USULAN PRAKTIK MAGANG

TEKNIK IDENTIFIKASI Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis Virus

(IHHNV) PADA UDANG VANAME (Litopenaeus Vannamei) DENGAN METODE
Polymerase Chain Reaction (PCR) DI BALAI KARANTINA IKAN ,
PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN(BKIPM)
LAMPUNG

OLEH
MUHAMMAD IQBAL
1904124248

FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN

UNIVERSITAS RIAU
PEKANBARU
2022
 TEKNIK IDENTIFIKASI Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis
Virus (IHHNV) PADA UDANG VANAME (Litopenaeus Vannamei) DENGAN
METODE Polymerase Chain Reaction (PCR) DI BALAI KARANTINA IKAN ,
PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN(BKIPM)
LAMPUNG

Diajukan Sebagai Salah Satu Syarat Untuk melakukan praktek magang pada
Fakultas Perikanan Dan Kelautan Universitas Riau

OLEH
MUHAMMAD IQBAL
1904124248

FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN

UNIVERSITAS RIAU
PEKANBARU
2022

i
 KATA PENGANTAR

Puji dan syukur Penulis ucapkan kepada Tuhan Yang Maha Esa yang telah

memberikan Rahmat dan Karunia-Nya, sehingga saya dapat menyusun usulan praktik

magang ini selesai tepat pada waktunya. Pada kesempatan ini saya juga mengucapkan

terima kasih kepada Ibu Dr. Dra. Iesje Lukistyowati, MS sebagai dosen pembimbing

yang telah banyak memberikan masukan dan arahan kepada saya, serta kepada rekan-

rekan yang telah membantu penulis dan orang tua yang selalu mendoakan dan memberi

semangat dalam menyelesaikan penyusunan usulan praktik magang yang berjudul

“Teknik Identifikasi Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis Virus

(IHHNV) Yang Menyerang Udang Vanamei (Litopenaeus Vannamei) Dengan

Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) Di Balai Karantina Ikan ,

Pengendalian Mutu Dan Keamanan Hasil Perikanan(BKIPM) Lampung”.

Dalam penulisan usulan praktik magang ini penulis menyadari bahwa masih banyak

kesalahan dan kekurangan. Oleh karena itu, penulis sangat mengharapkan kritikan dan

saran yang sifatnya membangun sebagai koreksi dan acuan dalam perbaikan penulisan

pada masa yang akan datang.

Pekanbaru, Desember 2021

Muhammad Iqbal

i
 DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR....................................................................................................................ii

DAFTAR ISI...................................................................................................................................iii

DAFTAR GAMBAR......................................................................................................................v

DAFTAR TABEL...........................................................................................................................vi

DAFTAR LAMPIRAN...................................................................................................................vii

I. PENDAHULUAN.........................................................................................................................1

1.1. Latar Belakang.....................................................................................................................1

1.2. Tujuan Praktek Magang.......................................................................................................2

II. Tinjauan Pustaka........................................................................................................................4

2.1. Klasifikasi dan Morfologi Udang Vaname...........................................................................4

2.2. Habitat Udang Vaname........................................................................................................7
2.3. Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis Virus (IHHNV).................................14
2.4. Karakteristik IHHNV..........................................................................................................12
2.5. Gejala Udang Vaname yang Terinfeksi IHHNV................................................................12
2.6. Polymerase Chain Reaction (PCR).....................................................................................14

III. METODE DAN PRAKTEK MAGANG................................................................................18

3.1. Waktu dan Tempat.............................................................................................................18

3.2. Bahan dan Alat...................................................................................................................18
3.2.1. Alat............................................................................................................................18
3.2.2. Bahan.........................................................................................................................19
3.3. Metode Praktek Magang....................................................................................................19
3.4. Prosedur Praktek................................................................................................................20
3.4.1. Penanganan Sampel...................................................................................................20
3.4.2. Ekstraksi DNA...........................................................................................................20

i
 3.4.3. Amplifikasi DNA.......................................................................................................22
3.4.4. Elektroforesis.............................................................................................................23
3.5. Teknik Pengumpulan Data.................................................................................................23
3.5.1. Data Primer................................................................................................................24
3.5.2. Data Sekunder............................................................................................................24
3.6. Analisis Data.............................................................................................................................26

DAFTAR PUSTAKA.....................................................................................................................28

LAMPIRAN...................................................................................................................................29

Lampiran 1. Organisasi Praktek Magang...................................................................................30

Lampiran 2. Anggaran Biaya.....................................................................................................31
Lampiran 3. Jadwal Praktek Magang.........................................................................................32
Lampiran 4. Daftar Quisioner....................................................................................................33

i
 DAFTAR GAMBAR

Gambar

1. Morfologi Udang Vannamei.............................................................................6

v
 DAFTAR TABEL

Tabel

1. Alat........................................................................................................................18

2. Bahan.....................................................................................................................19

3. Data Sampel Uji di BKIPM Lampung....................................................................24

4. Tingkat Pendidikan Tenaga Pelaksana di BKIPM Lampung..................................25

5. Jumlah pegawai dan status kepegawaian di BKIPM Lampung...............................25

6. Tingkat Keahlian Tenaga Pelaksanaan BKIPM Lampung......................................26

7. Keadaan Sarana dan Prasarana yang Ada di BKIPM Lampung..............................26

v
 DAFTAR LAMPIRAN

LAMPIRAN

1. Organisasi Praktek Magang..............................................................................30

2. Anggaran Biaya.................................................................................................31

3. Jadwal Praktek Magang....................................................................................32

4. Daftar Quesioner...............................................................................................33

v
I. PENDAHULUAN

1.1. Latar Belakang

Udang vaname (Litopenaeus vannamei) merupakan salah satu komoditas

perikanan unggulan yang bernilai ekonomis penting dan banyak diminati oleh

konsumen di pasaran. Berdasarkan data International Trade Center (2017), kontribusi

nilai ekspor udang vaname terhadap total nilai ekspor perikanan tahun 2016 mencapai

lebih dari 27%. Kegiatan budidaya udang vaname sudah dikomersilkan dan

berkembang pesat di berbagai daerah sehingga pembudidaya udang vaname semakin

meningkat (Haliman dan Adijaya, 2006). Total produksi udang mengalami penurunan

pada tahun 2012 dari 1.900 ton menjadi 1.025,8 ton (Arafani dkk, 2016). Hal ini

diduga menjadi patogen yang memicu penyakit pada udang.

Banyak jenis virus yang menyebabkan kerugian pada budidaya udang vaname

antara lain Taura Syndrome Virus (TSV), Infectious Myonecrosis Virus (IMNV),

White Spot Syndrome Virus (WSSV) dan Infectious Hypoderma and Hemotopietic

Necrosis Virus(IHHNV), virus tersebut mengganggu pertumbuhan meliputi bentuk

tubuh yang tidak normal, ukuran benih yang tidak seragam, pertumbuhan yang

lambat, hingga menyebabkan kematian pada kegiatan budidaya.

Infectious Hypodermal dan Hematopoetic Necrosis Virus (IHHNV)

merupakan salah satu jenis virus yang menyerang tambak udang vannamei secara luas

di berbagai negara. Penyakit IHHNV menyebabkan udang menjadi kerdil atau Runt

Deforminty Syndrome (RDS) dan berbagai cacat kutikula udang khususnya pada

daerah roskum, antenna, dada dan abdomen. Penyakit IHHNV dapat menyerang

semua stadia hidup

1
udang, baik telur, larva, post larva, juvenile maupun stadia dewasa. Udang yang telah

sembuh dapat manjadi carrier IHHNV sepanjang hidupnya (Motte et al., 2003).

Penyakit IHHNV dapat menyerang semua stadia hidup udang, baik telur,

larva, post larva, juvenile maupun stadia dewasa.

Untuk itu pengujian virus perlu dilakukan sebelum udang didistribusikan antar

wilayah dalam negeri maupun kegiatan ekspor dan impor, hal ini bertujuan untuk

meminimalisir penyebaran penyakit terutama yang disebabkan oleh virus IHHNV pada

udang vaname.

Infectious Hypoderma and Hemotopietic Necrosis Virus(IHHNV) pada udang

Vaname adalah salah satu penyakit yang digolongkan sebagai penyakit utama di

Indonesia oleh Komisi Nasional Kesehatan ikan, maka perlu dilakukan diagnose secara

cepat dan akurat dalam penanganannya. Perkembangan iptek dalam biologi molekuler

dengan Teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) dapat membantu untuk

mendeteksinvirus secara cepat dan tepat.

Metode yang banyak digunakan untuk pengujian virus yaitu metode Polymerase

Chain Reaction (PCR). Prinsip kerja dari metode tersebut adalah menggandakan

fragmen DNA spesifik yang diinginkan dengan ukuran tertentu dengan mekanisme

perubahan suhu (Fatimah dkk, 2010).

Berdasarkan uraian diatas maka penulis tertarik untuk melakukan praktek

magang pada aplikasi PCR dengan judul “Teknik Identifikasi Infectious Hypoderma

And Hemotopietic Necrosis Virus (IHHNV) Pada Udang Vaname (Litopenaeus

Vannamei) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) Di Balai Karantina

Ikan ,

2
Pengendalian Mutu Dan Keamanan Hasil Perikanan(BKIPM) Lampung”

1.2. Tujuan dan Manfaat Praktek Magang

Tujuan dari praktek magang adalah untuk mengetahui Teknik identifikasi

IHHNV(Infectious Hypoderma and Hemotopietic Necrosis Virus) pada Udang Vaneme

(Litopenaeus Vanname) menggunakan metode PCR(Polymerase Chain Reaction) di

Balai karantina Ikan, Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan(BKIPM)

Lampung.

Manfaat dari praktik magang ini ialah untuk menambah pengetahuan,

pengalama, keterampilan dan memperluas wawasan penulis dalam bidang perikanan,

khususnya dalam Teknik mengidentifikasi virus IHHNV(Infectious Hypoderma and

Hemotopietic Necrosis Virus) pada Udang Vaneme, sehingga ilmu yang diperoleh bisa

membawa manfaat dan menjadi bekal di masyarakat.

3
 II. Tinjauan Pustaka

2.1. Klasifikasi dan Morfologi Udang Vaname

Udang vaname atau biasa juga disebut udang vannamei (Litopenaeus

vannamei) merupakan udang introduksi. Habitat asli udang ini adalah di perairan

pantai dan laut Amerika Latin seperti Meksiko, Nikaragua, dan Puertorico. Udang ini

kemudian diimpor oleh negara-negara pembudi daya udang di Asia seperti China,

India, Thailand, Bangladesh, Vietnam, dan Malaysia. Dalam perkembangannya,

Indonesia kemudian juga memasukan udang vaname sebagai salah satu jenis udang

budi daya tambak, selain udang vaname (Penaeus Monodon) dan udang putih/udang

jrebung (Penaeus Merguiensis) yang sudah terkenal lebih dahulu.

Beberapa catatan menyebutkan bahwa udang vaname yang masuk ke Indonesia

berasal dari Nikaragua (Bisnis Indonesia, 06/08/2002) dan sebagian lagi berasal dari

Meksiko. Pada awalnya, pemerintah memberi izin bagi dua perusahaan untuk

mengimpor udang vaname sebanyak 2.000 ekor induk dan 5 juta ekor benur dari

Hawaii dan Taiwan, serta 300.000 ekor benur lainnya dari daerah asal udang ini, yaitu

wilayah Amerika Latin (Bisnis Indonesia, 06/08/2002). Selanjutnya induk dan benur

tadi dikembangkan oleh sejumlah hatchery di Indonesia terutama di Situbondo dan

Banyuwangi (Jawa Timur) untuk menghasilkan benur komersial yang kemudian

disebarluaskan kepada petambak udang di tanah air. Pembenihan udang vaname

kemudian juga berkembang di wilayah Lampung dan berapa daerah lainnya.

Daya tarik udang vaname ini terletak pada ketahanannya terhadap penyakit dan

tingkat produktivitasnya yang tinggi. Selain itu, udang ini juga mampu memanfaatkan

4
seluruh kolom air dari dasar tambak hingga ke lapisan permukaan. Faktor-faktor

tersebut memungkinkan udang vaname untuk dipelihara di tambak dengan kondisi

padat tebar tinggi karena mampu memanfaatkan pakan dan ruang secara lebih efisien.

Selain itu, udang vaname juga dapat matang gonad di dalam tambak sehingga mudah

dalam penyiapan bakalan induk untuk usaha pembenihan.

Setelah melalui serangkaian penelitian dan kajian akhirnya melalui SK Menteri

Kelautan dan Perikanan RI No. 41/2001 pemerintah secara resmi melepas udang

vaname sebagai varietas unggul untuk dibudidayakan petambak di tanah air pada

tanggal 12 Juli 2001. Disebut sebagai varietas unggul karena udang vaname dinilai

memiliki beberapa kelebihan antara lain:

2.1.1. Lebih tahan terhadap penyakit

2.1.2. Tumbuh lebih cepat

2.1.3. Tahan terhadap fluktuasi kondisi lingkungan

2.1.4. Waktu pemeliharaan relatif pendek, yakni sekitar 90-100 hari per siklus

2.1.5. Tingkat Survival Rate (SR) atau derajat kehidupannya tergolong tinggi,

dan

2.1.6. Hemat pakan

Secara internasional, udang vaname dalam dunia perdagangan dikenal sebagai

White Leg Shrimp atau Western White Shrimp atau Pacific White Leg Shrimp. Di

Indonesia dikenal sebagai udang Vaname atau Vannamei atau udang kaki putih.

Karena berasal dari benua Amerika, di kalangan petambak, udang vaname dikenal juga

sebagai

5
"Udang Putih Amerika".

Gambar 1. Morfologi Udang Vannamei (Haliman & Adijaya, 2005)

Secara ilmiah, udang vaname menyandang nama ilmiah- Litopenaeus

vannamei. Udang ini termasuk golongan crustaceae (udang udangan) dan

dikelompokkan sebagai udang laut atau udang penaide bersama dengan jenis udang

lainnya, seperti udang vaname (Penaeus Monodon), udang putih atau udang jrebung

(Penaeus Merguensis), udang werus atau udang dogol (Metapenaeus spp.), udang jari

(Penaeus Indicus), dan udang kembang (Penaeus Semisulcatus). Penggolongan udang

vaname secara lengkap berdasarkan ilmu taksonomi hewan (sistem pengelompokan

hewan berdasarkan bentuk tubuh dan sifat-sifatnya) dipaparkan sebagai berikut.

Filum : Arthropoda

Kelas : Crustacea

Ordo : Decapoda

Famili : Penaidae

Genus/Marga : Litopenaeus

6
 Species/Jenis : Litopenaeus vannamei

Nama local :Udang vaname, udang kaki putih, udang putih Amerika

Udang vaname memiliki tubuh yang dibalut kulit tipis keras dari bahan chitin

berwarna putih kekuning-kuningan dengan kaki berwarna putih. Jika dibandingkan

dengan udang vaname atau udang jrebung, sosok tubuh udang vaname jauh lebih

kecil.

Tubuh udang vaname dibagi menjadi dua bagian besar, yakni bagian

Cephalothorax yang terdiri atas kepala dan dada serta bagian abdomen. yang terdiri

atas perut dan ekor. Cephalothorax dilindungi oleh kulit chitin yang tebal atau disebut

juga dengan karapas (carapace). Bagian cephalotorax ini terdiri atas lima ruas kepala

dan delapan ruas dada; sementara tubuhnya (abdomen) terdiri atas enam ruas dan satu

ekor (telson). Bagian depan kepala yang menjorok merupakan kelopak kepala yang

memanjang dengan bagian pinggir bergerigi yang disebut juga dengan cucuk

(rostrum). Bagian rostrum bergerigi dengan 9 gerigi pada bagian atas dan 2 gerigi pada

bagian bawah. Sementara itu, di bawah pangkal kepala terdapat sepasang mata.

Induk betina siap pijah umumnya berukuran 35-40 gram/ekor, sedangkan

ukuran siap panen di tambak umur 100 hari (3,5 bulan) adalah 60-80 (60-80 ekor/kg)

atau rata- rata ukuran 70 untuk kepadatan tebar 80 ekor PL (post larva/m² dengan SR

(survival rate/derajat kelangsungan hidup) sekitar 80% dan FCR (Feed Conversion

Rate) pakan. Hidup dalam tambak dengan salinitas (kadar garam) air tambak

pemeliharaan berkisar 5-35% (permil).

2.2. Habitat Udang Vaneme

Masuknya udang vaname ke Indonesia berawal dari kondisi pembudi dayaan

7
udang vaname yang mengalami berbagai kesulitan akibat serangan penyakit dan juga

kasus tingginya kandungan residu antibiotika dalam tubuh udang yang mengakibatkan

terganggunya proses produksi dan pemasaran terutama untuk pasar ekspor. Karena

kondisi tersebut belum ditangani secara tuntas, maka banyak pembudi daya yang ke

mudian mencoba beralih ke komoditi lain. Salah satu pilihannya adalah

membudidayakan udang vaname. Selain di Indonesia, maraknya budi daya udang

vaname juga terjadi di belahan bumi lainnya seperti Thailand, Cina, Brasil, Ekuador,

Meksiko, dan beberapa negara Amerika Latin.

Negara-negara tersebut kini tercatat sebagai produsen udang vaname utama

dunia. Malaysia dan Brunei Darussalam merupakan dua negara terdekat yang tercatat

sudah berhasil membudidayakan udang jenis ini sejak tahun 1999.

Dibandingkan dengan udang vaname, udang vaname memiliki ukuran tubuh di

bawahnya. Disamping itu, harga jualnya pun relatif lebih murah. Umumnya, harga jual

udang vaname sangat fluktuatif. Namun demikian, udang ini memiliki beberapa

keunggulan, seperti laju pertumbuhan yang baik pada rehtang salinitas normal 5-35%.

Selain itu, udang vaname juga dianggap sangat toleran terhadap kepadatan yang tinggi

(> 70 ekor/m²) dan dapat tumbuh. baik dengan pakan berprotein rendah. Hal ini

menunjukkan bahwa udang vaname memiliki kecenderungan makan ke arah

herbivorus, yang berarti pula udang vaname membutuhkan biaya pakan yang relatif

lebih murah dalam proses produksinya. Jadi tidak mengherankan bila belakangan ini

banyak petambak yang tertank untuk membudidayakannya. Keunggulan lain udang

vaname adalah teknologi pembudidayaannya relatif sama dengan teknik

pembudidayaan udang

8
jenis lain, seperti udang vaname, yang sudah dikuasai oleh petambak udang kita.

Disamping itu, penyediaan benihnya pun hampir tidak bermasalah secara teknis karena

toleransinya yang baik terhadap lingkungan buatan.

Namun demikian, seperti yang dialami oleh berbagai jenis komoditi introduksi

lainnya, masa-masa awal masuknya udang vaname ke tanah air pun memunculkan

beragam komentar dan tanggapan, baik yang positif maupun negatif. Hal ini sebagai

akibat adanya sinyalemen terhadap perkembangan pembudidayaan udang introduksi

ini yang dikhawatirkan memicu terjadinya kasus penyakit seperti yang dialami udang

vaname. Bila udang vaname rentan terhadap serangan penyakit MBV (Monodon

Baculo Virus), white spot, dan sejumlah penyakit mematikan lainnya, udang vaname

dikhawatirkan rentan terhadap serangan penyakit TSV (Taura Syndrom Virus). Di

samping itu, belum adanya aturan yang jelas dalam pembenihan dan pembudidayaan

udang vaname memunculkan kekhawatiran dan kerisauan dari banyak pihak terhadap

penurunan mutu benih yang disebabkan oleh kemungkinan terjadinya perkawinan

inbreeding (perkawinan sekerabat).

Diakui atau tidak, kini kehadiran udang vaname di tengah merosotnya produksi

udang di tanah air telah memberi sedikit angin segar bagi perkembangan budi daya

udang tambak secara keseluruhan. Namun demikian, untuk menghindari kegagalan

dan risiko lainnya, para ahli menyarankan agar pembudidayaan udang vaname

dilakukan secara hati-hati sebab, bila tidak, nasibnya akan sama dengan komoditi

udang pendahulunya. Terlebih lagi udang vaname ini merupakan udang hasil

pembibitan impor dari Meksiko dan tidak terdapat di perairan Indonesia, sehingga

dikhawatirkan

9
suatu saat akan memengaruhi biodiversitas udang yang ada di perairan Indonesia.

Untuk menghindari kasus cemaran residu antibiotika, para ahli me nyarankan

agar dalam pembudidayaannya pemeliharaan udang vaname dilakukan di tambak yang

baru dibuka. Sebab, bila dilakukan di tambak yang sudah digunakan dalam waktu yang

lama, bukan tidak mungkin lama-kelamaan udang vaname juga akan mengalami

kondisi serupa. dengan udang jenis lain dalam hal kandungan residu antibiotikanya.

Cara lain adalah dengan melakukan perbaikan secara menyeluruh terhadap kondisi

tambak yang sebelumnya pernah digunakan untuk (Taura Syndrom Virus). Di samping

itu, belum adanya aturan yang jelas dalam pembenihan dan pembudidayaan udang

vaname memunculkan kekhawatiran dan kerisauan dari banyak pihak terhadap

penurunan mutu benih yang disebabkan oleh kemungkinan terjadinya perkawinan

inbreeding (perkawinan sekerabat).

Diakui atau tidak, kini kehadiran udang vaname di tengah merosotnya produksi

udang di tanah air telah memberi sedikit angin segar bagi perkembangan budi daya

udang tambak secara keseluruhan. Namun demikian, untuk menghindari kegagalan

dan risiko lainnya, para ahli menyarankan agar pembudidayaan udang vaname

dilakukan secara hati-hati sebab, bila tidak, nasibnya akan sama dengan komoditi

udang pendahulunya. Terlebih lagi udang vaname ini merupakan udang hasil

pembibitan impor dari Meksiko dan tidak terdapat di perairan Indonesia, sehingga

dikhawatirkan suatu saat akan memengaruhi biodiversitas udang yang ada di perairan

Indonesia.

Untuk menghindari kasus cemaran residu antibiotika, para ahli me nyarankan

agar dalam pembudidayaannya pemeliharaan udang vaname dilakukan di tambak yang

1
baru dibuka. Sebab, bila dilakukan di tambak yang sudah digunakan dalam waktu yang

lama, bukan tidak mungkin lama-kelamaan udang vaname juga akan mengalami

kondisi serupa. dengan udang jenis lain dalam hal kandungan residu antibiotikanya.

Cara lain adalah dengan melakukan perbaikan secara menyeluruh terhadap kondisi

tambak yang sebelumnya pernah digunakan untuk pembudidayaan udang jenis lain.

Sementara untuk menjaga kualitas induk agar tetap sesuai standar (tidak terjadi

inbreeding) dibutuhkan pengawasan yang ketat terhadap penggunaan induk, di mana

induk yang digunakan adalah induk penjenis (Great Grand Parent Stock-GGPS) impor

yang bersertifikat dan bermutu baik. Selain itu, pengeluaran benur pun harus dikontrol

dengan baik. Caranya dengan mengeluarkan benur melalui satu pintu yang diawasi

pemerintah. Meski kelihatan sulit, tetapi hasil yang didapatkan akan memberikan

kontribusi yang maksimal terhadap perkembangan budi daya udang vaname.

2.3. Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis Virus (Ihhnv)

IHHNV termasuk dalam golongan parvovirus dengan genom DNA untai

tunggal dan berdiameter kurang lebih 22 nm. Pertama kali dideteksi pada juvenil udang

Penaeus sytlirostris dari Hawaii pada tahun 1981. Penyebaran penyakit ini sangat luas

meliputi Asia hingga Amerika termasuk Indonesia dengan inang alami adalah

L.Vannamei, P.Monodon, P.Stylirostris, P.Semisulcatus, dan P.Japonicus. Pengaruh

infeksi HHNV bervariasi, misalnya berupa kurangnya konsumsi pakan, kanibalisme

tinggi, gerakan lemah dan peningkatan mortalitas. Namun pada udang L.Vannamei dan

P.Monodon tidak menyebabkan kematian langsung akibat terinfeksi virus tersebut

(Lightner et al., 1983).

Penyakit viral ini menyebabkan laju pertumbuhan udang vannamei menjadi

1
lambat dengan bentuk tubuh yang tidak normal dan cenderung kerdil atau lebih

dikenal dengan Runt Deformity Syndrome, RDS. Penularann IHHNV dapat terjadi

secara vertikal maupun horizontal. Infeksi vertikal IHHNV pada benur udang

disebabkan oleh induk yang menjadi karir tertular IHHNV sehingga terjadi penurunan

sifat genetik pada benih keturunannya. Infeksi IHHNV menyebabkan kerugian karena

menurunnya kualitas udang berupa tidak seragamnya bentuk tubuh udang yang

dipanen (Haliman dan Adijaya, 2006).

2.4. Karakteristik IHHNV

Virus ini memiliki ukuran rata-rata diameter tubuh sekitar 22

nanometer. IHHNV merupakan virus dengan rantai tunggal DNA. Organ target dari

virus ini adalah hipodermis, hemosit, organ hematopoetik dan jaringan penghubung.

Virus ini termasuk dalam jenis parvovirus kategori C-1, yaitu kategori yang dapat

menyebabkan kematian massal dan dapat menyebar dalam suatu wilayah serta sulit

untuk disembuhkan.

2.5. Gejala Udang Vaneme yang Terinfeksi IHHNV

Larva dan post larva yang terinfeksi secara vertikal tidak menunjukkan adanya

gejala klinis. Namun, setelah stadia PL 35 atau lebih, gejala klinis akan mulai nampak

dan kemudian akan diikuti dengan kematian massal. Gejala klinis ini yaitu konsumsi

pakan menurun dan diikuti dengan perubahan tingkah laku serta morfologinya. Mula-

mula udang akan berenang ke permukaan air, kehilangan gerak dan akhirnya akan

turun ke dasar air. Tingkah laku seperti ini akan berlangsung selama beberapa jam

hingga tubuh udang lemah dan diserang oleh udang lain yang sehat sebagai efek dari

1
kanibalisme. Pada fase ini, tubuh udang akan timbul bintik putih kekuningan pada

kutikula epidermisnya. Hal ini membuat warna tubuh udang menjadi pucat dan ketika

kondisi sekarat, tubuh udang akan berubah warna menjadi kebiru-biruan serta otot-otot

abdominalnya berwarna gelap (Lightner et al., 1983).

Infeksi secara horizontal menyebabkan udang mengalami pertumbuhan lambat.

Penularan ini tergantung pada periode inkubasi dan tingkat keparahan penyakit yang

merujuk pada ukuran serta umur inang di mana juvenil udang sangat rentan terhadap

serangan penyakit. Stadium dewasa yang terserang jarang menunjukkan gejala klinis

dan kematian (Lightner et al., 1983).(Rapcewicz, 2016)

Penyakit IHHNV merupakan penyakit kronis pada udang penaeid yang

disebabkan oleh virus Penaeid DNA untai tunggal linier (linier single-stranded

DNA=ssDNA) terkecil. Virus ini tergolong dalam densovirus parvoviridae

berdiameter 20 - 22 nm, tidak beramplop, berbendtu icosahedron dengan densitas 1.40

g/mL dalam CsCl. Penyakit IHHNV menyebabkan udang menjadi kerdil atau Runt

Deformity Syndrome (RDS) dan berbegai cacat kutikula khususnya pada daerah

rostum, antenna, dada dan abdomen (Kalagaya et al., 1991).

Udang yang telah sembuh dapat menjadi carrier IHHNV. Hal ini sepanjang

gejala klinis yang ditimbulkan yaitu udang berenang tidak normal, yaitu sangat

perlahan–lahan, muncul ke permukaan dan mengambang dengan perut di atas, udang

akan mati dalam waktu 4 - 12 jam sejak mulai timbulnya gejala tersebut. Udang

penderita banyak yang mati pada saat moulting (ganti karapas). Pada kondisi akut,

kulit udang akan terlihat keputih-putihan, tubuh berwarna putih keruh, permukaan

tubuh akan

1
ditumbuhi oleh diatome, bakteri atau jamur, terlihat nekrosis pada kutikula, syaraf,

anena dan pada mukosa usus depan serta usus tengah. Upaya pengendalian infeksi ini

dengan perbaikan kualitas air (Suyanto dan Mudjiman, 2005).

2.6. Polymerase Chain Reaction (Pcr)

Sejauh ini belum ada pengobatan yang dapat dilakukan untuk mengatasi

serangan dan infeksi virus akibat penyakit viral ini. Namun cara umum yang biasa

dilakukan hanyalah dengan penanganan dan penggelolaan lingkungan yang baik guna

mencegah dan menghindari faktor perkembangannya. Untuk pencegahan dapat

dilakukan pemeriksaan benih dan induk dengan cara deteksi dini menggunakan

metode PCR (Polymerase Chain Reaction). Penggunaan metode PCR merupakan

metode yang biasa dilakukan karena memiliki beberapa keuntungan dibandingkan

teknik yang lain. Teknik ini mampu menyajikan hasil yang akurat dalam waktu yang

relatif singkat karena setelah proses amplifikasi DNA hasil dapat segera ivisualisasi.

Kemungkinan karakter yang muncul bisa sangat banyak tergantung kepada jumlah

primer yang digunakan. Selain mempunyai keuntungan dalam segi teknis yaitu relatif

sederhana, kuantitas DNA yang dibutuhkan hanya sedikit (Pandey et al., 1996).

Reaksi berantai polimerase atau lebih umum dikenal sebagai PCR merupakan

suatu teknik atau metode perbanyakan (replikasi) DNA secara enzimatik tanpa

menggunakan organisme. Teknik ini dirintis oleh Kary Mullis pada tahun 1983 dan ia

memperoleh hadiah Nobel pada tahun 1994 berkat temuannya tersebut. Penerapan

PCR banyak dilakukan di bidang biokimia dan biologi molekular karena relatif

murah dan

1
hanya memerlukan jumlah sampel yang sangat kecil. Metode PCR yang merupakan

teknik amplifikasi DNA sekuen tertentu melalui tiga tahapan yaitu ekstraksi asam

nukleat, amplifikasi DNA dan elektroforesis (Anonim b, 2011).

Deteksi molekuler berbabsis PCR merupakan salah satu metode molekuler

yang lebih bagus daripada metode konvensional. Teknik Polymerase Chain Reaction

(PCR) pertama kali dikembangkan pada tahun 1985 oleh Karry Mullis (Handoyo et

al.,2001). Teknik ini menggunakan sepasang primer yang merupakan oligonukleotida

yang berperan untuk mengawali proses amplifikasi molekul DNA. Keberadaan primer

PCR tersebut menyebabkan gen target akan teramplifikasi sepanjang reaksi PCR

berlangsung. Analisis PCR dengan primer spesifik merupakan langkah terbaik untuk

kepentingan deteksi virus patogen karena dapat menghasilkan penentuan secara cepat

keberadaan gen target, cukup sensitif dan mudah digunakan dalam kegiatan rutin

(Aris, 2011).. Pada suhu yang lebih tinggi (550C) spesifisitas reaksi amplifikasi akan

meningkat, tetapi secara keseluruhan efisiensinya akan menurun. Reaksi ini dilakukan

berulang-ulang sampai 25-30 kali (siklus) sehingga pada akhir siklus akan didapatkan

molekul-molekul DNA rantai ganda yang baru hasil polimerasi dalam jumlah yang

jauh lebih banyak dibandingkan jumlah DNA cetakan yang digunakan (Yuwono,

2006).

Empat komponen utama pada PCR adalah (1) DNA Cetakan, yaitu fragmen

DNA yang akan dilipatgandakan, (2) Oligonikleotida primer, yaitu suatu sekuen

oligonukleotida pendek (15-25 basanukleotida) yang digunakan untuk mengawali

sintesis rantai DNA, (3) Dioksiribonukleotida trifosfat (dNTP) terdiri atas dATP,

dCTP, dGTP, dTTP, (4) Enzim DNA Polimerase, yaitu suatu enzim yang melakukan

katalis

1
reaksi sintesis rantai DNA. Komponen lain yang juga penting adalah senyawa buffer

(Yuwono, 2006).

Teknik PCR sebenarnya adalah mengeksploitasi berbagai sifat alami replikasi

DNA. Dalam proses tersebut, Polymerase-DNA menggunakan DNA berserat tunggal

sebagai cetakan (template) untuk mensintesis serat baru yang komplementer. Cetakan

berserat tunggal dapat diperoleh melalui pemanasan DNA berserat ganda pada

temperatur mendekati titik didih. Polymerase-DNA juga memerlukan suatu wilayah

berserat ganda pendek untuk memulai (prime) proses

sintesis. Pada saat PCR, posisi awal dan akhir sintesis DNA dapat ditentukan

dengan menyediakan suatu oligonukleotida sebagai primer yang menempel secara

komplementer pada cetakan sesuai dengan keinginan peneliti. Salah satu keunggulan

PCR adalah polymerase-DNA dapat diarahkan untuk sintesis wilayah DNA tertentu

(Mahardika, 2003).

Primer yang digunakan dalam PCR ada dua, yaitu oligonukleotida yang

mempunyai sekuen yang identik dengan salah satu untai DNA cetakan pada ujung 5’-

fosfat dan oligonukleotida yang kedua identik dengan sekuen pada ujung 3’OH untai

DNA cetakan yang lain. Annealing biasanya dilakukan selama satu sampai lima menit

antara oligonukleotida primer dan DNA cetakan yang kemudian dilanjutkan dengan

inkubasi selama 1,5 menit pada suhu 72ºC. Pada suhu ini DNA polymerase akan

melakukan proses polimerasi untai DNA baru berdasarkan informasi yang ada pada

cetakan. DNA untai ganda yang terbentuk dengan adanya ikatan hidrogen antara untai

DNA cetakan dengan untai DNA baru hasil polimerasi selanjutnya akan didenaturasi

1
lagi dengan menaikkan suhu inkubasi menjadi 95ºC. Untai DNA yang baru tersebut

selanjutnya akan berfungsi sebagai cetakan bagi reaksi polimerasi berikutnya

(Yuwono, 2006).

Reaksi-reaksi tersebut diulangi lagi sampai 25-30 siklus, sehingga pada akhir

siklus akan didapatkan molekul-molekul DNA untai ganda yang baru hasil polimerasi

dalam cetakan yang digunakan. Banyaknya siklus amplifikasi tergantung pada

konsentrasi DNA target di dalam reaksi. Pada umumnya konsentrasi DNA Polymerase

Taq menjadi terbatas setelah 25-30 siklus amplifikasi (Sambrook et al.,1989).

Metode PCR juga telah dikembangkan untuk membedakan dan mendeteksi

virus patogen ikan dan udang berdasarkan amplifikasi gen-gen tertentu yang lebih

spesifik seperti sekuen gen 16S rRNA, gen toksin, dan gen hemolysin serta gen lux.

Pemanfaatan gen 16S rRNA telah digunakan sebagai parameter sistematik molekuler

yang universal, representatif, dan praktis untuk mengkonstruksi kekerabatan

filogenetik pada tingkat spesies (Aris, 2011).

1
 III. METODE PRAKTEK

3.1. Waktu dan Tempat

Waktu pelaksanaan praktik magang ini akan dilaksanakan mulai 05 Januari

2022 sampai dengan 05 Februari, Di Balai Karantina Ikan, Pengendalian Mutu Dan

Keamanan Hasil Perikanan(BKIPM) Lampung.

3.2. Bahan dan Alat

Bahan yang akan digunakan selama magang di Di Balai Karantina Ikan,

Pengendalian Mutu Dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM) Lampung.

3.2.1. Alat

NO ALAT FUNGSI
1. Autoclave Sterilisasi basah
2. Apparatus Electroforesis Tempat running hasil elektroforesis
3. Microwave Memanaskan bahan
4. Tabung enlemeyer Menyimpan media
Wadah untuk menimbang agarose
5. Aluminium foil
dan organ
6. Vortex Menghomogenkan larutan
7. Uv Transilluminator Visualisasi pewarna DNA
8. Tray with comb Menyetak agarose
9. Sarung Tangan Melindungi tangan dari DNA
10. Mikropipet Mengambil larutan sampel
Mencampur sampel dengan loading
11. Kertas Parafilm
dye
12. Power Supply Menghantarkan listrik
13. Oven Sterilisasi kering
14. Thermalcycler PCR Amplifikasi DNA target
15. Centrifuge Pemisahan ekstrak
16. Freezer Penyimpanan sampel
17. Laminar Air flow Tempat kerja steril

1
 18. Incubator with Shake Overnight sampel
19. Mortal dan pastle Menggerus sampel
20. Timbangan elektrik Menimbang sampel dan agarose
21. Penggaris Mengukur sampel
Tabel 1. Alat

3.2.2. Bahan
NO BAHAN FUNGSI
Membersihkan sampel untuk
1. Alkohol 95%
pewarna DNA
2. Akuades Pengenceran
3. TAE Buffer 1x Menghantarkan listrik
4. Agarose Media running DNA
5. Es batu Menganestesi sampel
6. Marker Penanda ukuran DNA
7. Pemberat dna dalam sumuran
Loading dye
agarose
9. Induk udang

vaname (
Sebagai sampel
Litopenaeus

vannamei )

10. Ethanol 100 % Mencuci DNA dari zat lain

11. Proteinase-k Memisahkan DNA dari protein

12. Gel Red Pewarna DNA

13. Kit Multiplex Pcr Amplifikasi PCR

14. Kit Ekstraksi Ekstraksi DNA

15. Alkohol 70% Sterilisasi alat

Table 2. Bahan

3.3. Metode Deteksi Virus di BKIPM Lampung

Menggunakan metode secara langsung di Lab Khusus Unit Virus untuk

1
memperoleh data. Selain itu untuk mendapatkan dana primer dilakukan dengan

wawancara dan bimbingan pegawai dan pembimbing lapangan. Sedangkan untuk

data sekunder diperoleh dari informasi terkait yang berhubungan dengan data yang

diperlukan serta ditambahkan melalui studipustaka dari buku-buku, jurnal dan

literatur yang mendukung.

3.4. Prosedur Praktek Magang

3.4.1. Penanganan Sampel

Sampel udang dalam keadaan hidup dari masing-masing lokasi tersebut

secara bertahap dibawa ke laboratorium. Sampel tersebut dimasukkan

kedalam baskom yang diberi aerasi agar sampel tetap bertahan hidup. Setiap

ekor sampel dari setiap lokasi di ukur panjangnya, serta ditimbang beratnya.

Kemudian diambil organ target yaitu insang, kaki renang, hepatopankreas,

dan ekor.

3.4.2. Ekstraksi DNA

Untuk mengetahui keberadaan virus IHHNV terlebih dahulu dilakukan

proses ekstraksi DNA. Dalam proses ekstraksi DNA yang perlu dilakukan

terlebih dahulu yakni homogenesi bagian tubuh sampel udang sampai halus.

Bagian tubuh yang diambil yaitu organ insang, kaki renang, hepatopankreas,

dan ekor. Selanjutnya dilakukan ekstraksi DNA mengikuti petunjuk pabrikan

serta sedikit modifikasi sesuai dengan kebutuhan dalam proses penelitian

tersebut berlangsung. Prosedur ekstraksi DNA adalah sebagai berikut:

Induk udang vaname dari ke 4 lokasi dipisahkan sesuai lokasi

masingmasing, selanjutnya setiap ekor sampel di ekstraksi DNA nya dengan

menggunakan Qiamp DNA Mini Kit (Qiagen).

2
 Pertama-tama organ-organ target pada tubuh udang seperti kaki renang,

insang, hepatopangkreas, dan usus diambil menggunakan alat bedah seperti

gunting bedah, dan pinset. Kemudian organ dimasukkan ke dalam kantong

sampel sebelum di ekstrak.

Organ-organ target digerus sampai halus menggunakan pestle lalu

dimasukkan kedalam tabung mikro 1,5 mL dalam kondisi dingin.

Sampel hasil gerusan ditimbang dan dimasukkan dalam 1 buah tabung

eppendorf sebanyak 20 - 25 mg.

Kemudian ditambahkan buffer ATL sebanyak 100 µL ditambahkan ke

dalam tabung eppendorf 25 mg dan divorteks agar larutan homogen. Larutan

proteinase K sebanyak 20 µL ditambahkan ke dalam tabung, kemudian

dilakukan vorteks dan selanjutnya disentrifus secara cepat. Tabung kemudian

diinkubasi pada suhu 56o C selama semalam. Setelah inkubasi dilakukan

sentrifus cepat pada kecepatan 14.000 rpm selama 5 menit sehingga seluruh

cairan yang melengket pada dinding tabung akan menuju ke dasar tabung.

Kemudian supernatant dibuang. Ditambahkan larutan 200 µL buffer AL,

vorteks selama 15 detik, lalu diinkubasi pada 70o C selama 10 menit.

Kemudian sentrifus pada kecepatan 14.000 rpm, lalu supernatant dibuang.

Selanjutnya ditambahkan 200 µL ethanol 99,9% (ethanol absolut) dan vortex

selama 15 detik. Larutan dari tabung eppendorf selanjutnya dipindahkan pada

QIAamp mini spim column (dalam 2 mL tabung koleksi), pada saat

memindahkan larutan agar tidak menyentuh dinding tabung. Kemudian tabung

ditutup dan disentrifus

2
 pada kecepatan 8000 rpm selama 1 menit, selanjutnya QIAamp colum

diletakkan pada tabung koleksi yang baru dan tabung koleksi yang sudah

mengandung filtrate dibuang. Buffer AW 1 ditambahkan sebanyak 500 µL

tanpa menyentuh dinding tabung, dan tabung ditutup, lalu disentrifus pada

kecepatan 8000 rpm. selama 1 menit, dan column diletakkan kembali pada

tabung koleksi yang baru dan tabung koleksi yang mengandung filtrate

dibuang.

Buffer AW 2 ditambahkan sebanyak 500 µL pada column tanpa

menyentuh pinggir tabung, dan setelah ditutup lalu disentrifus pada kecepatan

14000 rpm selama 3 menit. Hasil filtrate kemudian diibuang dan column

ditempatkan kembali pada tabung koleksi yang sama, lalu disentrifus kembali

pada 14000 rpm selama 1 menit. Selanjutnya QIAamp column diletakkan pada

eppendorf 1,5 mL dan ditambahkan buffer DW (Destilated Water) sebanyak

200 µL, namun ditambahkan secara berkala yakni 100 µL DW dan kemudian

di centrifuge dengan kecepatan 8000 rpm selama 1 menit. Kemudian kembali

ditambahkan 100 µL dan dicentrifuge pada kecepatan 8000 rpm selama 1

menit. Hasil ekstraksi DNA disimpan pada suhu -20o C sebelum digunakan.

3.4.3. Amplifikasi DNA

Komposisi PCR master dengan volume mastermix yang digunakan

dalam proses PCR yaitu: primer F/R 1 µL, destilated water (DW) 1 µL, DNA

ase free water 6 µL, DNA template 2 µL, dan hot star 10 µL. Kondisi PCR

untuk deteksi adalah dengan beberapa tahapan yakni predenaturasi 94o C

selama 10 detik, denaturasi 94o C selama 30 detik, annealing 50o C selama 30

detik, extension 72o C selama 1 menit, final extention 72o C selama 5

2
menit dimana proses

2
 tersebut dilakukan selama 35 kali. Primer spesifik yang digunakan adalah

primer IHHNV 309 F/R (Tang et al, 2007).

3.4.4. Elektroforesis

Dalam tahapan elektroforesis, terlebih dahulu dilakukan persiapan gel

agarose dimana dalam prosedur ini agarose ditimbang terlebih dahulu sesuai

dengan kebutuhan sampel selanjutnya dilarutkan kedalam larutan TAE 1x,

dalam penelitian ini agarose yang dipakai adalah agarose 1%. Dengan

menggunakan pemanas (microwave), agarose yang telah dibuat, kemudian

dilarutkan sampai mendidih, setelah agarose tersebut mendidih, didiamkan

selama kurang lebih 25 menit hingga suhunya kurang lebih 50ᵒ C. Setelah itu,

agarose tersebut dicetak pada tray agarose yang telah dilengkapi dengan sisir

yang bertujuan untuk memebentuk sumur-sumur gel. Setelah agarose sudah

dingin dan mengeras, sisir tray pada cetakan agarose tersebut diangkat dengan

hati-hati kemudian gel tersebut dimasukkan ke dalam elektroforesis apparratus

yang berisi TAE 1x yang berfungsi sebagai buffer pada proses elektroforesis

tersebut. Adapun tujuan dilakukannya running hasil PCR pada elektroforesis

adalah untuk mengetahui apakah suatu sampel terinfeksi virus IHHNV, maka

hasil PCR sebanyak 8 µL ditam,bah 2 µL loading dye dirunning pada gel

elektroferesis mini bersama-sama dengan DNA marker 100 bp sebanyak 5 µL.

Setelah semua hasil PCR diinjeksikan ke dalam sumur-sumur gel

elektroforesis, selanjutnya elektroforesis dijalankan dengan kondisi 100 volt

selama 45 menit.

3.5. Teknik Pengumpulan Data

Data yang dikumpulkan meliputi data primer dan data sekunder. Data primer

2
diperoleh dari wawancara dan hasil praktek di lapangan. Data sekunder diperoleh

dari instansi terkait yang berhubungan dengan data yang diperlukan penulis dan

literature yang mendukung kelengkapan dan kejelasan mengenai data yang

didapatkan tersebut.

3.5.1. Data Primer

Data primer yang didapatkan melalui wawancara bersama pegawai di

Stasiun Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan

(SKIPM) Pekanbaru, selanjutnya dianalisis secara deskriptif yang bertujuan untuk

mengetahui keadaan Stasiun Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan

Hasil Perikanan (SKIPM) Pekanbaru.

3.5.2. Data Sekunder

Data yang diperoleh dari rujukan data-data melalui studi pustaka dari

buku- buku, jurnal, literatur pendukung dan wawancara ditabulasikan dalam

bentuk tabel. Data yang diperoleh dianalisis dan akan ditarik kesimpulan. Adapun

tabel yang diperlukan adalah sebagai berikut.

Table 3.Data Sampel Uji di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan
Keamanan Hasil Perikanan ( BKIPM ) Lampung
No Data Sampel Uji Jumlah Panjang (cm)

1. Asal Sampel Uji

2. Gejala Klinis

Berdasarkan Tabel dapat diketahui sampel uji serta gejala klinis Balai

Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM)

Lampung.

2
Tabel 4.Tingkat Pendidikan Tenaga Pelaksana di Balai karantina Ikan
Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM) Lampung.
No Tingkat Pendidikan Jumlah Persentase

1. Magister

2. Sarjana

3. Sarjana Muda

4. SLTA

Berdasarkan Tabel dapat diketahui tingkat pendidikan tenaga pelaksana di

BKIPM Lampung. Ini berguna untuk mengetahui perkembangan pendidikan

pekerja-pekerja di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil

Perikanan (BKIPM) Lampung untuk pengembangan pada masa yang akan datang.

Tabel 5.Jumlah pegawai dan status kepegawaian di Balai Karantina Ikan

Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasul Perikanan (BKIPM) Lampung.
No Status Kepegawaian Jumlah Persentase

1. Teknisi

2. Pegawai

3. Tata Usaha

Berdasarkan Tabel dapat diketahui status kepegawaian dan jumlah

pegawai yang ada di BKIPM Lampung.

Table 6.Tingkat Keahlian Tenaga Pelaksanaan di Balai Karantina Ikan

Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM) Lampung.

2
 No Tingkat Pendidikan Jumlah Persentase

1. Tenaga Ahli

2. Tenaga Terampil

3. Tenaga Pembantu

Berdasarkan Tabel dapat diketahui keahlian tenaga pelaksana di Balai

Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM)

Lampung sehingga mempunyai bidang keahlian masing-masing untuk mencapai

hasil yang optimal dalam penanganan dan pemeriksaan komoditi yang dilalu

lintaskan kedalam atau luar daerah.

Table 7.Keadaan Sarana dan Prasarana yang Ada di Balai Karantina Ikan
Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM) Lampung.
No Sarana dan Prasarana Jumlah (unit) Keadaan

1.

2.

3.

Berdasarkan Tabel dapat diketahui keadaan sarana dan prasarana yang ada

di BKIPM Lampung. Sarana dan Prasarana yang ada merupakan fasilitas yang

dapat mendukung semua kegiatan yang adandi balai tersebut.

3.6. Analisis Data

Analisis data yang digunakan adalah analisis deskriptif, yaitu dengan

menjelaskan Teknik Identifikasi Infectious Hypoderma And Hemotopietic Necrosis

2
Virus (IHHNV) Yang Menyerang Udang Vaname (Litopenaeus Vanname) Dengan

Metode (Polymerase Chain Reaction ) PCR Di Balai Karantina Ikan, Pengendalian

Mutu Dan Keamanan Hasil Perikanan(BKIPM) Lampung.

2
 DAFTAR PUSTAKA
Aulia, A. M. S., Budi, D. S., Fasya, A. H., Kenconojati, H., & Azhar, M. H. (2019). Deteksi
Virus Pada Udang Vaname ( Litopenaeus vannamei ) di Balai Karantina Ikan ,
Pengendalian Mutu , dan Keamanan Hasil Perikanan Surabaya I Virus Detection of
Pacific White Shrimp ( Litopenaeus vannamei ) at Fish Quarantine Center , Quality
Control , a. 4(2), 83–90.

Rapcewicz, Z. P. P. (2016). 済無 No Title No Title No Title. URTI - From Quantum

Mechanics to Technology, 1–23. https://link-springer-
com.proxy.libraries.uc.edu/content/pdf/10.1007%2F978-3-642-19199-2.pdf
Amri, K., & Pi, S. (2013). Budi Daya Udang Vaname. Gramedia Pustaka Utama.

Yuwono, T. (2006). Teori dan aplikasi polymerase chain reaction. Penerbit Andi.
Yogyakarta, 1-3.
Desyana, V. Analisis Prevalensi Infectious Hypodermal And Haematopoetic Necrosis
Virus(Ihhnv) Pada Induk Udang Windu (Panaeus Monodon Fabricius, 1798)
DiSulawesi Selatan Melalui Metode Polymerase Chain Reaction (Pcr).
Haliman, Adijaya. 2005. Udang Vannamei. Jakarta: Penebar Swadaya

2
LAMPIRAN

3
Lampiran 1. Organisasi Praktek Magang
1. Pelaksana Praktek Magang

Nama Lengkap : Muhammad Iqbal

NIM 1904124248

Pekerjaan : Mahasiswa

Alamat : Jl. Bangau Sakti, Simpang Baru. Kec. Tampan, Kota Pekanbaru , Riau

2. Dosen Pembimbing

Nama Lengkap : Dr. Dra. Iesje Lukistyowati,

MS NIP : 195711241988032001.

Pekerjaan : Dosen Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas

Riau Alamat : Rumbai

3
Lampiran 2. Anggaran Biaya
1. Biaya Persiapan Praktek Magang

 Transportasi : Rp. 900.000,00

 Konsumsi : Rp. 1000.000,00

 Dokumentasi : Rp. 100.000,00

2. Biaya Setelah Praktek Magang

 Penulisan Laporan : Rp. 100.000,00

 Perbanyak Laporan : RP. 200.000,00

3. Biaya Persiapan Praktek Magang

 Pengerjaan Proposal : Rp. 100.000,00

 Perbanyakan Proposal : Rp. 100.000,00

 Kertas dan Alat Tulis : Rp. 50.000,00

 Biaya Ujian Praktek Magang : Rp. 400.000,00

4. Biaya Tidak Terduga

 Biaya Tidak Terduga : Rp. 500.000,00

Total Biaya : Rp. 3.450.000,00

Terbilang : Tiga Juta Empat Ratus Lima Puluh Ribu Rupiah

3
Lampiran 3. Jadwal Praktek Magang
Praktek magang ini direncanakan pada bulan Januari sampai dengan Februari tahun
2022 di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (BKIPM)
Lampung. Adapun jadwal praktek dari awal sampai akhir magang ini adalah sebagai berikut
:
No Kegiatan Desember Januari Februari Maret
1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4
1. Penyusunan   
Usulan
Proposal
2. Persiapan 
3. Pelaksanaan     
4. Penyusunan  
Laporan
5. Revisi dan  
Penggandaan
6. Ujian 
Proposal

3
Lampiran 4. Daftar Quisioner
1. SUMBER DATA :

2. LUAS DAERAH :

3. LETAK GEOGRAFIS :

4. BATAS DAERAH

 Sebelah Barat :

 Sebelah Timur :

 Sebelah Utara :

 Sebelah Selatan :

5. SEJARAH BERDIRINYA BKIPM LAMPUNG

 Sejarah berdirinya :

 Apa latar belakang dan tujuannya:

 Alasan pemilihan lokasi :

 Hasil penelitian apa saja yang sudah

 didapat :

 Dan bidang apa saja :

6. LOKASI PRAKTEK MAGANG

 Lokasi balai penelitian terletak di

Desa :
Kecamatan :
Kabupaten :

3
 Provinsi :
 Bagaimana topografi lokasi balai budidaya :

 Curah hujan dan temperatur dilokasi penelitian :

 Jarak dari jalan raya :

 Jarak dari pemukiman penduduk :

 Bagaimana prospek usaha budidaya perikanan

Air tawar di daerah tersebut :

Dan berapa luas area budidaya : Km
7. SARANA DAN PRASARANA

 Alat-alat apa saja yang digunakan :

 Apa saja perangkat laboratorium yang digunakan :

 Ada berapa kolam bak yang digunakan untuk kegiatan pemijahan

:

 Berapa luas area yang diperuntukkan untuk budidaya:

 Berapa jumlah bangunan yang ada :

Apa fungsinya :

 Sumber listrik yang dipakai dari :

biaya per bulan :

 Sumber air yang digunakan dari :

Alat yang digunakan :

berapa jumlahnya :
 Sarana transportasi yang ada :

3
 berapa jumlahnya :
8. PARAMETER KUALITAS AIR

 Parameter kualitas air yang diukur

Suhu : oC
Salinitas : ppt
Do : ppm
warna air :
pH :
kekeruhan : cm
 Alat yang digunakan :

 Berapa kali pengukuran dalam waktu tertentu:

9. KENDALA YANG DIHADAPI

 Bagaimana permodalannya :

Pemasarannya :

 Apa saja kendala yang dihadapi dalam pencegahan dan pengobatan terhadap virus
pada udang vannamei di BKIPM Lampung:

 Bagaimana cara mengatasinya :

 Bagaimana kualitas benih yang dihasilkan: