TUGAS AGROBIOSAINS

Asam Amino Masuk Kedalam Siklus Krebs

Oleh:

M Andik Fathur Rohman (181510501073)

Ahmad Fikri Haikal (181510501107)
Abdurrahman Saleh (181510501)

KELAS A

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS JEMBER
2019
Degradasi Asam Amino
Asam amino yang berlebihan dari yang diperlukan untuk sintesis protein dan biomolekul
lain tidak dapat disimpan dalam tubuh maupun diekskresi ke luar tubuh, tidak seperti asam
lemak dan glukosa. Kelebihan asam amino condong digunakan untuk bahan bakar. Gugus α-
amino dibebaskan dan rangka karbon yang dihasilkan diubah menjadi zat antara metabolisme.
Sebagian besar gugus amino dari, kelebihan asam amino diubah menjadi urea, sedangkan rangka
atom karbonnya  di ubah menjadi asetil Ko-A, asetoasetil-Ko A, piruvat atau salah satu zat
antara pada daur asam sitrat. Jadi, asam lemak, zat keton, dan glukosa dapat dibentuk dari asam
amino. Asam amino tidak bisa disimpan karena didegradasi untuk daur asam trikarboksilat dan
menghasilkan energi.
 Proses oksidasi adalah salah satu dari perubahan yang terjadi pada asam amino terutama
setaelah gugus aminonya dihilangkan terlebih dahulu. Jalan yang ditempuh tergantung dari jenis
asam amino. Reaksi yang menghilangkan gugus amino sebagian besar berlangsung melalui dua
jalur yaitu transaminasi dan deaminasi.

Transaminasi
Transaminasi ialah proses katabolisme asam amino yang melibatkan pemindahan gugus
amino dari satu asam amino kepada asam amino lain.
Reaksi transaminasi dengan enzim aminotransferase
Gugus α-amino dari ke-20 asam L-amino yang biasa dijumpai pada protein, pada akhirnya
dipindahkan pada tahap tertentu dalam degradasi oksidatif molekul tersebut. Pembebahasan
gugus α-amino dari kebanyakan asam L-amino dikatalisa oleh enzim transaminase dan
aminotransferase. Pada transaminase, gugus α-amino dipindahkan secara enzimatik ke atom
karbon α pada α-ketoglutarat, sehingga dihasilkan asam α-keto, sebagai analog dengan asam
amino yang bersangkutan.
Transaminasi hanyalah salah satu dari berbagai ragam transformasi asam amino yang
dikatalisis oleh enzim-enzim piridoksal pospat. Reaksi lain pada karbon α asam amino adalah
dekarboksilasi, deaminasi, rasemisasi, dan pembelahan aldol.
Tujuan keseluruhan reaksi transaminase adalah mengumpulkan gugus amino dari berbagai
asam amino dalam bentuk hanya satu asam amino, yakni L-glutamat. Jadi, katabolisme gugus
amino menyatu menjadi produk tunggal. Kebanyakan tarnsaminase bersifat spesifik bagi α-
ketoglutarat sebagai molekul penerima gugus amino di dalam reaksi ini. Tetapi, enzim tersebut
tidak terlalu spesifik bagi substrat COOnya yang lain, yaitu asam L-amino yang memberikan
gugus aminonya. Beberapa transaminase yang paling penting, yang dinamakan sesuai dengan
molekul pemberinya aminonya, sebagai berikut:
L-Aspartat + α-ketoglutarat oksalasetat + L- glutamat
L-Alanin + α-ketoglutarat piruvat + L-glutamat
L-Leusin + α-ketoglutarat α-ketoisokaproat + L- glutamat
L-Tirosin + α-ketoglutarat p-hidroksifenilpiruvat + L-glutamat

α-ketoglutarat merupakan senyawa umum penerima gugus amino dari kebanyakan asam
amino yang lain. L- glutamate berperan untuk menyampaikan gugus amino kepada lintas
biosintetik tertentu atau menuju ke urutan akhir reaksi ini. Berdasarkan reaksi diatas dapat
disimpulkan bahwa gugus amino yang ada pada asam-asam tersebut dikumpulkan ke dalam satu
asam amino yaitu asam glutamate. Semua transaminase memiliki gugus prostetik yang terikat
kuat dan mekanisme reaksinya bersifat umum. Gugus prostetik piridoksal-fosfat, merupakan
turunan piridoksin atau vitamin Piridoksal fosfat berfungsi sebagai senyawa antara pembawa
gugus amino pada sisi aktif transaminase.
Gugus karbonil dari piridoksal fosfat yang terikat oleh enzim bergabung dengan gugus α-
amino dari asam amino yang datang, membentuk senyawa antara yang berikatan, kovalen, yaitu
sejenis senyawa yang disebut basa Schiff.  Suatu perpindahan ikatan ganda C=N terjadi setelah
itu, dan kerangka karbon asam amino terhidrolisis, meninggalkan gugus amino yang terikat
kovalen pada gugus prostetik dalam bentuk piridoksamin fosfat.

Piruvat yang terbentuk merupakan senyawa antara dalam Siklus Asam sitrat, sedangan
glutamate akan mengalami deaminasi oksidatif menghasilkan NH4+ dan α-ketoglutarat, α-
ketoglutarat juga merupakan senyawa antara dalam Siklus Asam Sitrat. NH4+  pada sebagian
besar vertebrata darat diubah menjadi urea untuk dikeluarkan dari dalam tubuh melalui Siklus
Urea.
Deaminasi
Deaminasi adalah mengeluarkan gugus amino dari suatu senyawa. Gugus α-amino dari
banyak asam amino dipindahkan kepada α-keto glutarat untuk membuat asam glutamat yang
 kemudian mengalami deaminasi oksidatif membentuk ion, Ion ammonium dibentuk dari
glutamat dengan deaminasi oksidatif. Reaksi ini dikatalisis oleh enzim glutamat dehidroginase,
yang tidak biasa karena dapat menggunakan baik maupun Aktivitas enzim glutamat
dehidroginase diatur secara alosetrik. Enzim pada vertebrata ini terdiri atas enam sub unit yang
identik. Guanosin trifosfat (GTP) dan adenosine trifosfat (ATP) adalah inhibitor alosetrik,
sedangkan guanosin difosfat (GDP) dan adenosin difosfat (ADP) adalah activator alosetrik. Jadi,
penurunan muatan energi akan mempercepat oksidasi asam amino.
Reaksi total yang dikatalisis oleh enzim aminotransferase dan glutamate dehidroginase
adalah :
Asam α-amino +  O + asam α-keto + NADH + (atau NADPH)

Pada sebagian besar vertebrata darat, diubah menjadi urea yang kemudian diekskresi.
Cara pemecahanan asam amino adalah dengan membentuk zat antara metabolic utama yang
dapat diubah menjadi glukosa atau dapat dioksidasi pada daur asam nitrat. Pada kenyataannya
rangka karbon 20 asam amino pokok yang membentuk protein disalurkan menjadi hanya 7
molekul yaitu, piruvat, asetil-KoA, asetoasetil- KoA, a-ketoglutarat, suksinil KoA, fumarat dan
okseloasetat.
Asam amino yang dapat dipecah menjadi asetil KoA atau asetoasetil KoA disebut
ketogenik karena asam tersebut pada pemecahannya menghasilkan zat keton. Sebaliknya asam
amino yang diubah menjadi piruvat, a-ketoglutarat, suksinil-KoA, fumarat, atau okseloasetat
disebut glukogenik. Sintesa glukosa dari asam amino mungkin dilakukan karena zat antara daur
asam sitrat dan piruvat dapat diubah manjadi fosfeonolpiruvat dan kemudian menjadi glukosa.
.

1. JALUR a-KETOGLUTARAT

Jalur ini memuat pengubahan arginin, prolin, histidin dan glutamin menjadi asam
glutamat yang selanjutnya senyawa akhir dideaminasi menghasilkan ketoglutarat. Asam-
asam amino tersebut termasuk dalam golongan senyawa glikogenat.

Arginin oleh enzim arginase dipecah menjadi ornitin dan urea. Dengan jalan transmiasi
ornitin yang terbentuk diubah menjadi glutamat semialdehida yang selanjutnya mengalami
 dehidrogenasi menjadi asam glutamat. Enzim pertama adalah ornitin transaminase  dan yang
berikutnya ialah dehidrogenase yang dibantu oleh NAD+.
Prolin oleh prolin oksidase diubah menjadi prolinkarboksilat yang karena tidak mantap 
langsung berubah menjadi glutamat semialdehida dan kemudian menjadi asam glutamat melalui
reaksi dehidrogenasi.
Enzim histidase (histidin-amoniak liase), urokanat hidratase dan imidazolon propionase
bersama-sama membuka cincin imidazol pada histidin menjadi N-formimino glutamat. Senyawa
ini kemudian melepaskan gugus formimino dalam suatu reaksi tramsfer yang dikatalisa oleh
glutamat-formimino transferase dan berubah menjadi asam glutamat.
Glutamin dapat membebaskan gugus NH3, pada reaksi hidrolisis yang dikatalisa oleh
glutaminase, menjadi asam glutamat. Senyawa tersebut juga bisa diubah menjadi asam glutamat
karena kegiatan enzim glutamat sintase.

2.     JALUR PIRUVAT

Kelompok  asam amino yang dapat diubah menjadi asam piruvat adalah alanin, glisin dan
serin, sistin dan sistein. Bagan perubahannya adalah sebagai berikut :
Glisin dapat diubah menjadi serin melalui reaksi transfer. Enzim yang mengkatalisareaksi
tersebut adalah serin hidroksimetil transferase yang dibantu oleh tetrahidrofolat(FH4).Serin yang
terbentuk pada reaksi transfer diatas diubah menjadi asam piruvat oleh serin dehidratase yang
dibantu oleh gugus prosintetis piridoksal-P.
Jalur pemecahan sistin menjadi asam piruvat merupakan sebuah lingkaran. Dari gambar
dibawah ini dapat diketahui bahwa sistin dapat diubah menjadi asam piruvat melalui tiga sub
jalur. Yang pertama sub-jalur sistin-sistein-merkaptopiruvat; yang kedua ialah sistin-sitein –
sistein sulfinat dan yang ketiga iadalah sistin – sistein  langsung asam piruvat. Enzim yang
mengkatalase senyawa yang terdapat pada sub jalur pertama masing- masing adalah sistin
reduktase yang merubah sistin menjadi sistein. Pengubahan sistein menjadi merkapto-piruvat
merupakan reaksi transfer yang dikatalisa oleh sistein transfaminase. Enzim 3-merkaptopiruvat
sulfurtransferase memindahkan gugus S ke HCN sehingga sisa yang dinamakan asam piruvat.
Pada sub jalur yang kedua dijumpai enzim-enzim  sistein deoksigenase dan aspartat
transaminase. Alanin dapat diubah menjadi asam piruvat melalui reaksi transaminasi yaitu :
Alanin + a-ketoglutarat                 Piruvat + glutamate
 Enzim alanin transaminase ini membutuhkan bantuan piridoksial-fosfat yang terikat erat pada
bagian apoenzimnya.
Asam piruvat yang dihasilkan oleh jalur piruvat ini diubah ke asetil-koa oleh kompleks
piruvat dehidrogenase. Asetil-koa ini dapat menghasilkan enersi melalui lingkaran asam
trikarboksilat.
  
3.     JALUR ASETO-ASETIL-KoA
Fenilalanin, triptofan, tirosin, lisin dan leusin dapat diubah menjadi asetil KoA melalui
asetoasetil KoA. Diagram konversi asam amino di atas dapat diikuti di bawah ini :
Fenilalanin berbeda dengan triptofan hanya pada kandungan gugs OH. Penempelan
gugus pada fenilalanin membentuk triptofan yang dikatalisis oleh fenilalanin 4-mono-oksigenase
(fenilalanin hidroksilase sebuah enzim oksigenase fungsi campuran) yang dibantu oleh koenzim
NADPH dan oksigen. Pembukaan cincin benzena yang ada pada fenilalanin atau trip tofan
dilakukan bersama-sama oleh enzim transainase dan dioksigenase yang dapat dilihat pada urutan
reksi ini.
            Pada jalur pemecahan fenilalanin atau triptofan dijumpai enzim yang bernama oksigenase
yaitu fenilalanin 4-monooksigenase, 4-OH fenilpiruvat dioksigenase dan homogentisat 1,2-
dioksigenase.  Enzim 4-monooksigenase adalah salah satu contoh dari yang mempunyai fungsi
campuran yaitu menempelkan 1 atom oksigen yang berasal dari O2 pada cincin benzena
(fenilalanin) dan mengkaitkan atom oksigen lainnya pada hidrogen sehingga terbentuklah air.
Hidrogen yang mereduksi secara tidak langsung berasal dari NADPH melalui dihidrobioproterin.
NADPH + H+ + dihidrobioproterin à NADP+ + tetrahidrobioproterin
L-Fenilalanin + tetrahidrobioproterin à dihidroproterin + L-tirosin

Leusin, asam amino yang terdapat dalam kelompok pada jalur aetil KoA diubah menjadi
aseto-asetat melalui tahapan reaksi transaminasi, dehidrogenasi, karboksilasi, hidratasi dan
pembentukan ikatan ganda.
Pengubahan lisin menjadi asetil-KoA menempuh jalur yang cukup panjang. Senyawa itu
dapat pula diubah melalui sakaropin setelah berkondensasi lebih dulu dengan asam  α-
ketoglutarat dan kemudian senyawa yang terbentuk dihidrogenasi menjadi L α-aminodipat
semialdehida.
 Enzim yang mengkatalisis reaksi di atas dan selanjutnya menjadi L- α-aminoadipat
semialdehida adalah sebuah dehidrogenase. Sakharopin selanjutnya diubah menjadi L- α-
aminoadipat semialdehida dan L-glutamat dengan enzim yang sama dibantu oleh NAD+.
Degradasi L- α-amino.
Reaksi pertama pengubahan triptofan adalah oksidasi yang dikatalisis oleh triptofan
pirolase atau disebut triptofan 2,3 dioksigenase yang dibantu oleh oksigen molekular. Enzim ini
mengandung Cu dan hem. Oksidasi ini mengakibatkan terbukanya cincin pirol. N-
formilkinurenin yang dihasilkan dalam oksidasi di atas dipisahkan gugus formilnya oleh enzim
formilase atau formamidase. Tahapan reaksi berikutnya oksidasi dengan bantuan NADPH dan
O2 dan kemudian hidrolisis. Reaksi ini menghasilkan 3-OH antranilat dan alanin. Senyawa yang
terakhir kemudian dapat diubah menjadi asetil-KoA. Senyawa hasil antara degradasi triptofan
banyak yang dapat digunakan sebagai senyawa dasar biosintesis hormon. Salah satu adalah
hormon tanaman yang disebutkan asam indolasetat.

4.     JALUR SUKSINAT

Asam amino metionin, isoleusin dan valin menempuh jalur yang sama pada proses
degradasinya menjadi asam suksinat.
           
Metionin yang masuk ke dalam jalur, pertama kali dipisahkan gugus metilnya. Caranya ialah
dengan mengubah metionin menjadi S-Adenosil metionin dengan bantuan ATP dan enzim
metionin adenosil transferase. Senyawa yang terbentuk ini kemudian bertindak sebagai donor
metil pada reaksi transmetilasi.