MAKALAH BIOTEKNOLOGI MOLEKULER

APLIKASI BIOTEKNOLOGI MOLEKULER DALAM BIDANG PERTANIAN

“PERAKITAN TANAMAN TAHAN SERANGGA MELALUI REKAYASA

GENETIK”

NAMA : AMALYAH FEBRYANTI

NIM : H311 10 265

JURUSAN KIMIA

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS HASANUDDIN

MAKASSAR

2013
 ABSTRAK

Pertumbuhan penduduk di Indonesia dan Negara-negara berkembang lainnya

mengalami peningkatan secara signifikan. Hal ini terlihat meningkatnya permintaan

pangan terutama bahan pokok yang saat ini pasokannya mulai menipis. Krisis pangan

menyebabkan peneliti berupaya untuk mengatasi masalah ini melalui pendekatan

bioteknologi molekuler dengan memproduksi tanaman transgenik dalam hal ini

tanaman yang resisten terhadap hama atau virus.

 DAFTAR ISI

Sampul………………………………………………………………………… 1

Abastrak………………………………………………………………………. 2

Daftar isi………………………………………………………………………. 3

BAB I Pendahuluan

Latar Belakang………………………………………………………………… 4

Rumusan Masalah……………………………………………………………... 5

BAB II Tinjauan Pustaka

Tinjauan Umum Bioteknologi Molekuler………….…………………………..

Rekayasa Genetika…………………………………………………………..…

Tanaman Transgenik…………………………………………………………...

Gen Ketahanan terhadap Serangga Hama……………………………………...

BAB III Penutup

Kesimpulan…………………………………………………………………….

DAFTAR PUSTAKA
 BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Pertumbuhan penduduk dunia khususnya di Negara maju seperti, Jerman,

Jepang, dan Italia menunjukkan angka yang sangat rendah. Disisi lain, Negara-negara

yang sedang berkembang tingkat pertumbuhan penduduknya relatif tinggi bahkan

diperkirakan mencapai lebih setengah milyar manusia Cina pada tahun 2030.

Demikian juga di Negara-negara seperti Pakistan dan India mnyumbangkan jumlah

penduduk yang cukup tinggi. Sementara Indonesia diproyeksikan mempunyai jumlah

penduduk sekitar 307 juta. Gambaran tersebut tentunya akan menjadi perhatian yang

serius bagi kita semua jika penduduk tersebut mengkonsumsi bahan pangan padi-

padian.

Pada tahun 1950-an hampir semua Negara di dunia baik kala itu berstatus

sebagai Negara masih belum maju dan maju hampir boleh dikatakan tidak mempunyai

masalah tentang pangan mereka. Bahkan Indonesia pada tahun 1984-an Negara kita

swasembada pangan. Demikian juga pada tahun 1990-an ada beberapa Negara

mengalami kekurangan pangan walaupun nampaknya kekurangan pangan tersebut

terkonsentrasi di Negara-negara Asia (Misal; India,China,Banglades) dan Negara-

negara Afrika. Kelanjutan akan difisit pangan dunia tersebut, nampaknya akan tetap

berlanjut pada tahun 2030, sehingga antisipasi tentang hal itu harus sedini mungkin

diantisipasi secara positif. Hal ini tidak boleh hanya menyangkut departemen

pertanian yang harus bertanggungjawab. Karena usaha peningkatan produksi padi-

padian tidak akan berarti apa-apa manakala laju pertumbuhan penduduk tidak dapat
dikendalikan (diatur) dengan baik. Ini berarti jumlah penduduk harus tumbuh, tetapi

dalam presentase (%) yang tidak mengkhawatirkan.

Dengan demikian usaha-usaha nyata untuk meningkatkan kualitas manusia

Indonesia dari sisi pendidikan dan kesehatan juga harus dilakukan secara bersama-

sama dengan sektor atau bidang-bidang yang lain.Untuk mengatasi kemungkinan

terjadinya krisis pangan dikarenakan jumlah penduduk yang akan meningkat dimasa

datang, maka keluarga berencana akan menjadi salah satu alternatif yang cukup

menjanjikan untuk membantu mengatasinya. Tetapi apabila usaha peningkatan

kuantitas dan kualitas produk padi-padian mengalami kendala misalnya timbul

penyakit yang sulit di basmi, seperti virus, maka kita sebaiknya tidak alergi untuk

turut serta menerapkan penerapan bioteknologi modern/ molekuler, disamping cara-

cara klasik juga perlu terus dikembngkan.

1.2 Rumusan Masalah

1. Bagaimana definisi bioteknologi molekuler?

2. Bagaimana definisi rekayasa genetik dan tanaman transgenik?

3. Bagaimana teknik rekayasa genetik untuk menghasilkan tanaman transgenik?

 BAB II

TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Bioteknologi Molekuler

Pada tahun 1981, Federasi Bioteknologi Eropa mendefinisikan bioteknologi

sebagai berikut, bioteknologi adalah aplikasi terpadu biokimia,mikrobiologi, dan

rekayasa kimiadengan tujuan untuk mendapatkan aplikasi teknologi dengan kapasutas

biakan mikroba, sel, atau jaringan di bidang industri, kesehatan, dan pertanian.

Sedangkan menurut Sardjoko (1991), boteknologi didefinisikan sebagai proses-proses

biologi oleh mikroorganisme yang dimanfaatkan oleh dan untuk kepentingan manusia.

Definisi bioteknologi yang lebih luas dinyatakan oleh Bul,et,al, (1982), yaitu

penerapan prinsip-prinsip ilmiah dan rekayasa pengolahan bahan oleh agen-agen

biologi seperti mokroorganisme, sel tumbuhan, sel hewan, manusia, dan enzim untuk

menghasilkan barang dan jasa. Pada tahun 1981, Federasi Bioteknologi Eropa

mendefinisikan bioteknologi sebagai berikut, bioteknologi adalah aplikasi terpadu

biokimia,mikrobiologi, dan rekayasa kimiadengan tujuan untuk mendapatkan aplikasi

teknologi dengan kapasutas biakan mikroba, sel, atau jaringan di bidang industri,

kesehatan, dan pertanian. Sedangkan menurut Sardjoko (1991), boteknologi

didefinisikan sebagai proses-proses biologi oleh mikroorganisme yang dimanfaatkan

oleh dan untuk kepentingan manusia.

Definisi bioteknologi yang lebih luas dinyatakan oleh Bul,et,al, (1982), yaitu

penerapan prinsip-prinsip ilmiah dan rekayasa pengolahan bahan oleh agen-agen

biologi seperti mokroorganisme, sel tumbuhan, sel hewan, manusia, dan enzim untuk

menghasilkan barang dan jasa.

 Pada tahun 1953 ditemukan struktur DNA oleh Watson dan Crick dan tahun

1966 dipecahkannya kode-kode genetik, oleh Rossenberg serta telah diketahuinya

proses transkripsi dan translasi. Sedangkan pada tahun 1970 ditemukan enzim restriksi

endonuklease (enzim pemotong gen), enzim ligase (enzim penyambung gen) dan

disusul pada tahun 1973 ditemukan metode DNA rekombinan atau rekayasa genetika

mengawali babak baru bioteknologi modern. Bioteknologi modern dikembangkan

dengan teknologhi rekayasa genetika pada agen-agen biologi tingkat molekuler. Yang

menjadi sasaran bioteknologi modern dengan teknologi rekayasa genetika adalah

seluruh aspek kehidupan mulai dari makanan, kedokteran, pertanian, peternakan,

pertambangan dan penanggulangan pencemaran lingkungan.

2.2 Rekayasa Genetik

Rekayasa genetika adalah suatu proses manipulasi gen yang bertujuan untuk

mendapatkan organisme yang unggul. Manipulasi gen dapat dilakukan dengan teknik

invitro dan invivo. Di Inggris manipulasi gen diartikan sebagai pembentukan

kombinasi baru materi yang dapat diturunkan dengan penyisipan (insertion) molekul-

molekul asam nukleat, yang dihasilkan dengan cara apapun diluar sel, ke dalam suatu

virus, plasmid bakteri atau sistem pembawa lainnya yang memungkinkan terjadinya

penggabungan ke dalam organisme inang selanjutnya mampu melakukan

penggandaan lagi. Teknik-teknik manipulasi gen secara invitro adalah tranformasi

Escchercia coli, pemotongan dan penggabungana molekul-molekul DNA, serta

pemotongan reaksi-reaksi pemotongan dan penggabungan.

Transfer DNA atau perpindahan DNA ke dalam bakteri dapat melalui tiga

cara, yaitu konjugasi, transformasi, dan transduksi. DNA yang masuk ke dalam sel

bakteri selanjutnya dapat berintegrasi dengan DNA atau kromosom bakteri sehingga
terbentuk kromosom rekombinan. Konjugasi merupakan perpindahan DNA dari satu

sel (sel donor) ke dalam sel bakteri lainnya (sel resepien) melalui kontak fisik antara

kedua sel. Sel donor memasukkan sebagian DNA-nya ke dalam sel resepien. Transfer

DNA ini melalui pili seks yang dimiliki oleh sel donor. Sel resepien tidak memiliki

pili seks. DNA dari sel resepie berpindah ke sel resipien secara replikatif sehingga

setelah proses ini selesai, sel jantan tidak kehilangan DNA. Ke dua sel tidak

mengalami peningkatan jumlah sel dan tidak dihasilkan sel anak. Oleh karena itu,

proses konjugasi disebut juga sebagai proses atau mekanisme seksual yang tidak

reproduktif.

Gambar 1. Proses konjugasi

Gambar 2. Proses konjugasi yang menyebabkan resistensi pada plasmid

 Transformasi merupakan pengambilan DNA oleh bakteri dari lingkungan di

sekelilingnya. DNA yang berada di sekitar bakteri (DNA asing) dapat berupa

potongan DNA atau fragmen DNA yang berasal dari sel bakteri yang lain atau

organisme yang lain. Masuknya DNA dari lingkungan ke dalam sel bakteri ini dapat

terjadi secara alami. Pada tahun 1928 ditemukan strain bakteri yang tidak virulen

dapat berubah sifatnya menjadi virulen disebabkan adanya strain yang tidak virulen

dicampur dengan sel-sel bakteri strain virulen yang telah dimatikan. Tahun 1944

ditemukan bahwa perubahan sifat atau transformasi dari bakteri yang tidak virulen

menjadi virulen disebabkan oleh adanya DNA dari sel bakteri strain virulen yang

masuk ke dalam bakteri strain yang tidak virulen.

Gambar 3. Proses transformasi

Gambar 4. Proses transformasi pada bakteri

 Transduksi adalah cara pemindahan DNA dari satu sel ke dalam sel lainnya

melalui perantaraan bakteriofage. Beberapa jenis virus berkembang biak di dalam sel

bakteri. Virus-virus yang inangnya adalah bakteri sering disebut bakteriofag atau fage.

Ketika virus menginfeksi bakteri, fage memasukkan DNA-nya ke dalam sel bakteri.

DNA tersebut kemudian akan bereplikasi di dalam sel bakteri atau berintegrasi dengan

kromosom baketri. DNA fage yang dikemas ketika membentuk partikel fage baru

akan membawa sebagian DNA bakteri yang menjadi inangnya. Selanjutnya jika fage

tersebut menginfeksi bakteri yang lain, maka fage akan memasukkan DNAnya yang

sebagian mengandung DNA sel inang sebelumnya. Jadi,

secara alami fage memindahkan DNA dari satu sle bakteri ke bakteri yang lain.

Transduksi adalah cara pemindahan DNA dari satu sel ke dalam sel lainnya melalui

perantaraan bakteriofage. Beberapa jenis virus berkembang biak di dalam sel bakteri.

Virus-virus yang inangnya adalah bakteri sering disebut bakteriofag atau fage. Ketika

virus menginfeksi bakteri, fage memasukkan DNA-nya ke dalam sel bakteri. DNA

tersebut kemudian akan bereplikasi di dalam sel bakteri atau berintegrasi dengan

kromosom baketri. DNA fage yang dikemas ketika membentuk partikel fage baru

akan membawa sebagian DNA bakteri yang menjadi inangnya. Selanjutnya jika fage

tersebut menginfeksi bakteri yang lain, maka fage akan memasukkan DNAnya yang

sebagian mengandung DNA sel inang sebelumnya. Jadi, secara alami fage

memindahkan DNA dari satu sle bakteri ke bakteri yang lain.

Gambar 5. Proses transduksi pada bakteri

 Adapun perangkat yang digunakan dalam teknik DNA rekombinan diantaranya

enzim restriksi untuk memotong DNA, enzim ligase untuk menyambung DNA dan

vektor untuk menyambung dan mengklonkan gen di dalam sel hidup, transposon

sebagai alat untuk melakukan mutagenesis dan untuk menyisipkan penanda, pustaka

genom untuk menyimpan gen atau fragmen DNA yang telah diklonkan, enzim

transkripsi balik untuk membuat DNA berdasarkan RNA, pelacak DNA atau RNA

untuk mendeteksi gen atau fragmen DNA yang diinginkan atau untuk mendeteksi klon

yang benar. Vektor yang sering digunakan diantarnya plasmid, kosmid dan

bakteriofag.

Gambar 6. Plasmid bakteri sebagai vektor

Enzim restriksi digunakan untuk memotong DNA. Enzim mengenal dan

memotong DNA pada sekuens spesifik yang panjangnya empat sampai enam pasang

basa. Enzim tersebut dikenal dengan nama enzim endonuklease restriksi. Berikut ini

adalah macam-macam enzim endonuklease restriksi.

Tabel 1. Enzim restriksi yang sering digunakan pada proses rekombinasi DNA

Enzyme Source Recognition Cut

Sequence
EcoRI Escherichia coli 5'GAATTC 5'---G AATTC---3'
3'CTTAAG 3'---CTTAA G---5'
EcoRII Escherichia coli 5'CCWGG 5'--- CCWGG---3'
3'GGWCC 3'---GGWCC ---5'
BamHI Bacillus 5'GGATCC 5'---G GATCC--- 3'
Amyloliquefaciens 3'CCTAGG 3'---CCTAG G--- 5'
HindIII Haemophilus 5'AAGCTT 5'---A AGCTT---3'
Influenza 3'TTCGAA 3'---TTCGA A---5'
TaqI Thermus 5'TCGA 5'---T CGA---3'
aquaticusThermus 3'AGCT 3'---AGC T---5'
aquaticus
NotI Nocardia otitidis 5'GCGGCCGC 5'---GC GGCCGC-
3'CGCCGGCG --3'
3'---CGCCGG CG-
--5'
HinfI Haemophilus 5'GGCC 5'---GG CC---3'
Influenza 3'CCGG 3'---CC GG---5'
Sau3A Staphylococcus 5'GATC 5'--- GATC---3'
aureus 3'CTAG 3'---CTAG ---5'
PovII* Proteus vulgaris 5'CAGCTG 5'---CAG CTG---3'
3'GTCGAC 3'---GTC GAC---5'
SmaI* Serratia marcescens 5'CCCGGG 5'---CCC GGG---3'
3'GGGCCC 3'---GGG CCC---5'
HaeIII* Haemophilus 5'GGCC 5'---GG CC---3'
Aegyptius 3'CCGG 3'---CC GG---5'
HgaI[33] Haemophilus 5'GACGC 5'---NN NN---3'
Gallinarum 3'CTGCG 3'---NN NN---5'
AluI* Arthrobacter luteus 5'AGCT 5'---AG CT---3'
3'TCGA 3'---TC GA---5'
EcoRV* Escherichia coli 5'GATATC 5'---GAT ATC---3'
3'CTATAG 3'---CTA TAG---5'
EcoP15I Escherichia coli 5'CAGCAGN25NN 5'---
3'GTCGTCN25NN CAGCAGN25NN --
-3'
3'---GTCGTCN25
KpnI[34] Klebsiella 5'GGTACC 5'---GGTAC C---3'
pneumonia 3'CCATGG 3'---C CATGG---5'
PstI[34] Providencia stuartii 5'CTGCAG 5'---CTGCA G---3'
3'GACGTC 3'---G ACGTC---5'
SacI[34] Streptomyces 5'GAGCTC 5'---GAGCT C---3'
Achromogenes 3'CTCGAG 3'---C TCGAG---5'
SalI[34] Streptomyces albus 5'GTCGAC 5'---G TCGAC---3'
3'CAGCTG 3'---CAGCT G---5'
ScaI[34] Streptomyces 5'AGTACT 5'---AGT ACT---3'
Caespitosus 3'TCATGA 3'---TCA TGA---5'
SpeI Sphaerotilus natans 5'ACTAGT 5'---A CTAGT---3'
3'TGATCA 3'---TGATC A---5'
SphI[34] Streptomyces 5'GCATGC 5'---G CATGC---3'
Phaeochromogenes 3'CGTACG 3'---CGTAC G---5'
StuI[35][36] Streptomyces 5'AGGCCT 5'---AGG CCT---3'
Tubercidicus 3'TCCGGA 3'---TCC GGA---5'
XbaI[34] Xanthomonas badrii 5'TCTAGA 5'---T CTAGA---3'
3'AGATCT 3'---AGATC T---5'

Ada beberapa bagian terpenting yang selalu digunakan dalam rekayasa genetika.Yang

pertama adalah enzim seluler dan yang kedua adalah vektor. Hal tersebut akan dibahas

sebagai berikut:

Enzim seluler

Enzim yang dipakai oleh orang-orang bioteknologi dalam memanipulasi DNA

diantaranya adalah enzim Endonuklease, yaitu enzim yang mengenali batas-batas

sekuen nukleotida spesifik dan berfungsi dalam proses restriction atau pemotongan

bahan-bahan genetik. Penggunaan enzim ini yang paling umum antara lain pada

sekuen palindromik. Enzim ini dibentuk dari bakteri yang dibuat sedemikian rupa

sehingga dapat menahan penyusupan DNA, seperti genom bacteriophage.Ada juga

DNA polimerisasi, yaitu enzim yang biasa dipakai untuk meng-copy DNA. Enzim ini

mengsintesis DNA dari sel induknya dan membentuk DNA yang sama persis ke sel

induk barunya. Enzim ini juga bisa didapatkan dari berbagai jenis organisme, yang

tidak mengherankan, karena semua organisme pasti harus meng-copy DNA mereka.

Selain DNA polimerisasi, ada juga enzim RNA polimerisasi yang berfungsi untuk

’membaca’ sekuen DNA dan mengsintesis molekul RNA komplementer.

Seperti halnya DNA polimerisasi, RNA polimerisasi juga banyak ditemukan

banyak organisme karena semua organisme harus ’merekam’ gennya.Selanjutnya

yang akan dibahas adalah enzim DNA ligase. Enzim DNA ligase merupakan suatu

enzim yang berfungsi untuk menyambungkan suatu bahan genetik dengan bahan

genetik yang lain. Contohnya saja, enzim DNA ligase ini dapat bergabung dengan

DNA (atau RNA) dan membentuk ikatan phosphodiester baru antara DNA (atau
RNA) yang satu dengan lainnya.Kemudian, ada pula enzim reverse transcriptases

yang berfungsi membentuk blue-print dari molekul RNA membentuk cDNA (DNA

komplementer). Enzim ini dibuat dari virus RNA yang mengubah genom RNA virus

menjadi DNA ketika virus menginfeksi inangnya. Enzim ini biasa dipakai ketika

bertemu dengan gen eukariotik yang biasanya terpisah-pisah menjadi potongan kecil

dan dipisahkan oleh introns dalam kromosom.

Vektor Natural

Sebagai salah satu cara untuk memanipulasi DNA di luar sel, para ilmuwan dalam

bioteknologi harus bisa membuat suatu tempat yang keadaannya stabil dan cocok

dengan tempat DNA yang dimanipulasi. Sekali lagi, alam telah memberikan solusi

dari masalah ini. Vektor disini bisa diartikan sebagai alat yang membawa DNA ke

dalam sel induk barunya. Agar suatu metode dalam rekayasa genetika dianggap

berhasil, di dalam vektor, DNA hasil rekombinan seharusnya benar-benar hanya

dibawa setelah sebelumnya DNA rekombinan digabungkan dengan DNA vektor

melalui enzim ligase. Namun di dalam vektor, DNA rekombinan tidak termutasi lagi

membentuk DNA dengan sifat baru. Contoh dari vektor natural dari alam adalah

plasmid dan virus atau bacteriophage.

Manfaat teknologi rekombinan DNA

Aplikasi teknik DNA rekombinan dalam bioteknologi diantaranya adalah produksi

vaksin, insulin, antibodi dan sebagainya. Misalkan saja insulin yang digunakan untuk

mengatasi diabetes diproduksi dengan menggunakan teknik DNA rekombinan. Gen

insulin yang berasal dari sapi kemudian ditentukan urutan DNA-nya setelah itu

direkombinasikan di dalam suatu vektor misal plasmid kemu dian dimasukan dalam

sel bakteri. Selanjutnya bakteri ini mengalami transformasi dan bisa menghasilkan
insulin. Ini adalah salah satu contoh aplikasi teknik DNA rekombinan dalam

bioteknologi. Beberapa produk DNA rekombinan yang digunakan dalam terapi

manusia, diantaranya :

 Insulin untuk penderita diabetes

 Faktor VIII untuk laki-laki menderita hemofilia a

 Faktor IX untuk hemofilia b

 Hormon pertumbuhan manusia (hgh)

 Erythropoietin (epo) untuk mengobati anemia

 Beberapa jenis interferon

 Beberapa interleukin

 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (gm-csf) untuk menstimulasi

sumsum tulang setelah transplantasi sumsum tulang

 Granulocyte koloni-stimulating factor (g-csf) untuk merangsang neutrofil

produksi, misalnya, setelah kemoterapi dan untuk memobilisasi sel induk

hematopoietik dari sumsum tulang ke dalam darah.

 Aktivator plasminogen jaringan (tpa) untuk melarutkan gumpalan darah

 Adenosin deaminase (ada) untuk mengobati beberapa bentuk severe combined

immunodeficiency (scid)

 Hormon paratiroid

 Beberapa antibodi monoclonal

 Antigen permukaan hepatitis B untuk vaksinasi terhadap virus hepatitis B

 C1 inhibitor (c1inh) digunakan untuk mengobati edema angioneurotic turun-

temurun. severe combined immunodeficiency (scid)

2.3 Tanaman Transgenik

Tanaman transgenik adalah merupakan aplikasi bioteknologi pada tanaman

yang telah direkayasa bentuk maupun kualitasnya melalui penyisipan gen atau DNA

binatang, bakteri, mikroba, atau virus untuk tujuan tertentu. Organisme transgenik

adalah organisme yang mendapatkan pindahan gen dari organisme lain.

Gen yang ditransfer dapat berasal dari jenis (spesies) lain seperti bakteri, virus,

hewan, atau tanaman lain. Untuk membuat suatu tanaman transgenik, pertama-tama

dilakukan identifikasi atau pencarian gen yang akan menghasilkan sifat tertentu (sifat

yang diinginkan). Gen yang diinginkan dapat diambil dari tanaman lain, hewan,

cendawan, atau bakteri. Setelah gen yang diinginkan didapat maka dilakukan

perbanyakan gen yang disebut dengan istilah kloning gen. Pada tahapan kloning gen,

DNA asing akan dimasukkan ke dalam vektor kloning (agen pembawa DNA),

contohnya plasmid (DNA yang digunakan untuk transfer gen).Kemudian, vektor

kloning akan dimasukkan ke dalam bakteri sehingga DNA dapat diperbanyak seiring

dengan perkembangbiakan bakteri tersebut. Apabila gen yang diinginkan telah

diperbanyak dalam jumlah yang cukup maka akan dilakukan transfer gen asing

tersebut ke dalam sel tumbuhan yang berasal dari bagian tertentu, salah satunya adalah

bagian daun.

Teknologi transfer gen dibedakan menjadi dua, yaitu langsung dan tidak

langsung (Herman, 1996). Contoh transfer gen secara langsung adalah penembakan

eksplan gen dengan gene gun atau divortex dengan silicon carbide (karbid silikon) dan

perlakuan pada protoplas tanaman dengan elektroporasi atau dengan polyethylene

glycol (PEG). Sedangkan transfer gen secara tidak langsung adalah melalui vector

Agrobacterium.

Transfer gen secara langsung

Penembakan Partikel

Metode ini sering digunakan pada spesies jagung dan padi.Untuk melakukannya,

digunakan senjata yang dapat menembakkan mikro-proyektil berkecepatan tinggi ke

dalam sel tanaman. Mikro-proyektil tersebut akan mengantarkan DNA untuk masuk

ke dalam sel tanaman. Penggunaan senjata gen memberikan hasil yang bersih dan

aman, meskipun ada kemungkinan terjadi kerusakan sel selama penembakan

berlangsung. Teknik paling modern dalam transformasi tanaman adalah penggunaan

metode penembakan partikel atau gene gun. Metode transfer gen ini dioperasikan

secara fisik dengan menembakkan partikel DNA-coated langsung ke sel atau jaringan

tanaman (Klein et al., 1988). Dengan cara demikian, partikel dan DNA yang

ditambahkan menembus dinding sel dan membran, kemudian DNA melarut dan

tersebar dalam sel secara independen. Telah didemonstrasikan bahwa teknik ini efektif

untuk mentransfer gen pada bermacam-macam eksplan. Penggunaan penembakan

partikel membuka peluang dan kemungkinan lebih mudah dalam memproduksi

tanaman transgenik dari berbagai spesies yang sebelumnya sukar ditransformasi

dengan Agrobacterium, khususnya tanaman monokotil seperti padi, jagung, dan

turfgrass.
 Tahap Metode Penembakan

Karbid silikon

Metode transfer gen lain yang kurang umum digunakan dalam transformasi tanaman

tetapi telah dilaporkan berhasil mentransformasi jagung dan turfgraas adalah

penggunaan karbid silikon. Suspensi sel tanaman yang akan ditransformasi dicampur

dengan serat karbid silikon dan DNA plasmid dari gen yang diinginkan dimasukkan

ke dalam tabung Eppendorf kemudian dilakukan pencampuran dan pemutaran dengan

vortex (Kaeppler et al., 1990). Serat silicon carbide berfungsi sebagai jarum injeksi

mikro (microinjection) untuk memudahkan transfer DNA ke dalam sel tanaman.

Elektroporasi

Metode transfer DNA yang umum digunakan pada tanaman monokotil adalah

elektroporasi dari protoplas, perlakuan poly-ethylene glycol (PEG) pada protoplas dan

kombinasi antara dua perlakuan tersebut (Joersbo dan Brunstedt, 1991). PEG

memudahkan presipitasi DNA dan membuat kontak lebih baik dengan protoplas, juga

melindungi DNA plasmid mengalami degradasi dari enzim nuclease (Mass dan Werr,
1989). Sedangkan elektroporasi dengan perlakuan listrik voltase tinggi menyebabkan

permiabilitas tinggi untuk sementara pada membran sel dengan membentuk pori-pori

sehingga DNA mudah penetrasi ke dalam protoplas. Integritas membran kembali

membaik seperti semula dalam beberapa detik sampai semenit setelah perlakuan

listrik. Jagung dan padi telah berhasil ditransformasi melalui elektroporasi dengan

efisiensi antara 0,1-1%. Kelemahan penggunaan protoplas sebagai explant untuk

transformasi adalah sulitnya regenerasi dari protoplas, dan ekstra komplikasi, serta

variasi somaklonal akibat panjangnya periode kultur.

Tahap elektroporasi berikutnya, yaitu dikejutkan dengan listrik tegangan tinggi

melalui larutan yang mengandung protoplas. Kejutan listrik ini menyebabkan

membran untuk sementara tidak stabil dengan membentuk pori-pori kecil. Melalui

pori-pori sementara ini, DNA gen donor dapat disuntikkan. DNA diinjeksikan dalam

bentuk transfer plasmid yang dipindahkan ke kromosom dan menjadi satu dalam DNA

tanaman. Tidak lama setelah pemberian kejutan listrik dan injeksi, sel membran

terbentuk kembali. Dinding sel juga terbentuk kembali melalui proses pembalikan.

Sel-sel yang baru saja diubah tersebut kemudian dikultur untuk menghasilkan jenis sel

yang unik yang membentuk organisme. Sel-sel yang dihasilkan kemudian dipindahkan

ke dalam lingkungan pertumbuhan biasa di mana gen baru akan diekspresikan.

Pada proses elektroporasi ini, dimana enzim khusus pendenaturasi dinding

sel melepaskan dinding sel dari selnya. Kemudian sel-sel akan menjadi protoplas,

yaitu sel-sel tumbuhan yang dilucut dinding selnya tetapi masih dilapisi membran

selular.

Transfer gen secara tidak langsung

Dari banyak teknik transfer gen yang berkembang, teknik melalui media vektor

Agrobacterium tumefaciens paling sering digunakan untuk mentransformasi tanaman

dikotil. A. tumefaciens mampu mentransfer gen ke dalam genom tanaman melalui

eksplan baik yang berupa potongan daun (leaf discs) atau bagian lain dari jaringan

tanaman yang mempunyai potensi beregenerasi beregenerasi tinggi (Hinchee et al.,

1988; Mullins et al., 1990). Gen yang ditransfer terletak pada plasmid Ti (tumor

inducing). Segmen spesifik DNA plasmid Ti disebut DNA T (transfer DNA) yang

berpindah dari bakteri ke inti sel tanaman dan berintegrasi ke dalam genom tanaman.

Karena A. tumefaciens merupakan patogen tanaman maka Agrobacterium sebagai

vektor yang digunakan untuk transformasi tanaman adalah bakteri dari jenis plasmid

Ti yang dilucuti virulen-sinya (disarmed), sehingga sel ta-naman yang ditransformasi

oleh Agrobacterium dan yang mampu beregenerasi akan membentuk suatu tanaman

sehat hasil rekayasa genetik. Tanaman tersebut akan menurunkan DNA T yang

disarmed dan gen asing (dari sifat yang diinginkan) ke keturunannya. Teknik

transformasi melalui media vector Agrobacterium pada tanaman dikotil telah berhasil

tetapi sebaliknya tidak umum digunakan pada tanaman monokotil. Meskipun

demikian, beberapa peneliti melaporkan bahwa beberapa strain Agrobacterium

berhasil mentransformasi tanaman monokotil seperti jagung dan padi.

Ti Plasmid  adalah vektor alamiah yang digunakan untuk mentransfer DNA ke

dalam sel tanaman. Bakteri yang membawa plasmid Ti (contohnya Agrobacterium

tumefaciens) dapat menyebabkan tumor pada tanaman yang disebut crown gall,

terutama tanaman dikotil. Pada sebagian besar plasmid Ti, terdapat lima kompleks

gen, yaitu T-DNA (bagian yang ditransfer dan menyatu dengan genom tanaman), gen

virulen (vir) yang terdiri dari 50 kilo basa untuk mengatur proses transfer T-DNA ke
dalam DNA tanaman, gen tra/trb yang mengatur perpindahan plasmid Ti antarbakteri,

bagian yang mengatur sistem replikasi plasmid, dan bagian gen yang menyandikan

molekul opin. Molekul opin ini akan dihasilkan oleh jaringan tanaman yang terinfeksi

bakteri pembawa Ti plasmid . Ti Plasmid dapat digunakan dalam pembuatan Tanaman

Transgenik  berikut ini tahapan pembuatan tanaman transgenik :

Proses transfer gen secara lengkap :

1) Melakukan skuensing pada DNA untuk gen yang akan diubah diidentifikasi

dan diperoleh dari organisme donor (bakteri). Skuensing ini dapat

dilakukan dengan mengacu pada informasi yang diketahui berkaitan dengan

urutan dari gen yang akan dipilih. Selanjutnya diikuti dengan pemindahan gen

dari organisme donor. Gen yang diinginkan dikeluarkan dari organisme donor

melalui penggunaan enzim spesifik yang dikenal sebagai enzim restriksi.

2) Gen yang diinginkan kemudian dipolimer melalaui polimerase chain

reaction (PCR), yaitu metode untuk memperkuat DNA dan menghasilkan

sejumlah gen yang bisa diterapkan.

3) Setelah diperoleh, ada beberapa cara untuk mentransfer gen donor ke dalam sel

organisme target. Pada beras, digunakan proses yang lebih canggih.

 Metode Transfer Gen melalui Bakteri

1. Ekstraksi  DNA dari plasmid Agrobacterium tumafaciens menggunakan

teknik PCR (polymerase chain reaction). Pemotongan dan

penggabungan/penyisipan  DNA yang dipilih melibatkan enzim restriksi dan

ligase.

2. Pengklonan gen oleh bacteria vektor sehingga dihasilkan  DNA yang

diharapkan kemudian klon gen Agrobacterium tumafaciens

diintroduksi/ditransformasi  ke dalam kultur sel tumbuhan.

3. Multifikasi dan regenerasi bagian-bagian tumbuhan sehingga terbentuk 

tumbuhan dengan sifat yang baru berikut gambar lain yang bisa mendukung

pemahaman tahapan pembentukan tanaman transgenik. 

 Bakteri dan Proses Perakitan Tanaman Transgenik secara Lengkap

2.4 Gen Ketahanan terhadap Serangga Hama

Gen ketahanan terhadap serangga hama dan sumbernya disajikan pada Tabel 1.

Sebagian dari gen tersebut akan diuraikan dalam makalah ini dengan fokus uraian ke

gen Bt. Sebagian besar penelitian transformasi untuk memproduksi tanaman tahan

serangga difokus-kan pada protein yang mengan-dung kode gen tunggal, seperti Bt

endotoxins (Cheng et al., 1992), proteinase inhibitor (Hilder et al., 1993; Johnson et

al., 1989; Ryan, 1990), cowpea trypsin inhibitor (Hoffman et al., 1993), pea seed

lectin (Gatehouse et al., 1991), snow drop lectin (Rao et al., 1999), amylose inhibitor

(Ishimoto et al., 1996 Schroeder et al., 1995; Shade et al., 1994). Protein dengan kode

gen tunggal lebih mudah diintroduksi ke dalam tanaman.

Gen Bt

Gen Bt adalah hasil isolasi bakteri tanah B. thuringiensis dan telah digunakan oleh

petani di Negara maju sebagai pestisida hayati yang aman sejak puluhan tahun yang
lalu (Shadduck, 1983; McClintock et al., 1995). Istilah populer cry (Held et al., 1982)

merupakan singkatan dari crystal sebagai representasi gen dari strain Bt yang

memproduksi protein kristal yang bekerja seperti insektisida (insecticidal crystal

protein) yang dapat mematikan serangga hama (MacIntosh et al., 1990). Sampai saat

ini, telah diisolasi gen Bt yang dimasukkan ke dalam 8 kelompo atau kelas Cry

(Rajamohan dan Dean, 1995; Krattiger, 1997; Crickmore et al., 1998). Kelas cry

tersebut dikelompokkan berdasarkan virulensinya yang spesifik terhadap kelompok

serangga sasaran. Sebagai contoh cryI, cryIX, dan cryX mematikan serangga golongan

Lepidoptera, cryV bisa mematikan golongan Lepidoptera dan Coleoptera.

Tabel 1. Gen ketahanan terhadap Serangga Hama

Semua gen yang menyandi 130-140 kDa protoxin dan aktif terhadap larva Lepidoptera

digolongkan ke dalam klas cryI yang selanjutnya dibagi dalam beberapa subklas A

sampai G. Berdasarkan pada identitas asam aminonya (>80%), sub-klas gen cryIA

dibagi menjadi IA(a), IA(b), dan IA(c). Tipe gen subklas cryII yang memproduksi 66

kDa protoxin aktif pada Lepidoptera (cryIIB) saja atau pada larva Lepi-doptera dan

Diptera (cryIIA). Gen cryIII menghasilkan 73 kDa protein aktif terhadap larva

Coleoptera. Gen tipe cryIV telah diisolasi dari subspesies israelensis dan

menghasilkan 135, 128, 74, dan 72 kDa protein aktif terhadap larva Diptera. Gen baru

telah diisolasi dari B. thuringiensis subsp. thompsoni dan diberi nama cryV. Gen

tersebut menghasilkan toxin 80 kDa dan aktif terhadap Lepidoptera dan Coleoptera.
Gen yang aktif terhadap nematode dimasukkan ke dalam klas cryVI. Dari penelitian

yang ada, umumnya tanaman tahan serangga yang berhasil ditransformasi berasal dari

gen cryBt yang bersifat meracuni hama serangga dari kelompok Coleoptera atau

Lepidoptera (Barton et al., 1987; Cheng et al., 1992; Delannay et al., 1989; Perlak et

al., 1990; Warren et al., 1992; Wilson et al., 1992). Racun Bt akan melekat pada

epithelial glycopro-tein dalam usus serangga, khusus-nya pada usus tengah. Keadaan

tersebut akan menyebabkan bocornya usus sehingga cairan yang ada akan merembes

ke luar ke daerah antara usus dan hemocoel dan mengakibatkan matinya serangga

(Hilder et al., 1993). Ada beberapa gen cry yang ditransformasikan ke kapas

transgenik, yaitu cryIA(a), cryIA(b), cryIA(c), cryIF, dan cryIIA(b) (Benedict dan

Altman, 2001; James, 2002). Akhir-akhir ini, hasil penelitian menunjukkan bahwa gen

cryBt tipe liar (wild type) yang ditransformasi ke tanaman ternyata berekspresikan

ketahanan yang rendah terhadap serangga (Cheng et al., 1992). Hal tersebut

dihipotesiskan bahwa penggunaan codon dari gen cryBt (yang diisolasi dari bakteri)

dikelabui oleh keharusan untuk mengekspresi dalam sel bakteri sehingga tidak

optimum untuk diekspresikan dalam sel tanaman (Cheng et al., 1992). Cara yang

dilakukan dalam pemecahan kendala tersebut adalah dengan mensintesis urutan

(sequence) gen secara kimiawi untuk menghilangkan banyaknya motif urutan adenin

thymine (AT) rich. Banyaknya urutan (AT) inilah yang menyebabkan tidak stabilnya

mRNA dari tanaman transgenik. Hasil percobaan tanaman transgenik dengan gen Bt

sintetis menunjukkan peningkatan ekspresi keefektifan ketahanan terhadap serangga

antara 10-100 kali (Perlak et al., 1991).

Gen dari Kelompok Inhibitor

Kelompok yang lain dari gen tahan serangga adalah proteinase inhibitor. Protein

penghambat akan mengganggu sistem pencernaan makanan serangga, dengan

menghasilkan senyawa antinutrisi yang menghambat kerja enzim proteinase. Supaya

fungsi dari gen penghambat (inhibitor) tersebut efektif, harus diekspresikan di

jaringan tanaman pada bagian yang diserang. Gen proteinase inhibitor II (dari

kentang) yang diintroduksikan ke tembakau telah meningkatkan ketahanan tanaman

transgenik terhadap serangga Manduca sexta (Johnson et al., 1989). Gen lain yang

ditransformasikan pada tembakau untuk memperoleh ketahanan terhadap Helicoverpa

zea adalah cowpea trypsin inhibitor (Hoffman et al., 1993). Azuki bean transgenik

yang dimasuki gen α-amylase inhibitor yang diperoleh dari common bean, telah

menunjukkan ketahanan terhadap hama kumbang Bruchus (Ishimoto et al., 1996).

Penelitian lain oleh Schroeder et al. (1995) dan Shade et al. (1994) gen α-amylase

inhibitor dari common bean berhasil ditransformasikan ke kacang pea (Pisum sativum

L.) dan menunjukkan ketahanan terhadap kumbang Bruchus (Bruchus pisorum). Hasil

penelitian Powel et al. (1993) tentang bioasai dengan menggunakan makanan buatan

dari lectin, tanaman menunjukkan bahwa lectin beracun terhadap wereng coklat dan

wereng hijau. Dibandingkan dengan lectin tanaman yang lain, snowdrop lectin dari

Galanthus nivalis agglutinin (GNA) menunjukkan hasil paling beracun terhadap

serangga hama, dengan menurunkan tingkat hidup wereng coklat sampai 50% pada

konsentrasi 6 µm (Gatehouse, 1998). Padi transgenik yang mengandung gen GNA

telah dihasilkan melalui sistem transformasi particle bombardment dari embrio muda

dan elektropora-si dari protoplas (Rao et al., 1999). Dalam uji bioasai, padi transgenik

tersebut dapat menurunkan tingkat hidup, keperidian, dan memper-lambat

pertumbuhan wereng coklat (Rao et al., 1999).

PERKEMBANGAN TANAMAN TRANSGENIK SECARA GLOBAL

Tahun 2001 merupakan tahun yang pertama di mana luas area pertanaman

transgenik di dunia melebihi 50 juta ha, yaitu 52,6 juta ha (James, 2001b). Luasan ini

adalah kenaikan 8,4 juta atau 19 % dari luasan tahun 2000 dan merupakan kenaikan

hampir dua kali lipat peningkatan luas dari tahun 1999 ke tahun 2000 seluas 4,3 juta

ha (Tabel 2). Selama periode tujuh tahun dari 1996 sampai 2002, telah terjadi

peningkatan luas area pertanaman yang begitu tajam, yaitu luas yang hanya 1,7 juta ha

pada tahun 1996 menjadi 58,7 juta ha pada tahun 2002. Peningkatan luas tersebut

melebihi dari 30 kali lipat (Tabel 2). Pada tahun 2001, distribusi luas pertanaman

tanaman transgenik 26 % atau 13,5 juta ha berada di negara berkembang (Tabel 3).

Luasan tersebut meningkat 2,8 % dari tahun 2000 yang 10,7 juta ha (Tabel 3). Di

negara berkembang, telah terjadi peningkatan luas area tanaman transgenik yang

konsisten sejak tahun 1997, yaitu 14 %, 16 % pada 1998, 18 % pada 1999, 23 % pada

2000, dan 26 % pada 2001 (James, 2001b). Dibandingkan dengan negara berkembang

(2,8 juta ha), pertumbuhan tanaman transgenic di negara industri (5,6 juta ha) dua kali

lipat lebih tinggi dari tahun 2000 ke tahun 2001 (James, 2001b). Meskipun demikian,

persentase peningkatan luas pertanaman lebih tinggi di Negara berkembang (26 %)

dibandingkan negara industri (17%) (Tabel 3). Dari 16 negara yang menanam tanaman

transgenik, sejak tahun 1997 hanya 3 negara yang mendominasi luasan area

penanaman, yaitu AS, Argentina, dan Kanada,

jagung Bt (Teng, 2001). Pengurangan aplikasi insektisida menimbulkan dampak

positif baik ke lingkungan maupun kesehatan manusia. Sedangkan dampak ke

lingkungan berupa pengurangan kemungkinan pengaruh berbahaya dari insektisida,

pengaruh yang mengakibatkan serangga hama menjadi resisten terhadap insektisida

dan terjadinya resurgensi, pengaruh mematikan terhadap serangga berguna seperti

predator dan parasit sehingga populasi musuh alami tersebut tetap terpelihara yang

nantinya akan meningkatkan pengendalian hayati secara alami. Dilaporkan bahwa

telah terjadi peningkatan populasi burung-burung langka di daerah peladangan

tanaman transgenik tahan serangga hama. Hal ini diduga diakibatkan oleh

pengurangan aplikasi insektisida yang cukup besar. Jagung transgenik yang

mengandung gen Bt bisa menghasilkan pengaruh lain yang positif. Hasil penelitian

lapang di Iowa State University, Amerika Serikat pada jagung Bt menunjukkan bahwa

jagung nontransgenik terserang parah oleh penyakit busuk tongkol yang disebabkan
oleh jamur Fusarium dibandingkan jagung Bt. (Fuller, 1999). Dari pengujian tingkat

ontaminasi mycotoxin menunjukkan bahwa jagung nontransgeik mengandung

fumonisin 14,5 ppm dibandingkan hanya 1,5 ppm pada jagung Bt (Fuller, 1999).

Selain manfaat dan keuntungan dari jagung Bt, dikhawatirkan bahwa jagung tersebut

akan berdampak negatif terhadap organisme bukan sasaran seperti predator, parasit,

lebah madu, dan hewan ternak. Selain penelitian laboratorium, selama tiga musim

tanam 1993-1995 telah dilakukan pada studi lapang tentang pengaruh penanaman

jagung Bt terhadap serangga berguna di Nebraska dan Iowa, AS. Studi lapang yang

sama juga dilakukan di Perancis pada tahun 1995. Data hasil penelitian menunjukkan

bahwa jagung Bt tidak berpengaruh terhadap serangga berguna seperti laba-laba,

coccinellid, chrysopid, dan nabid McLean dan MacKenzie (2001).

Di Indonesia juga telah dilakukan pengamatan populasi serangga berguna pada

tanaman transgenik dan dan nontransgenik baik di Fasilitas Uji Terbatas (FUT)

maupun Lapangan Uji Terbatas (LUT) (TTKH, 1999; TTKHKP, 2000). Hasil

pengamatan di Fasilitas Uji Terbatas menunjukkan bahwa tidak ada pengaruh jagung

Bt terhadap lebah madu tanaman transgenik (TTKHKP, 2000). Demikian pula

pengamatan di Lapangan Uji Terbatas (TTKH, 1999), menunjukkan bahwa jagung Bt

yang diuji tidak berpengaruh terhadap predator (kumbang Coccinella, larva dan

imagonya; kepik, green lacewing, laba-laba, bela-lang, semut merah), dan parasitoid

(Trichogramma). Mengenai pengujian di Fasilitas Uji Terbatas dan Lapangan Uji

Terbatas akan dijelas-kan di penjelasan tentang pengaturan pemanfaatan tanaman

transgenik. Feeding study dilakukan untuk melihat kesepadanan (equivalence) dalam

hal feed performance, kenaikan berat badan, produksi susu, dan komposisi susu antara

hewan ternak dan ikan yang diberi makanan dari tanaman transgenic dibandingkan
dengan nontransgenik. Folmer et al. (2000b) meneliti pengaruh pemberian makanan

dari jagung Bt dan nonBt pada sapi perah dengan hasil tidak adanya perbedaan dalam

hal feed performance, kenaikan berat badan, produksi susu, dan komposisi susu.

Feeding study lain dilakukan oleh Folmer et al (2000a) dan Russell et al (2000),

terhadap sapi potong. Hasil penelitian menunjukkan bahwa tidak ada perbedaan dalam

hal feed performance dan kenaikan berat badan sapi potong yang diberi makan jagung

Bt dan nonBt (Folmer et al., 2000a; Russell et al., 2000). Sanders et al. (1998) dan

McLean dan MacKenzie (2001) melaporkan bahwa gen cryIAb yang dikandung dalam

jagung Bt aman terhadap burung puyuh Northern Bobwhite. Gen-gen Bt atau cry yang

digunakan dalam perakitan tanaman transgenik tahan serangga hama telah

mendapatkan izin dari Environmental Protection Agency (EPA), AS. Sebagai contoh,

cryIA(b) (EPA, 1997; 1998a) dan cryIA(c) (EPA, 1998b) yang digunakan dalam

jagung Bt, cryIA(c) dalam kapas Bt (EPA, 1995a), dan cryIIIA dalam kentang (EPA,

1995b) telah diteliti dan dizinkan oleh EPA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa di

dalam tanaman, ketiga cry tersebut terkandung dalam konsentrasi rendah. Selain itu,

ketiga cry tersebut labil dan tidak tahan didegradasi dengan pemanasan (suhu >65 oC),

perlakuan asam (pH <5), dan protease. Data mengenai ketiga cry tersebut berbeda

dengan cry9C di dalam jagung Starlink. Ternyata cry9C di dalam cairan lambung

tidak terdegradasi dengan cepat dan relative lebih tahan dalam pemanasan (EPA,

1998c). Hasil tersebut menimbulkan kekhawatiran terjadinya alergi kalau jagung

transgenik yang mengandung cry9C tersebut dimakan oleh manusia, oleh karena itu

EPA hanya mengizinkan untuk bahan pakan tidak untuk pangan. Produsen jagung

Starlink mengajukan hasil penelitian terakhir tentang cry9C ke EPA sebagai informasi

tambahan untuk pengkajian risiko alerginisitas yang berpotensi pada produk pangan
olahan yang berasal dari jagung Starlink (GKCCB, 2001). Hasilnya menunjukkan

bahwa tingkat kandungan protein cry9C di dalam produk cair seperti minyak goreng,

sirup, alkohol, dan tajin jagung berada di bawah batas ambang untuk bisa dideteksi

melalui metode analitikal (GKCCB, 2001). Sedangkan di dalam produk kering seperti

tepung jagung halus dan kasar, protein cry9C mengalami denature tetapi tidak sampai

tereliminasi dengan komplit (GKCCB, 2001). Kegiatan penelitian rekayasa genetic

tanaman untuk merakit tanaman transgenik tahan serangga hama telah dilakukan di

berbagai lembaga penelitian seperti Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI dan Balai

Penelitian di dalam lingkup Badan Penelitian dan Pengembang-an Pertanian seperti

Balai Peneliti-an Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (Balitbiogen)

(Tabel 7). Teknologi rekayasa genetika dilakukan apabila persilangan konvensional

sudah tidak mampu dilaksanakan atau mengalami kendala sepert tidak adanya sumber

gen ketahanan terhadap serangga hama atau patogen tumbuhan, misalnya penggerek

batang padi, penggerek polong kedelai, hama boleng pada ubi jalar, dan penggerek

jagung. Serangga hama merupakan cekaman biotis yang utama pada komoditas

tertentu dan bisa menurunkan hasil 20 – 90 %. Kegiatan penelitian telah menghasilkan

tanaman transgenik seperti jagung dan padi tahan hama penggerek batang dan wereng

(Tabel 8). Selain itu, melalui kerja sama dengan lembaga penelitian di luar negeri juga

sudah menghasilkan tanaman transgenik seperti kentang tahan Potato Tuber Moth

(PTM).
 Perbandingan jagung Bt dengan jagung non-Bt

Kendala

Penelitian rekayasa genetik untuk merakit tanaman transgenik tidak semudah yang

dibayangkan oleh sementara orang, karena disamping memerlukan biaya besar,

peralatan laboratorium yang modern, juga sumber daya manusia yang tangguh dan

handal. Disamping itu, ada keterbatasan lain, yaitu jumlah gen yang diisolasi dan yang

sifat agronominya menarik masih sangat terbatas dan pengetahuan kita tentang

regulasi dari ekspresi gen masih terbatas, serta metode kultur jaringan untuk

regenerasi tanaman masih belum mencukupi. Masalah lain yang kita hadapi adalah

Hak Kekayaan Intelektual. Sebagai contoh adalah gen interes seperti gen Bt dan

metode transformasi seperti Agrobacterium tumefaciens dan particle bombardment

masih dimiliki dan dipatenkan oleh penemunya yang rata-rata dari negara maju.

Keterbatasan ini sementara bias ditanggulangi dengan memanfaatkan pihak fasilitator

seperti Agricultural Biotechnology for Support Project (ABSP) atau International

Service of the Acquisition for Agribiotech Application (ISAAA) untuk bisa

memanfatkan gen-gen interes. Contoh program kerja sama yang sudah berjalan baik
dan sukses adalah program rekayasa genetik tanaman transgenik tahan OPT seperti

kentang Bt tahan PTM (potato tuber moth) oleh ABSP dan papaya transgenik tahan

penyakit virus ring-spot oleh ISAAA. Di samping itu, ada kendala lain, yaitu peneliti

kita masih belum memiliki kemampuan dalam mengisolasi gen dan mensintesisnya

secara kimia. Oleh karena itu, perlu adanya peningkatan sumber daya manusia,

khususnya pembinaan tenaga usia muda dalam bidang kultur jaringan dengan

penekanan pada efisiensi regenerasi tanaman dan biologi molekuler khususnya teknik

isolasi, kloning, dan karakterisasi gen.

Tahapan Pembudidayaan Anggrek Transgenik Melalui  Agrobacterium

tumefaciens Dengan Teknik DNA Rekombinan

Dalam transformai genetik, tahap awal yang dilakukan adalah melakukan

kultur in vitro pada tanaman anggrek untuk pengupayaan penyediaan PLB sebagai

target transformasi gen. Proses transformasi genetik melalui Agrobacterium

tumefaciens EHA 105 cukup dilaksanakan dalam waktu 2 hari.  Hal ini disebabkan

semakin lama waktu ko kultivasi yang dilakukan akan semakin memacu dan

meningkatkan  perkembangan populasi A. tunefacuiens yang semakin tinggi, sehingga

hal ini akan mengganggu tahapan mematikan bakteri dalam proses transformasi

tersebut.

Bahan kimia yang diperlukan antara lain : bahan untuk sterilisasi (etanol,

spiritus, dll), media kultur in vitro anggrek (Media Vacin and Went modifikasi Lin),

media ko kultivasi (Media AB + 100 µM acetocyringone), bahan pencuci

Agrobacterium (400 mg/l antibiotik cefotaxime), media antibiotik I (Media Vacin and

Went modifikasi Lin + 250 mg/ Cefotaxime), media antibiotik II (Media Vacin and

Went modifikasi Lin + 100 mg/l Cefotaxime), media regenerasi (Media Vacin and
Went modifikasi Lin), serta bahan-bahan uji Gus berdasarkan metode Rueb dan

Hensgens (1989) antara lain X-gluc, triton X, NaHPO4, dll. Peralatan yang

dipergunakan meliputi peralatan kultur in vitro, shaker inkubator, alat-alat gelas,

laminar air flow cabinet, analitical balance, autoclave, hot plate, spektrometer, micro

centrifuge ,mikroskop, gusassay plate, microwave,  aluminium foil, parafilm,  dan

lain-lain.

Dalam kultur in vitro anggrek, proses induksi protochorm likes bodies

dipergunakan media Vacint and Went modifikasi Lin dengan penambahan air kelapa,

gula 30 gram dan agar 8 gram untuk setiap liter media. Media dituangkan ke dalam

botol kultur masing-masing 10 ml dan untuk  selanjutnya melalui proses disterilisasi.

Kultur dipelihara di ruang kultur dengan temperatur 25±3°C. Setelah PLB cukup besar

maka dilakukan sub kultur terhadap PLB yang telah tumbuh pada media baru yang

komposisinya sama dengan media induksi PLB tersebut.  Untuk botol kultur dengan

media padat diletak pada rak dan untuk media cair diletakan pada shaker.

Untuk persiapan proses transformasi, A. tumefaciens EHA 105 (yang

membawa pCambia 1303) dikulturkan di media AB padat (Chilton et al. 1974) dengan

penambahan antibiotik kanamisin dan rifampisin. Biakan tersebut diinkubasi dalam

inkubator pada suhu 370C selama 2 malam. Dalam proses ko-kultivasi, sejumlah

koloni bakteri yang telah tumbuh diambil menggunakan spatula dan disuspensikan

dalam media AB cair tanpa antibiotik.

Setelah proses ko-kultivasi kalus dicuci dengan 400 mg/l cefotaxime. Sebagian

kalus diambil untuk uji Gus berdasarkan metode Rueb dan Hensgens (1989).

Kemudian kalus yang telah dicuci ditumbuhkan pada media antibiotik I  (Media Vacin

and Went modifikasi Lin yang ditambah antibiotik Cefotaxime 250 mg/l). Inkubasi
dalam media antibiotik  pertama dilakukan pada suhu 250 - 260C diruang gelap selama

2 minggu. Kalus yang hidup dari media atibiotik  pertama  selanjutnya dikulturkan

lagi pada media antibiotik kedua  (Media Vacin and Went modifikasi Lin yang

ditambah antibiotik Cefotaxime 100 mg/l),  dan kultur diinkubasi kembali  pada suhu

250 - 260C di ruang gelap selama 2 minggu.

Transformasi gentik  yang dilakukan melalui perantaraan A. tumefaciens.

Semakin lama waktu ko kultivasi akan semakin meningkatkan jumlah PLB

kontaminasi A. tumefaciens setelah proses pencucian PLB. Waktu ko-kultivasi selama

2 hari menghasilkan julah PLB positif GUS mencapai 100% dan tidak berbeda dengan

waktu ko kultivasi 3 hari. Disamping itu, dalam perlakuan waktu ko kultivasi 2 hari

ekspresi gen hasil uji GUS sudah cukup merata di permukaan PLB target transformasi.

Waktu ko kultivasi selama 2 hari menghasilkan jumlah PLB hidup di media antibiotik.

Pembudidayaan Anggrek Transgenik Melalui  Agrobacterium tumefaciens

Dengan Teknik DNA Rekombinan

Secara alami, proses rekombinasi dapat terjadi sehingga memungkinkan suatu

gen dapat berpindah dari satu organisme ke organisme lain. Persitiwa tersebut

biasanya terjadi diantara organisme yang memiliki kekerabatan yang dekat. Dengan

kemajuan teknologi molekuler, perpindahan gen dapat terjadi meskipun antara

organisme yang tidak memiliki hubungan kekerabatan.

Untuk membuat DNA rekombinan digunakan dua macam enzim yaitu enzim

restriksi yang berfungsi memotong molekul DNA dan enzim ligase yang berfungsi

menggabungkan molekul DNA. Biasanya DNA rekombinan merupakan gabungan

antara DNA vektor dan DNA asing yang merupakan gen target. Selanjutnya adalah

memasukkan DNA vektor yang telah mengandung DNA asing ke dalam sel bakteri.
Proses masuknya DNA rekombinan ke sel bakteri disebut transformasi, dan proses ini

dapat menyebabkan fenotip sel bakteri mengalami perubahan.

Keberhasilan proses transformasi gen melalui Agrobacterium tumefaciens

sangat ditentukan oleh berbagai hal antara lain kesesuaian antara strain Agrobacterium

tumefaciens dengan jenis tanaman dan plasmid vektor yang dipergunakan, adanya

kerapatan sel A. tumefaciens yang digunakan pada saat proses tranformasi genetik,

lama waktu ko-kultivasi, tingkat kemasaman media, kondisi kultur in vitro dan

sebagainya.

Disamping itu pemanfaatan A. tumefaciens pada proses transformasi genetik

jenis tanaman monokotil masih memerlukan berbagai jalan penyesuaian dalam upaya

meningkatkan efisiensi transformasi. Hal ini disebabkan secara alami bakteri patogen

tanah tersebut hanya menginfeksi tanaman dikotil dengan cara mengintroduksi T DNA

dari plasmid Ti bakteri ke dalam inti sel tanaman.

Belarmino dan Mii (2000) telah melaporkan penelitian keberhasilannya

mendapatkanplanlet transgenik tanaman anggrek Phalaenopsis melalui proses

transformasi pada sel-sel dalam kultur suspensi tanaman anggrek Phalaenopsis

menggunakan perantara Agrobacterium tumefaciens LBA4404 (pTOK233) dan EHA

101 (pIG121Hm) yang membawa gen-gen β-glucuronidase serta gen yang memilki

ketahanan terhadap antibiotik higromisin.Metode transformasi melalui  bantuan

Agrobacterium lebih banyak dipergunakan pada tanaman  dikotil, namun

pemanfaatannya pada berbagai tanaman monokotil masih memerlukan penyesuaian

(Walden dan Wingender 1995).

Salah satu hal penting dalam keberhasilan menggunakan metode transformasi

melalui Agrobacterium tumefaciens adalah spesifikasi vektor yang digunakan.

Efisiensi transformasi melalui Agrobacterium tumefaciens sangat dipengaruhi pula

oleh  kesesuaian antara strain Agrobacterium dengan jenis maupun varietas tanaman.

Kemampuan Agrobacterium untuk menjadi “genetik enginer” alami telah

melakukan trasformasi pada sel tanaman tersebut berhubungan dengan adanya

plasmid penginduksi tumor. Akan tetapi untuk pemakaian A. tumefaciens seringkali

diperlukan berbagai penyesuaian terhadap tanaman monokotil maupun pada beberapa

kelompok tanaman yang rekalsitran.  Sheng dan Citovcky (1996) menyatakan

Agrobacterium memiliki tiga komponen genetik yang dipergunakan untuk

menginfeksi tanaman.

1. Komponen pertama adalah T-DNA yaitu fragmen yang ditransfer ke sel

tanaman dan terletak di plasmid Ti dari Agrobacterium.

2. Komponen kedua adalah virulence (vir) region, dimana gen vir berekspresi

jika terdapat inducer yang berupa senyawa monosiklik fenolik seperti

asetosyringone serta beberapa gugusmonosakharida seperti glukosa dan

galaktosa.

3. Komponen ketiga adalah chromosomal virulence (chv) yang terletak di

kromosom Agrobacterium tumefaciens yang berfungsi sebagai pelekatan

bakteri ke dalam sel tanaman-tanaman dengan membentuk senyawa protein b

-1,2  glukan.

Keuntungan transformasi genetik melalui Agrobacterium pada tanaman adalah

jumlah salinan gen yang relatif sedikit dalam kromosom sehingga mengurangi

kemungkinan terganggunya fungsi gen lain, mampu mentransfer segmen DNA

yang relatif besar serta menghasilkan tanaman transgenik dengan fertilitas tinggi.

Dampak positif dari penggunaan tanaman Transgenik

 1. Dapat menekan penggunaan pestisida, sehingga menurunkan biaya produksi.

2. Ketahanan tanaman terhadap hama dan jamur toksin dari Fusarium penyebab

pembusukan pada tongkol, dibandingkan dengan jagung non-Bt yang

mengalami kerusakan berat.

3. Hasil produksi menigkat sehingga akan mengatasi kelaparan.

Dampak negatif dari penggunaan tanaman Transgenik

1. Dapat menimbulkan penyakit atau gangguan kesehatan pada konsumen akibat

terjadinya kesalahan / human eror project.

2. Menimbulkan gangguan pada keseimbangan ekosistem lingkungan yang

terdapat tanaman transgenik.

3. Terjadi persaingan harga tanaman jagung transgenik dan tanaman jagung

biasa.

BAB III

PENUTUP
 Tanaman tahan serangga hama dapat dirakit melalui teknologi rekayasa

genetik dengan menggunakan gen yang berasal dari berbagai jenis organisme. Pada

tahun 2002, secara global luas tanaman transgenik tahan serangga hama dan sifat

gabungan dengan toleran herbisida adalah 14,5 juta ha atau 25 % dari total luas area

tanaman transgenik. Teknologi rekayasa genetik dan produknya yang berupa tanaman

transgenik tahan serangga hama telah dimanfaatkan oleh petani dan para peneliti. Di

Indonesia, penelitian perakitan tanaman transgenik tahan serangga hama sudah

dilakukan oleh berbagai lembaga penelitian baik perguruan tinggi, departemen teknis,

maupun non departemen. Manfaat tanaman transgenik tahan serangga hama berupa

terjadinya pengurangan aplikasi insektisida dan kasus keracunan insektisida, serta

keuntungan ekonomi bagi petani.

DAFTAR PUSTAKA

Ali, 2012, Bioteknologi,(online), (aliebios3.staff.ub.ac.id/files/2012/12/B-i-o-t-e-k-n-

o-l-o-g-i.docx, diakses tanggal 27 September 2013 pukul 10:02 WITA).
Anastasia, E., 2011, Peranan Bioteknologi dalam Kehidupan, (online), (efinawawi-
anastasia.blogspot.com/2011/12/peranan-bioteknologi dalam-kehidupan.html,
diakses 27 September 2013 pukul 20:17 WITA).

Anonim, 2009, Bioteknologi Pertanian, (online), (http://Bioteknologi-

pertanian.blogspot.com/, diakses tanggal 27 September 2013 pukul 9:21
WITA).

Anonim, 2011, Managemen Resistensi Hama pada Tanaman, (online),

(http://agriculturproduct.blogspot.com/manajemen+resistensi+tanaman+pada
hama.html, diakses tanggal 29 September 2013 pukul 22:46 WITA).

Herman, M., 2002, Perakitan Tanaman Tahan Serangga melalui Rekayasa Genetik,
Jurnal Agrobio, (online), (http://muhammadherman.blogspot.com, diakses
tanggal 8 Oktober 2013 pukul 23:02 WITA).

Krisna, A., 2012, Rekayasa Genetika Bakteri Rhizobacterium, (online),

(http://aguskrisnoblog.wordpress.com/2012/01/13/rekayasa-genetika-bakteri-
rhizobakterium.html, diakses tanggal 6 Desember 2013 pukul 15:04 WITA).

Krisna, A., 2012, Aplikasi Teknologi Rekayasa Genetika pada Bidang Florikultur
dalam Pembudidayaan Anggrek Transgenik melalui Bakteri Agrobacterium,
(online), (http://aguskrisnoblog.wordpress.com/2012/01/13/aplikasi-teknologi-
rekayasa-genetika-pada-bidang-florikultur-dalam-pembudidayaan-anggrek-
transgenik-melalui-agrobacterium-tumefaciens/, diakses tanggal 6 Desember
2013 pukul 17:15 WITA).

Suranto, 2009, Perkembangan IPTEK dan Sumbangannya terhadap Penanganan

Krisis Pangan Global (Sebuah Pendekatan Bioteknologi Molekuler),
Universitas Sebelas Maret, Surakarta.

Sustiprijatno, 2010, Jurnal Agrobioteknologi, Jagung Trangenik dan Perkembangan

Penelitian di Indonesia, (online), (http://duadelapan.blogspot.com, diakses
tanggal 8 Oktober 2013 pukul 22:46 WITA).

Sutrisno, 2006, Peran Bioteknologi dalam Pembangunan Pertanian di Indonesia,

(online), (digilib.batan.go.id/e-prosiding/File%20Prosiding/.../Sutrisno17.pdf,
diakses tanggal 27 September 2013 pukul 9:30 WITA).

Usyati, N., Buchori, D., Manuwoto, S., dkk., 2009, Keefektivan Padi Transgenik
terhadap Hama Penggerek Batang Padi Kuning Scirpophaga incertulas
(Lepidoptera : Crambidae Walker), Jurnal Entomol Indonesia, (6) 1, hal 30-
41, (http://journal.com/bioteknologi, diakses tanggal 22 November 2013 pukul
21:16 WITA).
Yuni, 2010, Bioteknologi, (online), (http://yunie160.blogspot.com/bioteknologi.html,
diakses tanggal 27 September 2013 pukul 10:42 WITA).

id.wikipedia.org/wiki/bioteknologi