PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang
Pada dasarnya, fotosintesis merupakan proses penyusunan karbohidrat atau
zat gula dengan menggunakan energi matahari. Matahari sebagai sumber energi
utama bagi kehidupan di bumi. Namun tidak semua organisme mampu secara
langsung menggunakannya. Hanya golongan tumbuhan dan beberapa jenis
bakteri saja yang mampu menyerap energi matahri dan memanfaatkannya untuk
fotosintesis. Melalui fotosintesis tumbuhan menyusun zat makanan yaitu
karbohidrat. Karena kemampuan menyusun makanannya sendiri inilah,
tumbuhan disebut organisme autotrof. Fotosintesis ternyata berlangsung dalam
dua reaksi yaitu reaksi terang dan reaksi gelap. Reaksi terang adalah tahap
dimana fotosintesis membutuhkan cahaya matahari, sedangkan reaksi gelap
adalah reaksi yang beralangsung tanpa bantuan cahaya matahari.
1.2 Rumusan Masalah
Berdasarkan latar belakang di atas. rumusan masalah dari makalah ini adalah
sebagai berikut.
1. Apa yang dimaksud dengan siklus Calvin?
2. Bagaimana peran enzim dalam proses fotosintesis?
3. Apa saja faktor-faktor yang mempengaruhi laju fotosintesis?
1.3 Tujuan
Berdasarkan rumusan masalah di atas, tujuan dari makalah ini adalah sebagai
berikut.
1. Mahasiswa dapat mengetahui pengertian siklus Calvin
2. Mahasiswa dapat mengetahui peran enzim dalam proses fotosintesis.
3. Mahasiswa dapat mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi laju
fotosintesis.
BAB II
PEMBAHASAN
2.1 1 Siklus Calvin
Siklus Calvin berlangsung dalam tiga tahap (Gambar 8.2):
1. Karboksilasi akseptor CO2 ribulosa-1,5-bifosfat, membentuk dua molekul 3-
fosfogliserat, zat antara stabil pertama dari siklus Calvin
2. Pengurangan 3-fosfogliserat, membentuk gyceraldehyde-3-fosfat, karbohidrat
3. Regenerasi akseptor CO2 ribulosa-1,5-bifosfat dari gliseraldehida-3-fosfat
Karbon dalam CO2 adalah bentuk teroksidasi yang ditemukan di alam (+4).
Karbon dari zat antara stabil pertama, 3fosfogliserat, lebih berkurang (+3), dan
selanjutnya berkurang dalam produk gliseraldehida-3-fosfat (+1). Secara keseluruhan,
reaksi awal siklus Calvin melengkapi pengurangan karbon atmosfer dan, dengan
demikian, memfasilitasi penggabungannya menjadi senyawa organik.
Karboksilasi Bifosfat Ribulosa Dikatalisis oleh Enzim Rubisco
CO2 memasuki siklus Calvin dengan bereaksi dengan ribulosa-1,5bisfosfat
untuk menghasilkan dua molekul 3-fosfogliserat (Gambar 8.3 dan Tabel 8.1), suatu
reaksi yang dikatalisis oleh enzim kloroplas ribulosa bifosfat karboksilase /
oksigenase, disebut sebagai rubisco (lihat Topik Web 8.2). Seperti ditunjukkan oleh
nama lengkapnya, enzim ini juga memiliki aktivitas oksigenase di mana O2 bersaing
dengan CO2 untuk substrat umum ribulosa-1,5-bifosfat (Lorimer 1983).
Gambar 8.2 Siklus Calvin berlangsung dalam tiga tahap: (1) karboksilasi, di mana CO2
secara kovalen terkait dengan kerangka karbon; (2) reduksi, di mana karbohidrat
dibentuk dengan mengorbankan ATP yang diturunkan secara fotokimia dan
mengurangi ekivalen dalam bentuk NADPH; dan (3) regenerasi, di mana akseptor
CO2 ribulosa, 1,5-bifosfat terbentuk kembali.
Dua sifat reaksi karboksilase sangat penting:
1. Perubahan negatif dalam energi bebas yang terkait dengan karboksilasi
ribulosa-1,5-bifosfat adalah besar; dengan demikian reaksi ke depan sangat
disukai.
2. Afinitas rubisco untuk CO2 cukup tinggi untuk memastikan karboksilasi cepat
pada konsentrasi rendah CO2 yang ditemukan dalam sel fotosintesis.
Triose Fosfat Dibentuk dalam Langkah Pengurangan Siklus Calvin Selanjutnya
dalam siklus Calvin (Gambar 8.3 dan Tabel 8.1), 3 fosfogliserat yang terbentuk
dalam tahap karboksilasi mengalami dua modifikasi:
1. Pertama kali difosforilasi melalui 3-fosfogliserat kinase menjadi 1, 3-
bifosfogliserat melalui penggunaan ATP yang dihasilkan dalam reaksi cahaya
(Tabel 8.1, reaksi 2).
2. Kemudian direduksi menjadi gliseraldehida-3-fosfat melalui penggunaan
NADPH yang dihasilkan oleh reaksi cahaya (Tabel 8.1, reaksi 3). Enzim
kloroplas NADP: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase mengkatalisasi
langkah ini. Suatu bentuk NADP terkait enzim disintesis selama
pengembangan kloroplas (penghijauan), dan bentuk ini lebih disukai
digunakan dalam reaksi biosintesis.
Siklus Calvin Meregenerasi Komponen Biokimia Sendiri
Reaksi siklus Calvin meregenerasi zat antara biokimia yang diperlukan untuk
mempertahankan operasi siklus. Tetapi yang lebih penting, laju operasi siklus Calvin
dapat ditingkatkan dengan peningkatan konsentrasi zat antara; artinya, siklusnya
adalah autokatalitik. Sebagai akibatnya, siklus Calvin memiliki fitur yang diinginkan
secara metabolik yaitu menghasilkan lebih banyak substrat daripada yang
dikonsumsi, selama triose fosfat tidak dialihkan di tempat lain:
5 RuBP4– + 5 CO2 + 9 H2O + 16 ATP4– + 10 NADPH → 6 RuBP4 - + 14 Pi + 6 H + +
16 ADP3– + 10 NADP + Pentingnya sifat autokatalitik ini ditunjukkan oleh
percobaan di mana daun yang sebelumnya gelap atau kloroplas yang terisolasi
diterangi.
Dalam percobaan tersebut, fiksasi CO2 dimulai hanya setelah jeda, yang
disebut periode induksi, dan laju fotosintesis meningkat seiring waktu dalam
beberapa menit pertama setelah timbulnya iluminasi. Peningkatan laju fotosintesis
selama periode induksi sebagian disebabkan oleh aktivasi enzim oleh cahaya (dibahas
kemudian), dan sebagian karena peningkatan konsentrasi zat antara siklus Calvin.
Calvin Cycle Stoichiometry Menunjukkan Bahwa Hanya Seperenam dari Triose
Phosphate Digunakan untuk Sukrosa atau Pati
Sintesis karbohidrat (pati, sukrosa) menyediakan bak untuk memastikan aliran
atom karbon yang cukup melalui siklus Calvin dalam kondisi penyerapan CO2 terus-
menerus. Fitur penting dari siklus ini adalah stoikiometri keseluruhannya. Pada awal
iluminasi, sebagian besar triose fosfat ditarik kembali ke dalam siklus untuk
memfasilitasi penumpukan konsentrasi metabolit yang memadai. Ketika fotosintesis
mencapai keadaan stabil, lima perenam triosa fosfat berkontribusi untuk regenerasi
ribulosa-1,5-bifosfat, dan seperenam diekspor ke sitosol untuk sintesis sukrosa atau
metabolit lain yang dikonversi menjadi pati dalam kloroplas.
Input energi, yang disediakan oleh ATP dan NADPH, diperlukan untuk
menjaga siklus berfungsi dalam fiksasi CO2. Perhitungan pada akhir Tabel 8.1
menunjukkan bahwa untuk mensintesis setara dengan 1 molekul heksosa, 6 molekul
CO2 ditetapkan dengan mengorbankan 18 ATP dan 12 NADPH. Dengan kata lain,
siklus Calvin mengkonsumsi dua molekul NADPH dan tiga molekul ATP untuk
setiap molekul CO2 yang dimasukkan ke dalam karbohidrat.
Siklus Calvin tidak terjadi di semua sel autotrophic. Beberapa bakteri anaerob
menggunakan jalur lain untuk pertumbuhan autotropik:
1. Sintesis asam organik yang dimediasi ferredoksin dari asetil- dan suksinil-
Kooperatif melalui pembalikan siklus asam sitrat (siklus asam karboksilat
reduktif dari bakteri sulfur hijau)Penghasil glikoksilat
2. siklus (jalur hidroksipropionat dari bakteri nonsulfur hijau)
3. Rute linier (asetil-CoApathway) dari bakteri asetogenik, metanogenik
Jadi, meskipun siklus Calvin secara kuantitatif merupakan jalur terpenting dari fiksasi
CO2 autotrofik.
Peraturan Siklus Kalvin
Efisiensi energi yang tinggi dari siklus Calvin menunjukkan bahwa beberapa
bentuk regulasi memastikan bahwa semua zat antara dalam siklus hadir pada
konsentrasi yang memadai dan bahwa siklus dimatikan saat tidak diperlukan dalam
gelap. Secara umum, variasi konsentrasi atau aktivitas spesifik enzim memodulasi
laju katalitik, sehingga menyesuaikan tingkat metabolit dalam siklus.
Perubahan dalam ekspresi gen dan biosintesis protein mengatur konsentrasi
enzim. Modifikasi protein posttranslasional berkontribusi pada regulasi aktivitas
enzim. Pada tingkat genetik, jumlah setiap enzim yang ada dalam stroma kloroplas
diatur oleh mekanisme yang mengontrol ekspresi genom nuklir dan kloroplas (Maier
et al. 1995; Purton 1995).
Pengaturan jangka pendek dari siklus Calvin dicapai oleh beberapa
mekanisme yang mengoptimalkan konsentrasi zat antara. Mekanisme ini
meminimalkan reaksi yang beroperasi di arah yang berlawanan, yang akan
membuang sumber daya (Wolosiuk et al. 1993). Dua mekanisme umum dapat
mengubah sifat kinetik enzim:
1) Transformasi ikatan kovalen seperti pengurangan disulfida dan karbamilasi
gugus amino, yang menghasilkan enzim yang dimodifikasi secara kimia.
2) Modifikasi interaksi nonkovalen, seperti pengikatan metabolit atau perubahan
komposisi lingkungan seluler (misalnya, pH). Selain itu, pengikatan enzim
pada membran tilakoid meningkatkan efisiensi siklus Calvin, sehingga
mencapai tingkat organisasi yang lebih tinggi yang mendukung penyaluran
dan perlindungan substrat.
Aktivasi Enzim Bergantung Cahaya Mengatur Siklus Calvin Lima enzim
teregulasi cahaya beroperasi dalam siklus Calvin: 1. Rubisco 2. NADP:
gliseraldehida-3-fosfat dehidrogenase 3. Fruktosa-1,6-bisphosphatase 4.
Sedoheptulose-1,7- bisphosphatase 5. Ribulose-5-phosphate kinase
Empat enzim terakhir mengandung satu atau lebih kelompok disulfida (—S
— S—). Cahaya mengontrol aktivitas empat enzim ini melalui sistem ferredoxin-
thioredoxin, mekanisme reduksi-oksidasi berbasis tiol kovalen yang diidentifikasi
oleh Bob Buchanan dan rekannya (Buchanan 1980; Wolosiuk et al. 1993; Besse dan
Buchanan 1997; Schürmann dan Jacquot 2000) .
Dalam gelap residu ini ada dalam keadaan teroksidasi (—S — S—), yang
membuat enzim tidak aktif atau subaktif. Dalam terang kelompok —S — S—
direduksi menjadi keadaan sulfhidril (—SH HS—). Perubahan redoks ini mengarah
pada aktivasi enzim (Gambar 8.5). Resolusi struktur kristal dari masing-masing
anggota sistem ferredoxin-thioredoxin dan enzim target fruktosa-1,6bisphosphatase
dan NADP: malat dehydrogenase (Dai et al. 2000 ) telah memberikan informasi
berharga tentang mekanisme yang terlibat.
Inaktivasi enzim target yang diamati pada penggelapan tampaknya terjadi
dengan pembalikan jalur reduksi (aktivasi). Yaitu, oksigen mengubah tioredoksin dan
enzim target dari keadaan tereduksi (—SH HS—) menjadi keadaan teroksidasi (—S
— S—) dan, dengan demikian, mengarah pada inaktivasi enzim (lihat Gambar 8.5;
lihat juga Topik Web 8.4). Empat enzim terakhir yang tercantum di sini diatur
langsung oleh thioredoxin; yang pertama, rubisco, diatur secara tidak langsung oleh
enzim aksesori thioredoxin, rubisco activase (lihat bagian selanjutnya).
Aktivitas Rubisco Meningkat dalam Cahaya
Aktivitas rubisco juga diatur oleh cahaya, tetapi enzim itu sendiri tidak
merespons thioredoxin. George Lorimer dan rekannya menemukan bahwa rubisco
diaktifkan ketika aktivator CO2 (molekul berbeda dari substrat CO2 yang menjadi
terfiksasi) bereaksi lambat dengan gugus lisin ε-NH2 yang tidak bermuatan dalam
situs aktif enzim. Turunan karbamat yang dihasilkan (situs anionik baru) kemudian
dengan cepat mengikat Mg2 + untuk menghasilkan kompleks yang diaktifkan
(Gambar 8.6).
Dua proton dilepaskan selama pembentukan kompleks terner rubisco-CO2-
Mg2 +, sehingga aktivasi dipromosikan oleh peningkatan pH dan konsentrasi Mg2 +.
Dengan demikian, perubahan stroma bergantung-cahaya pada pH dan Mg2 + (lihat
bagian selanjutnya) muncul untuk memfasilitasi aktivasi yang diamati dari rubisco
oleh cahaya.
Dalam keadaan aktif, rubisco mengikat molekul CO2 lain, yang bereaksi
dengan bentuk 2,3-enediol ribulosa1,5-bifosfat (P — O — CH2 — COH— —COH
— CHOH— CH2O — P) menghasilkan 2-karboksi -3-ketoribitol 1,5-bisphos phate.
Ketidakstabilan ekstrim dari zat antara terakhir mengarah pada pembelahan ikatan
yang menghubungkan karbon 2 dan 3 dari ribulosa-1,5-bifosfat, dan sebagai
konsekuensinya, rubisco melepaskan dua molekul 3-fosfogliserat.
GAMBAR 8.6 Salah satu cara di mana rubisco diaktifkan melibatkan pembentukan
kompleks karbamat-Mg2 + pada gugus ε-amino dari lisin di dalam situs aktif enzim.
Dua proton dilepaskan. Aktivasi ditingkatkan oleh peningkatan konsentrasi Mg2 +
dan pH lebih tinggi (konsentrasi H + rendah) yang dihasilkan dari pencahayaan. CO2
yang terlibat dalam reaksi karbamat-Mg2 + tidak sama dengan CO2 yang terlibat
dalam karboksilasi ribulosa-1,5-bifosfat.
Rubisco juga diatur oleh gula fosfat alami, carboxyarabinitol-1-phosphate,
yang sangat mirip dengan transisi transisi enam-karbon dari reaksi karboksilasi.
Inhibitor ini hadir pada konsentrasi rendah pada daun banyak spesies dan pada
konsentrasi tinggi pada daun polong-polongan seperti kedelai dan kacang.
Carboxyarabinitol1-fosfat berikatan dengan rubisco di malam hari, dan dihilangkan
oleh aksi rubisco activase di pagi hari, ketika densitas fluks foton meningkat. .
Gerakan Ion Bergantung Cahaya Mengatur Enzim Siklus Calvin
Cahaya menyebabkan perubahan ion yang dapat dibalik dalam stroma yang
memengaruhi aktivitas rubisco dan enzim kloroplas lainnya. Setelah iluminasi, proton
dipompa dari stroma ke lumen thylakoids. Eflux proton digabungkan ke serapan Mg2
+ ke dalam stroma. Fluks ion ini menurunkan konsentrasi stroma H + (pH 7 → 8) dan
meningkatkan Mg2 +. Perubahan ini dalam komposisi ion stroma kloroplas dibalik
setelah gelap.
Beberapa enzim siklus Calvin (rubisco, fructose-1,6bisphosphatase,
sedoheptulose-1,7-bisphosphatase, dan ribulose-5-phosphate kinase) lebih aktif pada
pH 8 daripada pada pH 7 dan memerlukan Mg2 + sebagai kofaktor untuk katalisis.
Karenanya fluks ion yang bergantung pada cahaya ini meningkatkan aktivitas enzim-
enzim kunci dari siklus Calvin (Heldt 1979).
SIKLUS KARBON FOTOKSINATIF C2OXIDATIVE
Sifat penting dari rubisco adalah kemampuannya untuk mengkatalisasi
karboksilasi dan oksigenasi RuBP. Oksigenasi adalah reaksi utama dalam proses yang
dikenal sebagai fotorespirasi. Karena fotosintesis dan fotorespirasi bekerja dalam arah
yang berlawanan secara diametral, fotorespirasi menghasilkan hilangnya sel CO2 dari
sel yang secara bersamaan memperbaiki CO2 oleh siklus Calvin (Ogren 1984;
Leegood et al. 1995).
a) Fotosintetik CO2Fiksasi dan Oksigenasi Fotorespirasi Adalah Persaingan
Reaksi
Penggabungan satu molekul O2 ke dalam isomer 2,3-enediol ribulosa-
1,5-bifosfat menghasilkan zat antara yang tidak stabil yang dengan cepat
membelah menjadi 2-fosfoglikolat dan 3-fosfogliserat (Gambar 8.7 dan Tabel
8.2, reaksi 1). Kemampuan untuk mengkatalisasi oksigenasi ribulosa-1,5-
bifosfat adalah properti dari semua rubiscos, terlepas dari asal taksonomi.
Bahkan rubisco dari bakteri anaerob, autotrofik mengkatalisis reaksi
oksigenase ketika terpapar oksigen.
Gambar 8.7 Reaksi utama dari siklus fotorespirasi. Operasi siklus fotosintesis oksidatif
C2 melibatkan interaksi kooperatif antara tiga organel: kloroplas, mitokondria, dan
peroksisom. Dua molekul glikolat (empat karbon) yang diangkut dari kloroplas ke
dalam peroksisom diubah menjadi glisin, yang kemudian diekspor ke mitokondria
dan diubah menjadi serin (tiga karbon) dengan pelepasan karbon dioksida (satu
karbon) secara bersamaan. Serin diangkut ke peroksisom dan diubah menjadi gliserat.
Yang terakhir mengalir ke kloroplas di mana fosforilasi to3-fosfogliserat dan
dimasukkan ke dalam siklus Calvin. Nitrogen anorganik (amonia) yang dilepaskan
oleh mitokondria ditangkap oleh kloroplas untuk dimasukkan ke dalam asam amino
dengan menggunakan kerangka yang sesuai (α-ketoglutarate). Tanda panah berwarna
merah menandai asimilasi amonia menjadi glutamat yang dikatalisasi oleh glutamin
sintetase. Selain itu, penyerapan oksigen dalam peroksisom mendukung siklus
oksigen pendek yang digabungkan dengan reaksi oksidatif. Aliran karbon, nitrogen,
dan oksigen masing-masing ditunjukkan dalam warna hitam, merah dan biru. Lihat
Tabel 8.2 untuk deskripsi masing-masing reaksi bernomor.
Sebagai substrat alternatif untuk rubisco, CO2 dan O2 bersaing untuk bereaksi
dengan ribulosa-1,5-bifosfat karena karboksilasi dan oksigenasi terjadi di dalam situs
aktif enzim yang sama. Menawarkan konsentrasi CO2 dan O2 yang sama dalam
tabung reaksi, rubios angiosperma memperbaiki CO2 sekitar 80 kali lebih cepat
daripada oksigenatnya. Namun, larutan dalam kesetimbangan dengan udara pada 25 °
C memiliki rasio CO2: O2 0,0416 (lihat Topik Web 8.2 dan 8.3). Pada konsentrasi
ini, karboksilasi dalam udara melebihi oksigenasi oleh tiga hingga satu.
Siklus karbon fotosintesis oksidatif C2 bertindak sebagai operasi pemulung
untuk memulihkan karbon tetap yang hilang selama fotorespirasi oleh reaksi
oksigenase dari rubisco (Web Topic 8.6). 2-fosfoglikolat yang terbentuk dalam
kloroplas oleh oksigenasi ribulosa-1,5-bifosfat cepat dihidrolisis menjadi glikol oleh
kloroplas fosfatase spesifik (Gambar 8.7 dan Tabel 8.2, reaksi 2). Metabolisme
glikolat selanjutnya melibatkan kerja sama dua organel lain: peroksisom dan
mitokondria (lihat Bab 1) (Tolbert 1981).
Glikolat meninggalkan kloroplas melalui protein transporter spesifik dalam
membran amplop dan berdifusi ke peroksisom. Di sana dioksidasi menjadi glioksilat
dan hidrogen peroksida (H2O2) oleh oksidase tergantung flavin mononukleotida:
glikol oksidase (Gambar 8.7 dan Tabel 8.2, reaksi 3). Sejumlah besar hidrogen
peroksida yang dilepaskan dalam peroksisom dihancurkan oleh aksi katalase (Tabel
8.2, reaksi 4) sementara glioksilat mengalami transaminasi (reaksi 5). Donor amino
untuk transaminasi ini mungkin glutamat, dan produknya adalah asam amino glisin.
Glycine meninggalkan peroxisome dan memasuki mitokondria (lihat Gambar 8.7). Di
sana kompleks multienzim glikin dekarboksilase mengkatalisis konversi dua molekul
glisin dan satu NAD + menjadi satu molekul masing-masing serin, NADH, NH4 +
dan CO2 (Tabel 8.2, reaksi 6 dan 7). Kompleks multienzim ini, hadir dalam
konsentrasi besar dalam matriks mitokondria tanaman, terdiri dari empat protein,
bernama H-protein (polipeptida yang mengandung lipoamide), protein-P (protein 200
kDa, homodimer, protein yang mengandung fosfat piridoksal), T- protein (protein
yang bergantung pada folat), dan protein-L (protein yang mengandung flavin adenin
nukleotida).
Amonia yang terbentuk dalam oksidasi glisin berdifusi dengan cepat dari
matriks mitokondria menjadi kloroplas, di mana glutamin sintetase
menggabungkannya dengan kerangka karbon untuk membentuk asam amino. Serin
yang baru terbentuk meninggalkan mitokondria dan memasuki peroksisom, di mana
ia diubah pertama-tama dengan transaminasi menjadi hidroksipiriruvat (Tabel 8.2,
reaksi 8) dan kemudian oleh reduksi yang bergantung pada NAD terhadap gliserat
(reaksi 9).
Dalam fotorespirasi, berbagai senyawa disirkulasikan melalui dua siklus.
Dalam salah satu siklus, karbon keluar dari kloroplas dalam dua molekul glikolat dan
kembali dalam satu molekul gliserat. Dalam siklus lainnya, nitrogen keluar dari
kloroplas dalam satu molekul glutamat dan kembali dalam satu molekul amonia
(bersama dengan satu molekul α-ketoglutarate) (lihat Gambar 8.7).
Jadi secara keseluruhan, dua molekul fosfoglikolat (empat atom karbon),
hilang dari siklus Calvin oleh oksigenasi RuBP, diubah menjadi satu molekul 3-
fosfogliserat (tiga atom karbon) dan satu CO2. Dengan kata lain, 75% karbon yang
hilang oleh oksigenasi ribulosa-1,5-bifosfat diperoleh kembali oleh siklus karbon
fotosintesis oksidatif C2 dan dikembalikan ke siklus Calvin (Lorimer 1981).
Di sisi lain, total nitrogen organik tetap tidak berubah karena pembentukan
nitrogen anorganik (NH4 +) dalam mitokondria diseimbangkan dengan sintesis
glutamin dalam kloroplas. Demikian pula, penggunaan NADH dalam peroxisome
(oleh hydroxypyruvate reductase) diimbangi dengan pengurangan NAD + dalam
mitokondria (oleh glycine decarboxylase).
Gambar 8.8 Alur karbon dalam daun ditentukan oleh keseimbangan antara dua siklus
yang saling berlawanan. Sementara siklus Calvin mampu beroperasi secara
independen dengan adanya substrat yang memadai yang dihasilkan oleh transpor
elektron fotosintesis, siklus karbon fotosintesis oksidatif C2 memerlukan operasi
lanjutan dari siklus Calvin untuk meregenerasi bahan awalnya, ribulosa-1,5-bifosfat.
Reaksi semacam itu akan memiliki sedikit konsekuensi di masa evolusi awal
jika rasio CO2 terhadap udara O2 di udara lebih tinggi daripada saat ini. Namun,
rendahnya rasio CO2: O2 yang lazim di zaman modern kondusif untuk fotorespirasi,
tanpa fungsi selain pemulihan sebagian karbon yang ada dalam 2-fosfoglikolat.
Penjelasan lain yang mungkin adalah bahwa fotorespirasi penting, terutama
dalam kondisi intensitas cahaya tinggi dan konsentrasi CO2 antar sel yang rendah
(misalnya, ketika stomata ditutup karena tekanan air), untuk menghilangkan
kelebihan ATP dan mengurangi daya dari reaksi cahaya, sehingga mencegah
kerusakan pada aparatus fotosintesis. Zat Arabidopsismutants yang tidak dapat
tumbuh secara normal tumbuh di bawah 2% CO2, tetapi mereka mati dengan cepat
jika dipindahkan ke udara normal. Ada bukti dari pekerjaan dengan tanaman
transgenik bahwa fotorespirasi melindungi tanaman C3 dari photooxidation dan
photoinhibition (Kozaki dan Takeba 1996). Pekerjaan lebih lanjut diperlukan untuk
meningkatkan pemahaman kita tentang fungsi fotorespirasi.
2.2.1 MEKANISME KONSENTRASI CO2 I: POMPA ALGAL DAN
SANKOBAKTERI
Tumbuhan ini memiliki rubiscos normal, dan kurangnya fotorespirasi
merupakan konsekuensi dari mekanisme yang memusatkan CO2 di lingkungan
rubisco dan dengan demikian menekan reaksi oksigenasi. Dalam bagian ini dan dua
bagian berikut ini kita akan membahas tiga mekanisme untuk memekatkan CO2 di
lokasi karboksilasi:
1. Fiksasi karbon fotosintesis C4 (C4)
2. Metabolisme asam Crassulacean (CAM)
3. Pompa CO2 pada membran plasma
Dua bagian pertama dari mekanisme pemekatan CO2 ini ditemukan di
beberapa angiospermae dan melibatkan “tambahan” pada siklus Calvin. Tumbuhan
dengan metabolisme C4 sering ditemukan di lingkungan yang panas; Tanaman CAM
adalah khas lingkungan gurun.
Ketika sel-sel alga dan cyanobacterial ditanam di udara yang diperkaya
dengan 5% CO2 dan kemudian ditransfer ke media rendah CO2, mereka
menampilkan gejala khas fotorespirasi (penghambatan O2 fotosintesis pada
konsentrasi rendah CO2). Tetapi jika sel-sel ditanam di udara yang mengandung
0,03% CO2, mereka dengan cepat mengembangkan kemampuan untuk memusatkan
karbon anorganik (CO2 plus HCO3–) secara internal. Di bawah kondisi CO2 rendah
ini, sel-sel tidak lagi mengalami fotorespirasi.
Pada konsentrasi CO2 yang ditemukan di lingkungan air, rubisco beroperasi
jauh di bawah aktivitas spesifik maksimalnya. Organisme laut dan air tawar
mengatasi kelemahan ini dengan mengakumulasi karbon anorganik dengan
menggunakan CO2 dan pompa HCO3 - pada membran plasma. ATP yang berasal
dari reaksi cahaya memberikan energi yang diperlukan untuk penyerapan aktif CO2
dan HCO3–. Total karbon anorganik di dalam beberapa sel cyanobacterial dapat
mencapai konsentrasi 50 mM (Ogawa dan Kaplan 1987). Penelitian terbaru
menunjukkan bahwa gen tunggal yang mengkode faktor transkripsi dapat mengatur
ekspresi gen yang mengkode komponen mekanisme pemekatan CO2 dalam ganggang
(Xiang et al. 2001).
Protein yang berfungsi sebagai pompa CO2-HCO3 tidak ada dalam sel yang
tumbuh dalam konsentrasi tinggi CO2 tetapi diinduksi pada paparan konsentrasi
rendah CO2. Akumulasi HCO3 – dikonversi menjadi CO2 oleh enzim carbonic
anhydrase, dan CO2 memasuki siklus Calvin.
Konsekuensi metabolik dari pengayaan CO2 ini adalah penekanan oksigenasi
ribulosa bifosfat dan karenanya juga penekanan fotorespirasi. Biaya energik dari
adaptasi ini adalah tambahan ATP yang dibutuhkan untuk memusatkan CO2.
2.2.2 MEKANISME KONSENTRASI CO2 II: SIKLUS C4CARBON
Ada perbedaan anatomi daun antara tanaman yang memiliki siklus C4carbon
(disebut C4plants) dan yang berfotosintesis hanya melalui siklus fotosintesis Calvin
(tanaman C3). Di seluruh bagian daun C3 khas mengungkapkan satu jenis sel utama
yang memiliki kloroplas, mesofil. Sebaliknya, daun C4 khas memiliki dua jenis sel
yang mengandung kloroplas berbeda: selubung mesofil dan bundel (atau Kranz,
Jerman untuk sel "karangan bunga") (Gambar 8.9).
Ada variasi anatomi yang cukup besar dalam pengaturan sel-sel bundel
selubung sehubungan dengan mesofil dan jaringan pembuluh darah. Namun, dalam
semua kasus, operasi siklus C4 membutuhkan upaya kerja sama dari kedua jenis sel.
Tidak ada sel mesofil dari tanaman C4 yang lebih dari dua atau tiga sel jauhnya dari
sel bundel selubung terdekat (lihat Gambar 8.9A). Selain itu, jaringan luas
plasmodesmata (lihat Gambar 1.27) menghubungkan sel-sel sel mesofil dan bundel,
sehingga menyediakan jalur untuk aliran metabolit antara tipe sel.
Malat dan Aspartat Adalah Produk Karboksilasi dari Siklus C4
Pelabelan awal asam C4 pertama kali diamati dalam studi pelabelan 14CO2
tebu oleh HP Kortschack dan rekannya dan jagung oleh Y. Karpilov dan rekan kerja.
Ketika daun terpapar selama beberapa detik hingga 14CO2 dalam cahaya, 70 hingga
80% label ditemukan pada asam malat C4 dan aspartat — pola yang sangat berbeda
dari yang diamati pada daun yang berfotosintesis hanya melalui siklus Calvin.
GAMBAR 8.9 Potongan melintang daun, menunjukkan perbedaan anatomi antara
tanaman C3 dan C4. (A) AC4 monocot, saccharum officinarum (tebu). (135
×) (B) AC3 monocot, Poa sp. (rumput). (240 ×) (C) AC4 dicot, Flaveria
australasica (Asteraceae). (740 ×) Sel selubung bundel berukuran besar pada
daun C4 (Aand C), dan tidak ada sel mesofil yang lebih dari dua atau tiga sel
jauhnya dari sel sel bundel terdekat. Fitur anatomi ini tidak ada pada daun C3
(B). (D) Model tiga dimensi daun C4. (Aand B © David Webb; C milik
Athena McKown; D setelah Lüttge dan Higinbotham; E dari Craig dan
Goodchild 1977.)
Dalam mengejar pengamatan awal ini, MD Hatch dan CR Slack menjelaskan
apa yang sekarang dikenal sebagai siklus karbon fotosintesis C4 ( Siklus C4)
(Gambar 8.10). Mereka menetapkan bahwa asam C4 malat dan aspartat adalah zat
antara fotosintesis stabil dan terdeteksi pertama dalam daun tebu dan bahwa atom
karbon 4 malat kemudian menjadi atom karbon 1 dari 3-fosfogliserat (Hatch dan
Slack 1966). Karboksilasi primer pada daun ini dikatalisis bukan oleh rubisco, tetapi
oleh PEP (phosphoenylpyruvate) karboksilase (Chollet et al. 1996).
Cara karbon ditransfer dari atom karbon 4 malat ke atom karbon 1 dari 3-
fosfogliserat menjadi jelas ketika keterlibatan sel sel mesofil dan bundel dijelaskan.
Enzim yang berpartisipasi terjadi pada salah satu dari dua jenis sel: PEPcarboxylase
dan piruvat-ortofosfat dikinase terbatas pada sel mesofil; dekarboksilase dan enzim
dari siklus Calvin lengkap terbatas pada sel bundel selubung. Dengan pengetahuan
ini, Hatch dan Slack mampu merumuskan model dasar siklus (Gambar 8.11 dan
Tabel 8.3).
C4Cycle Konsentrat Sel Bundel SelSiklus dasar C4 terdiri dari empat tahap:
1. Fiksasi CO2 oleh karboksilasi fosfoenolpiruvat dalam sel mesofil untuk
membentuk asam C4 (malat dan / atau aspartat)
2. Pengangkutan asam C4 ke sel bundel selubung
3. Dekarboksilasi asam C4 dalam sel sel bundel dan pembentukan CO2, yang
kemudian direduksi menjadi karbohidrat melalui siklus Calvin
Gambar 8.10 Siklus karbon fotosintesis C4 dasar melibatkan empat tahap dalam dua jenis
sel yang berbeda: (1 ) Fiksasi CO2 menjadi asam empat karbon dalam sel mesofil; (2)
Transportasi asam empat karbon dari sel mesofil ke sel bundel selubung; (3)
Dekarboksilasi asam empat-karbon, dan pembentukan konsentrasi CO2 yang tinggi
dalam sel bundel selubung. CO2 yang dilepaskan ditetapkan oleh rubisco dan
dikonversi menjadi karbohidrat oleh siklus Calvin. (4) Pengangkutan asam tiga-
karbon residual kembali ke sel mesofil, di mana akseptor CO2 asli,
phosphoenolpyruvate, diregenerasi.
GAMBAR 8.11 Fotosintesis C4 jalan. Hidrolisis dua ATP mendorong siklus ke arah
panah, sehingga memompa CO2 dari atmosfer ke siklus Calvin kloroplas dari sel sel
bundel.
4. Transportasi asam C3 (piruvat atau alanin) yang dibentuk oleh langkah
dekarboksilasi kembali ke sel mesofil dan regenerasi akseptor CO2
fosfoenolpiruvat.
Ada tiga variasi jalur C4 dasar yang terjadi pada spesies yang berbeda (lihat Topik Web
8.7). Variasi berbeda terutama dalam asam C4 (malat atau aspartat) yang diangkut ke
dalam sel bundel selubung dan dalam cara dekarboksilasi. Konsentrasi CO2 dalam
Sel Bundel Selubung Memiliki Biaya Energi Efek bersih dari siklus C4 adalah
mengubah larutan encer CO2 dalam sel mesofil menjadi larutan CO2 pekat dalam sel
bundel selubung. Studi tentang mutan yang kekurangan karboksilase PEP dari
Amaranthus edulis jelas menunjukkan bahwa kurangnya mekanisme yang efektif
untuk memekatkan CO2 dalam selubung bundel secara nyata meningkatkan
fotorespirasi di pabrik C4 (Dever et al. 1996). Termodinamika memberi tahu kita
bahwa pekerjaan harus dilakukan untuk menetapkan dan mempertahankan gradien
konsentrasi CO2 dalam selubung bundel (untuk pembahasan terperinci tentang
theododynamics, lihat Bab 2 di situs web). Prinsip ini juga berlaku untuk
pengoperasian siklus C4. Dari penjumlahan
reaksi yang terlibat, kita dapat menghitung biaya energi untuk instalasi (Tabel 8.4).
Perhitungan menunjukkan bahwa proses konsentrasi CO2 mengkonsumsi dua
kesetaraan AT (2 ikatan "energi tinggi") per molekul CO2 yang diangkut. Jadi total
kebutuhan energi untuk memperbaiki CO2 oleh siklus C4 dan Calvin gabungan
(masing-masing dihitung dalam Tabel 8.4 dan 8.1) adalah lima ATPplus dua NADPH
per CO2 yang diperbaiki.
Karena permintaan energi yang lebih tinggi ini, pabrik C4 melakukan
fotosintesis dalam kondisi pernapasan nonfotor (CO2 tinggi dan O2 rendah)
membutuhkan lebih banyak kuanta cahaya per CO2 daripada daun C3. Di udara
normal, kebutuhan kuantum tanaman C3 berubah dengan faktor-faktor yang
mempengaruhi keseimbangan antara fotosintesis dan fotorespirasi, seperti suhu.
Sebaliknya, karena mekanisme yang dibangun untuk menghindari fotorespirasi,
persyaratan kuantum tanaman C4 tetap relatif konstan di bawah kondisi lingkungan
yang berbeda (lihat Gambar 9.23).
Light Mengatur Aktivitas Enzim Kunci C4
Cahaya sangat penting untuk operasi siklus C4 karena mengatur beberapa
enzim spesifik. Misalnya, kegiatan PEP karboksilase, NADP: malat dehidrogenase,
dan piruvat-ortofosfat dikinase (lihat Tabel 8.3) diatur sebagai respons terhadap
variasi dalam kepadatan fluks foton dengan dua proses berbeda: reduksi-oksidasi
gugus tiol dan fosforilasi-defosforilasi.
NADP: malate dehydrogenase diatur melalui sistem thioredoxin dari kloroplas
(lihat Gambar 8.5). Enzim berkurang (diaktifkan) saat iluminasi daun dan teroksidasi
(tidak aktif) saat gelap. PEPcarboxylase diaktifkan oleh mekanisme fosforilasi-
defosforilasi tergantung cahaya yang belum dikarakterisasi.
Anggota regulator ketiga jalur C4, piruvat-ortofosfat dikinase, dengan cepat
dinonaktifkan oleh fosforilasi enzim yang bergantung pada ADP yang tidak biasa
ketika densitas fluks foton turun (Burnell dan Hatch 1985). Aktivasi dilakukan
dengan pembelahan fosforolitik kelompok fosfat ini. Kedua reaksi, fosforilasi dan
defosforilasi, tampaknya dikatalisis oleh protein pengatur tunggal.
Dalam Iklim Panas dan Kering, Siklus C4C Mengurangi Fotorespirasi
dan Kehilangan Air
Dua fitur C4cycle dalam C4plants mengatasi efek buruk dari suhu yang lebih
tinggi pada fotosintesis yang telah dicatat sebelumnya. Pertama, afinitas
PEPcarboxylase untuk substratnya, HCO3–, cukup tinggi sehingga enzim tersebut
jenuh oleh HCO3– dalam equlibrium dengan tingkat udara CO2. Lebih lanjut, karena
substratnya adalah HCO3–, oksigen bukanlah pesaing dalam reaksi. Aktivitas
PEPcarboxylase yang tinggi ini memungkinkan tanaman C4 untuk mengurangi
aperture stomata dan dengan demikian menghemat air sambil memperbaiki CO2 pada
tingkat yang sama atau lebih besar dari tanaman C3. Fitur menguntungkan kedua
adalah penekanan fotorespirasi yang dihasilkan dari konsentrasi CO2 dalam sel
bundel selubung (Marocco et al. 1998).
Fitur-fitur ini memungkinkan C4plants untuk berfotosintesis lebih efisien
pada suhu tinggi daripada C3plants, dan mereka mungkin merupakan alasan untuk
kelimpahan relatif tanaman C4 di iklim yang lebih kering dan lebih panas.
Tergantung pada lingkungan alaminya, beberapa tanaman menunjukkan sifat-sifat
peralihan antara spesies C3 dan C4 yang ketat.
MEKANISME KONSENTRASI CO2 III: METABOLISME ASAM
CRASSULACEAN
Mekanisme ketiga untuk memekatkan CO 2 di lokasi rubisco ditemukan
dalam metabolisme asam crassulacean (CAM). Meskipun namanya, CAM tidak
terbatas pada keluarga Crassulaceae (Crassula, Kalanchoe, Sedum); itu ditemukan di
banyak keluarga angiosperma. Kaktus dan euforia adalah tanaman CAM, serta nanas,
vanila, dan agave.
Mekanisme CAM memungkinkan pabrik meningkatkan efisiensi penggunaan
air. Biasanya, pabrik CAM kehilangan 50 hingga 100 g air untuk setiap gram CO2
yang diperoleh, dibandingkan dengan nilai masing-masing 250 hingga 300 g dan 400
hingga 500 g untuk tanaman C4 dan C3, masing-masing (lihat Bab 4). Dengan
demikian, tanaman CAM memiliki keunggulan kompetitif di lingkungan kering.
Mekanisme CAM serupa dalam banyak hal dengan siklus C4. Pada tanaman
C4, pembentukan asam C4 di mesofil dipisahkan secara spasial dari dekarboksilasi
asam C4 dan dari refixasi CO2 yang dihasilkan oleh siklus Calvin dalam selubung
bundel. Pada tanaman CAM, pembentukan asam C4 terpisah secara temporal dan
spasial. Pada malam hari, CO2 ditangkap oleh PEPcarboxylase di sitosol, dan malat
yang terbentuk dari produk oksaloasetat disimpan dalam vakuola (Gambar 8.12).
Pada siang hari, malat yang disimpan diangkut ke kloroplas dan didekarboksilasi oleh
enzim NADP-malat, CO2 yang dilepaskan ditetapkan oleh siklus Calvin, dan
NADPH digunakan untuk mengubah produk triosa fosfat dekarboksilasi menjadi pati.
Stomata Tanaman CAM Dibuka pada Malam Hari dan Tutup pada Siang Hari
Tanaman CAM seperti kaktus mencapai efisiensi penggunaan air yang tinggi
dengan membuka stomata mereka selama malam yang dingin dan sepi dan
menutupnya selama hari-hari yang panas dan kering. Menutup stomata di siang hari
meminimalkan kehilangan air, tetapi karena H2O dan CO2 berbagi jalur difusi yang
sama, maka CO2 harus diambil pada malam hari.
CO2 dimasukkan melalui karboksilasi fosfoenolpiruvat menjadi oksaloasetat,
yang kemudian direduksi menjadi malat. Malat terakumulasi dan disimpan dalam
vakuola besar yang merupakan fitur anatomi khas, tetapi tidak wajib, dari sel-sel daun
tanaman CAM (lihat Gambar 8.12). Akumulasi sejumlah besar asam malat, setara
dengan jumlah CO2 yang berasimilasi pada malam hari, telah lama dikenal sebagai
pengasaman daun pada malam hari (Bonner dan Bonner 1948).
Dengan permulaan hari, stomata menutup, mencegah kehilangan air dan
penyerapan CO2 lebih lanjut. Sel-sel daun deacidify sebagai cadangan asam malat
vacuolar dikonsumsi. Dekarboksilasi biasanya dicapai dengan aksi enzim NADP-
malat pada malat (Drincovich et al. 2001). Karena stomata tertutup, CO2 yang
dilepaskan secara internal tidak dapat lepas dari daun dan sebaliknya difiksasi
menjadi karbohidrat oleh siklus Calvin.
Pengaturan jangka pendek dari siklus Calvin dicapai oleh beberapa mekanisme yang
mengoptimalkan konsentrasi zat antara. Mekanisme ini meminimalkan reaksi yang
beroperasi di arah yang berlawanan, yang akan membuang sumber daya (Wolosiuk et
al. 1993). Dua mekanisme umum dapat mengubah sifat kinetik enzim:
Aktivasi Enzim Bergantung Cahaya Mengatur Siklus Calvin Lima enzim yang diatur
cahaya beroperasi dalam siklus Calvin:
1. Rubisco
3. Fruktosa-1,6-bisphosphatase
4. Sedoheptulose-1,7- bisphosphatase
5. Ribulose-5-phosphate kinase
Empat enzim terakhir mengandung satu atau lebih kelompok disulfida (—S — S—).
Cahaya mengontrol aktivitas empat enzim ini melalui sistem ferredoxin-thioredoxin,
mekanisme reduksi-oksidasi berbasis tiol kovalen yang diidentifikasi oleh Bob
Buchanan dan rekannya (Buchanan 1980; Wolosiuk et al. 1993; Besse dan Buchanan
1997; Schürmann dan Jacquot 2000) . Dalam gelap residu ini ada dalam keadaan
teroksidasi (—S — S—), yang membuat enzim tidak aktif atau subaktif. Dalam
terang kelompok —S — S— direduksi menjadi keadaan sulfhidril (—SH HS—).
Perubahan redoks ini mengarah pada aktivasi enzim (Gambar 8.5). Resolusi struktur
kristal dari masing-masing anggota sistem ferredoxin-thioredoxin dan dari enzim
target fruktosa-1,6bisphosphatase dan NADP: malat dehydrogenase (Dai et al. 2000 )
telah memberikan informasi berharga tentang mekanisme yang terlibat.
Sinyal sulfhydryl ini (juga disebut dithiol) dari protein regulator thioredoxin
ditransmisikan ke enzim target spesifik, menghasilkan aktivasi mereka (lihat Topik
Web 8.4). Dalam beberapa kasus (seperti fruktosa-1,6-bifosfatase), aktivasi terkait
thioredoksin ditingkatkan oleh efektor (mis., Fruktosa-1,6-bifosfat substrat).
Inaktivasi enzim target yang diamati pada penggelapan tampaknya terjadi dengan
pembalikan jalur reduksi (aktivasi). Yaitu, oksigen mengubah tioredoksin dan enzim
target dari keadaan tereduksi (—SH HS—) menjadi keadaan teroksidasi (—S — S—)
dan, dengan demikian, mengarah pada inaktivasi enzim (lihat Gambar 8.5; lihat juga
Topik Web 8.4). Empat enzim terakhir yang tercantum di sini diatur langsung oleh
thioredoxin; yang pertama, rubisco, diatur secara tidak langsung oleh enzim aksesori
thioredoxin, rubisco activase (lihat bagian selanjutnya).
Siklus Calvin Cahaya menyebabkan perubahan ion yang dapat dibalik dalam stroma
yang memengaruhi aktivitas rubisco dan enzim kloroplas lainnya. Setelah iluminasi,
proton dipompa dari stroma ke lumen thylakoids. Eflux proton digabungkan ke
serapan Mg2 + ke dalam stroma. Fluks ion ini menurunkan konsentrasi stroma H +
(pH 7 → 8) dan meningkatkan Mg2 +. Perubahan ini dalam komposisi ionic tion Laju
ekspor karbon dari kloroplas berperan dalam pengaturan siklus Calvin. Karbon
diekspor sebagai triose fosfat dengan imbalan ortofosfat melalui translokator fosfat
dalam membran bagian dalam amplop kloroplas (Flugge dan Heldt 1991). Untuk
memastikan operasi lanjutan dari siklus Calvin, setidaknya lima perenam triose fosfat
harus didaur ulang (lihat Tabel 8.1 dan Gambar 8.3). Dengan demikian, paling
banyak seperenam dapat diekspor untuk sintesis sukrosa dalam sitosol atau dialihkan
ke sintesis pati dalam kloroplas. Pengaturan aspek metabolisme karbon fotosintetik
ini akan dibahas lebih lanjut ketika sintesis sukrosa dan pati dipertimbangkan secara
rinci nanti dalam bab ini.