Nama: Juan S Lambey

Nim: 18101105073
Farmasi B

1. Jelaskan tentang klarifikasi virus berdasarkan Baltimore dan perbedaan dari masing-
masing grup
2. Pilinhlah salah satu virus yang menyerang hewan atau manusia dan jelaskan aspek-aspek
penting virus tsb seperti susuna penyusun, struktur genomnya, mekanisme infeksi,
transkripsi virus, proses perakitan, dsb
Jawab

1. Kelompok I : virus dsDNA adalah virus DNA rantai ganda (contoh: Adenovirus,

Herpesvirus, dan Poxvirus).
Kelompok II: virus ssDNA adalah virus DNA rantai tunggal (contoh: Parvovirus).
Kelompok III: virus dsRNA adalah virus RNA rantai ganda (contoh: Reovirus).
Kelompok IV: virus (+)ssRNA adalah virus sense RNA rantai tunggal (contoh:
Picornavirus dan Togavirus).
Kelompok V: virus (-)ssRNA adalah virus antisense RNA rantai tunggal (contoh:
Orthomyxovirus dan Rhabdovirus).
Kelompok VI: virus ssRNA-RT adalah virus RNA rantai tunggal dan melibatkan
penggunaan enzim reverse transcriptase (contoh: Retrovirus).
Kelompok VII: virus dsDNA-RT adalah virus DNA rantai ganda dan melibatkan
enzim reverse transcriptase (contoh: Hepadnavirus).

Kelompok I: Virus DNA untai ganda

Jenis-jenis virus ini harus memasuki inti inang sebelum dapat ditiru. Lebih lanjut,
virus ini memerlukan polimerase sel inang untuk mereplikasi genom virus dan
karenanya sangat tergantung pada siklus sel . Infeksi yang tepat dan produksi
keturunan mengharuskan sel dalam replikasi, karena selama replikasi polimerase sel
aktif. Virus dapat menginduksi sel untuk secara paksa menjalani pembelahan sel ,
yang dapat menyebabkan transformasi sel dan, pada akhirnya, kanker . Contohnya
termasuk Herpesviridae , Adenoviridae , dan Papovaviridae . Hanya ada satu contoh
yang dipelajari dengan baik di mana virus kelas 1 tidak mereplikasi dalam inti:
keluarga Poxvirus , virus yang sangat patogen yang menginfeksi vertebrata dan
termasuk virus cacar . MRNA ditranskripsi secara teratur dari DNA virus
menggunakan host RNA polimerase II. Ini menghasilkan dua jenis mRNA: 1) mRNA
awal, ditranskripsi sebelum sintesis DNA virus, dan 2) mRNA akhir, ditranskripsi dari
DNA progeni.
Kelompok II: Virus DNA untai tunggal
Virus dalam kategori ini termasuk Anelloviridae , Circoviridae ,
dan Parvoviridae (yang menginfeksi
vertebrata), Geminiviridae dan Nanoviridae (yang menginfeksi tanaman),
dan Microviridae (yang menginfeksi prokariota ). Sebagian besar dari mereka
memiliki genom sirkular (parvovirus adalah satu-satunya pengecualian yang
diketahui). Virus yang menginfeksi eukariot mereplikasi sebagian besar di dalam
nukleus - biasanya melalui mekanisme lingkaran bergulir , membentuk intermediet
 DNA untai ganda dalam proses tersebut. Anellovirus manusia yang lazim tetapi tanpa
gejala , disebut Transfusion Transmitted Virus (TTV), termasuk dalam klasifikasi ini.
Kelompok III: Virus RNA untai ganda
Seperti kebanyakan virus RNA , kelas ini bereplikasi dalam kapsid "Inti" yang ada
di sitoplasma , tidak harus menggunakan polimerase replikasi inang sebanyak derajat
virus DNA . Keluarga ini juga tidak dipelajari dengan baik seperti yang lainnya dan
mencakup 2 keluarga besar, Reoviridae dan Birnaviridae . Replikasi
bersifat monocistronic dan mencakup individu, genom tersegmentasi, yang berarti
bahwa masing-masing gen mengkode hanya satu protein, tidak seperti virus lain yang
menunjukkan terjemahan yang lebih kompleks.
Kelompok IV: Virus RNA beruntai tunggal - Positive-sense
Virus RNA indra-positif dan memang semua RNA yang didefinisikan sebagai indra-
positif dapat langsung diakses oleh host ribosom segera untuk membentuk protein. Ini
dapat dibagi menjadi dua kelompok, yang keduanya bereproduksi dalam sitoplasma:
 Virus dengan mRNA polikistronik di mana genom RNA membentuk mRNA dan
diterjemahkan ke dalam produk poliprotein yang kemudian dibelah untuk membentuk
protein dewasa. Ini berarti bahwa gen dapat menggunakan beberapa metode untuk
menghasilkan protein dari untaian RNA yang sama, semuanya demi mengurangi
ukuran gennya.
 Virus dengan transkripsi kompleks, di mana mRNA subgenomik , freshifting ribosom ,
dan pemrosesan proteolitik poliprotein dapat digunakan. Semuanya merupakan
mekanisme berbeda untuk menghasilkan protein dari untaian RNA yang sama.
Contoh kelas ini termasuk
keluarga Astroviridae , Caliciviridae , Coronaviridae , Flaviviridae , Picornaviridae , A
rteriviridae , dan Togaviridae.
KelompokV: Virus RNA beruntai tunggal - pengertian negatif
Virus RNA indra negatif dan memang semua gen yang didefinisikan sebagai indra
negatif tidak dapat langsung diakses oleh inang ribosom untuk segera membentuk
protein. Sebagai gantinya, mereka harus ditranskripsi oleh virus polimerase ke dalam
bentuk yang "dapat dibaca", yang merupakan kebalikan dari perasaan positif. Ini juga
dapat dibagi menjadi dua kelompok:
 Virus yang mengandung genom nonsegmented di mana langkah pertama dalam
replikasi adalah transkripsi dari genom (-) yang terdampar oleh RNA polimerase yang
tergantung pada RNA untuk menghasilkan mRNA monokistronik yang mengkode
berbagai protein virus. Salinan genom akal positif kemudian diproduksi yang berfungsi
sebagai templat untuk produksi genom untai (-). Replikasi ada dalam sitoplasma.
 Virus dengan genom tersegmentasi yang replikasi terjadi di dalam nukleus dan yang
tergantung pada RNA polimerase viral RNA menghasilkan mRNA monokistronik dari
setiap segmen genom. Perbedaan terbesar antara keduanya adalah lokasi replikasi.
Contoh dalam kelas ini termasuk
keluarga Arenaviridae , Orthomyxoviridae , Paramyxoviridae , Filoviridae ,
dan Rhabdoviridae (yang terakhir termasuk virus rabies ).

Kelompok VI: Virus RNA untai tunggal indra positif yang bereplikasi
melalui perantara DNA
Keluarga yang dipelajari dengan baik dari kelas virus ini termasuk retrovirus . Salah satu fitur
yang menentukan adalah penggunaan reverse transcriptase untuk mengubah RNA indra-
positif menjadi DNA. Alih-alih menggunakan RNA untuk templat protein, mereka
menggunakan DNA untuk membuat templat, yang disambungkan ke dalam genom inang
menggunakan integrase . Replikasi kemudian dapat dimulai dengan bantuan polimerase sel
inang.
Kelompok VII: Virus DNA beruntai ganda yang mereplikasi melalui perantara RNA
beruntai tunggal
Kelompok kecil virus ini, dicontohkan oleh virus Hepatitis B (yang ada dalam
keluarga Hepadnaviridae ), memiliki genom beruntai ganda, beralur yang kemudian diisi
untuk membentuk lingkaran tertutup secara kovalen ( cccDNA ) yang berfungsi sebagai
tempat untuk produksi mRNA virus dan RNA subgenomik . Pregenome RNA berfungsi
sebagai templat untuk transcriptase balik viral untuk produksi genom DNA.
Pararetrovirus lain dapat ditemukan dalam keluarga Caulimoviridae yang secara unik
dibentuk oleh virus yang menginfeksi tanaman. Pararetrovirus jauh terkait dengan retrovirus
Grup VI, dengan Caulimoviridae bahkan menjadi bagian dari ortervirales. Baik
Hepadnaviridae dan Caulimoviridae telah kehilangan langkah integrasi selama siklus
replikasi mereka dan telah berevolusi untuk merangkum DNA bukan RNA. Namun, keluarga
Caulimoviridae lebih terkait erat dengan keluarga Retroviridae kemudian ke
Hepadnaviridae. Ini menunjukkan bahwa kedua keluarga pararetrovirus telah berevolusi
secara terpisah dari leluhur yang mirip retrovirus menjadi pararetrovirus.

2. Influenza, yang lebih dikenal dengan sebutan flu, merupakan penyakit menular yang

disebabkan oleh virus RNA dari familia Orthomyxoviridae (virus influenza), yang
menyerang unggas dan mamalia. Gejala yang paling umum dari penyakit ini adalah
menggigil, demam, nyeri tenggorokan, nyeri otot, nyeri kepala berat, batuk, kelelahan,
dan rasa tidak nyaman secara umum, Walaupun sering tertukar dengan penyakit mirip
influenza lainnya, terutama selesma, influenza merupakan penyakit yang lebih berat
dibandingkan dengan selesma dan disebabkan oleh jenis virus yang berbeda Influenza
dapat menimbulkan mual, dan muntah, terutama pada anak-anak, namun gejala tersebut
lebih sering terdapat pada penyakit gastroenteritis, yang sama sekali tidak berhubungan,
yang juga kadang kala secara tidak tepat disebut sebagai "flu perut." Flu kadang kala
dapat menimbulkan pneumonia viral secara langsung maupun menimbulkan pneumonia
bakterial sekunder. Biasanya, influenza ditularkan melalui udara lewat batuk atau bersin,
yang akan menimbulkan aerosol yang mengandung virus. Influenza juga dapat ditularkan
melalui kontak langsung dengan tinja burung atau ingus, atau melalui kontak dengan
permukaan yang telah terkontaminasi. Aerosol yang terbawa oleh udara (airborne
aerosols) diduga menimbulkan sebagian besar infeksi, walaupun jalur penularan mana
yang paling berperan dalam penyakin ini belum jelas betul.
Dalam klasifikasi virus, virus influenza termasuk virus RNA yang merupakan tiga dari
lima genera dalam famili Orthomyxoviridae

 Virus influenza A
 Virus influenza B
 Virus influenza C
Virus influenza A
Genus ini memiliki satu spesies, virus influenza A. Unggas akuatik liar merupakan inang
alamiah untuk sejumlah besar varietas influenza A. Kadang kala, virus dapat ditularkan pada
spesies lain dan dapat menimbulkan wabah yang berdampak besar pada peternakan unggas
domestik atau menimbulkan suatu pandemi influenza manusia.
Virus influenza B
Genus ini memiliki satu spesies, yaitu virus influenza B. influenza B hampir secara eksklusif
hanya menyerang manusia dan lebih jarang dibandingkan dengan influenza A. Hewan lain
yang diketahui dapat terinfeksi oleh infeksi influenza B adalah anjing laut dan musang. Jenis
influenza ini mengalami mutasi 2-3 kali lebih lambat dibandingkan tipe A dan oleh
karenanya keragaman genetiknya lebih sedikit, hanya terdapat satu serotipe influenza B.
Virus influenza C
Genus ini memiliki satu spesies, virus influenza C, yang menginfeksi manusia, anjing, dan
babi, kadang kala menimbulkan penyakit yang berat dan epidemi lokal. Namun, influenza C
lebih jarang terjadi dibandingkan dengan jenis lain dan biasanya hanya menimbulkan
penyakit ringan pada anak-anak.

 Struktur Virus Influensa

Virus influenza A, B, dan C sangat serupa pada struktur keseluruhannya. Partikel
virus ini berdiameter 80-120 nanometer dan biasanya kurang-lebih berbentuk seperti
bola, walaupun bentuk filamentosa mungkin saja ada. Bentuk filamentosa ini lebih
sering terjadi pada influenza C, yang dapat membentuk struktur seperti benang
dengan panjang mencapai 500 mikrometer pada permukaan dari sel yang
terinfeksi. Namun, walaupun bentuknya beragam, partikel dari seluruh virus influenza
memiliki komposisi yang sama. Komposisi tersebut berupa envelope virus yang
mengandung dua tipe glikoprotein, yang membungkus suatu inti pusat. Inti pusat
tersebut mengandung genom RNA dan protein viral lain yang membungkus dan
melindungi RNA. RNA cenderung terdiri dari satu untaian namun pada kasus-kasus
khusus dapat berupa dua untaian. Pada virus, genom virus tidak terdiri dari satu
rangkaian asam nukleat; namun biasanya terdiri dari tujuh atau delapan bagian
RNA negative-sense yang tersegmentasi, tiap-tiap bagian RNA mengandung satu atau
dua gen. Contohya, genom influenza A mengandung 11 gen dalam delapan bagian
RNA, yang mengode
11 protein: hemagglutinin (HA), neuraminidase (NA), nukleoprotein (NP), M1, M2, 
NS1, NS2 (NEP: nuclear export protein), PA, PB1 (polymerase basic 1), PB1-F2 dan
PB2.
Virus dapat bereplikasi hanya pada sel hidup. Infeksi dan replikasi influenza merupakan
proses bertahap: pertama, virus harus berikatan dengan sel dan memasuki sel, kemudian
memindahkan genomnya pada suatu tempat dimana virus tersebut dapat memproduksi
duplikat dari protein virus dan RNA, kemudian menyusun komponen-komponen tersebut
menjadi partikel virus baru, dan terakhir, keluar dari sel inang
 Tahap-tahap infeksi virus influenza
1. Virus influenza berikatan melalui hemagglutinin dengan gula asam sialat pada
permukaan sel epitel, biasanya pada hidung, tenggorok, dan paru-paru mamalia, dan
usus unggas Setelah hemagglutinin dipecah oleh protease, sel akan memasukkan virus
melalui proses endositosis.
2. Setelah berada di dalam sel, kondisi asam dalam endosom akan menyebabkan dua
kejadian terjadi: pertama, bagian dari protein hemagglutinin akan menyatukan
envelope virus dengan membran vakuola, kemudian kanal ion M2 akan
memungkinkan proton untuk berpindah melewati envelope virus dan mengasamkan
 inti virus, yang akan menyebabkan inti menjadi terurai dan melepaskan RNA virus
dan protein inti. Molekul RNA virus (vRNA), protein aksesoris, dan RNA polymerase
yang bergantung pada RNA (RNA-dependent RNA polymerase) akan dilepaskan
pada sitoplasma. Kanal ion M2 akan disekat (diblok) oleh obat amantadine, yang akan
mencegah infeksi.
3. Protein inti ini berserta dengan vRNA akan membentuk kompleks yang akan
ditranspor ke inti sel, di mana polimerase RNA yang bergantung RNA akan memulai
transkripsi vRNA komplementer sense positif 
4. vRNA dapat keluar menuju sitoplasma dan mengalami translasi atau tetap bertahan
pada nucleus.
5. Protein virus yang baru disintesis dapat disekresi melalui apparatus Golgi menuju
permukaan sel (pada neuraminidase dan hemagglutinin) atau ditranspor kembali
menuju inti sel untuk berikatan dengan vRNA dan membentuk partikel genom virus
yang baru. Protein virus lainnya memiliki kerja yang beragam pada sel inang,
termasuk mengurai mRNA seluler dan mempergunakan nukleotida bebas untuk
sintesis vRNA dan juga menghambat translasi mRNA dan juga
menghambat translasi mRNA sel inang.
6. vRNA negative-sense yang membentuk genom dari calon virus, RNA polimerase
yang bergantung RNA (RNA-dependent RNA polymerase), dan protein virus lain
akan disusun menjadi virion. Molekul hemagglutinin dan neuraminidase akan
berkelompok membentuk suatu tonjolan pada permukaan sel. vRNA dan protein inti
virus akan meninggalkan inti sel dan memasuki penonjolan membran ini.
7. Virus dewasa akan melakukan budding off dari sel dalam suatu bentuk bola yang
terdiri dari membran fosfolipid inang, memperoleh hemagglutinin dan neuraminidase
yang terkandung dalam lapisan membran ini . Seperti sebelumnya, virus akan
berikatan melalui hemagglutinin; virus dewasa akan melepaskan diri
apabila neuraminidase mereka telah memecah residu asam sialat dari sel inang. Obat
yang menghambat neuraminidase, seperti oseltamivir, akan mencegah lepasnya virus
infeksius baru dan mencegah replikasi virus. Setelah lepasnya virus influenza baru,
sel inang akan mati.