiotik, sedangkan mutan yang kehilangan fungsi menunjukkan penurunan resistensi stres
menunjukkan bahwa konjugat auksin terlibat dalam mekanisme protektif terhadap kondisi
stres.
Hidrolisis Auxin Konjugat
Sebagian besar konjugat auksin dapat dikembalikan melalui tindakan hidrolase spesifik
dengan pelepasan IAA bebas berikutnya. Sedangkan sedikit yang diketahui tentang hidrolisis
konjugat gula auxin, prosesnya lebih baik dipahami untuk konjugat asam amino. Anggota IAA-
LEUCINE RESISTANT 1 (ILR1) seperti keluarga IAA amidohydrolisis mengatur tingkat
auxin seluler bebas dengan amina auksin deconjugating. Enzim ini berperan penting selama
pengembangan tanaman, seperti yang disarankan oleh pola ekspresi dinamis dan diferensial
dan fenotipe mutan ganda di Arabidopsis. Bukti tambahan untuk dampak perkembangannya
berasal dari hidrolisis cepat konjugat auxin amida dalam biji sebagai respons imbibisi. Regulasi
hidrolase konjugasi telah mendapat perhatian khusus dalam konteks tertentu, seperti pada
simbiosis yang dimediasi oleh auksin dan organogenesis nodul. Asam Jasmonat mengaktifkan
auxin conjugate hydrolases, sehingga meningkatkan pelepasan IAA bebas, dan membuat
spekulasi bahwa fitohormon lainnya dapat mengatur tingkat IAA gratis melalui jalur ini.
Regulasi konjugasi auksin dan hidrolisis molekular berikutnya tampaknya sangat penting untuk
menyesuaikan respons auksin. Khususnya, konjugasi telah dijelaskan pada auksin. Berbeda
dengan IAA, konjugat IBA ester-linked berlaku terhadap turunan amida di Arabidopsis.
Pentingnya fisiologis IBA tetap kontroversi yang juga berlaku untuk konjugat yang sesuai. IBA
mungkin bertindak/memberi sinyal secara independen atau mungkin terutama berfungsi
sebagai bentuk penyimpanan/prekursor IAA
Fungsi Lain Auxin?
Spesies yang berbeda dan organ tanaman memiliki profil konjugat IAA yang berbeda.
Sulit untuk membayangkan bahwa spektrum turunan seperti itu banyak bertindak terutama
sebagai molekul penyimpanan atau prekursor katabolik. Pada tanaman non-vaskular, seperti
lumut, konjugat auksin tampaknya lebih lambat, kurang melimpah, dan jalurnya menunjukkan
spesifisitas substrat yang lebih rendah dibandingkan dengan tanaman vaskular. Dalam studi
silico menyarankan tidak adanya ortolog GH3 pada alga uniselular (silase Chlorophyta),
meskipun ada ortolog dari IAA amidohydrolases. Konjugasi auxin yang rumit di tanaman yang
lebih tinggi dibandingkan tanaman yang lebih rendah dapat menyarankan evolusi fungsi
tambahan. Satu peran potensial untuk konjugat IAA bisa melawan efek auksin. Perlakuan IAA-
Ala menghambat pertumbuhan tunas yang diinduksi oleh IAA dan inisiasi akar pada kultur sel
tomat (Solanum lycopersicum). Selanjutnya, IAA-Trp memberikan ketahanan terhadap IAA,
IBA, dan asam auxin 2,4-diklorofenoksietat sintetis (2,4-D). Pentingnya fungsional konjugat
yang tidak dapat terhidrolisis, seperti IAA-Asp dan IAA-Glu masih harus ditangani.
Selain efek potensial pada IAA, menarik untuk berspekulasi bahwa beberapa konjugat
IAA dapat bersaing dengan hormon bebas untuk situs pengikatan umum di transporter dan/atau
reseptor, atau bahkan mungkin secara langsung mengatur langkah-langkah pembatasan tingkat
metabolisme auksin. .
Degradasi Oksidatif
Katabolisme IAA telah diusulkan terjadi pada jalur dekarboksilasi oksidatif, yang
menyebabkan modifikasi rantai samping dan cincin indol, atau melalui oksidasi non-
dekarboksilat inti indol. Jalur non-decarboylative tidak hanya mengurangi tingkat IAA bebas,
tetapi juga degradasi konjugat IAA-Asp (Gambar 2). Oleh karena itu, derivatisasi auxin ke
IAA-Asp mewakili metabolik auxin yang berlebihan ke jalur katabolik. Namun, masih harus
dilihat apakah oksidasi IAA-Asp memiliki fungsi pengatur yang berbeda dibandingkan dengan
oksidasi langsung IAA bebas. Juga, oksidasi konjugat lainnya seperti oxIAA-heksosa,
mungkin terkait dengan katabolisme auxin. Degradasi oksidatif auksin tampaknya sangat
penting seperti pada pematangan buah dan selama respon tanaman terhadap stres oksidatif.
Meskupun kurang dipahami, mekanisme seluler yang mengendalikan degradasi oksidatif
auksin tetap ada sampai saat ini.
Auxin Carrier: Kontrol
Menurut hipotesis chemiosmotik, IAA sebagian besar terprotonasi (IAA-H) pada pH
apoplas yang relatif asam dan melewati membran plasma melalui difusi ke dalam sel. Sekali
dalam sitosol terutama deprotonasi karena pH yang lebih tinggi, dan menghasilkan molekul
bermuatan (IAA) adalah membran impermeable, sehingga memerlukan aktivitas transporter
pada membran plasma untuk keluar dari sel. Mekanisme pembawa membran plasma
memungkinkan pengontrolan arah dan laju efusi auksin seluler. Transportasi auksin polar, sel
ke sel merupakan penentu distribusi auksin spatio-temporal jaringan.
Beberapa pembawa auksin telah diidentifikasi. Yang paling menonjol adalah kelas
pembawa AUXIN-RESISTANT 1/LIKE AUX1 (AUX1/LAX), transporter ATP BINDING
CASSETTE (ABC) dari subfamili MUREIDRUG RESISTANCE (MDR), dan pembawa
auksin efflux PIN-FORMED (Gambar 3). Intervensi farmakologis dan genetika dengan fungsi
pembawa auksin menunjukkan pentingnya ragulasi dalam pengembangan tanaman.
Infeksi Seluler
IAA pada prinsipnya masuk sel melalui difusi tetapi dalam beberapa keadaan, difusi
tampaknya tidak mencukupi kebutuhan seluler dalam pengambilan auksin. Empat transporter
mirip asam amino permeleto (AUX1 dan tiga protein LAX) memediasi pengambilan auksin
dengan mengorbankan masuknya H+. Pembawa ini secara simetris atau asimetris terlokalisasi,
tergantung pada jenis sel. Dalam beberapa kasus, AUX1 berlawanan dengan lokalisasi PIN,
ketika didistribusikan secara polar seperti pada sel protoplas akar. Arus yang dimediasi AUX1
ini diperlukan untuk aliran auksin polar yang cepat di sepanjang sumbu transportasi. Sebagai
alternatif, AUX1 mengendalikan homeostasis auksin seluler dengan mengkompensasi tingkat
eflux berlebihan. ABCB4/PGP4 mengalihkan arah transportasi auksin (dari influx ke efflux)
sebagai respons terhadap peningkatan tingkat auksin, mungkin mengisyaratkan substrat yang
diaktifkan daripada eflux konstitutif atau aktivitas influx. Selanjutnya, transporter nitrat NRT1
memfasilitasi penyerapan auksin seluler di bawah kondisi nitrat rendah, memberikan hubungan
langsung antara penginderaan nutrisi dan adaptasi pertumbuhan yang bergantung pada auksin.
Penemuan terbaru menunjukkan kompleksitas yang lebih tinggi dalam mekanisme
pengambilan auksin dari yang diperkirakan sebelumnya.
Non-Polar Cellular Auxin Efflux
P-glikoprotein (PGPs) adalah anggota superfamili ABC ATPase yang ada di mana-
mana, yang terlibat dalam pergerakan molekul kecil, nutrisi, dan xenobiotik. ABCB1/PGP1,
ABCB4/PGP4, dan ABCB19/PGP19 telah ditunjukkan untuk menengahi auksin efflux, namun
berbeda dengan protein PIN, residunya pada membran plasma sebagian besar bersifat non-
polar. Intervensi mekanistik potensial antara dua sistem efflux dinilai oleh studi co-localization,
interaksi molekuler langsung, dan analisis mutan yang menunjukkan perbedaan fungsional
yang agak kompleks. Pengangkut ABC auxin memodulasi laju dan spesifitas transport auksin
tergantung PIN untuk mengurangi refluks auksin dari apoplast dalam mengatur efektifitas
konsentrasi auxin seluler, dan untuk mengangkut subkelas spesifik auksin, seperti yang
dicontohkan oleh inhibitor IBA ABCG37 dan ABCG36.
Protein PIN Menentukan Arus Auxeline Intercellular
Auxin didistribusikan melalui jaringan oleh sistem transportasi sel ke sel yang disebut
transport auksin polar. Auxin efflux carrier dari tipe PIN1 memiliki lokalisasi kutub subselular
pada membran plasma yang berkorelasi dengan menentukan arah aliran auksin melalui jaringan
(Gambar 4). Dengan demikian, polaritas jaringan berhubungan erat dengan arah aliran auksin.
Polarisasi PIN tergantung pada vesikula dan memiliki perkembangan terkait dengan sinyal
yang dimediasi oleh auksin. Banyak sinyal perkembangan dan lingkungan yang diintegrasikan
dengan mengatur pelokalan subkellular dari auxil efflux PIN. Misalnya, polarisasi PIN1 ke sisi
sel basal pada sel provaskular embrio secara tidak sadar
Protein PIN juga diatur oleh auksin, seperti yang digambarkan oleh degradasi protein-
dependent dari PIN1 dan PIN2 (mungkin melalui pensinyalan TIR1-dependent). Intensitas
sinyal PIN7-GFP dan PIN2-GFP pada membran plasma menurun setelah pemberian auksin
konsentrasi tinggi, sedangkan pada konsentrasi rendah jumlah protein PIN2 dan PIN7
meningkat, menunjukkan peran ganda auksin dalam pengaturan transkripsi dan degradasi PIN.
Tingkat umpan balik auxin pada aktivitas PIN telah diajukan. Auxin meningkatkan
efflux dengan modulasi cepat protein. Hebatnya, penghambat internal protein yang dipicu
auxin berasal dari beberapa menit dan memerlukan ABP1, namun tidak bergantung pada jalur
TIR1/AFB. Reseptor auksin ABP1 merupakan regulator positif dari internalisasi protein
membran plasma yang bergantung pada clathrin, sementara ABP1 yang diberi ligan tidak
berhasil mendorong endositosis. ABP1 mengatur penataan ulang sitoskeletal ROP pada sel
epidermal daun, memberikan umpan balik tambahan mengenai polarisasi PIN1 dengan
perkiraan melalui transport vesikula.
Crosstalk phytohormonal untuk mengatur aktivitas pembawa
Berbagai phytohormones mengatur transportasi auksin melalui pengaturan transkripsi
dari komponen transportasi auksin. Sebagai contoh, etilen tidak hanya merangsang biosintesis
auksin, tetapi juga memodulasi transkripsi beberapa komponen transportasi auksin.
Mekanisme pengaturan ini secara fungsional penting untuk transportasi auzin basipetal menuju
zona pemanjangan, dengan mengaktifkan respons elemenasi auksin lokal yang menghambat
pemanjangan sel atau mengarahkan polaritas planar sel rambut akar. Sitokinin mempengaruhi
transport auksin sel ke sel melalui mekanisme pengaturan transkripsi dan posttranskripsional.
Sitokinin menurunkan ekspresi beberapa PIN dalam meristem akar basal yang mempengaruhi
distribusi auksin dan kemudian aktivitas meristem. Selain efek pada transkripsi, sitokinin juga
meningkatkan trafiking endositik PIN1 ke vakuola litik untuk degradasi yang secara substansial
berkontribusi pada organogenesis akar lateral dan meristem akar.
Jasmonate secara positif mengatur transkripsi PIN1 dan PIN2 dan akumulasi fine-tunes
auksin lokal pada meristem basalis akar, yang penting untuk pembentukan akar lateral. Selain
itu, strokolactone phytohormone yang baru diidentifikasi mengendalikan percabangan pada
Arabidopsis, sebagian dengan mengatur tingkat ekspresi PIN1, PIN3, PIN6, dan PIN7.
Berbagai pemicu internal dan eksternal mempengaruhi transpor auksin seluler melalui regulasi
transkripsi carrier auxin. Mekanisme umpan balik ini sangat penting untuk regulasi
pertumbuhan yang dikendalikan oleh fine-tuning auksin fluks.
Kesimpulan
Masih sulit untuk membayangkan bagaimana jalur katabolik dan anabolik auksin
bersamaan dengan regulasi auxin carrier-dependent dari homeostasis auksin seluler yang
terintegrasi secara dinamis dalam memodulasi bentuk tanaman. Tampaknya hormon tanaman
lain atau regulator pertumbuhan mempengaruhi tingkat metabolisme dan transportasi auksin.
Kami berasumsi bahwa crosstalk hormonal bisa memberikan hubungan koordinatif antara
metabolisme dan transportasi auksin. Di sisi lain, auxin memberi isyarat kembali ke jalur
hormonal lainnya. Oleh karena itu, tingkat steady-state phytohormonal global tampaknya
menyeimbangkan homeostasis auksin seluler. Mekanisme itu memberikan cara untuk
menstabilkan/menyangga tingkat auksin dan cukup fleksibel untuk diinduksi (pada isyarat
internal dan eksternal) perubahan substansial pada homeostasis auksin (Gambar 5).
Biosintesis auksin lokal dan pengangkutan auksin sel ke auksin berikutnya
menghasilkan gradien auksin dalam jaringan, melakukan transkripsi yang bergradasi. Selain
itu, biosintesis auksin selama embriogenesis tampaknya diimbangi oleh mekanisme transport
auksin polar yang menyiratkan bahwa pembawa auxin sangat penting untuk atensi auksin
seluler induk. Selain itu, pembawa auksin intraseluler menyebabkan kompartementalisasi
auksin yang mengatur ketersediaan IAA bebas untuk pensinyalan auksin. Menariknya,
kompartementalisasi auksin intraselular ini tampaknya menghubungkan transportasi auksin
dan metabolisme auksin subselularis. Sebagian besar hidrolase konjugat auksin mengandung
motif retensi ER. Dalam patogen Physcomitrella, konjugasi auksin terjadi di sitosol, namun
perlu ditunjukkan pada tanaman yang lebih tinggi. Meskipun percobaan lebih lanjut diperlukan,
temuan ini mengindikasikan bahwa metabolisme auksin sebagian dapat dikelompokkan.
Pemisahan spasial seperti metabolisme auksin dalam kompartemen sel yang berbeda mungkin
memerlukan pengangkutan auxin dan/atau turunan intraselularnya ke organel/kompartemen
tertentu.
Dalam hubungan manusia, istilah 'gatekeeper' telah diusulkan untuk menggambarkan
seseorang yang menentukan makanan mana yang berakhir di meja makan keluarga. Dalam
sistem sosial, gatekeeper menentukan komoditas mana yang dapat masuk ke sistem. Demikian
pula dengan penjaga gerbang, pembawa auksin dapat menyelesaikan apakah informasi akan
terintegrasi dengan memodulasi keadaan yang baik dan homeostasis seluler. Sepanjang ini,
pembawa auxin tampak sebagai penjaga gerbang yang relatif sederhana, karena sejauh yang
kita tahu bahwa kebanyakan dari mereka tidak membedakan antara berbagai komoditas
(substrat), namun hanya mengendalikan tingkat auxin seluler bebas. Namun, mengingat
mekanisme ambang batas spesifik, auxin memang menjadi pemicu perkembangan dengan
memodulasi tingkat auksin bebas untuk sinyal nukleus. Oleh karena itu, kita mengasumsikan
bahwa pembawa auxin baik di UGD maupun di membran plasma berfungsi sebagai penjaga
penting dalam memastikan nasib perkembangan sel atau jaringan tertentu.
Manipulasi lokal tingkat auksin sebagai cara untuk memperbaiki karakteristik
perkembangan tanaman dalam kepentingan pertanian. Ekspresi lokal gen biosintesis iaaM
auxin di plasenta dan ovula beberapa jenis tanaman, seperti tomat, raspberry, stroberi, dan
timun digunakan untuk menginduksi parthenocarpy. Ini mengatasi kebutuhan
penyerbukan/pemupukan yang berhasil dan memungkinkan produksi buah tanpa biji.
Manipulasi spesifik tingkat auxin pada sel epidermis ovula kapas meningkatkan kualitas serta
hasil produksi serat kapas. Selain pembentukan auxin maxima, juga pembentukan auxin
minima pada sel yang dipilih memiliki kepentingan dalam perkembangan buah dan dapat
digunakan untuk mengatur penyebaran benih.
Kami menyimpulkan bahwa modifikasi auxin spesifik tipe sel atau jaringan tampaknya
merupakan strategi sukses dapat diaplikasikan pada pertanian. Oleh karena itu, kita asumsikan
bahwa penggambaran molekuler kompartementalisasi auksin carrier-driven memiliki peran
penting dalam bioteknologi tanaman. Regulasi pembawa auksin intraselular dapat digunakan
untuk membentuk pengembangan tanaman melalui regulasi spesifik jenis sel tingkat IAA
bebas. Modifikasi spesifik aktivitas pembawa auksin intraselular mungkin merupakan
pendekatan yang menjanjikan untuk memahami dan merancang regulasi kompleks
homeostasis auksin seluler.