BAB I
PENDAHULUAN
A. Latar Belakang
Mitokondria adalah organel sel yang berfungsi sebagai tempat respirasi sel
makhluk hidup. Mitokondria kerap disebut sebagai “pembangkit energi” bagi sel
karena mitokondria yang paling banyak menghasilkan energi ATP untuk sel.
Mitokondria berisi sejumlah enzim dan protein yang membantu proses karbohidrat
dan lemak yang diperoleh dari makanan yang kita makan untuk melepaskan energi.
Mitokondria mempunyai dua lapisan membran, yaitu lapisan membran luar dan
lapisan membran dalam.Mitokondria merupakan suatu organel khas yang memiliki
sejumlah ciri yang tidak dimiliki oleh organel lainnya dimana mitokondria memiliki
materi genetiknya sendiri meskipun sebagian besar informasi genetik bagi biogenesis
dan fungsi mitokondria justru terletak pada genom nukleus.
Peran utama dari mitokondria adalah memproduksi ATP yang terjadi pada
membran bagian dalam. Hasil oksidasi dari proses glikolisis berupa piruvat dan
NADH akan dikonversi menjadi ATP dengan bantuan oksigen sebagai aseptor
elektron terakhir dan membentuk air sebagai hasil sampingannya. Peritiwa konversi
ini dikenal dengan respirasi sel, atau respirasi aerob.
1
2
BAB II
PEMBAHASAN
2
3
dalam beberapa sel membentuk filamen panjang yang bergerak atau rantai. Di sel lain
mereka tetap dalam satu posisi dimana mereka menyediakan ATP langsung ke situs
ATP yang konsumsinya tinggi misalnya dikemas antara miofibril yang berdekatan
dalam selotot jantung, atau dibungkus dengan rapat di flagela dalam sperma (Gambar
3).
Mitokondria cukup besar untuk dilihat dalam mikroskop cahaya dan mereka
pertama kali diidentifikasi pada abad sembilan belas. Bagaimanapun juga, kemajuan
nyata dalam memahami fungsi mitokondria, tergantung pada prosedur yang
dikembangkan pada tahun 1984 untuk mengisolasi mitokondria utuh. Untuk respon
teknis, banyak dari studi biokimia telah dilakukan dengan mitokondria murni dari
hati; dimana setiap sel hati mengandung 1000-2000 mitokondria, yang secara total
menempati sekitar 1-5 dari volume sel.
kimiawi pada hubungan sitosol dengan molekul kecil yang dikandungnya, matriks
berisi kumpulan molekul yang telah diseleksi.
Seperti yang akan dijelaskan nanti, bagian utama dari mitokondria adalah
matrik dan membran dalam yang mengelilinginya Membran dalam sangat khusus.
Lipid bilayer mengandung proporsi yang tinggi dari "dua" fosfolipid cardiolipin,
yang memiliki empat asam lemak dan hal ini membantu untuk membuat membran
kedap ion. Membran ini juga mengandung berbagai protein transportasi yang
membuatnya selektif permeabel untuk molekul-molekul kecil yang dimetabolisme
atau dibutuhkan oleh banyak enzim mitokondria yang terkonsentrasi dalam matriks.
Enzim matriks termasuk yang memetabolisme asam piruvat dan lemak jenuh untuk
menghasilkan asetil KoA dan yang mengoksidasi asetil KoA dalam siklus asam
sitrat. Produk akhir ini adalah oksidasi CO2, yang dilepaskan dari sel sebagai
pembuangan, dan NADH, yang merupakan sumber utama dari transportasi elektron
sepanjang rantai respirasi, yang memberikan ke rantai transpor elektron di
mitokondria. Enzim dari rantai respirasi yang tertanam di dalam membran
mitokondria sangat penting untuk proses fosforilasi oksidatif, yang menghasilkan
sebagian besar ATP pada sel hewan.
Seperti yang terlihat pada Gambar 5, membran dalam berlipat-lipat
membentuk serangkaian lipatan-lipatan yang dikenal sebagai krista, di dalamnya
terdapat matriks. Lilitan yang banyak ini menambah luas membran dalam, untuk
sebagai contoh yakni pada sebuah sel hati, terdapat lipatan sekitar sepertiga dari total
membran sel. Jumlah dari krista ini tiga kali lebih besar dalam mitokondria pada sel
otot jantung daripada di mitokondria pada sel hati, mungkin karena jumlah
permintaan ATP yang lebih besar dalam sel jantung. Ada juga perbedaan substansial
dalam enzim mitokondria dari jenis sel yang berbeda. Pada bab ini kita tidak
membahas perbedaan tetapi fokus kepada enzim dan kebutuhan yang sama untuk
semua mitokondria.
7
Matrix: ruang internal ini besar berisi campuran yang sangat terkonsentrasi
ratusan ezyme, termasuk yang diperlukan untuk oksidasi piruvat dan asam lemak dan
siklus asam sitrat. Matriks ini juga berisi beberapa salinan identik dari genom
mitokondria DNA, ribosom mitokondria khusus, tRNA, dan berbagai enzim yang
diperlukan untuk ekspresi gen mitokondria.
Membran dalam: membran dalam melipat ke dalam sebagai krista yang
berfungsi meningkatkan luas permukaan total. Ini berisi protein dengan tiga jenis
fungsi:
1. Mereka yang melaksanakan reaksi oksidasi darirantai transpor elektron.
2. ATP sintase yang membuat ATP dalam matriks.
3. Protein transport yang memungkinkan bagian metabolit masuk dan keluar dari
matriks.
8
Gradien elektrokimia dari H+, yang mendorong ATP sintase, sehingga membran
harus kedap ion dan molekul bermuatan yang paling kecil.
Membran luar: karena mengandung protein pembentuk saluran yang besar
(disebut Porin), membran luar bersifat permeabel terhadap semua molekul bermassa
5000 dalton atau kurang. Protein lain dalam membran ini termasuk enzim yang
terlibat dalam sintesis lipid mitokondria dan enzim yang mengubah substrat lipid
menjadi bentuk yang kemudian dimetabolisme dalam matriks, reseptor impor untuk
protein mitokondria, dan mesin enzimatik untuk pembagian dan fusi organel.
Ruang antar membran: ruang ini mengandung beberapa enzim yang
menggunakan ATP yang lewat dari matriks untuk memfosforilasi nukleotida lain.
sehingga efisien dimana sekitar 30 molekul ATP yang diproduksi untuk setiap
molekul glukosa teroksidasi. Sebaliknya, hanya 2 molekul ATP saja diproduksi per
molekul glukosa oleh glikolisis.
Mitokondria dapat menggunakan piruvat dan asam lemak sebagai bahan
bakar. Piruvat berasal dari glukosa dan gula lainnya, sedangkan asam lemak berasal
dari lemak. Kedua molekul bahan bakar diangkut melintasi membrane mitokondria
dan kemudian dikonversi ke metabolism penting asetil KoA oleh enzim yang terdapat
dalam matriks mitokondria. Kemudian asetil KoA dioksidasi di dalam matriks
melalui siklus asam sitrat. Siklus ini mengubah atom karbon diasetil KoA menjadi
CO2, dimana sel melepaskannya sebagai produk pembuangan. Yang paling penting,
siklus menghasilkan elektron berenergi tinggi yang dibawa oleh molekul NADH dan
FADH2 (Gambar 6).
dari NADH dan FADH2 juga melahirkan kembali NAD+ dan FAD yang diperlukan
untuk metabolism oksidatif lanjutan. Seluruh urutan reaksi diuraikan dalam Gambar
7.
ADP dan Pi menjadi ATP. ATP sintase berasal dari enzim yang sama terjadi di
mitokondria sel hewan, yang kloroplas tanaman dan ganggang, dan dalam membran
plasma bakteri dan archaea.
gerakan mereka menyebabkan cincin rotor berputar. Perputaran ini juga memutar
tangkai yang melekat pada rotor (biru pada Gambar 12B), yang dengan demikian bisa
menyebabkan putaran yang cepat di kepala lollipop.
Gambar 12. ATP Sinthase. (A) enzim tersusun atas bagian kepala, yang
disebut ATPase FI, dan pembawa transmembran H+, disebut F0. Baik FI
dan F0 terbentuk dari beberapa subunit. Tangkai berputar tetap pada rotor
(merah) yang dibentuk oleh cincin dari 10 sampai 14 subunit c dalam
membran. Stator (hijau) yang terbentuk dari transmembran suatu subunit,
terkait dengan subunit lain yang membuat lengan memanjang. Lengan ini
memperbaiki stator untuk cincin subunit 3α dan subunit 3β yang
membentuk kepala. (B) Struktur tiga dimensi dari ATPase F1 ditentukan
oleh x-ray kristalografi, nama ATP sintase berasal dari kemampuannya
untuk melakukan kebalikan dari reaksi sintesis ATP yaitu, hidrolisis ATP
ke ADP dan Pi, ketika terlepas dari bagian transmembran.
Sebagai hasil, energi dari aliran proton menurunkan gradien dapat dirubah
menjadi energi mekanik dari dua set gosokan protein yang bergesekan satu sama lain,
memutar tangkai protein mendorong terhadap cincin dari protein kepala.
Tiga dari enam subunit di kepala terdiri dari situs ikatan untuk ADP dan pospat
anorganik. Hal ini didorong untuk membentuk ATP sebagai energi mekanik yang
dirubah ke ikatan energi kimia melalui perubahan berulang dalam penyesuaian
18
protein yang membuat batang berputar. Dalam cara ini, ATP-sintase mampu
memproduksi lebih dari 100 molekul ATP/detik, menghasilkan 3 molekul ATP setiap
putaran. Jumlah proton-translokasi subunit pada rotor berbeda dalam synthases ATP
yang berbeda, dan jumlah ini yang menentukan jumlah proton yang harus lulus
melalui perangkat yang menakjubkan ini untuk membuat setiap molekul ATP.
Gambar 14. Rotasi Flagel Bakteri Didorong oleh Aliran H+. Flagel
yang melekat pada serangkaian cincin protein (orange), yang tertanam
dalam membran luar dan membran dalam serta memutar dengan flagel
tersebut. Rotasi didorong oleh aliran proton melalui cincin luar protein
(stator) oleh mekanisme yang mungkin mirip yang digunakan oleh ATP
sintase.
dirangkum dalam Tabel 1A, kita dapat menghitung bahwa oksidasi lengkap dari satu
molekul glukosa dimulainya dengan glycolisis dan berakhir dengan fosforilasi
oksidatif memberikan hasil bersih sekitar 30 ATP.
Kesimpulannya, produk ATP dari oksidasi glukosa pada sel hewan diproduksi
oleh mekanisme kemiosmosis dalam membran mitokondria. Posporilasi oksidatif
dalam mitokondria juga memproduksi sejumlah besar ATP dari NADH dan FADH 2
yang diambil dari oksidasi lemak (Table 1B).
dipompa ke dalam sitosol, ketika mereka dibutuhkan. ATP molekul yang khas dalam
angkutan tubuh manusia keluar dari mitochondriaon dan kembali ke dalamnya
(seperti ADP) untuk pengisian lebih dari satu kali per menit, sel menjaga konsentrasi
ATP sekitar 10 kali lebih tinggi dari ADP.
Enzim biosintetis sering membawa reaksi energi yang tidak menguntungkan
dengan memasangkan mereka ke energi hidrólisis yang menguntungkan dari ATP.
Kumpulan ATP kemudian mendorong proses sel, sama halnya dengan baterai yang
digunakan untuk mesin elektrik. Jika aktivitas mitokondria di blokir, level ATP turun
dan energi sel juga turun secara berangsur-angsur, reaksi energi yang menguntungkan
tidak lagi bisa dibawa dan sel mati. Racun sianida, yang menghentikan transpor
elektron di membran dalam mitokondria menyebabkan kematian yang prosesnya
persis seperti yang dijelaskan di atas.
Ini mungkin tampak bahwa proses sel akan berhenti ketika konsentrasi ATP
mencapai nol; tapi fakta nya, hidup lebih banyak menuntut, itu tergantung bagaimana
sel memelihara konsentrasi dari ATP yang dibandingkan dengan konsentrasi dari
ADP dan Pi. Untuk menjelaskan mengapa, kita harus mempertimbangkan beberapa
prinsip dasar termodinamika.
Besar Nilai Negatif ∆G untuk Hidrolisis ATP Membuat ATP Berguna untuk Sel
Perubahan energi bebas untuk reaksi, ∆G menentukan apakah reaksi ini akan
terjadi dalam sel. Kami menunjukkan bahwa ∆G untuk reaksi yang diberikan dapat
ditulis sebagai jumlah dari dua bagian: pertama, yang disebut perubahan energi bebas
standar, ∆G0 tergantung pada karakter intrinsik dari molekul, yang kedua tergantung
pada konsentrasi mereka. Untuk reaksi sederhana A → B,
∆G = ∆G0 + RT ln [B][A]
Dimana [A] dan [B] merupakan konsentrasi dari A dan B, dan ln adalah logaritma.
∆G0 hanya referensi nilai yang menghasilkan nilai dari ∆G ketika konsentrasi molar
dari A dan B sama ( ln 1 = 0).
23
ATP digambarkan sebagai "molekul pembawa energi aktif" utama dalam sel.
Secara luas, perubahan energi bebas menguntungkan (∆G negatif yang besar) untuk
hidrolisis yang digunakan melalui reaksi gabungan, untuk mendorong reaksi kimia
lain yang sebaliknya tidak terjadi. Reaksi hidrolisis ATP menghasilkan dua produk,
ADP dan fosfat anorganik (Pi), oleh karena itu jenis A → B + C, yang dijelaskan
pada Gambar 15.
∆G = ∆G0 + RT ln [B] [C][A]
(disebut kondisi standar), ∆G untuk hidrólisis ATP adalah perubahan energi bebas
yang stándar, dimana hanya –7.3 kcal/mole. Konsentrasi rendah dari ATP relatif ke
ADP dan Pi, ∆G menjadi 0 poin. Pada titik ini, tingkat dimana ADP dan Pi bekerja
sama untuk membentuk ATP akan sama dengan tingkat dimana ATP hidrólisis
menjadi bentuk ADP dan Pi. Dengan kata lain, ketika ∆G = 0, reaksi berada pada
equilibrium (lihat Gambar 15).
∆G, bukan ∆G0 diindikasikan sejauh apa reaksi pembentukan equilibrium dan
menentukan bagaimana itu dapat membawa reaksi lain. Karena efisiensi perubahan
dari ADP ke ATP dalam mitokondria dipertahankan konsentrasi tinggi dari ATP
relatif ke ADP dan Pi, reaksi hidrólisis ATP dalam sel tetap dijaga jauh dari
equilibrium dan ∆G cocok negatif. Tanpa disequilibrium besar, hidrólisis ATP tidak
bisa digunakan langsung ke reaksi sel. Contohnya banyak reaksi biosintesis akan
berjalan mundur daripada maju pada saat konsentrasi ATP rendah.
ATP Sintase juga Bisa Berfungsi dalam Mengembalikan Hidrólisis ATP dan
Memompa H+
Selain memanfaatkan aliran H+ dalam menurunkan gradien proton
elektrokimia untuk membuat ATP, ATP sintase dapat bekerja secara terbalik: dapat
menggunakan energi hidrolisis ATP untuk memompa H+ melewati membran dalam
mitokondria (Gambar 16). Kemudian bertindak sebagai “penyedia pasangan
reversibel”, pengubah gradien proton elektrokimia dan energi kimia. Arah tindakan
pada saat tertentu tergantung pada keseimbangan antara kecuraman gradien proton
elektrokimia dan tempat ΔG untuk ATP hidrolisis.
Jumlah pasti dari proton yang dibutuhkan untuk membuat setiap molekul ATP
bergantung jumlah subunit di cincin protein transmembran bentuk dasar rotor
(Gambar 12). Namun, untuk menggambarkan prinsip-prinsip yang terlibat, mari kita
asumsikan bahwa satu molekul ATP dibuat oleh ATP sintase untuk setiap 3 proton
yang dibawa. Walaupun ATP sintase bekerja dalam sintesis ATP atau hidrolisis ATP
mengarah pada hal instan, dalam kasus ini, keseimbangan antara perubahan energi
25
bebas yang baik untuk perpindahan 3 proton melalui membrane ke matriks, ∆G 3H+
(yang kurang dari nol) dan perubahan energi bebas tidak baik untuk sintesis ATP di
matriks ∆GATP sintesis (yang lebih besar dari nol).
Nilai dari ∆GATP sintesis bergantung pada konsentrasi dari 3 reaktan ATP, ADP,
Pi dalam matriks mitokondria (Gambar. 15). Nilai dari ∆G 3H+ berbeda, secara
langsung sebandinguntuk nilai kekuatan proton-motive melewati membran dalam
mitokondria.
elektrokimia yang disimpan dalam gradien ion transmembran menjadi energi ikatan
fosfat di ATP secara langsung.
28
BAB III
PENUTUP
Kesimpulan
Mitokondria melakukan sebagian besar oksidasi seluler dan menghasilkan
ATP dalam jumlah yang besar pada sel hewan. Mitokondria terdiri dari dua membran
konsentris, dan bagian utama yang bekerja adalah matriks dan membran dalam yang
mengelilinginya. Matriks mengandung berbagai macam enzim termasuk yang
mengkonversi piruvat dan asam lemak menjadi asetil CoA dan mengoksidasi asetil
CoA ini menjadi CO2 melalui siklus asam sitrat. Reaksi oksidasi ini menghasilkan
sejumlah besar NADH (dan FADH2). Rantai transpor elektron (rantai respirasi) yang
terletak di membran mitokondria bagian dalam kemudian memanfaatkan energi yang
tersedia dari gabungan molekul oksigen dengan elektron reaktif yang dibawa oleh
NADH dan FADH2.
Rantai respirasi menggunakan energi yang berasal dari transpor elektron
untuk memompa H+ dari matriks untuk membentuk gradien proton (H+) elektrokimia
transmembran, yang mencakup kontribusi dari potensial membran dan perbedaan pH.
Besarnya energi bebas dilepaskan ketika aliran H+ kembali ke dalam matriks
(melintasi membran dalam) menyediakan bahan dasar untuk produksi ATP dalam
matriks oleh protein-mesin ATP sintase yang luar biasa, yakni sebuah perangkat
pasangan reversibel antara arus proton dan sintesis ATP atau hidrolisis. Gradien
elektrokimia transmembran juga mendorong transportasi aktif metabolit yang dipilih
melintasi membran dalam mitokondria, termasuk pertukaran ATP-ADP antara
mitokondria dan sitosol. Hasil rasio yang tinggi dari ATP untuk produk hidrolisis
membuat perubahan energi bebas untuk hidrolisis ATP sehingga reaksi hidrolisis ini
untuk mendorong sejumlah besar proses yang membutuhkan energi di seluruh sel.
26
29
DAFTAR PUSTAKA
Albert, Bruce., Alexander Johnson, Julia Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and
Peter walter. 2008. Molecular Biologof The Cell. New York: Garland Science,
Taylor & Francis Group.
27