Virus Pernapasan dan Covid-19

A. Sekilas terkait virus pernapasan

Penyakit menular virus tetap menjadi tantangan utama bagi kesehatan
manusia. Menyusul munculnya pneumonia coronavirus baru, lebih dari
10.000 spesies virus liar telah disebutkan oleh media massa, tetapi hanya
beberapa yang diakui dengan baik. Dalam beberapa dekade terakhir, manusia
terus menerus menghadapi tantangan infeksi bakteri dan virus. Patogen yang
paling umum dari penyakit menular baru adalah virus, yang terbaru adalah
COVID 19. Oleh karena itu, kita harus memperhatikan dengan baik tingkat
keparahan infeksi virus pernapasan. Ada banyak virus umum yang dapat
menyebabkan infeksi pernapasan, termasuk virus terkait influenza,
metapneumovirus manusia, virus campak, rhinovirus, enterovirus,
coronavirus, virus sinkronisasi saluran pernapasan, adenovirus,
cytomegalovirus, virus herpes simpleks, dll. Secara khusus, ada lebih dari 100
spesies virus corona.
Kita biasanya mengabaikan "coronavirus" karena hubungannya yang
lemah dengan manusia. Namun, kami menyadarinya setelah penyebaran
sindrom pernapasan akut parah (SARS) dan COVID 19. Kelelawar
tampaknya menjadi salah satu tuan rumah virus corona yang paling cakap.
Hingga saat ini, ada tujuh jenis virus corona yang diketahui menular,
termasuk SARS-CoV-2. Human coronavirus 229E, human coronavirus nl63,
dan human coronavirus OC43 adalah virus umum yang menyebabkan pilek
manusia, tanpa patogenitas yang lebih serius. Karena mereka biasanya
membatasi diri tanpa perawatan khusus, kami tidak terlalu memperhatikan
mereka. Sekarang kita telah menyadari bahwa SARS dan COVID-19
memiliki pengaruh serius pada masyarakat manusia. Ada kebutuhan
mendesak untuk lebih memperhatikan infeksi virus terkait saluran pernapasan
Dari "A" flu burung hingga "Z" Zika, virus baru telah tumbuh dalam
beberapa tahun terakhir dan menunjukkan ketidakpastian wabah: terjadinya
virus baru tidak akan berakhir dengan alfabet, dan umat manusia harus
 menghadapi tantangan baru di masa depan. Skrining berkelanjutan dan
penelitian praklinis selalu diperlukan untuk pengendalian penyakit menular.
Penting untuk meluncurkan rencana genom virus global dan mendistribusikan
strategi "serangan aktif" dan "serangan habis-habisan" pada penyakit menular
baru yang muncul.
Ketika terinfeksi oleh virus, pasien dapat hadir dengan berbagai gejala
klinis, termasuk pilek, faringitis, trakeitis, bronkiolitis, pneumonia, dll.
Meskipun spektrum penyakit yang disebabkan oleh berbagai jenis virus
beragam, virus yang berbeda dapat mengakibatkan penyakit yang sama.
Misalnya, virus influenza dapat menyebabkan pneumonia dewasa; adenovirus
juga dapat menyebabkan pneumonia berat. Rhinovirus terutama
menyebabkan pilek serta pneumonia. Infeksi cytomegalovirus pada populasi
imunocompromised adalah tantangan besar untuk intervensi modern
(kemoterapi dosis tinggi, terapi imunosupresif, transplantasi organ)
Virus adalah patogen umum dari pneumonia yang diperoleh
masyarakat (CAP), dan pentingnya mereka telah semakin ditekankan. Virus
juga berperan dalam HAP, AECOPD, bronkiektasis, dan penyakit lainnya.

B. Etiologi COVID-19
Virus corona baru termasuk dalam genus beta virus corona. Ini
memiliki amplop, bulat atau oval, tetapi biasanya polimorfik. Diameternya
adalah 60 140 nm. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) menamainya SARS-
CoV-2. Virus corona SARS muncul pada tahun 2003, yang berasal dari
Guangdong, Middle East respiratory syndrome (MERS) virus corona muncul
pada tahun 2012, yang berasal dari Timur Tengah, dan COVID-19 muncul
pada tahun 2019, awalnya ditemukan di Wuhan. Ketiga virus corona ini
menular dan virulent. Empat virus corona lainnya juga diketahui
menyebabkan penyakit manusia. Namun, mereka terutama menyebabkan
pilek menyumbang 10%-15% dari virus dingin dan infeksinya tidak parah.
fig. 1.1 menunjukkan bahwa empat genera coronavirus, alpha, beta,
gamma, dan delta, memiliki struktur genetik yang berbeda. Bahkan dalam
 genus yang sama, misalnya, beta, coronavirus dari spesies yang berbeda
sangat berbeda. Virus corona baru ini cukup berbeda dengan virus corona
yang ditunjukkan pada Gbr. 1.1.
Gbr. 1.2 menyajikan genera yang berbeda dari coronavirus: genus alfa
ditunjukkan dalam warna ungu, genus beta berwarna merah muda, genus
gamma berwarna hijau, dan genus delta berwarna biru. Gamma adalah genus
terkecil. Seperti yang ditunjukkan pada Gbr. 1.2, unta dikaitkan dengan virus
sindrom pernapasan Timur Tengah. Di atas unta, kucing luwak ditampilkan,
yang terkait dengan virus corona SARS. Kelelawar adalah sumber asli dari
virus corona yang menyebabkan sindrom pernapasan SARS dan Timur
Tengah. Virus corona baru juga telah ditunjukkan berasal dari kelelawar;
secara khusus, bukti yang ada menunjukkan bahwa itu berasal dari kelelawar
krisan. Inang perantaranya belum ditentukan, tetapi penelitian telah
menunjukkan bahwa itu mungkin terkait dengan hewan liar seperti pangolin
atau ular.
C. Penularan COVID-19
Pertama, sumber infeksi saat ini terutama dari pasien COVID-19;
mereka yang memiliki infeksi ringan dan asimptomatik juga dapat menjadi
sumber infeksi. Kapasitas infeksi SARA-CoV-2 masih belum jelas.
Berdasarkan patogenesis COVID-19, kapasitas infeksi SARS-CoV-2 lebih
kuat, terutama dalam kasus yang parah, dan risiko infeksi tertinggi selama
proses intervensi intubasi trakea.
Kedua, ada dua rute utama rute penularan COVID-19: penularan tetesan
pernapasan dan transmis kontak dekat. Munculnya tetesan pernapasan
terutama disebabkan oleh batuk, bersin, atau berbicara. Jarak perambatan
untuk tetesan berdiameter lebih dari 5 μm terbatas dan umumnya kurang dari
1m. Dalam kasus transmisi kontak dekat, tetesan dapat mencemari permukaan
objek. Kotoran pasien, seperti kotoran dan urin, dapat mencemari lingkungan
serta permukaan benda. Jika tangan pasien menyentuh lingkungan atau
permukaan objek objek, tangan juga akan terkontaminasi. Tangan yang
terkontaminasi kemudian dapat melakukan kontak dengan rongga hidung,
rongga mulut, atau wajah, yang dapat menyebabkan penularan melalui kontak
dekat. Penularan pengelompokan keluarga adalah salah satu karakteristik
penularan spesifik COVID-19, di mana ada lebih dari dua anggota keluarga
—bahkan hingga lima anggota—terinfeksi, yang menegaskan pentingnya
penularan droplet, tetapi tidak mengecualikan kemungkinan faktor kontak
dekat.
Dalam ruang yang relatif terbatas, virus dapat ditularkan oleh aerosol,
dengan tingkat paparan aerosol yang tinggi untuk waktu yang lama. Namun,
ada sangat sedikit kasus transmisi aerosol sampai sekarang. Bukti baru masih
dibutuhkan. Meskipun asam nukleat kadang-kadang telah terdeteksi di udara
baru-baru ini, signifikansi mereka tetap harus ditentukan. Secara umum,
kemungkinan perambatan aerosol relatif kecil, dan perambatan aerosol
bukanlah rute utama penularan. Ini sekunder, tetapi perlu untuk mengamati
bentuk penularan ini dalam penelitian. Pada beberapa pasien, virus dapat
dideteksi dalam kotoran. Dengan demikian belum jelas apakah itu dapat
menyebar melalui saluran pencernaan. Setidaknya pada beberapa pasien kami
telah menemukan bahwa virus dapat ada lebih lama dalam kotoran daripada
di saluran pernapasan, yang mungkin membawa beberapa tantangan untuk
pencegahan dan pengendalian penyakit. Penelitian lebih lanjut diperlukan
untuk menentukan berapa lama periode transmisi.
Poin ketiga yang perlu dipertimbangkan mengenai penularan adalah
orang-orang yang rentan. Orang-orang umumnya rentan, terutama di antara
populasi imunocompromised. Dapat dipastikan bahwa risiko terkait dengan
mode paparan, kuantitas, dan durasi. Orang tua dan orang-orang dengan
penyakit yang mendasarinya menunjukkan gejala yang lebih serius,
sementara anak-anak dan bayi mengalami efek yang lebih ringan. Tidak ada
yang bawaan kebal terhadap SARS-CoV-2, bahkan mereka yang telah
mengalami infeksi. Masih belum jelas seberapa tinggi tingkat titer antibodi
pada tahap akhir dan apakah seseorang memiliki kemampuan untuk menjaga
terhadap infeksi berulang. Secara umum, risiko infeksi berulang sangat
 rendah, setidaknya dalam 6 bulan hingga 1 tahun, dengan keberlanjutan
menetralisir antibodi.
Hubungan antara tiga langkah penyakit menular —sumber infeksi, rute
transmisi, dan orang-orang yang rentan—sangat penting. Virus pernapasan
dan covid-19 penyakit menular dapat menyebar hanya ketika ketiga langkah
itu ada. Penyakit menular akan dikendalikan jika salah satu dari tiga langkah
ini dihentikan. Cara memotong saluran transmisi untuk mencegah penyebaran
infeksi adalah tantangan paling penting saat ini. Setiap penyakit menular
memiliki karakteristik tersendiri. Tidak peduli berapa banyak dokter, perawat,
dan tempat tidur yang tersedia, ini tidak berguna jika sumber infeksi atau rute
penularan di luar kendali. Dalam kasus bahwa tidak ada sumber daya ICU
yang memadai yang tersedia untuk perawatan pasien yang sakit kritis, orang
harus menghadapi dilema merawat atau menyerah pada pasien tersebut.
COVID-19 tidak hanya penyakit pernapasan, tetapi juga penyakit menular.
Kami berharap dapat memberikan beberapa edukasi publik menggunakan
pengetahuan kami tentang penyakit menular, sehingga kami dapat mengambil
langkah efektif untuk mencegah penyebaran penyakit ini. Itulah satu-satunya
cara untuk mengendalikan pandemi. Pasti akan sangat keras jika kita hanya
fokus pada pasien yang dirawat di rumah sakit.

Patogenesis COVID-19

A. Apakah ada kekhawatiran khusus tentang COVID-19 dan patogenesisnya?

Dikombinasikan dengan manifestasi klinis dan fitur pencitraan dada,
seperti batuk kering dan fungsi koagulasi abnormal, pencitraan dada terutama
menunjukkan beberapa tambalan kecil dan perubahan interstiial pada tahap
awal, dengan pemborosan yang jelas dan lesi yang kurang eksudatif, yang
berkembang menjadi beberapa opasitas kaca tanah dan menyusup bayangan
di paru-paru. Secara kritis sampai pasien menerima intubasi trakea, cairan
infiltrasi jarang terjadi pada trakea, yang berbeda dari influenza dan flu
burung. Kami berasumsi bahwa patogenesis cedera paru-paru COVID-19
terutama bisa menjadi gangguan interstitium paru-paru dan endotelium
vaskular. Meskipun ARDS dapat ditemukan pada beberapa pasien, lesi
eksudatif relatif kurang.
Hingga saat ini, lebih dari 10 studi anatomi tubuh pasien COVID-19
telah dilakukan di Rumah Sakit Wuhan Jin Yin Tan. Profesor Liang Liu dari
Tongji Medical College of Huazhong University of Science and Technology
dan akademisi Xiuwu Bian dari Rumah Sakit Afiliasi Pertama Universitas
Kedokteran Angkatan Darat telah menemukan bahwa partikel virus dan
badan inklusi dapat dilihat di paru-paru, dan fitur umum, seperti ARDS
sekunder, cedera alveolar difus, dan pembentukan membran hyaline, juga
hadir. Menariknya, berbeda dari pneumonia virus dan infeksi bakteri lainnya,
perubahan fibrosis, dengan runtuh dan oklusi saluran udara kecil perifer serta
penyusupan makrofag dan monosit, umum terjadi pada pasien COVID-19.
Pada infeksi virus, perubahan patologis fibrosis mirip dengan
pneumonia organik sekunder (SOP). Kami telah menyebutnya "kuasi-SOP,"
karena diperlukan penyaringan dan konfirmasi lebih lanjut. Dalam praktik
klinis, manifestasi organik serupa umumnya terlihat, baik di SARS atau pada
infeksi virus influenza. Kapan kuasi-SOP akan terjadi? Menurut pengalaman
kami yang ada, sering dikembangkan dalam pencitraan dada pada 7-10 hari
setelah onset. Kami dapat mendengar "suara ledakan" oleh auscultation, yang
sangat konsisten dengan lesi interstiial. Oleh karena itu, glucocorticoid
mungkin membantu. Sementara itu, kita juga harus memperhatikan beban
virus serta keadaan kekebalan humoral. Langkah-langkah harus diambil
setelah pertimbangan komprehensif. Tidak ada bukti yang ada dari studi RCT
yang dirancang dengan baik tentang cara memilih dosis glucocorticoid.
Ketika epidemi meluas terjadi, hal-hal "dipesan" akan digantikan oleh
"gangguan" atau faktor-faktor mengganggu lainnya, yang akan
mempengaruhi interpretasi penelitian yang kuat. Berdasarkan pengalaman
sebelumnya, pemberian intravena 40-120mg methylprednisolone
direkomendasikan, baik sebagai dosis tunggal atau beberapa dosis, dan dosis
dapat disesuaikan secara individual. Mengenai periode penggunaan, 3
 haridengan strategi dosis tinggi, diikuti dengan penurunan bertahap
disarankan oleh beberapa pengalaman. Saat ini, menghadapi COVID-19,
terutama dengan SOP, strategi pengobatan secara keseluruhan tetap harus
ditentukan dengan bantuan viral load dan status kekebalan tubuh.
Selain perubahan interstiial, fitur lain juga dapat dilihat di dalam
pembuluh paru. Penjabaran dari endotelium vaskular membutuhkan
pengamatan lebih lanjut oleh ahli patologi. Namun, trombosis adalah umum,
terutama thrombus hyaline di kapiler dan arteriole paru. Ini mungkin terkait
dengan peningkatan D-dimer. Kami terkesan dengan perubahan thrombus
dalam pembuluh darah.

B. Infeksi SARS-CoV-2 dan cedera jantung

Selain efek langsung pada paru-paru, jantung adalah organ target kritis
lain yang membutuhkan perhatian lebih. Virus mempengaruhi miokardium
serta sistem konduksi. Inilah sebabnya mengapa beberapa pasien mengalami
aritmia dan perubahan konduktif lainnya. EKG berkelanjutan, enzim miokard,
dan BNP perlu dipantau di antara pasien-pasien tersebut.
Studi awal menunjukkan bahwa BNP dan troponin jantung
hipersensitif dikaitkan dengan kemajuan penyakit kritis. Masih banyak daerah
yang tidak diketahui mengenai SARS-CoV 2, tetapi bukti telah menunjukkan
bahwa kematian dini terjadi pada beberapa pasien dengan miokarditis yang
fulminan rumit 8 COVID-19dengan kardiomiopati sepsis, sementara yang
lain hanya menderita kardiomiopati septik. Fitur utama miokarditis fulminan
adalah edema kardiomiosit, yang membutuhkan IABP dan ECMO untuk
menjaga stabilitas. Kardiomiopati Sepsis adalah perubahan miokard sepsis
yang disebabkan oleh infeksi bakteri, dengan karakteristik pembesaran
ventrikel kiri dan penurunan EF. Makalah terbaru dalam Intensive Care Med
mengungkapkan bahwa proporsi gagal jantung yang disebabkan oleh infeksi
SARS-CoV-2 setinggi 40%. Periode dari timbulnya gejala hingga kematian
pada sebagian besar pasien adalah 12-24 hari, yang tidak konsisten dengan
perkembangan miokarditis yang fulminan. Durasi panjang penyakit dan
 pengobatan yang tertunda akan meningkatkan kemungkinan kardiomiopati
sepsis sekunder setelah infeksi campuran, yang berbeda dari influenza. Pada
beberapa pasien COVID-19, hipertrofi miokard dan perubahan iskemik
kronis ditemukan, yang mungkin merupakan manifestasi dari penyakit
jantung koroner. Semakin lama durasi penyakit, semakin lama durasi
hipoksemia dipertahankan, dan semakin jelas kerusakan iskemia miokard
kronis. Kami telah mengamati bahwa sebagian besar pasien COVID-19
meninggal karena peningkatan troponin hipersensitif dan BNP. Dalam
beberapa kasus, peningkatan kadar troponin hipersensitif dapat dilihat di
semua tahap penyakit, mulai dari ratusan hingga ribuan ng/ml. Namun,
hubungan dengan prognosis
masih dalam penyelidikan. Terutama, pasien COVID-19 juga dapat memiliki
kejadian kardiovaskular akut, seperti sindrom koroner akut (ACS).

C. Penyakit lain

D. Apa peran pelepasan sitokin yang dipicu oleh patogen pada kasus COVID-19
yang parah dan kritis?
E. Menyerang organ dan infeksi yang diinduksi virus
History

Virus corona diketahui menyebabkan infeksi manusia sejak 1960-an; namun,

potensi virus ini dalam menyebabkan kematian hanya muncul dalam dua dekade
terakhir. COVID-19 adalah wabah besar ketiga penyakit pernapasan dalam dua
puluh tahun terkait virus corona, yang telah secara signifikan mengganggu
keseimbangan sosial ekonomi seluruh dunia. SARS-CoV-2 milik keluarga
Coronaviridae, yang termasuk dalam ordo Nidovirales [67]. Keluarga ini berisi
dua subfamili, Coronavirinae dan Torovirinae. Coronavirinae diklasifikasikan ke
dalam empat genera: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus,
dan Deltacoronavirus. Sebelumnya, genus Betacoronavirus dibagi menjadi garis
keturunan A, B, C, dan D. Sekarang, garis keturunan ini telah diklasifikasikan
sebagai subgenera Betacoronavirus — sebagai Embecovirus (garis keturunan A),
Sarbecovirus (garis keturunan B), Merbe covirus (garis keturunan C), dan
Nobecovirus (garis keturunan D (Gambar 3).

SARS-CoV-2 termasuk dalam genus Betacoronavirus dan subgenus Sarbecovirus.

Virus corona diselimuti virus berbentuk bulat, dan kadang-kadang berurutan,
berdiameter sekitar 80 hingga 120 nm. Virus ini ditandai dengan adanya proyeksi
lonjakan berbentuk klub yang berasal dari permukaan virus [68]. Lonjakan ini
bertanggung jawab atas penampilan khas mereka yang mirip dengan corona
matahari, memberinya nama coronavirus. Coronavirus peka sinar panas dan
ultraviolet tetapi dapat disimpan selama bertahun-tahun pada suhu −80 ◦C.
Namun, virus-virus ini dapat dinonaktifkan pada 56◦C selama 30 menit, yang
sering dilakukan oleh para peneliti. Selain itu, disinfektan yang mengandung
klorin, asam peracetic, dan etanol 75% juga dapat menonaktifkan virus corona
[10].
Menjadi virus zoonosis, coronavirus memiliki kemampuan untuk menularkan dari
hewan ke manusia dan juga di antara manusia melalui aerosol udara [69]. Sejauh
ini, beberapa hewan dan burung telah diidentifikasi sebagai reservoir untuk virus
ini, termasuk unta, babi, kalkun, tikus, anjing, kelelawar, kucing, dan lainnya.
Namun, di antara hewan-hewan ini, kelelawar adalah pembawa yang paling
dikenal luas untuk infeksi manusia [70,71].

SARS-CoV dan MERS-CoV termasuk dalam genus Betacoronavirus dalam

keluarga Coronaviridae dan memiliki genom RNA besar dan masuk akal positif
masing-masing 27,9 dan 30,1 kb. Sebagian besar, kelelawar adalah reservoir dari
berbagai macam virus corona, termasuk virus mirip SARS-CoV- dan MERS CoV
[75]. Penularan SARS-CoV dan MERS-CoV dari manusia ke manusia terjadi
terutama melalui transmisi nosokomial; 43,5–100% kasus MERS dalam wabah
individu terkait dengan rumah sakit, dan pengamatan yang sangat serupa
dilakukan untuk beberapa klaster SARS. Kursus klinis SARS dan MERS sangat
mirip, kecuali untuk beberapa perbedaan. Meskipun patogenesis MERS kurang
dipahami, mekanisme serupa dapat mendasari patogenesis MERS dan SARS

Kasus pneumonia atipikal pertama yang diketahui terkait dengan SARS-CoV

dilaporkan terjadi di Foshan, China, pada bulan November 2002 [77]. Sejak itu,
wabah penyakit mulai menyebar dengan cepat di seluruh dunia, yang mendorong
Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) untuk menyatakan penyakit "ancaman
kesehatan di seluruh dunia". Setelah munculnya penyakit di Cina daratan, dalam
beberapa bulan, > 300 kasus dilaporkan; di antara kasus-kasus ini, mayoritas dari
mereka adalah petugas kesehatan. Selanjutnya, perjalanan individu yang terinfeksi
semakin menyebarkan penyakit ini ke negara lain termasuk Hong Kong, Vietnam,
Kanada, dan banyak lagi [78]. Untuk menangani wabah ini, pada Maret 2003,
WHO berkoordinasi dengan jaringan besar pusat penelitian di seluruh dunia untuk
mengidentifikasi agen penyebab SARS. Dalam satu upaya tersebut, Drosten dkk
menyelidiki pasien yang terkena penyakit ini pada tahun yang sama dan mereka
mengungkapkan bahwa bentuk baru virus corona mungkin telah menyebabkan
SARS [79]. Namun, karakterisasi genetik, yang mengkonfirmasi kebaruan virus,
menunjukkan bahwa virus hanya jauh terkait dengan coronavirus yang diketahui
(hanya identik dalam 50 hingga 60 persen dari urutan nukleotida). Pandemi SARS
tidak hanya menyebabkan masalah kesehatan masyarakat tetapi juga memulai
krisis sosial-ekonomi, terutama di Cina [80]. Pada awalnya, diyakini bahwa
pandemi dapat menyebar secara global dan menyebabkan kemerosotan ekonomi
yang serius. Namun, tindakan cepat yang diambil oleh pihak berwenang yang
menangani epidemi seperti mengisolasi tersangka, pelacakan kontak, dan tindakan
karantina berfungsi dengan baik untuk secara efektif mengandung penyakit [81].
Selanjutnya, pandemi SARS berakhir pada Juli 2003, tetapi sebelum itu,
menginfeksi 8096 individu dan menyebabkan 774 kematian di 27 negara [82].
Beberapa kasus LAGI SARS kembali dilaporkan pada akhir 2003 (Desember–
Januari 2004) karena penularan zoonosis, kemungkinan melibatkan kucing luwak
(Paguma larvata). Namun, sejak itu, tidak ada lagi kasus manusia yang terkait
dengan SARS telah terdeteksi [83]. Meskipun SARS memiliki kematian dan
morbiditas yang rendah, konsekuensi kesehatan dari pandemi SARS tidak terbatas
pada orang yang terinfeksi. Memang, itu memicu ketakutan besar di antara
populasi umum karena kebaruan penyebab virus, kemampuan penularan
nosokomial yang cepat, dan kerentanan rumah sakit dan tenaga kesehatan

Satu dekade setelah terjadinya SARS-CoV, kasus pneumonia akut dan demam
ginjal dilaporkan pada Juni 2012 di Arab Saudi. Kematian itu dikaitkan dengan
bentuk novel lain dari coronavirus, MERS-CoV (sindrom pernapasan Timur
Tengah coronavirus), yang diisolasi dari daput pasien [85]. Namun, sebelum
penemuan kasus MERS pertama di Arab Saudi, wabah penyakit pernapasan akut
muncul di rumah sakit umum di Zarqa, Yordania, pada April 2012 [86]. Sebelas
orang ditemukan terpengaruh, yang termasuk delapan petugas kesehatan, dan satu
di antaranya meninggal kemudian. Pada saat wabah, penyebab penyakit tidak
diketahui sejak penyelidikan epidemiologi termasuk pengujian laboratorium yang
dilakukan setelah munculnya penyakit tetap tidak meyakinkan. Namun, setelah
penemuan infeksi novel coronavirus di Semenanjung Arab, tersimpan sampel
pernapasan dan serum pasien dari wabah ini diuji ulang dan diagnosis MERS-
CoV dikonfirmasi pada dua pasien yang meninggal. Setelah itu, beberapa kasus
lagi dilaporkan di Inggris dan penyakit ini terus menyebar ke bagian lain dunia
melalui perjalanan individu yang terinfeksi. Sebagian besar kasus MERS impor
dilaporkan karena transmisi nosocomial. Pada Mei 2015, pasien MERS pertama
dikonfirmasi di Korea Selatan yang kembali dari Timur Tengah. Pada 26 Juli,
dalam waktu sekitar dua bulan, 186 kasus dikonfirmasi, termasuk 36 kematian
dan 138 pemulihan [87]. Wabah MERS di Korea ditandai dengan penularan intra-
rumah sakit serta penularan rumah sakit ke rumah sakit karena pergerakan kasus
dari satu rumah sakit ke rumah sakit lainnya. Itu adalah wabah MERS terbesar di
luar Timur Tengah, yang melibatkan 16 infeksi yang diperoleh rumah sakit.
Menurut data WHO, total 2494 kasus laboratorium mers yang dikonfirmasi telah
dilaporkan per November 2019, termasuk 858 kematian di 27 negara (WHO
MERS). Pada penyakit ini, gejala seperti demam, batuk, dan sesak napas telah
dilaporkan. Meskipun pneumonia umumnya dilaporkan, itu tidak selalu ada.
Selain itu, gejala gastrointestinal, termasuk diare, juga dilaporkan. Terutama,
beberapa kasus infeksi MERS-CoV yang dikonfirmasi laboratorium telah
dilaporkan tidak bergematik, yang berarti beberapa individu tidak menunjukkan
gejala klinis tetapi mereka masih diuji positif untuk infeksi MERS-CoV. Sebagian
besar kasus asimptomatik ini terdeteksi setelah pelacakan kontak agresif dari
kasus laboratorium yang dikonfirmasi [88]. Dalam sebagian besar kasus, infeksi
menyebar melalui penularan dari manusia ke manusia dalam pengaturan
perawatan kesehatan. Namun, beberapa penelitian telah menyarankan peran unta
dromedary sebagai inang reservoir untuk MERS-CoV dan sebagai sumber hewan
infeksi MERS pada manusia. Namun, peran pasti dromedaries dalam penularan
virus dan rute penularan yang tepat tidak diketahui [89]. Selama wabah SARS-
CoV, komunitas medis dan ilmiah tidak cukup siap untuk menangani ancaman
virus patogen yang mematikan. Namun, satu dekade kemudian, para profesional
dan peneliti kesehatan relatif lebih siap ketika pandemi MERS-CoV muncul
karena kemajuan dalam alat diagnostik molekuler seperti ketersediaan alat
pengurutan canggih dan teknologi pengurutan generasi berikutnya yang membuat
pengurutan genom berdurasi penuh lebih mudah
 Kasus awal infeksi virus corona pada manusia dilaporkan pada tahun
1960, yang diasumsikan sebagai alasan untuk flu biasa.
 Sebelum merebaknya SARS-CoV 2002, terdapat beberapa subtipe virus
corona yang dilaporkan menginfeksi manusia dan bertanggung jawab
dalam menyebabkan infeksi pernapasan ringan yakni dua spesies
alphacoronavirus (HCoV-229E dan HCoV-NL63), dan dua spesies
Betacoronavirus (HCoV-OC43 dan HCoV-HKU1)
 pada tahun 2002, dunia menyaksikan penyakit mematikan pertama yang
diinduksi coronavirus yang dinamai sebagai severe acute respiratory
syndrome (SARS-CoV) dan berakhir tahun 2003 berakhir pada Juli 2003,
tetapi sebelum itu, menginfeksi 8096 individu dan menyebabkan 774
kematian di 27 negara
 Satu dekade kemudian pada 2012, wabah infeksi virus corona lainnya
dilaporkan di Arab Saudi, yang dikenal sebagai Middle Eastern
respiratory syndrome (MERS-CoV). Menurut data WHO, total 2494 kasus
laboratorium mers yang dikonfirmasi telah dilaporkan per November
2019, termasuk 858 kematian di 27 negara (WHO MERS).
 Pada Desember 2019, dilaporkan kejadian pneumonia parah pada orang
dewasa di Wuhan, China yang tidak diketahui penyebabnya. Pada 7
Januari virus ini diidentifikasi sebagai virus corona
 Jumlah kasus mulai meningkat secara eksponensial, beberapa di antaranya
tidak memiliki paparan ke pasar hewan hidup, menunjukkan fakta bahwa
penularan dari manusia ke manusia terjadi.
  Kasus fatal pertama dilaporkan pada 11 Jan 2020 dikarenakan migrasi
besar-besaran orang china saat tahun baru imlek, sehingga banyak orang
dari wuhan berpergiaan ke luar kota.

Pada Desember 2019, orang dewasa di Wuhan, ibu kota provinsi Hubei dan
pusat transportasi utama China mulai mempresentasikan ke rumah sakit setempat
dengan pneumonia parah penyebab yang tidak diketahui. Banyak kasus awal
memiliki paparan umum ke pasar makanan laut grosir Huanan yang juga
memperdagangkan hewan hidup. Sistem pengawasan (diberlakukan setelah wabah
SARS) diaktifkan dan sampel pernapasan pasien dikirim ke laboratorium referensi
untuk penyelidikan etologis. Pada 31 Desember 2019, China memberi tahu wabah
ini kepada Organisasi Kesehatan Dunia dan pada 1 Januari pasar makanan laut
Huanan ditutup. Pada 7 Januari virus ini diidentifikasi sebagai virus corona yang
memiliki homologi >95% dengan virus corona kelelawar dan > 70% kesamaan
dengan SARS-CoV. Sampel lingkungan dari pasar makanan laut Huanan juga
diuji positif, menandakan bahwa virus itu berasal dari sana [7]. Jumlah kasus
mulai meningkat secara eksponensial, beberapa di antaranya tidak memiliki
paparan ke pasar hewan hidup, menunjukkan fakta bahwa penularan dari manusia
ke manusia terjadi [8]. Kasus fatal pertama dilaporkan pada 11 Jan 2020. Migrasi
besar-besaran orang Cina selama Tahun Baru Imlek memicu epidemi. Kasus-
kasus di provinsi lain di China, negara-negara lain (Thailand, Jepang dan Korea
Selatan berturut-turut cepat) dilaporkan pada orang-orang yang kembali dari
Wuhan. Penularan kepada petugas kesehatan yang merawat pasien dijelaskan
pada 20 Jan 2020. Pada 23 Januari, 11 juta populasi Wuhan ditempatkan di bawah
penguncian dengan pembatasan masuk dan keluar dari wilayah tersebut. Segera
penguncian ini diperluas ke kota-kota lain di provinsi Hubei. Kasus COVID-19 di
negara-negara di luar China dilaporkan pada mereka yang tidak memiliki riwayat
perjalanan ke China menunjukkan bahwa penularan lokal dari manusia ke
manusia terjadi di negara-negara ini [9]. Bandara di berbagai negara termasuk
India dimasukkan ke dalam mekanisme penyaringan untuk mendeteksi orang-
orang tanpa gejala yang kembali dari China dan menempatkan mereka dalam
isolasi dan menguji mereka untuk COVID-19. Segera terlihat bahwa infeksi dapat
ditularkan dari orang asimptomatik dan juga sebelum timbulnya gejala. Oleh
karena itu, negara-negara termasuk India yang mengevakuasi warga mereka dari
Wuhan melalui penerbangan khusus atau memiliki pelancong yang kembali dari
China, menempatkan semua orang tanpa gejala atau sebaliknya dalam isolasi
selama 14 d dan menguji mereka untuk virus.

Karena SARS-CoV, MERS-CoV, dan SARS-CoV-2 tidak beradaptasi dengan

baik untuk dipertahankan pada manusia, mereka cenderung menyebar terutama
melalui reservoir zoonosis lainnya, dengan wabah sesekali pada populasi manusia
yang rentan, mungkin melalui spesies inang perantara [120]. Terutama, tingkat
penularan manusia ke manusia dari novel coronavirus secara signifikan tinggi,
yang menyebabkan spektrum luas manifestasi klinis pada pasien yang terinfeksi
virus [121]. Misalnya, Guan dkk telah melakukan analisis detail karakteristik
klinis pasien yang terkena dampak dari 552 rumah sakit dari 30 provinsi di Cina,
tepat setelah sebulan munculnya penyakit ini. Dari 1099 pasien dengan
laboratorium kasus COVID-19 yang dikonfirmasi, ~ 48% dari pasien adalah laki-
laki. Awalnya, diagnosis penyakit itu sulit karena adanya gejala yang beragam. Di
antara pasien yang diteliti, 43,8% demam dipamerkan pada saat presentasi, tetapi
setelah dirawat di rumah sakit, angkanya meningkat menjadi 88,7%. Sekitar
15,7% pasien mengalami gejala serius setelah masuk ke rumah sakit [122].
Meskipun sejumlah besar kematian terkait dengan COVID-19, SARS-CoV-2
tampaknya memiliki tingkat fatalitas yang lebih rendah jika dibandingkan dengan
SARS-CoV atau MERS-CoV. Penyebaran penyakit yang cepat telah mendorong
pejabat kesehatan masyarakat dan badan pemerintah untuk memberlakukan
langkah-langkah yang belum pernah terjadi sebelumnya seperti pembatasan
perjalanan, memberlakukan jam malam skala besar, isolasi dan karantina individu
yang terinfeksi, dll.

Sejak merebaknya COVID-19 pada bulan Desember di Wuhan, China, infeksi

telah menyebar dengan cepat ke belahan dunia lain, dan meningkatnya jumlah
kasus jelas menunjukkan bahwa penyakit ini masih terus menyebar. Awalnya,
beberapa kasus (>50 orang) pneumonia akut yang terkait dengan COVID-19
dilaporkan di China, yang terkait dengan pasar makanan laut di provinsi Wuhan.
Sejak itu, jumlah individu yang terinfeksi telah mencapai sekitar sepuluh juta,
yang mungkin masih meremehkan karena ada kemungkinan kuat paparan yang
tidak terlacak dan individu asimptomatik. Analisis isolat berbasis urutan dari
pasien telah menyebabkan identifikasi agen penyebab sebagai bentuk baru virus
corona. Selain itu, teknologi urutan dan teknik lain telah secara signifikan
membantu dalam diagnosis infeksi virus yang benar [123]. Awalnya, individu
yang telah mengunjungi pasar makanan laut atau mengkonsumsi makanan yang
disiapkan dengan hewan yang terinfeksi seharusnya terinfeksi SARS-CoV-2.
Kemudian, analisis lebih lanjut dan penelusuran kontak pasien positif COVID-19
mengungkapkan bahwa sejumlah individu yang tidak memiliki riwayat bepergian
ke pasar makanan laut juga dites positif mengusik penyakit COVID-19. Hasil ini
telah menunjuk pada kemungkinan penularan virus dari manusia ke manusia,
yang kemudian dilaporkan di lebih dari 200 negara di seluruh dunia.

Kemungkinan penularan manusia ke manusia SARS-CoV-2 dikonfirmasi dalam

studi epidemiologi pasien dalam kelompok keluarga, di mana beberapa anggota
mengunjungi Wuhan, tetapi satu anggota keluarga tidak mengunjungi tempat itu
[124]. Dalam penelitian lain, Liu dkk melaporkan munculnya infeksi SARS-CoV-
2 pada tingkat epidemi di Shenzhen, China [125]. Studi berskala besar ini telah
mengindikasikan kemungkinan penularan komunitas dan penularan intra-keluarga
sebagai alasan utama SARS-CoV-2 tersebar di kota. Penularan SARS-CoV-2 dari
manusia ke manusia sebagian besar terjadi di hadapan kedekatan individu yang
terinfeksi karena paparan batuk, bersin, tetesan pernapasan, atau aerosol. Aerosol
ini dapat mencapai paru-paru melalui menghirup melalui saluran oral atau hidung.
Mirip dengan infeksi pernapasan lainnya seperti SARS-CoV dan MERS-CoV,
SARS-CoV-2 ditularkan melalui tetesan berbagai ukuran. Biasanya, tetesan
dengan diameter partikel lebih dari 5 hingga 10 μm dianggap sebagai tetesan
pernapasan, sedangkan tetesan dengan diameter kurang dari 5 μm disebut sebagai
inti [126]. Penularan penyakit oleh tetesan nuklei yang mengandung virus, yang
tetap setelah penguapan tetesan besar, biasanya disebut sebagai penularan melalui
udara. Tetesan udara ini tetap di atmosfer untuk waktu yang sangat lama dan
dapat ditularkan di antara individu yang berdiri pada jarak besar lebih dari satu
meter. Di sisi lain, SARS-CoV-2 sebagian besar ditularkan melalui tetesan
pernapasan dan rute kontak. Memang, dalam analisis terperinci lebih dari 75.000
pasien dengan COVID di Cina, indikasi penularan melalui udara tidak dilaporkan

Penularan tetesan SARS-CoV-2 terjadi ketika seseorang berada dalam kontak

dekat < 1 m dengan seseorang yang menderita gejala pernapasan seperti batuk
atau bersin. Individu yang terinfeksi dapat berpotensi menularkan virus melalui
tetesan mukosae (mulut dan hidung) atau konjungtiva (mata) yang terinfeksi.
Meskipun penularan melalui mukosa paling umum, penularan virus melalui
konjungtiva relatif kurang umum [128]. Selain itu, mirip dengan virus corona
lainnya, SARS-CoV-2 juga berpotensi bertanggung jawab atas wabah nosokomial
melalui kontaminasi lingkungan sebagai rute penularan. Namun, modus dan
luasnya kontaminasi lingkungan masih perlu diselidiki. Baru-baru ini, Ong dkk
telah mempelajari berbagai fomite termasuk sampel permukaan benda yang
digunakan pada individu yang terinfeksi, sampel APD, dan swab, dll., dari pasien
yang bersarang di ruang isolasi yang dilindungi dengan baik (12 pertukaran udara
per jam). Penelitian ini telah menyarankan kontaminasi lingkungan oleh pasien
positif SARS-CoV-2 melalui tetesan pernapasan dan gudang tinja menjadi
ancaman potensial untuk penularan penyakit.
Treatment covid 19

 Obat
Meskipun sampai saat ini, tidak ada obat yang berhasil mengobati
COVID-19, para ilmuwan telah menunjukkan beberapa keberhasilan
antivirus spektrum luas dan beberapa obat lain dalam mengobati infeksi
SARS-CoV-2. Sekitar 15 obat yang berbeda sedang diuji untuk
pengobatan infeksi COVID-19. Ini termasuk, klorokuin dan
hydroxychloroquine, lopinavir dan ritonavir, nafamostat dan camostat,
famotidine, umifenovir, nitoxanide, ivermectin, kortikosteroid,
tocilizumab dan sarilumab, bevacizumab, dan fluvoxamine [104].
Berbagai agen antivirus seperti remdesivir dan ribavirin diuji
kemanjurannya dalam mengobati penyakit. Misalnya, remdesivir (GS-
5734) memiliki aktivitas spektrum luas dan aktivitasnya terhadap MERS
dan SARS telah ditunjukkan dalam uji coba hewan [105–107]. Remdesivir
diketahui menghambat aktivitas polimerase RNA yang bergantung pada
RNA, oleh karena itu menghambat transkripsi RNA virus. Beberapa uji
coba remdesivir untuk mengobati COVID-19 juga dilakukan, tetapi
ditemukan memiliki beberapa efek samping [105–107].
Obat antivirus lain yang banyak digunakan adalah ribavirin, yang
dikenal untuk menghambat sintesis ribonukleoprotein. Ini juga
menghambat transkripsi awal gen virus dan, oleh karena itu, diketahui
menghambat replikasi dan penyebaran virus [108]. Uji coba ribavirin tetap
 tidak meyakinkan, karena beberapa penelitian tidak menunjukkan efek
obat pada pasien COVID-19 [109]. Sebelumnya, FDA AS dengan jelas
menyatakan bahwa obat ini tidak efektif untuk pengobatan influenza. D
emikian pula agen antivirus lainnya termasuk lopinavir dan ritonavir
juga sedang diuji untuk mengobati pasien COVID-19, karena ini diketahui
memiliki efek positif pada pasien MERS dan SARS-CoV-19 [91].
Beberapa penelitian menunjukkan bahwa klorokuin dan turunannya
dapat menghambat replikasi virus secara in vitro [110]. Beberapa
mekanisme kerja yang mungkin melibatkan pengurangan pH endosomal
yang akan mengakibatkan degradasi protein virus, dan gangguan dengan
glikasi terminal reseptor seluler ACE2, meminimalkan pengikatan virus
[111]. Juga didokumentasikan bahwa obat ini juga dapat mengganggu
enzim konversi angiotensin 2, yang merupakan salah satu situs yang
mengikat untuk protein SARS-CoV S [112].
Namun, baru-baru ini diterbitkan studi tentang uji coba yang
dilakukan di seluruh dunia tidak menunjukkan dampak positif dari obat
[113.114]. Masalah terpenting dengan infeksi COVID-19 adalah sindrom
gangguan pernapasan akut (ARDS).
Kortikosteroid dapat digunakan untuk mengimbangi ARDS dengan
mengimbangi badai sitokin. Namun, efek imunomodulator ini juga
memaparkan pasien terhadap infeksi sekunder dan komplikasi lain [115].
 Terapi/manajemen dukungan:
Karena tidak ada obat yang efektif untuk pengobatan COVID-19,
penyakit ini mengakibatkan sejumlah komplikasi pada pasien. Ini akan
membutuhkan sejumlah terapi pendukung kehidupan untuk bertahan dan
meminimalkan kerugian yang disebabkan oleh penyakit. Ini termasuk
terapi seperti artificial liver system (ALS) dan extracorporeal membrane
oxygenation (ECMO).
Jelas dari berbagai uji coba dan penelitian lain bahwa tidak ada
pengobatan khusus untuk COVID-19 dan pasien sedang dirawat
menggunakan kombinasi obat-obatan dan praktik manajemen yang
berbeda [116]. Menurut WHO, ada lebih dari selusin vaksin dalam uji
klinis fase 3 yang dikembangkan oleh berbagai organisasi dan kelompok
penelitian; ini termasuk vaksin yang dikembangkan oleh University of
Oxford /AstraZeneca [117]. Sayangnya, uji coba dihentikan karena
beberapa efek samping pada beberapa pasien. Vaksin lain di bawah uji
klinis fase 3 termasuk vaksin yang dikembangkan oleh CanSino Biological
Inc./Beijing Institute of Biotechnology, Sinovac, Moderna/NIAID, dan
banyak lainnya [118]. Ini terutama vektor virus non-replikasi atau virus
yang tidak aktif [119]. Baru-baru ini, vaksin Pfizer-BioNTech COVID-19
telah diotorisasi dan direkomendasikan. Vaksin lain yang telah
dikembangkan termasuk vaksin COVID-19 Moderna, Sinovac, dan
Sputnik V.