Real time PCR untuk Diagnosis

Sars CoV 2
Rizalinda Sjahril
Materi penjelasan pembahasan Kasus-
kasus dalam Webinar IDI tanggal 17 Mei
2020
 Cara diagnosis
1. Real time PCR atau cara amplifikasi lainnya
(misalnya LAMP)
2. Viral antigen (Lateral flow atau immunoassay)
3. Test respons antibodi terhadap SARS-CoV-2
4. Whole genome sequencing
5. Cell culture
 Keuntungan qPCR
• Untuk banyak tes qPCR:
• Deteksi patogen
• Lakukan typing
• Identifikasi
• Test resistensi secara genetik
• Deteksi toksin
• Mencari mikroorganisme baru
 Keuntungan qPCR
• Biaya lebih murah
• Target gen diketahui
• Pemeriksaan banyak sekaligus
• Pengaturan (setting) satu kali
• Fleksibel
Fleksibel : dapat disesuaikan dengan kemajuan info;
masih bisa untuk patogen lain dari Coronavirus
Bisa untuk strain lain dalam strain SARS CoV2,
bermanfaat dlama kondisi KLB
 Negatif Palsu
• Stadium infeksi masih sangat awal atau sudah
mulai berakhir
• Analisis Pre-lab: Kualitas spesimen (cara ambil
tepat; cara simpan tepat; cara transport tepat)
• Faktor inhibisi
– lysis buffer dalam media transport
– kalsium alginat dalam swab
– Swab batang kayu
– Media transport virus: Heparin, Hemoglobin, ethanol,
EDTA
True negative: Pasien terinfeksi oleh virus respiratorik lainnya atau bakteri