Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

16
APTER

EPILOG
CH

Manousos E. Kambouris
Golden Helix Foundation, London, Inggris

Tidak ada prospek jelas mengenai mikrobiologi yang dapat diproyeksikan dengan pasti; mereka muncul dalam cakrawala
peristiwa yang kabur. Revolusi biologi molekuler dalam hal sintesis, yang diikuti dengan ketersediaan pengetahuan dan
keterampilan yang melimpah, telah membawa prospek atau, lebih tepatnya, ketakutan bahwa bioteknologi akan menyebar
ke tingkat rumah tangga atau bahkan tingkat pribadi, seperti yang terjadi pada komputer dan TI pada umumnya (Regalado
Antonio, 2012; Baiklah Philip, 2016). Mulai dari laboratorium kecil yang kurang lebih berlisensi di lingkungan sekitar hingga
format yang dapat diterapkan sendiri, keterjangkauan bahan habis pakai dan instrumentasi dapat, dan sebenarnya masih,
memungkinkan sosialisasi seperti itu, yang merupakan potensi mimpi buruk baik dalam konteks keamanan hayati maupun
keamanan hayati. Area risiko yang diproyeksikan berkisar dari pembusukan minuman buatan sendiri dan alergi akibat
strain rumahan yang salah rekayasa hingga sejumlah besar patogen baru, yang diciptakan oleh sejumlah radikal dan
mahasiswa ilmu pengetahuan yang tidak puas, yang muncul setiap bulan di seluruh dunia dan setiap tahunnya.
diantaranya mampu, meskipun kecil kemungkinannya, menimbulkan Risiko Bencana Biologis Global (GCBR) (Cameron, 2017
).
Namun lompatan penyebaran ini tidak pernah terjadi, dan mungkin juga tidak akan terjadi. Bisa saja, tapi
kemungkinannya kecil. Alasannya adalah mereka bersaing untuk mendapatkan sumber daya yang sebenarnya
terbatas, terutama intelektual, dalam keterbatasan rumah tangga, dengan fasilitas IT dan silika. Masyarakat
manusia tampaknya lebih menyukai teknologi konvensional dan tidak tertarik dengan potensi bioteknologi yang
sangat nyata. Geeks lebih suka bekerja keras pada kode mesin dan bahasa pemrograman yang berbeda daripada
kode DNA sumber tunggal; inovasi dan pengerjaan dibuktikan dengan membentuk batu, kayu, kaca, logam, dan
plastik serta menggabungkan, menyambungkan, dan menyambungkan bagian-bagian inti tembaga atau
semikonduktor daripada mencampurkan biomolekul di inkubator rumah, ketel, dan Tupperware.
Ini adalah masalah kenyamanan, karena yang pertama telah ada selama dua abad dan mengembangkan tingkat
pengenalan yang belum pernah terjadi sebelumnya kepada setiap anggota masyarakat kontemporer. Hal ini juga
merupakan masalah pengambilan keuntungan: perusahaan-perusahaan besar dan raksasa memperoleh keuntungan yang
tinggi dan tidak terikat untuk mengubah kompetisi eksistensial demi teknologi baru, di mana peraturan dan ketentuan
yang berbeda mungkin berlaku, bahkan jika keberlanjutan adalah hadiah utamanya. Sebenarnya, mereka benci
melakukannya,khususnyajika keberlanjutan dipertaruhkan, karena keberlanjutan jelas-jelas berdampak buruk bagi bisnis
yang didasarkan pada siklus konsumsi—yakni, bagi “bisnis seperti biasa”.
Namun ada alasan yang lebih biasa untuk pilihan ini, yang tampaknya tidak dapat diubah: bertentangan dengan mitos
perkotaan, alam memang demikianbukaninsinyur terhebat, dan penciptaan dari perspektif ilmu sistem menyisakan banyak
hal yang diinginkan yang terbukti dengan proses evolusi yang sedang berlangsung. Ketidakmampuan sistem kekebalan
tubuh manusia dalam mengatasi parasit metazoa saat sedang dalam proses alergi

Mikrobiomik. DOI:https://doi.org/10.1016/B978-0-12-816664-2.00016-5 ©2020 Elsevier

Inc. Hak cipta dilindungi undang-undang. 361
362 BAB 16EPILOG

terjadi, sebagai produk sampingan dari proses yang penting namun masih tidak efektif, adalah salah satu
contohnya (Fitzsimmons dkk., 2014). Autoimunitas dan kanker menunjukkan kegagalan regulasi yang mencolok (
Ivanova dan Orekhov, 2015); di sisi lain, kemampuan adaptasi mikrobiota terhadap ancaman, antibiotik, dan
lingkungan yang berbeda secara umum merupakan keberhasilan yang tidak memenuhi syarat (Woappi dkk., 2016).
Mungkin ada pelajaran di sini, mengenai tingkat kompleksitas di mana alam saat ini berada pada kondisi terbaiknya
dalam perancangan sistem, dan ini mungkin menjadi argumen kuat untuk kemajuan mikrobiologi.
Alasan tersembunyi atas kualitas rekayasa alam yang biasa-biasa saja (atau apa pun yang dianggap
bertanggung jawab atas upaya desain yang koheren dan masif yang kita anggap sebagai bentuk kehidupan)
sangatlah rasional. Hal ini tidak dapat menggunakan bahan-bahan terbaik yang tersedia, bahkan dalam
konteks planet ini. Logam, keramik, bahan sintetis/plastik, semikonduktor, dan bahan nano saat ini akan
menghasilkan sistem yang jauh lebih baik. Hal ini terlihat jelas dalam konsep Peningkatan Kemanusiaan (
Buchanan, 2009), yang sebenarnya telah dipraktikkan selama ribuan tahun, tetapi masih dikonsep saat ini.
Dalam konsep ini, “suku cadang” yang dibuat dari material berteknologi terbaik yang tersedia (terutama,
namun tidak eksklusif, logam pada sebagian besar era ini) menggantikan suku cadang yang rusak atau
rusak (misalnya karena luka) dan terbukti mempunyai kinerja yang lebih baik dan, terutama selama
setengah abad terakhir, benar-benar memperbaiki versi aslinya (Aydin, 2017). Tentu saja langkah utamanya
adalah penggantian secara proaktif untuk memberikan kinerja yang ditingkatkan atau dioptimalkan, yang
merupakan inti dari moto “Peningkatan Kemanusiaan”. Alasan pemilihan bahan-bahan berkualitas rendah
ini jelas terlihat dalam prospek sementara: Alam membutuhkan keberlanjutan dalam sistemnya, dan
kebutuhan akan reproduksi otonom, atau semiotonom ketika spesies seks eksklusif dipertimbangkan,
memerlukan fleksibilitas yang dapat diberikan. oleh rantai karbon yang serba guna namun tidak optimal.
Sebagai intisari kehidupan di biosfer bumi, rantai karbon cukup serbaguna untuk digunakan pada struktur
yang sangat efektif dan beragam, beberapa di antaranya sangat berdedikasi, sekaligus memungkinkan
pengkodean rencana rekayasa dalam empat dimensi (usia-ontogeni adalah yang keempat) dan
menerapkannya.Taylor dkk., 2007), namun ia tidak dapat bertumbuh menjadi ada; apalagi mereplikasi dan
menarik molekul dari lingkungan. Itu harus diprodukside novo.

Masih di sanaadalahkemungkinan yang sangat besar bahwa mikrobiologi dapat berkembang. Alasannya
adalah keberlanjutan yang melekat dan diversifikasi proses dan entitas yang dikembangkan, yang dapat diterapkan
di berbagai bidang—contohnya, secara selektif dan tidak eksklusif, probiotik, farmasi, dan biofarmasi (Gasbarrini
dkk., 2016; Hager dan Ghannoum, 2017; Lee dkk., 2018; Kooijman dkk., 2012); penerapan seperti itu dapat
ditentukan oleh kekuatan analitis yang melekat dalam analisis Big Data dan ditangani dengan penyesuaian yang
dapat dicapai melalui biologi sintetik, kemungkinan besar dengan rekayasa genomik tetapi juga dengan
pendekatan intervensi translasi lainnya. Mikrobiologi sebenarnya menggabungkan konsep kolektif sebelumnya
mengenai mikrobiologi (mikroflora dan mikroekologi) ke dalam jaringan yang dapat dilacak; mereka juga
menggabungkan populasi, campuran, dan efek yang dapat dihitung menjadi satu kesatuan yang terintegrasi dan
fungsional, berkat Big Data. Akibatnya, gambaran multidimensi, deskriptif, dan prediktif muncul—sebuah dimensi
penting dari Holly Grail TI yang baru, Quantified Planet (Ozdemir, 2018), dan dengan memahami dan
memanipulasinya, versi sebenarnya dari Gelombang Ketiga (Toffler, 1981) mungkin bisa terwujud. Alam berhasil
dengan jelas dalam format distribusi berdasarkan kawanan, kawanan, hutan, dan kawanan (Trewavas, 2017;
Zahadat dkk., 2015), sementara teknologi berupaya keras namun tidak membuahkan hasil. Distribusi ini
sebenarnya berkaitan dengan keberlanjutan, dan ketika sumber daya menjadi faktor pembatas bahkan dalam
teknologi, keberlanjutan menjadi hal yang penting. Ketika data yang andal dapat dikumpulkan dan diproses secara
efisien dalam skala mikrobioma,
 EPILOG 363

yaitu Data Besar (Navas-Molina dkk., 2017), peluang baru muncul untuk eksploitasi. Mikrobiota adalah efektor yang
sangat baik, dan dapat ditingkatkan dengan saklar, sensor, dan molekul (bio)aktif baru (Ford dan Perak, 2015) dan
juga cenderung bertransformasi menjadi biosensor yang andal (Ling, 2017; Reen dkk., 2017). Teknologi dapat
dikembangkan tidak hanya dengan menyalin atau menggunakannya sebagai produk tetapi juga dengan
menghubungkannya ke antarmuka sehingga dapat memanfaatkan pemrosesan yang dilakukan secara spontan (
Kim dkk., 2015; Reen dkk., 2017). Lebih mudah untuk mendengarkan mikrobioma untuk mendeteksi anomali dan
menstimulasinya untuk memulihkan keseimbangan, daripada menyusun, merancang, dan memproduksi
perangkat keras teknis buatan untuk melakukan hal tersebut—dan pendekatan mikrobioma tetap berkelanjutan.
Dalam hal ini, baik perusahaan rintisan maupun perusahaan raksasa perekonomian tampaknya menyetujui hal-hal
berikut: penggunaan sumber daya hayati terstruktur (bukan bahan mentah) baik dalam konteks alami maupun
buatan (kehutanan dan pertanian adalah contohnya; biosensor dan produksi metabolit/ xenobiotik (yang terakhir)
jauh lebih menjanjikan dibandingkan dalam konteks perkotaan dan mempunyai potensi besar untuk inovasi, yang
mungkin dapat mendorong keuntungan atau keberlanjutan.
Suatu senyawa biologis karena fungsi pengaturan mandiri dan reproduksinya jauh lebih efisien per beratnya
dibandingkan dengan senyawa aktif mana pun dan lebih mudah untuk diproduksi: desainnya yang sangat detail
dan fungsional, diasah oleh banyak generasi evolusi, memerlukan lebih sedikit upaya untuk mencapainya. proses
produksi dengan pembawa alami, memungkinkan unit kecil, investasi moderat, instalasi terdistribusi, dengan
dampak lingkungan yang rendah, sumber daya transportasi yang berkurang dan ukuran yang terjangkau,
sekaligus memenuhi kebutuhan model produksi piramidal yang terstruktur, administratif yang haus sumber daya,
dan staf .
Dalam catatan yang lebih praktis, bahkan teknis, bioma bawahan, seperti virome, bacteriome, dan mycetobiome (lihat
Bab 3: Myc(et)obiome: Paman Besar dalam Keluarga) cenderung menjadi entitas yang terpisah untuk beberapa waktu. . Hal
ini disebabkan oleh kepraktisan: untuk semua jenis studi genomik dan postgenomik, kompleksitas kolektifnya terlalu besar,
sebuah fakta yang terlihat pada susunan panmikroba (Gardner dkk., 2010) pada saat genom mikroba hanya sedikit yang
telah diurutkan. Selain itu, terdapat banyak sumber daya yang dialokasikan untuk pendekatan metagenomik gen
konsensus, baik untuk bakteri maupun jamur, dan para pemangku kepentingan tidak akan melakukan apa pun dengan
membuang investasi tersebut atas nama keusangan atau redundansi. Tetap saja, pelan-pelan, banyak haladalahpasti akan
berubah. Di sektor genomik saja, pengembangan pengurutan jangka panjang (LRS) ke format yang lebih terjangkau dan
andal, baik yang menggabungkan priming yang tidak memihak atau dalam format yang tidak diprioritaskan, pada akhirnya
akan memungkinkan metagenomics dan metatranscriptomik shotgun dalam sampel lingkungan (dan, tentu saja, klinis). .
Kemajuan di bidang TI akan memungkinkan Big Data diproses dalam platform yang lebih ringkas dan terjangkau,
memungkinkan analisis skala mikrobiomik yang sebenarnya di bidang postgenomik (transkriptomik, metabolomik, dan
infeksi).
Pada saat yang sama, ketika generasi ahli mikrobiologi terspesialisasi saat ini (ahli mikologi, ahli virologi,
dll.) pensiun, bidang ini, dalam istilah profesional, akan diubah: pendekatan metodologis, konseptual, dan
teknologi baru memerlukan pelatihan khusus dan keterampilan khusus dan di sana tidak ada sumber daya
maupun keinginan untuk memperluas status spesialisasi saat ini, memperluas diferensiasi dan spesialisasi
saat ini dengan tingkat dan bidang tambahan. Oleh karena itu, generasi ahli mikrobiologi di masa depan
akan beralih ke basis yang lebih umum (Gambar 16.1) untuk menghilangkan pembelahan yang ada saat ini
dan mengatasi semua mikroba, tidak hanya beberapa taksa-Kerajaan, sementara spesialisasi dan
diferensiasinya akan bersifat fungsional (metabolisme, genetika/genomik) atau dalam hal metodologi dan
teknologi (spektrometri, asam nukleat, metode imunokimia). , pencitraan/mikroskopi), memajukan dampak
sebenarnya dari dimensi omics pertama (subseluler) dan ketiga (metodologis), dengan mengorbankan
dimensi kedua (Kambouris dkk., 2018).
364 BAB 16EPILOG

Saat ini Ahli bakteriologi

spesialisasi

Ahli ilmu jamur

Ahli virus

Masa depan Ahli bakteriologi Ahli genomik Ahli Metabolomik Ahli ekologi/ Penerjemah

spesialisasi — ahli interaksi

diperluas

Ahli ilmu jamur Ahli genomik Ahli Metabolomik Ahli ekologi/ Penerjemah
ahli interaksi
Ahli virus Ahli genomik Ahli Metabolomik Ahli ekologi/ Penerjemah
ahli interaksi
Masa depan Mikro biologi Ahli genomik Ahli metabolisme Ahli ekologi/ Penerjemah

spesialisasi—
ahli interaksi
dirombak

GAMBAR 16.1

Proyeksi perombakan indikatif spesialisasi mikrobiologi dalam konsep mikrobiologi.

REFERENSI
Aydin, C., 2017. Posthuman sebagai idola hampa: kritik Nietzschean terhadap peningkatan kualitas manusia. J.Med. Filsafat.
J: Forum Bioeth. Filsafat. medis. 42, 304-327.
Buchanan, A., 2009. Sifat dan peningkatan manusia. Bioetika 23, 141-150.
Cameron, EE, 2017. Risiko biologis bencana global yang muncul dan menyatu. Keamanan Kesehatan. 15,
337-338.
Fitzsimmons, CM, Falcone, FH, Dunne, DW, 2014. Alergen cacing, IgE spesifik parasit, dan pro-
peran tektif dalam kekebalan manusia. Depan. imunol. 5, 61.
Ford, TJ, Silver, PA, 2015. Biologi sintetik memperluas pengendalian kimia mikroorganisme. Saat ini. Pendapat.
kimia. biologi. 28, 20-28.
Gardner, SN, Jaing, CJ, McLoughlin, KS, Slezak, TR, 2010. Array deteksi mikroba (MDA) untuk virus
dan deteksi bakteri. Genomik BMC 11, 668-689.
Gasbarrini, G., Bonvicini, F., Gramenzi, A., 2016. Sejarah Probiotik. J.Klin. Gastroenterol. 50, S116-S119. Hager, CL,
Ghannoum, MA, 2017. Mycobiome: peran dalam kesehatan dan penyakit, dan sebagai probiotik potensial
sasaran penyakit gastrointestinal. Menggali. Hati. Dis. 49, 1171-1176.