KATA PENGANTAR
Ilmuwan mulai menggunakan jamur dan bakteri untuk degradasi xenobiotik
Senyawa organik menjelang pertengahan abad ke-20. Penggunaan
Bakteri menunjukkan hasil yang cepat dan menjanjikan, namun penelitian tentang evaluasi jamur
Telah tertinggal. Ini tidak berarti jamur itu tidak sesuai organisme
Atau fungsinya kurang memuaskan daripada bakteri dalam merendahkan senyawa tersebut.
Partisipasi jamur dalam bioremediasi sekarang sudah mapan
Di semua ekosistem.
Mycoremediation adalah salah satu area yang paling kompleks dalam remediasi terapan
teknik. Selama dua dekade terakhir, banyak ilmuwan jamur dan insinyur
Ingin mencoba menggunakan jamur dalam degradasi senyawa organik,
Dan bagi mereka yang mencoba menggunakannya, hasilnya bagus.
Penemuan nilai jamur putih membusuk dalam bioremediasi telah membawa
Kesuksesan yang lebih besar dan dengan demikian telah merangsang penelitian di seluruh dunia. Baru
Era dalam penggunaan teknologi jamur untuk degradasi senyawa organik
telah mulai. Dengan demikian, kebutuhan telah muncul untuk sebuah buku yang membahas tentang
Peran unik jamur dalam bioremediasi.
Keadaan sains yang digambarkan di sini merupakan karya perintis yang fokus
Di bidang baru dan menarik dari mikoremediasi. Buku itu berisi unsur
Dari semua disiplin ilmiah dan teknik yang dikenal secara global dan berbasis
Dasar yang kuat dalam subjek yang akan berfungsi untuk menghubungkan pengetahuan yang dikembangkan
Pada abad kedua puluh dan kedua puluh satu. Buku itu ensiklopedi
Dalam lingkup dan menyajikan berbagai jenis jamur dan jamur yang terkait
Proses yang digunakan untuk membersihkan limbah dan wastewaters di lingkungan yang terkontaminasi.
Buku ini mencakup aspek-aspek yang berkaitan dengan jamur degradatif, taksonomi, biokimia,
Enzim, rekayasa reaktor, rekayasa genetika, ekologi Biodegradasi, dan aplikasi praktis. Pengetahuan mengalir
dari
Mendasar untuk aspek praktis, sehingga berguna untuk belajar dan menerapkan bioremediasi
Secara holistik Buku ini tidak hanya berisi sintesis interwoven
Dan perspektif historis teknologi namun juga memberikan "slow release
Nutrisi "untuk penemuan dan batas baru untuk penelitian masa depan.
Jamur adalah salah satu organisme alami yang paling serbaguna dalam strukturnya,
Metabolisme, ekologi, dan genomik. Langkah pertama adalah memahami jamur
Morfologi, analisis dan pengukuran pertumbuhan, dan proses jamur
Biodegradasi (Bab 1). Tes imunologi dan molekuler dikoreksi
Sebagai alat baru untuk deteksi jamur degradatif. Bab 2 dan 3 penutup
Pengolahan berbagai macam limbah industri dan tempat pembuatan bir dan
Limbah penyulingan, fermentasi, bioreaktor, dan pemodelan bersamaan dengan
Kepentingan ekonomi. Selanjutnya, jalur metabolisme dan mekanisme
Mycotransformation dan mycodetoxifi kation dari minyak bumi hidrokarbon
(Bab 4), bifenil poliklorinat dan dioksin (Bab 5), dan pestisida
(Bab 6) dieksplorasi. Spektrum bioreaktor, mekanisme,
Dan faktor-faktor yang mempengaruhi mycotransformation, jalur metabolisme, dan metabolit
Fenol (Bab 7), hidrokarbon aromatik polisiklik (Bab 8),
Pulp dan serbuk kertas pabrik (Bab 9), dan pewarna (Bab 10) ditutupi
berikutnya. Peran enzim jamur dalam degradasi dan transformasi
Fenol, hidrokarbon aromatik polisiklik, lignin dan pabrik pulp dan kertas
Effl uents, dan pewarna dibahas secara rinci. Bab 11 berfokus pada properti,
Mekanisme yang terkait, dan aplikasi jamur hidup dan tidak hidup
Biomassa dalam biosorpsi logam. Peran jamur mikoriza dalam pengambilan
Logam beracun dan degradasi senyawa organik xenobiotik juga dibahas
(Bab 12). Metode untuk mengidentifikasi, memilih, dan menggunakan jamur dibahas
Secara holistik terkait dengan aplikasi mikoremediasi. Kemajuan terakhir
Dalam rekayasa genetik dan bioteknologi molekular yang akan berguna
Penciptaan jamur yang sesuai mampu mendetoksifikasi senyawa detoksifikasi lebih cepat
Juga dijelaskan. Namun, banyak masalah dan keterbatasan masih ada
Dan perlu diatasi.
Buku ini ditujukan untuk menjangkau khalayak luas, termasuk para manajer dan
Pemimpin dalam penelitian dan praktik mikoremediasi dan harus sangat
Berguna sebagai alat referensi untuk berlatih insinyur, ilmuwan, pengelola lokasi limbah,
Dan ahli regulasi. Ini juga akan memberikan informasi yang berguna bagi para ahli
Di bidang sekutu, seperti botani, mikologi, geologi, ekologi, biokimia jamur,
Genetika, enzim, teknik metabolik, mikrobiologi lingkungan,
Dan bioteknologi. Ini harus menjadi sumber terkemuka untuk lulusan dan
Mahasiswa sarjana tertarik untuk memahami kapasitas dan prosesnya
Biodegradasi jamur. Mahasiswa pascasarjana dapat melakukan eksperimen
Atau penelitian di laboratorium atau menerapkan jamur dalam bioremediasi pada saat terkontaminasi
Situs tanpa mencari panduan khusus. Pekerjaan juga akan berfungsi sebagai
Buku pegangan untuk pembuatan desain dan komponen baru untuk mikoremediasi
Proses. Instruktur akan menemukan bahwa mereka dapat mengajar kursus atau courserelated
Topik langsung dari buku, dan ceramah dapat dipersiapkan dalam a
Berbagai program studi, mulai dari latar belakang mendasar hingga studi kasus.
Referensi hampir 2000 dapat berfungsi sebagai template untuk subjek tertentu
Daerah yang terkait dengan mikoremediasi. Buku ini akan merangsang pemikiran dan lebih besar
Penelitian dalam konteks proses mikoremediasi yang lebih luas di masa datang
Dekade. Limbah berbahaya dan wastewaters merupakan masalah modern
Peradaban yang tidak akan hilang selama berabad-abad. Limbah dan wastewaters baru
Sedang dihasilkan setiap tahun dengan industrialisasi kita yang terus berkembang. Sehari akan
Datanglah saat jamur akan memainkan peran lebih besar dalam transformasi dan detoksifikasi
Limbah berbahaya dan air limbah dari pada saat ini.
Saya sangat berterima kasih kepada Dr. Steven C. McCutcheon atas bimbingannya yang berharga
Dan saran selama persiapan buku. Kredit khusus diberikan kepada saya
Istri, Dr. Julu Bhatnagar, yang memberikan wawasan tentang bioteknologi dan molekuler
Dan teknik imunologi untuk deteksi jamur degradatif sebagai
Serta berkontribusi pada disain sampulnya. Akhirnya, saya ingin mengungkapkan
Terima kasih yang tulus kepada Pak Nathan Wilson karena telah mengizinkan saya untuk menggunakan
fotonya
Dari Trametes versicolor (dari situs Web http://mushroomobserver.org) di
Sampul buku.
Penolakan
Buku ini ditulis oleh Harbhajan Singh dalam kapasitas pribadinya. Tidak ada yang istimewa
Dukungan atau pengesahan oleh Badan Perlindungan Lingkungan A.S. atau apapun
Badan pemerintah federal lainnya memang dimaksudkan atau harus disimpulkan.
Atlanta, Georgia Harbhajan Singh
PENGANTAR
Jamur adalah kelompok organisme yang beragam dan ada di mana-mana di lingkungan.
Mereka telah banyak berkontribusi terhadap pembentukan kesejahteraan manusia sejak
Awal peradaban. Kontribusi mereka berkisar dari alam hingga industri
menggunakan. Mereka bisa eksis dan bertahan di hampir setiap habitat. Jamur memainkan peran penting
Di semua ekosistem dan mampu mengatur aliran nutrisi dan
Energi melalui jaringan miselia mereka. Mereka mempengaruhi lingkungan di
Macroscale, meskipun dampaknya tetap tersembunyi dari dunia.
Jaringan miselium mereka mungkin mencakup beberapa hektar lapisan hutan, dan dengan demikian
Jamur dianggap sebagai insinyur ekosistem alami dan sejati (Lawton dan
Jones, 1995). Namun, kontribusi jamur seringkali terbengkalai
Profesional, insinyur, ilmuwan, dan masyarakat umum.
Jamur diyakini bertahan selama sekitar 5300 tahun (Haselwandter
Dan Ebner, 1994). Armillaria bulbosa dianggap sebagai yang terbesar dan
Organisme hidup terpanjang di dunia (Smith et al., 1992). Jamur bersifat mikroskopis
Organisme eukariotik yang menunjukkan pertumbuhan pada berbagai substrat dan
Mampu melanjutkan fungsinya hampir indefi nitely. Organisme ini,
Termasuk jamur, ragi, dan jamur ringan, adalah mikroorganisme yang unik
Yang bisa digunakan dalam remediasi limbah dan wastewaters.
Insinyur lingkungan hidup di seluruh dunia harus memecahkan masalah limbah
Dan wastewaters, dan jamur saprophytic famented lainnya dapat menurunkan senyawa
Mengalir dengan air limbah untuk menerima air dan dengan demikian berkontribusi
Pembersihan mereka Beberapa jamur, ragi, dan jamur sangat toleran terhadap ekstrem
Konsentrasi ion hidrogen di substrat dan dapat ditemukan dengan sangat
Asam atau sangat basa lingkungan. Jamur sangat plastik dan paling banyak
Sel jamur adalah totipoten, sehingga seluruh organisme dapat diregenerasi tidak hanya
Dari spora tapi juga dari fragmen hama.
1.1 BIODEGRADASI DAN BIODETERIORASI FUNGAL
Jamur diketahui mendegradasi, atau menyebabkan memburuk, berbagai macam bahan
Dan senyawa, proses yang dikenal sebagai mycodegradation dan mycodeterioration.
Aktivitas degradasi jamur telah dikenal di berbagai bidang
Situasi dimana mereka menghancurkan berbagai jenis kayu, kertas bekas, tekstil,
Plastik, kulit, dan elektroinsulasi dan berbagai bahan pembungkus (Tabel
1.1). Polyethylene, dengan berat molekul 4000 sampai 28.000, terdegradasi oleh
Budidaya Penicillium simplicissimum YK (Yamada-Onodera et al.,
2001), dan bioremediasi polietilena mungkin dilakukan di masa depan.
Enzim Mucor rouxii NRRL 1835 dan Aspergillus fleve telah diproduksi
Perubahan sifat mekanik dan berat polietilen sekali pakai
Tas (El-Shafei et al., 1998). Jamur putih membusuk juga efisien dalam polietilen
Degradasi (Iiyoshi et al., 1997). Aspergillus flvus dijajah dan
Jenis polimetil metakrilat chitosan-graft terdegradasi sebesar 45% selama 25 hari
Budidaya aerobik dalam penelitian oleh Harish Prashanth dkk. (2005). Phanerochaete
Chrysosporium menempel pada serat poliamida-6 dan mengurangi 50% dari
Massa molar polimer setelah 3 bulan (Klun et al., 2003). Dari 15 jenis
Jamur putih dan coklat, Resinicium bicolor terbukti paling banyak
Jamur efektif untuk detoksifikasi bahan karet ban bekas limbah
Sebelum devulcanisasi (Bredberg et al., 2002).
Jamur juga membantu dalam memburuknya beton. Spesies Fusarium
Berkontribusi terhadap hilangnya kalsium dan berat pada beton selama pemaparan (Gu
Et al., 1998). Peningkatan porositas semen dan kehilangan kekuatan lentur dengan
Pencucian kalsium rendah telah dikaitkan dengan asam yang diproduksi oleh Aspergillus
Niger dan Mycelia sterilia (Perfettini et al., 1991). Kontak langsung jamur
Miselia dengan permukaan semen tidak perlu. Jamur hitam seperti Phoma
Dan Alternaria berinteraksi dengan permukaan marmer dan menyebabkan fisik, kimiawi,
Dan kerusakan estetika (Diakumaku et al., 1995). Aureobasidium pullulans
Berkoloni pada polivinil klorida plasticized (pPVC) dalam waktu 25 sampai 40 minggu
Paparan (Webb et al., 2000). Tarik aureobasidium tumbuh utuh
Formulasi pPVC sebagai satu-satunya sumber karbon, mengeluarkan ekstraseluler
Esterase, dan menyebabkan penurunan berat lapisan bawah. Selain itu, konstruksi baru
Bahan yang dihasilkan dari bagian tanaman yang hancur sangat terancam oleh
Cetakannya
Keanekaragaman hayati jamur dari berbagai jenis bahan pustaka menjadi masalah
Di seluruh dunia. Pada periode 1919-1977, jamur berkepala milik 234
Spesies dari 84 genera diisolasi dari berbagai jenis bahan pustaka
(Zyska, 1997). Dua puluh lima tahun penelitian menyelidiki noda di atas kertas
Dibuat oleh jamur, dikenal sebagai foxing, telah dijelaskan (Arai, 2000). Sebuah budaya
Dari Rhizopus oryzae mengubah kertas limbah ke l (+) - asam laktat (Park et
Al., 2004). Jamur juga menyebabkan kerusakan pada lukisan dinding dan kemunduran
Artefak kayu Ada banyak literatur tentang pembusukan kayu dengan warna putih - dan
Jamur coklat-membusuk. Jamur juga telah diketahui menyerang kuno dan abad pertengahan
Permukaan kaca Trichophyton simii dan A. niger telah terbukti menyebabkan
Degradasi wol dalam media kultur cair (Shrivastava et al., 1996).
Kedua jamur tersebut menyebabkan penurunan berat badan pada wol dan pelepasan protein.
Beberapa
Spesies jamur juga diketahui menyerbu resin yang digunakan untuk merekatkan lensa bersama
Mikroskop dan instrumen optik lainnya. Fusarium moniliforme adalah
Mampu merendahkan asam deoksiribonukleat (DNA) ke dasar nukleat atau
Derivatif (Kruszewska et al., 2004).
1.2 BAGAIMANA BUNGA MENGHASILKAN AIR UNTUK TUMBUH DI AIR
Jamur filamen dapat menjajah substrat lembab seperti kayu dan lobang
Antarmuka air untuk tumbuh ke udara (Wosten et al., 1999). Schizophyllum
Komune mengurangi tegangan permukaan air sebelum keluar dari air
Fase untuk membentuk hifa udara atau badan buah. Tegangan permukaan hasil dari
Sekresi sejumlah besar hidrofobin ke dalam lingkungan berair
Yang membentuk protein amphipathic yang stabil di antarmuka air-udara. Di sebuah
Aliran kontinu medium cair, hifa jamur miselium, terutama
A. niger, mengarahkan kembali arahan mereka untuk tumbuh di hulu (Oh et al., 1997).
1.3 MUGFOLOGI FUNGAL, ANALISIS,
DAN PENGUKURAN PERTUMBUHAN
1.3.1 Morfologi jamur
Kerajaan jamur mewakili sekelompok organisme dengan berbagai macam
Struktur. Mayoritas jamur terdiri dari struktur vegetatif
Disebut miselia yang tumbuh dari tip mereka sebagai pohon bercabang biner (Viniegra-
Gonzalez et al., 1993). Mycelia adalah struktur unik seperti struktur tabung
Membentuk sistem bercabang dan anastomulan yang luas. Setiap miselium seperti a
Hutan, dimana pohon individu dikenal sebagai hypha. Hifa paling banyak
Jamur septate, namun kehadiran pori-pori melalui septa memungkinkan massa
(Yonni et al., 2004). Teknik ini digunakan pada berbagai media padat yang mengandung
Kandungan nitrogen rendah atau tinggi dan pada pewarna.
Secara umum, pertumbuhan jamur dalam kultur cair diukur dari segi kering
Berat dalam budaya stasioner atau kocok dalam 500 ml Erlenmeyer fl ask. SEBUAH
Metode cepat dan effisien telah dikembangkan untuk pengukuran pertumbuhan
Jamur yang tidak rata (Langvad, 1999). Pertumbuhan bisa diukur sangat effi -
Dengan mudah pada piring microtiter 96-well dan pembaca microplate. Pencacahan
Propagul jamur oleh unit pembentuk koloni (CFU) dipekerjakan secara rutin
Kation kuantisasi jamur (Bridge and Spooner, 2001).
Metode elektrokimia yang didasarkan pada voltametri siklik menunjukkan keempatnya
Fase pertumbuhan Fusarium solani (Subrahmanyam et al., 2000). Pertumbuhan
Kurva yang diperoleh cocok dengan metode pengukuran kering yang biasa
berat. Eksperimen juga menegaskan bahwa puncak anodik disebabkan oleh metabolit,
Bukan biomassa jamur. Perilaku sel hidup Saccharomyces
Cerevisiae dalam sistem voltametri dengan elektroda grafit menunjukkan
Hubungan antara arus puncak dan kurva pertumbuhan selama keseluruhan
Periode fermentasi (Ci et al., 1997). Tahap awal pertumbuhan, dari
Perkecambahan melalui pengembangan hyphal jamur ringan seperti Penicillium,
Phoma, dan Trichoderma, dapat dianalisis dengan flow cytometry
(Bradner dan Nevalainen, 2003).
1.4 TRANSFER MASSA, KINETIKA PERTUMBUHAN,
DAN BIOREAKTOR
Cendawan filamen adalah mikroorganisme terpenting untuk pengolahannya
Substrat padat Hal ini bisa disebabkan karena beragam kemampuan
Dan mode pertumbuhan hyphal. Perbedaan terbatas adalah model pertama yang bisa diprediksi
Perubahan panjang hyphal, percabangan, dan septa, berdasarkan mekanisme seluler
Diamati (Prosser dan Trinci, 1979). Sejak itu, beberapa model punya
Telah diusulkan untuk menjelaskan pertumbuhan hifa dengan pembesaran apikal dan bercabang.
Model ini telah dibagi menjadi dua kategori dan dijelaskan oleh
Nielsen (1992). Secara umum, model sel didasarkan pada mekanisme seluler
Diamati, dan model populasi mempertimbangkan sejumlah komponen intraselular
Dan reaksi. Berbagai pendekatan pemodelan diterapkan pada vegetatif
Pertumbuhan jamur. Ini termasuk empiris, mekanistik, deterministik, dan
Model stokastik
Bartnicki-Garcia dkk. (1989) mengusulkan sebuah model empiris untuk dideskripsikan
Pertumbuhan apikal dan hyphal morfogenesis secara kualitatif. Dua parameter utama
Digunakan: tingkat kenaikan luas sama dengan jumlah vesikula yang dilepaskan
Oleh pusat vesikel yang dipasok (VSC) per satuan waktu, dan laju linier
Perpindahan dari VSC. Georgiou dan Shuler (1986) menganggap difusi
Dari substrat dan biomassa di koloni dalam hal vegetatif, kompeten,
Conidiophore, dan spesies conidial. Model simulasi menyarankan proliferasi
Struktur pembeda karena keterbatasan perpindahan massa. Aynsley
Et al. (1990) mengembangkan model kinetik untuk pertumbuhan jamur miselium pada a
Budaya terendam. Nutrisi diserap secara merata, ditransformasikan menjadi dinding
Prekursor, dan diangkut ke ujung pertumbuhan, di mana mereka digunakan dalam
Proses perpanjangan Tidak ada pembatasan transfer massa yang diasumsikan di sini dan
Prekursor ditransformasikan pada tingkat konstan melalui kinetika Michaelis-Menten.
Mitchell dkk. (1991) mengusulkan model semimechanistik untuk pertumbuhan
Rhizopus oligosporus, sekresi glukoamilase pada media padat di mana ia berada
Berdifusi selama hidrolisis pati dan pelepasan glukosa. Glukosa
Diserap oleh miselium ditransformasikan menjadi biomassa melalui kinetika Monod.
Model matematis telah dikembangkan untuk pertumbuhan apikal, septasi, dan
Percabangan jamur miselium (Yang et al., 1992). Model ini didasarkan pada
Difusi dan produksi prekursor dinding untuk menggambarkan pertumbuhan tip dan septasi
(Deterministik) dan untuk proses percabangan (stochastic). Secara morfologi
Perkembangan miselia hingga pembentukan pelet berkorelasi dengan baik
Temuan eksperimental
Model mekanistik telah diturunkan yang mempertimbangkan perpindahan massa dan
Pertumbuhan hara pada jamur yang tidak beraturan sebelum bercabang (Lopez-Isunza et al.,
1997). Model ini mempertimbangkan difusi substrat dalam medium padat, serapan,
Dan pelepasan substrat di dinding oleh pembawa, dan pembentukan prekursor dinding
Untuk transportasi massal dengan difusi dan konveksi di dalam hifa. Baik
Korelasi kualitatif telah ditunjukkan antara simulasi model untuk a
Kisaran konsentrasi substrat dengan data eksperimen bila diukur
Nilai diameter hyphal dan panjang tabung kuman maksimum dipertimbangkan.
Cui dkk. (1998) menyajikan model matematis pertumbuhan jamur dan morfologi
Dalam fermentasi terendam. Model ini menjelaskan transfer oksigen,
Intensitas agitasi, tegangan oksigen terlarut, formasi ukuran pelet
Miselia, pecahan miselia dalam total biomassa, sumber karbohidrat
Konsumsi, dan pertumbuhan biomassa. Perbandingan simulasi dengan eksperimen
Data menunjukkan bahwa model tersebut dapat menggambarkan dengan baik periode jamur
Pertumbuhan dan morfologi. Variasi kekuatan tarik hyphal dengan waktu miliki
Telah dianggap dapat menyebabkan perbaikan pada model morfologi (Li
Et al., 2002). Sebuah model matematis telah dikembangkan yang menghubungkan
Sifat miselium jamur pada tingkat mikroskopik terhadap pertumbuhan dan fungsi
Pada makroskop (Boswell et al., 2003). Model ini didasarkan pada pergerakan
Dari tip hyphal dan translokasi substrat internal. Persamaan model
Adalah jenis hiperbolik-parabolik campuran dan penting bahwa massa
Dilestarikan dan dipelihara. Model ini dikalibrasi untuk Fusarium solani
Tumbuh pada media garam glukosa-mineral dan dipecahkan secara homogen
Dan lingkungan heterogen.
Sebuah model telah dibangun untuk menjelaskan pola koloni dan kolektif
Pertumbuhan hyphal jamur fusi (Matsuura, 2002). Model
Mempertimbangkan dua parameter eksternal, seperti tingkat nutrisi awal dan
Panjang langkah dari random random random, dan satu parameter internal, seperti
Frekuensi serapan hara. Model koloni menunjukkan awalan yang tidak teratur
Kation ramifikasi pada tingkat hara rendah, dengan pengurangan serapan hara