BIO100 Biologi 3(2-3)

Program Pendidikan Kompetensi Umum

2016
1
 Learning Outcomes (LO)

Kompetensi yang diharapkan bagi mahasiswa yang

telah mengambil MK Biologi adalah memahami dan
dapat menjelaskan:
• Cakupan/tema-tema dan cara mempelajari kehidupan.
• Struktur dan cara kerja sel dan bagaimana sel
memanen energi dan membuat makanan.
• Cara sel bereproduksi, pewarisan sifat, dan biologi
molekuler gen dan rekayasa genetik.
• Keanekaragaman organisme (termasuk struktur dan
fungsi), mulai Monera, Protista, Fungi, Plantae, dan
Animalia.
• Hirarki kehidupan di atas individu, yang mencakup
populasi, komunitas, ekosistem, dan keanekaragaman
hayati yang dapat dimanfaatkan dan usaha
konservasinya.
2
 Silabus
1. Ruang lingkup biologi dan asal-muasal kehidupan
2. Wisata sel
3. Kerja sel dan respirasi selular
4. Fotosintesis
5. Struktur, replikasi dan ekspresi gen
6. Prinsip dasar teknologi DNA rekombinan (bioteknologi)
7. Pola pewarisan sifat
8. Ujian Tengah Semester (UTS)
9. Fungsi hayati, keragaman & peranan monera dan protista
10. Karakteristik tumbuhan
11. Struktur dan fungsi tumbuhan
12. Karakteristik dan fungsi hayati hewan (1)
13. Karakteristik dan fungsi hayati hewan (2)
14. Populasi dan komunitas
15. Ekosistem dan biologi konservasi
16. Ujian Akhir Semester (UAS)
3
 Kontrak Kuliah

A. Identitas dan Koordinator MK

Nama MK : BIO100 Biologi

SKS : 3(2-3)

Koordinator : Dr. Tri Atmowidi

Bagian Biosistematik dan Ekologi Hewan
Departemen Biologi, FMIPA IPB
Email: atmowidi@gmail.com

4
 Kontrak Kuliah
B. Pengajar Smt Ganjil 2016/2017
NO KEL HARI PUKUL RUANG DOSEN UTS DOSEN UAS

BIO100 BIOLOGI

INT TL 2.01
1 SENIN 08:00-09.40 YULIN LESTARI PUJI RIANTI
(internasional) (teaching lab)

2 P04 SENIN 08:00-09.40 CCR. 104 ARIS TJAHJOLEKSONO TARUNI S PRAWASTI

3 P05 SENIN 08:00-09.40 CCR. 105 MIFTAHUDIN DORLY

4 P06 SENIN 08:00-09.40 CCR. 106 ENCE DJ SUPENA BERRY JULIANDI

5 P01 SENIN 10:00-11.40 CCR. 108 HADI SUNARSO NINA RATNA DJUITA

6 P02 SENIN 10:00-11.40 CCR. 109 NAMPIAH SUKARNO TRI HERU WIDARTO

7 P03 SENIN 10:00-11.40 CCR. 110 WINDRA P PUTRA

8 T03 SENIN 13:00-14.40 CCR. 101 ENCE DJ SUPENA MAFRIKUL M

9 T04 SENIN 13:00-14.40 CCR. 102 TRI ATMOWIDI HIRMAS F PUTRA

10 T01 SELASA 10:00-11.40 CCR. 106 ACHMAD FARAJALLAH RITA MEGIA

11 T05 SELASA 10:00-11.40 CCR. 107 TRIADIATI HADI SUNARSO

12 P07 RABU 08:00-09.40 CCR. 202 SRI LISTYOWATI IVAN P PUTRA

13 P08 RABU 08:00-09.40 CCR. 203 DYAH PERWITASARI F PUJI RIANTI

14 T02 RABU 13:00-14.40 CCR. 205 ALEX HARTANA SULISTIJORINI

15 P09 KAMIS 10:00-11.40 CCR. 229 ANJA MERYANDINI HILDA AKMAL

5
 Kontrak Kuliah

C. Kuliah dan Ujian

• Perkuliahan dilaksanakan dalam 14 kali pertemuan, 1 kali

UTS, dan 1 kali UAS.

• Jadwal perkuliahan dan ujian sesuai dengan jadwal yang

dikeluarkan oleh Program Pendidikan Kompetensi Umum
(PPKU).

• Dalam satu kelas, perkuliahan diasuh oleh tim dosen.

• Setiap pertemuan, perkuliahan dilaksanakan dalam 2 x 50

menit.

• Kehadiran mahasiswa dalam perkuliahan minimal 11 kali

(80%) dari 14 kali (100%).
6
 Kontrak Kuliah

C. Kuliah dan Ujian (lanjutan)

• Bagi mahasiswa yang kehadiran perkuliahan kurang dari 11 kali,

tidak diperbolehkan mengikuti UAS dan nilai UAS adalah 0 (nol).

• Mata kuliah BIO100 Biologi TIDAK melakukan ujian perbaikan,

her ataupun remedial.

• Bagi mahasiswa yang tidak dapat mengikuti UTS dan/atau UAS,

dapat mengikuti UJIAN SUSULAN dengan alasan yang dapat
diterima.

• Ujian susulan akan dilaksanakan maksimum 1 minggu setelah

ujian dilaksanan. Mohon mhs segera menghubungi koordinator
mk untuk pengurusan ujian susulan.

7
 Kontrak Kuliah
C. Kuliah dan Ujian (lanjutan)

• Buku Teks: (beberapa tersedia di Perpustakaan IPB)

Jane B. Reece, Lisa A. Urry, Michael L. Cain, Steven A.
Wasserman, Peter V. Minorsky, Robert B. Jackson. 2014.
Campbell Biology.10th. Pearson Education, Inc.

Neil A. Campbell, Jane B. Reece. 2008. Biology 8th. Pearson

Benjamin Cummings: San Francisco.

Slide kuliah dapat didownload di Lecture Management System

- http://lms.ipb.ac.id
- all courses
- Common First Year Program
- Biologi
Enrolment Key: bio100-ganjil-2016-2017

8
 Kontrak Kuliah

Disamping itu, mahasiswa juga dapat mengkopi materi kuliah

(PDF) dan modul dengan menghubungi Pak Sunaryo di
laboratorium Biologi, Gedung Teaching Laboratory

D. Penilaian

• Nilai Akhir ditemtukan dari:

35% UTS + 35% UAS + 30% Praktikum

• Selang nilai huruf mutu mengikuti rataan kelas dan penentuan

selang nilai berdasarkan standar deviasi.
• Huruf Mutu: A, AB, B, BC, C, D, dan E.

9
 Kuliah 1
Cakupan Biologi dan Asal Muasal Kehidupan

Program Pendidikan Kompetensi Umum

2016
 Topik Bahasan

• Cakupan dalam studi biologi

• Bagaimana mempelajari kehidupan?
• Keanekaragaman mahluk hidup
• Asal muasal kehidupan
Cakupan dalam Studi Biologi
 Cakupan Biologi
• Biologi: studi saintifik tentang kehidupan
• Beberapa pertanyaan dalam studi kehidupan:
– Bagaimana sel dapat membentuk organisme
– Bagaimana sistem kerja pada tubuh manusia
– Bagaimana organisme berinteraksi dalam komunitas
• Biologi berkaitan dengan dengan isu-isu utama dunia:
– Masalah lingkungan dan penyelesaiannya
– Kedokteran, rekayasa genetik, dan lainnya
 Cakupan Biologi
Interaksi antar organisme berpengaruh pada kehidupan:
– Pohon Eucalyptus menyediakan makanan dan habitat bagi
flying fox
– Flying fox (kelelawar) membantu penyerbukan dan
penyebaran biji Eucalyptus
 Hirarki Kehidupan

Struktur hirarki kehidupan: molekul sampai ekosistem

(cakupan biologi)

• Ekosistem
- Mencakup semua organisme dalam area
- komponen fisik (tanah, air, dll)

• Komunitas: semua organisme dalam suatu area

• Populasi: kelompok organisms yang sama species dalam suatu
area

• Organisme tersusun atas sistem organ, organs, jaringan, sel,

molekul
 Hirarki Kehidupan

biosphere

organs and 10 µm
organ systems Cell
ecosystems
Organelles
communities
1 µm
Atoms
tissues 50 µm
populations molecules
organisms
Sifat-sifat organsime dan proses berkaitan dengan
kehidupan

Order

Response
to the
environment

Evolutionary
adaptation

Regulation

Reproduction
Energy
processing Growth and
development
 Pendekatan yang Digunakan dalam Studi Biologi

Discovery Science
• Deskripsi beberapa aspek kehidupan dan menggunakan pendekatan
induksi untuk mengambil kesimpulan umum

• Pengamatan spesifik secara berulang untuk mengambil kesimpulan

umum

• Contoh:
- Semua organisme tersusun atas sel (kesimpulan umum)
- Pendekatan induksi yang dipakai: pengamatan spesimen biologi
dengan bantuan mikroskop.
 Pendekatan yang Digunakan dalam Studi Biologi

Hypothesis-Driven Science:
Observation
• Observasi

• Mengajukan pertanyaan Question

• Mengajukan hipotesis Hypothesis

• Prediksi hasil
Prediction

• Tes hipotesis
Test does not Test: Test supports
support Experiment or hypothesis; make
hypothesis; additional additional
revise hypothesis observation predictions and
or pose new one test them
 Hypothesis-Driven Science

Observations

Contoh: lampu senter mati

– Observasi: lampu senter mati
Question

– Pertanyaan: Mengapa lampu senter

mati? Hypothesis #1: Hypothesis #2:
Dead batteries Burnt-out bulb

– Hipotesis 1: Baterai mati

Prediction: Prediction:
Replacing batteries Replacing bulb

– Hipotesis 2: lampu putus

will fix problem will fix problem

Test prediction Test prediction

Test falsifies hypothesis Test does not falsify hypothesis

 Dinamika Ekosistem

Dinamika dalam ekosistem mencakup dua proses utama:

– Siklus materi (materi yang dibutuhkan tanaman akan kembali ke
tanah)
– Aliran energi dari matahari – produsen - konsumen

Inflow
of Loss
light of
energy heat
energy

Air Chemica
l
energy

Organis
ms

Soil
ECOSYSTEM
 Dinamika Ekosistem

Jejaring kehidupan dalam ekosistem hutan tropis

 Struktur dan Fungsi pada Organisme
Contoh:
- Struktur tulang sayap burung berpori (ringan ) - fungsi untuk terbang
- Daun tipis dan datar – memaksimalkan menangkap cahaya matari oleh
kloroplas

(a) Wings
(b) Bones

Infoldings of
membrane

Mitochondrion

0.5 µm
(c) Neurons (d) Mitochondria
 Sel: unit dasar kehidupan
• Sel: level paling rendah dalam organisasi kehidupan yang dapat
melakukan aktivitas

• Semua sel:
– Dibungkus oleh membran
– DNA sebagai bahan genetik

• Kemampuan sel dalam membelah merupakan dasar selular

reproduksi, pertumbuhan, dan regenerasi organisme multiselular
 Sel: unit dasar kehidupan

• Sel prokariot: sederhana, berukuran kecil, tanpa nukleus atau

organel bermembran (bakteri dan arkea)
• Sel eukariot: mempunyai organel bermembran, ukuran besar,
memiliki (tumbuhan, hewan, cendawan, protista)

Prokaryotic cell
Eukaryotic cell DNA
(no nucleus)
Membrane
Membrane
Cytoplasm

Organelles
Nucleus (contains DNA) 1 µm
 Kontinuitas kehidupan tergantung pada
Informasi Genetik dalam DNA

• Kromosom mengandung material genetik (DNA)

(deoxyribonucleic acid)
• Gene: unit pewarisan yang mentransfer informasi dari tetua
ke keturunan
• Kromosom memiliki molekul DNA dengan ratusan-ribuan gen
• DNA diwariskan ke keturuanan dari tetua
• DNA mengontrol perkembangan organisme
 Kontinuitas kehidupan tergantung pada
Informasi Genetik dalam DNA

Nucleus DNA

Nucleotide

Cell

(a) DNA double helix (b) Single strand of DNA

 Kontinuitas kehidupan tergantung pada
Informasi Genetik dalam DNA

Sperm cell

Nuclei
containing
DNA

Fertilized egg Embryo’s cells with

with DNA from copies of inherited DNA
Egg cell both parents Offspring with traits
inherited from
both parents
 Organisasi Diversitas Kehidupan

• Sekitar 1.8 juta spesies telah teridentifikasi dan diberi nama

• Spesies baru teridentifikasi setiap tahunnya.
• Perkiraan jumlah spesies di dunia: 10-100 juta
• Taksonomi: cabang ilmu biologi yang mempelajari penamaan
dan klasifikasi spesies.
 Organisasi Diversitas Kehidupan

Species Genus Family Order Class Phylum Kingdom Domain

Ursus americanus
(American black bear)

Ursus

Ursidae

Carnivora

Mammalia

Chordata

Animalia

Eukarya
 Tiga Domain Mahluk Hidup
(a) DOMAIN BACTERIA

• Domain Bacteria

• Domain Archaea
(b) DOMAIN ARCHAEA
(prokariot)

• Domain Eukarya
(eukariotik)
- Protista (c) DOMAIN EUKARYA

- Cendawan
- Tumbuhan
- Hewan
Protists

Kingdom
Plantae

Kingdom Fungi
Kesatuan dalam Keanekaragaman Mahluk Hidup

– DNA: “bahasa genetik” universal pada semua organisme

– Kesatuan ditunjukkan pada struktur sel

15 µm 5 µm

Cilia of
Paramecium Cilia of
windpipe
cells

0.1 µm
Cross section of a cilium, as viewed
with an electron microscope
 Seleksi Alam
• Fosil dan material lain yang terawetkan merupakan dokumen penting
dalam evolusi kehidupan di bumi dalam jutaan tahun lalu.
• Charles Darwin mempublikasikan tulisan On the Origin of Species by
Means of Natural Selection pada tahun 1859
• Dua poin utama dalam teori Darwin:
– Spesies diwariskan dengan modifikasi dari tetuanya
– Seleksi alam merupakan mekanisme dari pewarisan dengan
modifikasi
• Teori Darwin menjelaskan tentang unity and diversity
 Seleksi Alam

Population Elimination Reproduction Increasing

with varied of individuals of survivors. frequency
inherited traits. with certain of traits that
traits. enhance survival
and reproductive
success.

• Individu dalam populasi mempunyai variasi genetik

• Banyak variasi tersebut diwariskan ke keturunannya
• Banyak keturunan akan bertahan hidup
• Terjadi kompetisi
• Spesies beradaptasi terhadap lingkungannya
Asal-Muasal Kehidupan
Kondisi bumi purba memungkinkan terbentukya kehidupan

Proses kimia dan fisika pada bumi purba memungkinkan

terbentuknya sel sederhana melalui tahapan:
1. Sintesis molekul organik secara abiotik
2. Penggabungan/ikatan molekul organik kecil
membentuk makromolekul
3. Pembentukan “protobionts”
4. Origin of self-replicating molecules
 (1) Sintesis Senyawa Organik pada Awal Bumi Purba

• Bumi terbentuk sekitar 4.6 milyar tahun yang lalu

• Atmosfer bumi purba mengandung air dan senyawa-senyawa
kimia dari gunung berapi (kemungkinan H2O, CO, CO2, N2, dan
CH4, namun sedikit atau tidak ada O2)
• Aktivitas gunung berapi, halilintar, dan radiasi ultra violet sangat
intens.
Kehidupan kemungkinan berkembang dari benta tak hidup
(3.9 milyar tahun yang lalu)

= 500 juta tahun yang lalu

Hewan awal, keragaman algae

Eukariot multiselular awal

Eukaryot awal
Billions of years ago

Akumulasi oksigen dari

cyanobacteria

Fosil prokariot tertua

Awal kehidupan?

Pembentukkan bumi
 Bagaimana Kehidupan Berawal?
• Percobaan Stanley Miller menunjukkan bahwa bahan organik
terbentuk dari bahan-bahan anorganik
• Hasil eksperimen Miller: terbentuk senyawa-senyawa organik
(asam amino, gula, basa nukleotida) CH4
Water vapor
Electrode

Condenser

Cold
water

Cooled water
H2O containing
organic
compounds

Sample for
chemical analysis
 (2) Polimer Pertama Kemungkinan Terbentuk dari
Bebatuan atau Tanah yang Panas
• Molekul-molekul mengalamai polimerisasi pada batu atau
tanah panas.
• Dihasilkan polipeptida dan asam nukleat pendek
• Gen pertama merupakan molekul RNA
• Molekul-molekul tersebut dapat mengkatalisis replikasi RNA.

2 Assembly of a
complementary RNA
chain, the first step in
replication of the
Monomers 1 Formation of short RNA original “gene”
polymers: simple “genes”
 (3) Kerjasama Molekular

RNA
Self-replication
of RNA
• Molekul RNA
digunakan sebagai
cetakan (template)
Self-replicating RNA
untuk acts as template on
which polypeptide
pembentukkan forms.

polipeptida

• Polipeptida tersebut
membantu replikasi Polypeptide
RNA

Polypeptide acts
as primitive
enzyme that
aids RNA
replication.
 (4) Molekul Hasil Kerjasama dibungkus Membran sehingga
Terbentuk Sel Awal

• Terbentuk membran sel – terbentuk sel awal

• Sel awal tersebut berevolusi membnetuk sel prokariot awal

Membrane

RNA

Polypeptide
Thank You