MAKALAH

COVID-19

Dibuat untuk memenuhi tugas mata kuliah Bioteknologi

Dosen Pengampu: Maryati, M. Si., Apt., PhD.

Disusun Oleh :

Listyana Dewi Prastiwi

V100190022

SEKOLAH PASCASARJANA

FAKULTAS FARMASI

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA

2020
 KATA PENGANTAR

Puji syukur atas rahmat Allah SWT karena berkat ridho dan rahmat-Nya
kami dapat menyelesaikan makalah ini tepat pada waktunya sehingga saya
dapat menyusun makalah yang berjudul “Covid 19”. Tugas ini disusun untuk
memenuhi tugas mata kuliah Bioteknologi yang disusun berdasarkan fakta
yang didapatkan dari berbagai sumber.

Saya menyadari sepenuhnya dalam penyusunan makalah ini masih

jauh dari kata sempurna. Untuk itu, saya mengucapkan permohonan maaf
apabila ada penulisan atau penggunaan kata yang salah serta kritik dan
saran yang bersifat membangun merupakan sesuatu yang berharga demi
perbaikan ke depannya. Semoga penyusunan makalah ini dapat memberikan
manfaat bagi para pembacanya.

Surakarta, 18 April 2020

Listyana Dewi Prastiwi

 BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Virus corona merupakan virus yang menyebabkan penyakit pada manusia dan hewan.
Biasanya pada manusia menyebabkan penyakit infeksi saluran pernafasan, dimulai dari flu
biasa hingga penyakit yang serius seperti Middle East Respiratory Syndrome (MERS) dan
Sindrom pernafasan Akut Berat/ Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). Virus corona
merupakan jenis virus baru yang ditemukan pada manusia sejak kejadian pertama di Wuhan
Cina, kemudian diberi nama Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-
COV2), dan menyebabkan penyakit Coronavirus Disease-2019 (COVID-19) (Kemenkes RI,
2020).
Masa inkubasi virus COVID-19 yaitu 14 hari. Dimana kejala dari virus corona sendiri
diantaranya yaitu gejala gangguan pernafasan akut seperti demam, batuk, dan sesak nafas.
Pada kasus yang berat dapat menyebabkan pneumonia, sindrom pernafasan akut, gagal
ginjal, hingga kematian. Untuk membantu dan berkontribusi dalam pengurangan laju dari
wabah ini, Indonesia telah menerapkan social-distancing yang merupakan tindakan disiplin
dalam menjaga jarak. Sejumlah pusat pendidikan, tempat wisata serta kegiatan-kegiatan
diliburkan hingga keadaan kondusif.

1.2 Rumusan Masalah

1. Apakah pengertian virus corona ?
2. Bagaimanakah transmisi virus corona?
3. Bagaimanakah karakteristik virus corona ?
4. Bagaimanakah mekanisme masuknya virus corona pada inang ?
5. Bagaimanakah deteksi virus corona ?
6. Bagaimanakah pengobatan virus corona ?

1.3 Tujuan
1. Mengetahui pengertian virus corona
2. Mengetahui bagaimana transmisi virus corona
3. Mengetahui bagaimana karakteristik virus corona
4. Mengetahui bagaimana mekanisme masuknya virus corona pada inang
5. Mengetahui bagaimana deteksi virus corona
6. Mengetahui bagaimana pengobatan virus corona
 BAB II

PEMBAHASAN

2.1 Pengertian virus corona

Coronavirus (COV) merupakan satu untai RNA virus dengan diameter 80-120 nm.
Coronavirus dibagi menjadi empat jenis diantaranya : α-coronavirus (α-COV), β-coronavirus (β-
COV), δ-coronavirus (δ-COV), dan γ-coronavirus (γ-COV) (Chan JF et al., 2013). SARS-COV 2
merupakan anggota ketujuh dari keluarga coronavirus yang menginfeksi manusia setelah SARS-
COV 2 dan MERS-COV (Zhu N et al., 2020).

2.2 Transmisi virus corona

Studi epidemiologi sebelumnya telah membuktikan bahwa ada tiga kondisi untuk
penyebaran luas virus, yaitu sumber infeksi, rute transmisi, dan kerentanan. Tidak ada
pengecualian untuk SARS-COV-2. Dari sudut pandang sumber infeksi, kelelawar dianggap
sebagai tuan rumah alami SARS-COV-2, sementara pangolins dan ular dianggap sebagai tuan
rumah perantara. Studi Institut Pasteur dari Shanghai menunjukkan bahwa kelelawar mungkin
menjadi tuan rumah alami SARS-COV-2.

Selanjutnya, studi Universitas Peking (Ji W et al., 2020) menunjukkan bahwa infeksi
SARS-COV-2 mungkin disebabkan oleh ular. Namun, kemudian studi (Zhang C et al., 2020)
menemukan bahwa tidak ada bukti yang menunjukkan bahwa ular adalah tuan rumah SARS-
COV-2. Studi dari Wuhan Institute of Virology menunjukkan bahwa kesamaan urutan gen antara
SARS-COV-2 dan Bat Coronavirus setinggi 96,2 % oleh teknologi pengurutan (Zhou P et al.,
2020). Hal ini juga menyiratkan bahwa kelelawar adalah sumber yang mungkin menyebabkan
SARS-COV-2.

Menurut Xu X et al., 2020 mengatakan bahwa persamaan SARS-COV-2 terisolasi dari

trenggiling dan strain virus saat ini menginfeksi manusia setinggi 99% menggunakan pengurutan
makrogenom, pendeteksian biologis molekuler yang membutuhkan lebih banyak studi untuk
menguraikan. Hasil lebih lanjut menunjukkan kemampuan transmisi SARS-COV-2 pada
manusia lebih cepat dibandingkan dengan SARS-COV, serta telah dikonfirmasi jumlah Covid-19
jauh lebih tinggi dibandingkan orang dengan infeksi SARS-COV. Mengingat afinitas yang lebih
tinggi dari SARS-COV-2 mengikat ACE2, ACE2 mempunyai potensi pengobatan untuk
COVID-19.

2.3 Karakteristik virus corona

Virus corona memiliki kapsul, partikel berbentuk bulat atau elips, sering pleimorfik
dengan diameter sekitar 50-200 m. Semua virus ordo Nidovirales memiliki kapsul, tidak
bersegmen, dan virus positif RNA serta memiliki genom RNA sangat panjang. Struktur
coronavirus membentuk struktur seperti kubus dengan protein S berlokasi di permukaan virus.
Protein S atau spike protein merupakan salah satu protein antigen utama virus dan merupakan
struktur utama untuk penulisan gen. Protein S ini berperan dalam penempelan dan masuknya
virus kedalam sel host (interaksi protein S dengan reseptornya di sel inang) (Wang Z et al., 2019,
Fehr AR et al., 2015).

Gambar 1. Struktur virus corona (Wang Z et al., 2019).

Virus corona bersifat sensitif terhadap panas dan secara efektif dapat diinaktifkan oleh
desinfektan mengandung klorin, pelarut lipid dengan suhu 56℃ selama 30 menit, eter, alkohol,
asam perioksiasetat, detergen non-ionik, formalin, oxidizing agent dan kloroform. Klorheksidin
tidak efektif dalam menonaktifkan virus (Korsman SNJ et al., 2012).
2.4 Mekanisme masuknya virus corona pada inang

Semua virus corona mengandung gen spesifik di daerah hilir ORF1 yang mengkodekan
protein untuk replikasi virus, nukleokapsid dan pembentukan paku . Paku glikoprotein pada
permukaan luar coronavirus bertanggung jawab atas perlekatan dan masuknya virus ke sel inang.
Domain pengikat reseptor (RBD) secara longgar melekat di antara virus, oleh karena itu, virus
dapat menginfeksi beberapa host. Virus corona lain sebagian besar mengenali aminopeptidase
atau karbohidrat sebagai reseptor kunci untuk masuk ke sel manusia sementara SARS-CoV dan
MERS-CoV mengenali exopeptidases. Mekanisme masuknya coronavirus tergantung pada
protease seluler yang meliputi, human airway trypsin-like protease (HAT), cathepsin dan
transmembran protease serine 2 (TMPRSS2) yang membagi protein lonjakan dan membentuk
perubahan penetrasi lebih lanjut. MERS-coronavirus menggunakan dipeptidyl peptidase 4
(DPP4), sedangkan HCoV-NL63 dan SARS-coronavirus membutuhkan enzim pengonversi
angiotensin 2 (ACE2) sebagai reseptor utama.

SARS-CoV-2 memiliki struktur coronavirus khas dengan protein spike dan juga
mengekspresikan poliprotein, nukleoprotein, dan protein membran lainnya, seperti RNA
polimerase, protease seperti 3-chymotrypsin, protease mirip papain, helikase, glikoprotein, dan
protein aksesori. Protein lonjakan SARS-CoV-2 mengandung struktur 3-D di wilayah RBD
untuk mempertahankan kekuatan van der Waals. 394 residu glutamin di wilayah RBD dari
SARS-CoV-2 diakui oleh residu lisin 31 kritis pada reseptor ACE2 manusia.
 Gambar 2. Siklus hidup SARS-CoV-2 dalam sel inang (Sheeren MA., 2020).

Siklus hidup SARS-CoV-2 dalam sel inang; memulai siklus hidupnya ketika protein S
berikatan dengan reseptor seluler ACE2. Setelah pengikatan reseptor, perubahan konformasi
pada protein S memfasilitasi fusi amplop virus dengan membran sel melalui jalur endosom.
Kemudian SARS-CoV-2 melepaskan RNA ke dalam sel inang. Genom RNA diterjemahkan ke
dalam poliprotein replikasi virus pp1a dan 1ab, yang kemudian dibelah menjadi produk kecil
oleh proteinase virus. Polimerase menghasilkan serangkaian mRNA subgenomik dengan
transkripsi diskontinyu dan akhirnya diterjemahkan menjadi protein virus yang relevan. Protein
virus dan RNA genom kemudian dirakit menjadi virion di UGD dan Golgi dan kemudian
diangkut melalui vesikel dan dilepaskan keluar dari sel. ACE2, enzim pengonversi angiotensin 2;
ER, retikulum endoplasma; ERGIC, kompartemen perantara ER-Golgi (Sheeren MA et al.,
2020).

2.5 Deteksi virus COVID-19

Deteksi infeksi virus corona dilakukan dengan metode swap (usap hidung, usap
tenggorokan, tetesan pernafasan serta aerosol). Kemudian jika didapatkan hasil positif
dilanjutkan dengan uji RT-PCR (Leung et al, 2020). Reverse transcription polymerase chain
reaction (RT-PCR) merupakan teknik laboratorium menggabungkan transkripsi terbalik dari
RNA ke DNA (dalam konteks ini disebut DNA komplementer atau cDNA) dan amplifikasi
target DNA tertentu menggunakan polymerase chain reaction (PCR). digunakan untuk mengukur
jumlah RNA tertentu. Ini dicapai dengan memantau reaksi amplifikasi menggunakan fluoresensi,
teknik yang disebut PCR waktu-nyata atau PCR kuantitatif (qPCR). Gabungan RT-PCR dan
qPCR secara rutin digunakan untuk analisis ekspresi gen dan kuantifikasi viral load dalam
penelitian dan pengaturan klinis (Freeman WM et al., 1999).

2.6 Pengobatan virus corona

2.6.1 Chloroquine

Sejumlah mekanisme potensial aksi CQ / HCQ terhadap SARS-CoV-2 telah

dipostulasikan. Virus diyakini memasuki sel dengan mengikat enzim permukaan sel yang
disebut angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). Ekspresi ACE2 juga diyakini diregulasi
oleh infeksi dengan SARS-CoV-2. Chloroquine dapat mengurangi glikosilasi ACE2, sehingga
mencegah COVID-19 dari ikatan yang efektif dengan sel inang. Lebih lanjut, Savarino et al.,
2003 berhipotesis bahwa CQ dapat memblokir produksi sitokin pro-inflamasi (seperti
interleukin-6), sehingga menghalangi jalur yang kemudian mengarah ke sindrom gangguan
pernapasan akut (ARDS). Beberapa virus memasuki sel inang melalui endositosis; virus
ditransportasikan dalam sel inang dalam vesikel turunan sel-sel yang disebut endosom, tempat
virus dapat bereplikasi. Ketika endosom menyatu dengan lisosom intraseluler asam, hal ini
menyebabkan pecahnya endosom dengan pelepasan konten virus. Klorokuin telah ditemukan
terakumulasi dalam lisosom, mengganggu proses ini. Chloroquine juga diyakini
meningkatkan level pH endosom, yang dapat mengganggu masuknya virus dan / atau keluar
dari sel inang.

2.6.2 Favipiravir

Favipiravir adalah prodrug yang mengalami ribosilasi dan fosforilasi intraseluler menjadi
bentuk aktif favipiravir-RTP. Favipiravir-RTP berikatan dengan dan menghambat RNA-
dependent RNA polymerase (RdRp) virus, mengakibatkan hambatan transkripsi dan replikasi
genom virus. Domain katalitik RdRp tersebut serupa di antara virus-virus RNA, membuat
favipiravir memiliki spektrum antivirus RNA yang luas. Karena manusia tidak memiliki
RdRp, Favipiravir relatif aman digunakan. Akan tetapi penggunaan favipiravir harus dihindari
pada ibu hamil karena berisiko teratogenik dan embriotoksik (Dong L et al., 2020, Furuta Y et
al., 2017).
 BAB III

PENUTUP

3.1 Kesimpulan

Coronavirus (COV) merupakan satu untai RNA virus dengan diameter 80-120 nm.
Coronavirus dibagi menjadi empat jenis diantaranya : α-coronavirus (α-COV), β-coronavirus
(β-COV), δ-coronavirus (δ-COV), dan γ-coronavirus (γ-COV) (Chan JF et al., 2013). SARS-
COV 2 merupakan anggota ketujuh dari keluarga coronavirus yang menginfeksi manusia
setelah SARS-COV 2 dan MERS-COV dan merupakan penyakit akut yang dapat
menyebabkan kematian.
Deteksi virus corona menggunakan metode swab yang kemudian dilanjutkan dengan uji
menggunakan metode RT-PCR menggunakan sampel specimen darah dan specimen saluran
pernafasan bagian bawah.
Obat yang direkomendasikan untuk pasien Covid-19 yaitu Chloroquine dan Favipiravir.

3.2 Ide Penelitian

Pemanfaatan buah paprika sebagai antioksidan pencegahan Covid-19

Kandungan senyawa lama dari buah paprika yaitu beta-karoten, vitamin (A, C, E, dan K).
 Kandungan Vitamin C buah paprika yaitu 190 mg tiap 100 gr buah. Paprika juga
mengandung senyawa yang bermanfaat yang bermanfaat sebagai energi, antara lain : protein,
karbohidrat, lemak jenuh dan lemak tidak jenuh. Paprika mengandung senyawa yang
membuat rasa pedas yaitu capsaisin. Kandungan mineral pada paprika sangat lengkap, yaitu :
kalsium, besi, kalium, magnesium, fosfor, natrium, seng, tembaga, mangan, selenium serta
asam folat. Paprika juga mengandung vitamin B kompleks. Kandungan vitamin B6 pada
paprika termasuk kategori excellent, karena paprika mengandung vitamin B6 dengan tingkat
densitas tinggi (Astawan, 2009). Vitamin C selain berfungsi sebagai antioksidan juga dapat
membantu dalam produksi sel darah putih dan melawan beberapa penyakit radang. Vitamin c
juga diketahui dapat berperan sebagai antivirus dan antibakteri. Menurut Jurnal Kemoterapi
Antimikroba, vitamin c telah mengurangi keparahan dan durasi pilek pada manusia serta
menurunkan infeksi pernafasan virus.

DAFTAR PUSTAKA

Astawan, Made., 2009, Paprika Bikin Agresif Sperma, (www.CBN.com), Indonesia.

Devaux, C.A., Rolain, J.M., Colson, P. and Raoult, D., 2020. New insights on the antiviral
effects of chloroquine against coronavirus: what to expect for COVID-19?. International
Journal of Antimicrobial Agents, p.105938.

Dong L, Hu S, Gao J. Discovering drugs to treat coronavirus disease 2019 (COVID-19). Drug
Discov Ther. 2020;14(1):58-60. doi:10.5582/ddt.2020.01012

Fehr AR, Perlman S. Coronavirus: An Overview of Their Replication and Pathogenesis.

Methods Mol Biol. 2015 ; 1282: 1– 23.

Freeman WM, Walker SJ, Vrana KE (January 1999). "Quantitative RT-PCR: pitfalls and
potential". BioTechniques. 26 (1): 112–22, 124–5.

Furuta Y, Komeno T, Nakamura T. Favipiravir (T-705), a broad spectrum inhibitor of viral RNA
polymerase. Proc Japan Acad Ser B Phys Biol Sci. 2017;93(7):449-463.
doi:10.2183/pjab.93.027
Golden EB, Cho HY, Hofman FM, Louie SG, Schonthal AH, Chen TC. Quinoline-based
antimalarial drugs: a novel class of autophagy inhibitors. Neurosurg Focus. 2015;38(3):E12.

Korsman SNJ, van Zyl GU, Nutt L, Andersson MI, Presier W. Viroloy. Chins: Churchill
Livingston Elsevier; 2012

Savarino, A., Boelaert, J.R., Cassone, A., Majori, G. and Cauda, R., 2003. Effects of chloroquine
on viral infections: an old drug against today’s diseases. The Lancet infectious diseases,
3(11), pp.722-727.

Vincent, M.J., Bergeron, E., Benjannet, S., Erickson, B.R., Rollin, P.E., Ksiazek, T.G., Seidah,
N.G. and Nichol, S.T., 2005. Chloroquine is a potent inhibitor of SARS coronavirus
infection and spread. Virology journal, 2(1), p.69.

Wang Z, Qiang W, Ke H. A Handbook of 2019-nCoV Pneumonia Control and Prevention. Hubei

Science and Technologi Press. China; 2020.

Wang, P.H., 2020. Increasing Host Cellular Receptor—Angiotensin-Converting Enzyme 2

(ACE2) Expression by Coronavirus may Facilitate 2019-nCoV Infection. bioRxiv.

Zhou, P., Yang, X.L., Wang, X.G., Hu, B., Zhang, L., Zhang, W., Si, H.R., Zhu, Y., Li, B.,
Huang, C.L. and Chen, H.D., 2020. A pneumonia outbreak associated with a new
coronavirus of probable bat origin. Nature, pp.1-4.